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***  OXIDOREDUCTASE 12-NOV-18 6N21  ***

LOGs for ID: 20112715303934475

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20112715303934475.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20112715303934475.atom to be opened. Openam> File opened: 20112715303934475.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1988 First residue number = 30 Last residue number = 526 Number of atoms found = 15925 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.661543 +/- 22.827342 From: -72.509000 To: 32.175000 = 51.636355 +/- 24.760454 From: -1.804000 To: 118.048000 = 37.154261 +/- 19.436400 From: -15.639000 To: 85.543000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.6420 % Filled. Pdbmat> 6460099 non-zero elements. Pdbmat> 707281 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.83 +/- 21.94 Maximum number = 135 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.414562E+07 Pdbmat> Larger element = 510.359 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1988 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20112715303934475.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20112715303934475.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20112715303934475.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 15925 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1988 residues. Blocpdb> 81 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 77 atoms in block 2 Block first atom: 82 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 159 Blocpdb> 74 atoms in block 4 Block first atom: 242 Blocpdb> 83 atoms in block 5 Block first atom: 316 Blocpdb> 90 atoms in block 6 Block first atom: 399 Blocpdb> 75 atoms in block 7 Block first atom: 489 Blocpdb> 88 atoms in block 8 Block first atom: 564 Blocpdb> 95 atoms in block 9 Block first atom: 652 Blocpdb> 82 atoms in block 10 Block first atom: 747 Blocpdb> 90 atoms in block 11 Block first atom: 829 Blocpdb> 77 atoms in block 12 Block first atom: 919 Blocpdb> 88 atoms in block 13 Block first atom: 996 Blocpdb> 75 atoms in block 14 Block first atom: 1084 Blocpdb> 80 atoms in block 15 Block first atom: 1159 Blocpdb> 82 atoms in block 16 Block first atom: 1239 Blocpdb> 77 atoms in block 17 Block first atom: 1321 Blocpdb> 81 atoms in block 18 Block first atom: 1398 Blocpdb> 73 atoms in block 19 Block first atom: 1479 Blocpdb> 85 atoms in block 20 Block first atom: 1552 Blocpdb> 79 atoms in block 21 Block first atom: 1637 Blocpdb> 71 atoms in block 22 Block first atom: 1716 Blocpdb> 84 atoms in block 23 Block first atom: 1787 Blocpdb> 79 atoms in block 24 Block first atom: 1871 Blocpdb> 86 atoms in block 25 Block first atom: 1950 Blocpdb> 87 atoms in block 26 Block first atom: 2036 Blocpdb> 72 atoms in block 27 Block first atom: 2123 Blocpdb> 84 atoms in block 28 Block first atom: 2195 Blocpdb> 75 atoms in block 29 Block first atom: 2279 Blocpdb> 81 atoms in block 30 Block first atom: 2354 Blocpdb> 90 atoms in block 31 Block first atom: 2435 Blocpdb> 77 atoms in block 32 Block first atom: 2525 Blocpdb> 75 atoms in block 33 Block first atom: 2602 Blocpdb> 86 atoms in block 34 Block first atom: 2677 Blocpdb> 78 atoms in block 35 Block first atom: 2763 Blocpdb> 86 atoms in block 36 Block first atom: 2841 Blocpdb> 86 atoms in block 37 Block first atom: 2927 Blocpdb> 86 atoms in block 38 Block first atom: 3013 Blocpdb> 86 atoms in block 39 Block first atom: 3099 Blocpdb> 55 atoms in block 40 Block first atom: 3185 Blocpdb> 77 atoms in block 41 Block first atom: 3240 Blocpdb> 86 atoms in block 42 Block first atom: 3317 Blocpdb> 79 atoms in block 43 Block first atom: 3403 Blocpdb> 70 atoms in block 44 Block first atom: 3482 Blocpdb> 80 atoms in