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***  CIRCADIAN CLOCK PROTEIN, TRANSFERASE 10-MAR-06 2GBL  ***

LOGs for ID: 22013106500182055

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22013106500182055.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22013106500182055.atom to be opened. Openam> File opened: 22013106500182055.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2958 First residue number = 14 Last residue number = 519 Number of atoms found = 23322 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 100.414080 +/- 23.052610 From: 44.790000 To: 153.529000 = 67.700567 +/- 24.212882 From: 7.261000 To: 138.025000 = 30.677191 +/- 25.503055 From: -39.178000 To: 87.143000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0800 % Filled. Pdbmat> 9245163 non-zero elements. Pdbmat> 1011864 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.77 +/- 20.27 Maximum number = 127 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.023728E+07 Pdbmat> Larger element = 502.958 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2958 non-zero elements, NRBL set to 15 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22013106500182055.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 15 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22013106500182055.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22013106500182055.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 23322 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 15 residue(s) per block. Blocpdb> 2958 residues. Blocpdb> 121 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 107 atoms in block 2 Block first atom: 122 Blocpdb> 103 atoms in block 3 Block first atom: 229 Blocpdb> 125 atoms in block 4 Block first atom: 332 Blocpdb> 123 atoms in block 5 Block first atom: 457 Blocpdb> 118 atoms in block 6 Block first atom: 580 Blocpdb> 113 atoms in block 7 Block first atom: 698 Blocpdb> 115 atoms in block 8 Block first atom: 811 Blocpdb> 125 atoms in block 9 Block first atom: 926 Blocpdb> 124 atoms in block 10 Block first atom: 1051 Blocpdb> 118 atoms in block 11 Block first atom: 1175 Blocpdb> 122 atoms in block 12 Block first atom: 1293 Blocpdb> 122 atoms in block 13 Block first atom: 1415 Blocpdb> 129 atoms in block 14 Block first atom: 1537 Blocpdb> 122 atoms in block 15 Block first atom: 1666 Blocpdb> 115 atoms in block 16 Block first atom: 1788 Blocpdb> 110 atoms in block 17 Block first atom: 1903 Blocpdb> 115 atoms in block 18 Block first atom: 2013 Blocpdb> 98 atoms in block 19 Block first atom: 2128 Blocpdb> 118 atoms in block 20 Block first atom: 2226 Blocpdb> 125 atoms in block 21 Block first atom: 2344 Blocpdb> 134 atoms in block 22 Block first atom: 2469 Blocpdb> 111 atoms in block 23 Block first atom: 2603 Blocpdb> 123 atoms in block 24 Block first atom: 2714 Blocpdb> 106 atoms in block 25 Block first atom: 2837 Blocpdb> 117 atoms in block 26 Block first atom: 2943 Blocpdb> 119 atoms in block 27 Block first atom: 3060 Blocpdb> 91 atoms in block 28 Block first atom: 3179 Blocpdb> 122 atoms in block 29 Block first atom: 3270 Blocpdb> 125 atoms in block 30 Block first atom: 3392 Blocpdb> 121 atoms in block 31 Block first atom: 3517 Blocpdb> 126 atoms in block 32 Block first atom: 3638 Blocpdb> 119 atoms in block 33 Block first atom: 3764 Blocpdb> 91 atoms in block 34 Block first atom: 3883 Blocpdb> 121 atoms in block 35 Block first atom: 3974 Blocpdb> 107 atoms in block 36 Block first atom: 4095 Blocpdb> 103 atoms in block 37 Block first atom: 4202 Blocpdb> 125 atoms in block 38 Block first atom: 4305 Blocpdb> 123 atoms in block 39 Block first atom: 4430 Blocpdb> 118 atoms in block 40 Block first atom: 4553 Blocpdb> 113 atoms in block 41 Block first atom: 4671 Blocpdb> 115 atoms in block 42 Block first atom: 4784 Blocpdb> 125 atoms in block 43 Block first atom: 4899 Blocpdb> 124 atoms in block 44 Block first atom: 5024 Blocpdb> 118 atoms