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LOGs for ID: 2502031614181658725

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2502031614181658725.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2502031614181658725.atom to be opened. Openam> File opened: 2502031614181658725.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 379 First residue number = 512 Last residue number = 16 Number of atoms found = 2948 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 7.428640 +/- 11.468212 From: -24.717000 To: 31.627000 = 5.481211 +/- 19.133159 From: -31.425000 To: 37.143000 = 23.018243 +/- 27.185703 From: -28.881000 To: 75.607000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6279 % Filled. Pdbmat> 1027850 non-zero elements. Pdbmat> 112263 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.16 +/- 22.75 Maximum number = 122 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 2.245260E+06 Pdbmat> Larger element = 482.196 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 379 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2502031614181658725.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2502031614181658725.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2502031614181658725.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2948 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 379 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 35 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 50 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 69 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 86 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 101 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 118 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 133 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 148 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 167 Blocpdb> 8 atoms in block 12 Block first atom: 183 Blocpdb> 20 atoms in block 13 Block first atom: 191 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 211 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 229 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 252 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 267 Blocpdb> 18 atoms in block 18 Block first atom: 280 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 298 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 310 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 321 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 333 Blocpdb> 13 atoms in block 23 Block first atom: 349 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 362 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 380 Blocpdb> 13 atoms in block 26 Block first atom: 396 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 409 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 426 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 440 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 456 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 468 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 500 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 519 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 536 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 553 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 567 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 586 Blocpdb> 11 atoms in block 39 Block first atom: 603 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 614 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 629 Blocpdb> 10 atoms in block 42 Block first atom: 650 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 660 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 677 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 690 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 705 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 723 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 736 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 752 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 767 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 786 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 803 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 818 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 835 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 850 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 865 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 884 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 900 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 908 Blocpdb> 18 atoms in block 60 Block first atom: 928 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 946 Blocpdb> 15 atoms in block 62 Block first atom: 961 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 976 Blocpdb> 18 atoms in block 64 Block first atom: 989 Blocpdb> 12 atoms in block 65 Block first atom: 1007 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 1019 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1030 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1042 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1058 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1071 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1089 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1105 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1118 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1135 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1149 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1165 Blocpdb> 27 atoms in block 77 Block first atom: 1177 Blocpdb> 13 atoms in block 78 Block first atom: 1204 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1217 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1236 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1253 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1270 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1284 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1303 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 1320 Blocpdb> 6 atoms in block 86 Block first atom: 1331 Blocpdb> 10 atoms in block 87 Block first atom: 1337 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1347 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1364 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1380 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1395 