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LOGs for ID: 250216133155656269

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 250216133155656269.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 250216133155656269.atom to be opened. Openam> File opened: 250216133155656269.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 1 Last residue number = 349 Number of atoms found = 2845 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = -22.369018 +/- 8.061964 From: -44.432000 To: -0.907000 = -29.867691 +/- 12.955164 From: -63.229000 To: -2.023000 = 26.188943 +/- 14.654571 From: -5.717000 To: 63.368000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9056 % Filled. Pdbmat> 1058418 non-zero elements. Pdbmat> 115722 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.35 +/- 22.86 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.314440E+06 Pdbmat> Larger element = 493.159 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 349 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 250216133155656269.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 250216133155656269.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 250216133155656269.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2845 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 349 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 66 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 85 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 101 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 121 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 138 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 156 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 172 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 187 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 200 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 222 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 238 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 254 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 268 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 284 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 299 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 316 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 335 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 353 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 370 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 390 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 401 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 414 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 428 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 446 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 461 Blocpdb> 13 atoms in block 30 Block first atom: 475 Blocpdb> 10 atoms in block 31 Block first atom: 488 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 498 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 508 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 521 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 535 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 554 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 569 Blocpdb> 13 atoms in block 38 Block first atom: 583 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 596 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 611 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 629 Blocpdb> 17 atoms in block 42 Block first atom: 644 Blocpdb> 13 atoms in block 43 Block first atom: 661 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 674 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 694 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 711 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 730 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 752 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 765 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 784 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 802 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 821 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 841 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 858 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 869 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 889 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 907 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 927 Blocpdb> 18 atoms in block 59 Block first atom: 943 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 961 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 977 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 992 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1010 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 1030 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 1045 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 1061 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1078 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1110 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1123 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1140 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1158 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1174 Blocpdb> 15 atoms in block 74 Block first atom: 1194 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1209 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1224 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1240 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1253 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1265 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1288 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1302 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1318 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1334 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1349 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1366 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1385 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1402 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1419 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1434 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1449 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1464 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1482 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1495 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1512 Blocpdb> 18 atoms in block 95 Block first atom: 1525 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1543 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 1560 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1588 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1607 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1626 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1645 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1659 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1676 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1691 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 1707 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1726 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1742 Blocpdb> 21 atoms in block 108 Block first atom: 1766 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1787 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1800 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 1818 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1835 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1847 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1864 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 1878 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1899 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1912 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1929 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 1944 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1963 Blocpdb> 18 atoms in block 121 Block first atom: 1982 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 2000 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 2010 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 2030 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 2045 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 2062 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 2074 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2087 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2107 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2121 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2138 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 2153 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2170 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 2189 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2206 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 2220 Blocpdb> 14 atoms in block 137 Block first atom: 2245 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 2259 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 2283 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2302 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2317 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2331 