in block 45 Block first atom: 5148 Blocpdb> 122 atoms in block 46 Block first atom: 5266 Blocpdb> 122 atoms in block 47 Block first atom: 5388 Blocpdb> 129 atoms in block 48 Block first atom: 5510 Blocpdb> 122 atoms in block 49 Block first atom: 5639 Blocpdb> 115 atoms in block 50 Block first atom: 5761 Blocpdb> 110 atoms in block 51 Block first atom: 5876 Blocpdb> 115 atoms in block 52 Block first atom: 5986 Blocpdb> 98 atoms in block 53 Block first atom: 6101 Blocpdb> 118 atoms in block 54 Block first atom: 6199 Blocpdb> 125 atoms in block 55 Block first atom: 6317 Blocpdb> 134 atoms in block 56 Block first atom: 6442 Blocpdb> 111 atoms in block 57 Block first atom: 6576 Blocpdb> 123 atoms in block 58 Block first atom: 6687 Blocpdb> 106 atoms in block 59 Block first atom: 6810 Blocpdb> 117 atoms in block 60 Block first atom: 6916 Blocpdb> 119 atoms in block 61 Block first atom: 7033 Blocpdb> 91 atoms in block 62 Block first atom: 7152 Blocpdb> 122 atoms in block 63 Block first atom: 7243 Blocpdb> 125 atoms in block 64 Block first atom: 7365 Blocpdb> 121 atoms in block 65 Block first atom: 7490 Blocpdb> 126 atoms in block 66 Block first atom: 7611 Blocpdb> 94 atoms in block 67 Block first atom: 7737 Blocpdb> 121 atoms in block 68 Block first atom: 7831 Blocpdb> 107 atoms in block 69 Block first atom: 7952 Blocpdb> 103 atoms in block 70 Block first atom: 8059 Blocpdb> 125 atoms in block 71 Block first atom: 8162 Blocpdb> 123 atoms in block 72 Block first atom: 8287 Blocpdb> 118 atoms in block 73 Block first atom: 8410 Blocpdb> 113 atoms in block 74 Block first atom: 8528 Blocpdb> 115 atoms in block 75 Block first atom: 8641 Blocpdb> 125 atoms in block 76 Block first atom: 8756 Blocpdb> 124 atoms in block 77 Block first atom: 8881 Blocpdb> 118 atoms in block 78 Block first atom: 9005 Blocpdb> 122 atoms in block 79 Block first atom: 9123 Blocpdb> 122 atoms in block 80 Block first atom: 9245 Blocpdb> 129 atoms in block 81 Block first atom: 9367 Blocpdb> 122 atoms in block 82 Block first atom: 9496 Blocpdb> 115 atoms in block 83 Block first atom: 9618 Blocpdb> 110 atoms in block 84 Block first atom: 9733 Blocpdb> 115 atoms in block 85 Block first atom: 9843 Blocpdb> 98 atoms in block 86 Block first atom: 9958 Blocpdb> 118 atoms in block 87 Block first atom: 10056 Blocpdb> 125 atoms in block 88 Block first atom: 10174 Blocpdb> 134 atoms in block 89 Block first atom: 10299 Blocpdb> 111 atoms in block 90 Block first atom: 10433 Blocpdb> 123 atoms in block 91 Block first atom: 10544 Blocpdb> 106 atoms in block 92 Block first atom: 10667 Blocpdb> 117 atoms in block 93 Block first atom: 10773 Blocpdb> 119 atoms in block 94 Block first atom: 10890 Blocpdb> 97 atoms in block 95 Block first atom: 11009 Blocpdb> 122 atoms in block 96 Block first atom: 11106 Blocpdb> 125 atoms in block 97 Block first atom: 11228 Blocpdb> 121 atoms in block 98 Block first atom: 11353 Blocpdb> 126 atoms in block 99 Block first atom: 11474 Blocpdb> 70 atoms in block 100 Block first atom: 11600 Blocpdb> 121 atoms in block 101 Block first atom: 11670 Blocpdb> 107 atoms in block 102 Block first atom: 11791 Blocpdb> 103 atoms in block 103 Block first atom: 11898 Blocpdb> 125 atoms in block 104 Block first atom: 12001 Blocpdb> 123 atoms in block 105 Block first atom: 12126 Blocpdb> 118 atoms in block 106 Block first atom: 12249 Blocpdb> 113 atoms in block 107 Block first atom: 12367 Blocpdb> 115 atoms in block 108 Block first atom: 12480 Blocpdb> 125 atoms in block 109 Block first atom: 12595 Blocpdb> 124 atoms in block 110 Block first atom: 12720 Blocpdb> 118 atoms in block 111 Block first atom: 12844 Blocpdb> 122 atoms in block 112 Block first atom: 12962 Blocpdb> 122 atoms in block 113 Block first atom: 13084 Blocpdb> 129 atoms in block 114 Block first atom: 13206 Blocpdb> 122 atoms in block 115 Block first atom: 13335 Blocpdb> 115 atoms in block 116 Block first atom: 13457 Blocpdb> 