block 45 Block first atom: 3552 Blocpdb> 72 atoms in block 46 Block first atom: 3632 Blocpdb> 77 atoms in block 47 Block first atom: 3704 Blocpdb> 80 atoms in block 48 Block first atom: 3781 Blocpdb> 81 atoms in block 49 Block first atom: 3861 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 3942 Blocpdb> 81 atoms in block 51 Block first atom: 3992 Blocpdb> 77 atoms in block 52 Block first atom: 4073 Blocpdb> 83 atoms in block 53 Block first atom: 4150 Blocpdb> 74 atoms in block 54 Block first atom: 4233 Blocpdb> 83 atoms in block 55 Block first atom: 4307 Blocpdb> 80 atoms in block 56 Block first atom: 4390 Blocpdb> 75 atoms in block 57 Block first atom: 4470 Blocpdb> 88 atoms in block 58 Block first atom: 4545 Blocpdb> 95 atoms in block 59 Block first atom: 4633 Blocpdb> 82 atoms in block 60 Block first atom: 4728 Blocpdb> 90 atoms in block 61 Block first atom: 4810 Blocpdb> 78 atoms in block 62 Block first atom: 4900 Blocpdb> 96 atoms in block 63 Block first atom: 4978 Blocpdb> 75 atoms in block 64 Block first atom: 5074 Blocpdb> 80 atoms in block 65 Block first atom: 5149 Blocpdb> 82 atoms in block 66 Block first atom: 5229 Blocpdb> 77 atoms in block 67 Block first atom: 5311 Blocpdb> 81 atoms in block 68 Block first atom: 5388 Blocpdb> 73 atoms in block 69 Block first atom: 5469 Blocpdb> 85 atoms in block 70 Block first atom: 5542 Blocpdb> 79 atoms in block 71 Block first atom: 5627 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 5706 Blocpdb> 84 atoms in block 73 Block first atom: 5777 Blocpdb> 75 atoms in block 74 Block first atom: 5861 Blocpdb> 86 atoms in block 75 Block first atom: 5936 Blocpdb> 87 atoms in block 76 Block first atom: 6022 Blocpdb> 72 atoms in block 77 Block first atom: 6109 Blocpdb> 84 atoms in block 78 Block first atom: 6181 Blocpdb> 75 atoms in block 79 Block first atom: 6265 Blocpdb> 78 atoms in block 80 Block first atom: 6340 Blocpdb> 90 atoms in block 81 Block first atom: 6418 Blocpdb> 77 atoms in block 82 Block first atom: 6508 Blocpdb> 75 atoms in block 83 Block first atom: 6585 Blocpdb> 82 atoms in block 84 Block first atom: 6660 Blocpdb> 78 atoms in block 85 Block first atom: 6742 Blocpdb> 86 atoms in block 86 Block first atom: 6820 Blocpdb> 86 atoms in block 87 Block first atom: 6906 Blocpdb> 86 atoms in block 88 Block first atom: 6992 Blocpdb> 86 atoms in block 89 Block first atom: 7078 Blocpdb> 55 atoms in block 90 Block first atom: 7164 Blocpdb> 77 atoms in block 91 Block first atom: 7219 Blocpdb> 86 atoms in block 92 Block first atom: 7296 Blocpdb> 79 atoms in block 93 Block first atom: 7382 Blocpdb> 70 atoms in block 94 Block first atom: 7461 Blocpdb> 80 atoms in block 95 Block first atom: 7531 Blocpdb> 72 atoms in block 96 Block first atom: 7611 Blocpdb> 77 atoms in block 97 Block first atom: 7683 Blocpdb> 80 atoms in block 98 Block first atom: 7760 Blocpdb> 81 atoms in block 99 Block first atom: 7840 Blocpdb> 50 atoms in block 100 Block first atom: 7921 Blocpdb> 81 atoms in block 101 Block first atom: 7971 Blocpdb> 77 atoms in block 102 Block first atom: 8052 Blocpdb> 83 atoms in block 103 Block first atom: 8129 Blocpdb> 74 atoms in block 104 Block first atom: 8212 Blocpdb> 83 atoms in block 105 Block first atom: 8286 Blocpdb> 80 atoms in block 106 Block first atom: 8369 Blocpdb> 75 atoms in block 107 Block first atom: 8449 Blocpdb> 88 atoms in block 108 Block first atom: 8524 Blocpdb> 95 atoms in block 109 Block first atom: 8612 Blocpdb> 82 atoms in block 110 Block first atom: 8707 Blocpdb> 90 atoms in block 111 Block first atom: 8789 Blocpdb> 81 atoms in block 112 Block first atom: 8879 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 8960 Blocpdb> 75 atoms in block 114 Block first atom: 9048 Blocpdb> 80 