***  12345  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2502191555212884508.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2502191555212884508.atom to be opened.
Openam> File opened: 2502191555212884508.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 165
First residue number = 1
Last residue number = 165
Number of atoms found = 1297
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.182089 +/- 9.349317 From: -26.771000 To: 16.822000
= 10.416835 +/- 7.610207 From: -5.786000 To: 30.688000
= -13.673703 +/- 8.161171 From: -32.068000 To: 4.190000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 6.4109 % Filled.
Pdbmat> 485426 non-zero elements.
Pdbmat> 53081 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.85 +/- 23.87
Maximum number = 135
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.061620E+06
Pdbmat> Larger element = 532.160
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
165 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2502191555212884508.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2502191555212884508.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2502191555212884508.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1297 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 165 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 16
Blocpdb> 7 atoms in block 4
Block first atom: 24
Blocpdb> 7 atoms in block 5
Block first atom: 31
Blocpdb> 7 atoms in block 6
Block first atom: 38
Blocpdb> 11 atoms in block 7
Block first atom: 45
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 67
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 75
Blocpdb> 5 atoms in block 11
Block first atom: 83
Blocpdb> 7 atoms in block 12
Block first atom: 88
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 95
Blocpdb> 4 atoms in block 14
Block first atom: 103
Blocpdb> 9 atoms in block 15
Block first atom: 107
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 116
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 123
Blocpdb> 4 atoms in block 18
Block first atom: 131
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 135
Blocpdb> 7 atoms in block 20
Block first atom: 146
Blocpdb> 6 atoms in block 21
Block first atom: 153
Blocpdb> 11 atoms in block 22
Block first atom: 159
Blocpdb> 9 atoms in block 23
Block first atom: 170
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 179
Blocpdb> 11 atoms in block 25
Block first atom: 187
Blocpdb> 5 atoms in block 26
Block first atom: 198
Blocpdb> 8 atoms in block 27
Block first atom: 203
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 211
Blocpdb> 7 atoms in block 29
Block first atom: 220
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 227
Blocpdb> 9 atoms in block 31
Block first atom: 234
Blocpdb> 7 atoms in block 32
Block first atom: 243
Blocpdb> 5 atoms in block 33
Block first atom: 250
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 255
Blocpdb> 8 atoms in block 35
Block first atom: 264
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 272
Blocpdb> 11 atoms in block 37
Block first atom: 283
Blocpdb> 5 atoms in block 38
Block first atom: 294
Blocpdb> 8 atoms in block 39
Block first atom: 299
Blocpdb> 6 atoms in block 40
Block first atom: 307
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 313
Blocpdb> 4 atoms in block 42
Block first atom: 320
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 324
Blocpdb> 9 atoms in block 44
Block first atom: 333
Blocpdb> 4 atoms in block 45
Block first atom: 342
Blocpdb> 11 atoms in block 46
Block first atom: 346
Blocpdb> 4 atoms in block 47
Block first atom: 357
Blocpdb> 12 atoms in block 48
Block first atom: 361
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 373
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 382
Blocpdb> 6 atoms in block 51
Block first atom: 386
Blocpdb> 9 atoms in block 52
Block first atom: 392
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 401
Blocpdb> 10 atoms in block 54
Block first atom: 412
Blocpdb> 11 atoms in block 55
Block first atom: 422
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 433
Blocpdb> 8 atoms in block 57
Block first atom: 441
Blocpdb> 7 atoms in block 58
Block first atom: 449
Blocpdb> 4 atoms in block 59
Block first atom: 456
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 460
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 471
Blocpdb> 6 atoms in block 62
Block first atom: 479
Blocpdb> 9 atoms in block 63
Block first atom: 485
Blocpdb> 4 atoms in block 64
Block first atom: 494
Blocpdb> 4 atoms in block 65
Block first atom: 498
Blocpdb> 8 atoms in block 66
Block first atom: 502
Blocpdb> 11 atoms in block 67
Block first atom: 510
Blocpdb> 7 atoms in block 68
Block first atom: 521
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 528
Blocpdb> 10 atoms in block 70
Block first atom: 547
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 557
Blocpdb> 4 atoms in block 72
Block first atom: 565
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 569
