*** 4P8Y V/S 4FF6 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 20122619181697143.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 20122619181697143.atom to be opened.
Openam> File opened: 20122619181697143.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 871
First residue number = 4
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6724
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 33.700549 +/- 20.837689 From: -10.470000 To: 80.516000
= -16.227418 +/- 12.976692 From: -55.617000 To: 17.592000
= 19.857881 +/- 21.966084 From: -26.057000 To: 65.493000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2664 % Filled.
Pdbmat> 2576684 non-zero elements.
Pdbmat> 281860 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.84 +/- 22.21
Maximum number = 130
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 5.637200E+06
Pdbmat> Larger element = 504.295
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
871 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 20122619181697143.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 20122619181697143.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
20122619181697143.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6724 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 871 residues.
Blocpdb> 30 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 38 atoms in block 2
Block first atom: 31
Blocpdb> 40 atoms in block 3
Block first atom: 69
Blocpdb> 32 atoms in block 4
Block first atom: 109
Blocpdb> 39 atoms in block 5
Block first atom: 141
Blocpdb> 36 atoms in block 6
Block first atom: 180
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 216
Blocpdb> 35 atoms in block 8
Block first atom: 253
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 288
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 315
Blocpdb> 38 atoms in block 11
Block first atom: 348
Blocpdb> 38 atoms in block 12
Block first atom: 386
Blocpdb> 30 atoms in block 13
Block first atom: 424
Blocpdb> 35 atoms in block 14
Block first atom: 454
Blocpdb> 38 atoms in block 15
Block first atom: 489
Blocpdb> 39 atoms in block 16
Block first atom: 527
Blocpdb> 37 atoms in block 17
Block first atom: 566
Blocpdb> 39 atoms in block 18
Block first atom: 603
Blocpdb> 32 atoms in block 19
Block first atom: 642
Blocpdb> 42 atoms in block 20
Block first atom: 674
Blocpdb> 36 atoms in block 21
Block first atom: 716
Blocpdb> 40 atoms in block 22
Block first atom: 752
Blocpdb> 33 atoms in block 23
Block first atom: 792
Blocpdb> 41 atoms in block 24
Block first atom: 825
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 866
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 892
Blocpdb> 43 atoms in block 27
Block first atom: 928
Blocpdb> 30 atoms in block 28
Block first atom: 971
Blocpdb> 42 atoms in block 29
Block first atom: 1001
Blocpdb> 39 atoms in block 30
Block first atom: 1043
Blocpdb> 34 atoms in block 31
Block first atom: 1082
Blocpdb> 43 atoms in block 32
Block first atom: 1116
Blocpdb> 33 atoms in block 33
Block first atom: 1159
Blocpdb> 47 atoms in block 34
Block first atom: 1192
Blocpdb> 30 atoms in block 35
Block first atom: 1239
Blocpdb> 31 atoms in block 36
Block first atom: 1269
Blocpdb> 39 atoms in block 37
Block first atom: 1300
Blocpdb> 39 atoms in block 38
Block first atom: 1339
Blocpdb> 37 atoms in block 39
Block first atom: 1378
Blocpdb> 36 atoms in block 40
Block first atom: 1415
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1451
Blocpdb> 40 atoms in block 42
Block first atom: 1484
Blocpdb> 37 atoms in block 43
Block first atom: 1524
Blocpdb> 35 atoms in block 44
Block first atom: 1561
Blocpdb> 43 atoms in block 45
Block first atom: 1596
Blocpdb> 43 atoms in block 46
