***  dndc-4FS-rank3  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 250214070608127607.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 250214070608127607.atom to be opened.
Openam> File opened: 250214070608127607.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 540
First residue number = 1
Last residue number = 540
Number of atoms found = 4369
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.855193 +/- 21.663020 From: -75.410000 To: 35.469000
= 4.107000 +/- 14.567638 From: -24.648000 To: 63.438000
= 0.132900 +/- 19.460006 From: -40.525000 To: 40.861000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.8541 % Filled.
Pdbmat> 1592717 non-zero elements.
Pdbmat> 174082 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.69 +/- 22.93
Maximum number = 128
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 3.481640E+06
Pdbmat> Larger element = 506.828
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
540 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 250214070608127607.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 250214070608127607.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
250214070608127607.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4369 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 540 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 25 atoms in block 3
Block first atom: 48
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 73
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 95
Blocpdb> 27 atoms in block 6
Block first atom: 124
Blocpdb> 27 atoms in block 7
Block first atom: 151
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 178
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 198
Blocpdb> 26 atoms in block 10
Block first atom: 224
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 250
Blocpdb> 27 atoms in block 12
Block first atom: 271
Blocpdb> 26 atoms in block 13
Block first atom: 298
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 324
Blocpdb> 32 atoms in block 15
Block first atom: 346
Blocpdb> 19 atoms in block 16
Block first atom: 378
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 397
Blocpdb> 21 atoms in block 18
Block first atom: 419
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 440
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 457
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 479
Blocpdb> 21 atoms in block 22
Block first atom: 506
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 527
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 547
Blocpdb> 25 atoms in block 25
Block first atom: 570
Blocpdb> 25 atoms in block 26
Block first atom: 595
Blocpdb> 25 atoms in block 27
Block first atom: 620
Blocpdb> 20 atoms in block 28
Block first atom: 645
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 665
Blocpdb> 23 atoms in block 30
Block first atom: 687
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 710
Blocpdb> 24 atoms in block 32
Block first atom: 731
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 755
Blocpdb> 25 atoms in block 34
Block first atom: 780
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 805
Blocpdb> 18 atoms in block 36
Block first atom: 827
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 845
Blocpdb> 23 atoms in block 38
Block first atom: 868
Blocpdb> 26 atoms in block 39
Block first atom: 891
Blocpdb> 19 atoms in block 40
Block first atom: 917
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 936
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 959
Blocpdb> 32 atoms in block 43
Block first atom: 983
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1015
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 1039
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1056
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1080
Blocpdb> 28 atoms in block 48
Block first atom: 1105
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1133
Blocpdb> 28 atoms in block 50
Block first atom: 1160
Blocpdb> 25 atoms in block 51
Block first atom: 1188
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 1213
Blocpdb> 27 atoms in block 53
Block first atom: 1233
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1260
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1286
Blocpdb> 28 atoms in block 56
Block first atom: 1308
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1336
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 1358
Blocpdb> 23 atoms in block 59
Block first atom: 1377
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 1400
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1421
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1443
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1464
Blocpdb> 27 atoms in block 64
Block first atom: 1486
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1513
Blocpdb> 24 atoms in block 66
Block first atom: 1531
Blocpdb> 28 atoms in block 67
Block first atom: 1555
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1583
Blocpdb> 24 atoms in block 69
Block first atom: 1603
Blocpdb> 27 atoms in block 70
Block first atom: 1627
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1654
Blocpdb> 29 atoms in block 72
Block first atom: 1677
Blocpdb> 24 atoms in block 73
Block first atom: 1706
Blocpdb> 30 atoms in block 74
Block first atom: 1730
Blocpdb> 27 atoms in block 75
Block first atom: 1760
