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LOGs for ID: 2504020431271785066

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2504020431271785066.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2504020431271785066.atom to be opened. Openam> File opened: 2504020431271785066.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1178 First residue number = 1 Last residue number = 1178 Number of atoms found = 9116 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.885308 +/- 18.138631 From: -43.443000 To: 46.811000 = 2.137947 +/- 21.334602 From: -48.385000 To: 56.142000 = -2.451745 +/- 22.777408 From: -63.150000 To: 40.433000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8577 % Filled. Pdbmat> 3207358 non-zero elements. Pdbmat> 350358 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.87 +/- 23.46 Maximum number = 129 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 7.007160E+06 Pdbmat> Larger element = 473.133 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1178 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2504020431271785066.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2504020431271785066.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2504020431271785066.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9116 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1178 residues. Blocpdb> 43 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 44 Blocpdb> 43 atoms in block 3 Block first atom: 91 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 134 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 180 Blocpdb> 36 atoms in block 6 Block first atom: 224 Blocpdb> 49 atoms in block 7 Block first atom: 260 Blocpdb> 52 atoms in block 8 Block first atom: 309 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 361 Blocpdb> 45 atoms in block 10 Block first atom: 404 Blocpdb> 54 atoms in block 11 Block first atom: 449 Blocpdb> 49 atoms in block 12 Block first atom: 503 Blocpdb> 36 atoms in block 13 Block first atom: 552 Blocpdb> 43 atoms in block 14 Block first atom: 588 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 631 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 676 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 726 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 770 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 815 Blocpdb> 44 atoms in block 20 Block first atom: 869 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 913 Blocpdb> 44 atoms in block 22 Block first atom: 962 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1006 Blocpdb> 50 atoms in block 24 Block first atom: 1053 Blocpdb> 45 atoms in block 25 Block first atom: 1103 Blocpdb> 45 atoms in block 26 Block first atom: 1148 Blocpdb> 50 atoms in block 27 Block first atom: 1193 Blocpdb> 47 atoms in block 28 Block first atom: 1243 Blocpdb> 46 atoms in block 29 Block first atom: 1290 Blocpdb> 44 atoms in block 30 Block first atom: 1336 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1380 Blocpdb> 51 atoms in block 32 Block first atom: 1427 Blocpdb> 47 atoms in block 33 Block first atom: 1478 Blocpdb> 47 atoms in block 34 Block first atom: 1525 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1572 Blocpdb> 57 atoms in block 36 Block first atom: 1613 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1670 Blocpdb> 49 atoms in block 38 Block first atom: 1720 Blocpdb> 54 atoms in block 39 Block first atom: 1769 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1823 Blocpdb> 48 atoms in block 41 Block first atom: 1867 Blocpdb> 55 atoms in block 42 Block first atom: 1915 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1970 Blocpdb> 50 atoms in block 44 Block first atom: 2016 Blocpdb> 41 atoms in block 45 Block first atom: 2066 Blocpdb> 46 atoms in block 46 Block first atom: 2107 Blocpdb> 59 atoms in block 47 Block first atom: 2153 Blocpdb> 41 atoms in block 48 Block first atom: 2212 Blocpdb> 45 atoms in block 49 Block first atom: 2253 Blocpdb> 52 atoms in block 50 Block first atom: 2298 Blocpdb> 61 atoms in block 51 Block first atom: 2350 Blocpdb> 43 atoms in block 52 Block first atom: 2411 Blocpdb> 56 atoms in block 53 Block first atom: 2454 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2510 Blocpdb> 42 atoms in block 55 Block first atom: 2554 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 2596 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2642 Blocpdb> 55 atoms in block 58 Block first atom: 2684 Blocpdb> 45 atoms in block 59 Block first atom: 2739 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 2784 Blocpdb> 46 atoms in block 61 Block first atom: 2821 Blocpdb> 49 atoms in block 62 Block first atom: 2867 Blocpdb> 53 atoms in block 63 Block first atom: 2916 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 2969 Blocpdb> 53 atoms in block 65 