CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  4f2hc removed  ***

LOGs for ID: 250201003220452694

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 250201003220452694.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 250201003220452694.atom to be opened. Openam> File opened: 250201003220452694.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 468 First residue number = 287 Last residue number = 507 Number of atoms found = 3616 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 148.446525 +/- 10.675597 From: 121.254000 To: 174.477000 = 144.454718 +/- 12.139600 From: 116.177000 To: 175.267000 = 148.324152 +/- 17.410964 From: 87.378000 To: 188.132000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1485 % Filled. Pdbmat> 1264262 non-zero elements. Pdbmat> 138084 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.37 +/- 21.48 Maximum number = 122 Minimum number = 5 Pdbmat> Matrix trace = 2.761680E+06 Pdbmat> Larger element = 517.533 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 468 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 250201003220452694.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 250201003220452694.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 250201003220452694.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3616 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 468 residues. Blocpdb> 6 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 6 atoms in block 2 Block first atom: 7 Blocpdb> 6 atoms in block 3 Block first atom: 13 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 19 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 31 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 53 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 81 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 104 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 124 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 144 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 163 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 186 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 200 Blocpdb> 21 atoms in block 14 Block first atom: 226 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 247 Blocpdb> 23 atoms in block 16 Block first atom: 266 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 289 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 306 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 323 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 345 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 369 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 386 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 411 Blocpdb> 26 atoms in block 24 Block first atom: 427 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 453 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 475 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 493 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 516 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 530 Blocpdb> 28 atoms in block 30 Block first atom: 555 Blocpdb> 28 atoms in block 31 Block first atom: 583 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 611 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 629 Blocpdb> 25 atoms in block 34 Block first atom: 652 Blocpdb> 31 atoms in block 35 Block first atom: 677 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 708 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 732 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 758 Blocpdb> 27 atoms in block 39 Block first atom: 779 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 806 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 826 Blocpdb> 28 atoms in block 42 Block first atom: 849 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 877 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 901 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 926 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 946 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 971 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 990 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 1010 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 1030 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 1053 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1073 Blocpdb> 25 atoms in block 53 Block first atom: 1094 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1119 Blocpdb> 25 atoms in block 55 Block first atom: 1138 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 1163 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 1185 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1206 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1228 Blocpdb> 21 atoms in block 60 Block first atom: 1249 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1270 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1294 Blocpdb> 21 atoms in block 63 Block first atom: 1316 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1337 Blocpdb> 21 atoms in block 65 Block first atom: 1358 Blocpdb> 23 atoms in block 66 Block first atom: 1379 Blocpdb> 25 atoms in block 67 Block first atom: 1402 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1427 Blocpdb> 24 atoms in block 69 Block first atom: 1451 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1475 Blocpdb> 23 atoms in block 71 Block first atom: 1494 Blocpdb> 21 atoms in block 72 Block first atom: 1517 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1538 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1560 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1584 Blocpdb> 34 atoms in block 76 Block first atom: 1604 Blocpdb> 27 atoms in block 77 Block first atom: 1638 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 1665 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1688 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1713 Blocpdb> 27 atoms in block 81 Block first atom: 1740 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1767 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 1787 Blocpdb> 21 atoms in block 84 Block first atom: 1811 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1832 Blocpdb> 27 atoms in block 86 Block first atom: 1854 Blocpdb> 22 atoms in block 87 Block first atom: 1881 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1903 