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LOGs for ID: 22010716082450287

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22010716082450287.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22010716082450287.atom to be opened. Openam> File opened: 22010716082450287.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 62 First residue number = 33 Last residue number = 94 Number of atoms found = 805 Mean number per residue = 13.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 275.813867 +/- 4.677186 From: 265.197000 To: 287.333000 = 292.345759 +/- 6.494069 From: 281.202000 To: 312.132000 = 260.266952 +/- 12.448739 From: 238.043000 To: 284.551000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 12.3949 % Filled. Pdbmat> 361598 non-zero elements. Pdbmat> 39647 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 98.50 +/- 31.19 Maximum number = 176 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 792940. Pdbmat> Larger element = 728.970 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 62 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22010716082450287.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22010716082450287.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22010716082450287.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 805 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 62 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 4 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 9 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 23 Blocpdb> 14 atoms in block 5 Block first atom: 30 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 44 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 58 Blocpdb> 7 atoms in block 8 Block first atom: 66 Blocpdb> 7 atoms in block 9 Block first atom: 73 Blocpdb> 7 atoms in block 10 Block first atom: 80 Blocpdb> 4 atoms in block 11 Block first atom: 87 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 91 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 98 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 106 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 122 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 138 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 145 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 164 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 183 Blocpdb> 7 atoms in block 20 Block first atom: 199 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 206 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 223 Blocpdb> 7 atoms in block 23 Block first atom: 239 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 246 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 263 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 277 Blocpdb> 10 atoms in block 27 Block first atom: 293 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 303 Blocpdb> 7 atoms in block 29 Block first atom: 314 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 321 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 332 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 356 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 375 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 395 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 414 Blocpdb> 10 atoms in block 36 Block first atom: 421 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 431 Blocpdb> 10 atoms in block 38 Block first atom: 438 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 448 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 467 Blocpdb> 10 atoms in block 41 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 497 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 516 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 536 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 553 Blocpdb> 7 atoms in block 46 Block first atom: 572 Blocpdb> 7 atoms in block 47 Block first atom: 579 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 586 Blocpdb> 10 atoms in block 49 Block first atom: 602 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 612 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 629 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 646 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 663 Blocpdb> 7 atoms in block 54 Block first atom: 683 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 690 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 697 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 721 Blocpdb> 7 atoms in block 58 Block first atom: 741 Blocpdb> 7 atoms in block 59 Block first atom: 748 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 755 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 772 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 788 Blocpdb> 62 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 361660 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 2415 Prepmat> Matrix trace = 792940.0000 Prepmat> Last element read: 2415 2415 158.6428 Prepmat> 1954 lines saved. Prepmat> 1432 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 805 RTB> Total mass = 805.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 805 RTB> Number of blocks = 62 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 102905.5856 RTB> 17826 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 372 Diagstd> Nb of non-zero elements: 17826 Diagstd> Projected matrix trace = 102905.5856 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 372 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 102905.5856 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8217550 1.0407357 1.5413761 2.2962668 3.0052609 4.6041602 5.4378565 6.4306594 7.3933149 9.7571822 11.1798300 12.7661622 13.4526710 15.4031949 16.1329245 16.7232845 19.7943953 24.6157109 26.1429417 26.9919098 30.2965760 31.8752262 34.0235426 35.9867250 38.1243105 39.7217165 40.6589979 42.8285720 44.9482344 47.1969897 49.0916440 50.0452717 51.3577645 52.5990649 54.3393265 56.1976833 61.4382429 62.6324635 65.2685086 65.6830087 69.3351211 70.9245339 72.0912412 74.3474610 76.9941699 79.9150625 82.0908396 85.0029384 89.2209356 89.9454272 93.0310642 95.4410808 96.3088830 97.5402108 100.4627355 101.3623813 102.6881300 104.2494295 106.2381102 108.8863645 109.9018286 111.2308989 112.7587985 113.5102801 114.3638785 115.3685972 117.2756189 119.5436428 123.2576901 124.7510318 129.1030731 132.0063804 133.5000088 133.7062755 135.7084013 137.9926344 138.4043397 141.7752792 142.7042633 145.4246159 146.5816319 148.8313608 151.2239442 152.5377636 153.2376897 155.0991941 156.7721065 157.6107377 158.8536813 159.9735401 162.7276107 165.3706591 165.7372576 168.1779965 168.9139625 172.7375310 173.7063188 174.2580245 176.0319220 178.2625143 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034329 