*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 14051617144916654.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 14051617144916654.atom to be opened.
Openam> File opened: 14051617144916654.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1284
First residue number = 1
Last residue number = 428
Number of atoms found = 9918
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -3.934002 +/- 28.382313 From: -71.707000 To: 56.700000
= 57.119643 +/- 23.369838 From: 3.019000 To: 105.030000
= 46.549210 +/- 18.184960 From: 5.390000 To: 86.496000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 15 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is .8426 % Filled.
Pdbmat> 3729818 non-zero elements.
Pdbmat> 407875 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.25 +/- 17.67
Maximum number = 125
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 8.157500E+06
Pdbmat> Larger element = 515.087
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1284 non-zero elements, NRBL set to 7
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 14051617144916654.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 7
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 14051617144916654.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
14051617144916654.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9918 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 7 residue(s) per block.
Blocpdb> 1284 residues.
Blocpdb> 61 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 56 atoms in block 2
Block first atom: 62
Blocpdb> 55 atoms in block 3
Block first atom: 118
Blocpdb> 53 atoms in block 4
Block first atom: 173
Blocpdb> 59 atoms in block 5
Block first atom: 226
Blocpdb> 53 atoms in block 6
Block first atom: 285
Blocpdb> 48 atoms in block 7
Block first atom: 338
Blocpdb> 61 atoms in block 8
Block first atom: 386
Blocpdb> 47 atoms in block 9
Block first atom: 447
Blocpdb> 46 atoms in block 10
Block first atom: 494
Blocpdb> 57 atoms in block 11
Block first atom: 540
Blocpdb> 61 atoms in block 12
Block first atom: 597
Blocpdb> 52 atoms in block 13
Block first atom: 658
Blocpdb> 55 atoms in block 14
Block first atom: 710
Blocpdb> 57 atoms in block 15
Block first atom: 765
Blocpdb> 48 atoms in block 16
Block first atom: 822
Blocpdb> 59 atoms in block 17
Block first atom: 870
Blocpdb> 56 atoms in block 18
Block first atom: 929
Blocpdb> 54 atoms in block 19
Block first atom: 985
Blocpdb> 64 atoms in block 20
Block first atom: 1039
Blocpdb> 57 atoms in block 21
Block first atom: 1103
Blocpdb> 50 atoms in block 22
Block first atom: 1160
Blocpdb> 59 atoms in block 23
Block first atom: 1210
Blocpdb> 52 atoms in block 24
Block first atom: 1269
Blocpdb> 55 atoms in block 25
Block first atom: 1321
Blocpdb> 54 atoms in block 26
Block first atom: 1376
Blocpdb> 59 atoms in block 27
Block first atom: 1430
Blocpdb> 54 atoms in block 28
Block first atom: 1489
Blocpdb> 59 atoms in block 29
Block first atom: 1543
Blocpdb> 55 atoms in block 30
Block first atom: 1602
Blocpdb> 53 atoms in block 31
Block first atom: 1657
Blocpdb> 58 atoms in block 32
Block first atom: 1710
Blocpdb> 56 atoms in block 33
Block first atom: 1768
Blocpdb> 61 atoms in block 34
Block first atom: 1824
Blocpdb> 53 atoms in block 35
Block first atom: 1885
Blocpdb> 50 atoms in block 36
Block first atom: 1938
Blocpdb> 46 atoms in block 37
Block first atom: 1988
Blocpdb> 50 atoms in block 38
Block first atom: 2034
Blocpdb> 45 atoms in block 39
Block first atom: 2084
Blocpdb> 54 atoms in block 40
Block first atom: 2129
Blocpdb> 51 atoms in block 41
Block first atom: 2183
Blocpdb> 61 atoms in block 42
Block first atom: 2234
Blocpdb> 46 atoms in block 43
Block first atom: 2295
Blocpdb> 59 atoms in block 44
Block first atom: 2341
Blocpdb> 51 atoms in block 45