atoms in block 115 Block first atom: 9123 Blocpdb> 82 atoms in block 116 Block first atom: 9203 Blocpdb> 77 atoms in block 117 Block first atom: 9285 Blocpdb> 81 atoms in block 118 Block first atom: 9362 Blocpdb> 73 atoms in block 119 Block first atom: 9443 Blocpdb> 85 atoms in block 120 Block first atom: 9516 Blocpdb> 79 atoms in block 121 Block first atom: 9601 Blocpdb> 71 atoms in block 122 Block first atom: 9680 Blocpdb> 84 atoms in block 123 Block first atom: 9751 Blocpdb> 75 atoms in block 124 Block first atom: 9835 Blocpdb> 86 atoms in block 125 Block first atom: 9910 Blocpdb> 87 atoms in block 126 Block first atom: 9996 Blocpdb> 72 atoms in block 127 Block first atom: 10083 Blocpdb> 84 atoms in block 128 Block first atom: 10155 Blocpdb> 75 atoms in block 129 Block first atom: 10239 Blocpdb> 81 atoms in block 130 Block first atom: 10314 Blocpdb> 90 atoms in block 131 Block first atom: 10395 Blocpdb> 77 atoms in block 132 Block first atom: 10485 Blocpdb> 75 atoms in block 133 Block first atom: 10562 Blocpdb> 86 atoms in block 134 Block first atom: 10637 Blocpdb> 78 atoms in block 135 Block first atom: 10723 Blocpdb> 86 atoms in block 136 Block first atom: 10801 Blocpdb> 86 atoms in block 137 Block first atom: 10887 Blocpdb> 86 atoms in block 138 Block first atom: 10973 Blocpdb> 86 atoms in block 139 Block first atom: 11059 Blocpdb> 55 atoms in block 140 Block first atom: 11145 Blocpdb> 77 atoms in block 141 Block first atom: 11200 Blocpdb> 86 atoms in block 142 Block first atom: 11277 Blocpdb> 79 atoms in block 143 Block first atom: 11363 Blocpdb> 70 atoms in block 144 Block first atom: 11442 Blocpdb> 80 atoms in block 145 Block first atom: 11512 Blocpdb> 72 atoms in block 146 Block first atom: 11592 Blocpdb> 77 atoms in block 147 Block first atom: 11664 Blocpdb> 80 atoms in block 148 Block first atom: 11741 Blocpdb> 81 atoms in block 149 Block first atom: 11821 Blocpdb> 50 atoms in block 150 Block first atom: 11902 Blocpdb> 81 atoms in block 151 Block first atom: 11952 Blocpdb> 77 atoms in block 152 Block first atom: 12033 Blocpdb> 83 atoms in block 153 Block first atom: 12110 Blocpdb> 74 atoms in block 154 Block first atom: 12193 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 12267 Blocpdb> 80 atoms in block 156 Block first atom: 12350 Blocpdb> 75 atoms in block 157 Block first atom: 12430 Blocpdb> 88 atoms in block 158 Block first atom: 12505 Blocpdb> 95 atoms in block 159 Block first atom: 12593 Blocpdb> 82 atoms in block 160 Block first atom: 12688 Blocpdb> 90 atoms in block 161 Block first atom: 12770 Blocpdb> 81 atoms in block 162 Block first atom: 12860 Blocpdb> 88 atoms in block 163 Block first atom: 12941 Blocpdb> 75 atoms in block 164 Block first atom: 13029 Blocpdb> 80 atoms in block 165 Block first atom: 13104 Blocpdb> 82 atoms in block 166 Block first atom: 13184 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 13266 Blocpdb> 81 atoms in block 168 Block first atom: 13343 Blocpdb> 73 atoms in block 169 Block first atom: 13424 Blocpdb> 85 atoms in block 170 Block first atom: 13497 Blocpdb> 79 atoms in block 171 Block first atom: 13582 Blocpdb> 71 atoms in block 172 Block first atom: 13661 Blocpdb> 84 atoms in block 173 Block first atom: 13732 Blocpdb> 75 atoms in block 174 Block first atom: 13816 Blocpdb> 86 atoms in block 175 Block first atom: 13891 Blocpdb> 87 atoms in block 176 Block first atom: 13977 Blocpdb> 72 atoms in block 177 Block first atom: 14064 Blocpdb> 84 atoms in block 178 Block first atom: 14136 Blocpdb> 75 atoms in block 179 Block first atom: 14220 Blocpdb> 81 atoms in block 180 Block first atom: 14295 Blocpdb> 90 atoms in block 181 Block first atom: 14376 Blocpdb> 73 atoms in block 182 Block first atom: 14466 Blocpdb> 