*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2502032111431911249.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2502032111431911249.atom to be opened.
Openam> File opened: 2502032111431911249.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 849
First residue number = 1
Last residue number = 849
Number of atoms found = 8455
Mean number per residue = 10.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -15.108406 +/- 29.133313 From: -81.063000 To: 72.709000
= -2.189908 +/- 20.991769 From: -64.834000 To: 51.091000
= 9.694843 +/- 29.440033 From: -56.352000 To: 81.045000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.7869 % Filled.
Pdbmat> 2531450 non-zero elements.
Pdbmat> 275685 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 65.21 +/- 34.18
Maximum number = 171
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 5.513700E+06
Pdbmat> Larger element = 640.480
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
849 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2502032111431911249.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2502032111431911249.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2502032111431911249.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8455 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 849 residues.
Blocpdb> 42 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 57 atoms in block 2
Block first atom: 43
Blocpdb> 54 atoms in block 3
Block first atom: 100
Blocpdb> 42 atoms in block 4
Block first atom: 154
Blocpdb> 47 atoms in block 5
Block first atom: 196
Blocpdb> 42 atoms in block 6
Block first atom: 243
Blocpdb> 35 atoms in block 7
Block first atom: 285
Blocpdb> 51 atoms in block 8
Block first atom: 320
Blocpdb> 40 atoms in block 9
Block first atom: 371
Blocpdb> 42 atoms in block 10
Block first atom: 411
Blocpdb> 43 atoms in block 11
Block first atom: 453
Blocpdb> 44 atoms in block 12
Block first atom: 496
Blocpdb> 60 atoms in block 13
Block first atom: 540
Blocpdb> 52 atoms in block 14
Block first atom: 600
Blocpdb> 52 atoms in block 15
Block first atom: 652
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 704
Blocpdb> 41 atoms in block 17
Block first atom: 742
Blocpdb> 40 atoms in block 18
Block first atom: 783
Blocpdb> 48 atoms in block 19
Block first atom: 823
Blocpdb> 61 atoms in block 20
Block first atom: 871
Blocpdb> 64 atoms in block 21
Block first atom: 932
Blocpdb> 43 atoms in block 22
Block first atom: 996
Blocpdb> 53 atoms in block 23
Block first atom: 1039
Blocpdb> 39 atoms in block 24
Block first atom: 1092
Blocpdb> 39 atoms in block 25
Block first atom: 1131
Blocpdb> 42 atoms in block 26
Block first atom: 1170
Blocpdb> 51 atoms in block 27
Block first atom: 1212
Blocpdb> 66 atoms in block 28
Block first atom: 1263
Blocpdb> 45 atoms in block 29
Block first atom: 1329
Blocpdb> 63 atoms in block 30
Block first atom: 1374
Blocpdb> 61 atoms in block 31
Block first atom: 1437
Blocpdb> 56 atoms in block 32
Block first atom: 1498
Blocpdb> 53 atoms in block 33
Block first atom: 1554
Blocpdb> 43 atoms in block 34
Block first atom: 1607
Blocpdb> 38 atoms in block 35
Block first atom: 1650
Blocpdb> 49 atoms in block 36
Block first atom: 1688
Blocpdb> 46 atoms in block 37
Block first atom: 1737
Blocpdb> 54 atoms in block 38
Block first atom: 1783
Blocpdb> 69 atoms in block 39
Block first atom: 1837
Blocpdb> 53 atoms in block 40
Block first atom: 1906
Blocpdb> 42 atoms in block 41
Block first atom: 1959
Blocpdb> 49 atoms in block 42
Block first atom: 2001
Blocpdb> 60 atoms in block 43
Block first atom: 2050
Blocpdb> 61 atoms in block 44
Block first atom: 2110
Blocpdb> 46 atoms in block 45
Block first atom: 2171
Blocpdb> 59 atoms in block 46
Block first atom: 2217
Blocpdb> 62 atoms in block 47
Block first atom: 2276
Blocpdb> 52 atoms in block 48
Block first atom: 2338
Blocpdb> 41 atoms in block 49
Block first atom: 2390
Blocpdb> 51 atoms in block 50
Block first atom: 2431
Blocpdb> 45 atoms in block 51
Block first atom: 2482
Blocpdb> 41 atoms in block 52
Block first atom: 2527
Blocpdb> 45 atoms in block 53
Block first atom: 2568
Blocpdb> 39 atoms in block 54
Block first atom: 2613
Blocpdb> 38 atoms in block 55
Block first atom: 2652
Blocpdb> 42 atoms in block 56
Block first atom: 2690
Blocpdb> 72 atoms in block 57
Block first atom: 2732
Blocpdb> 73 atoms in block 58
Block first atom: 2804
Blocpdb> 51 atoms in block 59
Block first atom: 2877
Blocpdb> 40 atoms in block 60
Block first atom: 2928
Blocpdb> 60 atoms in block 61
Block first atom: 2968
Blocpdb> 44 atoms in block 62
Block first atom: 3028
Blocpdb> 36 atoms in block 63
Block first atom: 3072
Blocpdb> 38 atoms in block 64
Block first atom: 3108
Blocpdb> 54 atoms in block 65
Block first atom: 3146
Blocpdb> 43 atoms in block 66
Block first atom: 3200
Blocpdb> 43 atoms in block 67
Block first atom: 3243
Blocpdb> 44 atoms in block 68
Block first atom: 3286
Blocpdb> 44 atoms in block 69
Block first atom: 3330
Blocpdb> 63 atoms in block 70
Block first atom: 3374
Blocpdb> 33 atoms in block 71
Block first atom: 3437
Blocpdb> 43 atoms in block 72
Block first atom: 3470
Blocpdb> 40 atoms in block 73
Block first atom: 3513
Blocpdb> 36 atoms in block 74
Block first atom: 3553
Blocpdb> 53 atoms in block 75
Block first atom: 3589
Blocpdb> 49 atoms in block 76
Block first atom: 3642
Blocpdb> 40 atoms in block 77
Block first atom: 3691
