CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  Test_nma  ***

CA distance fluctuations for 2502120609543972122

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLY 175 0.44 MET 1 -0.10 THR 7
GLY 175 0.33 ARG 2 -0.17 THR 7
CYS 174 0.45 ARG 3 -0.00 ASN 4
ASP 10 0.16 ASN 4 -0.22 ASP 196
ASP 10 0.14 ARG 5 -0.45 ASP 196
ARG 3 0.10 ASN 6 -0.54 CYS 194
LYS 318 0.10 THR 7 -0.44 CYS 194
ARG 3 0.21 SER 8 -0.41 CYS 194
ARG 3 0.22 LEU 9 -0.25 CYS 194
ARG 3 0.40 ASP 10 -0.15 CYS 194
ARG 3 0.39 THR 11 -0.07 CYS 194
ARG 3 0.36 VAL 12 -0.05 ASN 6
ARG 3 0.36 VAL 13 -0.08 ASN 6
ARG 3 0.32 THR 14 -0.02 PRO 172
ARG 3 0.31 ASP 15 -0.05 ASN 6
MET 1 0.31 PHE 16 -0.12 ASN 6
MET 1 0.31 LEU 17 -0.11 ASN 6
MET 1 0.31 LEU 18 -0.14 ASN 6
MET 1 0.32 LEU 19 -0.16 ASN 6
MET 1 0.29 GLY 20 -0.15 ASN 6
MET 1 0.28 LEU 21 -0.15 ASN 6
MET 1 0.28 ALA 22 -0.16 ASN 6
MET 1 0.26 HIS 23 -0.17 LYS 318
MET 1 0.25 PRO 24 -0.21 LYS 318
MET 1 0.24 PRO 25 -0.21 LYS 318
MET 1 0.22 ASN 26 -0.26 LYS 318
MET 1 0.23 LEU 27 -0.25 LYS 318
MET 1 0.23 ARG 28 -0.22 LYS 318
MET 1 0.22 ALA 29 -0.26 LYS 318
MET 1 0.21 PHE 30 -0.28 LYS 318
MET 1 0.22 LEU 31 -0.22 LYS 318
MET 1 0.22 PHE 32 -0.20 LYS 318
MET 1 0.21 LEU 33 -0.26 LYS 318
MET 1 0.21 VAL 34 -0.24 LYS 318
MET 1 0.22 PHE 35 -0.17 LYS 318
MET 1 0.21 PHE 36 -0.17 LYS 318
MET 1 0.19 LEU 37 -0.23 LYS 318
MET 1 0.20 ILE 38 -0.17 ASP 315
MET 1 0.20 TYR 39 -0.11 ASP 315
MET 1 0.19 ILE 40 -0.14 ASP 315
MET 1 0.18 LEU 41 -0.18 ASP 315
MET 1 0.19 THR 42 -0.09 GLY 316
MET 1 0.19 GLN 43 -0.06 ASN 6
MET 1 0.17 LEU 44 -0.08 ARG 311
MET 1 0.17 GLY 45 -0.10 ARG 308
MET 1 0.17 ASN 46 -0.08 ASN 6
MET 1 0.17 LEU 47 -0.05 ASN 6
MET 1 0.16 LEU 48 -0.06 ASN 6
MET 1 0.16 ILE 49 -0.07 ASN 6
VAL 314 0.24 LEU 50 -0.06 ASN 6
VAL 314 0.28 LEU 51 -0.05 ALA 55
VAL 314 0.26 THR 52 -0.05 ASN 6
VAL 314 0.34 VAL 53 -0.06 ASN 6
VAL 314 0.46 TRP 54 -0.05 ASN 6
VAL 314 0.54 ALA 55 -0.05 LEU 51
VAL 314 0.51 ASP 56 -0.05 ASN 6
VAL 314 0.58 PRO 57 -0.05 ASN 6
VAL 314 0.46 LYS 58 -0.06 ASN 6
VAL 314 0.38 LEU 59 -0.07 ASN 6
VAL 314 0.44 HIS 60 -0.06 ASN 6
VAL 314 0.44 ALA 61 -0.06 ASN 6
