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LOGs for ID: 21070916233781295

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21070916233781295.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21070916233781295.atom to be opened. Openam> File opened: 21070916233781295.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1458 First residue number = 38 Last residue number = 474 Number of atoms found = 11780 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 145.807877 +/- 19.233082 From: 101.869000 To: 192.630000 = 130.952952 +/- 22.479643 From: 68.147000 To: 185.767000 = 158.099336 +/- 28.941753 From: 89.431000 To: 224.841000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6803 % Filled. Pdbmat> 4248083 non-zero elements. Pdbmat> 464237 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.82 +/- 23.47 Maximum number = 150 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 9.284740E+06 Pdbmat> Larger element = 567.721 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1458 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21070916233781295.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21070916233781295.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21070916233781295.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11780 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1458 residues. Blocpdb> 67 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 70 atoms in block 2 Block first atom: 68 Blocpdb> 67 atoms in block 3 Block first atom: 138 Blocpdb> 74 atoms in block 4 Block first atom: 205 Blocpdb> 65 atoms in block 5 Block first atom: 279 Blocpdb> 74 atoms in block 6 Block first atom: 344 Blocpdb> 51 atoms in block 7 Block first atom: 418 Blocpdb> 63 atoms in block 8 Block first atom: 469 Blocpdb> 65 atoms in block 9 Block first atom: 532 Blocpdb> 60 atoms in block 10 Block first atom: 597 Blocpdb> 68 atoms in block 11 Block first atom: 657 Blocpdb> 67 atoms in block 12 Block first atom: 725 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 792 Blocpdb> 61 atoms in block 14 Block first atom: 803 Blocpdb> 66 atoms in block 15 Block first atom: 864 Blocpdb> 60 atoms in block 16 Block first atom: 930 Blocpdb> 68 atoms in block 17 Block first atom: 990 Blocpdb> 63 atoms in block 18 Block first atom: 1058 Blocpdb> 60 atoms in block 19 Block first atom: 1121 Blocpdb> 72 atoms in block 20 Block first atom: 1181 Blocpdb> 57 atoms in block 21 Block first atom: 1253 Blocpdb> 69 atoms in block 22 Block first atom: 1310 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 1379 Blocpdb> 55 atoms in block 24 Block first atom: 1430 Blocpdb> 62 atoms in block 25 Block first atom: 1485 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 1547 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1618 Blocpdb> 58 atoms in block 28 Block first atom: 1677 Blocpdb> 64 atoms in block 29 Block first atom: 1735 Blocpdb> 52 atoms in block 30 Block first atom: 1799 Blocpdb> 71 atoms in block 31 Block first atom: 1851 Blocpdb> 66 atoms in block 32 Block first atom: 1922 Blocpdb> 68 atoms in block 33 Block first atom: 1988 Blocpdb> 59 atoms in block 34 Block first atom: 2056 Blocpdb> 52 atoms in block 35 Block first atom: 2115 Blocpdb> 67 atoms in block 36 Block first atom: 2167 Blocpdb> 41 atoms in block 37 Block first atom: 2234 Blocpdb> 72 atoms in block 38 Block first atom: 2275 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2347 Blocpdb> 59 atoms in block 40 Block first atom: 2416 Blocpdb> 59 atoms in block 41 Block first atom: 2475 Blocpdb> 73 atoms in block 42 Block first atom: 2534 Blocpdb> 57 atoms in block 43 Block first atom: 2607 Blocpdb> 61 atoms in block 44 Block first atom: 2664 Blocpdb> 63 atoms in block 45 Block first atom: 2725 Blocpdb> 58 atoms in