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***  MSH2  ***

LOGs for ID: 2502220316173414144

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2502220316173414144.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2502220316173414144.atom to be opened. Openam> File opened: 2502220316173414144.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 934 First residue number = 1 Last residue number = 934 Number of atoms found = 7356 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.843616 +/- 28.564449 From: -51.440000 To: 69.229000 = -3.165958 +/- 15.576266 From: -50.274000 To: 35.501000 = 1.915159 +/- 18.432422 From: -37.734000 To: 57.573000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0783 % Filled. Pdbmat> 2625737 non-zero elements. Pdbmat> 286894 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.00 +/- 23.31 Maximum number = 128 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.737880E+06 Pdbmat> Larger element = 501.033 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 934 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2502220316173414144.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2502220316173414144.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2502220316173414144.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7356 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 934 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 42 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 33 atoms in block 3 Block first atom: 79 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 112 Blocpdb> 46 atoms in block 5 Block first atom: 150 Blocpdb> 40 atoms in block 6 Block first atom: 196 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 236 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 275 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 317 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 360 Blocpdb> 37 atoms in block 11 Block first atom: 396 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 433 Blocpdb> 37 atoms in block 13 Block first atom: 476 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 513 Blocpdb> 34 atoms in block 15 Block first atom: 549 Blocpdb> 37 atoms in block 16 Block first atom: 583 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 620 Blocpdb> 42 atoms in block 18 Block first atom: 662 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 704 Blocpdb> 50 atoms in block 20 Block first atom: 743 Blocpdb> 45 atoms in block 21 Block first atom: 793 Blocpdb> 37 atoms in block 22 Block first atom: 838 Blocpdb> 37 atoms in block 23 Block first atom: 875 Blocpdb> 47 atoms in block 24 Block first atom: 912 Blocpdb> 39 atoms in block 25 Block first atom: 959 Blocpdb> 35 atoms in block 26 Block first atom: 998 Blocpdb> 44 atoms in block 27 Block first atom: 1033 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 1077 Blocpdb> 33 atoms in block 29 Block first atom: 1116 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 1149 Blocpdb> 35 atoms in block 31 Block first atom: 1178 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1213 Blocpdb> 34 atoms in block 33 Block first atom: 1254 Blocpdb> 38 atoms in block 34 Block first atom: 1288 Blocpdb> 40 atoms in block 35 Block first atom: 1326 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1366 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1407 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1449 Blocpdb> 37 atoms in block 39 Block first atom: 1487 Blocpdb> 38 atoms in block 40 Block first atom: 1524 Blocpdb> 32 atoms in block 41 Block first atom: 1562 Blocpdb> 32 atoms in block 42 Block first atom: 1594 Blocpdb> 41 atoms in block 43 Block first atom: 1626 Blocpdb> 40 atoms in block 44 Block first atom: 1667 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1707 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 1742 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 1785 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 1826 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 1871 Blocpdb> 35 atoms in block 50 Block first atom: 1914 Blocpdb> 40 atoms in block 51 Block first atom: 1949 Blocpdb> 36 atoms in block 52 Block first atom: 1989 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2025 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 2066 Blocpdb> 35 atoms in block 55 Block first atom: 2098 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2133 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 2177 Blocpdb> 44 atoms in block 58 Block first atom: 2213 Blocpdb> 41 atoms in block 59 Block first atom: 2257 Blocpdb> 46 atoms in block 60 Block first atom: 2298 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2344 Blocpdb> 36 atoms in block 62 Block first atom: 2382 Blocpdb> 40 atoms in block 63 Block first atom: 2418 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2458 