***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 14051917195825065.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 14051917195825065.atom to be opened.
Openam> File opened: 14051917195825065.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 220
First residue number = 5
Last residue number = 224
Number of atoms found = 1714
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.518405 +/- 8.555467 From: -17.412000 To: 20.474000
= -31.716337 +/- 15.444123 From: -60.847000 To: -.897000
= 5.882805 +/- 7.270063 From: -15.034000 To: 23.127000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6225 % Filled.
Pdbmat> 611216 non-zero elements.
Pdbmat> 66783 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.93 +/- 21.42
Maximum number = 130
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 1.335660E+06
Pdbmat> Larger element = 470.948
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
220 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 14051917195825065.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 14051917195825065.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
14051917195825065.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1714 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 220 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 12 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 28
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 43
Blocpdb> 18 atoms in block 5
Block first atom: 55
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 73
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 91
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 111
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 129
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 141
Blocpdb> 11 atoms in block 11
Block first atom: 161
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 172
Blocpdb> 15 atoms in block 13
Block first atom: 191
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 206
Blocpdb> 10 atoms in block 15
Block first atom: 228
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 238
Blocpdb> 18 atoms in block 17
Block first atom: 251
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 269
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 286
Blocpdb> 21 atoms in block 20
Block first atom: 302
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 323
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 340
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 355
Blocpdb> 10 atoms in block 24
Block first atom: 374
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 384
Blocpdb> 12 atoms in block 26
Block first atom: 400
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 412
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 429
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 445
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 460
Blocpdb> 13 atoms in block 31
Block first atom: 476
Blocpdb> 9 atoms in block 32
Block first atom: 489
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 498
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 513
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 528
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 545
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 565
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 579
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 595
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 612
Blocpdb> 24 atoms in block 41
Block first atom: 624
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 648
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 663
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 675
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 690
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 705
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 719
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 735
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 751
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 767
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 780
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 797
Blocpdb> 13 atoms in block 53
Block first atom: 813
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 826
Blocpdb> 12 atoms in block 55
Block first atom: 840
Blocpdb> 15 atoms in block 56
Block first atom: 852
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 867
Blocpdb> 10 atoms in block 58
Block first atom: 878
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 888
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 903
Blocpdb> 14 atoms in block 61
Block first atom: 920
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 934
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 950
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 966
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 983
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1002
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1022
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1037
Blocpdb> 13 atoms in block 69
Block first atom: 1053
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1066
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1086
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 1103
Blocpdb> 19 atoms in block 73
Block first atom: 1114
Blocpdb> 13 atoms in block 74
Block first atom: 1133
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1146
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1158
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1176
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1191
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1206
Blocpdb> 23 atoms in block 80
Block first atom: 1222
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1245
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1262
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1274
Blocpdb> 13 atoms in block 84
Block first atom: 1286
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1299
Blocpdb> 12 atoms in block 86
Block first atom: 1319
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1331
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1343
Blocpdb> 14 atoms in block 89
Block first atom: 1357
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1371
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1389
Blocpdb> 13 atoms in block 92
Block first atom: 1405
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 1418
Blocpdb> 13 atoms in block 94
Block first atom: 1436
Blocpdb> 14 atoms in block 95
Block first atom: 1449
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1463
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 1480
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1499
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1515
Blocpdb> 13 atoms in block 100
Block first atom: 1527
Blocpdb> 16 atoms in block 101
Block first atom: 1540
Blocpdb> 19 atoms in block 102
Block first atom: 1556
Blocpdb> 17 atoms in block 103
Block first atom: 1575
Blocpdb> 11 atoms in block 104
Block first atom: 1592
Blocpdb> 20 atoms in block 105
Block first atom: 1603
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1623
Blocpdb> 21 atoms in block 107
Block first atom: 1640
Blocpdb> 23 atoms in block 108
Block first atom: 1661
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1684
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1698
Blocpdb> 110 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 611326 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5142
Prepmat> Matrix trace = 1335660.0000
Prepmat> Last element read: 5142 5142 132.1285
Prepmat> 6106 lines saved.