block 46 Block first atom: 2788 Blocpdb> 59 atoms in block 47 Block first atom: 2846 Blocpdb> 59 atoms in block 48 Block first atom: 2905 Blocpdb> 37 atoms in block 49 Block first atom: 2964 Blocpdb> 67 atoms in block 50 Block first atom: 3001 Blocpdb> 70 atoms in block 51 Block first atom: 3068 Blocpdb> 67 atoms in block 52 Block first atom: 3138 Blocpdb> 74 atoms in block 53 Block first atom: 3205 Blocpdb> 65 atoms in block 54 Block first atom: 3279 Blocpdb> 74 atoms in block 55 Block first atom: 3344 Blocpdb> 51 atoms in block 56 Block first atom: 3418 Blocpdb> 63 atoms in block 57 Block first atom: 3469 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 3532 Blocpdb> 60 atoms in block 59 Block first atom: 3597 Blocpdb> 68 atoms in block 60 Block first atom: 3657 Blocpdb> 67 atoms in block 61 Block first atom: 3725 Blocpdb> 11 atoms in block 62 Block first atom: 3792 Blocpdb> 73 atoms in block 63 Block first atom: 3803 Blocpdb> 57 atoms in block 64 Block first atom: 3876 Blocpdb> 69 atoms in block 65 Block first atom: 3933 Blocpdb> 57 atoms in block 66 Block first atom: 4002 Blocpdb> 68 atoms in block 67 Block first atom: 4059 Blocpdb> 64 atoms in block 68 Block first atom: 4127 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4191 Blocpdb> 67 atoms in block 70 Block first atom: 4257 Blocpdb> 60 atoms in block 71 Block first atom: 4324 Blocpdb> 67 atoms in block 72 Block first atom: 4384 Blocpdb> 36 atoms in block 73 Block first atom: 4451 Blocpdb> 68 atoms in block 74 Block first atom: 4487 Blocpdb> 65 atoms in block 75 Block first atom: 4555 Blocpdb> 73 atoms in block 76 Block first atom: 4620 Blocpdb> 67 atoms in block 77 Block first atom: 4693 Blocpdb> 65 atoms in block 78 Block first atom: 4760 Blocpdb> 62 atoms in block 79 Block first atom: 4825 Blocpdb> 70 atoms in block 80 Block first atom: 4887 Blocpdb> 67 atoms in block 81 Block first atom: 4957 Blocpdb> 47 atoms in block 82 Block first atom: 5024 Blocpdb> 70 atoms in block 83 Block first atom: 5071 Blocpdb> 63 atoms in block 84 Block first atom: 5141 Blocpdb> 66 atoms in block 85 Block first atom: 5204 Blocpdb> 61 atoms in block 86 Block first atom: 5270 Blocpdb> 67 atoms in block 87 Block first atom: 5331 Blocpdb> 68 atoms in block 88 Block first atom: 5398 Blocpdb> 62 atoms in block 89 Block first atom: 5466 Blocpdb> 67 atoms in block 90 Block first atom: 5528 Blocpdb> 66 atoms in block 91 Block first atom: 5595 Blocpdb> 69 atoms in block 92 Block first atom: 5661 Blocpdb> 64 atoms in block 93 Block first atom: 5730 Blocpdb> 66 atoms in block 94 Block first atom: 5794 Blocpdb> 64 atoms in block 95 Block first atom: 5860 Blocpdb> 67 atoms in block 96 Block first atom: 5924 Blocpdb> 66 atoms in block 97 Block first atom: 5991 Blocpdb> 62 atoms in block 98 Block first atom: 6057 Blocpdb> 66 atoms in block 99 Block first atom: 6119 Blocpdb> 60 atoms in block 100 Block first atom: 6185 Blocpdb> 68 atoms in block 101 Block first atom: 6245 Blocpdb> 70 atoms in block 102 Block first atom: 6313 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 6383 Blocpdb> 74 atoms in block 104 Block first atom: 6432 Blocpdb> 69 atoms in block 105 Block first atom: 6506 Blocpdb> 76 atoms in block 106 Block first atom: 6575 Blocpdb> 64 atoms in block 107 Block first atom: 6651 Blocpdb> 69 atoms in block 108 Block first atom: 6715 Blocpdb> 53 atoms in block 109 Block first atom: 6784 Blocpdb> 68 atoms in block 110 Block first atom: 6837 Blocpdb> 58 atoms in block 111 Block first atom: 6905 Blocpdb> 61 atoms in block 112 Block first atom: 6963 Blocpdb> 60 atoms in block 113 Block first atom: 7024 Blocpdb> 65 atoms in block 114 Block first atom: 7084 Blocpdb> 64 atoms in block 115 Block first atom: 7149 Blocpdb> 67 atoms in block 116 Block first atom: 7213 