Blocpdb> 32 atoms in block 65 Block first atom: 2495 Blocpdb> 34 atoms in block 66 Block first atom: 2527 Blocpdb> 39 atoms in block 67 Block first atom: 2561 Blocpdb> 40 atoms in block 68 Block first atom: 2600 Blocpdb> 46 atoms in block 69 Block first atom: 2640 Blocpdb> 41 atoms in block 70 Block first atom: 2686 Blocpdb> 44 atoms in block 71 Block first atom: 2727 Blocpdb> 45 atoms in block 72 Block first atom: 2771 Blocpdb> 37 atoms in block 73 Block first atom: 2816 Blocpdb> 40 atoms in block 74 Block first atom: 2853 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 2893 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 2937 Blocpdb> 48 atoms in block 77 Block first atom: 2979 Blocpdb> 43 atoms in block 78 Block first atom: 3027 Blocpdb> 43 atoms in block 79 Block first atom: 3070 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 3113 Blocpdb> 43 atoms in block 81 Block first atom: 3151 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3194 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 3238 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3278 Blocpdb> 45 atoms in block 85 Block first atom: 3315 Blocpdb> 41 atoms in block 86 Block first atom: 3360 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 3401 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 3437 Blocpdb> 40 atoms in block 89 Block first atom: 3477 Blocpdb> 45 atoms in block 90 Block first atom: 3517 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 3562 Blocpdb> 38 atoms in block 92 Block first atom: 3605 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 3643 Blocpdb> 45 atoms in block 94 Block first atom: 3684 Blocpdb> 41 atoms in block 95 Block first atom: 3729 Blocpdb> 38 atoms in block 96 Block first atom: 3770 Blocpdb> 44 atoms in block 97 Block first atom: 3808 Blocpdb> 42 atoms in block 98 Block first atom: 3852 Blocpdb> 39 atoms in block 99 Block first atom: 3894 Blocpdb> 32 atoms in block 100 Block first atom: 3933 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 3965 Blocpdb> 37 atoms in block 102 Block first atom: 4004 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 4041 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 4080 Blocpdb> 53 atoms in block 105 Block first atom: 4115 Blocpdb> 40 atoms in block 106 Block first atom: 4168 Blocpdb> 43 atoms in block 107 Block first atom: 4208 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 4251 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 4293 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4332 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 4369 Blocpdb> 37 atoms in block 112 Block first atom: 4410 Blocpdb> 46 atoms in block 113 Block first atom: 4447 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 4493 Blocpdb> 40 atoms in block 115 Block first atom: 4538 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 4578 Blocpdb> 37 atoms in block 117 Block first atom: 4616 Blocpdb> 38 atoms in block 118 Block first atom: 4653 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 4691 Blocpdb> 36 atoms in block 120 Block first atom: 4730 Blocpdb> 37 atoms in block 121 Block first atom: 4766 Blocpdb> 39 atoms in block 122 Block first atom: 4803 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 4842 Blocpdb> 40 atoms in block 124 Block first atom: 4872 Blocpdb> 39 atoms in block 125 Block first atom: 4912 Blocpdb> 35 atoms in block 126 Block first atom: 4951 Blocpdb> 44 atoms in block 127 Block first atom: 4986 Blocpdb> 37 atoms in block 128 Block first atom: 5030 Blocpdb> 38 atoms in block 129 Block first atom: 5067 Blocpdb> 41 atoms in block 130 Block first atom: 5105 Blocpdb> 38 atoms in block 131 Block first atom: 5146 Blocpdb> 49 atoms in block 132 Block first atom: 5184 Blocpdb> 47 atoms in block 133 Block first atom: 5233 Blocpdb> 34 atoms in block 134 Block first atom: 5280 Blocpdb> 33 atoms in block 135 Block first atom: 5314 Blocpdb> 44 atoms in block 136 Block first atom: 5347 Blocpdb> 35 atoms in block 137 Block first atom: 5391 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5426 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 5463 Blocpdb> 33 atoms in block 140 Block first atom: 5499 Blocpdb> 37 atoms in block 141 Block first atom: 5532 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 5569 Blocpdb> 31 atoms in block 143 Block first atom: 5604 Blocpdb> 40 atoms in block 144 Block first atom: 5635 Blocpdb> 35 atoms in block 145 Block first atom: 5675 Blocpdb> 38 atoms in block 146 Block first atom: 5710 Blocpdb> 35 atoms in block 147 Block first atom: 5748 Blocpdb> 37 atoms in block 148 Block first atom: 5783 Blocpdb> 39 atoms in block 149 Block first atom: 5820 Blocpdb> 41 atoms in block 150 Block first atom: 5859 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 5900 Blocpdb> 42 atoms in block 152 