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please let us know.

* 1JSF_Native *

LOGs for ID: 2503180600413132399

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2503180600413132399.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2503180600413132399.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2503180600413132399.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    130
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    130
            Number of atoms found    =   1061
            Mean number per residue  =      8.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    13.333488 +/-     8.183381 From:    -4.337000 To:    31.633000
 =    14.961791 +/-     8.468999 From:    -7.729000 To:    36.331000
 =    28.025762 +/-     7.934829 From:    10.433000 To:    46.698000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   7.6844 % Filled.
 Pdbmat>       389395  non-zero elements.
 Pdbmat>        42566 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     80.24 +/-     23.01
         Maximum number =    127
         Minimum number =     20

 Pdbmat> Matrix trace   =  851320.    
 Pdbmat> Larger element =  486.403    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
130 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2503180600413132399.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2503180600413132399.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2503180600413132399.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1061 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   130 residues.
 Blocpdb>     9 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     7 atoms in block      2
 Block first atom:     10
 Blocpdb>    11 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>     9 atoms in block      4
 Block first atom:     28
 Blocpdb>    11 atoms in block      5
 Block first atom:     37
 Blocpdb>     6 atoms in block      6
 Block first atom:     48
 Blocpdb>     9 atoms in block      7
 Block first atom:     54
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     63
 Blocpdb>     5 atoms in block      9
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    11 atoms in block     10
 Block first atom:     76
 Blocpdb>     7 atoms in block     11
 Block first atom:     87
 Blocpdb>     8 atoms in block     12
 Block first atom:     94
 Blocpdb>     9 atoms in block     13
 Block first atom:    102
 Blocpdb>    18 atoms in block     14
 Block first atom:    111
 Blocpdb>     8 atoms in block     15
 Block first atom:    129
 Blocpdb>     4 atoms in block     16
 Block first atom:    137
 Blocpdb>     8 atoms in block     17
 Block first atom:    141
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    149
 Blocpdb>     4 atoms in block     19
 Block first atom:    157
 Blocpdb>    12 atoms in block     20
 Block first atom:    161
 Blocpdb>    11 atoms in block     21
 Block first atom:    173
 Blocpdb>     4 atoms in block     22
 Block first atom:    184
 Blocpdb>     8 atoms in block     23
 Block first atom:    188
 Blocpdb>     6 atoms in block     24
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    12 atoms in block     25
 Block first atom:    202
 Blocpdb>     5 atoms in block     26
 Block first atom:    214
 Blocpdb>     8 atoms in block     27
 Block first atom:    219
 Blocpdb>    14 atoms in block     28
 Block first atom:    227
 Blocpdb>     8 atoms in block     29
 Block first atom:    241
 Blocpdb>     6 atoms in block     30
 Block first atom:    249
 Blocpdb>     8 atoms in block     31
 Block first atom:    255
 Blocpdb>     5 atoms in block     32
 Block first atom:    263
 Blocpdb>     9 atoms in block     33
 Block first atom:    268
 Blocpdb>    14 atoms in block     34
 Block first atom:    277
 Blocpdb>     9 atoms in block     35
 Block first atom:    291
 Blocpdb>     6 atoms in block     36
 Block first atom:    300
 Blocpdb>     4 atoms in block     37
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    12 atoms in block     38
 Block first atom:    310
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    322
 Blocpdb>     7 atoms in block     40
 Block first atom:    330
 Blocpdb>    18 atoms in block     41
 Block first atom:    337
 Blocpdb>     5 atoms in block     42
 Block first atom:    355
 Blocpdb>     7 atoms in block     43
 Block first atom:    360
 Blocpdb>     8 atoms in block     44
 Block first atom:    367
 Blocpdb>    12 atoms in block     45
 Block first atom:    375
 Blocpdb>     8 atoms in block     46
 Block first atom:    387
 Blocpdb>     5 atoms in block     47
 Block first atom:    395
 Blocpdb>     4 atoms in block     48
 Block first atom:    400
 Blocpdb>     8 atoms in block     49
 Block first atom:    404
 Blocpdb>    11 atoms in block     50
 Block first atom:    412
 Blocpdb>     6 atoms in block     51
 Block first atom:    423
 Blocpdb>     7 atoms in block     52
 Block first atom:    429
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    436