Block first atom: 1639
Blocpdb> 33 atoms in block 47
Block first atom: 1682
Blocpdb> 37 atoms in block 48
Block first atom: 1715
Blocpdb> 33 atoms in block 49
Block first atom: 1752
Blocpdb> 38 atoms in block 50
Block first atom: 1785
Blocpdb> 38 atoms in block 51
Block first atom: 1823
Blocpdb> 43 atoms in block 52
Block first atom: 1861
Blocpdb> 43 atoms in block 53
Block first atom: 1904
Blocpdb> 37 atoms in block 54
Block first atom: 1947
Blocpdb> 37 atoms in block 55
Block first atom: 1984
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2021
Blocpdb> 41 atoms in block 57
Block first atom: 2059
Blocpdb> 34 atoms in block 58
Block first atom: 2100
Blocpdb> 54 atoms in block 59
Block first atom: 2134
Blocpdb> 38 atoms in block 60
Block first atom: 2188
Blocpdb> 40 atoms in block 61
Block first atom: 2226
Blocpdb> 43 atoms in block 62
Block first atom: 2266
Blocpdb> 45 atoms in block 63
Block first atom: 2309
Blocpdb> 46 atoms in block 64
Block first atom: 2354
Blocpdb> 24 atoms in block 65
Block first atom: 2400
Blocpdb> 37 atoms in block 66
Block first atom: 2424
Blocpdb> 47 atoms in block 67
Block first atom: 2461
Blocpdb> 35 atoms in block 68
Block first atom: 2508
Blocpdb> 46 atoms in block 69
Block first atom: 2543
Blocpdb> 35 atoms in block 70
Block first atom: 2589
Blocpdb> 34 atoms in block 71
Block first atom: 2624
Blocpdb> 45 atoms in block 72
Block first atom: 2658
Blocpdb> 46 atoms in block 73
Block first atom: 2703
Blocpdb> 39 atoms in block 74
Block first atom: 2749
Blocpdb> 37 atoms in block 75
Block first atom: 2788
Blocpdb> 40 atoms in block 76
Block first atom: 2825
Blocpdb> 40 atoms in block 77
Block first atom: 2865
Blocpdb> 43 atoms in block 78
Block first atom: 2905
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 2948
Blocpdb> 38 atoms in block 80
Block first atom: 2984
Blocpdb> 46 atoms in block 81
Block first atom: 3022
Blocpdb> 38 atoms in block 82
Block first atom: 3068
Blocpdb> 41 atoms in block 83
Block first atom: 3106
Blocpdb> 36 atoms in block 84
Block first atom: 3147
Blocpdb> 42 atoms in block 85
Block first atom: 3183
Blocpdb> 45 atoms in block 86
Block first atom: 3225
Blocpdb> 45 atoms in block 87
Block first atom: 3270
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 3315
Blocpdb> 41 atoms in block 89
Block first atom: 3360
Blocpdb> 38 atoms in block 90
Block first atom: 3401
Blocpdb> 44 atoms in block 91
Block first atom: 3439
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 3483
Blocpdb> 33 atoms in block 93
Block first atom: 3500
Blocpdb> 44 atoms in block 94
Block first atom: 3533
Blocpdb> 34 atoms in block 95
Block first atom: 3577
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 3611
Blocpdb> 41 atoms in block 97
Block first atom: 3644
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 3685
Blocpdb> 37 atoms in block 99
Block first atom: 3722
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 3759
Blocpdb> 28 atoms in block 101
Block first atom: 3790
Blocpdb> 36 atoms in block 102
Block first atom: 3818
Blocpdb> 37 atoms in block 103
Block first atom: 3854
Blocpdb> 38 atoms in block 104
Block first atom: 3891
Blocpdb> 27 atoms in block 105
Block first atom: 3929
Blocpdb> 38 atoms in block 106
Block first atom: 3956
Blocpdb> 41 atoms in block 107
Block first atom: 3994
Blocpdb> 35 atoms in block 108
Block first atom: 4035
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 4070
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 4109
Blocpdb> 41 atoms in block 111
Block first atom: 4141
Blocpdb> 35 atoms in block 112
Block first atom: 4182
Blocpdb> 44 atoms in block 113
Block first atom: 4217
Blocpdb> 36 atoms in block 114
Block first atom: 4261