Blocpdb> 70 atoms in block 117 Block first atom: 7280 Blocpdb> 71 atoms in block 118 Block first atom: 7350 Blocpdb> 61 atoms in block 119 Block first atom: 7421 Blocpdb> 67 atoms in block 120 Block first atom: 7482 Blocpdb> 70 atoms in block 121 Block first atom: 7549 Blocpdb> 62 atoms in block 122 Block first atom: 7619 Blocpdb> 67 atoms in block 123 Block first atom: 7681 Blocpdb> 67 atoms in block 124 Block first atom: 7748 Blocpdb> 68 atoms in block 125 Block first atom: 7815 Blocpdb> 50 atoms in block 126 Block first atom: 7883 Blocpdb> 67 atoms in block 127 Block first atom: 7933 Blocpdb> 69 atoms in block 128 Block first atom: 8000 Blocpdb> 64 atoms in block 129 Block first atom: 8069 Blocpdb> 60 atoms in block 130 Block first atom: 8133 Blocpdb> 47 atoms in block 131 Block first atom: 8193 Blocpdb> 66 atoms in block 132 Block first atom: 8240 Blocpdb> 58 atoms in block 133 Block first atom: 8306 Blocpdb> 68 atoms in block 134 Block first atom: 8364 Blocpdb> 65 atoms in block 135 Block first atom: 8432 Blocpdb> 57 atoms in block 136 Block first atom: 8497 Blocpdb> 70 atoms in block 137 Block first atom: 8554 Blocpdb> 76 atoms in block 138 Block first atom: 8624 Blocpdb> 72 atoms in block 139 Block first atom: 8700 Blocpdb> 70 atoms in block 140 Block first atom: 8772 Blocpdb> 66 atoms in block 141 Block first atom: 8842 Blocpdb> 64 atoms in block 142 Block first atom: 8908 Blocpdb> 62 atoms in block 143 Block first atom: 8972 Blocpdb> 67 atoms in block 144 Block first atom: 9034 Blocpdb> 58 atoms in block 145 Block first atom: 9101 Blocpdb> 70 atoms in block 146 Block first atom: 9159 Blocpdb> 63 atoms in block 147 Block first atom: 9229 Blocpdb> 74 atoms in block 148 Block first atom: 9292 Blocpdb> 57 atoms in block 149 Block first atom: 9366 Blocpdb> 67 atoms in block 150 Block first atom: 9423 Blocpdb> 59 atoms in block 151 Block first atom: 9490 Blocpdb> 57 atoms in block 152 Block first atom: 9549 Blocpdb> 62 atoms in block 153 Block first atom: 9606 Blocpdb> 62 atoms in block 154 Block first atom: 9668 Blocpdb> 70 atoms in block 155 Block first atom: 9730 Blocpdb> 53 atoms in block 156 Block first atom: 9800 Blocpdb> 61 atoms in block 157 Block first atom: 9853 Blocpdb> 69 atoms in block 158 Block first atom: 9914 Blocpdb> 73 atoms in block 159 Block first atom: 9983 Blocpdb> 64 atoms in block 160 Block first atom: 10056 Blocpdb> 80 atoms in block 161 Block first atom: 10120 Blocpdb> 66 atoms in block 162 Block first atom: 10200 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 10266 Blocpdb> 60 atoms in block 164 Block first atom: 10331 Blocpdb> 62 atoms in block 165 Block first atom: 10391 Blocpdb> 73 atoms in block 166 Block first atom: 10453 Blocpdb> 67 atoms in block 167 Block first atom: 10526 Blocpdb> 67 atoms in block 168 Block first atom: 10593 Blocpdb> 76 atoms in block 169 Block first atom: 10660 Blocpdb> 69 atoms in block 170 Block first atom: 10736 Blocpdb> 63 atoms in block 171 Block first atom: 10805 Blocpdb> 66 atoms in block 172 Block first atom: 10868 Blocpdb> 63 atoms in block 173 Block first atom: 10934 Blocpdb> 62 atoms in block 174 Block first atom: 10997 Blocpdb> 60 atoms in block 175 Block first atom: 11059 Blocpdb> 67 atoms in block 176 Block first atom: 11119 Blocpdb> 69 atoms in block 177 Block first atom: 11186 Blocpdb> 67 atoms in block 178 Block first atom: 11255 Blocpdb> 61 atoms in block 179 Block first atom: 11322 Blocpdb> 50 atoms in block 180 Block first atom: 11383 Blocpdb> 68 atoms in block 181 Block first atom: 11433 Blocpdb> 61 atoms in block 182 Block first atom: 11501 Blocpdb> 63 atoms in block 183 Block first atom: 11562 Blocpdb> 72 atoms in block 184 Block first atom: 11625 Blocpdb> 66 atoms in block 185 Block first atom: 11697 Blocpdb> 18 atoms in block 186 Block first atom: 11762 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 80 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4248269 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 35340 Prepmat> Matrix trace = 9284740.0000 Prepmat> Last element read: 35340 35340 143.3350 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 16036 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11780 RTB> Total mass = 11780.