110 atoms in block 117 Block first atom: 13572 Blocpdb> 115 atoms in block 118 Block first atom: 13682 Blocpdb> 98 atoms in block 119 Block first atom: 13797 Blocpdb> 118 atoms in block 120 Block first atom: 13895 Blocpdb> 125 atoms in block 121 Block first atom: 14013 Blocpdb> 134 atoms in block 122 Block first atom: 14138 Blocpdb> 111 atoms in block 123 Block first atom: 14272 Blocpdb> 123 atoms in block 124 Block first atom: 14383 Blocpdb> 106 atoms in block 125 Block first atom: 14506 Blocpdb> 117 atoms in block 126 Block first atom: 14612 Blocpdb> 119 atoms in block 127 Block first atom: 14729 Blocpdb> 97 atoms in block 128 Block first atom: 14848 Blocpdb> 122 atoms in block 129 Block first atom: 14945 Blocpdb> 125 atoms in block 130 Block first atom: 15067 Blocpdb> 121 atoms in block 131 Block first atom: 15192 Blocpdb> 126 atoms in block 132 Block first atom: 15313 Blocpdb> 46 atoms in block 133 Block first atom: 15439 Blocpdb> 121 atoms in block 134 Block first atom: 15485 Blocpdb> 107 atoms in block 135 Block first atom: 15606 Blocpdb> 103 atoms in block 136 Block first atom: 15713 Blocpdb> 125 atoms in block 137 Block first atom: 15816 Blocpdb> 123 atoms in block 138 Block first atom: 15941 Blocpdb> 118 atoms in block 139 Block first atom: 16064 Blocpdb> 113 atoms in block 140 Block first atom: 16182 Blocpdb> 115 atoms in block 141 Block first atom: 16295 Blocpdb> 125 atoms in block 142 Block first atom: 16410 Blocpdb> 124 atoms in block 143 Block first atom: 16535 Blocpdb> 118 atoms in block 144 Block first atom: 16659 Blocpdb> 122 atoms in block 145 Block first atom: 16777 Blocpdb> 122 atoms in block 146 Block first atom: 16899 Blocpdb> 129 atoms in block 147 Block first atom: 17021 Blocpdb> 122 atoms in block 148 Block first atom: 17150 Blocpdb> 115 atoms in block 149 Block first atom: 17272 Blocpdb> 110 atoms in block 150 Block first atom: 17387 Blocpdb> 115 atoms in block 151 Block first atom: 17497 Blocpdb> 98 atoms in block 152 Block first atom: 17612 Blocpdb> 118 atoms in block 153 Block first atom: 17710 Blocpdb> 125 atoms in block 154 Block first atom: 17828 Blocpdb> 134 atoms in block 155 Block first atom: 17953 Blocpdb> 111 atoms in block 156 Block first atom: 18087 Blocpdb> 123 atoms in block 157 Block first atom: 18198 Blocpdb> 106 atoms in block 158 Block first atom: 18321 Blocpdb> 117 atoms in block 159 Block first atom: 18427 Blocpdb> 119 atoms in block 160 Block first atom: 18544 Blocpdb> 91 atoms in block 161 Block first atom: 18663 Blocpdb> 122 atoms in block 162 Block first atom: 18754 Blocpdb> 125 atoms in block 163 Block first atom: 18876 Blocpdb> 121 atoms in block 164 Block first atom: 19001 Blocpdb> 126 atoms in block 165 Block first atom: 19122 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 19248 Blocpdb> 121 atoms in block 167 Block first atom: 19350 Blocpdb> 107 atoms in block 168 Block first atom: 19471 Blocpdb> 103 atoms in block 169 Block first atom: 19578 Blocpdb> 125 atoms in block 170 Block first atom: 19681 Blocpdb> 123 atoms in block 171 Block first atom: 19806 Blocpdb> 118 atoms in block 172 Block first atom: 19929 Blocpdb> 113 atoms in block 173 Block first atom: 20047 Blocpdb> 115 atoms in block 174 Block first atom: 20160 Blocpdb> 125 atoms in block 175 Block first atom: 20275 Blocpdb> 124 atoms in block 176 Block first atom: 20400 Blocpdb> 118 atoms in block 177 Block first atom: 20524 Blocpdb> 122 atoms in block 178 Block first atom: 20642 Blocpdb> 122 atoms in block 179 Block first atom: 20764 Blocpdb> 129 atoms in block 180 Block first atom: 20886 Blocpdb> 122 atoms in block 181 Block first atom: 21015 Blocpdb> 115 atoms in block 182 Block first atom: 21137 Blocpdb> 110 atoms in block 183 Block first atom: 21252 Blocpdb> 115 atoms in block 184 Block first atom: 21362 Blocpdb> 98 atoms in block 185 Block first atom: 21477 Blocpdb> 118 atoms in block 186 Block first atom: 21575 