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LOGs for ID: 250201224349801369

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 250201224349801369.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 250201224349801369.atom to be opened. Openam> File opened: 250201224349801369.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 929 First residue number = 9 Last residue number = 324 Number of atoms found = 6507 Mean number per residue = 7.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -26.075224 +/- 13.686518 From: -55.376000 To: 15.840000 = -9.634611 +/- 25.251106 From: -69.692000 To: 45.881000 = 17.952864 +/- 17.845596 From: -23.405000 To: 58.514000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1315 % Filled. Pdbmat> 2155989 non-zero elements. Pdbmat> 235253 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 72.31 +/- 21.05 Maximum number = 124 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 4.705060E+06 Pdbmat> Larger element = 481.995 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 929 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 250201224349801369.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 250201224349801369.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 250201224349801369.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6507 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 929 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 73 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 104 Blocpdb> 26 atoms in block 5 Block first atom: 137 Blocpdb> 40 atoms in block 6 Block first atom: 163 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 203 Blocpdb> 40 atoms in block 8 Block first atom: 238 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 278 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 310 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 346 Blocpdb> 38 atoms in block 12 Block first atom: 373 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 411 Blocpdb> 40 atoms in block 14 Block first atom: 450 Blocpdb> 44 atoms in block 15 Block first atom: 490 Blocpdb> 35 atoms in block 16 Block first atom: 534 Blocpdb> 45 atoms in block 17 Block first atom: 569 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 614 Blocpdb> 33 atoms in block 19 Block first atom: 652 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 685 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 721 Blocpdb> 44 atoms in block 22 Block first atom: 751 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 795 Blocpdb> 34 atoms in block 24 Block first atom: 840 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 874 Blocpdb> 43 atoms in block 26 Block first atom: 923 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 966 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 1007 Blocpdb> 36 atoms in block 29 Block first atom: 1046 Blocpdb> 38 atoms in block 30 Block first atom: 1082 Blocpdb> 31 atoms in block 31 Block first atom: 1120 Blocpdb> 31 atoms in block 32 Block first atom: 1151 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 1182 Blocpdb> 29 atoms in block 34 Block first atom: 1206 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1235 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1272 Blocpdb> 34 atoms in block 37 Block first atom: 1306 Blocpdb> 39 atoms in block 38 Block first atom: 1340 Blocpdb> 37 atoms in block 39 Block first atom: 1379 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1416 Blocpdb> 33 atoms in block 41 Block first atom: 1457 Blocpdb> 43 atoms in block 42 Block first atom: 1490 Blocpdb> 39 atoms in block 43 Block first atom: 1533 Blocpdb> 38 atoms in block 44 Block first atom: 1572 Blocpdb> 38 atoms in block 45 Block first atom: 1610 Blocpdb> 40 atoms in block 46 Block first atom: 1648 Blocpdb> 31 atoms in block 47 Block first atom: 1688 Blocpdb> 41 atoms in block 48 Block first atom: 1719 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 1760 Blocpdb> 36 atoms in block 50 Block first atom: 1800 Blocpdb> 33 atoms in block 51 Block first atom: 1836 Blocpdb> 43 atoms in block 52 Block first atom: 1869 Blocpdb> 37 atoms in block 53 Block first atom: 1912 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 1949 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1993 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 2027 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 2057 Blocpdb> 30 atoms in block 58 Block first atom: 2085 Blocpdb> 26 atoms in block 59 Block first atom: 2115 Blocpdb> 29 atoms in block 60 Block first atom: 2141 Blocpdb> 35 atoms in block 61 Block first atom: 2170 Blocpdb> 34 atoms in block 62 Block first atom: 2205 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 2239 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 2269 Blocpdb> 31 atoms in block 65 Block first atom: 2294 Blocpdb> 33 atoms in block 66 Block first atom: 2325 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 2358 Blocpdb> 34 atoms in block 68 Block first atom: 2382 Blocpdb> 38 atoms in block 69 Block first atom: 2416 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 2454 Blocpdb> 34 atoms in block 71 Block first atom: 2472 Blocpdb> 35 atoms in block 72 Block first atom: 2506 Blocpdb> 34 atoms in block 73 Block first atom: 2541 Blocpdb> 41 atoms in block 74 Block first atom: 2575 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2616 Blocpdb> 35 atoms in block 76 Block first atom: 2650 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 2685 Blocpdb> 42 atoms in block 78 Block first atom: 2727 Blocpdb> 36 atoms in block 79 Block first atom: 2769 Blocpdb> 34 atoms in block 80 Block first atom: 2805 Blocpdb> 40 atoms in block 81 Block first atom: 2839 Blocpdb> 39 atoms in block 82 Block first atom: 2879 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 2918 Blocpdb> 36 atoms in block 84 Block first atom: 2958 Blocpdb> 42 