Prepmat> 5016 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1714
RTB> Total mass = 1714.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1714
RTB> Number of blocks = 110
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 143164.1955
RTB> 37554 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 660
Diagstd> Nb of non-zero elements: 37554
Diagstd> Projected matrix trace = 143164.1955
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 660 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 143164.1955
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
.0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000
.0000000 .8980090 1.2609219 2.3546027 6.0466211
6.6105133 7.4050921 8.1141436 11.3000919 11.6246526
13.7651078 15.5275171 16.9112448 18.5287099 18.8337215
19.2669993 22.0548622 22.5230636 23.8775592 24.9057297
25.8811446 26.1277162 26.8123435 27.3101613 29.2527273
29.8716814 30.1220539 30.3792320 31.2380461 32.3353414
33.0696556 33.3707660 34.4393019 34.9716078 36.5989022
37.3152628 38.4301605 38.7592337 40.0004359 40.7429114
42.4417255 42.6460150 43.7262714 44.3024985 45.5356454
46.6977704 47.1945672 48.4208427 49.6547778 50.0127648
50.7564959 51.9800869 52.9088057 53.4430169 54.0506694
54.4577727 54.8760648 55.6378240 56.8622858 59.8466958
60.6601536 61.1812287 62.0101862 62.9501566 62.9830929
64.1183509 64.1551285 64.7290349 65.5877448 66.8213506
67.6228144 67.7020206 69.2002941 69.6343238 70.3172023
70.6103644 71.4573421 72.8876705 74.0332503 74.3877414
75.1428315 75.7077254 76.5518129 77.6653292 78.1721655
78.9271639 79.3401365 80.1580395 82.1958480 82.2517282
82.6811791 83.7295027 84.0974270 84.3376354 84.9900983
85.8489862 86.0692157 87.4755249 87.9151278 89.4649082
90.5591553
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
.0034331 .0034334 .0034335 .0034342 .0034346
.0034351 102.9047960 121.9380856 166.6303465 267.0248362
279.1983661 295.5020607 309.3261419 365.0364795 370.2416492
402.8887016 427.9039435 446.5633416 467.4313877 471.2630096
476.6529897 509.9733179 515.3579884 530.6281003 541.9321496
552.4424210 555.0677634 562.2929873 567.4889544 587.3249651
593.5060008 595.9880766 598.5269021 606.9280526 617.4957963
624.4678963 627.3044499 637.2684974 642.1745350 656.9454507
663.3435834 673.1802711 676.0563109 686.7958187 693.1405555
707.4435585 709.1441226 718.0695377 722.7854312 732.7756483
742.0674007 746.0042201 755.6339325 765.2014807 767.9548938
773.6438831 782.9134982 789.8766204 793.8542302 798.3545759
801.3554919 804.4272250 809.9912895 818.8558141 840.0697938
845.7597889 849.3845898 855.1194758 861.5761881 861.8015523
869.5337680 869.7831097 873.6648159 879.4408393 887.6727845
892.9803477 893.5031658 903.3358590 906.1643277 910.5966993
912.4929268 917.9493307 927.0908939 934.3480608 936.5823441
941.3238408 944.8554652 950.1080992 956.9932487 960.1107924
964.7360977 967.2567120 972.2295649 984.5102008 984.8447996
987.4124777 993.6525149 995.8332769 997.2544676 1001.1045749
1006.1503111 1007.4400297 1015.6371051 1018.1859177 1027.1210757
1033.3833545
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1714
Rtb_to_modes> Number of blocs = 110
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: .8980
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.261
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.355
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.047
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.611
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.405
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.56
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 660 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 .99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 .99999 .99997 1.00004
.99999 .99999 .99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 .99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
.99999 1.00000 .99996 1.00001 1.00002
1.00003 .99998 .99997 1.00002 .99998
.99998 1.00000 .99997 1.00001 1.00002
1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003
1.00000 .99998 .99998 .99998 .99997
.99999 1.00002 .99999 1.00001 1.00001
.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
.99998 .99996 .99997 .99999 1.00000
1.00001 .99999 1.00002 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 .99997 1.00000 .99999 .99999
1.00000 1.00000 1.00001 .99998 .99996
1.00002 .99998 1.00004 1.00001 1.00000
.99998 .99999 1.00002 .99999 1.00003
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 30852 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 .99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001
1.00000 1.00001 .99999 .99997 1.00004
.99999 .99999 .99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 .99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
.99999 1.00000 .99996 1.00001 1.00002
1.00003 .99998 .99997 1.00002 .99998
.99998 1.00000 .99997 1.00001 1.00002
1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003
1.00000 .99998 .99998 .99998 .99997
.99999 1.00002 .99999 1.00001 1.00001
.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
.99998 .99996 .99997 .99999 1.00000
1.00001 .99999 1.00002 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 .99997 1.00000 .99999 .99999
1.00000 1.00000 1.00001 .99998 .99996
1.00002 .99998 1.00004 1.00001 1.00000
.99998 .99999 1.00002 .99999 1.00003
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: .000
Vector 3: .000 .000
Vector 4: .000 .000 .000
Vector 5: .000 .000 .000 .000
Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000
Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051917195825065.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051917195825065.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 14051917195825065.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051917195825065.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 220
First residue number = 5
Last residue number = 224
Number of atoms found = 1714
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: .8980
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.355
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.405
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.56
Bfactors> 106 vectors, 5142 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : .898000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= .524 for 220 C-alpha atoms.
