***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2504020431271785066.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2504020431271785066.atom to be opened.
Openam> File opened: 2504020431271785066.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1178
First residue number = 1
Last residue number = 1178
Number of atoms found = 9116
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.885308 +/- 18.138631 From: -43.443000 To: 46.811000
= 2.137947 +/- 21.334602 From: -48.385000 To: 56.142000
= -2.451745 +/- 22.777408 From: -63.150000 To: 40.433000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.8577 % Filled.
Pdbmat> 3207358 non-zero elements.
Pdbmat> 350358 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.87 +/- 23.46
Maximum number = 129
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 7.007160E+06
Pdbmat> Larger element = 473.133
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1178 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2504020431271785066.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2504020431271785066.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2504020431271785066.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9116 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1178 residues.
Blocpdb> 43 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 47 atoms in block 2
Block first atom: 44
Blocpdb> 43 atoms in block 3
Block first atom: 91
Blocpdb> 46 atoms in block 4
Block first atom: 134
Blocpdb> 44 atoms in block 5
Block first atom: 180
Blocpdb> 36 atoms in block 6
Block first atom: 224
Blocpdb> 49 atoms in block 7
Block first atom: 260
Blocpdb> 52 atoms in block 8
Block first atom: 309
Blocpdb> 43 atoms in block 9
Block first atom: 361
Blocpdb> 45 atoms in block 10
Block first atom: 404
Blocpdb> 54 atoms in block 11
Block first atom: 449
Blocpdb> 49 atoms in block 12
Block first atom: 503
Blocpdb> 36 atoms in block 13
Block first atom: 552
Blocpdb> 43 atoms in block 14
Block first atom: 588
Blocpdb> 45 atoms in block 15
Block first atom: 631
Blocpdb> 50 atoms in block 16
Block first atom: 676
Blocpdb> 44 atoms in block 17
Block first atom: 726
Blocpdb> 45 atoms in block 18
Block first atom: 770
Blocpdb> 54 atoms in block 19
Block first atom: 815
Blocpdb> 44 atoms in block 20
Block first atom: 869
Blocpdb> 49 atoms in block 21
Block first atom: 913
Blocpdb> 44 atoms in block 22
Block first atom: 962
Blocpdb> 47 atoms in block 23
Block first atom: 1006
Blocpdb> 50 atoms in block 24
Block first atom: 1053
Blocpdb> 45 atoms in block 25
Block first atom: 1103
Blocpdb> 45 atoms in block 26
Block first atom: 1148
Blocpdb> 50 atoms in block 27
Block first atom: 1193
Blocpdb> 47 atoms in block 28
Block first atom: 1243
Blocpdb> 46 atoms in block 29
Block first atom: 1290
Blocpdb> 44 atoms in block 30
Block first atom: 1336
Blocpdb> 47 atoms in block 31
Block first atom: 1380
Blocpdb> 51 atoms in block 32
Block first atom: 1427
Blocpdb> 47 atoms in block 33
Block first atom: 1478
Blocpdb> 47 atoms in block 34
Block first atom: 1525
Blocpdb> 41 atoms in block 35
Block first atom: 1572
Blocpdb> 57 atoms in block 36
Block first atom: 1613
Blocpdb> 50 atoms in block 37
Block first atom: 1670
Blocpdb> 49 atoms in block 38
Block first atom: 1720
Blocpdb> 54 atoms in block 39
Block first atom: 1769
Blocpdb> 44 atoms in block 40
Block first atom: 1823
Blocpdb> 48 atoms in block 41
Block first atom: 1867
Blocpdb> 55 atoms in block 42
Block first atom: 1915
Blocpdb> 46 atoms in block 43
Block first atom: 1970
Blocpdb> 50 atoms in block 44
Block first atom: 2016
Blocpdb> 41 atoms in block 45
Block first atom: 2066
Blocpdb> 46 atoms in block 46
Block first atom: 2107
Blocpdb> 59 atoms in block 47
Block first atom: 2153
Blocpdb> 41 atoms in block 48
Block first atom: 2212
Blocpdb> 45 atoms in block 49
Block first atom: 2253
Blocpdb> 52 atoms in block 50
Block first atom: 2298
Blocpdb> 61 atoms in block 51