VAL 314 0.35 ARG 62 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.31 PRO 63 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.25 MET 64 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.28 TYR 65 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.32 ILE 66 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.25 LEU 67 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.21 LEU 68 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.26 GLY 69 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.25 VAL 70 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.18 LEU 71 -0.10 ASN 6
MET 1 0.18 SER 72 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.19 PHE 73 -0.08 ASN 6
MET 1 0.19 LEU 74 -0.09 ASN 6
MET 1 0.19 ASP 75 -0.10 ASN 6
MET 1 0.19 MET 76 -0.08 ASN 6
MET 1 0.20 TRP 77 -0.08 ASN 6
MET 1 0.21 LEU 78 -0.11 ASN 6
MET 1 0.21 SER 79 -0.10 ASN 6
MET 1 0.21 SER 80 -0.07 ASN 6
MET 1 0.22 VAL 81 -0.09 ASN 6
MET 1 0.23 ILE 82 -0.11 ASN 6
MET 1 0.23 VAL 83 -0.10 ASN 6
MET 1 0.23 PRO 84 -0.07 ASN 6
MET 1 0.24 ARG 85 -0.09 ASN 6
MET 1 0.25 ILE 86 -0.11 ASN 6
MET 1 0.23 ILE 87 -0.10 LYS 318
MET 1 0.24 LEU 88 -0.07 LYS 318
MET 1 0.26 ASN 89 -0.09 LYS 318
MET 1 0.24 PHE 90 -0.15 LYS 318
MET 1 0.24 THR 91 -0.13 LYS 318
MET 1 0.24 PRO 92 -0.12 LYS 318
MET 1 0.24 ALA 93 -0.06 LYS 318
MET 1 0.26 SER 94 -0.03 GLY 310
MET 1 0.27 LYS 95 -0.06 ASN 6
MET 1 0.28 VAL 96 -0.04 ASN 6
MET 1 0.26 ILE 97 -0.06 ASN 6
ARG 3 0.27 ALA 98 -0.04 ASN 6
ARG 3 0.27 PHE 99 -0.08 ASN 6
ARG 3 0.24 GLY 100 -0.06 ASN 6
MET 1 0.24 GLY 101 -0.07 ASN 6
MET 1 0.26 CYS 102 -0.12 ASN 6
MET 1 0.25 ALA 103 -0.12 ASN 6
MET 1 0.23 ALA 104 -0.10 ASN 6
MET 1 0.24 GLN 105 -0.11 ASN 6
MET 1 0.25 LEU 106 -0.16 ASN 6
MET 1 0.23 TYR 107 -0.13 ASN 6
MET 1 0.22 PHE 108 -0.12 ASN 6
MET 1 0.23 PHE 109 -0.14 ASN 6
MET 1 0.22 HIS 110 -0.16 ASN 6
MET 1 0.21 PHE 111 -0.13 ASN 6
MET 1 0.20 LEU 112 -0.12 ASN 6
MET 1 0.21 GLY 113 -0.15 ASN 6
MET 1 0.20 SER 114 -0.16 ASN 6
MET 1 0.19 THR 115 -0.13 ASN 6
MET 1 0.19 GLN 116 -0.14 ASN 6
MET 1 0.18 CYS 117 -0.16 ASN 6
VAL 314 0.18 PHE 118 -0.14 ASN 6
VAL 314 0.19 LEU 119 -0.13 ASN 6
MET 1 0.17 TYR 120 -0.14 ASN 6
VAL 314 0.16 THR 121 -0.15 ASN 6
VAL 314 0.21 LEU 122 -0.13 ASN 6
VAL 314 0.18 MET 123 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.15 ALA 124 -0.14 ASN 6
