CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  1AE0DC429781E066  ***

LOGs for ID: 2502180527242155601

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2502180527242155601.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2502180527242155601.atom to be opened. Openam> File opened: 2502180527242155601.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 222 First residue number = 1 Last residue number = 222 Number of atoms found = 1662 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.369388 +/- 12.928924 From: -21.379000 To: 29.339000 = -0.609913 +/- 8.166256 From: -17.826000 To: 30.343000 = 2.390138 +/- 14.586860 From: -36.758000 To: 40.968000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.4249 % Filled. Pdbmat> 550128 non-zero elements. Pdbmat> 60029 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 72.24 +/- 25.00 Maximum number = 130 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.200580E+06 Pdbmat> Larger element = 473.109 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 222 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2502180527242155601.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2502180527242155601.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2502180527242155601.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1662 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 222 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 38 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 51 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 68 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 85 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 99 Blocpdb> 10 atoms in block 9 Block first atom: 115 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 125 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 142 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 156 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 170 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 183 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 201 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 218 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 232 Blocpdb> 13 atoms in block 18 Block first atom: 249 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 262 Blocpdb> 10 atoms in block 20 Block first atom: 270 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 280 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 298 Blocpdb> 13 atoms in block 23 Block first atom: 315 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 328 Blocpdb> 17 atoms in block 25 Block first atom: 346 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 363 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 373 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 391 Blocpdb> 13 atoms in block 29 Block first atom: 405 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 418 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 430 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 444 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 461 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 479 Blocpdb> 11 atoms in block 35 Block first atom: 496 Blocpdb> 13 atoms in block 36 Block first atom: 507 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 520 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 529 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 542 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 556 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 570 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 584 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 613 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 629 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 646 Blocpdb> 10 atoms in block 47 Block first atom: 662 Blocpdb> 8 atoms in block 48 Block first atom: 672 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 680 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 695 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 711 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 719 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 733 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 752 Blocpdb> 10 atoms in block 55 Block first atom: 764 Blocpdb> 10 atoms in block 56 Block first atom: 774 Blocpdb> 18 atoms in block 57 Block first atom: 784 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 802 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 819 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 839 Blocpdb> 18 atoms in block 61 Block first atom: 854 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 872 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 894 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 908 Blocpdb> 13 atoms in block 65 Block first atom: 919 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 932 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 952 Blocpdb> 10 atoms in block 68 Block first atom: 967 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 977 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 991 Blocpdb> 8 atoms in block 71 Block first atom: 1009 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1017 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1030 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1054 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1069 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1082 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1095 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1117 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1132 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1149 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1165 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1179 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1198 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1217 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1234 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1250 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1264 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1280 Blocpdb> 12 atoms in block 89 Block first atom: 1297 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1309 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1328 Blocpdb> 10 atoms in block 92 Block first atom: 1346 Blocpdb> 9 atoms in block 93 Block first atom: 1356 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 1365 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1383 Blocpdb> 12 atoms in block 96 Block first atom: 1397 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 1409 Blocpdb> 18 atoms in block 98 Block first atom: 1427 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1445 Blocpdb> 15 atoms in block 100 Block first atom: 1460 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 1475 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 1494 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1519 Blocpdb> 11 atoms in block 104 Block first atom: 1532 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1543 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1559 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1573 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1585 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1622 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 1641 Blocpdb> 111 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 550239 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4986 Prepmat> Matrix trace = 1200580.0000 Prepmat> Last element read: 4986 4986 119.0417 Prepmat> 6217 lines saved. Prepmat> 5214 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1662 RTB> Total mass = 1662.