Block first atom: 3015 Blocpdb> 44 atoms in block 66 Block first atom: 3068 Blocpdb> 54 atoms in block 67 Block first atom: 3112 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3166 Blocpdb> 43 atoms in block 69 Block first atom: 3216 Blocpdb> 48 atoms in block 70 Block first atom: 3259 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3307 Blocpdb> 52 atoms in block 72 Block first atom: 3349 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 3401 Blocpdb> 52 atoms in block 74 Block first atom: 3446 Blocpdb> 40 atoms in block 75 Block first atom: 3498 Blocpdb> 57 atoms in block 76 Block first atom: 3538 Blocpdb> 32 atoms in block 77 Block first atom: 3595 Blocpdb> 50 atoms in block 78 Block first atom: 3627 Blocpdb> 47 atoms in block 79 Block first atom: 3677 Blocpdb> 52 atoms in block 80 Block first atom: 3724 Blocpdb> 44 atoms in block 81 Block first atom: 3776 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3820 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 3863 Blocpdb> 44 atoms in block 84 Block first atom: 3903 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 3947 Blocpdb> 54 atoms in block 86 Block first atom: 3995 Blocpdb> 46 atoms in block 87 Block first atom: 4049 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 4095 Blocpdb> 49 atoms in block 89 Block first atom: 4140 Blocpdb> 54 atoms in block 90 Block first atom: 4189 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 4243 Blocpdb> 41 atoms in block 92 Block first atom: 4283 Blocpdb> 57 atoms in block 93 Block first atom: 4324 Blocpdb> 53 atoms in block 94 Block first atom: 4381 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4434 Blocpdb> 40 atoms in block 96 Block first atom: 4480 Blocpdb> 49 atoms in block 97 Block first atom: 4520 Blocpdb> 48 atoms in block 98 Block first atom: 4569 Blocpdb> 40 atoms in block 99 Block first atom: 4617 Blocpdb> 53 atoms in block 100 Block first atom: 4657 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 4710 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4755 Blocpdb> 47 atoms in block 103 Block first atom: 4797 Blocpdb> 45 atoms in block 104 Block first atom: 4844 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 4889 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 4927 Blocpdb> 41 atoms in block 107 Block first atom: 4973 Blocpdb> 40 atoms in block 108 Block first atom: 5014 Blocpdb> 46 atoms in block 109 Block first atom: 5054 Blocpdb> 47 atoms in block 110 Block first atom: 5100 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 5147 Blocpdb> 60 atoms in block 112 Block first atom: 5187 Blocpdb> 53 atoms in block 113 Block first atom: 5247 Blocpdb> 40 atoms in block 114 Block first atom: 5300 Blocpdb> 45 atoms in block 115 Block first atom: 5340 Blocpdb> 43 atoms in block 116 Block first atom: 5385 Blocpdb> 42 atoms in block 117 Block first atom: 5428 Blocpdb> 37 atoms in block 118 Block first atom: 5470 Blocpdb> 43 atoms in block 119 Block first atom: 5507 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5550 Blocpdb> 49 atoms in block 121 Block first atom: 5595 Blocpdb> 52 atoms in block 122 Block first atom: 5644 Blocpdb> 43 atoms in block 123 Block first atom: 5696 Blocpdb> 52 atoms in block 124 Block first atom: 5739 Blocpdb> 44 atoms in block 125 Block first atom: 5791 Blocpdb> 55 atoms in block 126 Block first atom: 5835 Blocpdb> 47 atoms in block 127 Block first atom: 5890 Blocpdb> 44 atoms in block 128 Block first atom: 5937 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 5981 Blocpdb> 45 atoms in block 130 Block first atom: 6030 Blocpdb> 46 atoms in block 131 Block first atom: 6075 Blocpdb> 49 atoms in block 132 Block first atom: 6121 Blocpdb> 44 atoms in block 133 Block first atom: 6170 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 6214 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 6253 Blocpdb> 47 atoms in block 136 Block first atom: 6296 Blocpdb> 56 atoms in block 137 Block first atom: 6343 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 6399 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 6445 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6496 Blocpdb> 42 atoms in block 141 Block first atom: 6540 Blocpdb> 45 atoms in block 142 Block first atom: 6582 Blocpdb> 52 atoms in block 143 Block first atom: 6627 Blocpdb> 41 atoms in block 144 Block first atom: 6679 Blocpdb> 50 atoms in block 145 Block first atom: 6720 Blocpdb> 49 atoms in block 146 Block first atom: 6770 Blocpdb> 46 atoms in block 147 Block first atom: 6819 Blocpdb> 45 atoms in block 148 Block first atom: 6865 Blocpdb> 42 atoms in block 149 Block first atom: 6910 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 6952 Blocpdb> 48 atoms in block 151 Block first atom: 6996 Blocpdb> 41 atoms in block 152 Block first atom: 7044 Blocpdb> 47 atoms in block 153 Block