VAL 314 0.19 TYR 125 -0.13 ASN 6
VAL 314 0.22 ASP 126 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.17 ARG 127 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.17 TYR 128 -0.13 ASN 6
VAL 314 0.21 LEU 129 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.21 ALA 130 -0.11 ASN 6
VAL 314 0.16 ILE 131 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.17 CYS 132 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.20 GLN 133 -0.12 ASN 6
VAL 314 0.21 PRO 134 -0.11 ASN 6
VAL 314 0.24 LEU 135 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.26 ARG 136 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.26 TYR 137 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.31 PRO 138 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.31 VAL 139 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.28 LEU 140 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.30 MET 141 -0.10 ASN 6
VAL 314 0.35 ASN 142 -0.08 ASN 6
VAL 314 0.39 GLY 143 -0.08 ASN 6
LYS 318 0.40 LYS 144 -0.07 ASN 6
LYS 318 0.34 LEU 145 -0.09 ASN 6
VAL 314 0.32 CYS 146 -0.09 ASN 6
LYS 318 0.36 THR 147 -0.08 ASN 6
LYS 318 0.35 ILE 148 -0.09 ASN 6
LYS 318 0.29 LEU 149 -0.10 ASN 6
LYS 318 0.29 VAL 150 -0.10 ASN 6
LYS 318 0.34 ALA 151 -0.09 ASN 6
LYS 318 0.30 GLY 152 -0.10 ASN 6
LYS 318 0.25 ALA 153 -0.12 ASN 6
LYS 318 0.28 TRP 154 -0.10 ASN 6
LYS 318 0.29 VAL 155 -0.11 ASN 6
LYS 318 0.24 ALA 156 -0.13 ASN 6
LYS 318 0.21 GLY 157 -0.13 ASN 6
LYS 318 0.24 SER 158 -0.12 ASN 6
LYS 318 0.24 ILE 159 -0.14 ASN 6
MET 1 0.20 HIS 160 -0.16 ASN 6
MET 1 0.21 GLY 161 -0.15 ASN 6
LYS 318 0.21 SER 162 -0.14 ASN 6
MET 1 0.21 ILE 163 -0.18 ASN 6
MET 1 0.24 GLN 164 -0.20 ASN 6
MET 1 0.24 ALA 165 -0.17 ASN 6
MET 1 0.23 THR 166 -0.18 ASN 6
MET 1 0.25 LEU 167 -0.23 ASN 6
MET 1 0.28 THR 168 -0.24 ASN 6
MET 1 0.27 PHE 169 -0.20 ASN 6
MET 1 0.25 ARG 170 -0.21 ASN 6
MET 1 0.29 LEU 171 -0.29 ASN 6
MET 1 0.32 PRO 172 -0.29 ASN 6
MET 1 0.35 TYR 173 -0.29 ASN 6
ARG 3 0.45 CYS 174 -0.35 SER 8
MET 1 0.44 GLY 175 -0.37 ASN 6
MET 1 0.42 PRO 176 -0.25 ASN 6
MET 1 0.36 LYS 177 -0.17 ASN 6
MET 1 0.37 GLU 178 -0.20 ASN 6
MET 1 0.35 VAL 179 -0.22 ASN 6
MET 1 0.35 ASP 180 -0.24 ASN 6
MET 1 0.31 TYR 181 -0.21 ASN 6
