*** NMA_5D14 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 250302041030829887.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 250302041030829887.atom to be opened.
Openam> File opened: 250302041030829887.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 108
First residue number = 1
Last residue number = 38
Number of atoms found = 1209
Mean number per residue = 11.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 29.975880 +/- 9.489227 From: 0.951000 To: 59.675000
= 29.978534 +/- 6.879670 From: 2.889000 To: 60.430000
= 30.037846 +/- 6.428584 From: 0.168000 To: 54.232000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'SOD ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 40 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 10.6112 % Filled.
Pdbmat> 698154 non-zero elements.
Pdbmat> 76782 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 127.02 +/- 52.61
Maximum number = 240
Minimum number = 0
Pdbmat> Matrix trace = 1.535640E+06
Pdbmat> Larger element = 831.670
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
108 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 250302041030829887.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 250302041030829887.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
250302041030829887.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1209 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 108 residues.
Blocpdb> 24 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 15 atoms in block 2
Block first atom: 25
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 40
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 59
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 83
Blocpdb> 17 atoms in block 6
Block first atom: 93
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 110
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 120
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 161
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 175
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 196
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 207
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 229
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 243
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 263
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 280
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 294
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 316
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 336
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 355
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 377
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 392
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 411
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 435
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 451
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 470
Blocpdb> 11 atoms in block 28
Block first atom: 485
Blocpdb> 7 atoms in block 29
Block first atom: 496
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 503
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 517
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 534
Blocpdb> 10 atoms in block 33
Block first atom: 544
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 554
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 568
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 582
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 597
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 616
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 635
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 651
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 673
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 692
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 703
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 715
Blocpdb> 24 atoms in block 45
Block first atom: 722
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 746
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 761
Blocpdb> 10 atoms in block 48
Block first atom: 780
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 790
Blocpdb> 12 atoms in block 50
Block first atom: 809
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 821
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 835
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 857
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 872
Blocpdb> 24 atoms in block 55
Block first atom: 886
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 910
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 926
Blocpdb> 24 atoms in block 58
Block first atom: 943
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 967
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 983
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 999
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1014
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1036
Blocpdb> 19 atoms in block 64
Block first atom: 1056
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1075
Blocpdb> 24 atoms in block 66
Block first atom: 1097
Blocpdb> 10 atoms in block 67
Block first atom: 1121
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1131
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1146
Blocpdb> 12 atoms in block 70
Block first atom: 1160
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 71 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1172th, in residue 1
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 71 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1173th, in residue 2
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 71
Block first atom: 1172
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 72 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1175th, in residue 4
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 72 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1176th, in residue 5
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 72
Block first atom: 1175
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 73 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1178th, in residue 7
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 73 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1179th, in residue 8
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 73
Block first atom: 1178
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 74 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1181th, in residue 10
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 74 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1182th, in residue 11
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 74
Block first atom: 1181
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 75 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1184th, in residue 13
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 75 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1185th, in residue 14
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 75
Block first atom: 1184
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 76 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1187th, in residue 16
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 76 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1188th, in residue 17
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 76
Block first atom: 1187
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 77 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1190th, in residue 19
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 77 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1191th, in residue 20
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 77
Block first atom: 1190
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 78 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1193th, in residue 22
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 78 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1194th, in residue 23
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 1193
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 79 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1196th, in residue 25
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 79 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1197th, in residue 26
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 79
Block first atom: 1196
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 80 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1199th, in residue 28
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 80 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1200th, in residue 29
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 80
Block first atom: 1199
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 81 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1202th, in residue 31
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 81 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1203th, in residue 32
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 81
Block first atom: 1202
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 82 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1205th, in residue 34
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 82 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1206th, in residue 35
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 82
Block first atom: 1205
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 83 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 1209th, in residue 38
%Blocpdb-Wn> It is merged with last block.
Blocpdb> 82 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 698236 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3627
Prepmat> Matrix trace = 1535640.0000
Prepmat> Last element read: 3627 3627 16.2990
Prepmat> 3404 lines saved.