Blocpdb> 47 atoms in block 78
Block first atom: 3731
Blocpdb> 45 atoms in block 79
Block first atom: 3778
Blocpdb> 43 atoms in block 80
Block first atom: 3823
Blocpdb> 37 atoms in block 81
Block first atom: 3866
Blocpdb> 41 atoms in block 82
Block first atom: 3903
Blocpdb> 57 atoms in block 83
Block first atom: 3944
Blocpdb> 49 atoms in block 84
Block first atom: 4001
Blocpdb> 49 atoms in block 85
Block first atom: 4050
Blocpdb> 44 atoms in block 86
Block first atom: 4099
Blocpdb> 48 atoms in block 87
Block first atom: 4143
Blocpdb> 55 atoms in block 88
Block first atom: 4191
Blocpdb> 45 atoms in block 89
Block first atom: 4246
Blocpdb> 60 atoms in block 90
Block first atom: 4291
Blocpdb> 57 atoms in block 91
Block first atom: 4351
Blocpdb> 45 atoms in block 92
Block first atom: 4408
Blocpdb> 46 atoms in block 93
Block first atom: 4453
Blocpdb> 35 atoms in block 94
Block first atom: 4499
Blocpdb> 60 atoms in block 95
Block first atom: 4534
Blocpdb> 60 atoms in block 96
Block first atom: 4594
Blocpdb> 62 atoms in block 97
Block first atom: 4654
Blocpdb> 63 atoms in block 98
Block first atom: 4716
Blocpdb> 67 atoms in block 99
Block first atom: 4779
Blocpdb> 48 atoms in block 100
Block first atom: 4846
Blocpdb> 58 atoms in block 101
Block first atom: 4894
Blocpdb> 56 atoms in block 102
Block first atom: 4952
Blocpdb> 43 atoms in block 103
Block first atom: 5008
Blocpdb> 44 atoms in block 104
Block first atom: 5051
Blocpdb> 40 atoms in block 105
Block first atom: 5095
Blocpdb> 52 atoms in block 106
Block first atom: 5135
Blocpdb> 62 atoms in block 107
Block first atom: 5187
Blocpdb> 69 atoms in block 108
Block first atom: 5249
Blocpdb> 53 atoms in block 109
Block first atom: 5318
Blocpdb> 51 atoms in block 110
Block first atom: 5371
Blocpdb> 42 atoms in block 111
Block first atom: 5422
Blocpdb> 46 atoms in block 112
Block first atom: 5464
Blocpdb> 70 atoms in block 113
Block first atom: 5510
Blocpdb> 45 atoms in block 114
Block first atom: 5580
Blocpdb> 47 atoms in block 115
Block first atom: 5625
Blocpdb> 47 atoms in block 116
Block first atom: 5672
Blocpdb> 48 atoms in block 117
Block first atom: 5719
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 5767
Blocpdb> 43 atoms in block 119
Block first atom: 5815
Blocpdb> 51 atoms in block 120
Block first atom: 5858
Blocpdb> 41 atoms in block 121
Block first atom: 5909
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 5950
Blocpdb> 58 atoms in block 123
Block first atom: 5988
Blocpdb> 48 atoms in block 124
Block first atom: 6046
Blocpdb> 45 atoms in block 125
Block first atom: 6094
Blocpdb> 42 atoms in block 126
Block first atom: 6139
Blocpdb> 51 atoms in block 127
Block first atom: 6181
Blocpdb> 53 atoms in block 128
Block first atom: 6232
Blocpdb> 48 atoms in block 129
Block first atom: 6285
Blocpdb> 53 atoms in block 130
Block first atom: 6333
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 6386
Blocpdb> 53 atoms in block 132
Block first atom: 6427
Blocpdb> 39 atoms in block 133
Block first atom: 6480
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 6519
Blocpdb> 44 atoms in block 135
Block first atom: 6577
Blocpdb> 43 atoms in block 136
Block first atom: 6621
Blocpdb> 51 atoms in block 137
Block first atom: 6664
Blocpdb> 45 atoms in block 138
Block first atom: 6715
Blocpdb> 56 atoms in block 139
Block first atom: 6760
Blocpdb> 40 atoms in block 140
Block first atom: 6816
Blocpdb> 46 atoms in block 141
Block first atom: 6856
Blocpdb> 49 atoms in block 142
Block first atom: 6902
Blocpdb> 51 atoms in block 143
Block first atom: 6951
Blocpdb> 47 atoms in block 144
Block first atom: 7002
Blocpdb> 60 atoms in block 145
Block first atom: 7049
Blocpdb> 41 atoms in block 146
Block first atom: 7109
Blocpdb> 53 atoms in block 147
Block first atom: 7150
Blocpdb> 56 atoms in block 148
Block first atom: 7203
Blocpdb> 60 atoms in block 149
Block first atom: 7259
Blocpdb> 47 atoms in block 150
Block first atom: 7319
Blocpdb> 70 atoms in block 151
Block first atom: 7366
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 7436
Blocpdb> 34 atoms in block 153
Block first atom: 7482
Blocpdb> 50 atoms in block 154
Block first atom: 7516
Blocpdb> 70 atoms in block 155
Block first atom: 7566
Blocpdb> 46 atoms in block 156
Block first atom: 7636
Blocpdb> 42 atoms in block 157
Block first atom: 7682
Blocpdb> 51 atoms in block 158
Block first atom: 7724
Blocpdb> 41 atoms in block 159
Block first atom: 7775
Blocpdb> 70 atoms in block 160
Block first atom: 7816
Blocpdb> 65 atoms in block 161
Block first atom: 7886
Blocpdb> 51 atoms in block 162
Block first atom: 7951
Blocpdb> 53 atoms in block 163
Block first atom: 8002
Blocpdb> 62 atoms in block 164
Block first atom: 8055
Blocpdb> 64 atoms in block 165
Block first atom: 8117
Blocpdb> 61 atoms in block 166
Block first atom: 8181
Blocpdb> 57 atoms in block 167
Block first atom: 8242
Blocpdb> 57 atoms in block 168
Block first atom: 8299
Blocpdb> 61 atoms in block 169
Block first atom: 8356
Blocpdb> 39 atoms in block 170
Block first atom: 8416
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 73 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2531620 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 25365
Prepmat> Matrix trace = 5513700.0000
Prepmat> Last element read: 25365 25365 59.5824
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 13757 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8455