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1413 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1430 Blocpdb> 15 atoms in block 94 Block first atom: 1446 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1461 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1477 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1496 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1512 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1529 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1541 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1563 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1578 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1593 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1606 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1622 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 1639 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1652 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1666 Blocpdb> 17 atoms in block 109 Block first atom: 1681 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1698 Blocpdb> 11 atoms in block 111 Block first atom: 1710 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 1721 Blocpdb> 13 atoms in block 113 Block first atom: 1735 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1748 Blocpdb> 14 atoms in block 115 Block first atom: 1762 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1776 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1795 Blocpdb> 12 atoms in block 118 Block first atom: 1812 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1824 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1840 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1855 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1871 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1886 Blocpdb> 14 atoms in block 124 Block first atom: 1902 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 1916 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 1933 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1951 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 1967 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 1982 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2001 Blocpdb> 12 atoms in block 131 Block first atom: 2015 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 2027 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 2044 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2068 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 2083 Blocpdb> 8 atoms in block 136 Block first atom: 2101 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2109 Blocpdb> 15 atoms in block 138 Block first atom: 2125 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2140 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 2156 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2175 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2191 Blocpdb> 12 atoms in block 143 Block first atom: 2208 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 2220 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2242 Blocpdb> 15 atoms in block 146 Block first atom: 2257 Blocpdb> 13 atoms in block 147 Block first atom: 2272 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2285 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2301 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2318 Blocpdb> 14 atoms in block 151 Block first atom: 2331 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2345 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2360 Blocpdb> 12 atoms in block 154 Block first atom: 2377 Blocpdb> 11 atoms in block 155 Block first atom: 2389 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2400 Blocpdb> 13 atoms in block 157 Block first atom: 2414 Blocpdb> 14 atoms in block 158 Block first atom: 2427 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2441 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 2455 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 2474 Blocpdb> 12 atoms in block 162 Block first atom: 2491 Blocpdb> 16 atoms in block 163 Block first atom: 2503 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2519 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2534 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2550 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2565 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2581 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 2595 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 2612 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2630 Blocpdb> 15 atoms in block 172 Block first atom: 2646 Blocpdb> 19 atoms in block 173 Block first atom: 2661 Blocpdb> 14 atoms in block 174 Block first atom: 2680 Blocpdb> 12 atoms in block 175 Block first atom: 2694 Blocpdb> 9 atoms in block 176 Block first atom: 2706 Blocpdb> 13 atoms in block 177 Block first atom: 2715 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2728 Blocpdb> 16 atoms in block 179 Block first atom: 2744 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 2760 Blocpdb> 15 atoms in block 181 Block first atom: 2778 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2793 Blocpdb> 14 atoms in block 183 Block first atom: 2810 Blocpdb> 8 atoms in block 184 Block first atom: 2824 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 2832 Blocpdb> 14 atoms in block 186 Block first atom: 2849 Blocpdb> 8 atoms in block 187 Block first atom: 2863 Blocpdb> 17 atoms in block 188 Block first atom: 2871 Blocpdb> 14 atoms in block 189 Block first atom: 2888 Blocpdb> 8 atoms in block 190 Block first atom: 2902 Blocpdb> 17 atoms in block 191 Block first atom: 2910 Blocpdb> 14 atoms in block 192 Block first atom: 2927 Blocpdb> 8 atoms in block 193 Block first atom: 2940 Blocpdb> 193 blocks. Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1028043 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8844 Prepmat> Matrix trace = 2245260.0000 Prepmat> Last element read: 8844 8844 264.7165 Prepmat> 18722 lines saved. Prepmat> 16779 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2948 RTB> Total mass = 2948.