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LOGs for ID: 2503042230092249439

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2503042230092249439.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2503042230092249439.atom to be opened. Openam> File opened: 2503042230092249439.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 358 First residue number = 1 Last residue number = 733 Number of atoms found = 2766 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -22.502674 +/- 14.442387 From: -60.043000 To: 8.441000 = 19.826457 +/- 10.988272 From: -10.767000 To: 46.098000 = -20.928342 +/- 11.274878 From: -52.247000 To: 6.776000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8121 % Filled. Pdbmat> 968264 non-zero elements. Pdbmat> 105757 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.47 +/- 21.84 Maximum number = 120 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 2.115140E+06 Pdbmat> Larger element = 499.651 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 358 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2503042230092249439.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2503042230092249439.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2503042230092249439.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2766 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 358 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 13 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 46 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 61 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 78 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 95 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 110 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 129 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 143 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 152 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 168 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 185 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 200 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 217 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 231 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 242 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 258 Blocpdb> 13 atoms in block 19 Block first atom: 270 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 283 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 295 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 310 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 325 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 340 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 355 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 371 Blocpdb> 15 atoms in block 27 Block first atom: 386 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 401 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 412 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 427 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 445 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 463 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 479 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 496 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 511 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 528 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 543 Blocpdb> 20 atoms in block 38 Block first atom: 560 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 580 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 596 Blocpdb> 18 atoms in block 41 Block first atom: 607 Blocpdb> 12 atoms in block 42 Block first atom: 625 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 637 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 653 Blocpdb> 23 atoms in block 45 Block first atom: 667 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 690 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 703 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 722 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 739 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 756 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 773 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 792 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 811 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 828 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 847 Blocpdb> 17 atoms in block 56 Block first atom: 865 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 882 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 899 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 915 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 934 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 944 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 960 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 973 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 986 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1002 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 1017 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1035 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1052 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1069 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1084 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1098 Blocpdb> 15 atoms in block 72 Block first atom: 1114 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1129 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1144 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1159 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1171 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1187 Blocpdb> 11 atoms in block 78 Block first atom: 1201 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1212 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1229 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1245 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1261 Blocpdb> 17 atoms in block 83 Block first atom: 1278 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1295 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1315 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1331 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 1350 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1369 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1383 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1398 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1412 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1428 Blocpdb> 12 atoms in block 93 Block first atom: 1440 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1452 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1465 Blocpdb> 13 atoms in block 96 Block first atom: 1480 Blocpdb> 13 atoms in block 97 Block first atom: 1493 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1506 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 1520 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1537 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1551 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1571 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1586 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1601 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 1616 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 1634 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1647 Blocpdb> 16 atoms in block 108 Block first atom: 1662 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1678 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1694 Blocpdb> 13 atoms in block 111 Block first atom: 1710 Blocpdb> 11 atoms in block 112 Block first atom: 1723 Blocpdb> 13 atoms in block 113 Block first atom: 1734 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1747 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1763 Blocpdb> 12 atoms in block 116 Block first atom: 1778 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1790 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1808 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1823 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1839 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1851 Blocpdb> 11 atoms in block 122 Block first atom: 1867 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1878 Blocpdb> 17 atoms in block 124 Block first atom: 1893 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 1910 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 1927 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1943 Blocpdb> 18 atoms in block 128 Block first atom: 1959 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 1977 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 1990 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 2005 