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 576
Blocpdb> 4 atoms in block 75
Block first atom: 580
Blocpdb> 9 atoms in block 76
Block first atom: 584
Blocpdb> 6 atoms in block 77
Block first atom: 593
Blocpdb> 8 atoms in block 78
Block first atom: 599
Blocpdb> 12 atoms in block 79
Block first atom: 607
Blocpdb> 4 atoms in block 80
Block first atom: 619
Blocpdb> 9 atoms in block 81
Block first atom: 623
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 632
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 647
Blocpdb> 9 atoms in block 84
Block first atom: 658
Blocpdb> 8 atoms in block 85
Block first atom: 667
Blocpdb> 9 atoms in block 86
Block first atom: 675
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 684
Blocpdb> 11 atoms in block 88
Block first atom: 692
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 703
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 711
Blocpdb> 9 atoms in block 91
Block first atom: 719
Blocpdb> 10 atoms in block 92
Block first atom: 728
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 738
Blocpdb> 4 atoms in block 94
Block first atom: 745
Blocpdb> 7 atoms in block 95
Block first atom: 749
Blocpdb> 4 atoms in block 96
Block first atom: 756
Blocpdb> 8 atoms in block 97
Block first atom: 760
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 768
Blocpdb> 6 atoms in block 99
Block first atom: 776
Blocpdb> 8 atoms in block 100
Block first atom: 782
Blocpdb> 5 atoms in block 101
Block first atom: 790
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 795
Blocpdb> 5 atoms in block 103
Block first atom: 803
Blocpdb> 4 atoms in block 104
Block first atom: 808
Blocpdb> 7 atoms in block 105
Block first atom: 812
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 819
Blocpdb> 7 atoms in block 107
Block first atom: 827
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 834
Blocpdb> 4 atoms in block 109
Block first atom: 842
Blocpdb> 6 atoms in block 110
Block first atom: 846
Blocpdb> 9 atoms in block 111
Block first atom: 852
Blocpdb> 11 atoms in block 112
Block first atom: 861
Blocpdb> 11 atoms in block 113
Block first atom: 872
Blocpdb> 8 atoms in block 114
Block first atom: 883
Blocpdb> 6 atoms in block 115
Block first atom: 891
Blocpdb> 7 atoms in block 116
Block first atom: 897
Blocpdb> 5 atoms in block 117
Block first atom: 904
Blocpdb> 9 atoms in block 118
Block first atom: 909
Blocpdb> 7 atoms in block 119
Block first atom: 918
Blocpdb> 9 atoms in block 120
Block first atom: 925
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 934
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 948
Blocpdb> 8 atoms in block 123
Block first atom: 956
Blocpdb> 4 atoms in block 124
Block first atom: 964
Blocpdb> 9 atoms in block 125
Block first atom: 968
Blocpdb> 10 atoms in block 126
Block first atom: 977
Blocpdb> 7 atoms in block 127
Block first atom: 987
Blocpdb> 7 atoms in block 128
Block first atom: 994
Blocpdb> 11 atoms in block 129
Block first atom: 1001
Blocpdb> 4 atoms in block 130
Block first atom: 1012
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1016
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 1025
Blocpdb> 9 atoms in block 133
Block first atom: 1032
Blocpdb> 9 atoms in block 134
Block first atom: 1041
Blocpdb> 4 atoms in block 135
Block first atom: 1050
Blocpdb> 8 atoms in block 136
Block first atom: 1054
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1062
Blocpdb> 8 atoms in block 138
Block first atom: 1070
Blocpdb> 7 atoms in block 139
Block first atom: 1078
Blocpdb> 9 atoms in block 140
Block first atom: 1085
Blocpdb> 5 atoms in block 141
Block first atom: 1094
Blocpdb> 8 atoms in block 142
Block first atom: 1099
Blocpdb> 9 atoms in block 143
Block first atom: 1107
Blocpdb> 19 atoms in block 144
Block first atom: 1116
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 1135
Blocpdb> 4 atoms in block 146
Block first atom: 1146
Blocpdb> 6 atoms in block 147
Block first atom: 1150
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 1156
Blocpdb> 8 atoms in block 149
Block first atom: 1167
Blocpdb> 4 atoms in block 150
Block first atom: 1175
Blocpdb> 15 atoms in block 151
Block first atom: 1179
Blocpdb> 7 atoms in block 152
Block first atom: 1194
Blocpdb> 6 atoms in block 153
Block first atom: 1201
Blocpdb> 9 atoms in block 154
Block first atom: 1207
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 1216
Blocpdb> 8 atoms in block 156
Block first atom: 1225
Blocpdb> 7 atoms in block 157
Block first atom: 1233
Blocpdb> 8 atoms in block 158
Block first atom: 1240
Blocpdb> 5 atoms in block 159
Block first atom: 1248
Blocpdb> 8 atoms in block 160
Block first atom: 1253
Blocpdb> 6 atoms in block 161
Block first atom: 1261
Blocpdb> 4 atoms in block 162
Block first atom: 1267
Blocpdb> 9 atoms in block 163
Block first atom: 1271
Blocpdb> 8 atoms in block 164
Block first atom: 1280
Blocpdb> 10 atoms in block 165
Block first atom: 1287
Blocpdb> 165 blocks.