Prepmat> 2542 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1209
RTB> Total mass = 1209.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1209
RTB> Number of blocks = 82
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 164493.3871
RTB> 29766 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 492
Diagstd> Nb of non-zero elements: 29766
Diagstd> Projected matrix trace = 164493.3871
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 492 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 164493.3871
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 40 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0088054 0.0141946 0.0434410 0.1495012 0.1834525
0.5945612 0.6518100 1.0394871 1.4319387 2.7563707
3.6451487 4.0568786 4.6019833 5.0089729 5.5039321
7.0094477 8.3597275 8.9693513 10.3474340 10.6573269
11.2739898 11.8363705 12.1567600 13.0311121 14.9297505
15.2912188 15.3799897 17.1106617 17.1533585 19.0810044
19.9354762 20.6444554 22.1866527 23.2688227 23.9474734
25.4638754 27.1982852 28.1709644 31.0858466 33.7978172
35.8639833 37.6194712 38.5191029 41.2157676 43.0026470
43.8992453 45.4661133 47.1910869 48.6973480 49.7937549
50.2767604 53.0257369 56.4980227 59.3860264 61.4255454
63.5296568 65.9192776 67.6601116 68.9039637 72.8447524
74.3790523 77.8961169 78.9281495 82.5603520 83.8906475
88.7295187
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034295 0.0034299 0.0034306 0.0034316 0.0034321
0.0034326 0.0034328 0.0034329 0.0034330 0.0034330
0.0034331 0.0034332 0.0034333 0.0034333 0.0034334
0.0034335 0.0034335 0.0034337 0.0034338 0.0034338
0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034341
0.0034341 0.0034342 0.0034342 0.0034343 0.0034344
0.0034344 0.0034345 0.0034345 0.0034346 0.0034346
0.0034347 0.0034348 0.0034349 0.0034350 0.0034351
10.1899105 12.9377042 22.6331679 41.9872715 46.5111524
83.7324034 87.6709638 110.7145844 129.9443779 180.2868664
207.3255865 218.7214041 232.9527279 243.0354480 254.7603358
287.4995576 313.9723047 325.2189156 349.3104771 354.5025996
364.6146378 373.5980113 378.6205666 391.9999577 419.5865472
424.6355325 425.8663279 449.1885552 449.7486438 474.3467143
484.8513256 493.3975575 511.4947410 523.8204935 531.4043808
547.9709434 566.3254023 576.3630587 605.4476950 631.3055493
650.3161542 666.0420112 673.9588215 697.1511953 712.1030973
719.4884178 732.2159676 745.9767129 757.7883699 766.2715805
769.9790758 790.7489728 816.2287815 836.8303328 851.0788359
865.5328088 881.6607351 893.2265740 901.3996458 926.8179066
936.5276426 958.4140785 964.7421218 986.6907306 994.6082411
1022.8909663
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1209
Rtb_to_modes> Number of blocs = 82
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9743E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9762E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9805E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9864E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9890E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.8054E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4195E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3441E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1495
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1835
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5946
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6518
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.039
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.432
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.756
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.645
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.057
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.602
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.969
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.73
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 492 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997
1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003
1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00005 1.00006 0.99997
0.99999 1.00004 1.00002 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999
0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00004 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00005
1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997
0.99997 1.00003 0.99999 0.99996 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998
0.99996 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998
1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00004 0.99998 0.99996 0.99999
1.00004 1.00005 1.00002 1.00002 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 21762 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997
1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003
1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00005 1.00006 0.99997
0.99999 1.00004 1.00002 0.99996 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999
0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00004 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00005
1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997
0.99997 1.00003 0.99999 0.99996 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998
0.99996 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998
1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00004 0.99998 0.99996 0.99999
1.00004 1.00005 1.00002 1.00002 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 250302041030829887.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
250302041030829887.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 250302041030829887.atom
Openam> file on opening on unit 11:
250302041030829887.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 108
First residue number = 1
Last residue number = 38
Number of atoms found = 1209
Mean number per residue = 11.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9743E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9762E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9805E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9890E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.8054E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4195E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3441E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1495
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1835
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.432
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.645
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.504
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.73
Bfactors> 106 vectors, 3627 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 40 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.008805
Bfactors> 66 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.058 +/- 0.04
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.058
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 250302041030829887.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
250302041030829887.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4297E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Chkmod> 106 vectors, 3627 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1209 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 5 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 40 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 49 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 66 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.0276
0.0034 0.6298
0.0034 0.0148
0.0034 0.0221
0.0034 0.0511
0.0034 0.0440
0.0034 0.0190
0.0034 0.0263
0.0034 0.0313
0.0034 0.0331
0.0034 0.0275
0.0034 0.0206
0.0034 0.0407
0.0034 0.0323
0.0034 0.0399
0.0034 0.1071
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m2.563s
user 0m2.527s
sys 0m0.036s
rm: cannot remove '250302041030829887.sdijf': No such file or directory
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