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1662 RTB> Number of blocks = 111 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 131065.3273 RTB> 34407 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 666 Diagstd> Nb of non-zero elements: 34407 Diagstd> Projected matrix trace = 131065.3273 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 666 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 131065.3273 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0833996 0.1203087 0.2524269 0.3769484 0.5333477 0.8760552 1.0143191 1.2012365 1.4272796 1.8023462 1.8803753 2.3455602 2.4024615 2.8170494 3.8281753 4.1387690 4.5628189 5.8790444 6.0566474 6.4861662 7.3338894 7.4702798 7.9141495 8.7456099 9.0112721 9.8047997 10.1924577 11.6201847 11.7687316 12.7430369 12.8447058 13.5482400 13.8384328 14.6551035 15.1124954 15.9184825 16.4941275 17.5084208 18.2640438 18.8357212 19.2374071 20.6077878 20.9925914 21.8863528 23.7084834 24.6806560 24.9830789 26.4593423 27.2248197 28.2429039 28.8184757 29.6906532 30.1117134 31.6566904 31.8501744 33.2747970 33.6635949 34.3625653 34.5444137 35.2953097 35.5874372 36.8214338 38.1551641 39.3489664 40.1077751 40.6078134 41.4292369 42.5646789 42.7672733 44.2751339 44.7861593 45.8117190 46.5497540 46.6489622 48.0021792 48.1716238 48.4565101 49.4032252 50.2265698 51.1257190 51.4924900 52.9436413 53.7855192 54.3574134 55.3710265 56.3819551 56.6807522 57.4719634 57.6191810 58.3370740 59.4467816 59.6197963 60.5617965 61.9681491 62.3689530 62.8746030 63.1173980 64.7366342 64.7779847 66.2896480 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034335 0.0034344 0.0034345 0.0034353 31.3600782 37.6654998 54.5585853 66.6708912 79.3049842 101.6391482 109.3660623 119.0171468 129.7328044 145.7855196 148.9078356 166.3100787 168.3152623 182.2604816 212.4668547 220.9178833 231.9593579 263.2986613 267.2461306 276.5599679 294.0779483 296.7998763 305.4902858 321.1369884 325.9780314 340.0279700 346.6847499 370.1704924 372.5290195 387.6428251 389.1861360 399.7023681 403.9603458 415.7092854 422.1466730 433.2575228 441.0216945 454.3795411 464.0809590 471.2880272 476.2868024 492.9591894 497.5403488 508.0213668 528.7460882 539.4778650 542.7730305 558.5792551 566.6015869 577.0985118 582.9492973 591.7048877 595.8857701 610.9814641 612.8457628 626.4017866 630.0507407 636.5581301 638.2402560 645.1397161 647.8040172 658.9396309 670.7673938 681.1800883 687.7166922 691.9904210 698.9542460 708.4675468 710.1515860 722.5621732 726.7201303 734.9936285 740.8904132 741.6794971 752.3601030 753.6868246 755.9121856 763.2607524 769.5946499 776.4526820 779.2328034 790.1366087 796.3939699 800.6167497 808.0468987 815.3899342 817.5476655 823.2339971 824.2877029 829.4068192 837.2582854 838.4757840 845.0738343 854.8295814 857.5896024 861.0589953 862.7199157 873.7160992 873.9950978 884.1340912 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1662 Rtb_to_modes> Number of blocs = 111 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3400E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1203 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.014 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.880 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.470 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.29 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 666 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00005 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00004 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 29916 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00005 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00004 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502180527242155601.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502180527242155601.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2502180527242155601.atom Openam> file on opening on unit 11: 2502180527242155601.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 222 First residue number = 1 Last residue number = 222 Number of atoms found = 1662 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3400E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1203 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.014 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.880 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.470 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.29 Bfactors> 106 vectors, 4986 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.083400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.489 for 222 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.318 +/- 0.78 Bfactors> = 83.827 +/- 16.82 Bfactors> Shiftng-fct= 83.509 Bfactors> Scaling-fct= 21.648 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502180527242155601.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502180527242155601.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.1 Chkmod> 106 vectors, 4986 coordinates in file. Chkmod> That is: 1662 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7508 0.0034 0.8972 0.0034 0.9814 0.0034 0.7631 0.0034 0.6589 0.0034 0.8596 31.3588 0.0714 37.6625 0.2636 54.5533 0.4462 66.6637 0.2642 79.2980 0.1438 101.6374 0.2811 109.3442 0.1208 119.0003 0.3895 129.7145 0.2756 145.7653 0.2540 148.8866 0.1180 166.3185 0.3267 168.2919 0.0259 182.2511 0.4476 212.4529 0.1463 220.9146 0.2825 231.9540 0.1175 263.2864 0.4350 267.2424 0.3195 276.5446 0.1951 294.0675 0.2827 296.7816 0.3487 305.4743 0.2985 321.1304 0.1572 325.9591 0.0811 340.0168 0.2097 346.6281 0.2393 370.1517 0.4130 372.5331 0.4577 387.5800 0.1585 389.0981 0.4351 399.7112 0.2758 403.9659 0.2441 415.7609 0.4167 422.0937 0.0790 433.2596 0.3432 440.9476 0.2185 454.3805 0.1433 464.0097 0.2428 471.3213 0.3420 476.2985 0.0826 492.9645 0.0895 497.4883 0.1128 508.0419 0.1849 528.7403 0.2257 539.4475 0.1362 542.7163 0.2531 558.5622 0.3564 566.5271 0.3606 577.0441 0.4283 582.9397 0.4878 591.6730 0.4309 595.8432 0.2499 610.9872 0.0391 612.8178 0.3598 626.3297 0.1360 629.9901 0.1901 636.5070 0.4095 638.1721 0.2045 645.1549 0.4801 647.7995 0.3269 658.8985 0.3150 670.7811 0.2828 681.1598 0.3654 687.7062 0.1737 691.9793 0.2494 698.9307 0.3743 708.3982 0.3937 710.1437 0.2348 722.5709 0.4931 726.7201 0.4265 734.9483 0.4111 740.8606 0.2714 741.6559 0.1836 752.3107 0.3909 753.6418 0.3582 755.9070 0.2910 763.2031 0.4293 769.5879 0.4584 776.4519 0.3412 779.1805 0.5270 790.0755 0.4518 796.3930 0.2166 800.6014 0.2922 808.0047 0.1023 815.3408 0.1466 817.5071 0.3006 823.1846 0.4805 824.2582 0.5082 829.3920 0.4023 837.2450 0.4699 838.4412 0.3842 845.0250 0.4390 854.8057 0.4186 857.5600 0.4515 860.9905 0.4538 862.7007 0.1102 873.7013 0.4673 873.9712 0.5021 884.0985 0.5359 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2502180527242155601 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom making animated gifs 11 models are in 2502180527242155601.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2502180527242155601 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom making animated gifs 11 models are in 2502180527242155601.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2502180527242155601 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom making animated gifs 11 models are in 2502180527242155601.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2502180527242155601 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom making animated gifs 11 models are in 2502180527242155601.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2502180527242155601 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502180527242155601.eigenfacs 2502180527242155601.atom making animated gifs 11 models are in 2502180527242155601.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502180527242155601.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2502180527242155601.10.pdb 2502180527242155601.11.pdb 2502180527242155601.7.pdb 2502180527242155601.8.pdb 2502180527242155601.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m5.686s user 0m5.658s sys 0m0.028s rm: cannot remove '2502180527242155601.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.