first atom: 7085 Blocpdb> 46 atoms in block 154 Block first atom: 7132 Blocpdb> 47 atoms in block 155 Block first atom: 7178 Blocpdb> 50 atoms in block 156 Block first atom: 7225 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 7275 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7320 Blocpdb> 36 atoms in block 159 Block first atom: 7370 Blocpdb> 49 atoms in block 160 Block first atom: 7406 Blocpdb> 49 atoms in block 161 Block first atom: 7455 Blocpdb> 44 atoms in block 162 Block first atom: 7504 Blocpdb> 46 atoms in block 163 Block first atom: 7548 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7594 Blocpdb> 43 atoms in block 165 Block first atom: 7639 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7682 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 7729 Blocpdb> 34 atoms in block 168 Block first atom: 7771 Blocpdb> 49 atoms in block 169 Block first atom: 7805 Blocpdb> 44 atoms in block 170 Block first atom: 7854 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 7898 Blocpdb> 57 atoms in block 172 Block first atom: 7942 Blocpdb> 51 atoms in block 173 Block first atom: 7999 Blocpdb> 51 atoms in block 174 Block first atom: 8050 Blocpdb> 42 atoms in block 175 Block first atom: 8101 Blocpdb> 48 atoms in block 176 Block first atom: 8143 Blocpdb> 39 atoms in block 177 Block first atom: 8191 Blocpdb> 50 atoms in block 178 Block first atom: 8230 Blocpdb> 50 atoms in block 179 Block first atom: 8280 Blocpdb> 43 atoms in block 180 Block first atom: 8330 Blocpdb> 46 atoms in block 181 Block first atom: 8373 Blocpdb> 49 atoms in block 182 Block first atom: 8419 Blocpdb> 40 atoms in block 183 Block first atom: 8468 Blocpdb> 55 atoms in block 184 Block first atom: 8508 Blocpdb> 42 atoms in block 185 Block first atom: 8563 Blocpdb> 43 atoms in block 186 Block first atom: 8605 Blocpdb> 50 atoms in block 187 Block first atom: 8648 Blocpdb> 49 atoms in block 188 Block first atom: 8698 Blocpdb> 45 atoms in block 189 Block first atom: 8747 Blocpdb> 43 atoms in block 190 Block first atom: 8792 Blocpdb> 39 atoms in block 191 Block first atom: 8835 Blocpdb> 49 atoms in block 192 Block first atom: 8874 Blocpdb> 50 atoms in block 193 Block first atom: 8923 Blocpdb> 38 atoms in block 194 Block first atom: 8973 Blocpdb> 50 atoms in block 195 Block first atom: 9011 Blocpdb> 42 atoms in block 196 Block first atom: 9061 Blocpdb> 14 atoms in block 197 Block first atom: 9102 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 61 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3207555 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27348 Prepmat> Matrix trace = 7007160.0000 Prepmat> Last element read: 27348 27348 63.0164 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 17880 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9116 RTB> Total mass = 9116.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9116 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 197949.5372 RTB> 55473 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55473 Diagstd> Projected matrix trace = 197949.5372 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 197949.5372 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0512896 0.1206442 0.1653534 0.3565855 0.4061737 0.5369788 0.6911560 0.7992094 0.8653738 1.0751724 1.1744629 1.2381698 1.4593184 1.4812159 1.6124495 1.6631042 1.7665799 1.9327417 1.9624132 2.0959217 2.2499713 2.3457606 2.6145094 2.6493277 2.9274201 3.0226902 3.3401742 3.5893482 3.7659028 3.8805591 3.9492118 4.2278302 4.2646600 4.5256300 4.7662748 4.9959470 5.1825019 5.4985144 5.6183523 5.6997803 5.8690575 6.1435218 6.3669123 6.4837665 6.7264284 7.0645422 7.1696973 7.5608809 7.8581833 8.2353500 8.7584919 8.9116374 9.2904059 9.4940464 9.5058897 10.0075620 10.0899379 10.2709889 10.4603968 10.8018639 10.9330750 11.0668480 11.5709025 11.9221507 12.1278120 12.5716869 12.6470951 12.8327834 12.8973452 13.1022775 13.4526866 13.8563432 14.1564148 14.6212936 14.9709162 15.3004201 15.5131287 15.7815128 16.1004477 16.4685103 16.8531474 17.0647473 17.4827522 17.6193126 17.8152782 18.1558644 18.7009999 19.1550151 19.2297926 19.4460759 19.6827106 20.1736684 20.2926682 20.5084213 20.9386824 21.1965572 21.2912298 21.7672756 21.8991742 22.3255974 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034331 0.0034331 0.0034333 0.0034337 0.0034347 24.5929121 37.7179898 44.1572388 64.8450962 69.2071812 79.5744887 90.2782907 97.0790603 101.0176262 112.5989462 117.6833267 120.8329510 131.1808118 132.1613478 137.8917680 140.0409369 144.3317656 150.9670559 152.1214689 157.2109556 162.8860037 166.3171853 175.5862027 176.7515065 185.7966181 188.7956995 198.4631301 205.7325822 210.7316811 213.9155877 215.7995307 223.2821735 224.2526007 231.0121393 237.0744867 242.7192322 247.2094194 254.6349216 257.3947972 259.2533260 263.0749289 269.1559481 274.0057739 