0.0034336 0.0034338 0.0034344 0.0034350 98.4388317 110.7810588 134.8185315 164.5532452 188.2506021 233.0078191 253.2265004 275.3740636 295.2669802 339.2012838 363.0888230 387.9944017 398.2901275 426.1874778 436.1660227 444.0747388 483.1326629 538.7676011 555.2294677 564.1727264 597.7121098 613.0867323 633.4101902 651.4280321 670.4961360 684.3988702 692.4263966 710.6603372 728.0338940 746.0233661 760.8500411 768.2044274 778.2127399 787.5611638 800.4835397 814.0563840 851.1667965 859.3993626 877.2979706 880.0792857 904.2154421 914.5206692 922.0119116 936.3287341 952.8492593 970.7549239 983.8811248 1001.1801943 1025.7196297 1029.8757326 1047.3920538 1060.8719211 1065.6840191 1072.4748710 1088.4231743 1093.2857380 1100.4122158 1108.7461474 1119.2715082 1133.1359786 1138.4074772 1145.2703139 1153.1093673 1156.9454379 1161.2874108 1166.3773737 1175.9778642 1187.2946837 1205.5973718 1212.8786556 1233.8534230 1247.6499159 1254.6885288 1255.6574448 1265.0236575 1275.6256199 1277.5271372 1292.9911010 1297.2203534 1309.5263540 1314.7254094 1324.7761673 1335.3821319 1341.1704240 1344.2439115 1352.3840836 1359.6579839 1363.2897867 1368.6547913 1373.4705700 1385.2428085 1396.4471659 1397.9941513 1408.2503489 1411.3283168 1427.2124785 1431.2090990 1433.4801169 1440.7578540 1449.8574152 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 805 Rtb_to_modes> Number of blocs = 62 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8218 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.296 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.431 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99995 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00004 1.00001 1.00003 1.00001 1.00004 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00005 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 1.00007 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00006 1.00000 0.99999 1.00003 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00004 1.00002 1.00004 1.00000 1.00004 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22010716082450287.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22010716082450287.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22010716082450287.atom Openam> file on opening on unit 11: 22010716082450287.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 62 First residue number = 33 Last residue number = 94 Number of atoms found = 805 Mean number per residue = 13.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8218 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.3 Bfactors> 106 vectors, 2415 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.821800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.491 for 62 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.119 +/- 0.21 Bfactors> = 488.073 +/- 179.78 Bfactors> Shiftng-fct= 487.954 Bfactors> Scaling-fct= 843.330 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22010716082450287.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22010716082450287.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1093. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1176. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1255. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1265. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1276. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1293. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1335. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1344. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1360. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1363. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1369. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1374. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1385. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1398. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1411. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1431. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1441. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450. Chkmod> 106 vectors, 2415 coordinates in file. Chkmod> That is: 805 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 101 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6910 0.0034 0.6988 0.0034 0.9048 0.0034 0.7480 0.0034 0.7088 0.0034 0.8991 98.4373 0.5368 110.7904 0.5602 134.7963 0.5372 164.5366 0.4683 188.2343 0.3665 232.9938 0.4791 253.2190 0.6087 275.3695 0.2197 295.2480 0.5148 339.1836 0.3660 363.0760 0.2362 388.0361 0.5826 398.2335 0.3157 426.1250 0.0502 436.1078 0.3613 444.0121 0.5333 483.0583 0.5042 538.7914 0.2314 555.1744 0.4645 564.1285 0.4329 597.7202 0.1874 613.1063 0.4155 633.3500 0.3947 651.4297 0.5376 670.4294 0.4668 684.3547 0.1099 692.4052 0.5181 710.6417 0.4026 728.0169 0.4227 746.0151 0.0463 760.8046 0.2294 768.2077 0.2600 778.1963 0.3868 787.5344 0.3912 800.4541 0.0946 814.0382 0.2503 851.1424 0.1696 859.3456 0.2567 877.2703 0.4949 880.0214 0.5497 904.2084 0.2175 914.4522 0.5968 921.9644 0.0817 936.3045 0.2853 952.7826 0.0437 970.7432 0.4528 983.8339 0.1998 1001.1199 0.4969 1025.6702 0.3644 1029.8577 0.4408 1047.3411 0.1999 1060.8204 0.3031 1065.6445 0.1333 1072.4277 0.0936 1088.5783 0.3240 1093.4417 0.2869 1100.4286 0.1971 1108.4357 0.3819 1119.0227 0.3318 1133.1583 0.2787 1138.3491 0.2160 1145.0621 0.1674 1153.2705 0.2031 1156.8434 0.2339 1161.4209 0.3969 1166.4860 0.1399 1176.0496 0.1024 1187.0270 0.2683 1205.7525 0.0780 1213.0646 0.3107 1233.7858 0.3283 1247.5662 0.3941 1254.6346 0.2673 1255.5741 0.1877 1264.9302 0.3054 1275.6049 0.2634 1277.4523 0.4024 1293.0483 0.1018 1297.1453 0.2501 1309.3593 0.2286 1314.7513 0.2659 1324.5797 0.2216 1335.2191 0.2971 1340.9468 0.3420 1344.0209 0.3645 1352.3295 0.1596 1359.7206 0.3749 1363.1848 0.5441 1368.7956 0.4466 1373.5252 0.1250 1385.0658 0.2151 1396.5111 0.4251 1397.7770 0.1148 1408.2820 0.3170 1411.2094 0.2257 1426.9962 0.3093 1431.1216 0.3750 1433.5912 0.4826 1440.5654 0.2025 1449.9476 0.0852 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22010716082450287 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom making animated gifs 11 models are in 22010716082450287.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010716082450287.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010716082450287.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22010716082450287 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010716082450287.eigenfacs 22010716082450287.atom making animated gifs 11 models are in 22010716082450287.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010716082450287.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010716082450287.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting 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