atoms in block 85 Block first atom: 2994 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 3036 Blocpdb> 32 atoms in block 87 Block first atom: 3049 Blocpdb> 47 atoms in block 88 Block first atom: 3081 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 3128 Blocpdb> 35 atoms in block 90 Block first atom: 3161 Blocpdb> 26 atoms in block 91 Block first atom: 3196 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 3222 Blocpdb> 30 atoms in block 93 Block first atom: 3251 Blocpdb> 31 atoms in block 94 Block first atom: 3281 Blocpdb> 42 atoms in block 95 Block first atom: 3312 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 3354 Blocpdb> 32 atoms in block 97 Block first atom: 3378 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 3410 Blocpdb> 31 atoms in block 99 Block first atom: 3435 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 3466 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 3494 Blocpdb> 34 atoms in block 102 Block first atom: 3533 Blocpdb> 26 atoms in block 103 Block first atom: 3567 Blocpdb> 31 atoms in block 104 Block first atom: 3593 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 3624 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 3655 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 3693 Blocpdb> 24 atoms in block 108 Block first atom: 3724 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 3748 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 3776 Blocpdb> 34 atoms in block 111 Block first atom: 3807 Blocpdb> 29 atoms in block 112 Block first atom: 3841 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 3870 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 115 Block first atom: 3910 Blocpdb> 5 atoms in block 116 Block first atom: 3936 Blocpdb> 36 atoms in block 117 Block first atom: 3941 Blocpdb> 37 atoms in block 118 Block first atom: 3977 Blocpdb> 40 atoms in block 119 Block first atom: 4014 Blocpdb> 36 atoms in block 120 Block first atom: 4054 Blocpdb> 32 atoms in block 121 Block first atom: 4090 Blocpdb> 35 atoms in block 122 Block first atom: 4122 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 4157 Blocpdb> 40 atoms in block 124 Block first atom: 4198 Blocpdb> 37 atoms in block 125 Block first atom: 4238 Blocpdb> 36 atoms in block 126 Block first atom: 4275 Blocpdb> 35 atoms in block 127 Block first atom: 4311 Blocpdb> 32 atoms in block 128 Block first atom: 4346 Blocpdb> 37 atoms in block 129 Block first atom: 4378 Blocpdb> 29 atoms in block 130 Block first atom: 4415 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 4444 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 4472 Blocpdb> 34 atoms in block 133 Block first atom: 4500 Blocpdb> 35 atoms in block 134 Block first atom: 4534 Blocpdb> 32 atoms in block 135 Block first atom: 4569 Blocpdb> 39 atoms in block 136 Block first atom: 4601 Blocpdb> 30 atoms in block 137 Block first atom: 4640 Blocpdb> 40 atoms in block 138 Block first atom: 4670 Blocpdb> 33 atoms in block 139 Block first atom: 4710 Blocpdb> 36 atoms in block 140 Block first atom: 4743 Blocpdb> 38 atoms in block 141 Block first atom: 4779 Blocpdb> 37 atoms in block 142 Block first atom: 4817 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 4854 Blocpdb> 43 atoms in block 144 Block first atom: 4892 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 4935 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 4977 Blocpdb> 43 atoms in block 147 Block first atom: 5008 Blocpdb> 34 atoms in block 148 Block first atom: 5051 Blocpdb> 36 atoms in block 149 Block first atom: 5085 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 5121 Blocpdb> 36 atoms in block 151 Block first atom: 5145 Blocpdb> 32 atoms in block 152 Block first atom: 5181 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 5213 Blocpdb> 36 atoms in block 154 Block first atom: 5246 Blocpdb> 39 atoms in block 155 Block first atom: 5282 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 5321 Blocpdb> 26 atoms in block 157 Block first atom: 5356 Blocpdb> 43 atoms in block 158 Block first atom: 5382 Blocpdb> 41 atoms in block 159 Block first atom: 5425 Blocpdb> 37 atoms in block 160 Block first atom: 5466 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 5503 Blocpdb> 29 atoms in block 162 Block first atom: 5533 Blocpdb> 33 atoms in block 163 Block first atom: 5562 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 5595 Blocpdb> 26 atoms in block 165 Block first atom: 5620 Blocpdb> 33 atoms in block 166 Block first atom: 5646 Blocpdb> 39 atoms in block 167 Block first atom: 5679 Blocpdb> 39 atoms in block 168 Block first atom: 5718 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 5757 Blocpdb> 38 atoms in block 170 Block first atom: 5796 Blocpdb> 37 atoms in block 171 Block first atom: 5834 Blocpdb> 28 atoms in block 172 Block first atom: 5871 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 5899 Blocpdb> 43 atoms in block 174 Block first atom: 5940 Blocpdb> 31 atoms in block 175 Block first atom: 5983 Blocpdb> 40 atoms in block 176 Block first atom: 6014 Blocpdb> 36 atoms in block 177 Block first atom: 6054 Blocpdb> 34 atoms in block 178 Block first atom: 6090 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 6124 Blocpdb> 32 atoms in block 180 Block first atom: 6168 Blocpdb> 43 atoms in block 181 Block first atom: 6200 Blocpdb> 32 atoms in block 182 Block first atom: 6243 Blocpdb> 28 atoms in block 183 Block first atom: 6275 Blocpdb> 31 atoms in block 184 Block first atom: 6303 Blocpdb> 37 atoms in block 185 Block first atom: 6334 Blocpdb> 30 atoms in block 186 Block first atom: 6371 Blocpdb> 26 atoms in block 187 Block first atom: 6401 Blocpdb> 35 atoms in block 188 Block first atom: 6427 Blocpdb> 34 atoms in block 189 Block first atom: 6462 Blocpdb> 12 atoms in block 190 Block first atom: 6495 Blocpdb> 190 blocks. Blocpdb> At most, 49 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2156179 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 19521 Prepmat> Matrix trace = 4705060.0000 Prepmat> Last element read: 19521 19521 57.7208 Prepmat> 18146 lines saved. Prepmat> 16646 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6507 RTB> Total mass = 6507.