MET 1 0.28 PHE 182 -0.16 ASN 6
MET 1 0.28 PHE 183 -0.16 ASN 6
MET 1 0.28 CYS 184 -0.18 ASN 6
MET 1 0.29 ASP 185 -0.22 ASN 6
MET 1 0.29 ILE 186 -0.26 ASN 6
MET 1 0.32 PRO 187 -0.30 ASN 6
MET 1 0.34 ALA 188 -0.28 ASN 6
MET 1 0.34 VAL 189 -0.28 ASN 6
MET 1 0.35 LEU 190 -0.34 ASN 6
MET 1 0.41 ARG 191 -0.40 ASN 6
MET 1 0.41 LEU 192 -0.38 ASN 6
MET 1 0.39 ALA 193 -0.41 ASN 6
MET 1 0.43 CYS 194 -0.54 ASN 6
MET 1 0.38 ALA 195 -0.51 ASN 6
MET 1 0.37 ASP 196 -0.50 ASN 6
MET 1 0.34 THR 197 -0.42 ASN 6
MET 1 0.31 THR 198 -0.41 ASN 6
MET 1 0.26 VAL 199 -0.35 ASN 6
MET 1 0.27 ASN 200 -0.32 ASN 6
MET 1 0.29 GLU 201 -0.34 ASN 6
MET 1 0.25 LEU 202 -0.32 ASN 6
MET 1 0.23 VAL 203 -0.28 ASN 6
MET 1 0.25 THR 204 -0.27 ASN 6
MET 1 0.24 PHE 205 -0.28 ASN 6
MET 1 0.21 VAL 206 -0.26 ASN 6
MET 1 0.21 ASP 207 -0.23 ASN 6
MET 1 0.22 ILE 208 -0.23 ASN 6
MET 1 0.21 GLY 209 -0.24 ASN 6
MET 1 0.19 VAL 210 -0.22 ASN 6
MET 1 0.19 VAL 211 -0.20 ASN 6
MET 1 0.19 ALA 212 -0.20 ASN 6
MET 1 0.18 ALA 213 -0.21 ASN 6
MET 1 0.17 SER 214 -0.19 ASN 6
MET 1 0.17 CYS 215 -0.17 ASN 6
MET 1 0.17 PHE 216 -0.18 ASN 6
MET 1 0.16 MET 217 -0.19 ASN 6
MET 1 0.15 LEU 218 -0.17 ASN 6
MET 1 0.15 ILE 219 -0.16 ASN 6
MET 1 0.15 LEU 220 -0.17 ASN 6
MET 1 0.14 LEU 221 -0.17 ASN 6
MET 1 0.14 SER 222 -0.15 ASN 6
MET 1 0.14 TYR 223 -0.15 ASN 6
MET 1 0.13 ALA 224 -0.16 ASN 6
MET 1 0.13 ASN 225 -0.15 ASN 6
MET 1 0.13 ILE 226 -0.14 ASN 6
MET 1 0.13 VAL 227 -0.14 ASN 6
MET 1 0.12 HIS 228 -0.14 ASN 6
MET 1 0.12 ALA 229 -0.13 ASN 6
MET 1 0.12 ILE 230 -0.13 ASN 6
MET 1 0.12 LEU 231 -0.13 ASN 6
MET 1 0.11 LYS 232 -0.13 ASN 6
MET 1 0.11 ILE 233 -0.12 ASN 6
MET 1 0.11 ARG 234 -0.11 ASN 6
MET 1 0.11 THR 235 -0.11 ASN 6
MET 1 0.12 ALA 236 -0.12 GLY 316
MET 1 0.12 ASP 237 -0.12 GLY 316
MET 1 0.12 GLY 238 -0.11 ASN 6
MET 1 0.12 ARG 239 -0.12 ASN 6
MET 1 0.13 LYS 240 -0.13 GLY 316
MET 1 0.13 ARG 241 -0.11 ASN 6
MET 1 0.13 ALA 242 -0.12 ASN 6
MET 1 0.13 PHE 243 -0.12 ASN 6
MET 1 0.14 SER 244 -0.12 ARG 312
MET 1 0.14 THR 245 -0.12 ASN 6
MET 1 0.14 CYS 246 -0.13 ASN 6
MET 1 0.15 GLY 247 -0.13 ASN 6
MET 1 0.15 SER 248 -0.13 ASN 6
MET 1 0.16 HIS 249 -0.13 ASN 6
MET 1 0.16 LEU 250 -0.15 ASN 6
MET 1 0.16 THR 251 -0.15 ASN 6