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11780 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 174482.8344 RTB> 45990 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45990 Diagstd> Projected matrix trace = 174482.8344 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 174482.8344 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1095554 0.1707665 0.2216797 0.3652685 0.4480286 0.5287791 0.5762574 0.6628774 0.8643831 0.9570930 1.0847064 1.1388289 1.3118001 1.4005129 1.4373078 1.6163818 1.6726192 1.7041721 1.7580302 1.8172140 2.0285715 2.1296392 2.4151467 2.4900737 2.6608951 2.9259329 3.2374787 3.3981948 3.5350603 3.7961645 3.9239526 4.2204086 4.3922373 4.4747781 4.6918652 5.2989062 5.8139552 6.0239681 6.3732881 6.5470697 6.6499225 7.1764899 7.4642941 7.7195716 7.9899709 8.3036234 8.6051098 8.8950229 9.1691279 9.4158335 9.6092287 9.8334720 10.2541941 10.6717400 10.7954978 11.3001674 11.3963308 11.8180312 12.0478966 12.2899668 12.7186507 13.5300310 13.6466761 13.9913977 14.1469630 14.3415336 14.7883389 14.9099736 15.0992419 15.2287992 15.5947368 16.0410348 16.3196485 16.4584288 16.8600579 17.1880787 17.4007144 17.5413525 18.0963909 18.4838848 18.7358808 18.9203596 19.0672651 19.7834965 19.9046710 20.0071547 20.7997374 21.1334671 21.1979612 21.5042870 21.7032333 22.0416180 22.5308362 23.0114764 23.2027485 23.2069301 23.9055763 23.9845502 24.3256307 24.4391733 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034337 0.0034342 0.0034344 0.0034344 0.0034346 35.9428291 44.8741961 51.1279338 65.6298453 72.6855645 78.9645958 82.4334652 88.4121351 100.9597832 106.2361541 113.0970752 115.8842784 124.3738585 128.5105654 130.1877658 138.0598059 140.4409698 141.7594468 143.9820823 146.3855859 154.6644300 158.4704512 168.7590374 171.3568136 177.1369484 185.7494190 195.3883826 200.1794136 204.1708298 211.5766757 215.1082938 223.0861101 227.5821410 229.7105979 235.2166413 249.9702904 261.8370631 266.5241767 274.1429329 277.8553503 280.0293638 290.9050901 296.6809441 301.7115112 306.9501698 312.9169603 318.5469780 323.8685780 328.8208107 333.2150938 336.6197121 340.5247814 347.7331121 354.7422358 356.7932402 365.0376997 366.5876280 373.3084729 376.9214879 380.6892692 387.2717343 399.4336756 401.1517784 406.1868235 408.4387032 411.2378479 417.5946995 419.3085500 421.9615240 423.7679528 428.8291561 434.9220938 438.6828742 440.5441792 445.8870007 450.2035824 452.9797837 454.8066622 461.9460567 466.8656348 470.0373158 472.3457084 474.1759065 482.9996387 484.4765737 485.7221907 495.2496831 499.2069883 499.9681355 503.5676283 505.8916361 509.8201732 515.4469045 520.9157905 523.0762444 523.1233758 530.9393196 531.8155959 535.5836804 536.8321733 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11780 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.085 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.616 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.490 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.926 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.237 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.220 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.373 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.990 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.895 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 212040 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99996 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21070916233781295.