RTB> Total mass = 8455.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8455
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 109942.6664
RTB> 25458 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 25458
Diagstd> Projected matrix trace = 109942.6664
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 109942.6664
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000850 0.0001294 0.0002184 0.0002607
0.0004582 0.0005556 0.0005647 0.0006866 0.0007708
0.0010908 0.0011598 0.0012950 0.0016240 0.0016779
0.0018154 0.0019114 0.0025381 0.0028371 0.0029116
0.0032908 0.0038585 0.0041848 0.0045568 0.0050952
0.0055119 0.0056180 0.0063561 0.0068878 0.0074142
0.0086288 0.0101589 0.0123798 0.0131322 0.0143807
0.0158085 0.0168889 0.0185541 0.0209882 0.0222750
0.0256886 0.0263272 0.0269807 0.0280403 0.0289645
0.0318738 0.0344949 0.0355395 0.0370759 0.0446037
0.0480041 0.0501024 0.0588502 0.0591578 0.0628776
0.0683358 0.0758001 0.0783478 0.0831686 0.0863203
0.0887294 0.1103588 0.1142188 0.1191058 0.1210833
0.1284389 0.1369579 0.1411740 0.1501203 0.1540625
0.1589903 0.1638633 0.1894919 0.1970855 0.1982098
0.2117767 0.2137883 0.2220801 0.2274712 0.2436599
0.2490901 0.2596460 0.2748556 0.3012653 0.3061382
0.3130366 0.3358672 0.3480444 0.3569785 0.3750902
0.3893851 0.3945910 0.3999145 0.4130146 0.4227853
0.4315326 0.4709105 0.4844113 0.5096911 0.5354368
0.5421172
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340
0.0034340 1.0009149 1.2353347 1.6047833 1.7535016
2.3245866 2.5596970 2.5804190 2.8454654 3.0148260
3.5864556 3.6981832 3.9077427 4.3761393 4.4481254
4.6268157 4.7475638 5.4708209 5.7840774 5.8595457
6.2293759 6.7453493 7.0248058 7.3303796 7.7513344
8.0620341 8.1393143 8.6574340 9.0122768 9.3503433
10.0872227 10.9450511 12.0823781 12.4441170 13.0222466
13.6534043 14.1122360 14.7916195 15.7319674 16.2070640
17.4046682 17.6196709 17.8369930 18.1838981 18.4811168
19.3870850 20.1684525 20.4715650 20.9093681 22.9340507
23.7921919 24.3066134 26.3432508 26.4120054 27.2297294
28.3869900 29.8971731 30.3954483 31.3166181 31.9044880
32.3466391 36.0743637 36.6998371 37.4767299 37.7865676
38.9173772 40.1872971 40.8011657 42.0741155 42.6229702
43.2992659 43.9578230 47.2705427 48.2083898 48.3457013
49.9728758 50.2096579 51.1740895 51.7914945 53.6027783
54.1967866 55.3332406 56.9308410 59.6032355 60.0833397
60.7565142 62.9330953 64.0637825 64.8808194 66.5063530
67.7617988 68.2132681 68.6718698 69.7875571 70.6082091
71.3349061 74.5185618 75.5792207 77.5262586 79.4601533
79.9543072
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8455
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2275E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6327E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8964E-02
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.8729E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1211
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1412
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1971
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1982
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3061
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3946
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3999
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4228
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4315
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4709
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5097
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5354
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5421
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 0.99998
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1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 152190 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 0.99995 0.99997
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1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002
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1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 0.99998
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001 1.00002 0.99997 1.00005 0.99997
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1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99996
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0.99997 1.00004 1.00001 0.99996 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003
1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2502032111431911249.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2502032111431911249.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2502032111431911249.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2502032111431911249.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 849
First residue number = 1
Last residue number = 849
Number of atoms found = 8455