MET 1 0.17 VAL 252 -0.14 ASN 6
MET 1 0.17 VAL 253 -0.16 ASN 6
MET 1 0.18 THR 254 -0.17 ASN 6
MET 1 0.19 VAL 255 -0.16 ASN 6
MET 1 0.19 TYR 256 -0.17 ASN 6
MET 1 0.19 TYR 257 -0.19 ASN 6
MET 1 0.20 VAL 258 -0.20 ASN 6
MET 1 0.21 PRO 259 -0.20 ASN 6
MET 1 0.22 CYS 260 -0.21 ASN 6
MET 1 0.21 ILE 261 -0.23 ASN 6
MET 1 0.22 PHE 262 -0.23 ASN 6
MET 1 0.24 ILE 263 -0.25 ASN 6
MET 1 0.24 TYR 264 -0.27 ASN 6
MET 1 0.23 LEU 265 -0.27 ASN 6
MET 1 0.25 ARG 266 -0.28 ASN 6
MET 1 0.27 ALA 267 -0.31 ASN 6
MET 1 0.30 GLY 268 -0.34 ASN 6
MET 1 0.30 SER 269 -0.31 ASN 6
MET 1 0.33 LYS 270 -0.31 ASN 6
MET 1 0.30 SER 271 -0.26 ASN 6
MET 1 0.29 PRO 272 -0.23 ASN 6
MET 1 0.27 PHE 273 -0.22 ASN 6
MET 1 0.27 ASP 274 -0.23 ASN 6
MET 1 0.27 GLY 275 -0.21 ASN 6
MET 1 0.25 ALA 276 -0.19 ASN 6
MET 1 0.24 VAL 277 -0.20 ASN 6
MET 1 0.25 ALA 278 -0.19 ASN 6
MET 1 0.24 VAL 279 -0.16 ASN 6
MET 1 0.22 PHE 280 -0.16 ASN 6
MET 1 0.22 TYR 281 -0.17 ASN 6
MET 1 0.22 THR 282 -0.15 ASN 6
MET 1 0.22 VAL 283 -0.13 ASN 6
MET 1 0.20 VAL 284 -0.13 ASN 6
MET 1 0.20 THR 285 -0.14 ASN 6
MET 1 0.19 PRO 286 -0.12 ASN 6
MET 1 0.19 LEU 287 -0.12 GLY 316
MET 1 0.18 LEU 288 -0.14 GLY 316
MET 1 0.18 ASN 289 -0.11 ASN 6
MET 1 0.17 PRO 290 -0.12 ARG 308
MET 1 0.17 LEU 291 -0.18 GLY 316
MET 1 0.16 ILE 292 -0.15 GLY 316
MET 1 0.16 TYR 293 -0.11 ARG 308
MET 1 0.16 THR 294 -0.15 ARG 308
MET 1 0.15 LEU 295 -0.22 ARG 312
MET 1 0.15 ARG 296 -0.17 ARG 312
MET 1 0.14 ASN 297 -0.11 ARG 312
MET 1 0.14 GLN 298 -0.13 ARG 312
GLY 310 0.15 GLU 299 -0.08 ASN 6
MET 1 0.14 VAL 300 -0.08 ARG 308
MET 1 0.14 LYS 301 -0.17 ARG 312
MET 1 0.14 SER 302 -0.10 ARG 312
GLY 310 0.20 ALA 303 -0.06 ASN 6
MET 1 0.14 LEU 304 -0.11 ARG 308
MET 1 0.14 LYS 305 -0.19 ALA 309
GLY 310 0.24 ARG 306 -0.06 LEU 295
ALA 55 0.22 LEU 307 -0.08 LEU 295
ALA 55 0.17 ARG 308 -0.19 LEU 295
ALA 55 0.15 ALA 309 -0.19 LYS 305
ASP 56 0.40 GLY 310 -0.12 LEU 37
ALA 55 0.51 ARG 311 -0.17 LEU 37
ALA 55 0.33 ARG 312 -0.22 LEU 295
PRO 57 0.39 ASP 313 -0.15 PHE 30
PRO 57 0.58 VAL 314 -0.20 PHE 30
ALA 55 0.44 ASP 315 -0.25 PHE 30
PRO 57 0.35 GLY 316 -0.23 PHE 30
PRO 57 0.46 GLU 317 -0.23 PHE 30
PRO 57 0.44 LYS 318 -0.28 PHE 30

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.