Block first atom: 5932 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 5974 Blocpdb> 43 atoms in block 154 Block first atom: 6010 Blocpdb> 33 atoms in block 155 Block first atom: 6053 Blocpdb> 41 atoms in block 156 Block first atom: 6086 Blocpdb> 43 atoms in block 157 Block first atom: 6127 Blocpdb> 37 atoms in block 158 Block first atom: 6170 Blocpdb> 37 atoms in block 159 Block first atom: 6207 Blocpdb> 38 atoms in block 160 Block first atom: 6244 Blocpdb> 37 atoms in block 161 Block first atom: 6282 Blocpdb> 39 atoms in block 162 Block first atom: 6319 Blocpdb> 43 atoms in block 163 Block first atom: 6358 Blocpdb> 38 atoms in block 164 Block first atom: 6401 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 6439 Blocpdb> 40 atoms in block 166 Block first atom: 6475 Blocpdb> 35 atoms in block 167 Block first atom: 6515 Blocpdb> 44 atoms in block 168 Block first atom: 6550 Blocpdb> 37 atoms in block 169 Block first atom: 6594 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 6631 Blocpdb> 46 atoms in block 171 Block first atom: 6671 Blocpdb> 39 atoms in block 172 Block first atom: 6717 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 6756 Blocpdb> 34 atoms in block 174 Block first atom: 6797 Blocpdb> 44 atoms in block 175 Block first atom: 6831 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 6875 Blocpdb> 43 atoms in block 177 Block first atom: 6917 Blocpdb> 43 atoms in block 178 Block first atom: 6960 Blocpdb> 40 atoms in block 179 Block first atom: 7003 Blocpdb> 41 atoms in block 180 Block first atom: 7043 Blocpdb> 41 atoms in block 181 Block first atom: 7084 Blocpdb> 43 atoms in block 182 Block first atom: 7125 Blocpdb> 38 atoms in block 183 Block first atom: 7168 Blocpdb> 38 atoms in block 184 Block first atom: 7206 Blocpdb> 41 atoms in block 185 Block first atom: 7244 Blocpdb> 41 atoms in block 186 Block first atom: 7285 Blocpdb> 31 atoms in block 187 Block first atom: 7325 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2625924 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22068 Prepmat> Matrix trace = 5737880.0000 Prepmat> Last element read: 22068 22068 80.9564 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 16045 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7356 RTB> Total mass = 7356.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7356 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 196541.7237 RTB> 52383 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52383 Diagstd> Projected matrix trace = 196541.7237 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 196541.7237 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0372058 0.0544069 0.0771727 0.0862054 0.1852061 0.3113657 0.3498076 0.4210357 0.5102657 0.7001002 0.7215852 0.9264707 1.0254172 1.0875191 1.3994842 1.4637976 1.5174351 1.7877817 2.1864378 2.3801437 2.3986635 3.0095339 3.3098318 3.4138232 3.5166079 3.5424247 3.9517473 4.1733789 4.5032832 4.8839064 5.0086923 5.2221634 5.5164908 5.9018073 6.2258302 6.3536221 6.7272363 7.1231770 7.3738432 7.7004483 7.9306001 8.1213786 8.4351610 8.8819247 9.3313424 9.6341928 9.8770450 10.0906647 10.3272375 10.7802497 11.3725627 12.0218300 12.3715335 12.6016596 13.1016997 13.4114574 13.4782288 13.6391409 13.9431314 14.6445791 15.2333917 15.9346564 16.1343623 16.5434440 16.8330864 17.3803993 17.6977695 18.0050619 18.1425741 18.3503893 18.6031232 19.0875645 20.1868607 20.3550887 20.5216747 20.6066591 21.1195449 21.2696041 21.6166710 22.1656578 22.3395934 22.9969849 23.0523693 23.5609371 23.9514083 24.8639307 25.2162828 25.6360269 25.9830189 26.1196964 26.5595927 27.2053992 27.3408462 27.4518507 27.8267156 28.1732033 28.7239946 28.8437600 29.1014470 29.4901596 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034327 0.0034334 0.0034339 0.0034344 0.0034358 20.9459671 25.3292417 30.1666492 31.8832503 46.7329210 60.5941463 64.2258581 70.4619645 77.5699416 90.8605567 92.2442060 104.5228221 109.9627492 113.2436164 128.4633602 131.3819771 133.7674186 145.1952896 160.5697907 167.5316530 168.1821662 188.3843846 197.5596462 200.6392034 203.6372642 204.3833871 215.8687941 221.8396584 230.4410841 239.9821526 243.0286404 248.1535600 255.0508230 263.8078987 270.9529706 273.7196474 281.6525072 289.8225325 294.8779029 301.3375726 305.8076224 309.4640176 315.3856784 323.6300378 331.7167061 337.0566865 341.2783951 344.9492205 348.9694130 356.5411747 366.2051526 376.5135161 381.9504689 385.4864817 393.0602272 397.6795585 398.6682894 401.0410128 405.4856037 415.5599903 423.8318446 433.4775718 436.1854580 441.6805180 445.5302096 452.7152825 456.8299272 460.7789060 462.5351402 465.1766659 468.3690738 474.4282474 487.8987142 489.9274581 491.9281552 492.9456901 499.0425288 500.8122968 504.8817670 511.2526736 513.2546735 520.7517409 521.3784355 527.0982325 531.4480377 541.4771986 545.3003970 549.8201348 