75 atoms in block 183 Block first atom: 14539 Blocpdb> 86 atoms in block 184 Block first atom: 14614 Blocpdb> 78 atoms in block 185 Block first atom: 14700 Blocpdb> 86 atoms in block 186 Block first atom: 14778 Blocpdb> 86 atoms in block 187 Block first atom: 14864 Blocpdb> 83 atoms in block 188 Block first atom: 14950 Blocpdb> 86 atoms in block 189 Block first atom: 15033 Blocpdb> 55 atoms in block 190 Block first atom: 15119 Blocpdb> 77 atoms in block 191 Block first atom: 15174 Blocpdb> 86 atoms in block 192 Block first atom: 15251 Blocpdb> 79 atoms in block 193 Block first atom: 15337 Blocpdb> 70 atoms in block 194 Block first atom: 15416 Blocpdb> 80 atoms in block 195 Block first atom: 15486 Blocpdb> 72 atoms in block 196 Block first atom: 15566 Blocpdb> 77 atoms in block 197 Block first atom: 15638 Blocpdb> 80 atoms in block 198 Block first atom: 15715 Blocpdb> 81 atoms in block 199 Block first atom: 15795 Blocpdb> 50 atoms in block 200 Block first atom: 15875 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 96 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 50 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6460299 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 47775 Prepmat> Matrix trace = 14145620.0000 Prepmat> Last element read: 47775 47775 75.3902 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18184 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15925 RTB> Total mass = 15925.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 15925 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 234144.0773 RTB> 65976 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65976 Diagstd> Projected matrix trace = 234144.0773 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 234144.0773 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2367010 0.4710737 0.7960494 1.0416148 1.1022653 1.5271246 1.6746883 1.9122773 2.0935721 2.2699795 2.4631357 2.7377014 4.3491304 4.4105741 5.5481360 6.1868199 6.4726955 6.7292341 10.3325038 11.0790453 12.7769340 13.5169233 13.6466681 14.1490285 14.7165898 15.3181530 16.4095752 16.8338644 17.3028229 17.4635359 17.6954226 17.9971660 19.3354370 19.7779078 19.9995547 20.0026521 20.3774678 21.2497789 21.9422292 22.6249145 22.8482329 23.0500728 23.2082072 23.2947985 23.5482001 23.8378461 24.6000059 24.9317570 25.1630063 25.5118618 25.5959398 26.1453695 26.5032824 27.0834150 28.3285734 28.8483269 29.6496955 29.7912652 30.4751192 31.3435723 31.4983945 31.5982110 32.1145336 32.3920671 32.8343079 33.6922099 34.0759144 34.3947526 34.9120769 35.2483097 35.4335419 35.8443967 35.8578917 36.5639185 36.6915431 37.0291449 37.2037934 37.3741593 38.2834374 38.4619742 39.2193547 39.5017026 39.6836841 40.0495827 40.1690434 40.7789447 40.9149002 41.2458574 41.4108124 41.9616210 43.3185707 43.6025735 43.9278182 44.1028513 44.3296296 44.8492485 45.0933951 45.8431972 46.1954809 46.9168281 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034333 0.0034337 0.0034348 0.0034350 0.0034353 52.8317933 74.5314729 96.8869501 110.8278367 114.0087940 134.1938189 140.5278092 150.1656901 157.1228126 163.6086432 170.4274134 179.6752739 226.4626019 228.0567024 255.7813226 270.1027580 276.2726334 281.6943257 349.0583784 361.4485188 388.1580578 399.2401461 401.1516611 408.4685190 416.5804384 425.0093470 439.8898587 445.5405049 451.7038179 453.7967393 456.7996360 460.6778610 477.4987908 482.9314118 485.6299282 485.6675323 490.1967051 500.5788410 508.6694486 516.5219160 519.0648122 521.3524644 523.1377700 524.1127912 526.9557399 530.1866476 538.5957050 542.2152432 544.7240414 548.4870235 549.3900891 555.2552481 559.0428692 565.1282176 577.9731091 583.2511393 591.2966230 592.7065876 599.4707352 607.9523293 609.4519754 610.4168698 