Block first atom: 2350
Blocpdb> 43 atoms in block 52
Block first atom: 2411
Blocpdb> 56 atoms in block 53
Block first atom: 2454
Blocpdb> 44 atoms in block 54
Block first atom: 2510
Blocpdb> 42 atoms in block 55
Block first atom: 2554
Blocpdb> 46 atoms in block 56
Block first atom: 2596
Blocpdb> 42 atoms in block 57
Block first atom: 2642
Blocpdb> 55 atoms in block 58
Block first atom: 2684
Blocpdb> 45 atoms in block 59
Block first atom: 2739
Blocpdb> 37 atoms in block 60
Block first atom: 2784
Blocpdb> 46 atoms in block 61
Block first atom: 2821
Blocpdb> 49 atoms in block 62
Block first atom: 2867
Blocpdb> 53 atoms in block 63
Block first atom: 2916
Blocpdb> 46 atoms in block 64
Block first atom: 2969
Blocpdb> 53 atoms in block 65
Block first atom: 3015
Blocpdb> 44 atoms in block 66
Block first atom: 3068
Blocpdb> 54 atoms in block 67
Block first atom: 3112
Blocpdb> 50 atoms in block 68
Block first atom: 3166
Blocpdb> 43 atoms in block 69
Block first atom: 3216
Blocpdb> 48 atoms in block 70
Block first atom: 3259
Blocpdb> 42 atoms in block 71
Block first atom: 3307
Blocpdb> 52 atoms in block 72
Block first atom: 3349
Blocpdb> 45 atoms in block 73
Block first atom: 3401
Blocpdb> 52 atoms in block 74
Block first atom: 3446
Blocpdb> 40 atoms in block 75
Block first atom: 3498
Blocpdb> 57 atoms in block 76
Block first atom: 3538
Blocpdb> 32 atoms in block 77
Block first atom: 3595
Blocpdb> 50 atoms in block 78
Block first atom: 3627
Blocpdb> 47 atoms in block 79
Block first atom: 3677
Blocpdb> 52 atoms in block 80
Block first atom: 3724
Blocpdb> 44 atoms in block 81
Block first atom: 3776
Blocpdb> 43 atoms in block 82
Block first atom: 3820
Blocpdb> 40 atoms in block 83
Block first atom: 3863
Blocpdb> 44 atoms in block 84
Block first atom: 3903
Blocpdb> 48 atoms in block 85
Block first atom: 3947
Blocpdb> 54 atoms in block 86
Block first atom: 3995
Blocpdb> 46 atoms in block 87
Block first atom: 4049
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 4095
Blocpdb> 49 atoms in block 89
Block first atom: 4140
Blocpdb> 54 atoms in block 90
Block first atom: 4189
Blocpdb> 40 atoms in block 91
Block first atom: 4243
Blocpdb> 41 atoms in block 92
Block first atom: 4283
Blocpdb> 57 atoms in block 93
Block first atom: 4324
Blocpdb> 53 atoms in block 94
Block first atom: 4381
Blocpdb> 46 atoms in block 95
Block first atom: 4434
Blocpdb> 40 atoms in block 96
Block first atom: 4480
Blocpdb> 49 atoms in block 97
Block first atom: 4520
Blocpdb> 48 atoms in block 98
Block first atom: 4569
Blocpdb> 40 atoms in block 99
Block first atom: 4617
Blocpdb> 53 atoms in block 100
Block first atom: 4657
Blocpdb> 45 atoms in block 101
Block first atom: 4710
Blocpdb> 42 atoms in block 102
Block first atom: 4755
Blocpdb> 47 atoms in block 103
Block first atom: 4797
Blocpdb> 45 atoms in block 104
Block first atom: 4844
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 4889
Blocpdb> 46 atoms in block 106
Block first atom: 4927
Blocpdb> 41 atoms in block 107
Block first atom: 4973
Blocpdb> 40 atoms in block 108
Block first atom: 5014
Blocpdb> 46 atoms in block 109
Block first atom: 5054
Blocpdb> 47 atoms in block 110
Block first atom: 5100
Blocpdb> 40 atoms in block 111
Block first atom: 5147
Blocpdb> 60 atoms in block 112
Block first atom: 5187
Blocpdb> 53 atoms in block 113
Block first atom: 5247
Blocpdb> 40 atoms in block 114
Block first atom: 5300
Blocpdb> 45 atoms in block 115
Block first atom: 5340
Blocpdb> 43 atoms in block 116
Block first atom: 5385
Blocpdb> 42 atoms in block 117
Block first atom: 5428
Blocpdb> 37 atoms in block 118
Block first atom: 5470
Blocpdb> 43 atoms in block 119
Block first atom: 5507
Blocpdb> 45 atoms in block 120
Block first atom: 5550
Blocpdb> 49 atoms in block 121
Block first atom: 5595
Blocpdb> 52 atoms in block 122
Block first atom: 5644
Blocpdb> 43 atoms in block 123
Block first atom: 5696
Blocpdb> 52 atoms in block 124
Block first atom: 5739
Blocpdb> 44 atoms in block 125
