CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 22010510434787365

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22010510434787365.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22010510434787365.atom to be opened. Openam> File opened: 22010510434787365.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 251 First residue number = -5 Last residue number = 245 Number of atoms found = 1981 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 19.987207 +/- 9.453398 From: -2.995000 To: 40.750000 = -4.214037 +/- 12.157795 From: -29.870000 To: 27.584000 = 31.202617 +/- 8.618477 From: 11.724000 To: 51.729000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.3318 % Filled. Pdbmat> 765116 non-zero elements. Pdbmat> 83705 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.51 +/- 23.08 Maximum number = 129 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 1.674100E+06 Pdbmat> Larger element = 504.202 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 251 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22010510434787365.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22010510434787365.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22010510434787365.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1981 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 251 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 40 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 53 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 81 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 96 Blocpdb> 12 atoms in block 8 Block first atom: 116 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 128 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 151 Blocpdb> 11 atoms in block 11 Block first atom: 166 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 177 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 197 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 213 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 236 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 253 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 273 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 286 Blocpdb> 21 atoms in block 19 Block first atom: 302 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 323 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 350 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 369 Blocpdb> 14 atoms in block 24 Block first atom: 384 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 398 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 417 Blocpdb> 13 atoms in block 27 Block first atom: 434 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 447 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 461 Blocpdb> 17 atoms in block 30 Block first atom: 480 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 497 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 510 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 523 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 545 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 564 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 576 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 590 Blocpdb> 12 atoms in block 38 Block first atom: 604 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 616 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 636 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 653 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 668 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 683 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 700 Blocpdb> 13 atoms in block 45 Block first atom: 717 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 730 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 743 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 759 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 779 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 795 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 52 Block first atom: 827 Blocpdb> 16 atoms in block 53 Block first atom: 845 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 861 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 881 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 892 Blocpdb> 13 atoms in block 57 Block first atom: 907 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 920 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 931 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 943 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 957 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 970 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 982 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 1001 Blocpdb> 17 atoms in block 65 Block first atom: 1017 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1034 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1050 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 1065 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1078 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1090 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1102 Blocpdb> 12 atoms in block 72 Block first atom: 1119 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1131 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1144 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1157 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1172 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1185 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1199 Blocpdb> 15 atoms in block 79 Block first atom: 1219 Blocpdb> 18 atoms in block 80 Block first atom: 1234 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1252 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1267 Blocpdb> 18 atoms in block 83 Block first atom: 1286 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1304 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1321 Blocpdb> 12 atoms in block 86 Block first atom: 1336 Blocpdb> 15 atoms in block 87 Block first atom: 1348 Blocpdb> 20 atoms in block 88 Block first atom: 1363 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1383 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1402 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1416 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1433 Blocpdb> 21 atoms in block 93 Block first atom: 1448 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1469 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1482 Blocpdb> 18 atoms in block 96 Block first atom: 1496 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1514 Blocpdb> 13 atoms in block 98 Block first atom: 1530 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1543 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1559 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1573 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1593 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1608 Blocpdb> 13 atoms in block 104 Block first atom: 1622 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1635 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1648 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1663 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1684 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1701 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1721 Blocpdb> 13 atoms in block 111 Block first atom: 1738 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 1751 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 1769 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1785 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1798 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1811 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1827 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1844 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 1858 Blocpdb> 17 atoms in block 120 Block first atom: 1879 Blocpdb> 12 atoms in block 121 Block first atom: 1896 Blocpdb> 16 atoms in block 122 Block first atom: 1908 Blocpdb> 14 atoms in block 123 Block first atom: 1924 Blocpdb> 19 atoms in block 124 Block first atom: 1938 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 1957 Blocpdb> 8 atoms in block 126 Block first atom: 1973 Blocpdb> 126 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 765242 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5943 Prepmat> Matrix trace = 1674100.0000 Prepmat> Last element read: 5943 5943 91.6676 Prepmat> 8002 lines saved. Prepmat> 6544 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1981 RTB> Total mass = 1981.