Block first atom: 2400
Blocpdb> 55 atoms in block 46
Block first atom: 2451
Blocpdb> 54 atoms in block 47
Block first atom: 2506
Blocpdb> 54 atoms in block 48
Block first atom: 2560
Blocpdb> 47 atoms in block 49
Block first atom: 2614
Blocpdb> 55 atoms in block 50
Block first atom: 2661
Blocpdb> 47 atoms in block 51
Block first atom: 2716
Blocpdb> 51 atoms in block 52
Block first atom: 2763
Blocpdb> 52 atoms in block 53
Block first atom: 2814
Blocpdb> 49 atoms in block 54
Block first atom: 2866
Blocpdb> 60 atoms in block 55
Block first atom: 2915
Blocpdb> 57 atoms in block 56
Block first atom: 2975
Blocpdb> 61 atoms in block 57
Block first atom: 3032
Blocpdb> 47 atoms in block 58
Block first atom: 3093
Blocpdb> 58 atoms in block 59
Block first atom: 3140
Blocpdb> 48 atoms in block 60
Block first atom: 3198
Blocpdb> 51 atoms in block 61
Block first atom: 3246
Blocpdb> 10 atoms in block 62
Block first atom: 3297
Blocpdb> 61 atoms in block 63
Block first atom: 3307
Blocpdb> 56 atoms in block 64
Block first atom: 3368
Blocpdb> 55 atoms in block 65
Block first atom: 3424
Blocpdb> 53 atoms in block 66
Block first atom: 3479
Blocpdb> 59 atoms in block 67
Block first atom: 3532
Blocpdb> 53 atoms in block 68
Block first atom: 3591
Blocpdb> 48 atoms in block 69
Block first atom: 3644
Blocpdb> 61 atoms in block 70
Block first atom: 3692
Blocpdb> 47 atoms in block 71
Block first atom: 3753
Blocpdb> 46 atoms in block 72
Block first atom: 3800
Blocpdb> 57 atoms in block 73
Block first atom: 3846
Blocpdb> 61 atoms in block 74
Block first atom: 3903
Blocpdb> 52 atoms in block 75
Block first atom: 3964
Blocpdb> 55 atoms in block 76
Block first atom: 4016
Blocpdb> 57 atoms in block 77
Block first atom: 4071
Blocpdb> 48 atoms in block 78
Block first atom: 4128
Blocpdb> 59 atoms in block 79
Block first atom: 4176
Blocpdb> 56 atoms in block 80
Block first atom: 4235
Blocpdb> 54 atoms in block 81
Block first atom: 4291
Blocpdb> 64 atoms in block 82
Block first atom: 4345
Blocpdb> 57 atoms in block 83
Block first atom: 4409
Blocpdb> 50 atoms in block 84
Block first atom: 4466
Blocpdb> 59 atoms in block 85
Block first atom: 4516
Blocpdb> 52 atoms in block 86
Block first atom: 4575
Blocpdb> 55 atoms in block 87
Block first atom: 4627
Blocpdb> 54 atoms in block 88
Block first atom: 4682
Blocpdb> 59 atoms in block 89
Block first atom: 4736
Blocpdb> 54 atoms in block 90
Block first atom: 4795
Blocpdb> 59 atoms in block 91
Block first atom: 4849
Blocpdb> 55 atoms in block 92
Block first atom: 4908
Blocpdb> 53 atoms in block 93
Block first atom: 4963
Blocpdb> 58 atoms in block 94
Block first atom: 5016
Blocpdb> 56 atoms in block 95
Block first atom: 5074
Blocpdb> 61 atoms in block 96
Block first atom: 5130
Blocpdb> 53 atoms in block 97
Block first atom: 5191
Blocpdb> 50 atoms in block 98
Block first atom: 5244
Blocpdb> 46 atoms in block 99
Block first atom: 5294
Blocpdb> 50 atoms in block 100
Block first atom: 5340
Blocpdb> 45 atoms in block 101
Block first atom: 5390
Blocpdb> 54 atoms in block 102
Block first atom: 5435
Blocpdb> 51 atoms in block 103
Block first atom: 5489
Blocpdb> 61 atoms in block 104
Block first atom: 5540
Blocpdb> 46 atoms in block 105
Block first atom: 5601
Blocpdb> 59 atoms in block 106
Block first atom: 5647
Blocpdb> 51 atoms in block 107
Block first atom: 5706
Blocpdb> 55 atoms in block 108
Block first atom: 5757
Blocpdb> 54 atoms in block 109
Block first atom: 5812
Blocpdb> 54 atoms in block 110
Block first atom: 5866
Blocpdb> 47 atoms in block 111
Block first atom: 5920
Blocpdb> 55 atoms in block 112
Block first atom: 5967
Blocpdb> 47 atoms in block 113
Block first atom: 6022
Blocpdb> 51 atoms in block 114
Block first atom: 6069
Blocpdb> 52 atoms in block 115
Block first atom: 6120
Blocpdb> 49 atoms in block 116
Block first atom: 6172
