Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* 1JSF_D67G *

LOGs for ID: 2503181240583265195

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2503181240583265195.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2503181240583265195.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2503181240583265195.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    130
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    130
            Number of atoms found    =   2016
            Mean number per residue  =     15.5

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    13.324196 +/-     8.121977 From:    -5.105000 To:    31.683000
 =    14.948486 +/-     8.448132 From:    -8.769000 To:    33.710000
 =    28.118631 +/-     7.933305 From:     9.487000 To:    46.781000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   7.6407 % Filled.
 Pdbmat>      1397645  non-zero elements.
 Pdbmat>       153976 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    152.75 +/-     48.36
         Maximum number =    243
         Minimum number =     31

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.079520E+06
 Pdbmat> Larger element =  868.539    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
130 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2503181240583265195.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2503181240583265195.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2503181240583265195.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2016 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   130 residues.
 Blocpdb>    24 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     25
 Blocpdb>    20 atoms in block      3
 Block first atom:     41
 Blocpdb>    15 atoms in block      4
 Block first atom:     61
 Blocpdb>    24 atoms in block      5
 Block first atom:     76
 Blocpdb>    10 atoms in block      6
 Block first atom:    100
 Blocpdb>    15 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    19 atoms in block      8
 Block first atom:    125
 Blocpdb>    10 atoms in block      9
 Block first atom:    144
 Blocpdb>    24 atoms in block     10
 Block first atom:    154
 Blocpdb>    14 atoms in block     11
 Block first atom:    178
 Blocpdb>    19 atoms in block     12
 Block first atom:    192
 Blocpdb>    22 atoms in block     13
 Block first atom:    211
 Blocpdb>    24 atoms in block     14
 Block first atom:    233
 Blocpdb>    19 atoms in block     15
 Block first atom:    257
 Blocpdb>     7 atoms in block     16
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    283
 Blocpdb>    12 atoms in block     18
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     7 atoms in block     19
 Block first atom:    312
 Blocpdb>    21 atoms in block     20
 Block first atom:    319
 Blocpdb>    24 atoms in block     21
 Block first atom:    340
 Blocpdb>     7 atoms in block     22
 Block first atom:    364
 Blocpdb>    19 atoms in block     23
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    11 atoms in block     24
 Block first atom:    390
 Blocpdb>    19 atoms in block     25
 Block first atom:    401
 Blocpdb>    10 atoms in block     26
 Block first atom:    420
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    24 atoms in block     28
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    17 atoms in block     29
 Block first atom:    468
 Blocpdb>    10 atoms in block     30
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    19 atoms in block     31
 Block first atom:    495
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    514
 Blocpdb>    22 atoms in block     33
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    24 atoms in block     34
 Block first atom:    546
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    570
 Blocpdb>    11 atoms in block     36
 Block first atom:    585
 Blocpdb>     7 atoms in block     37
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    21 atoms in block     38
 Block first atom:    603
 Blocpdb>    14 atoms in block     39
 Block first atom:    624
 Blocpdb>    14 atoms in block     40
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    24 atoms in block     41
 Block first atom:    652
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    676
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    686
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    700
 Blocpdb>    21 atoms in block     45
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    14 atoms in block     46
 Block first atom:    735
 Blocpdb>    10 atoms in block     47
 Block first atom:    749
 Blocpdb>     7 atoms in block     48
 Block first atom:    759
 Blocpdb>    12 atoms in block     49
 Block first atom:    766
 Blocpdb>    24 atoms in block     50
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    11 atoms in block     51
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    14 atoms in block     52
