***  CIRCADIAN CLOCK PROTEIN, TRANSFERASE 10-MAR-06 2GBL  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22013106500182055.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22013106500182055.atom to be opened.
Openam> File opened: 22013106500182055.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2958
First residue number = 14
Last residue number = 519
Number of atoms found = 23322
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 100.414080 +/- 23.052610 From: 44.790000 To: 153.529000
= 67.700567 +/- 24.212882 From: 7.261000 To: 138.025000
= 30.677191 +/- 25.503055 From: -39.178000 To: 87.143000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.0800 % Filled.
Pdbmat> 9245163 non-zero elements.
Pdbmat> 1011864 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.77 +/- 20.27
Maximum number = 127
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 2.023728E+07
Pdbmat> Larger element = 502.958
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2958 non-zero elements, NRBL set to 15
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22013106500182055.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 15
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22013106500182055.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22013106500182055.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 23322 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 15 residue(s) per block.
Blocpdb> 2958 residues.
Blocpdb> 121 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 107 atoms in block 2
Block first atom: 122
Blocpdb> 103 atoms in block 3
Block first atom: 229
Blocpdb> 125 atoms in block 4
Block first atom: 332
Blocpdb> 123 atoms in block 5
Block first atom: 457
Blocpdb> 118 atoms in block 6
Block first atom: 580
Blocpdb> 113 atoms in block 7
Block first atom: 698
Blocpdb> 115 atoms in block 8
Block first atom: 811
Blocpdb> 125 atoms in block 9
Block first atom: 926
Blocpdb> 124 atoms in block 10
Block first atom: 1051
Blocpdb> 118 atoms in block 11
Block first atom: 1175
Blocpdb> 122 atoms in block 12
Block first atom: 1293
Blocpdb> 122 atoms in block 13
Block first atom: 1415
Blocpdb> 129 atoms in block 14
Block first atom: 1537
Blocpdb> 122 atoms in block 15
Block first atom: 1666
Blocpdb> 115 atoms in block 16
Block first atom: 1788
Blocpdb> 110 atoms in block 17
Block first atom: 1903
Blocpdb> 115 atoms in block 18
Block first atom: 2013
Blocpdb> 98 atoms in block 19
Block first atom: 2128
Blocpdb> 118 atoms in block 20
Block first atom: 2226
Blocpdb> 125 atoms in block 21
Block first atom: 2344
Blocpdb> 134 atoms in block 22
Block first atom: 2469
Blocpdb> 111 atoms in block 23
Block first atom: 2603
Blocpdb> 123 atoms in block 24
Block first atom: 2714
Blocpdb> 106 atoms in block 25
Block first atom: 2837
Blocpdb> 117 atoms in block 26
Block first atom: 2943
Blocpdb> 119 atoms in block 27
Block first atom: 3060
Blocpdb> 91 atoms in block 28
Block first atom: 3179
Blocpdb> 122 atoms in block 29
Block first atom: 3270
Blocpdb> 125 atoms in block 30
Block first atom: 3392
Blocpdb> 121 atoms in block 31
Block first atom: 3517
Blocpdb> 126 atoms in block 32
Block first atom: 3638
Blocpdb> 119 atoms in block 33
Block first atom: 3764
Blocpdb> 91 atoms in block 34
Block first atom: 3883
Blocpdb> 121 atoms in block 35
Block first atom: 3974
Blocpdb> 107 atoms in block 36
Block first atom: 4095
Blocpdb> 103 atoms in block 37
Block first atom: 4202
Blocpdb> 125 atoms in block 38
Block first atom: 4305
Blocpdb> 123 atoms in block 39
Block first atom: 4430
Blocpdb> 118 atoms in block 40
Block first atom: 4553
Blocpdb> 113 atoms in block 41
Block first atom: 4671
Blocpdb> 115 atoms in block 42
Block first atom: 4784
Blocpdb> 125 atoms in block 43
Block first atom: 4899
Blocpdb> 124 atoms in block 44
Block first atom: 5024
Blocpdb> 118 atoms in block 45
Block first atom: 5148
Blocpdb> 122 atoms in block 46
Block first atom: 5266
Blocpdb> 122 atoms in block 47
Block first atom: 5388
Blocpdb> 129 atoms in block 48
Block first atom: 5510
Blocpdb> 122 atoms in block 49
Block first atom: 5639
Blocpdb> 115 atoms in block 50
Block first atom: 5761