Bfactors> = .042 +/- .03
Bfactors> = 20.362 +/- 9.84
Bfactors> Shiftng-fct= 20.320
Bfactors> Scaling-fct= 325.429
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051917195825065.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051917195825065.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Chkmod> 106 vectors, 5142 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1714 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
.0034 .7670
.0034 .8921
.0034 .9527
.0034 .7246
.0034 .9189
.0034 .7809
102.8999 .7407
121.9366 .6116
166.6373 .6860
267.0217 .2976
279.1967 .6239
295.4875 .5745
309.3101 .2871
365.0193 .1250
370.1517 .2479
402.9430 .4112
427.9198 .4957
446.5277 .3024
467.4276 .3191
471.1962 .5459
476.6696 .4131
509.8952 .4018
515.3008 .3642
530.6324 .3839
541.9553 .3662
552.4065 .4531
555.0682 .5634
562.2443 .5717
567.4629 .4871
587.2724 .4100
593.4638 .4250
595.9422 .3388
598.5088 .3708
606.9210 .3957
617.5138 .5398
624.4443 .4174
627.2703 .3752
637.2476 .5627
642.1322 .4691
656.9271 .4274
663.3572 .3891
673.1500 .3573
676.0340 .4567
686.7626 .5432
693.0860 .4236
707.3988 .4518
709.1468 .5129
718.0693 .5541
722.7340 .4654
732.7792 .5078
742.0533 .6038
745.9361 .3476
755.5949 .5683
765.1318 .4500
767.9007 .5165
773.6374 .4418
782.8792 .4561
789.8516 .4477
793.7977 .4522
798.3154 .4052
801.3375 .4465
804.4215 .5549
809.9724 .5684
818.8042 .3968
840.0569 .4920
845.7224 .4170
849.3396 .5614
855.0815 .5071
861.5381 .4517
861.7434 .4229
869.5076 .3451
869.7788 .3563
873.6338 .3205
879.4182 .5551
887.6257 .4420
892.9234 .3776
893.4515 .3225
903.2952 .3931
906.0973 .3723
910.5757 .2865
912.4514 .4097
917.9270 .4421
927.0659 .3425
934.2874 .3599
936.5564 .4465
941.2657 .4977
944.8291 .4618
950.0561 .2316
956.9809 .4305
960.0563 .2774
964.7120 .4242
967.2144 .2425
972.1997 .4245
984.4928 .4842
984.7922 .3146
987.3631 .4146
993.6128 .2185
995.8058 .4379
997.2256 .3380
1001.0610 .4310
1006.1131 .3995
1007.4014 .3417
1015.6195 .4774
1018.1704 .5372
1027.0488 .4596
1033.3438 .4241
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 14051917195825065.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051917195825065.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 14051917195825065.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051917195825065.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 14051917195825065.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
14051917195825065.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Projmod> 106 vectors, 5142 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 220
First residue number = 5
Last residue number = 224
Number of atoms found = 1714
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 220
First residue number = 5
Last residue number = 224
Number of atoms found = 1714