Mean number per residue = 10.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4958E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2941E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1839E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6075E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5825E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5563E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6466E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8662E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7079E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0908E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1598E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2950E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6240E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6779E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8154E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9114E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5381E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8371E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9116E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2908E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8585E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1848E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5568E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0952E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5119E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6180E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3561E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8878E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4142E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6288E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0159E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3132E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4381E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2878E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8336E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5800E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8348E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3169E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6320E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.8729E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1142
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1211
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1639
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1895
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1971
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1982
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2118
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2221
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3061
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3570
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3894
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4709
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5097
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5354
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5421
Bfactors> 106 vectors, 25365 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000085
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 85.181 +/- 125.89
Bfactors> = 99.990 +/- NaN
Bfactors> Shiftng-fct= 14.809
Bfactors> Scaling-fct= NaN
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2502032111431911249.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2502032111431911249.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.001
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.605
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.324
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.580
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.845
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.015
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.586
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.698
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.908
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.448
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.747
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.471
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.784
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.859
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.229
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.745
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.024
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.139
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.657
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.95
Chkmod> 106 vectors, 25365 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8455 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6751
0.0034 0.7583
0.0034 0.9343
0.0034 0.7188
0.0034 0.8605
0.0034 0.8640
1.0009 0.2019
1.2353 0.3887
1.6047 0.1590
1.7534 0.5397
2.3245 0.2052
2.5596 0.3272
2.5803 0.1230
2.8453 0.1633
3.0147 0.3495
3.5863 0.4824
3.6980 0.3220
3.9076 0.4990
4.3759 0.3913
4.4479 0.2707
4.6266 0.1034
4.7474 0.3088
5.4706 0.3441
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MODEL 7 will be plotted
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getting mode 11
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generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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2502032111431911249.11.pdb
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2502032111431911249.8.pdb
2502032111431911249.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m37.919s
user 0m37.778s
sys 0m0.088s
rm: cannot remove '2502032111431911249.sdijf': No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG
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