Blocpdb> 110 atoms in block 51
Block first atom: 5876
Blocpdb> 115 atoms in block 52
Block first atom: 5986
Blocpdb> 98 atoms in block 53
Block first atom: 6101
Blocpdb> 118 atoms in block 54
Block first atom: 6199
Blocpdb> 125 atoms in block 55
Block first atom: 6317
Blocpdb> 134 atoms in block 56
Block first atom: 6442
Blocpdb> 111 atoms in block 57
Block first atom: 6576
Blocpdb> 123 atoms in block 58
Block first atom: 6687
Blocpdb> 106 atoms in block 59
Block first atom: 6810
Blocpdb> 117 atoms in block 60
Block first atom: 6916
Blocpdb> 119 atoms in block 61
Block first atom: 7033
Blocpdb> 91 atoms in block 62
Block first atom: 7152
Blocpdb> 122 atoms in block 63
Block first atom: 7243
Blocpdb> 125 atoms in block 64
Block first atom: 7365
Blocpdb> 121 atoms in block 65
Block first atom: 7490
Blocpdb> 126 atoms in block 66
Block first atom: 7611
Blocpdb> 94 atoms in block 67
Block first atom: 7737
Blocpdb> 121 atoms in block 68
Block first atom: 7831
Blocpdb> 107 atoms in block 69
Block first atom: 7952
Blocpdb> 103 atoms in block 70
Block first atom: 8059
Blocpdb> 125 atoms in block 71
Block first atom: 8162
Blocpdb> 123 atoms in block 72
Block first atom: 8287
Blocpdb> 118 atoms in block 73
Block first atom: 8410
Blocpdb> 113 atoms in block 74
Block first atom: 8528
Blocpdb> 115 atoms in block 75
Block first atom: 8641
Blocpdb> 125 atoms in block 76
Block first atom: 8756
Blocpdb> 124 atoms in block 77
Block first atom: 8881
Blocpdb> 118 atoms in block 78
Block first atom: 9005
Blocpdb> 122 atoms in block 79
Block first atom: 9123
Blocpdb> 122 atoms in block 80
Block first atom: 9245
Blocpdb> 129 atoms in block 81
Block first atom: 9367
Blocpdb> 122 atoms in block 82
Block first atom: 9496
Blocpdb> 115 atoms in block 83
Block first atom: 9618
Blocpdb> 110 atoms in block 84
Block first atom: 9733
Blocpdb> 115 atoms in block 85
Block first atom: 9843
Blocpdb> 98 atoms in block 86
Block first atom: 9958
Blocpdb> 118 atoms in block 87
Block first atom: 10056
Blocpdb> 125 atoms in block 88
Block first atom: 10174
Blocpdb> 134 atoms in block 89
Block first atom: 10299
Blocpdb> 111 atoms in block 90
Block first atom: 10433
Blocpdb> 123 atoms in block 91
Block first atom: 10544
Blocpdb> 106 atoms in block 92
Block first atom: 10667
Blocpdb> 117 atoms in block 93
Block first atom: 10773
Blocpdb> 119 atoms in block 94
Block first atom: 10890
Blocpdb> 97 atoms in block 95
Block first atom: 11009
Blocpdb> 122 atoms in block 96
Block first atom: 11106
Blocpdb> 125 atoms in block 97
Block first atom: 11228
Blocpdb> 121 atoms in block 98
Block first atom: 11353
Blocpdb> 126 atoms in block 99
Block first atom: 11474
Blocpdb> 70 atoms in block 100
Block first atom: 11600
Blocpdb> 121 atoms in block 101
Block first atom: 11670
Blocpdb> 107 atoms in block 102
Block first atom: 11791
Blocpdb> 103 atoms in block 103
Block first atom: 11898
Blocpdb> 125 atoms in block 104
Block first atom: 12001
Blocpdb> 123 atoms in block 105
Block first atom: 12126
Blocpdb> 118 atoms in block 106
Block first atom: 12249
Blocpdb> 113 atoms in block 107
Block first atom: 12367
Blocpdb> 115 atoms in block 108
Block first atom: 12480
Blocpdb> 125 atoms in block 109
Block first atom: 12595
Blocpdb> 124 atoms in block 110
Block first atom: 12720
Blocpdb> 118 atoms in block 111
Block first atom: 12844
Blocpdb> 122 atoms in block 112
Block first atom: 12962
Blocpdb> 122 atoms in block 113
Block first atom: 13084
Blocpdb> 129 atoms in block 114
Block first atom: 13206
Blocpdb> 122 atoms in block 115
Block first atom: 13335
Blocpdb> 115 atoms in block 116
Block first atom: 13457
Blocpdb> 110 atoms in block 117
Block first atom: 13572
Blocpdb> 115 atoms in block 118
Block first atom: 13682
Blocpdb> 98 atoms in block 119
Block first atom: 13797
Blocpdb> 118 atoms in block 120
Block first atom: 13895
Blocpdb> 125 atoms in block 121
Block first atom: 14013
Blocpdb> 134 atoms in block 122
Block first atom: 14138
Blocpdb> 111 atoms in block 123
Block first atom: 14272
Blocpdb> 123 atoms in block 124
Block first atom: 14383
Blocpdb> 106 atoms in block 125
Block first atom: 14506
Blocpdb> 117 atoms in block 126
Block first atom: 14612
