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***  Thaimine_transporter  ***

LOGs for ID: 250201203403752093

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 250201203403752093.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 250201203403752093.atom to be opened. Openam> File opened: 250201203403752093.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 388 First residue number = 11 Last residue number = 459 Number of atoms found = 3110 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 137.967879 +/- 12.051216 From: 112.926000 To: 170.253000 = 134.286055 +/- 9.834457 From: 110.835000 To: 156.669000 = 159.655369 +/- 14.001162 From: 123.025000 To: 190.508000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6730 % Filled. Pdbmat> 1163530 non-zero elements. Pdbmat> 127230 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.82 +/- 22.72 Maximum number = 132 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 2.544600E+06 Pdbmat> Larger element = 507.688 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 388 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 250201203403752093.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 250201203403752093.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 250201203403752093.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3110 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 388 residues. Blocpdb> 20 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 21 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 41 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 55 Blocpdb> 14 atoms in block 5 Block first atom: 70 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 84 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 103 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 118 Blocpdb> 16 atoms in block 9 Block first atom: 135 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 151 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 169 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 184 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 202 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 218 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 237 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 251 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 262 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 279 Blocpdb> 13 atoms in block 19 Block first atom: 295 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 308 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 322 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 337 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 354 Blocpdb> 14 atoms in block 24 Block first atom: 373 Blocpdb> 21 atoms in block 25 Block first atom: 387 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 408 Blocpdb> 20 atoms in block 27 Block first atom: 426 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 446 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 461 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 477 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 491 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 509 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 524 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 544 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 562 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 583 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 597 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 613 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 630 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 642 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 659 Blocpdb> 21 atoms in block 42 Block first atom: 675 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 696 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 712 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 728 Blocpdb> 13 atoms in block 46 Block first atom: 743 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 756 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 772 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 787 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 803 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 819 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 841 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 857 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 872 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 884 Blocpdb> 12 atoms in block 56 Block first atom: 898 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 910 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 934 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 951 Blocpdb> 13 atoms in block 60 Block first atom: 971 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 984 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 997 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1013 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1035 Blocpdb> 13 atoms in block 65 Block first atom: 1055 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1068 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1084 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 1101 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1114 Blocpdb> 10 atoms in block 70 Block first atom: 1129 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1139 Blocpdb> 9 atoms in block 72 Block first atom: 1158 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1167 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1180 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1193 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1210 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1225 Blocpdb> 13 atoms in block 78 Block first atom: 1239 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1252 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1266 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1289 Blocpdb> 15 atoms in block 82 Block first atom: 1309 Blocpdb> 14 atoms in block 83 Block first atom: 1324 Blocpdb> 13 atoms in block 84 Block first atom: 1338 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1351 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1364 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1377 Blocpdb> 19 atoms in block 88 Block