Block first atom: 5791
Blocpdb> 55 atoms in block 126
Block first atom: 5835
Blocpdb> 47 atoms in block 127
Block first atom: 5890
Blocpdb> 44 atoms in block 128
Block first atom: 5937
Blocpdb> 49 atoms in block 129
Block first atom: 5981
Blocpdb> 45 atoms in block 130
Block first atom: 6030
Blocpdb> 46 atoms in block 131
Block first atom: 6075
Blocpdb> 49 atoms in block 132
Block first atom: 6121
Blocpdb> 44 atoms in block 133
Block first atom: 6170
Blocpdb> 39 atoms in block 134
Block first atom: 6214
Blocpdb> 43 atoms in block 135
Block first atom: 6253
Blocpdb> 47 atoms in block 136
Block first atom: 6296
Blocpdb> 56 atoms in block 137
Block first atom: 6343
Blocpdb> 46 atoms in block 138
Block first atom: 6399
Blocpdb> 51 atoms in block 139
Block first atom: 6445
Blocpdb> 44 atoms in block 140
Block first atom: 6496
Blocpdb> 42 atoms in block 141
Block first atom: 6540
Blocpdb> 45 atoms in block 142
Block first atom: 6582
Blocpdb> 52 atoms in block 143
Block first atom: 6627
Blocpdb> 41 atoms in block 144
Block first atom: 6679
Blocpdb> 50 atoms in block 145
Block first atom: 6720
Blocpdb> 49 atoms in block 146
Block first atom: 6770
Blocpdb> 46 atoms in block 147
Block first atom: 6819
Blocpdb> 45 atoms in block 148
Block first atom: 6865
Blocpdb> 42 atoms in block 149
Block first atom: 6910
Blocpdb> 44 atoms in block 150
Block first atom: 6952
Blocpdb> 48 atoms in block 151
Block first atom: 6996
Blocpdb> 41 atoms in block 152
Block first atom: 7044
Blocpdb> 47 atoms in block 153
Block first atom: 7085
Blocpdb> 46 atoms in block 154
Block first atom: 7132
Blocpdb> 47 atoms in block 155
Block first atom: 7178
Blocpdb> 50 atoms in block 156
Block first atom: 7225
Blocpdb> 45 atoms in block 157
Block first atom: 7275
Blocpdb> 50 atoms in block 158
Block first atom: 7320
Blocpdb> 36 atoms in block 159
Block first atom: 7370
Blocpdb> 49 atoms in block 160
Block first atom: 7406
Blocpdb> 49 atoms in block 161
Block first atom: 7455
Blocpdb> 44 atoms in block 162
Block first atom: 7504
Blocpdb> 46 atoms in block 163
Block first atom: 7548
Blocpdb> 45 atoms in block 164
Block first atom: 7594
Blocpdb> 43 atoms in block 165
Block first atom: 7639
Blocpdb> 47 atoms in block 166
Block first atom: 7682
Blocpdb> 42 atoms in block 167
Block first atom: 7729
Blocpdb> 34 atoms in block 168
Block first atom: 7771
Blocpdb> 49 atoms in block 169
Block first atom: 7805
Blocpdb> 44 atoms in block 170
Block first atom: 7854
Blocpdb> 44 atoms in block 171
Block first atom: 7898
Blocpdb> 57 atoms in block 172
Block first atom: 7942
Blocpdb> 51 atoms in block 173
Block first atom: 7999
Blocpdb> 51 atoms in block 174
Block first atom: 8050
Blocpdb> 42 atoms in block 175
Block first atom: 8101
Blocpdb> 48 atoms in block 176
Block first atom: 8143
Blocpdb> 39 atoms in block 177
Block first atom: 8191
Blocpdb> 50 atoms in block 178
Block first atom: 8230
Blocpdb> 50 atoms in block 179
Block first atom: 8280
Blocpdb> 43 atoms in block 180
Block first atom: 8330
Blocpdb> 46 atoms in block 181
Block first atom: 8373
Blocpdb> 49 atoms in block 182
Block first atom: 8419
Blocpdb> 40 atoms in block 183
Block first atom: 8468
Blocpdb> 55 atoms in block 184
Block first atom: 8508
Blocpdb> 42 atoms in block 185
Block first atom: 8563
Blocpdb> 43 atoms in block 186
Block first atom: 8605
Blocpdb> 50 atoms in block 187
Block first atom: 8648
Blocpdb> 49 atoms in block 188
Block first atom: 8698
Blocpdb> 45 atoms in block 189
Block first atom: 8747
Blocpdb> 43 atoms in block 190
Block first atom: 8792
Blocpdb> 39 atoms in block 191
Block first atom: 8835
Blocpdb> 49 atoms in block 192
Block first atom: 8874
Blocpdb> 50 atoms in block 193
Block first atom: 8923
Blocpdb> 38 atoms in block 194
Block first atom: 8973
Blocpdb> 50 atoms in block 195
Block first atom: 9011
Blocpdb> 42 atoms in block 196
Block first atom: 9061
Blocpdb> 14 atoms in block 197
Block first atom: 9102
Blocpdb> 197 blocks.