Blocpdb> 119 atoms in block 127
Block first atom: 14729
Blocpdb> 97 atoms in block 128
Block first atom: 14848
Blocpdb> 122 atoms in block 129
Block first atom: 14945
Blocpdb> 125 atoms in block 130
Block first atom: 15067
Blocpdb> 121 atoms in block 131
Block first atom: 15192
Blocpdb> 126 atoms in block 132
Block first atom: 15313
Blocpdb> 46 atoms in block 133
Block first atom: 15439
Blocpdb> 121 atoms in block 134
Block first atom: 15485
Blocpdb> 107 atoms in block 135
Block first atom: 15606
Blocpdb> 103 atoms in block 136
Block first atom: 15713
Blocpdb> 125 atoms in block 137
Block first atom: 15816
Blocpdb> 123 atoms in block 138
Block first atom: 15941
Blocpdb> 118 atoms in block 139
Block first atom: 16064
Blocpdb> 113 atoms in block 140
Block first atom: 16182
Blocpdb> 115 atoms in block 141
Block first atom: 16295
Blocpdb> 125 atoms in block 142
Block first atom: 16410
Blocpdb> 124 atoms in block 143
Block first atom: 16535
Blocpdb> 118 atoms in block 144
Block first atom: 16659
Blocpdb> 122 atoms in block 145
Block first atom: 16777
Blocpdb> 122 atoms in block 146
Block first atom: 16899
Blocpdb> 129 atoms in block 147
Block first atom: 17021
Blocpdb> 122 atoms in block 148
Block first atom: 17150
Blocpdb> 115 atoms in block 149
Block first atom: 17272
Blocpdb> 110 atoms in block 150
Block first atom: 17387
Blocpdb> 115 atoms in block 151
Block first atom: 17497
Blocpdb> 98 atoms in block 152
Block first atom: 17612
Blocpdb> 118 atoms in block 153
Block first atom: 17710
Blocpdb> 125 atoms in block 154
Block first atom: 17828
Blocpdb> 134 atoms in block 155
Block first atom: 17953
Blocpdb> 111 atoms in block 156
Block first atom: 18087
Blocpdb> 123 atoms in block 157
Block first atom: 18198
Blocpdb> 106 atoms in block 158
Block first atom: 18321
Blocpdb> 117 atoms in block 159
Block first atom: 18427
Blocpdb> 119 atoms in block 160
Block first atom: 18544
Blocpdb> 91 atoms in block 161
Block first atom: 18663
Blocpdb> 122 atoms in block 162
Block first atom: 18754
Blocpdb> 125 atoms in block 163
Block first atom: 18876
Blocpdb> 121 atoms in block 164
Block first atom: 19001
Blocpdb> 126 atoms in block 165
Block first atom: 19122
Blocpdb> 102 atoms in block 166
Block first atom: 19248
Blocpdb> 121 atoms in block 167
Block first atom: 19350
Blocpdb> 107 atoms in block 168
Block first atom: 19471
Blocpdb> 103 atoms in block 169
Block first atom: 19578
Blocpdb> 125 atoms in block 170
Block first atom: 19681
Blocpdb> 123 atoms in block 171
Block first atom: 19806
Blocpdb> 118 atoms in block 172
Block first atom: 19929
Blocpdb> 113 atoms in block 173
Block first atom: 20047
Blocpdb> 115 atoms in block 174
Block first atom: 20160
Blocpdb> 125 atoms in block 175
Block first atom: 20275
Blocpdb> 124 atoms in block 176
Block first atom: 20400
Blocpdb> 118 atoms in block 177
Block first atom: 20524
Blocpdb> 122 atoms in block 178
Block first atom: 20642
Blocpdb> 122 atoms in block 179
Block first atom: 20764
Blocpdb> 129 atoms in block 180
Block first atom: 20886
Blocpdb> 122 atoms in block 181
Block first atom: 21015
Blocpdb> 115 atoms in block 182
Block first atom: 21137
Blocpdb> 110 atoms in block 183
Block first atom: 21252
Blocpdb> 115 atoms in block 184
Block first atom: 21362
Blocpdb> 98 atoms in block 185
Block first atom: 21477
Blocpdb> 118 atoms in block 186
Block first atom: 21575
Blocpdb> 125 atoms in block 187
Block first atom: 21693
Blocpdb> 134 atoms in block 188
Block first atom: 21818
Blocpdb> 111 atoms in block 189
Block first atom: 21952
Blocpdb> 123 atoms in block 190
Block first atom: 22063
Blocpdb> 106 atoms in block 191
Block first atom: 22186
Blocpdb> 117 atoms in block 192
Block first atom: 22292
Blocpdb> 119 atoms in block 193
Block first atom: 22409
Blocpdb> 91 atoms in block 194
Block first atom: 22528
Blocpdb> 122 atoms in block 195
Block first atom: 22619
Blocpdb> 125 atoms in block 196
Block first atom: 22741
Blocpdb> 121 atoms in block 197
Block first atom: 22866
Blocpdb> 126 atoms in block 198
Block first atom: 22987
Blocpdb> 119 atoms in block 199
Block first atom: 23113
Blocpdb> 91 atoms in block 200
Block first atom: 23231
Blocpdb> 200 blocks.