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1787
Blocpdb> 28 atoms in block 77
Block first atom: 1807
Blocpdb> 24 atoms in block 78
Block first atom: 1835
Blocpdb> 25 atoms in block 79
Block first atom: 1859
Blocpdb> 29 atoms in block 80
Block first atom: 1884
Blocpdb> 25 atoms in block 81
Block first atom: 1913
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1938
Blocpdb> 26 atoms in block 83
Block first atom: 1958
Blocpdb> 29 atoms in block 84
Block first atom: 1984
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 2013
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 2041
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 2058
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 2080
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2101
Blocpdb> 21 atoms in block 90
Block first atom: 2124
Blocpdb> 19 atoms in block 91
Block first atom: 2145
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 2164
Blocpdb> 26 atoms in block 93
Block first atom: 2182
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2208
Blocpdb> 20 atoms in block 95
Block first atom: 2235
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2255
Blocpdb> 22 atoms in block 97
Block first atom: 2278
Blocpdb> 23 atoms in block 98
Block first atom: 2300
Blocpdb> 25 atoms in block 99
Block first atom: 2323
Blocpdb> 21 atoms in block 100
Block first atom: 2348
Blocpdb> 31 atoms in block 101
Block first atom: 2369
Blocpdb> 21 atoms in block 102
Block first atom: 2400
Blocpdb> 29 atoms in block 103
Block first atom: 2421
Blocpdb> 27 atoms in block 104
Block first atom: 2450
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2477
Blocpdb> 22 atoms in block 106
Block first atom: 2501
Blocpdb> 22 atoms in block 107
Block first atom: 2523
Blocpdb> 24 atoms in block 108
Block first atom: 2545
Blocpdb> 30 atoms in block 109
Block first atom: 2569
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 2599
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2631
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2653
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 2675
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2708
Blocpdb> 23 atoms in block 115
Block first atom: 2731
Blocpdb> 16 atoms in block 116
Block first atom: 2754
Blocpdb> 29 atoms in block 117
Block first atom: 2770
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 2799
Blocpdb> 23 atoms in block 119
Block first atom: 2823
Blocpdb> 31 atoms in block 120
Block first atom: 2846
Blocpdb> 32 atoms in block 121
Block first atom: 2877
Blocpdb> 31 atoms in block 122
Block first atom: 2909
Blocpdb> 26 atoms in block 123
Block first atom: 2940
Blocpdb> 25 atoms in block 124
Block first atom: 2966
Blocpdb> 28 atoms in block 125
Block first atom: 2991
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 3019
Blocpdb> 23 atoms in block 127
Block first atom: 3040
Blocpdb> 22 atoms in block 128
Block first atom: 3063
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 3085
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 3108
Blocpdb> 23 atoms in block 131
Block first atom: 3133
Blocpdb> 28 atoms in block 132
Block first atom: 3156
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 3184
Blocpdb> 24 atoms in block 134
Block first atom: 3215
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3239
Blocpdb> 34 atoms in block 136
Block first atom: 3263
Blocpdb> 23 atoms in block 137
Block first atom: 3297
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 3320
Blocpdb> 32 atoms in block 139
Block first atom: 3339
Blocpdb> 28 atoms in block 140
Block first atom: 3371
Blocpdb> 25 atoms in block 141
Block first atom: 3399
Blocpdb> 29 atoms in block 142
Block first atom: 3424
Blocpdb> 23 atoms in block 143
Block first atom: 3453
Blocpdb> 26 atoms in block 144
Block first atom: 3476
Blocpdb> 24 atoms in block 145
Block first atom: 3502
Blocpdb> 19 atoms in block 146
Block first atom: 3526
Blocpdb> 24 atoms in block 147
Block first atom: 3545
Blocpdb> 24 atoms in block 148
Block first atom: 3569
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 3593
Blocpdb> 26 atoms in block 150
Block first atom: 3611
Blocpdb> 23 atoms in block 151
Block first atom: 3637
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 3660
Blocpdb> 25 atoms in block 153
Block first atom: 3683
Blocpdb> 26 atoms in block 154
Block first atom: 3708
Blocpdb> 21 atoms in block 155
Block first atom: 3734
Blocpdb> 21 atoms in block 156
Block first atom: 3755
Blocpdb> 28 atoms in block 157
Block first atom: 3776
Blocpdb> 21 atoms in block 158
Block first atom: 3804
Blocpdb> 28 atoms in block 159
Block first atom: 3825
Blocpdb> 19 atoms in block 160
Block first atom: 3853
Blocpdb> 25 atoms in block 161
Block first atom: 3872
Blocpdb> 31 atoms in block 162
Block first atom: 3897
Blocpdb> 19 atoms in block 163
Block first atom: 3928
Blocpdb> 26 atoms in block 164
Block first atom: 3947
Blocpdb> 27 atoms in block 165
Block first atom: 3973
Blocpdb> 23 atoms in block 166
Block first atom: 4000
Blocpdb> 26 atoms in block 167
Block first atom: 4023
Blocpdb> 27 atoms in block 168
Block first atom: 4049
Blocpdb> 27 atoms in block 169
Block first atom: 4076
Blocpdb> 28 atoms in block 170
Block first atom: 4103
Blocpdb> 24 atoms in block 171
Block first atom: 4131
Blocpdb> 26 atoms in block 172
Block first atom: 4155
Blocpdb> 24 atoms in block 173
Block first atom: 4181