615.3838430 618.0371943 622.2418446 630.3184639 633.8975006 636.8561911 641.6277273 644.7100318 646.4018092 650.1385491 650.2609227 656.6313998 657.7763717 660.7955688 662.3520610 663.8668707 671.8939691 673.4588532 680.0572930 682.5008357 684.0711460 687.2176067 688.2417672 693.4469970 694.6019984 697.4056288 698.7988078 703.4308459 714.7140832 717.0531398 719.7225282 721.1549922 723.0067164 727.2318068 729.2085425 735.2461000 738.0657065 743.8058705 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15925 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4711 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.187 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.729 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.92 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 286650 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112715303934475.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112715303934475.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20112715303934475.atom Openam> file on opening on unit 11: 20112715303934475.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1988 First residue number = 30 Last residue number = 526 Number of atoms found = 15925 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4711 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.187 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.729 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92 Bfactors> 106 vectors, 47775 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.236700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.638 for 1991 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.017 +/- 0.01 Bfactors> = 39.884 +/- 8.60 Bfactors> Shiftng-fct= 39.867 Bfactors> Scaling-fct= 1073.677 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112715303934475.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112715303934475.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 15925 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7887 0.0034 0.8122 0.0034 0.9191 0.0034 0.7881 0.0034 0.8194 0.0034 0.9363 52.8294 0.7104 74.5304 0.7738 96.8798 0.8667 110.8436 0.6448 113.9902 0.6517 134.1826 0.7732 140.5349 0.7596 150.1484 0.7275 157.1321 0.7536 163.6024 0.6512 170.4154 0.7890 179.6774 0.7359 226.4495 0.7824 228.0579 0.7926 255.7672 0.7896 270.0951 0.8324 276.2673 0.8136 281.6773 0.7831 349.0011 0.3125 361.4486 0.3174 388.1880 0.3075 399.2684 0.2883 401.1834 0.3818 408.4650 0.2196 416.6108 0.3766 425.0167 0.3789 439.8767 0.5975 445.4702 0.5740 451.6476 0.3488 453.7313 0.3673 456.8391 0.4331 460.6944 0.4200 477.5346 0.4657 482.9362 0.5605 485.6145 0.4362 485.6145 0.4236 490.2061 0.5794 500.5600 0.6568 508.6218 0.4630 516.4436 0.4998 519.0626 0.4669 521.3293 0.5318 523.1355 0.5077 524.0363 0.5684 526.9533 0.5641 530.1878 0.6513 538.5725 0.4255 542.1729 0.3780 544.6681 0.6554 548.4435 0.5881 549.4101 0.6574 555.2806 0.6518 558.9843 0.6440 565.0683 0.7038 577.9628 0.6335 583.2430 0.5592 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112715303934475.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112715303934475.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20112715303934475 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom making animated gifs 11 models are in 20112715303934475.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112715303934475.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112715303934475.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 20112715303934475 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112715303934475.eigenfacs 20112715303934475.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112715303934475.eigenfacs 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