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21070916233781295.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21070916233781295.atom Openam> file on opening on unit 11: 21070916233781295.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1458 First residue number = 38 Last residue number = 474 Number of atoms found = 11780 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.616 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.490 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.926 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.237 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.220 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.373 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.895 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Bfactors> 106 vectors, 35340 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.109600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.274 for 1458 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.062 +/- 0.06 Bfactors> = 22.281 +/- 33.57 Bfactors> Shiftng-fct= 22.219 Bfactors> Scaling-fct= 570.455 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21070916233781295.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21070916233781295.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 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vecteur en lecture: 434.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Chkmod> 106 vectors, 35340 coordinates in file. Chkmod> That is: 11780 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 73 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6990 0.0034 0.8606 0.0034 0.7372 0.0034 0.7629 0.0034 0.8578 0.0034 0.9890 35.9486 0.6838 44.8767 0.6817 51.1281 0.5119 65.6299 0.8100 72.6801 0.4727 78.9628 0.7093 82.4330 0.5332 88.4098 0.5726 100.9564 0.0238 106.2320 0.5260 113.1075 0.4648 115.8880 0.6112 124.3780 0.5974 128.5274 0.4889 130.1682 0.2739 138.0376 0.1659 140.4509 0.1953 141.7462 0.2342 143.9747 0.1930 146.3707 0.2197 154.6741 0.1483 158.4771 0.3818 168.7467 0.3552 171.3469 0.2460 177.1328 0.2711 185.7436 0.4145 195.3656 0.4465 200.1651 0.3119 204.1603 0.1311 211.5630 0.1317 215.1004 0.3188 223.0657 0.4890 227.5662 0.1361 229.7064 0.4277 235.2099 0.3131 249.9618 0.4609 261.8268 0.4785 266.5134 0.4528 274.1250 0.3125 277.8419 0.4193 280.0190 0.3228 290.8827 0.2721 296.6624 0.5136 301.7069 0.3506 306.9376 0.1772 312.9106 0.5195 318.5313 0.2200 323.8543 0.3841 328.8044 0.3498 333.2037 0.3721 336.6013 0.4890 340.5020 0.3816 347.6471 0.3684 354.6981 0.4050 356.8523 0.3637 365.0193 0.2879 366.6309 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21070916233781295 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom making animated gifs 11 models are in 21070916233781295.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21070916233781295 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21070916233781295.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21070916233781295 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21070916233781295 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21070916233781295.eigenfacs 21070916233781295.atom making animated gifs 11 models are in 21070916233781295.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21070916233781295.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21070916233781295.10.pdb 21070916233781295.11.pdb 21070916233781295.7.pdb 21070916233781295.8.pdb 21070916233781295.9.pdb STDERR: real 0m52.849s user 0m52.616s sys 0m0.188s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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