 Blocpdb>    12 atoms in block     54
 Block first atom:    444
 Blocpdb>     4 atoms in block     55
 Block first atom:    456
 Blocpdb>     8 atoms in block     56
 Block first atom:    460
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    468
 Blocpdb>     9 atoms in block     58
 Block first atom:    479
 Blocpdb>     8 atoms in block     59
 Block first atom:    488
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    496
 Blocpdb>     6 atoms in block     61
 Block first atom:    504
 Blocpdb>    11 atoms in block     62
 Block first atom:    510
 Blocpdb>    12 atoms in block     63
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    14 atoms in block     64
 Block first atom:    533
 Blocpdb>     6 atoms in block     65
 Block first atom:    547
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    553
 Blocpdb>     8 atoms in block     67
 Block first atom:    561
 Blocpdb>     4 atoms in block     68
 Block first atom:    569
 Blocpdb>     9 atoms in block     69
 Block first atom:    573
 Blocpdb>     7 atoms in block     70
 Block first atom:    582
 Blocpdb>     7 atoms in block     71
 Block first atom:    589
 Blocpdb>     4 atoms in block     72
 Block first atom:    596
 Blocpdb>     5 atoms in block     73
 Block first atom:    600
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    605
 Blocpdb>     8 atoms in block     75
 Block first atom:    612
 Blocpdb>     5 atoms in block     76
 Block first atom:    620
 Blocpdb>     6 atoms in block     77
 Block first atom:    625
 Blocpdb>    10 atoms in block     78
 Block first atom:    631
 Blocpdb>     8 atoms in block     79
 Block first atom:    641
 Blocpdb>     6 atoms in block     80
 Block first atom:    649
 Blocpdb>     6 atoms in block     81
 Block first atom:    655
 Blocpdb>     8 atoms in block     82
 Block first atom:    661
 Blocpdb>     5 atoms in block     83
 Block first atom:    669
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:    674
 Blocpdb>     8 atoms in block     85
 Block first atom:    682
 Blocpdb>     9 atoms in block     86
 Block first atom:    690
 Blocpdb>     8 atoms in block     87
 Block first atom:    699
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    707
 Blocpdb>     8 atoms in block     89
 Block first atom:    715
 Blocpdb>     5 atoms in block     90
 Block first atom:    723
 Blocpdb>     8 atoms in block     91
 Block first atom:    728
 Blocpdb>     5 atoms in block     92
 Block first atom:    736
 Blocpdb>     7 atoms in block     93
 Block first atom:    741
 Blocpdb>     5 atoms in block     94
 Block first atom:    748
 Blocpdb>     6 atoms in block     95
 Block first atom:    753
 Blocpdb>     5 atoms in block     96
 Block first atom:    759
 Blocpdb>     9 atoms in block     97
 Block first atom:    764
 Blocpdb>    11 atoms in block     98
 Block first atom:    773
 Blocpdb>     7 atoms in block     99
 Block first atom:    784
 Blocpdb>     7 atoms in block    100
 Block first atom:    791
 Blocpdb>    11 atoms in block    101
 Block first atom:    798
 Blocpdb>     8 atoms in block    102
 Block first atom:    809
 Blocpdb>     7 atoms in block    103
 Block first atom:    817
 Blocpdb>     9 atoms in block    104
 Block first atom:    824
 Blocpdb>     4 atoms in block    105
 Block first atom:    833
 Blocpdb>     8 atoms in block    106
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    11 atoms in block    107
 Block first atom:    845
 Blocpdb>     5 atoms in block    108
 Block first atom:    856
 Blocpdb>    14 atoms in block    109
 Block first atom:    861
 Blocpdb>     7 atoms in block    110
 Block first atom:    875
 Blocpdb>     5 atoms in block    111
 Block first atom:    882
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:    887
 Blocpdb>    11 atoms in block    113
 Block first atom:    901
 Blocpdb>     8 atoms in block    114
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    11 atoms in block    115
 Block first atom:    920
 Blocpdb>     6 atoms in block    116
 Block first atom:    931
 Blocpdb>     9 atoms in block    117
 Block first atom:    937
 Blocpdb>     8 atoms in block    118
 Block first atom:    946
 Blocpdb>    11 atoms in block    119
 Block first atom:    954
 Blocpdb>     8 atoms in block    120
 Block first atom:    965
 Blocpdb>     7 atoms in block    121
 Block first atom:    973
 Blocpdb>    18 atoms in block    122
 Block first atom:    980
 Blocpdb>     9 atoms in block    123
 Block first atom:    998
 Blocpdb>    12 atoms in block    124
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>     7 atoms in block    125
 Block first atom:   1019
 Blocpdb>    14 atoms in block    126
 Block first atom:   1026
 Blocpdb>     4 atoms in block    127
 Block first atom:   1040
 Blocpdb>     6 atoms in block    128
 Block first atom:   1044
 Blocpdb>     4 atoms in block    129
 Block first atom:   1050
 Blocpdb>     8 atoms in block    130
 Block first atom:   1053