 Block first atom:    813
 Blocpdb>    12 atoms in block     53
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    21 atoms in block     54
 Block first atom:    839
 Blocpdb>     7 atoms in block     55
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    19 atoms in block     56
 Block first atom:    867
 Blocpdb>    20 atoms in block     57
 Block first atom:    886
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    19 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    14 atoms in block     60
 Block first atom:    942
 Blocpdb>    11 atoms in block     61
 Block first atom:    956
 Blocpdb>    24 atoms in block     62
 Block first atom:    967
 Blocpdb>    21 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    24 atoms in block     64
 Block first atom:   1012
 Blocpdb>    10 atoms in block     65
 Block first atom:   1036
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:   1046
 Blocpdb>     7 atoms in block     67
 Block first atom:   1060
 Blocpdb>     7 atoms in block     68
 Block first atom:   1067
 Blocpdb>    22 atoms in block     69
 Block first atom:   1074
 Blocpdb>    14 atoms in block     70
 Block first atom:   1096
 Blocpdb>    14 atoms in block     71
 Block first atom:   1110
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    10 atoms in block     73
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1141
 Blocpdb>    14 atoms in block     75
 Block first atom:   1157
 Blocpdb>    10 atoms in block     76
 Block first atom:   1171
 Blocpdb>    10 atoms in block     77
 Block first atom:   1181
 Blocpdb>    17 atoms in block     78
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    19 atoms in block     79
 Block first atom:   1208
 Blocpdb>    11 atoms in block     80
 Block first atom:   1227
 Blocpdb>    10 atoms in block     81
 Block first atom:   1238
 Blocpdb>    11 atoms in block     82
 Block first atom:   1248
 Blocpdb>    10 atoms in block     83
 Block first atom:   1259
 Blocpdb>    19 atoms in block     84
 Block first atom:   1269
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1288
 Blocpdb>    17 atoms in block     86
 Block first atom:   1307
 Blocpdb>    12 atoms in block     87
 Block first atom:   1324
 Blocpdb>    14 atoms in block     88
 Block first atom:   1336
 Blocpdb>    19 atoms in block     89
 Block first atom:   1350
 Blocpdb>    10 atoms in block     90
 Block first atom:   1369
 Blocpdb>    12 atoms in block     91
 Block first atom:   1379
 Blocpdb>    10 atoms in block     92
 Block first atom:   1391
 Blocpdb>    16 atoms in block     93
 Block first atom:   1401
 Blocpdb>    10 atoms in block     94
 Block first atom:   1417
 Blocpdb>    10 atoms in block     95
 Block first atom:   1427
 Blocpdb>    10 atoms in block     96
 Block first atom:   1437
 Blocpdb>    22 atoms in block     97
 Block first atom:   1447
 Blocpdb>    24 atoms in block     98
 Block first atom:   1469
 Blocpdb>    16 atoms in block     99
 Block first atom:   1493
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1509
 Blocpdb>    24 atoms in block    101
 Block first atom:   1525
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1549
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1561
 Blocpdb>    17 atoms in block    104
 Block first atom:   1575
 Blocpdb>     7 atoms in block    105
 Block first atom:   1592
 Blocpdb>    19 atoms in block    106
 Block first atom:   1599
 Blocpdb>    24 atoms in block    107
 Block first atom:   1618
 Blocpdb>    10 atoms in block    108
 Block first atom:   1642
 Blocpdb>    24 atoms in block    109
 Block first atom:   1652
 Blocpdb>    16 atoms in block    110
 Block first atom:   1676
 Blocpdb>    10 atoms in block    111
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    24 atoms in block    112
 Block first atom:   1702
 Blocpdb>    24 atoms in block    113
 Block first atom:   1726
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1750
 Blocpdb>    24 atoms in block    115
 Block first atom:   1764
 Blocpdb>    10 atoms in block    116
 Block first atom:   1788
 Blocpdb>    17 atoms in block    117
 Block first atom:   1798
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1815
 Blocpdb>    24 atoms in block    119
 Block first atom:   1829
 Blocpdb>    12 atoms in block    120
 Block first atom:   1853
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   1865
 Blocpdb>    24 atoms in block    122
 Block first atom:   1881
 Blocpdb>    17 atoms in block    123
 Block first atom:   1905
 Blocpdb>    21 atoms in block    124
 Block first atom:   1922
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1943
 Blocpdb>    17 atoms in block    126
 Block first atom:   1959
 Blocpdb>     7 atoms in block    127
 Block first atom:   1976
 Blocpdb>    10 atoms in block    128
 Block first atom:   1983
 Blocpdb>     7 atoms in block    129
 Block first atom:   1993
 Blocpdb>    17 atoms in block    130
 Block first atom:   1999