first atom: 1393 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1412 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1426 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1445 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 1460 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1476 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1491 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 1510 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1531 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 1545 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 1552 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 1577 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1594 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1611 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1626 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1644 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1659 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 1678 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1701 Blocpdb> 22 atoms in block 107 Block first atom: 1721 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1743 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1762 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1778 Blocpdb> 15 atoms in block 111 Block first atom: 1790 Blocpdb> 17 atoms in block 112 Block first atom: 1805 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1822 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 1837 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1857 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1873 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 1889 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 1911 Blocpdb> 12 atoms in block 119 Block first atom: 1932 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1944 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1959 Blocpdb> 14 atoms in block 122 Block first atom: 1973 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 1987 Blocpdb> 9 atoms in block 124 Block first atom: 2007 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 2016 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 2032 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 2045 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 2057 Blocpdb> 9 atoms in block 129 Block first atom: 2072 Blocpdb> 12 atoms in block 130 Block first atom: 2081 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 2093 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 2109 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2121 Blocpdb> 16 atoms in block 134 Block first atom: 2137 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2153 Blocpdb> 22 atoms in block 136 Block first atom: 2168 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2190 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2206 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2219 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2232 Blocpdb> 18 atoms in block 141 Block first atom: 2247 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2265 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2278 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 2293 Blocpdb> 14 atoms in block 145 Block first atom: 2302 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2316 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 2335 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 2353 Blocpdb> 13 atoms in block 149 Block first atom: 2372 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 2385 Blocpdb> 11 atoms in block 151 Block first atom: 2407 Blocpdb> 17 atoms in block 152 Block first atom: 2418 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2435 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2451 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 2467 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 2487 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 2499 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2519 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2535 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2550 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2563 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 2581 Blocpdb> 12 atoms in block 163 Block first atom: 2598 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2610 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2626 Blocpdb> 20 atoms in block 166 Block first atom: 2641 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2661 Blocpdb> 15 atoms in block 168 Block first atom: 2678 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2693 Blocpdb> 16 atoms in block 170 Block first atom: 2708 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 2724 Blocpdb> 13 atoms in block 172 Block first atom: 2742 Blocpdb> 15 atoms in block 173 Block first atom: 2755 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 2770 Blocpdb> 15 atoms in block 175 Block first atom: 2787 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2802 Blocpdb> 15 atoms in block 177 Block first atom: 2817 Blocpdb> 14 atoms in block 178 Block first atom: 2832 Blocpdb> 17 atoms in block 179 Block first atom: 2846 Blocpdb> 15 atoms in block 180 Block first atom: 2863 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2878 Blocpdb> 15 atoms in block 182 Block first atom: 2894 Blocpdb> 13 atoms in block 183 Block first atom: 2909 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 2922 Blocpdb> 19 atoms in block 185 Block first atom: 2939 Blocpdb> 19 atoms in block 186 Block first atom: 2958 Blocpdb> 10 atoms in block 187 Block first atom: 2977 Blocpdb> 23 atoms in block 188 Block first atom: 2987 Blocpdb> 12 atoms in block 189 Block first atom: 3010 Blocpdb> 13 atoms in block 190 Block first atom: 3022 Blocpdb> 12 atoms in block 191 Block first atom: 3035 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 3047 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 3066 Blocpdb> 14 atoms in block 194 Block first atom: 3085 Blocpdb> 12 atoms in block 195 Block first atom: 3098 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1163725 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9330 Prepmat> Matrix trace = 2544600.0000 Prepmat> Last element read: 9330 9330 75.4643 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 17009 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3110 RTB> Total mass = 3110.