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 2019 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 2038 Blocpdb> 16 atoms in block 134 Block first atom: 2059 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2075 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 2092 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2110 Blocpdb> 14 atoms in block 138 Block first atom: 2129 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2143 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 2156 Blocpdb> 11 atoms in block 141 Block first atom: 2175 Blocpdb> 21 atoms in block 142 Block first atom: 2186 Blocpdb> 13 atoms in block 143 Block first atom: 2207 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2220 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2238 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2254 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2273 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 2289 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2309 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2328 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2342 Blocpdb> 17 atoms in block 152 Block first atom: 2357 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2374 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 2390 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2409 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2424 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2437 Blocpdb> 21 atoms in block 158 Block first atom: 2451 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2472 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2486 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2502 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2520 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2533 Blocpdb> 8 atoms in block 164 Block first atom: 2547 Blocpdb> 10 atoms in block 165 Block first atom: 2555 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 2565 Blocpdb> 10 atoms in block 167 Block first atom: 2575 Blocpdb> 10 atoms in block 168 Block first atom: 2585 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2595 Blocpdb> 10 atoms in block 170 Block first atom: 2613 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2623 Blocpdb> 17 atoms in block 172 Block first atom: 2639 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 2656 Blocpdb> 13 atoms in block 174 Block first atom: 2669 Blocpdb> 11 atoms in block 175 Block first atom: 2682 Blocpdb> 17 atoms in block 176 Block first atom: 2693 Blocpdb> 13 atoms in block 177 Block first atom: 2710 Blocpdb> 17 atoms in block 178 Block first atom: 2723 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 2740 Blocpdb> 7 atoms in block 180 Block first atom: 2759 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 968444 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8298 Prepmat> Matrix trace = 2115140.0000 Prepmat> Last element read: 8298 8298 128.2480 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14416 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2766 RTB> Total mass = 2766.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2766 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 229489.1240 RTB> 64764 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64764 Diagstd> Projected matrix trace = 229489.1240 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 229489.1240 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5009999 0.9794576 1.5472858 1.6168547 1.9481377 2.1200435 2.8835775 3.1843849 3.7968635 4.1549666 4.6366433 5.2672102 5.6664318 6.0929941 6.4315753 6.7215254 7.4105256 7.6857278 8.8705549 9.4827883 9.7774838 10.0474141 10.5774579 10.9325924 11.4112284 11.8135339 12.8247353 12.9449405 13.9377254 14.3043054 14.9517179 15.4136088 15.8295116 16.5306617 17.0649482 17.7017868 18.0294251 18.1415092 18.5319933 19.1307013 19.9933372 20.3114357 21.1275364 21.5594776 22.5293265 22.7315956 23.6659340 24.1678971 24.8169134 25.4136342 25.8187027 27.1627410 27.3470551 28.1275443 28.4788714 28.9962922 29.1522245 29.7264723 30.0523608 30.8580767 31.8087786 32.4901947 32.7737670 33.6267994 34.3888437 35.2340251 35.3147874 35.6281721 36.3305017 36.8334526 37.1386866 37.5733127 38.2679317 38.4905487 39.0745488 39.7494242 40.3170807 40.5391098 41.0543495 41.3338102 42.4193879 42.6475291 42.7762434 43.4043209 43.8951601 44.3665092 44.6227416 45.1503028 45.5039134 45.9621330 46.3297370 47.0762293 47.3779556 48.0973806 48.6260907 49.1424784 49.8704478 50.3640734 51.2324178 51.8197655 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034326 0.0034328 0.0034329 0.0034338 0.0034340 76.8624286 107.4702128 135.0767325 138.0799988 151.5671565 158.1130304 184.4000746 193.7796003 211.5961557 221.3497563 233.8283284 249.2215564 258.4937886 268.0468208 275.3936739 281.5329316 295.6104532 301.0494100 323.4228304 334.3977208 339.5539852 344.2091658 353.1717306 359.0515931 366.8271565 373.2374346 388.8834721 390.7017085 405.4069892 410.7037496 419.8951208 426.3315244 432.0450543 441.5098525 448.5881193 456.8817743 461.0905482 462.5215659 467.4728006 474.9640356 485.5544357 489.4018324 499.1369367 504.2134158 515.4296350 517.7382380 528.2714074 533.8444256 540.9649943 547.4300935 551.7755966 565.9552285 567.8721403 575.9187115 579.5043061 584.7449959 586.3151689 592.0616991 595.2982106 603.2255208 612.4473743 618.9726179 621.6679259 629.7063128 636.8014837 644.5793820 645.3177012 648.1746634 654.5321414 659.0471633 661.7722481 665.6332740 671.7578888 673.7089730 678.8006761 684.6375286 689.5088093 691.4047899 695.7846890 698.1488075 707.2573654 709.1567116 710.2260564 715.4211303 719.4549401 723.3074031 725.3930747 729.6685262 732.5202830 736.1992455 739.1374335 745.0683495 747.4522241 753.1058007 757.2337426 761.2438689 766.8614639 770.6473769 777.2624840 781.7052019 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2766 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9795 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.617 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.184 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.722 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.82 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99994 1.00002 1.00002 1.00001 0.99994 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 49788 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99994 1.00002 1.00002 1.00001 0.99994 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99997 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99996 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2503042230092249439.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2503042230092249439.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2503042230092249439.atom Openam> file on opening on unit 11: 2503042230092249439.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 358 First residue number = 1 Last residue number = 733 Number of atoms found = 2766 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9795 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.617 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.184 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.722 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.777 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.82 Bfactors> 106 vectors, 8298 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.501000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.638 for 358 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.062 +/- 0.15 Bfactors> = 43.068 +/- 18.13 Bfactors> Shiftng-fct= 43.006 Bfactors> Scaling-fct= 120.088 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2503042230092249439.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2503042230092249439.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 2766 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 100 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2503042230092249439 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating 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MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2503042230092249439 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2503042230092249439.eigenfacs 2503042230092249439.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2503042230092249439.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2503042230092249439.10.pdb 2503042230092249439.11.pdb 2503042230092249439.7.pdb 2503042230092249439.8.pdb 2503042230092249439.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.241s user 0m21.189s sys 0m0.032s rm: cannot remove '2503042230092249439.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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