 Blocpdb>   130 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     7 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1397775 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6048

 Prepmat> Matrix trace    =    3079520.0000
 Prepmat> Last element read:    6048   6048       592.5375
 Prepmat>         8516 lines saved.
 Prepmat>         6629 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2016
 RTB> Total mass =        2016.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2016
 RTB> Number of blocks =   130
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  362173.1514
 RTB>     65946 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      780
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    65946
 Diagstd> Projected matrix trace =  362173.1514

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    780 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 362173.1514
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      7.3738289     11.0365691     18.4771692     24.3128192
     27.0983708     34.7829629     36.3228467     40.1388036     43.7846232
     46.4358613     49.6842351     51.5873037     53.3167981     60.1675760
     62.0477535     63.7893549     64.4091639     69.1085882     74.6529291
     75.2847544     79.2458219     79.7250438     83.5024951     85.4438625
     86.3449392     89.9546356     92.2963565     96.7942158     98.1601377
    100.4421693    102.3590794    103.9035168    104.3760926    108.7387662
    109.2268922    111.6616698    112.2030047    116.7265928    117.8070158
    118.9193130    120.4574013    123.4365158    124.7917627    127.2446227
    128.2405195    132.7978903    135.9431888    137.4690685    138.7690360
    141.8742421    144.1344686    144.4783378    146.3348972    147.1933662
    150.1949496    151.4557120    152.5387359    152.8645477    154.5441817
    155.0930054    158.0739057    160.9392027    162.2656385    164.6196134
    165.8612488    167.1289006    169.8549688    170.3166622    172.7451690
    173.5491805    174.6702356    176.1274401    177.2625720    180.9296244
    183.3181558    184.7192475    184.9648522    186.3045625    190.0587268
    191.0979397    191.6935925    192.0281355    192.8463295    194.2849644
    195.7698628    198.3473736    198.7208218    199.2178948    201.7736238
    202.3776496    204.4431776    204.8726908    206.7939126    207.6005708
    209.4551161    210.6032821    211.0143001    214.0131530    215.5233370
    215.9904601

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034310      0.0034339      0.0034341      0.0034345      0.0034350
      0.0034360    294.8776177    360.7549701    466.7808152    535.4426246
    565.2842309    640.4401747    654.4631818    687.9826595    718.5485027
    739.9834947    765.4284218    779.9498788    792.9162353    842.3188850
    855.3784631    867.3000780    871.5034510    902.7370994    938.2502881
    942.2123649    966.6816336    969.6001269    992.3046048   1003.7734781
   1009.0524106   1029.9284489   1043.2479953   1068.3658147   1075.8775856
   1088.3117602   1098.6477380   1106.9051395   1109.4195066   1132.3677202
   1134.9064617   1147.4858513   1150.2639896   1173.2219635   1178.6391365
   1184.1902365   1191.8237212   1206.4716122   1213.0766405   1224.9405156
   1229.7247521   1251.3847788   1266.1174859   1273.2033574   1279.2091757
   1293.4422936   1303.7046242   1305.2588558   1313.6184321   1317.4659480
   1330.8311116   1336.4050521   1341.1746984   1342.6062609   1349.9622056
   1352.3571023   1365.2914553   1377.6097346   1383.2751075   1393.2725120
   1398.5169865   1403.8511382   1415.2540562   1417.1761961   1427.2440319
   1430.5616020   1435.1745794   1441.1486914   1445.7852958   1460.6633121
   1470.2731291   1475.8810470   1476.8618947   1482.2007394   1497.0599361
   1501.1472072   1503.4849272   1504.7962937   1507.9987059   1513.6130950
   1519.3862734   1529.3557046   1530.7947620   1532.7081032   1542.5081850
   1544.8152716   1552.6786863   1554.3088365   1561.5797027   1564.6224301
   1571.5954639   1575.8970689   1577.4340972   1588.6034924   1594.1986302
   1595.9253200