Blocpdb> 38 atoms in block 115
Block first atom: 4297
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 4335
Blocpdb> 35 atoms in block 117
Block first atom: 4362
Blocpdb> 41 atoms in block 118
Block first atom: 4397
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 4438
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 4469
Blocpdb> 41 atoms in block 121
Block first atom: 4509
Blocpdb> 32 atoms in block 122
Block first atom: 4550
Blocpdb> 52 atoms in block 123
Block first atom: 4582
Blocpdb> 34 atoms in block 124
Block first atom: 4634
Blocpdb> 41 atoms in block 125
Block first atom: 4668
Blocpdb> 37 atoms in block 126
Block first atom: 4709
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 4746
Blocpdb> 39 atoms in block 128
Block first atom: 4777
Blocpdb> 37 atoms in block 129
Block first atom: 4816
Blocpdb> 34 atoms in block 130
Block first atom: 4853
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 4887
Blocpdb> 34 atoms in block 132
Block first atom: 4928
Blocpdb> 36 atoms in block 133
Block first atom: 4962
Blocpdb> 38 atoms in block 134
Block first atom: 4998
Blocpdb> 33 atoms in block 135
Block first atom: 5036
Blocpdb> 47 atoms in block 136
Block first atom: 5069
Blocpdb> 53 atoms in block 137
Block first atom: 5116
Blocpdb> 32 atoms in block 138
Block first atom: 5169
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 5201
Blocpdb> 34 atoms in block 140
Block first atom: 5236
Blocpdb> 39 atoms in block 141
Block first atom: 5270
Blocpdb> 40 atoms in block 142
Block first atom: 5309
Blocpdb> 40 atoms in block 143
Block first atom: 5349
Blocpdb> 39 atoms in block 144
Block first atom: 5389
Blocpdb> 31 atoms in block 145
Block first atom: 5428
Blocpdb> 54 atoms in block 146
Block first atom: 5459
Blocpdb> 38 atoms in block 147
Block first atom: 5513
Blocpdb> 40 atoms in block 148
Block first atom: 5551
Blocpdb> 43 atoms in block 149
Block first atom: 5591
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 5634
Blocpdb> 44 atoms in block 151
Block first atom: 5646
Blocpdb> 42 atoms in block 152
Block first atom: 5690
Blocpdb> 36 atoms in block 153
Block first atom: 5732
Blocpdb> 46 atoms in block 154
Block first atom: 5768
Blocpdb> 36 atoms in block 155
Block first atom: 5814
Blocpdb> 37 atoms in block 156
Block first atom: 5850
Blocpdb> 40 atoms in block 157
Block first atom: 5887
Blocpdb> 43 atoms in block 158
Block first atom: 5927
Blocpdb> 48 atoms in block 159
Block first atom: 5970
Blocpdb> 39 atoms in block 160
Block first atom: 6018
Blocpdb> 41 atoms in block 161
Block first atom: 6057
Blocpdb> 43 atoms in block 162
Block first atom: 6098
Blocpdb> 36 atoms in block 163
Block first atom: 6141
Blocpdb> 39 atoms in block 164
Block first atom: 6177
Blocpdb> 42 atoms in block 165
Block first atom: 6216
Blocpdb> 46 atoms in block 166
Block first atom: 6258
Blocpdb> 39 atoms in block 167
Block first atom: 6304
Blocpdb> 35 atoms in block 168
Block first atom: 6343
Blocpdb> 39 atoms in block 169
Block first atom: 6378
Blocpdb> 41 atoms in block 170
Block first atom: 6417
Blocpdb> 45 atoms in block 171
Block first atom: 6458
Blocpdb> 44 atoms in block 172
Block first atom: 6503
Blocpdb> 46 atoms in block 173
Block first atom: 6547
Blocpdb> 44 atoms in block 174
Block first atom: 6593
Blocpdb> 32 atoms in block 175
Block first atom: 6637
Blocpdb> 47 atoms in block 176
Block first atom: 6669
Blocpdb> 9 atoms in block 177
Block first atom: 6715
Blocpdb> 177 blocks.
Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2576861 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 20172
Prepmat> Matrix trace = 5637200.0000
Prepmat> Last element read: 20172 20172 224.2946
Prepmat> 15754 lines saved.