Blocpdb> 125 atoms in block 187 Block first atom: 21693 Blocpdb> 134 atoms in block 188 Block first atom: 21818 Blocpdb> 111 atoms in block 189 Block first atom: 21952 Blocpdb> 123 atoms in block 190 Block first atom: 22063 Blocpdb> 106 atoms in block 191 Block first atom: 22186 Blocpdb> 117 atoms in block 192 Block first atom: 22292 Blocpdb> 119 atoms in block 193 Block first atom: 22409 Blocpdb> 91 atoms in block 194 Block first atom: 22528 Blocpdb> 122 atoms in block 195 Block first atom: 22619 Blocpdb> 125 atoms in block 196 Block first atom: 22741 Blocpdb> 121 atoms in block 197 Block first atom: 22866 Blocpdb> 126 atoms in block 198 Block first atom: 22987 Blocpdb> 119 atoms in block 199 Block first atom: 23113 Blocpdb> 91 atoms in block 200 Block first atom: 23231 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 134 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 46 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 9245363 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 69966 Prepmat> Matrix trace = 20237280.0001 Prepmat> Last element read: 69966 69966 6.3606 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18294 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 23322 RTB> Total mass = 23322.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 23322 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 201423.8093 RTB> 62016 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 62016 Diagstd> Projected matrix trace = 201423.8093 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 201423.8093 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0795796 0.2349857 0.4478651 0.5765054 1.0818253 1.9748049 2.2511398 2.5169702 2.7351482 2.8582187 2.8969211 3.7421219 3.7821545 3.8193000 3.8937780 3.9824553 4.2905225 4.5123209 4.7477113 5.6254669 5.8325671 6.2661479 6.5149295 6.8114888 7.0547629 7.2560209 7.4153049 8.1899289 8.2533676 8.3787419 8.7887372 8.8502804 10.2673303 10.8567164 11.3087780 11.4111241 11.4515654 11.6516138 11.7938541 12.1471622 12.5959214 13.0857510 13.5257631 13.6770912 13.8648405 14.4694594 14.8686547 14.8909816 15.8252817 16.6345329 16.7085503 16.9123684 17.4422819 18.7236378 18.8399544 19.3359163 20.0566097 20.3045074 20.5421934 20.6616821 20.7800961 21.4785535 22.2738818 22.5056945 22.6254150 22.9997129 23.5480581 23.6738029 23.8811640 24.3843655 24.9668223 25.0261024 26.1675951 26.9612080 27.8305225 28.1067208 28.4658491 28.6790992 29.1657617 29.1940357 29.7031233 29.8221200 30.0205150 30.1544640 30.7756987 31.3844387 31.8962919 32.1554983 32.8463056 33.4011723 33.7426244 34.0092606 34.5466077 34.7493876 35.0111533 35.1755231 35.3665459 35.5424603 36.0177416 36.0979067 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034331 0.0034336 0.0034339 0.0034342 0.0034344 30.6334641 52.6400165 72.6722959 82.4511963 112.9467794 152.6009986 162.9282962 172.2797823 179.5914743 183.5874581 184.8262329 210.0652651 211.1858967 212.2204183 214.2796238 216.7058990 224.9315487 230.6722054 236.6123628 257.5577170 262.2558298 271.8288836 277.1725003 283.4107391 288.4273850 292.5125770 295.7057621 310.7673230 311.9685933 314.3291706 321.9278279 323.0530120 347.9557732 357.8034522 365.1767503 366.8254808 367.4749245 370.6707543 372.9264235 378.4710767 385.3987050 392.8209188 399.3706713 401.5985650 404.3455979 413.0678873 418.7271472 419.0414114 431.9873252 442.8948047 443.8790675 446.5781764 453.5205085 469.8837177 471.3409839 477.5047093 486.3221402 489.3183579 492.1740227 493.6033724 495.0157945 503.2662363 512.4992522 515.1592353 516.5276289 520.7826264 526.9541506 528.3592248 530.6681534 536.2298797 542.5964091 543.2401853 555.4912035 563.8517772 572.8698429 575.7054887 579.3717984 581.5379131 586.4512844 586.7354752 591.8291325 593.0134406 594.9827150 596.3086189 602.4198044 608.3485303 613.2892874 615.7762045 622.3555184 627.5901742 630.7898685 633.2772333 638.2605236 640.1309980 642.5375141 644.0440352 