Blocpdb> 60 atoms in block 117
Block first atom: 6221
Blocpdb> 57 atoms in block 118
Block first atom: 6281
Blocpdb> 61 atoms in block 119
Block first atom: 6338
Blocpdb> 47 atoms in block 120
Block first atom: 6399
Blocpdb> 58 atoms in block 121
Block first atom: 6446
Blocpdb> 48 atoms in block 122
Block first atom: 6504
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 6552
Blocpdb> 10 atoms in block 124
Block first atom: 6603
Blocpdb> 61 atoms in block 125
Block first atom: 6613
Blocpdb> 56 atoms in block 126
Block first atom: 6674
Blocpdb> 55 atoms in block 127
Block first atom: 6730
Blocpdb> 53 atoms in block 128
Block first atom: 6785
Blocpdb> 59 atoms in block 129
Block first atom: 6838
Blocpdb> 53 atoms in block 130
Block first atom: 6897
Blocpdb> 48 atoms in block 131
Block first atom: 6950
Blocpdb> 61 atoms in block 132
Block first atom: 6998
Blocpdb> 47 atoms in block 133
Block first atom: 7059
Blocpdb> 46 atoms in block 134
Block first atom: 7106
Blocpdb> 57 atoms in block 135
Block first atom: 7152
Blocpdb> 61 atoms in block 136
Block first atom: 7209
Blocpdb> 52 atoms in block 137
Block first atom: 7270
Blocpdb> 55 atoms in block 138
Block first atom: 7322
Blocpdb> 57 atoms in block 139
Block first atom: 7377
Blocpdb> 48 atoms in block 140
Block first atom: 7434
Blocpdb> 59 atoms in block 141
Block first atom: 7482
Blocpdb> 56 atoms in block 142
Block first atom: 7541
Blocpdb> 54 atoms in block 143
Block first atom: 7597
Blocpdb> 64 atoms in block 144
Block first atom: 7651
Blocpdb> 57 atoms in block 145
Block first atom: 7715
Blocpdb> 50 atoms in block 146
Block first atom: 7772
Blocpdb> 59 atoms in block 147
Block first atom: 7822
Blocpdb> 52 atoms in block 148
Block first atom: 7881
Blocpdb> 55 atoms in block 149
Block first atom: 7933
Blocpdb> 54 atoms in block 150
Block first atom: 7988
Blocpdb> 59 atoms in block 151
Block first atom: 8042
Blocpdb> 54 atoms in block 152
Block first atom: 8101
Blocpdb> 59 atoms in block 153
Block first atom: 8155
Blocpdb> 55 atoms in block 154
Block first atom: 8214
Blocpdb> 53 atoms in block 155
Block first atom: 8269
Blocpdb> 58 atoms in block 156
Block first atom: 8322
Blocpdb> 56 atoms in block 157
Block first atom: 8380
Blocpdb> 61 atoms in block 158
Block first atom: 8436
Blocpdb> 53 atoms in block 159
Block first atom: 8497
Blocpdb> 50 atoms in block 160
Block first atom: 8550
Blocpdb> 46 atoms in block 161
Block first atom: 8600
Blocpdb> 50 atoms in block 162
Block first atom: 8646
Blocpdb> 45 atoms in block 163
Block first atom: 8696
Blocpdb> 54 atoms in block 164
Block first atom: 8741
Blocpdb> 51 atoms in block 165
Block first atom: 8795
Blocpdb> 61 atoms in block 166
Block first atom: 8846
Blocpdb> 46 atoms in block 167
Block first atom: 8907
Blocpdb> 59 atoms in block 168
Block first atom: 8953
Blocpdb> 51 atoms in block 169
Block first atom: 9012
Blocpdb> 55 atoms in block 170
Block first atom: 9063
Blocpdb> 54 atoms in block 171
Block first atom: 9118
Blocpdb> 54 atoms in block 172
Block first atom: 9172
Blocpdb> 47 atoms in block 173
Block first atom: 9226
Blocpdb> 55 atoms in block 174
Block first atom: 9273
Blocpdb> 47 atoms in block 175
Block first atom: 9328
Blocpdb> 51 atoms in block 176
Block first atom: 9375
Blocpdb> 52 atoms in block 177
Block first atom: 9426
Blocpdb> 49 atoms in block 178
Block first atom: 9478
Blocpdb> 60 atoms in block 179
Block first atom: 9527
Blocpdb> 57 atoms in block 180
Block first atom: 9587
Blocpdb> 61 atoms in block 181
Block first atom: 9644
Blocpdb> 47 atoms in block 182
Block first atom: 9705
Blocpdb> 58 atoms in block 183
Block first atom: 9752
Blocpdb> 48 atoms in block 184
Block first atom: 9810
Blocpdb> 51 atoms in block 185
Block first atom: 9858
Blocpdb> 10 atoms in block 186
Block first atom: 9908
Blocpdb> 186 blocks.
Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3730004 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 29754
Prepmat> Matrix trace = 8157500.0000
Prepmat> Last element read: 29754 29754 129.6641
Prepmat> 17392 lines saved.
Prepmat> 16172 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9918
RTB> Total mass = 9918.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9918
RTB> Number of blocks = 186
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 187040.5079
RTB> 41094 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1116
Diagstd> Nb of non-zero elements: 41094
Diagstd> Projected matrix trace = 187040.5079
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1116 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 187040.5079
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
.0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000
.0000000 .8319557 .8406434 1.6099371 1.9942953
2.0014588 2.7051015 2.7332159 2.8123203 3.2356598
3.3206021 3.8967276 3.9374415 4.0247683 4.9752268
5.0074435 5.4361277 5.4799156 5.6364980 6.4119584
6.4295538 7.0072415 7.5204815 8.4278885 8.4989956
8.8332518 9.0028429 9.0304624 9.2053276 9.3667437
9.3796255 10.0839993 10.1488919 10.2513127 10.9706528
11.5138355 11.5901050 11.9312299 12.2735293 12.4841477
12.6463714 12.7013050 12.8601922 13.0962922 13.8684399
13.9839732 14.1294311 14.1772144 14.3836072 15.8355297
15.9587217 16.1199115 16.8503679 16.9188115 16.9751114
17.6807537 17.7181952 17.7314140 18.3036462 18.4755357
18.5160201 18.8656289 20.1619468 20.2699109 20.3436571
20.9178856 21.0477430 21.5533352 23.2267788 23.2412093
23.4854620 23.5249443 23.6525464 23.7779211 24.6467608
25.0428662 25.3111149 25.4074109 26.2429403 26.2915408
26.8541705 27.2071427 27.4740874 27.6148342 27.8697931
28.0022905 28.2344428 29.0544364 29.0833826 29.4224525
29.7664252 29.9357341 30.3394269 30.4800068 30.7240049
31.2207593 31.2674985 31.3092644 32.5843954 33.1617690
33.2660272
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
.0034333 .0034334 .0034334 .0034336 .0034339
.0034343 99.0479248 99.5637372 137.7843014 153.3521998
153.6273741 178.6023075 179.5280243 182.1074325 195.3334899
197.8808183 214.3607678 215.4777037 217.8540927 242.2153842
242.9983404 253.1862426 254.2039027 257.8101184 274.9733647
275.3503911 287.4543086 297.7954818 315.2496926 316.5767980
322.7420740 325.8255339 326.3249465 329.4692641 332.3453444
332.5737974 344.8352728 345.9430371 347.6842521 359.6760463
368.4726775 369.6910747 375.0920743 380.4346038 383.6849184
386.1697453 387.0075634 389.4206787 392.9791047 404.3980796
406.0790388 408.1855424 408.8751661 411.8406277 432.1271743
433.8047780 435.9900788 445.7588498 446.6632348 447.4057868
456.6102614 457.0934746 457.2639520 464.5838262 466.7601813
467.2712947 471.6620387 487.5975469 488.9013093 489.7898642
496.6542685 498.1934873 504.1415846 523.3470405 523.5095894
526.2533027 526.6954690 528.1219661 529.5198210 539.1072907
543.4221001 546.3248028 547.3630611 556.2903503 556.8052215
562.7314025 566.4176100 569.1895503 570.6456359 573.2738772
574.6349790 577.0120608 585.3309763 585.6224788 589.0263391
592.4594360 594.1419765 598.1346566 599.5188053 601.9136515
606.7600947 607.2141016 607.6195135 619.8692803 625.3369991
626.3192349
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9918
Rtb_to_modes> Number of blocs = 186
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: .8320
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: .8406
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.610
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.994
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.001
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.705
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.733
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.812
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.236
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.321
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.897
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.937
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.025
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.436
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.636
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.412
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.428
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.499
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.833
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.003
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.030
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.367
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.380
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00000
.99999 .99998 1.00001 .99999 .99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99998
1.00001 .99997 .99999 .99997 1.00000
.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
.99999 1.00000 1.00001 1.00001 .99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
.99999 .99999 1.00001 1.00000 .99999
.99998 1.00001 1.00000 .99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 .99999
.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00002
1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000
1.00000 .99999 1.00000 1.00001 .99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
.99999 1.00000 .99998 1.00000 .99999
1.00001 .99999 1.00001 1.00000 .99999
.99999 .99999 1.00000 .99997 1.00000