276.5088034 281.6355939 288.6272237 290.7673841 298.5942774 304.4082066 311.6278833 321.3734148 324.1709047 330.9882871 334.5961627 334.8047928 343.5258519 344.9367969 348.0177627 351.2120115 356.8984250 359.0595188 361.2494984 369.3846954 374.9493314 378.1695072 385.0277746 386.1807953 389.0054729 389.9827904 393.0688945 398.2903574 404.2216731 408.5751226 415.2294797 420.1646104 424.7632724 427.7056406 431.3895254 435.7267839 440.6790841 445.7956122 448.5854784 454.0463415 455.8162043 458.3440365 462.7045244 469.5995736 475.2657631 476.1925325 478.8629850 481.7677604 487.7392643 489.1756798 491.7692800 496.9010959 499.9515786 501.0668305 506.6374840 508.1701480 513.0938688 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9116 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1290E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3566 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5370 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.075 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.481 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.663 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.615 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.023 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.589 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.618 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.494 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99995 0.99999 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 164088 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99995 0.99999 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2504020431271785066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2504020431271785066.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2504020431271785066.atom Openam> file on opening on unit 11: 2504020431271785066.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1178 First residue number = 1 Last residue number = 1178 Number of atoms found = 9116 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1290E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3566 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5370 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.481 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.615 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.023 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.589 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.526 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.618 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.494 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33 Bfactors> 106 vectors, 27348 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.051290 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.419 for 1178 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.104 +/- 0.25 Bfactors> = 92.772 +/- 13.54 Bfactors> Shiftng-fct= 92.668 Bfactors> Scaling-fct= 53.940 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2504020431271785066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2504020431271785066.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1 Chkmod> 106 vectors, 27348 coordinates in file. Chkmod> That is: 9116 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7464 0.0034 0.8151 0.0034 0.8874 0.0034 0.8935 0.0034 0.8409 0.0034 0.8538 24.5920 0.2508 37.7095 0.2261 44.1616 0.0223 64.8436 0.2940 69.2065 0.5052 79.5726 0.3160 90.2773 0.2576 97.0743 0.0947 101.0148 0.3710 112.5851 0.4653 117.6551 0.3918 120.8195 0.4934 131.1609 0.1787 132.1460 0.0530 137.8666 0.0772 140.0305 0.1754 144.3427 0.2089 150.9707 0.2631 152.0989 0.2978 157.2071 0.3383 162.8801 0.2861 166.3185 0.2168 175.5951 0.2748 176.7330 0.2506 185.7753 0.2201 188.7973 0.0483 198.4494 0.2780 205.7138 0.0926 210.7254 0.2092 213.9186 0.2507 215.7845 0.1335 223.2771 0.4228 224.2519 0.4837 231.0117 0.3454 237.0575 0.5545 242.7101 0.3750 247.2107 0.1264 254.6352 0.3148 257.3757 0.2684 259.2472 0.2434 263.0623 0.5076 269.1549 0.2510 273.9959 0.1529 276.5019 0.1516 281.6145 0.3441 288.6242 0.2960 290.7610 0.2325 298.5838 0.1611 304.3916 0.4563 311.6079 0.2008 321.3506 0.3539 324.1636 0.3933 330.9668 0.0787 334.5810 0.1377 334.7924 0.3778 343.5529 0.2947 344.9231 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models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2504020431271785066.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2504020431271785066.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2504020431271785066 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2504020431271785066.eigenfacs 2504020431271785066.atom making animated gifs 11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2504020431271785066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making 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