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6507 RTB> Number of blocks = 190 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 182051.1589 RTB> 51114 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1140 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51114 Diagstd> Projected matrix trace = 182051.1589 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1140 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 182051.1589 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1302443 0.1944931 0.4855080 0.5817787 0.7192308 0.8829146 0.9996995 1.5319443 1.6382465 1.9724793 2.3508095 2.3988076 2.8003500 3.1198859 3.4929813 3.7117770 3.9437885 4.2680732 4.4247928 4.7299867 5.0755600 5.2912673 5.7194686 5.9014469 6.4836992 6.8495333 7.2150156 7.6283288 7.7584723 8.1214682 8.2639776 8.6109627 8.8486390 9.0722859 9.4455320 10.2765273 10.4622185 10.6248164 11.0058328 11.0974259 11.7182493 12.0590189 12.2604059 12.4045297 12.6314317 13.0935529 13.3970795 13.6340363 13.8358465 14.4291152 14.8959886 14.9397473 15.2041530 15.5363497 15.6775899 15.7759642 15.7831850 16.6676157 16.8675265 16.9259224 17.0046162 17.3901055 17.8945553 17.9064221 18.2989987 18.4489658 18.6124503 18.8279475 19.1126429 19.3120373 19.6790591 20.0118676 20.3051504 20.7194665 20.7722372 21.0242539 21.2757626 21.5701363 22.5300781 22.6896211 22.9135741 23.1464553 23.5140862 23.5324471 23.9246703 24.2423632 24.6138607 24.7726207 24.8127266 25.4089810 25.6040783 25.9981208 26.1480554 26.6612408 26.9310254 27.0402163 27.1639308 27.3900352 27.5500857 27.7186745 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034336 0.0034339 0.0034340 0.0034344 0.0034349 39.1899466 47.8902817 75.6647244 82.8274297 92.0935950 102.0362848 108.5750465 134.4054170 138.9904304 152.5111202 166.4960737 168.1872199 181.7194601 191.8070796 202.9520349 209.2118216 215.6513030 224.3423209 228.4240099 236.1702786 244.6455176 249.7900483 259.7006994 263.7998429 276.5073694 284.2011103 291.6848797 299.9231450 302.4707526 309.4657239 312.1690520 318.6552914 323.0230545 327.0797405 333.7401775 348.1115792 351.2425912 353.9614761 360.2522784 361.7482236 371.7291747 377.0954296 380.2311601 382.4594819 385.9415792 392.9380027 397.4663329 400.9659586 403.9225943 412.4916209 419.1118556 419.7269985 423.4249017 428.0256291 429.9668069 431.3136838 431.4123801 443.3350003 445.9857479 446.7570896 447.7944400 452.8416751 459.3627086 459.5149966 464.5248406 466.4244335 468.4864730 471.1907649 474.7398121 477.2097698 481.7230702 485.7793961 489.3261057 494.2931186 494.9221801 497.9154202 500.8847948 504.3380380 515.4382319 517.2600079 519.8064909 522.4413291 526.5739045 526.7794519 531.1513145 534.6662328 538.7473530 540.4820267 540.9193599 547.3799739 549.4774240 553.6894629 555.2837685 560.7063303 563.5360774 564.6773407 565.9676239 568.3182145 569.9762472 571.7175306 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6507 Rtb_to_modes> Number of blocs = 190 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4855 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5818 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.399 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.944 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.730 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.076 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1140 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 117126 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201224349801369.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201224349801369.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 250201224349801369.atom Openam> file on opening on unit 11: 250201224349801369.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 929 First residue number = 9 Last residue number = 324 Number of atoms found = 6507 Mean number per residue = 7.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5818 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.399 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.944 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.730 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.076 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Bfactors> 106 vectors, 19521 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.130200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.593 for 929 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.077 +/- 0.08 Bfactors> = 132.754 +/- 33.69 Bfactors> Shiftng-fct= 132.677 Bfactors> Scaling-fct= 408.173 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201224349801369.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201224349801369.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8 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Chkmod> That is: 6507 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201224349801369.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201224349801369.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 250201224349801369 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 250201224349801369 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom making animated gifs 11 models are in 250201224349801369.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201224349801369.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201224349801369.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 250201224349801369 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201224349801369.eigenfacs 250201224349801369.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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