Blocpdb> 24 atoms in block 174
Block first atom: 4205
Blocpdb> 31 atoms in block 175
Block first atom: 4229
Blocpdb> 23 atoms in block 176
Block first atom: 4260
Blocpdb> 20 atoms in block 177
Block first atom: 4283
Blocpdb> 20 atoms in block 178
Block first atom: 4303
Blocpdb> 20 atoms in block 179
Block first atom: 4323
Blocpdb> 27 atoms in block 180
Block first atom: 4342
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1592897 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13107
Prepmat> Matrix trace = 3481640.0000
Prepmat> Last element read: 13107 13107 131.9865
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14650 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4369
RTB> Total mass = 4369.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4369
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 219574.3081
RTB> 56340 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56340
Diagstd> Projected matrix trace = 219574.3081
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 219574.3081
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0101811 0.0200319 0.1806489 0.2567741
0.3808710 0.4468413 0.4843839 0.5978900 1.1492418
1.3502907 1.4593752 1.5991441 1.9951011 2.3336711
2.7119868 2.9928624 3.1098955 3.7036033 4.1801891
4.4018226 4.7507504 5.2427423 5.8109623 6.3158345
6.7302158 7.0820972 7.5214726 7.8100538 8.5173763
8.6781925 9.2564406 9.6494979 10.3347455 11.0176424
12.0157080 12.4914599 13.4127228 14.1242347 14.4842925
15.0495189 15.4952766 15.6681121 15.9325732 16.4675973
17.5221196 17.8836998 18.3097906 19.0035202 19.1789940
19.6673745 20.1280626 20.4864623 20.7868125 21.2467483
21.7283000 22.5079307 22.9234345 23.0866777 23.5652811
24.5886277 24.9702686 25.2564742 25.3847851 25.8426287
26.1839768 26.6069495 27.3358314 27.9166929 28.1042631
28.5390678 29.3561874 29.4035399 29.4991086 29.9372626
30.6233895 30.9785428 31.3861471 32.2695815 32.6865728
33.3888287 34.1940081 34.4244977 35.2178408 35.4074903
35.9537833 36.3300921 36.5919797 37.3003585 37.9527003
38.1089499 38.5695826 38.9358608 39.8684596 40.0138166
40.2055870 40.8468207 41.0320704 41.3690927 42.0284735
42.2024311
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034329 0.0034347 0.0034349 0.0034351
0.0034353 10.9570506 15.3693743 46.1543863 55.0263681
67.0168830 72.5891832 75.5770852 83.9664770 116.4128676
126.1853443 131.1833619 137.3216716 153.3831790 165.8880508
178.8294619 187.8618746 191.4997360 208.9813409 222.0205856
227.8303357 236.6880799 248.6420270 261.7696606 272.9044707
281.7148722 288.9856125 297.8151033 303.4745624 316.9189416
319.8968183 330.3826935 337.3243082 349.0962410 360.4455075
376.4176367 383.7972691 397.6983190 408.1104759 413.2795571
421.2661740 427.4594738 429.8368211 433.4492359 440.6668684
454.5572622 459.2233535 464.6617984 473.3826196 475.5631465
481.5800352 487.1876462 491.5059330 495.0957855 500.5431437
506.1836990 515.1848279 519.9183237 521.7662703 527.1468218
538.4711325 542.6338564 545.7347915 547.1192887 552.0312003
555.6650532 560.1351452 567.7555961 573.7560330 575.6803178
580.1164385 588.3626646 588.8369970 589.7931531 594.1571450
600.9272654 604.4018327 608.3650874 616.8675815 620.8404051
627.4741978 634.9949707 637.1315133 644.4313258 646.1641405
651.1298096 654.5284520 656.8833189 663.2110955 668.9853710
670.3610482 674.4002920 677.5949659 685.6618848 686.9106805
688.5547586 694.0238730 695.5958720 698.4467141 703.9909703
705.4463898
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4369
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0181E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0032E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1806
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2568
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3809
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5979
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.149
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.459
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.599
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.712
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.993
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.110
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.704
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.180
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.402
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.751
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.316
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.730
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.082
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.810
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.517
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.678
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.20
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001
1.00004 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
0.99997 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99996 0.99997 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99997
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 78642 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001
1.00004 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
0.99997 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99996 0.99997 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004