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2342 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2359 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2375 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2393 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2410 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 2426 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2444 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2459 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2475 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2487 Blocpdb> 11 atoms in block 153 Block first atom: 2502 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2513 Blocpdb> 8 atoms in block 155 Block first atom: 2528 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 2536 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2548 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 2565 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2585 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2605 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2618 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2636 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 2652 Blocpdb> 12 atoms in block 164 Block first atom: 2673 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2685 Blocpdb> 12 atoms in block 166 Block first atom: 2704 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2716 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2733 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2749 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2759 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 2774 Blocpdb> 21 atoms in block 172 Block first atom: 2783 Blocpdb> 16 atoms in block 173 Block first atom: 2804 Blocpdb> 18 atoms in block 174 Block first atom: 2820 Blocpdb> 8 atoms in block 175 Block first atom: 2837 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1058593 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8535 Prepmat> Matrix trace = 2314440.0000 Prepmat> Last element read: 8535 8535 75.0455 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13497 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2845 RTB> Total mass = 2845.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2845 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 239019.6310 RTB> 65883 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65883 Diagstd> Projected matrix trace = 239019.6310 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 239019.6310 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1741389 1.7263784 3.4016988 4.1085768 4.8348473 5.3642788 6.4641457 6.8107626 7.6025036 8.7415768 9.2724867 9.9969930 10.4899203 10.9149477 12.2169819 12.8352966 13.3428674 15.2395422 15.4075948 15.7676854 15.8894613 16.4436883 17.5692875 17.7190005 18.4492597 19.5064047 20.5954326 20.6318757 21.5857510 22.3150582 22.5265663 23.4499562 23.8209627 24.2221747 25.3663742 25.6624653 26.8437167 27.2054548 27.9108263 28.4470839 29.3407625 30.6523918 30.9486484 31.5587468 31.6662232 32.0335462 32.5376507 33.1229935 34.0390336 34.7136967 35.0904099 36.5733791 36.8606307 37.9948583 38.1745407 38.5742331 38.7441889 39.4488151 40.1676031 40.8603059 41.4613081 41.7192147 43.1414100 43.3072383 43.5751495 44.0572280 44.1032540 45.2937661 45.4861657 46.3109548 46.6867947 47.0718068 47.9036099 48.1618508 49.0306814 49.9353851 50.5344539 50.7477381 51.2635662 52.1902810 53.0537492 53.4547617 54.4167067 54.8810194 55.1370464 55.2758952 55.4637472 56.4546206 57.3268314 57.9888930 58.7851927 59.7307925 60.5815573 60.7763711 61.0361302 61.1329052 62.3643383 62.8700729 64.3941486 64.5644634 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034332 0.0034337 0.0034342 0.0034344 0.0034354 117.6670894 142.6800591 200.2825942 220.1106126 238.7737936 251.5075052 276.0901090 283.3956311 299.4150301 321.0629338 330.6689301 343.3444043 351.7072937 358.7617296 379.5572104 389.0435633 396.6613316 423.9173977 426.2483438 431.2004971 432.8624042 440.3468543 455.1686633 457.1038616 466.4281488 479.6052132 492.8113932 493.2472097 504.5205520 512.9727459 515.3980592 525.8553515 529.9988593 534.4435578 546.9208469 550.1035761 562.6218618 566.4000397 573.6957430 579.1808008 588.2080696 601.2117561 604.1101376 610.0355645 611.0734495 614.6074070 619.4244968 624.9712945 633.5543700 639.8021753 643.2643765 656.7163424 659.2902622 669.3568234 670.9376924 674.4409485 675.9250891 682.0437941 688.2294282 694.1384267 699.2247306 701.3960935 713.2510959 714.6205896 716.8276079 720.7818872 721.1582846 730.8268534 732.3774182 738.9875947 741.9801886 745.0333514 751.5872451 753.6103671 760.3774778 767.3605740 771.9498169 773.5771359 777.4987290 784.4948519 790.9578128 793.9414559 801.0532887 804.4635388 806.3378180 807.3524592 808.7231666 815.9152056 822.1938980 826.9279844 832.5862864 839.2559303 845.2116931 846.5695880 848.3767842 849.0490843 857.5578757 861.0279754 871.4018606 872.5534763 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2845 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.835 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.603 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.56 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99994 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00006 0.99998 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99998 1.00003 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00006 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51210 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99994 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00006 0.99998 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99998 1.00003 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00006 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250216133155656269.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250216133155656269.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 250216133155656269.atom Openam> file on opening on unit 11: 250216133155656269.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 1 Last residue number = 349 Number of atoms found = 2845 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.835 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.603 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.56 Bfactors> 106 vectors, 8535 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.174000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.786 for 350 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.03 Bfactors> = 35.373 +/- 14.92 Bfactors> Shiftng-fct= 35.345 Bfactors> Scaling-fct= 458.003 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250216133155656269.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250216133155656269.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4 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Chkmod> That is: 2845 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 91 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7830 0.0034 0.7208 0.0034 0.9761 0.0034 0.7579 0.0034 0.7279 0.0034 0.9722 117.6551 0.5749 142.6583 0.6127 200.2829 0.0767 220.1125 0.5870 238.7673 0.0140 251.4902 0.4407 276.0751 0.5418 283.3884 0.5715 299.4120 0.5300 321.0569 0.1722 330.6461 0.1780 343.3298 0.2835 351.6935 0.5303 358.6650 0.5294 379.5878 0.2432 389.0981 0.4603 396.6017 0.3433 423.9056 0.0666 426.2633 0.2779 431.2136 0.4846 432.8512 0.3576 440.2786 0.4696 455.1584 0.2122 457.0971 0.4521 466.4175 0.2922 479.6288 0.4034 492.8449 0.3109 493.2036 0.1122 504.5485 0.2254 513.0075 0.4045 515.4152 0.3564 525.8333 0.3302 529.9654 0.3880 534.3966 0.4888 546.9365 0.5815 550.0535 0.3763 562.5588 0.5077 566.4230 0.5004 573.6626 0.4131 579.1856 0.4170 588.1752 0.3955 601.1625 0.5042 604.0974 0.0191 610.0215 0.4074 611.0837 0.4028 614.5470 0.3707 619.4203 0.3327 624.9162 0.4275 633.5362 0.5392 639.7406 0.2302 643.2330 0.3873 656.6578 0.4847 659.2563 0.2467 669.2853 0.5564 670.8690 0.4173 674.3750 0.4889 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250216133155656269.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250216133155656269.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 250216133155656269 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 250216133155656269 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom making animated gifs 11 models are in 250216133155656269.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250216133155656269.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250216133155656269.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 250216133155656269 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250216133155656269.eigenfacs 250216133155656269.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250216133155656269.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 250216133155656269.10.pdb 250216133155656269.11.pdb 250216133155656269.7.pdb 250216133155656269.8.pdb 250216133155656269.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.794s user 0m19.731s sys 0m0.060s rm: cannot remove '250216133155656269.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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