Blocpdb> At most, 61 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3207555 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 27348
Prepmat> Matrix trace = 7007160.0000
Prepmat> Last element read: 27348 27348 63.0164
Prepmat> 19504 lines saved.
Prepmat> 17880 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9116
RTB> Total mass = 9116.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9116
RTB> Number of blocks = 197
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 197949.5372
RTB> 55473 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1182
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55473
Diagstd> Projected matrix trace = 197949.5372
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1182 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 197949.5372
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0512896 0.1206442 0.1653534 0.3565855
0.4061737 0.5369788 0.6911560 0.7992094 0.8653738
1.0751724 1.1744629 1.2381698 1.4593184 1.4812159
1.6124495 1.6631042 1.7665799 1.9327417 1.9624132
2.0959217 2.2499713 2.3457606 2.6145094 2.6493277
2.9274201 3.0226902 3.3401742 3.5893482 3.7659028
3.8805591 3.9492118 4.2278302 4.2646600 4.5256300
4.7662748 4.9959470 5.1825019 5.4985144 5.6183523
5.6997803 5.8690575 6.1435218 6.3669123 6.4837665
6.7264284 7.0645422 7.1696973 7.5608809 7.8581833
8.2353500 8.7584919 8.9116374 9.2904059 9.4940464
9.5058897 10.0075620 10.0899379 10.2709889 10.4603968
10.8018639 10.9330750 11.0668480 11.5709025 11.9221507
12.1278120 12.5716869 12.6470951 12.8327834 12.8973452
13.1022775 13.4526866 13.8563432 14.1564148 14.6212936
14.9709162 15.3004201 15.5131287 15.7815128 16.1004477
16.4685103 16.8531474 17.0647473 17.4827522 17.6193126
17.8152782 18.1558644 18.7009999 19.1550151 19.2297926
19.4460759 19.6827106 20.1736684 20.2926682 20.5084213
20.9386824 21.1965572 21.2912298 21.7672756 21.8991742
22.3255974
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034328 0.0034331 0.0034331 0.0034333 0.0034337
0.0034347 24.5929121 37.7179898 44.1572388 64.8450962
69.2071812 79.5744887 90.2782907 97.0790603 101.0176262
112.5989462 117.6833267 120.8329510 131.1808118 132.1613478
137.8917680 140.0409369 144.3317656 150.9670559 152.1214689
157.2109556 162.8860037 166.3171853 175.5862027 176.7515065
185.7966181 188.7956995 198.4631301 205.7325822 210.7316811
213.9155877 215.7995307 223.2821735 224.2526007 231.0121393
237.0744867 242.7192322 247.2094194 254.6349216 257.3947972
259.2533260 263.0749289 269.1559481 274.0057739 276.5088034
281.6355939 288.6272237 290.7673841 298.5942774 304.4082066
311.6278833 321.3734148 324.1709047 330.9882871 334.5961627
334.8047928 343.5258519 344.9367969 348.0177627 351.2120115
356.8984250 359.0595188 361.2494984 369.3846954 374.9493314
378.1695072 385.0277746 386.1807953 389.0054729 389.9827904
393.0688945 398.2903574 404.2216731 408.5751226 415.2294797
420.1646104 424.7632724 427.7056406 431.3895254 435.7267839
440.6790841 445.7956122 448.5854784 454.0463415 455.8162043
458.3440365 462.7045244 469.5995736 475.2657631 476.1925325
478.8629850 481.7677604 487.7392643 489.1756798 491.7692800
496.9010959 499.9515786 501.0668305 506.6374840 508.1701480
513.0938688
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9116
Rtb_to_modes> Number of blocs = 197
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1290E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1206
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1654
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3566
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4062
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6912
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8654
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.174
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.238
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.459
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.481
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.663
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.962
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.096
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.250
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.346
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.023
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.589
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.228
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.183
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.499
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.869
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.144
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.367
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.484
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.726
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.065
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.170
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.858
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.235
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.758
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.912
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.494
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99996
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996
1.00004 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99995 0.99999 0.99998 0.99996
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00004
1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 164088 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99996