Blocpdb> At most, 19 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 485591 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3891
Prepmat> Matrix trace = 1061620.0000
Prepmat> Last element read: 3891 3891 102.4036
Prepmat> 13696 lines saved.
Prepmat> 11518 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1297
RTB> Total mass = 1297.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1297
RTB> Number of blocks = 165
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 252241.4132
RTB> 75897 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 990
Diagstd> Nb of non-zero elements: 75897
Diagstd> Projected matrix trace = 252241.4132
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 990 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 252241.4132
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.9571466 4.5576442 7.3889491 7.9979621
10.5650969 12.0707043 12.5171306 13.8934135 15.5823974
15.8660204 17.5250071 18.7439766 19.0610513 20.5237927
21.7977607 22.0689787 22.6109752 23.3727713 25.2105200
25.7357809 26.7784397 27.7321086 29.1114338 30.4336323
30.8556702 31.8314108 32.1843456 33.1163566 35.2069518
36.3022884 36.5981020 37.6136339 39.2644327 40.8321962
41.9789866 43.4539552 44.0676105 45.0242713 45.8824217
48.0006357 48.6822568 48.7227867 49.5428078 51.2745877
51.4473890 53.1782196 54.6241705 55.7691272 56.1200856
57.6601669 57.9970323 58.9183466 60.3733148 61.3908747
61.8753193 62.3948775 63.6752030 64.4012932 65.4502202
66.7097220 66.8944961 68.0841526 68.7856247 70.7343243
71.9752137 72.6810184 72.9433298 74.5312469 75.6232612
77.3641643 77.6951204 79.1361610 81.3052808 81.6764866
81.7722632 82.7602836 83.6770236 85.2089428 85.6508698
86.6092835 86.9211693 88.3732996 89.2271885 89.3498076
89.7250545 90.2272661 91.2109729 91.4406719 91.7187516
92.7588465 93.9164180 94.9690857 95.3768503 96.5993004
97.2670192 97.3291737 98.4764468 98.9138324 99.7328847
101.0367047
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034335 0.0034341 0.0034342 0.0034349
0.0034357 151.9172026 231.8277860 295.1797884 307.1036317
352.9653085 377.2780906 384.1914288 404.7620257 428.6594651
432.5429962 454.5947139 470.1388564 474.0986350 491.9535401
506.9921335 510.1364993 516.3627767 524.9892189 545.2380827
550.8888164 561.9373697 571.8560578 585.9048303 599.0625551
603.2019993 612.6652155 616.0523550 624.9086780 644.3316926
654.2779458 656.9382694 665.9903353 680.4480026 693.8996209
703.5763867 715.8300679 720.8668121 728.6494251 735.5605799
752.3480069 757.6709424 757.9862722 764.3382409 777.5823046
778.8914738 791.8851098 802.5788447 810.9465010 813.4941659
824.5808183 826.9860162 833.5286953 843.7577813 850.8386126
854.1890635 857.7678183 866.5237077 871.4502007 878.5183481
886.9310227 888.1584942 896.0212276 900.6252590 913.2935382
921.2696447 925.7757113 927.4448045 937.4853155 944.3282484
955.1359672 957.1767746 966.0125519 979.1622405 981.3949170
981.9701568 987.8847139 993.3410705 1002.3926388 1004.9886780
1010.5958332 1012.4138095 1020.8356201 1025.7555720 1026.4601443
1028.6133243 1031.4879990 1037.0956782 1038.4007293 1039.9784682
1045.8585472 1052.3641387 1058.2454471 1060.5148847 1067.2895834
1070.9719192 1071.3140444 1077.6096338 1080.0000976 1084.4623297
1091.5279655
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1297
Rtb_to_modes> Number of blocs = 165
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.957
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.998
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 990 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99997 1.00004 1.00002 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99995
0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 23346 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99997 1.00004 1.00002 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99995
0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998
0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2502191555212884508.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2502191555212884508.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2502191555212884508.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2502191555212884508.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 165