Blocpdb> At most, 134 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 46 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 9245363 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 69966
Prepmat> Matrix trace = 20237280.0001
Prepmat> Last element read: 69966 69966 6.3606
Prepmat> 20101 lines saved.
Prepmat> 18294 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 23322
RTB> Total mass = 23322.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 23322
RTB> Number of blocks = 200
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 201423.8093
RTB> 62016 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1200
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62016
Diagstd> Projected matrix trace = 201423.8093
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 201423.8093
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0795796 0.2349857 0.4478651 0.5765054
1.0818253 1.9748049 2.2511398 2.5169702 2.7351482
2.8582187 2.8969211 3.7421219 3.7821545 3.8193000
3.8937780 3.9824553 4.2905225 4.5123209 4.7477113
5.6254669 5.8325671 6.2661479 6.5149295 6.8114888
7.0547629 7.2560209 7.4153049 8.1899289 8.2533676
8.3787419 8.7887372 8.8502804 10.2673303 10.8567164
11.3087780 11.4111241 11.4515654 11.6516138 11.7938541
12.1471622 12.5959214 13.0857510 13.5257631 13.6770912
13.8648405 14.4694594 14.8686547 14.8909816 15.8252817
16.6345329 16.7085503 16.9123684 17.4422819 18.7236378
18.8399544 19.3359163 20.0566097 20.3045074 20.5421934
20.6616821 20.7800961 21.4785535 22.2738818 22.5056945
22.6254150 22.9997129 23.5480581 23.6738029 23.8811640
24.3843655 24.9668223 25.0261024 26.1675951 26.9612080
27.8305225 28.1067208 28.4658491 28.6790992 29.1657617
29.1940357 29.7031233 29.8221200 30.0205150 30.1544640
30.7756987 31.3844387 31.8962919 32.1554983 32.8463056
33.4011723 33.7426244 34.0092606 34.5466077 34.7493876
35.0111533 35.1755231 35.3665459 35.5424603 36.0177416
36.0979067
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034331 0.0034336 0.0034339 0.0034342
0.0034344 30.6334641 52.6400165 72.6722959 82.4511963
112.9467794 152.6009986 162.9282962 172.2797823 179.5914743
183.5874581 184.8262329 210.0652651 211.1858967 212.2204183
214.2796238 216.7058990 224.9315487 230.6722054 236.6123628
257.5577170 262.2558298 271.8288836 277.1725003 283.4107391
288.4273850 292.5125770 295.7057621 310.7673230 311.9685933
314.3291706 321.9278279 323.0530120 347.9557732 357.8034522
365.1767503 366.8254808 367.4749245 370.6707543 372.9264235
378.4710767 385.3987050 392.8209188 399.3706713 401.5985650
404.3455979 413.0678873 418.7271472 419.0414114 431.9873252
442.8948047 443.8790675 446.5781764 453.5205085 469.8837177
471.3409839 477.5047093 486.3221402 489.3183579 492.1740227
493.6033724 495.0157945 503.2662363 512.4992522 515.1592353
516.5276289 520.7826264 526.9541506 528.3592248 530.6681534
536.2298797 542.5964091 543.2401853 555.4912035 563.8517772
572.8698429 575.7054887 579.3717984 581.5379131 586.4512844
586.7354752 591.8291325 593.0134406 594.9827150 596.3086189
602.4198044 608.3485303 613.2892874 615.7762045 622.3555184
627.5901742 630.7898685 633.2772333 638.2605236 640.1309980
642.5375141 644.0440352 645.7904277 647.3945271 651.7087008
652.4335557
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 23322
Rtb_to_modes> Number of blocs = 200
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9884E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9580E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4479
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5765
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.082
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.517
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.858
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.897
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.782
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.819
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.982
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.291
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.512
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.625
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.833
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.266
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.515
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.789
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.850
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.10
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004
1.00004 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003
0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998
1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 419796 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00004
1.00004 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003
0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999
0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998
1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22013106500182055.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22013106500182055.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22013106500182055.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22013106500182055.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2958
First residue number = 14
Last residue number = 519
Number of atoms found = 23322
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9884E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9580E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4479
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5765
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.082
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.517
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.858
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.897
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.894
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.982
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.291
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.512
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.748
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.625
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.833
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.266
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.515
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.789
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.10
Bfactors> 106 vectors, 69966 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.079580
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.073 for 2958 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.021 +/- 0.24
Bfactors> = 72.034 +/- 25.43
Bfactors> Shiftng-fct= 72.014
Bfactors> Scaling-fct= 104.037
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22013106500182055.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22013106500182055.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.4
Chkmod> 106 vectors, 69966 coordinates in file.