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996
1.00004 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99995 0.99999 0.99998 0.99996
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00004
1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2504020431271785066.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2504020431271785066.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2504020431271785066.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2504020431271785066.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1178
First residue number = 1
Last residue number = 1178
Number of atoms found = 9116
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1290E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3566
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6912
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.238
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.459
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.481
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.962
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.096
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.346
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.649
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.023
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.589
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.949
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.183
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.618
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.144
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.367
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.484
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.726
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.065
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.170
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.858
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.758
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.912
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.494
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Bfactors> 106 vectors, 27348 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.051290
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.419 for 1178 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.104 +/- 0.25
Bfactors> = 92.772 +/- 13.54
Bfactors> Shiftng-fct= 92.668
Bfactors> Scaling-fct= 53.940
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2504020431271785066.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2504020431271785066.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1
Chkmod> 106 vectors, 27348 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9116 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7464
0.0034 0.8151
0.0034 0.8874
0.0034 0.8935
0.0034 0.8409
0.0034 0.8538
24.5920 0.2508
37.7095 0.2261
44.1616 0.0223
64.8436 0.2940
69.2065 0.5052
79.5726 0.3160
90.2773 0.2576
97.0743 0.0947
101.0148 0.3710
112.5851 0.4653
117.6551 0.3918
120.8195 0.4934
131.1609 0.1787
132.1460 0.0530
137.8666 0.0772
140.0305 0.1754
144.3427 0.2089
150.9707 0.2631
152.0989 0.2978
157.2071 0.3383
162.8801 0.2861
166.3185 0.2168
175.5951 0.2748
176.7330 0.2506
185.7753 0.2201
188.7973 0.0483
198.4494 0.2780
205.7138 0.0926
210.7254 0.2092
213.9186 0.2507
215.7845 0.1335
223.2771 0.4228
224.2519 0.4837
231.0117 0.3454
237.0575 0.5545
242.7101 0.3750
247.2107 0.1264
254.6352 0.3148
257.3757 0.2684
259.2472 0.2434
263.0623 0.5076
269.1549 0.2510
273.9959 0.1529
276.5019 0.1516
281.6145 0.3441
288.6242 0.2960
290.7610 0.2325
298.5838 0.1611
304.3916 0.4563
311.6079 0.2008
321.3506 0.3539
324.1636 0.3933
330.9668 0.0787
334.5810 0.1377
334.7924 0.3778
343.5529 0.2947
344.9231 0.1769
347.9861 0.1612
351.1903 0.2937
356.8523 0.2398
358.9936 0.1282
361.2854 0.3496
369.3544 0.3643
374.8994 0.3396
378.1874 0.4895
384.9854 0.3059
386.2086 0.3534
388.9466 0.2380
390.0062 0.3218
393.0179 0.2945
398.2335 0.1793
404.2577 0.3280
408.6093 0.3506
415.1933 0.2862
420.1337 0.2442
424.7392 0.3199
427.6442 0.2268
431.3503 0.1223
435.7020 0.3415
440.6801 0.4274
445.7348 0.3541
448.5038 0.0774
453.9911 0.2684
455.8055 0.3150
458.3851 0.3341
462.7374 0.3386
469.5669 0.1399
475.3072 0.3191
476.1747 0.4741
478.8907 0.1216
481.7139 0.2988
487.6740 0.1463
489.1225 0.2974
491.7671 0.0473
496.8954 0.2728
499.9707 0.2102
501.0308 0.3349
506.6474 0.2679
508.1579 0.2016
513.1224 0.4083
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
making animated gifs
11 models are in 2504020431271785066.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
making animated gifs
11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
making animated gifs
11 models are in 2504020431271785066.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
making animated gifs
11 models are in 2504020431271785066.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2504020431271785066.eigenfacs
2504020431271785066.atom
making animated gifs
11 models are in 2504020431271785066.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2504020431271785066.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2504020431271785066.10.pdb
2504020431271785066.11.pdb
2504020431271785066.7.pdb
2504020431271785066.8.pdb
2504020431271785066.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m50.135s
user 0m49.989s
sys 0m0.144s
rm: cannot remove '2504020431271785066.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.
|