0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 0.99997
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 250214070608127607.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
250214070608127607.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 250214070608127607.atom
Openam> file on opening on unit 11:
250214070608127607.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 540
First residue number = 1
Last residue number = 540
Number of atoms found = 4369
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0181E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0032E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1806
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2568
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3809
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5979
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.149
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.459
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.599
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.993
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.180
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.402
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.316
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.730
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.082
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.810
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.517
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.678
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.649
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.20
Bfactors> 106 vectors, 13107 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.010181
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.314 for 540 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.639 +/- 2.19
Bfactors> = 86.112 +/- 11.54
Bfactors> Shiftng-fct= 85.473
Bfactors> Scaling-fct= 5.275
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 250214070608127607.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
250214070608127607.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.4
Chkmod> 106 vectors, 13107 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4369 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8421
0.0034 0.4908
0.0034 0.9631
0.0034 0.7564
0.0034 0.9623
0.0034 0.8075
10.9565 0.1654
15.3688 0.2138
46.1462 0.1668
55.0268 0.1842
67.0166 0.2698
72.5827 0.2587
75.5751 0.3039
83.9636 0.6100
116.3956 0.2297
126.1663 0.2752
131.1609 0.2889
137.3096 0.1658
153.3727 0.3988
165.8926 0.4144
178.8222 0.0631
187.8581 0.3580
191.4947 0.2131
208.9836 0.2389
222.0060 0.4319
227.8251 0.2966
236.6841 0.4321
248.6375 0.5948
261.7593 0.1526
272.8963 0.2824
281.6983 0.2487
288.9712 0.2634
297.7930 0.1876
303.4605 0.2227
316.8983 0.4230
319.8795 0.3796
330.3606 0.3253
337.3011 0.5331
349.0011 0.3892
360.4686 0.2717
376.4687 0.4171
383.7584 0.5319
397.6409 0.5724
408.0318 0.3268
413.2006 0.4711
421.2548 0.2228
427.5063 0.4152
429.8443 0.4494
433.3956 0.2749
440.6801 0.3852
454.5103 0.4694
459.1561 0.4671
464.6445 0.3817
473.3185 0.4347
475.5552 0.3842
481.5915 0.3106
487.1902 0.4176
491.5273 0.3771
495.1125 0.3930
500.5600 0.5390
506.1818 0.5499
515.1864 0.1914
519.8571 0.4666
521.7814 0.4674
527.1770 0.4368
538.4630 0.4478
542.6076 0.0614
545.7495 0.4285
547.0442 0.4288
551.9794 0.5088
555.5990 0.4433
560.1432 0.3858
567.7745 0.2954
573.7654 0.3841
575.6119 0.5095
580.1010 0.3381
588.3756 0.4886
588.7763 0.4404
589.7767 0.4929
594.1588 0.5630
600.8682 0.3930
604.3901 0.3982
608.3763 0.4794
616.8451 0.3637
620.8463 0.4299
627.4583 0.3237
634.9305 0.3959
637.0625 0.5189
644.4234 0.2453
646.1593 0.1971
651.0676 0.5249
654.4995 0.4457
656.8374 0.2214
663.1794 0.3492
668.9329 0.5287
670.3415 0.4775
674.3750 0.4394
677.6019 0.3146
685.6457 0.4284
686.8484 0.3460
688.5630 0.5249
694.0211 0.3344
695.5485 0.3932
698.4244 0.3226
703.9735 0.4863
705.3958 0.3976
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 250214070608127607 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
making animated gifs
11 models are in 250214070608127607.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 250214070608127607 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
making animated gifs
11 models are in 250214070608127607.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 250214070608127607 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
making animated gifs
11 models are in 250214070608127607.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 250214070608127607 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
making animated gifs
11 models are in 250214070608127607.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 250214070608127607 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
250214070608127607.eigenfacs
250214070608127607.atom
making animated gifs
11 models are in 250214070608127607.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 250214070608127607.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
250214070608127607.10.pdb
250214070608127607.11.pdb
250214070608127607.7.pdb
250214070608127607.8.pdb
250214070608127607.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m23.295s
user 0m23.209s
sys 0m0.052s
rm: cannot remove '250214070608127607.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.
|