First residue number = 1
Last residue number = 165
Number of atoms found = 1297
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.957
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.998
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0
Bfactors> 106 vectors, 3891 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.957000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.750 for 170 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.028 +/- 0.07
Bfactors> = 14.928 +/- 6.44
Bfactors> Shiftng-fct= 14.900
Bfactors> Scaling-fct= 90.612
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2502191555212884508.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2502191555212884508.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Chkmod> 106 vectors, 3891 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1297 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 82 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9934
0.0034 0.8302
0.0034 0.9510
0.0034 0.7149
0.0034 0.7591
0.0034 0.8019
151.9050 0.0087
231.8269 0.0070
295.1681 0.3575
307.0912 0.3992
353.0320 0.3928
377.2509 0.0783
384.2190 0.1469
404.6949 0.0263
428.6081 0.3197
432.5787 0.2763
454.6399 0.2402
470.0688 0.4120
474.0652 0.4451
491.8870 0.2023
506.9964 0.2870
510.1264 0.2751
516.3295 0.3335
524.9356 0.3073
545.2091 0.2366
550.9103 0.4673
561.9296 0.2973
571.8098 0.3423
585.8653 0.7053
599.0011 0.4021
603.2184 0.4521
612.6253 0.3145
615.9843 0.2987
624.9162 0.4126
644.3319 0.3565
654.2292 0.2590
656.9271 0.4380
665.9296 0.3179
680.3804 0.2369
693.8512 0.4056
703.5547 0.3083
715.7668 0.3831
720.8554 0.1233
728.5836 0.3684
735.5096 0.2598
752.3107 0.4644
757.6209 0.3577
757.9321 0.3539
764.2838 0.4756
777.5141 0.6440
778.8778 0.3041
791.8644 0.3546
802.5138 0.4792
810.9180 0.3569
813.4586 0.5771
824.5442 0.3241
826.9717 0.2621
833.5046 0.3020
843.6984 0.4649
850.7960 0.2252
854.1847 0.4268
857.6975 0.3716
866.5191 0.3118
871.4040 0.3350
878.4792 0.2330
886.8948 0.3905
888.0905 0.5564
895.9554 0.4443
900.6152 0.2311
913.2264 0.4221
921.2607 0.4535
925.7295 0.3700
927.3838 0.5684
937.4372 0.2167
944.2673 0.3165
955.0693 0.3733
957.1657 0.3738
965.9945 0.3214
979.1486 0.3521
981.3739 0.4637
981.9144 0.3541
987.8406 0.2291
993.3161 0.4251
1002.3558 0.3526
1004.9404 0.1789
1010.5566 0.3604
1012.3635 0.3019
1020.7727 0.3804
1025.7277 0.3703
1026.4172 0.1271
1028.5975 0.1531
1031.4593 0.4321
1037.0456 0.3850
1038.3523 0.2415
1039.9409 0.1996
1045.8202 0.3031
1052.3390 0.1812
1058.2051 0.3506
1060.4869 0.3249
1067.2476 0.3715
1070.9424 0.2769
1071.2726 0.4117
1077.5828 0.4046
1079.9328 0.4206
1084.4001 0.4306
1091.2828 0.4280
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2502191555212884508 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
making animated gifs
11 models are in 2502191555212884508.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2502191555212884508 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
making animated gifs
11 models are in 2502191555212884508.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2502191555212884508 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
making animated gifs
11 models are in 2502191555212884508.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2502191555212884508 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
making animated gifs
11 models are in 2502191555212884508.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2502191555212884508 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2502191555212884508.eigenfacs
2502191555212884508.atom
making animated gifs
11 models are in 2502191555212884508.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2502191555212884508.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2502191555212884508.10.pdb
2502191555212884508.11.pdb
2502191555212884508.7.pdb
2502191555212884508.8.pdb
2502191555212884508.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.461s
user 0m13.429s
sys 0m0.032s
rm: cannot remove '2502191555212884508.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.
|