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3110 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 269595.2528 RTB> 72711 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72711 Diagstd> Projected matrix trace = 269595.2528 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 269595.2528 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.1658359 2.9183050 3.4225301 3.7995509 4.8951577 5.2170992 5.6150533 6.3664793 6.9367714 7.7023210 8.4566780 8.6966883 9.0146212 10.2553699 10.5646541 11.0906139 11.6114509 12.2996277 12.6581649 13.5515553 14.2315146 14.7387001 15.4202209 15.7156526 16.1937360 17.1833965 17.4184839 17.8547866 18.2946015 18.8110808 20.3136050 20.5913689 21.6120539 22.1351352 22.4036310 22.6471853 23.1779206 24.2100022 24.8745684 25.7263594 26.0214484 26.6346115 26.8490315 26.9319617 27.5591677 27.8752251 28.2581064 29.0583292 29.9020250 30.4415128 30.8330870 31.3657264 32.1915600 32.4138526 32.8229132 33.5553130 33.6329615 33.9811164 34.5050176 35.7950203 35.9002551 36.2173380 37.4398442 37.8966947 38.1281588 38.7578192 39.0292512 39.5502029 39.9132850 40.7686493 41.3124224 42.4308790 42.6063938 43.0187479 43.3864167 44.4167441 44.9700688 45.8913033 46.0529625 46.6512070 47.0411359 47.3382563 47.7222427 48.0416584 48.4514120 49.3275560 49.8395429 50.4280440 51.5012508 51.7040132 52.5178822 53.0882828 53.3998782 53.5957451 53.6953962 54.6229148 54.8137762 55.2234021 55.7362963 56.2850382 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034333 0.0034344 0.0034346 0.0034347 0.0034360 159.8115111 185.5071352 200.8949036 211.6710242 240.2584248 248.0332055 257.3192166 273.9964559 286.0052271 301.3742125 315.7876766 320.2375337 326.0386007 347.7530475 352.9579118 361.6371802 370.0313548 380.8388655 386.3497677 399.7512686 409.6574345 416.8932576 426.4229571 430.4884360 436.9872928 450.1422591 453.2110143 458.8519823 464.4690253 470.9796627 489.4279663 492.7627719 504.8278450 510.9005497 513.9897825 516.7760730 522.7963129 534.3092523 541.5930179 550.7879706 553.9378151 560.4262431 562.6775559 563.5458740 570.0701870 573.3297423 577.2538104 585.3701872 593.8073655 599.1401110 602.9812175 608.1671461 616.1213975 618.2449911 622.1338657 629.0366171 629.7640068 633.0151461 637.8762122 649.6906057 650.6449262 653.5119653 664.4499864 668.4915882 670.5299755 676.0439751 678.4071084 682.9196958 686.0472328 693.3594545 697.9681589 707.3531544 708.8146234 712.2363968 715.2735604 723.7167766 728.2107006 735.6317686 736.9263176 741.6973421 744.7905892 747.1390028 750.1631092 752.6694269 755.8724203 762.6759989 766.6238132 771.1366457 779.2990893 780.8316472 786.9531585 791.2151951 793.5337700 794.9877504 795.7264714 802.5696194 803.9705513 806.9690148 810.7077665 814.6888319 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3110 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.895 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.615 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.366 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.29 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00005 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99996 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 55980 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00005 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99996 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201203403752093.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201203403752093.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 250201203403752093.atom Openam> file on opening on unit 11: 250201203403752093.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 388 First residue number = 11 Last residue number = 459 Number of atoms found = 3110 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.895 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.615 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.366 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.29 Bfactors> 106 vectors, 9330 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.166000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.388 for 388 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.05 Bfactors> = 75.837 +/- 13.92 Bfactors> Shiftng-fct= 75.813 Bfactors> Scaling-fct= 280.825 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201203403752093.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201203403752093.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 3110 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 65 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9338 0.0034 0.8459 0.0034 0.8091 0.0034 0.8276 0.0034 0.7658 0.0034 0.8231 159.8107 0.3262 185.4895 0.1646 200.9001 0.1109 211.6744 0.1082 240.2442 0.2132 248.0202 0.0270 257.3070 0.4637 273.9744 0.4104 285.9977 0.1182 301.3550 0.2582 315.7801 0.1996 320.2295 0.5031 326.0315 0.1942 347.8166 0.2750 352.8650 0.2891 361.6116 0.3965 369.9924 0.1824 380.8283 0.5145 386.3612 0.4573 399.7112 0.2963 409.6181 0.3104 416.8937 0.5561 426.4016 0.1785 430.5295 0.3485 436.9181 0.3840 450.0784 0.3327 453.2113 0.3674 458.7708 0.4116 464.3907 0.3029 470.9459 0.3764 489.3635 0.1518 492.7252 0.3415 504.7822 0.4211 510.9348 0.5555 513.9261 0.3886 516.7860 0.5379 522.7973 0.3560 534.2863 0.2842 541.5200 0.2077 550.8033 0.3382 553.8986 0.3755 560.3537 0.4080 562.6635 0.3988 563.5012 0.3541 570.0543 0.3146 573.3542 0.1536 577.2484 0.3113 585.3619 0.3426 593.7618 0.3469 599.0995 0.3968 602.9251 0.4386 608.1825 0.4078 616.0800 0.1703 618.1817 0.2746 622.0796 0.3539 629.0535 0.2019 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perturbed structure for DQ=-100 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201203403752093.eigenfacs 250201203403752093.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201203403752093.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 250201203403752093.10.pdb 250201203403752093.11.pdb 250201203403752093.7.pdb 250201203403752093.8.pdb 250201203403752093.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m27.679s user 0m27.612s sys 0m0.048s rm: cannot remove '250201203403752093.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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