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***  6B73.S187.Chol  ***

LOGs for ID: 210720075415116992

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210720075415116992.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210720075415116992.atom to be opened. Openam> File opened: 210720075415116992.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 282 First residue number = 51 Last residue number = 1 Number of atoms found = 2146 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.274555 +/- 9.677062 From: -28.013000 To: 20.688000 = -0.344370 +/- 8.875813 From: -19.403000 To: 20.343000 = -1.737783 +/- 15.309394 From: -36.523000 To: 31.636000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.6526 % Filled. Pdbmat> 757072 non-zero elements. Pdbmat> 82704 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 77.08 +/- 22.21 Maximum number = 129 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.654080E+06 Pdbmat> Larger element = 493.563 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 282 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210720075415116992.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210720075415116992.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210720075415116992.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2146 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 282 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 21 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 34 Blocpdb> 14 atoms in block 5 Block first atom: 47 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 61 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 77 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 89 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 108 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 121 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 139 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 153 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 165 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 176 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 190 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 205 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 224 Blocpdb> 13 atoms in block 18 Block first atom: 239 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 252 Blocpdb> 13 atoms in block 20 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 284 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 300 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 312 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 328 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 348 Blocpdb> 13 atoms in block 26 Block first atom: 367 Blocpdb> 13 atoms in block 27 Block first atom: 380 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 393 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 406 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 421 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 435 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 450 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 468 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 483 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 497 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 517 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 533 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 553 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 571 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 583 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 598 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 613 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 628 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 642 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 658 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 682 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 698 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 716 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 730 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 748 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 763 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 779 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 792 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 811 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 831 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 843 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 859 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 873 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 887 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 903 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 925 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 939 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 956 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 970 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 986 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1002 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1016 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1038 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 1052 Blocpdb> 11 atoms in block 70 Block first atom: 1063 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1074 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1087 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1100 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 1115 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1123 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1135 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1145 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1155 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 1172 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1184 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1201 Blocpdb> 10 atoms in block 82 Block first atom: 1219 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1229 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1249 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1269 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1291 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1310 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1324 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 1338 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1356 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1375 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1391 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1406 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1420 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1436 Blocpdb> 13 atoms in block 96 Block first atom: 1452 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1465 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1484 Blocpdb> 13 atoms in block 99 Block first atom: 1500 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1513 Blocpdb> 11 atoms in block 101 Block first atom: 1532 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1543 Blocpdb> 10 atoms in block 103 Block first atom: 1555 Blocpdb> 10 atoms in block 104 Block first atom: 1565 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1575 