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1981 RTB> Number of blocks = 126 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 182685.3292 RTB> 50562 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 756 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50562 Diagstd> Projected matrix trace = 182685.3292 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 756 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 182685.3292 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.9011795 5.3555750 5.9629487 8.6646859 9.9909018 11.6256199 13.8249139 14.9889865 16.2122896 16.8014103 17.2669822 20.3026743 21.8282837 22.4392826 23.1962088 24.3436523 25.3069808 26.0651982 28.5390359 29.4567043 30.4400988 33.0432562 33.7280588 35.2721938 35.5753051 37.4628519 38.8706574 39.9022584 40.8808351 41.9128003 42.1964552 43.6051735 43.7907638 44.5970374 45.7733836 47.2798381 47.5369410 48.8163279 49.2804029 51.0351175 51.0693604 51.8912073 53.4557445 54.0376988 54.6092380 56.2764929 57.1487700 57.7796958 58.7935487 59.3414668 59.9250425 60.1882348 61.5692478 62.2297003 62.8012033 64.0063584 65.1103399 66.7391673 66.9106370 67.6695919 68.1503007 68.5086802 69.7074410 70.4497729 71.6368917 71.8516240 72.6584079 73.4932416 74.2582077 74.9750170 75.4155774 76.8738715 76.9155039 77.7526421 78.1859174 79.3817451 79.6349012 82.3928475 82.9294185 83.2507435 84.7075689 85.3011064 86.0703352 86.2481717 87.9105633 88.0076132 88.7699353 89.4551348 90.4183760 92.3879185 92.7167315 93.2165260 94.9976447 95.4225137 96.0270811 96.3031836 96.9727130 98.3274600 98.7399430 98.9672302 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034337 0.0034343 0.0034347 0.0034354 0.0034356 214.4831830 251.3033829 265.1708712 319.6477804 343.2397891 370.2570534 403.7629813 420.4181088 437.2375541 445.1108169 451.2357510 489.2962686 507.3469753 514.3985843 523.0025247 535.7820367 546.2801854 554.4032860 580.1161136 589.3690939 599.1261957 624.2185915 630.6537082 644.9284213 647.6935872 664.6541151 677.0273653 685.9524611 694.3127808 703.0215200 705.3964421 717.0745181 718.5988869 725.1841190 734.6860421 746.6778541 748.7052799 758.7135387 762.3113835 775.7643892 776.0246018 782.2438688 793.9487541 798.2587789 802.4691372 814.6269856 820.9160068 825.4350496 832.6454581 836.5163211 840.6194909 842.4634800 852.0737856 856.6316867 860.5562495 868.7740492 876.2343245 887.1267443 888.2656390 893.2891499 896.4563927 898.8103831 906.6399466 911.4546794 919.1018644 920.4783425 925.6316987 930.9341926 935.7665388 940.2721366 943.0306549 952.1045862 952.3623654 957.5310330 960.1952394 967.5103095 969.0518233 985.6892871 988.8936551 990.8076261 999.4392228 1002.9345961 1007.4465812 1008.4868253 1018.1594856 1018.7213351 1023.1239051 1027.0649714 1032.5798156 1043.7653404 1045.6210961 1048.4355466 1058.4045523 1060.7687247 1064.1237694 1065.6524858 1069.3504418 1076.7941578 1079.0503660 1080.2915727 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1981 Rtb_to_modes> Number of blocs = 126 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9863E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 756 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 35658 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22010510434787365.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22010510434787365.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22010510434787365.atom Openam> file on opening on unit 11: 22010510434787365.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 251 First residue number = -5 Last residue number = 245 Number of atoms found = 1981 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9863E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.97 Bfactors> 106 vectors, 5943 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.901000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.384 for 254 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.02 Bfactors> = 33.264 +/- 5.51 Bfactors> Shiftng-fct= 33.245 Bfactors> Scaling-fct= 359.615 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22010510434787365.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22010510434787365.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080. Chkmod> 106 vectors, 5943 coordinates in file. Chkmod> That is: 1981 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7644 0.0034 0.7691 0.0034 0.8634 0.0034 0.9937 0.0034 0.9835 0.0034 0.7914 214.4690 0.4874 251.3026 0.4428 265.1606 0.4192 319.6399 0.4204 343.2267 0.4459 370.3109 0.5168 403.6739 0.6217 420.4143 0.4154 437.1879 0.4263 445.0730 0.5794 451.2558 0.5325 489.2430 0.5898 507.3451 0.3239 514.3847 0.4471 523.0228 0.6467 535.7188 0.5978 546.2893 0.5880 554.4305 0.6246 580.1010 0.4670 589.3768 0.4595 599.0995 0.5595 624.1610 0.3731 630.6448 0.2401 644.8807 0.3895 647.7085 0.4068 664.6003 0.4501 676.9926 0.3485 685.9036 0.4533 694.2759 0.5082 702.9679 0.2475 705.3958 0.4345 717.0834 0.3577 718.5618 0.3630 725.1771 0.3324 734.6273 0.4136 746.6471 0.4565 748.6972 0.4967 758.7095 0.4514 762.2755 0.5143 775.7682 0.2707 775.9961 0.4879 782.2012 0.4529 793.9463 0.3479 798.2415 0.4352 802.4403 0.5105 814.6174 0.4506 820.8896 0.4397 825.4018 0.3808 832.5846 0.3617 836.4701 0.3790 840.6182 0.4210 842.4397 0.3994 852.0424 0.2599 856.5970 0.4170 860.5111 0.1754 868.7615 0.4669 876.1944 0.5116 887.0942 0.5017 888.2233 0.3724 893.2535 0.5284 896.4159 0.3331 898.7805 0.5354 906.6177 0.4902 911.4170 0.5291 919.0823 0.3408 920.4284 0.5260 925.6021 0.3845 930.8737 0.3026 935.7377 0.4143 940.2630 0.4298 943.0178 0.2755 952.0397 0.5568 952.3493 0.3804 957.4737 0.4890 960.1791 0.4809 967.4581 0.4851 968.9804 0.4445 985.6299 0.3843 988.8547 0.4255 990.7607 0.4340 999.4107 0.4536 1002.8850 0.5281 1007.4014 0.4243 1008.4542 0.4065 1018.1125 0.4128 1018.6914 0.5566 1023.0804 0.3920 1027.0488 0.5154 1032.5448 0.4002 1043.7323 0.4997 1045.5946 0.3515 1048.4101 0.5414 1058.3722 0.4796 1060.7092 0.4713 1064.0943 0.4651 1065.5891 0.4548 1069.2896 0.4427 1076.7618 0.5041 1079.0044 0.4519 1080.2603 0.5021 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22010510434787365 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom making animated gifs 11 models are in 22010510434787365.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22010510434787365 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom making animated gifs 11 models are in 22010510434787365.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22010510434787365 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom making animated gifs 11 models are in 22010510434787365.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22010510434787365 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom making animated gifs 11 models are in 22010510434787365.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22010510434787365 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22010510434787365.eigenfacs 22010510434787365.atom making animated gifs 11 models are in 22010510434787365.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22010510434787365.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22010510434787365.10.pdb 22010510434787365.11.pdb 22010510434787365.7.pdb 22010510434787365.8.pdb 22010510434787365.9.pdb STDERR: real 0m6.062s user 0m6.024s sys 0m0.032s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.