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2948 RTB> Number of blocks = 193 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 247185.7548 RTB> 67017 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1158 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67017 Diagstd> Projected matrix trace = 247185.7548 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1158 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 247185.7548 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 %Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ? Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7557796 0.9037433 1.1079802 1.5713451 1.9863488 3.1216270 4.9891650 5.4039396 6.6174490 6.9718075 7.0356383 7.7155961 8.2349054 10.6124464 11.0910811 11.4254793 11.6419775 11.7834555 11.9427228 12.1981283 13.2141251 13.3631538 13.7084937 14.8052617 14.9441451 15.5688937 15.6660355 17.0638772 17.4253843 17.5973736 17.9328726 18.5030434 20.1521167 20.7918826 20.9036211 21.6566463 21.8540512 22.4092715 22.4520471 23.1968373 23.7905919 24.0784367 24.4520026 24.9099369 26.0617761 26.5133645 26.9162763 28.2992845 29.1044880 29.1845573 29.3159624 30.0685670 31.3329968 31.9652450 32.2562458 32.4208900 33.1059145 33.2176884 33.5581518 33.9501085 33.9960698 34.4460506 34.4869212 34.9006360 35.7017978 35.9445380 36.4951849 36.8062859 37.1809518 37.6814066 38.0685994 38.5920625 38.8905276 39.0714835 39.4975356 39.6562548 39.8708517 40.4891681 40.8413186 41.0110411 41.8388636 42.5673005 42.6476560 43.7043420 44.0225571 44.1608911 45.0922584 45.1571917 45.5853132 46.1904102 46.5956142 47.0172458 47.8217955 48.7087872 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034331 0.0034336 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034341 0.0034343 0.0034344 0.0034345 0.0034347 0.0034349 94.4045364 103.2328310 114.3039588 136.1228588 153.0463707 191.8605952 242.5544306 252.4355544 279.3447941 286.7265934 288.0361737 301.6338127 311.6194729 353.7553656 361.6447967 367.0561405 370.5174425 372.7619837 375.2726864 379.2642251 394.7430451 396.9627579 402.0593334 417.8335656 419.7887714 428.4736872 429.8083350 448.5740423 453.3007762 455.5323322 459.8542582 467.1075257 487.4786675 495.1561616 496.4848984 505.3483854 507.6463387 514.0544811 514.5448699 523.0096094 529.6608880 532.8554647 536.9730595 541.9779203 554.3668912 559.1491918 563.3817433 577.6742479 585.8349288 586.6402201 587.9594278 595.4587011 607.8497571 613.9518308 616.7401045 618.3121018 624.8101484 625.8640181 629.0632259 632.7262657 633.1544102 637.3309339 637.7089215 641.5225861 648.8440455 651.0460876 656.0139346 658.8040763 662.1487020 666.5900598 670.0060587 674.5967975 677.2003872 678.7740509 682.4648369 683.8346907 685.6824543 690.9787746 693.9771293 695.4175991 702.4011598 708.4893642 709.1577666 717.8894539 720.4982213 721.6293602 729.1993514 729.7241897 733.1751758 738.0251975 741.2552810 744.6014423 750.9451544 757.8773687 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2948 Rtb_to_modes> Number of blocs = 193 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9037 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.617 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.71 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1158 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00004 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00004 1.00002 1.00002 0.99996 0.99997 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 53064 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00004 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00004 1.00002 1.00002 0.99996 0.99997 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502031614181658725.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502031614181658725.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2502031614181658725.atom Openam> file on opening on unit 11: 2502031614181658725.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 379 First residue number = 512 Last residue number = 16 Number of atoms found = 2948 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9037 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.617 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.71 Bfactors> 106 vectors, 8844 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 12 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.755800 Bfactors> 94 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.644 for 382 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.041 +/- 0.04 Bfactors> = 48.100 +/- 13.32 Bfactors> Shiftng-fct= 48.058 Bfactors> Scaling-fct= 377.204 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502031614181658725.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502031614181658725.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 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Chkmod> That is: 2948 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 48 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.3830 0.0034 0.7334 0.0034 0.8161 0.0034 0.8065 0.0034 0.4796 0.0034 0.4940 0.0034 0.6996 0.0034 0.5638 0.0034 0.7842 0.0034 0.4409 0.0034 0.4523 0.0034 0.6475 94.4018 0.3634 103.2259 0.3630 114.3001 0.3667 136.1021 0.3740 153.0264 0.3715 191.8638 0.3725 242.5400 0.1456 252.4261 0.3070 279.3233 0.3478 286.7182 0.3134 288.0312 0.2598 301.6288 0.0920 311.6079 0.3546 353.6994 0.0636 361.6116 0.0458 367.1130 0.0550 370.4701 0.1330 372.6913 0.0905 375.2138 0.1219 379.2770 0.0658 394.6645 0.0808 396.8989 0.0830 402.0642 0.1565 417.8825 0.0899 419.7125 0.0781 428.4705 0.1131 429.8443 0.1028 448.5038 0.1026 453.3413 0.1732 455.5468 0.1142 459.7977 0.1046 467.0491 0.1679 487.4321 0.0910 495.1125 0.1064 496.4206 0.0791 505.3658 0.1966 507.5775 0.1357 514.0408 0.2299 514.4993 0.2164 523.0228 0.1818 529.6316 0.1205 532.8499 0.0398 536.9280 0.1220 541.9553 0.1412 554.3242 0.0834 559.0897 0.0752 563.3965 0.0922 577.6568 0.2137 585.7646 0.1626 586.5692 0.1670 587.9747 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models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502031614181658725.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502031614181658725.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2502031614181658725 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502031614181658725.eigenfacs 2502031614181658725.atom making animated gifs 11 models are in 2502031614181658725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502031614181658725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2502031614181658725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making 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