Chkmod> That is: 23322 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7375
0.0034 0.7516
0.0034 0.8066
0.0034 0.8805
0.0034 0.9691
0.0034 0.8833
30.6322 0.0028
52.6394 0.0040
72.6720 0.0040
82.4473 0.0041
112.9510 0.0037
152.6020 0.0420
162.9162 0.7191
172.2734 0.5891
179.5789 0.4996
183.5726 0.4372
184.8208 0.4241
210.0528 0.4049
211.1725 0.7106
212.2030 0.7186
214.2765 0.8700
216.6842 0.3069
224.9344 0.1776
230.6541 0.2281
236.6094 0.0335
257.5360 0.0498
262.2543 0.7419
271.8140 0.1137
277.1621 0.2495
283.3884 0.2943
288.4198 0.1542
292.4996 0.4249
295.6870 0.4386
310.7553 0.5179
311.9483 0.5651
314.3205 0.7083
321.9188 0.7342
323.0340 0.7407
347.9861 0.4282
357.8422 0.4911
365.1808 0.0509
366.7917 0.4974
367.4340 0.5929
370.6292 0.6080
372.8495 0.2930
378.4990 0.2761
385.4445 0.5373
392.8678 0.6348
399.4161 0.3571
401.6240 0.2483
404.2577 0.3135
413.0579 0.5087
418.7281 0.4371
419.0096 0.5881
432.0332 0.5936
442.8154 0.3779
443.8793 0.3887
446.5277 0.5232
453.4714 0.4914
469.8179 0.2832
471.3213 0.4533
477.5346 0.1168
486.3424 0.0634
489.2430 0.4355
492.1266 0.4491
493.5621 0.4214
494.9934 0.4859
503.2616 0.3368
512.4326 0.5631
515.1864 0.5172
516.5578 0.6137
520.7635 0.4558
526.9533 0.2803
528.2941 0.5242
530.6324 0.4694
536.1589 0.6091
542.6076 0.4691
543.2592 0.5844
555.4929 0.2674
563.8149 0.3868
572.8399 0.5138
575.7144 0.4958
579.3892 0.5478
581.5221 0.5220
586.4687 0.4904
586.6697 0.5091
591.7726 0.5017
592.9669 0.5987
594.9521 0.5825
596.2389 0.5372
602.4360 0.5377
608.2794 0.5925
613.2986 0.4265
615.7929 0.6247
622.3638 0.4577
627.5522 0.4081
630.7383 0.4370
633.2569 0.4169
638.2645 0.4063
640.1092 0.3689
642.4993 0.3723
644.0574 0.3089
645.7942 0.4751
647.3443 0.5458
651.7012 0.4000
652.4245 0.3602
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
making animated gifs
11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
making animated gifs
11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
making animated gifs
11 models are in 22013106500182055.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
making animated gifs
11 models are in 22013106500182055.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22013106500182055 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22013106500182055.eigenfacs
22013106500182055.atom
making animated gifs
11 models are in 22013106500182055.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22013106500182055.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22013106500182055.10.pdb
22013106500182055.11.pdb
22013106500182055.7.pdb
22013106500182055.8.pdb
22013106500182055.9.pdb
STDERR:
real 3m4.616s
user 3m3.812s
sys 0m0.512s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|