1.00000 1.00000 .99999 1.00001 1.00002
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 178524 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00000
.99999 .99998 1.00001 .99999 .99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99998
1.00001 .99997 .99999 .99997 1.00000
.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
.99999 1.00000 1.00001 1.00001 .99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
.99999 .99999 1.00001 1.00000 .99999
.99998 1.00001 1.00000 .99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 .99999
.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00002
1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000
1.00000 .99999 1.00000 1.00001 .99998
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
.99999 1.00000 .99998 1.00000 .99999
1.00001 .99999 1.00001 1.00000 .99999
.99999 .99999 1.00000 .99997 1.00000
1.00000 1.00000 .99999 1.00001 1.00002
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: .000
Vector 3: .000 .000
Vector 4: .000 .000 .000
Vector 5: .000 .000 .000 .000
Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000
Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051617144916654.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051617144916654.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 14051617144916654.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051617144916654.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1284
First residue number = 1
Last residue number = 428
Number of atoms found = 9918
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: .8320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: .8406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.610
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.994
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.001
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.705
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.733
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.812
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.897
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.937
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.025
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.436
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.430
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.520
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.428
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.833
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.367
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.380
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27
Bfactors> 106 vectors, 29754 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : .832000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= .486 for 1284 C-alpha atoms.
Bfactors> = .019 +/- .02
Bfactors> = 48.241 +/- 15.73
Bfactors> Shiftng-fct= 48.222
Bfactors> Scaling-fct= 982.094
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051617144916654.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051617144916654.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3
Chkmod> 106 vectors, 29754 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9918 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
.0034 .8084
.0034 .8735
.0034 .8667
.0034 .8044
.0034 .7839
.0034 .7443
99.0463 .6363
99.5569 .6361
137.7811 .5609
153.3343 .5989
153.6032 .5952
178.5913 .6407
179.5132 .6530
182.0892 .5665
195.3354 .3420
197.8842 .4337
214.3591 .4017
215.4564 .5488
217.8510 .4661
242.1995 .6052
242.9771 .6026
253.1724 .6432
254.1949 .6975
257.7877 .0893
274.9625 .7282
275.3481 .7435
287.4370 .6304
297.7732 .8289
315.2382 .4041
316.5633 .5192
322.7236 .5490
325.8144 .5700
326.3026 .5387
329.4493 .5111
332.3356 .4298
332.5662 .4237
344.7521 .6045
345.9471 .5191
347.6471 .4794
359.6499 .2358
368.3955 .4149
369.6735 .5779
375.0566 .2553
380.3636 .3972
383.6047 .4526
386.2086 .1102
386.9711 .5692
389.4011 .4427
393.0179 .0284
404.4035 .1001
406.0039 .5907
408.1762 .4662
408.8978 .4516
411.7713 .6786
432.1696 .5781
433.8035 .5978
435.9726 .6826
445.7348 .5575
446.6597 .5003
447.4510 .5236
456.5809 .6785
457.0971 .6577
457.2261 .6559
464.5176 .5546
466.7965 .5232
467.3014 .5314
471.6964 .6066
487.5531 .5973
488.8814 .5999
489.7248 .6155
496.6580 .6619
498.1988 .6595
504.0809 .6341
523.3609 .6744
523.4735 .6632
526.2815 .5671
526.6175 .5772
528.0709 .5664
529.5202 .5703
539.1196 .4802
543.3677 .5398
546.2893 .5203
547.3675 .5266
556.2353 .6394
556.7650 .6404
562.6635 .4231
566.4230 .3162
569.1228 .1455
570.5712 .2958
573.2514 .2691
574.5868 .2977
576.9419 .3352
585.2612 .2914
585.5633 .2616
588.9765 .2762
592.4696 .4829
594.1588 .2984
598.1146 .3903
599.4930 .4057
601.8486 .2108
606.7267 .5210
607.2123 .5024
607.6006 .5409
619.8009 .4177
625.2935 .5188
626.3297 .5288
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617144916654.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617144916654.eigenfacs
14051617144916654.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617144916654.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617144916654.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
14051617144916654.10.pdb
14051617144916654.11.pdb
14051617144916654.7.pdb
14051617144916654.8.pdb
14051617144916654.9.pdb
STDERR:
96.73user 1.81system 1:38.63elapsed 99%CPU (0avgtext+0avgdata 186160maxresident)k
0inputs+259168outputs (0major+11715minor)pagefaults 0swaps
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