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2016
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    130

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9830E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.374    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   112.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   116.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   118.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   120.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   123.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   127.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   132.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   135.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   138.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   144.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   144.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   146.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   147.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   150.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   151.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   152.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   152.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   154.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   155.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   158.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   160.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   162.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   164.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   165.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   167.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   169.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   170.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   172.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   173.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   174.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   176.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   177.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   180.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   184.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   185.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   186.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   190.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   191.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   191.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   192.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   192.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   194.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   195.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   198.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   198.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   199.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   201.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   202.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   204.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   204.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   206.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   207.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   209.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   210.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   211.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   214.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   215.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   216.0    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    780 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
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 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99994 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
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 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
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 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003
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 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00003
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    36288 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
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 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
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 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
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 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003
 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00003 0.99998 1.00003 0.99998 1.00003
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2503181240583265195.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2503181240583265195.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2503181240583265195.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2503181240583265195.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    130
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    130
            Number of atoms found    =   2016
            Mean number per residue  =     15.5

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9830E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.374    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   112.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   116.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   120.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   123.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   127.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   132.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   135.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   144.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   144.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   146.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   147.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   150.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   151.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   152.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   152.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   154.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   155.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   158.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   160.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   162.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   165.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   167.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   169.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   170.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   172.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   173.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   174.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   176.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   177.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   180.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   184.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   185.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   186.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   190.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   191.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   191.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   192.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   192.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   194.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   195.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   198.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   198.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   199.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   201.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   202.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   204.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   204.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   206.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   207.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   209.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   210.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   211.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   214.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   215.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   216.0    

 Bfactors>  106 vectors,   6048 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     7.374000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.620 for    130 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.007 +/-   0.01
 Bfactors> =     15.959 +/-   5.01
 Bfactors> Shiftng-fct=     15.952
 Bfactors> Scaling-fct=    588.700

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2503181240583265195.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2503181240583265195.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4309E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4359E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   294.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   360.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   466.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   535.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   565.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   640.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   654.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   688.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   842.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   855.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   871.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1343.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1383.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1393.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1399.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1415.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1417.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1435.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1497.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1501.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1565.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1576.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1577.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1588.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1594.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1596.    

 Chkmod>  106 vectors,   6048 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2016 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    37 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    41 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9431
      0.0034      0.7624
      0.0034      0.7718
      0.0034      0.6573
      0.0034      0.7969
      0.0034      0.7538
    294.8684      0.3765
    360.7956      0.4684
    466.7965      0.3641
    535.3886      0.4244
    565.2770      0.2997
    640.3854      0.5140
    654.4094      0.4593
    687.9634      0.4973
    718.4797      0.3084
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    855.3572      0.3244
    867.2672      0.4792
    871.4717      0.3864
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   1594.0439      0.3449
   1595.8921      0.2587
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2503181240583265195 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2503181240583265195.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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2503181240583265195.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2503181240583265195.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2503181240583265195.eigenfacs
2503181240583265195.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2503181240583265195.eigenfacs
2503181240583265195.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2503181240583265195.eigenfacs
2503181240583265195.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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11 models are in 2503181240583265195.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 9 will be plotted
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getting mode 8
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making thumbnail 100x100
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2503181240583265195.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m8.764s
user	0m8.720s
sys	0m0.044s
rm: cannot remove '2503181240583265195.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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