Blocpdb> 30 atoms in block 89 Block first atom: 1924 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 1954 Blocpdb> 25 atoms in block 91 Block first atom: 1975 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 2000 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2022 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 2042 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2061 Blocpdb> 30 atoms in block 96 Block first atom: 2084 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2114 Blocpdb> 28 atoms in block 98 Block first atom: 2133 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2161 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 2184 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 2209 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2227 Blocpdb> 21 atoms in block 103 Block first atom: 2248 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 2269 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 2287 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 2311 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 2336 Blocpdb> 21 atoms in block 108 Block first atom: 2365 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2386 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2409 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2430 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 2452 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 2478 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2502 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 2524 Blocpdb> 26 atoms in block 116 Block first atom: 2544 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 2570 Blocpdb> 23 atoms in block 118 Block first atom: 2590 Blocpdb> 25 atoms in block 119 Block first atom: 2613 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2638 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 2664 Blocpdb> 21 atoms in block 122 Block first atom: 2691 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 2712 Blocpdb> 28 atoms in block 124 Block first atom: 2742 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 2770 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 2800 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 2818 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2839 Blocpdb> 30 atoms in block 129 Block first atom: 2859 Blocpdb> 32 atoms in block 130 Block first atom: 2889 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2921 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 2946 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 2974 Blocpdb> 23 atoms in block 134 Block first atom: 2998 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 3021 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3041 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 3070 Blocpdb> 25 atoms in block 138 Block first atom: 3091 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 3116 Blocpdb> 24 atoms in block 140 Block first atom: 3137 Blocpdb> 30 atoms in block 141 Block first atom: 3161 Blocpdb> 23 atoms in block 142 Block first atom: 3191 Blocpdb> 18 atoms in block 143 Block first atom: 3214 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 3232 Blocpdb> 24 atoms in block 145 Block first atom: 3254 Blocpdb> 18 atoms in block 146 Block first atom: 3278 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 3296 Blocpdb> 26 atoms in block 148 Block first atom: 3322 Blocpdb> 35 atoms in block 149 Block first atom: 3348 Blocpdb> 26 atoms in block 150 Block first atom: 3383 Blocpdb> 30 atoms in block 151 Block first atom: 3409 Blocpdb> 25 atoms in block 152 Block first atom: 3439 Blocpdb> 23 atoms in block 153 Block first atom: 3464 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3487 Blocpdb> 21 atoms in block 155 Block first atom: 3507 Blocpdb> 26 atoms in block 156 Block first atom: 3528 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3554 Blocpdb> 23 atoms in block 158 Block first atom: 3578 Blocpdb> 16 atoms in block 159 Block first atom: 3600 Blocpdb> 159 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1264421 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10848 Prepmat> Matrix trace = 2761680.0000 Prepmat> Last element read: 10848 10848 22.6734 Prepmat> 12721 lines saved. Prepmat> 11254 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3616 RTB> Total mass = 3616.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3616 RTB> Number of blocks = 159 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 186117.4244 RTB> 50391 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 954 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50391 Diagstd> Projected matrix trace = 186117.4244 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 954 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 186117.4244 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 18 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 %Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ? Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0049406 0.0294952 0.1533773 0.3991010 0.8783785 1.7870274 2.1805451 2.5126082 2.8198065 2.9623505 3.9480027 4.5449219 4.6075068 5.0547988 5.3222442 5.7876809 6.1969772 7.1102015 7.3985451 7.5284392 7.8028844 8.2236575 8.8883115 9.3465450 9.8038269 9.9963505 10.6406444 10.9011091 11.4004672 11.7158484 11.9062956 12.2096782 12.6804928 13.0874466 13.2135892 13.4585180 13.6328980 14.1816178 15.0892942 15.6048483 16.1527961 17.3060684 17.3481455 18.1904408 18.6270512 19.0515987 19.3769245 19.7635129 20.1211285 20.8061762 20.8689695 21.1874565 22.0991479 22.3007726 23.1077417 23.1873600 24.3511201 24.4798278 25.1335007 25.5164984 26.1467242 26.3312575 26.4275352 27.2531617 27.5951469 28.3674263 28.7420759 29.0223105 29.8908369 30.9125764 31.1281208 31.6741219 32.1441969 33.0406856 33.1999876 33.5763528 33.9231956 34.6235000 34.9960895 35.3819856 36.1244477 36.4242444 37.1182898 37.4288660 37.7606791 38.5579938 39.0186976 39.1734066 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034325 0.0034328 0.0034336 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034340 0.0034349 7.6328467 18.6496523 42.5280916 68.6019875 101.7738305 145.1646541 160.3532673 172.1304353 182.3496508 186.9018064 215.7664907 231.5039964 233.0924862 244.1446524 250.5201580 261.2447491 270.3243885 289.5584436 