 Blocpdb>   130 blocks.

 Blocpdb> At most,     18 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       389525 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       3183

 Prepmat> Matrix trace    =     851320.0000
 Prepmat> Last element read:    3183   3183       185.3692
 Prepmat>         8516 lines saved.
 Prepmat>         6894 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1061
 RTB> Total mass =        1061.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1061
 RTB> Number of blocks =   130
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  192071.4299
 RTB>     56406 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      780
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    56406
 Diagstd> Projected matrix trace =  192071.4299

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    780 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 192071.4299
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      3.5997313      5.6061176      9.1194896     12.2624602
     13.3941433     15.9418160     17.1666462     20.4395799     21.8467511
     23.3227630     25.4810058     26.0784125     26.6940217     27.4118335
     29.8064928     31.3652590     31.8292373     32.8099912     33.7737723
     35.7235372     36.9922754     37.6884233     38.9560409     40.4944926
     41.4037637     42.7185981     44.9691830     45.5724009     46.2257884
     47.0113366     49.5470032     50.4686449     51.9057260     52.5434648
     54.5389327     55.8227335     57.7674945     58.1844855     58.7085125
     59.8428552     60.6439932     61.6315462     63.5506899     63.8782292
     65.2346300     65.7064752     66.8287459     67.6711648     68.3596407
     68.9398278     69.7659274     70.1630186     71.2120668     72.4520738
     73.2480914     73.9337142     74.6634887     77.9179109     78.2915605
     79.1523026     79.3053316     81.2286840     81.4970108     83.1401510
     84.1421676     84.8630036     84.9748969     86.1887878     87.2579410
     87.6671743     89.0150222     89.7079498     90.1783618     92.2533268
     92.6093020     93.4144395     94.8630286     95.5547459     96.1479574
     96.6347960     97.8586781     98.2336425    100.2242067    100.7880971
    101.2968210    102.6307041    103.3244273    103.7528088    104.5308319
    105.1485387    106.1362035    106.4141035    107.2491208    107.6999824
    108.3024801    108.6649672    109.4824638    110.1846602    110.7255071
    112.2592498

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034337      0.0034337      0.0034345      0.0034345
      0.0034356    206.0299332    257.1143901    327.9295452    380.2630135
    397.4227742    433.5749432    449.9228068    490.9432153    507.5615453
    524.4272858    548.1552320    554.5438024    561.0509282    568.5443173
    592.8580474    608.1626142    612.6442992    622.0113899    631.0809429
    649.0415609    660.4665137    666.6521208    677.7705385    691.0242068
    698.7393332    709.7473444    728.2035289    733.0713300    738.3077779
    744.5546492    764.3706034    771.4470139    782.3532933    787.1448059
    801.9524112    811.3361556    825.3478916    828.3213958    832.0430908
    840.0428376    845.6471226    852.5047590    865.6760753    867.9040492
    877.0702536    880.2364842    887.7219038    893.2995315    897.8321776
    901.6342016    907.0202143    909.5978241    916.3725586    924.3164678
    929.3802446    933.7197441    938.3166435    958.5481429    960.8437180
    966.1110668    967.0445302    978.7009026    980.3160658    990.1492997
    996.0981375   1000.3557658   1001.0150416   1008.1395820   1014.3731863
   1016.7490718   1024.5353143   1028.5152747   1031.2084216   1043.0047794
   1045.0151476   1049.5479542   1057.6543824   1061.5034532   1064.7933041
   1067.4856542   1074.2242515   1076.2803324   1087.1302841   1090.1842493
   1092.9321167   1100.1044830   1103.8162508   1106.1020867   1110.2415683
   1113.5171264   1118.7345602   1120.1982130   1124.5846481   1126.9459739
   1130.0937712   1131.9833966   1136.2334264   1139.8713778   1142.6655107
   1150.5522551

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1061
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    130

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9883E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.600    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.606    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.119    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   112.3    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    780 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997
 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
 1.00005 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00003 1.00003 1.00003 0.99998
 0.99999 1.00006 1.00001 0.99999 1.00001
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 0.99996 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00004 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996
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 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    19098 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997
 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
 1.00005 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002
 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 1.00003
 1.00001 1.00003 1.00003 1.00003 0.99998
 0.99999 1.00006 1.00001 0.99999 1.00001
 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 0.99996
 0.99996 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00004 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00002 0.99999 0.99995 0.99998 0.99999
 1.00001 0.99996 0.99998 0.99997 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2503180600413132399.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2503180600413132399.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2503180600413132399.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2503180600413132399.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    130
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    130
            Number of atoms found    =   1061
            Mean number per residue  =      8.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9883E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9986E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.600    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.606    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.119    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   112.3    

 Bfactors>  106 vectors,   3183 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     3.600000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.530 for    130 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.030 +/-   0.04
 Bfactors> =     15.959 +/-   5.01
 Bfactors> Shiftng-fct=     15.929
 Bfactors> Scaling-fct=    136.200

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2503180600413132399.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2503180600413132399.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4318E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4354E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   206.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   257.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   327.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   380.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   397.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   433.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   449.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   490.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   507.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   524.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   548.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   554.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   568.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   592.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   608.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   612.6    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1136.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1140.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1142.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1151.    

 Chkmod>  106 vectors,   3183 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1061 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    57 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    86 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    93 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   105 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7626
      0.0034      0.7441
      0.0034      0.8414
      0.0034      0.8806
      0.0034      0.8216
      0.0034      0.6920
    206.0288      0.4243
    257.1007      0.5041
    327.9067      0.4601
    380.2085      0.3683
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   1150.7117      0.4391
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2503180600413132399 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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2503180600413132399.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2503180600413132399.eigenfacs
2503180600413132399.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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2503180600413132399.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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2503180600413132399.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2503180600413132399.eigenfacs
2503180600413132399.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2503180600413132399.eigenfacs
2503180600413132399.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2503180600413132399.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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2503180600413132399.atom
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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2503180600413132399.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.262s
user	0m7.250s
sys	0m0.012s
rm: cannot remove '2503180600413132399.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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