553.5286249 554.9825683 559.6364405 566.3994616 567.8076721 568.9591608 572.8306602 576.3859623 581.9929165 583.2049712 585.8043231 589.7036850 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7356 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7206E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4407E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7173E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6205E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.399 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.399 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.310 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.331 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.49 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99996 0.99997 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99995 1.00004 0.99999 0.99996 0.99998 1.00003 0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 132408 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99996 0.99997 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99995 1.00004 0.99999 0.99996 0.99998 1.00003 0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502220316173414144.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502220316173414144.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2502220316173414144.atom Openam> file on opening on unit 11: 2502220316173414144.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 934 First residue number = 1 Last residue number = 934 Number of atoms found = 7356 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7206E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4407E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7173E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6205E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.399 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.399 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.310 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.331 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.49 Bfactors> 106 vectors, 22068 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.037206 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.259 for 934 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.208 +/- 0.40 Bfactors> = 84.126 +/- 13.25 Bfactors> Shiftng-fct= 83.917 Bfactors> Scaling-fct= 33.146 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502220316173414144.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502220316173414144.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4 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vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.7 Chkmod> 106 vectors, 22068 coordinates in file. Chkmod> That is: 7356 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6642 0.0034 0.6791 0.0034 0.9266 0.0034 0.6827 0.0034 0.9671 0.0034 0.9597 20.9451 0.2141 25.3282 0.3102 30.1654 0.2765 31.8818 0.2431 46.7301 0.2564 60.5949 0.4216 64.2224 0.2459 70.4560 0.3851 77.5692 0.3212 90.8566 0.5376 92.2412 0.0291 104.5200 0.2597 109.9357 0.1301 113.2638 0.2677 128.4356 0.2516 131.3854 0.1155 133.7425 0.4552 145.1979 0.0993 160.5468 0.3782 167.5194 0.5020 168.1867 0.2800 188.3909 0.4800 197.5562 0.1083 200.6358 0.0780 203.6399 0.2105 204.3624 0.3894 215.8664 0.1860 221.8201 0.4444 230.4239 0.3268 239.9742 0.4609 243.0257 0.3570 248.1390 0.3298 255.0285 0.3040 263.8009 0.3780 270.9450 0.4150 273.7160 0.4152 281.6355 0.3585 289.8065 0.3334 294.8684 0.4170 301.3159 0.3856 305.8022 0.1735 309.4435 0.1403 315.3691 0.2719 323.6175 0.0682 331.6964 0.4177 337.0388 0.2915 341.2630 0.3487 344.9231 0.1932 349.0011 0.3464 356.5217 0.2596 366.1482 0.3580 376.4687 0.1337 381.9104 0.3342 385.4445 0.4853 393.0179 0.4676 397.6409 0.2231 398.6774 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2502220316173414144 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2502220316173414144 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502220316173414144.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502220316173414144.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2502220316173414144 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502220316173414144.eigenfacs 2502220316173414144.atom making animated gifs 11 models are in 2502220316173414144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502220316173414144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502220316173414144.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2502220316173414144.10.pdb 2502220316173414144.11.pdb 2502220316173414144.7.pdb 2502220316173414144.8.pdb 2502220316173414144.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m36.390s user 0m36.265s sys 0m0.104s rm: cannot remove '2502220316173414144.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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