645.7904277 647.3945271 651.7087008 652.4335557 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 23322 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9580E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.253 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.10 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 1.00004 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003 0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 419796 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004 1.00004 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003 0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22013106500182055.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22013106500182055.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22013106500182055.atom Openam> file on opening on unit 11: 22013106500182055.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2958 First residue number = 14 Last residue number = 519 Number of atoms found = 23322 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9884E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9580E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.253 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.10 Bfactors> 106 vectors, 69966 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.079580 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.073 for 2958 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.24 Bfactors> = 72.034 +/- 25.43 Bfactors> Shiftng-fct= 72.014 Bfactors> Scaling-fct= 104.037 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22013106500182055.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22013106500182055.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.4 Chkmod> 106 vectors, 69966 coordinates in file. Chkmod> That is: 23322 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7375 0.0034 0.7516 0.0034 0.8066 0.0034 0.8805 0.0034 0.9691 0.0034 0.8833 30.6322 0.0028 52.6394 0.0040 72.6720 0.0040 82.4473 0.0041 112.9510 0.0037 152.6020 0.0420 162.9162 0.7191 172.2734 0.5891 179.5789 0.4996 183.5726 0.4372 184.8208 0.4241 210.0528 0.4049 211.1725 0.7106 212.2030 0.7186 214.2765 0.8700 216.6842 0.3069 224.9344 0.1776 230.6541 0.2281 236.6094 0.0335 257.5360 0.0498 262.2543 0.7419 271.8140 0.1137 277.1621 0.2495 283.3884 0.2943 288.4198 0.1542 292.4996 0.4249 295.6870 0.4386 310.7553 0.5179 311.9483 0.5651 314.3205 0.7083 321.9188 0.7342 323.0340 0.7407 347.9861 0.4282 357.8422 0.4911 365.1808 0.0509 366.7917 0.4974 367.4340 0.5929 370.6292 0.6080 372.8495 0.2930 378.4990 0.2761 385.4445 0.5373 392.8678 0.6348 399.4161 0.3571 401.6240 0.2483 404.2577 0.3135 413.0579 0.5087 418.7281 0.4371 419.0096 0.5881 432.0332 0.5936 442.8154 0.3779 443.8793 0.3887 446.5277 0.5232 453.4714 0.4914 469.8179 0.2832 471.3213 0.4533 477.5346 0.1168 486.3424 0.0634 489.2430 0.4355 492.1266 0.4491 493.5621 0.4214 494.9934 0.4859 503.2616 0.3368 512.4326 0.5631 515.1864 0.5172 516.5578 0.6137 520.7635 0.4558 526.9533 0.2803 528.2941 0.5242 530.6324 0.4694 536.1589 0.6091 542.6076 0.4691 543.2592 0.5844 555.4929 0.2674 563.8149 0.3868 572.8399 0.5138 575.7144 0.4958 579.3892 0.5478 581.5221 0.5220 586.4687 0.4904 586.6697 0.5091 591.7726 0.5017 592.9669 0.5987 594.9521 0.5825 596.2389 0.5372 602.4360 0.5377 608.2794 0.5925 613.2986 0.4265 615.7929 0.6247 622.3638 0.4577 627.5522 0.4081 630.7383 0.4370 633.2569 0.4169 638.2645 0.4063 640.1092 0.3689 642.4993 0.3723 644.0574 0.3089 645.7942 0.4751 647.3443 0.5458 651.7012 0.4000 652.4245 0.3602 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom making animated gifs 11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom making animated gifs 11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22013106500182055.eigenfacs 22013106500182055.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22013106500182055.eigenfacs 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