295.3714002 297.9529941 303.3352386 311.4065820 323.7463740 331.9868105 340.0111025 343.3333712 354.2250291 358.5342294 366.6541494 371.6910910 374.6999292 379.4437366 386.6903607 392.8463678 394.7350406 398.3766732 400.9492195 408.9386585 421.8225016 428.9681581 436.4345620 451.7461792 452.2950222 463.1449065 468.6701935 473.9810651 478.0107937 482.7556340 487.1037213 495.3263321 496.0732198 499.8442408 510.4850693 512.8085230 522.0042419 522.9027579 535.8642099 537.2784965 544.4045820 548.5368630 555.2696326 557.2256251 558.2434172 566.8964362 570.4421857 578.3693206 582.1760652 585.0072826 593.6962659 603.7579767 605.8592347 611.1496566 615.6679842 624.1943103 625.6972428 629.2337954 632.4754292 638.9704351 642.3992709 645.9313762 652.6733630 655.3760344 661.5904983 664.3525631 667.2908631 674.2989677 678.3153811 679.6588096 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3616 Rtb_to_modes> Number of blocs = 159 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9406E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9495E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1534 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.322 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.197 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.399 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.888 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 954 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 1.00003 0.99999 0.99996 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99994 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 65088 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 1.00003 0.99999 0.99996 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99994 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 0.99996 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201003220452694.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201003220452694.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 250201003220452694.atom Openam> file on opening on unit 11: 250201003220452694.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 468 First residue number = 287 Last residue number = 507 Number of atoms found = 3616 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9915E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9406E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9495E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.197 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.399 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.888 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Bfactors> 106 vectors, 10848 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 18 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.004941 Bfactors> 88 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.031 for 468 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.729 +/- 14.83 Bfactors> = 52.481 +/- 25.63 Bfactors> Shiftng-fct= 51.752 Bfactors> Scaling-fct= 1.728 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 250201003220452694.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 250201003220452694.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.6 Chkmod> 106 vectors, 10848 coordinates in file. Chkmod> That is: 3616 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 0.0034 NaN 7.6325 NaN 18.6488 NaN 42.5294 NaN 68.5990 NaN 101.7707 NaN 145.1573 NaN 160.3631 NaN 172.1365 NaN 182.3481 NaN 186.8827 NaN 215.7572 NaN 231.4960 NaN 233.0950 NaN 244.1390 NaN 250.5037 NaN 261.2407 NaN 270.3133 NaN 289.5419 NaN 295.3678 NaN 297.9315 NaN 303.3245 NaN 311.3997 NaN 323.7268 NaN 331.9806 NaN 339.9995 NaN 343.3126 NaN 354.1991 NaN 358.5006 NaN 366.6309 NaN 371.7410 NaN 374.7421 NaN 379.4324 NaN 386.6662 NaN 392.8678 NaN 394.6645 NaN 398.3815 NaN 400.8894 NaN 408.8978 NaN 421.8143 NaN 428.8831 NaN 436.3781 NaN 451.7781 NaN 452.2998 NaN 463.1194 NaN 468.6872 NaN 473.9408 NaN 478.0282 NaN 482.6920 NaN 487.0692 NaN 495.3506 NaN 496.0642 NaN 499.8528 NaN 510.4730 NaN 512.7776 NaN 522.0073 NaN 522.9101 NaN 535.8289 NaN 537.2573 NaN 544.3433 NaN 548.5510 NaN 555.2806 NaN 557.1884 NaN 558.2455 NaN 566.8392 NaN 570.4679 NaN 578.3707 NaN 582.1301 NaN 584.9589 NaN 593.6625 NaN 603.7069 NaN 605.8515 NaN 611.0837 NaN 615.6014 NaN 624.1610 NaN 625.6705 NaN 629.2410 NaN 632.4185 NaN 638.9107 NaN 642.4076 NaN 645.8855 NaN 652.6052 NaN 655.3097 NaN 661.5773 NaN 664.3341 NaN 667.2562 NaN 674.2876 NaN 678.2976 NaN 679.6001 NaN getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 250201003220452694 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom making animated gifs 11 models are in 250201003220452694.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 250201003220452694 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom making animated gifs 11 models are in 250201003220452694.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 250201003220452694 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom making animated gifs 11 models are in 250201003220452694.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 250201003220452694 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom making animated gifs 11 models are in 250201003220452694.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 250201003220452694 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=0 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=20 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=40 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=60 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=80 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom calculating perturbed structure for DQ=100 250201003220452694.eigenfacs 250201003220452694.atom making animated gifs 11 models are in 250201003220452694.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 250201003220452694.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 250201003220452694.10.pdb 250201003220452694.11.pdb 250201003220452694.7.pdb 250201003220452694.8.pdb 250201003220452694.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m17.377s user 0m17.205s sys 0m0.092s rm: cannot remove '250201003220452694.sdijf': No such file or directory Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG IEEE_DIVIDE_BY_ZERO pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 8th, 2025.