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 1588 Blocpdb> 10 atoms in block 107 Block first atom: 1601 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1611 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1626 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1645 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1660 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1674 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1686 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1704 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 1718 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 1738 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1752 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1770 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1789 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1805 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 1817 Blocpdb> 4 atoms in block 122 Block first atom: 1830 Blocpdb> 11 atoms in block 123 Block first atom: 1834 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1845 Blocpdb> 12 atoms in block 125 Block first atom: 1860 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 1872 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 1885 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 1897 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1921 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1938 Blocpdb> 12 atoms in block 131 Block first atom: 1951 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 1963 Blocpdb> 14 atoms in block 133 Block first atom: 1982 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 1996 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2010 Blocpdb> 10 atoms in block 136 Block first atom: 2025 Blocpdb> 17 atoms in block 137 Block first atom: 2035 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2052 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2071 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2088 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2104 Blocpdb> 29 atoms in block 142 Block first atom: 2117 Blocpdb> 142 blocks. Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 757214 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6438 Prepmat> Matrix trace = 1654080.0000 Prepmat> Last element read: 6438 6438 239.4018 Prepmat> 10154 lines saved. Prepmat> 8795 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2146 RTB> Total mass = 2146.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2146 RTB> Number of blocks = 142 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 180958.0082 RTB> 46758 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 852 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46758 Diagstd> Projected matrix trace = 180958.0082 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 852 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 180958.0082 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4910772 1.1975903 1.2406556 1.4347833 1.6932622 1.8829463 3.1475461 3.3591224 4.0701368 4.2246461 5.3508785 5.5309479 5.7771872 6.2868176 6.5255534 7.4103108 7.6985759 8.6370491 9.1077663 10.0207741 10.1749602 10.5767034 11.2602001 11.8673950 12.5022928 13.5356037 13.7546587 14.7250571 15.7025159 16.3357569 16.5586289 16.8879230 17.3223691 18.4764800 19.3540967 19.5811013 19.6639531 20.8284755 20.9340728 21.6816541 22.3213709 22.5648054 23.2626440 23.8743204 24.5008759 24.6910560 25.0224490 25.8736078 26.1915884 26.4801356 28.0057636 28.1602293 28.8610125 29.4395305 30.6420740 31.5588869 32.1660563 32.8908097 33.3138309 33.9819510 35.0422589 36.2439185 36.9936083 37.6540023 37.9084665 38.3107647 38.6397496 39.6483962 39.8935807 40.3495284 42.6236829 42.9971441 43.4173841 43.5239304 44.2721791 44.6698076 45.9446045 45.9739604 46.9248401 47.0461310 47.4456517 47.8927016 48.5960456 50.4208134 51.1317669 51.7213856 52.1357761 52.4730274 53.7075088 54.2294995 54.5293591 55.0457986 56.3847033 56.9617383 57.5122671 57.8563478 58.2984293 58.9384204 59.6130121 60.0357766 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034333 0.0034338 0.0034347 0.0034349 0.0034353 0.0034361 76.0974584 118.8363822 120.9541830 130.0733818 141.3049549 149.0095984 192.6554637 199.0252570 219.0785133 223.1980774 251.1931695 255.3848111 261.0078084 272.2768450 277.3984009 295.6061678 301.3009334 319.1376001 327.7186970 343.7525400 346.3870439 353.1591342 364.3915803 374.0873132 383.9636517 399.5159245 402.7357561 416.7002625 430.3084766 438.8993228 441.8831762 446.2553141 451.9588810 466.7721094 477.7291408 480.5226211 481.5381445 495.5916980 496.8463971 505.6400737 513.0452989 515.8353206 523.7509425 530.5921116 537.5094267 539.5915156 543.2005317 552.3619768 555.7458125 558.7986943 574.6706132 576.2532314 583.3793629 589.1972619 601.1105617 610.0369185 615.8772885 622.7769971 626.7690871 633.0229204 642.8228811 653.7517324 660.4784125 666.3476230 668.5954069 672.1337306 675.0134583 683.7669301 685.8778691 689.7862162 708.9584230 712.0575334 715.5287809 716.4061970 722.5380619 725.7755290 736.0588501 736.2939619 743.8693777 744.8301310 747.9860332 751.5016668 756.9997672 771.0813591 776.4986060 780.9628151 784.0851010 786.6170234 795.8162160 799.6741884 801.8820221 805.6703270 815.4098060 819.5715939 823.5226040 825.9823891 829.1320581 833.6706775 838.4280771 841.3958136 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2146 Rtb_to_modes> Number of blocs = 142 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.241 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.693 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.225 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.699 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210720075415116992.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210720075415116992.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210720075415116992.atom Openam> file on opening on unit 11: 210720075415116992.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 282 First residue number = 51 Last residue number = 1 Number of atoms found = 2146 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.241 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.30 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7 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vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.4 Chkmod> 106 vectors, 6438 coordinates in file. Chkmod> That is: 2146 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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6 models are in 210720075415116992.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210720075415116992 11 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 210720075415116992.eigenfacs 210720075415116992.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210720075415116992.eigenfacs 210720075415116992.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210720075415116992.eigenfacs 210720075415116992.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210720075415116992.eigenfacs 210720075415116992.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210720075415116992.eigenfacs 210720075415116992.atom calculating perturbed structure for DQ=50 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