Prepmat> 14127 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6724
RTB> Total mass = 6724.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6724
RTB> Number of blocks = 177
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212308.8930
RTB> 55881 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1062
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55881
Diagstd> Projected matrix trace = 212308.8930
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1062 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212308.8930
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2049901 0.2341724 0.3317421 1.5414916
1.7862509 1.8672233 2.6355508 3.1145930 3.5440523
4.5500490 4.6899846 5.4202136 6.1644240 6.8018364
7.1804946 7.6701245 7.9894902 8.2811820 8.4897634
9.3927030 10.9838692 11.2387420 11.2760065 11.7307960
12.1648074 12.7765397 13.3209886 13.6850198 14.0285642
14.7214039 14.8571814 15.8890533 16.5963281 17.2598295
17.3653694 17.8361935 18.0646480 18.8591033 19.4545391
19.6042181 20.0960626 20.2518074 20.8920362 21.0653335
21.3143919 21.7218243 22.0329029 22.5461808 22.9104195
23.9523593 24.2022980 24.6130014 25.0931249 25.6492263
25.7060847 26.2708700 26.9529042 27.3375158 28.0612358
28.6627643 28.6920155 29.6150975 30.4554887 30.6846626
31.3535469 31.5572490 31.7012509 32.2288318 32.8660216
32.9915951 33.6019872 33.6880310 34.0320784 34.7272860
34.9095438 35.1085249 35.5761309 36.3862579 36.8598169
36.9990866 37.5661678 38.8128239 39.2822418 39.4408216
39.9785303 40.5226667 40.7796312 40.8562905 41.6097633
41.7959969 42.1475645 42.8842889 43.2044032 43.7163962
44.4403092 44.6037147 45.2845987 45.5952793 46.2042983
46.4610670
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034325 0.0034331 0.0034336 0.0034342
0.0034355 49.1656443 52.5488359 62.5454334 134.8235833
145.1331119 148.3861654 176.2913391 191.6443110 204.4303355
231.6345399 235.1694950 252.8153736 269.6134355 283.2098611
290.9862455 300.7436638 306.9409376 312.4938292 316.4048076
332.8055609 359.8926329 364.0442130 364.6472471 371.9281251
378.7458634 388.1520680 396.3359872 401.7149512 406.7259597
416.6485691 418.5655626 432.8568468 442.3859103 451.1422807
452.5194941 458.6130064 461.5407288 471.5804583 478.9671782
480.8061814 486.8002217 488.6829358 496.3473020 498.4016248
501.3393034 506.1082633 509.7193730 515.6223964 519.7707079
531.4585876 534.2242312 538.7379485 543.9671255 549.9616613
550.5708925 556.5862950 563.7649399 567.7730883 575.2394695
581.3722745 581.6688530 590.9515333 599.2776305 601.5281504
608.0490565 610.0210877 611.4113271 616.4779713 622.5422747
623.7304366 629.4739492 630.2793733 633.4896402 639.9273945
641.6044494 643.4303931 647.7011044 655.0342019 659.2829846
660.5273145 665.5699831 676.5235223 680.6023000 681.9746900
686.6077364 691.2645554 693.4528338 694.1043190 700.4754245
702.0412398 704.9876713 711.1224459 713.7716353 717.9884480
723.9087340 725.2384067 730.7528907 733.2553167 738.1361405
740.1843016
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6724
Rtb_to_modes> Number of blocs = 177
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.24
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
0.99995 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00003
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0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 121032 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
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0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 1.00002 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 1.00005 0.99998
1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00000
0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122619181697143.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122619181697143.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 20122619181697143.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122619181697143.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 871
First residue number = 4
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6724
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2050
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3317
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.786
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.867
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.115
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.420
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.802
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.670
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.490
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46
Bfactors> 106 vectors, 20172 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.205000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.585 for 876 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.044 +/- 0.03
Bfactors> = 39.911 +/- 14.26
Bfactors> Shiftng-fct= 39.867
Bfactors> Scaling-fct= 427.087
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122619181697143.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122619181697143.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1
Chkmod> 106 vectors, 20172 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6724 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7179
0.0034 0.9480
0.0034 0.8062
0.0034 0.8654
0.0034 0.8566
0.0034 0.8935
49.1647 0.7216
52.5497 0.6533
62.5388 0.7638
134.7963 0.6914
145.1167 0.7118
148.3709 0.4412
176.2988 0.4280
191.6486 0.3281
204.4201 0.1007
231.6233 0.3353
235.1598 0.3329
252.7995 0.0668
269.5926 0.4771
283.2011 0.4794
290.9637 0.3179
300.7283 0.3522
306.9183 0.3893
312.4770 0.3318
316.3956 0.3152
332.7965 0.1361
359.8138 0.3067
364.0490 0.5601
364.6962 0.3322
371.8995 0.4919
378.6548 0.2948
388.1880 0.6056
396.3043 0.3799
401.7708 0.3417
406.7293 0.3244
416.6108 0.3185
418.5873 0.2741
432.8512 0.3621
442.4159 0.2354
451.1251 0.5239
452.5604 0.4678
458.6423 0.4960
461.4615 0.3148
471.5714 0.2255
478.8907 0.1962
480.7338 0.3231
486.8270 0.4033
488.6402 0.2097
496.3018 0.3659
498.4354 0.3143
501.2661 0.2084
506.0653 0.4198
509.6639 0.3752
515.6439 0.4537
519.7436 0.1825
531.4096 0.3370
534.1759 0.3483
538.6820 0.2825
543.9099 0.3560
549.9463 0.2508
550.5892 0.4411
556.5532 0.5371
563.7104 0.4567
567.7745 0.5374
575.2021 0.5106
581.3193 0.6225
581.6235 0.4953
590.9751 0.4156
599.2963 0.5042
601.4566 0.3036
607.9886 0.5235
610.0215 0.5124
611.3730 0.3505
616.4627 0.2820
622.5532 0.4132
623.6886 0.4781
629.4283 0.2073
630.2707 0.3372
633.4431 0.3786
639.9249 0.4507
641.5811 0.3332
643.4163 0.5267
647.7085 0.4607
655.0398 0.3641
659.2563 0.3425
660.5071 0.4549
665.5754 0.4856
676.4699 0.5332
680.5537 0.5027
681.9383 0.3460
686.5909 0.3828
691.2121 0.4542
693.4262 0.4331
694.1060 0.3150
700.4473 0.4214
702.0447 0.2993
704.9778 0.4754
711.0564 0.5192
713.7046 0.2201
717.9872 0.3503
723.8751 0.2806
725.1771 0.4326
730.6844 0.5002
733.2618 0.4545
738.0701 0.4929
740.1440 0.5276
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 20122619181697143.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122619181697143.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 20122619181697143.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122619181697143.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 20122619181697143.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
20122619181697143.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1
Projmod> 106 vectors, 20172 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 871
First residue number = 4
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6724
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 837
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6338
Mean number per residue = 7.6
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 20122619181697143 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
making animated gifs
11 models are in 20122619181697143.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 423 0.415 422 0.380
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 423 0.410 422 0.374
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 423 0.406 422 0.368
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 423 0.402 422 0.364
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 423 0.400 422 0.361
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 423 0.398 422 0.359
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 423 0.398 422 0.358
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 423 0.398 422 0.358
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 423 0.400 422 0.359
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 423 0.402 422 0.362
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 423 0.406 422 0.365
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 20122619181697143 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
making animated gifs
11 models are in 20122619181697143.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 423 0.415 422 0.378
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 423 0.408 422 0.370
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 423 0.402 422 0.364
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 423 0.399 422 0.360
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 423 0.398 422 0.359
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 423 0.398 422 0.359
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 423 0.401 422 0.362
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 423 0.405 422 0.366
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 423 0.410 422 0.373
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 423 0.418 422 0.381
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 423 0.427 422 0.391
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 20122619181697143 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
making animated gifs
11 models are in 20122619181697143.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 423 0.445 422 0.414
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 423 0.431 422 0.398
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 423 0.420 422 0.385
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 423 0.411 422 0.374
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 423 0.404 422 0.366
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 423 0.398 422 0.359
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 423 0.395 422 0.355
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 423 0.394 422 0.353
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 423 0.395 422 0.354
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 423 0.399 422 0.357
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 423 0.405 422 0.363
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 20122619181697143 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
making animated gifs
11 models are in 20122619181697143.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 423 0.644 422 0.611
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 423 0.559 422 0.523
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 423 0.486 422 0.447
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 423 0.430 422 0.388
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 423 0.399 422 0.357
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 423 0.398 422 0.359
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 423 0.428 422 0.395
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 423 0.483 422 0.456
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 423 0.555 422 0.534
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 423 0.638 422 0.622
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 423 0.729 422 0.713
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 20122619181697143 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122619181697143.eigenfacs
20122619181697143.atom
making animated gifs
11 models are in 20122619181697143.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122619181697143.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 423 0.851 413 0.590
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 423 0.734 414 0.535
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 423 0.624 420 0.565
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 423 0.525 422 0.501
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 423 0.446 422 0.414
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 423 0.398 422 0.359
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 423 0.394 422 0.351
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 423 0.433 422 0.392
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 423 0.507 422 0.469
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 423 0.602 422 0.569
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 423 0.710 421 0.665
20122619181697143.10.pdb
20122619181697143.11.pdb
20122619181697143.7.pdb
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real 0m26.961s
user 0m26.764s
sys 0m0.124s
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