Mean number per residue = 7.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1714 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 5.59
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- .00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0004
Vector: 2 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0000
Vector: 3 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0005
Vector: 4 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= -.0006
Vector: 5 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0004
Vector: 6 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0050
Vector: 7 F= 102.90 Cos= -.895 Sum= .802 q= -207.3613
Vector: 8 F= 121.94 Cos= -.105 Sum= .813 q= -24.2790
Vector: 9 F= 166.64 Cos= -.086 Sum= .820 q= -19.9074
Vector: 10 F= 267.02 Cos= -.039 Sum= .822 q= -9.0781
Vector: 11 F= 279.20 Cos= -.175 Sum= .852 q= -40.4212
Vector: 12 F= 295.49 Cos= .004 Sum= .852 q= .8893
Vector: 13 F= 309.31 Cos= .002 Sum= .852 q= .4708
Vector: 14 F= 365.02 Cos= -.005 Sum= .852 q= -1.1491
%Projmod-Wn> Eigenvector 15 Norm= 1.0001
Vector: 15 F= 370.15 Cos= -.016 Sum= .852 q= -3.7439
Vector: 16 F= 402.94 Cos= .052 Sum= .855 q= 12.1094
Vector: 17 F= 427.92 Cos= -.034 Sum= .856 q= -7.8940
Vector: 18 F= 446.53 Cos= .027 Sum= .857 q= 6.1729
Vector: 19 F= 467.43 Cos= .021 Sum= .857 q= 4.9275
Vector: 20 F= 471.20 Cos= .060 Sum= .861 q= 13.8398
Vector: 21 F= 476.67 Cos= .064 Sum= .865 q= 14.8559
Vector: 22 F= 509.90 Cos= -.048 Sum= .867 q= -11.1501
Vector: 23 F= 515.30 Cos= -.024 Sum= .868 q= -5.5757
Vector: 24 F= 530.63 Cos= -.006 Sum= .868 q= -1.4181
Vector: 25 F= 541.96 Cos= -.017 Sum= .868 q= -3.9397
Vector: 26 F= 552.41 Cos= -.001 Sum= .868 q= -.2033
Vector: 27 F= 555.07 Cos= .011 Sum= .868 q= 2.4545
Vector: 28 F= 562.24 Cos= .033 Sum= .870 q= 7.6942
Vector: 29 F= 567.46 Cos= .065 Sum= .874 q= 14.9442
Vector: 30 F= 587.27 Cos= .009 Sum= .874 q= 2.1242
Vector: 31 F= 593.46 Cos= -.001 Sum= .874 q= -.3396
Vector: 32 F= 595.94 Cos= -.001 Sum= .874 q= -.3150
Vector: 33 F= 598.51 Cos= -.038 Sum= .875 q= -8.7750
Vector: 34 F= 606.92 Cos= .041 Sum= .877 q= 9.4780
Vector: 35 F= 617.51 Cos= -.026 Sum= .878 q= -5.9841
Vector: 36 F= 624.44 Cos= -.002 Sum= .878 q= -.5237
Vector: 37 F= 627.27 Cos= .012 Sum= .878 q= 2.8347
Vector: 38 F= 637.25 Cos= -.028 Sum= .879 q= -6.5009
Vector: 39 F= 642.13 Cos= -.052 Sum= .881 q= -12.0584
Vector: 40 F= 656.93 Cos= -.025 Sum= .882 q= -5.6931
Vector: 41 F= 663.36 Cos= -.015 Sum= .882 q= -3.5285
Vector: 42 F= 673.15 Cos= .015 Sum= .882 q= 3.4075
Vector: 43 F= 676.03 Cos= .004 Sum= .882 q= 1.0318
Vector: 44 F= 686.76 Cos= -.053 Sum= .885 q= -12.3488
Vector: 45 F= 693.09 Cos= .031 Sum= .886 q= 7.1154
Vector: 46 F= 707.40 Cos= -.006 Sum= .886 q= -1.2993
Vector: 47 F= 709.15 Cos= -.012 Sum= .886 q= -2.8062
Vector: 48 F= 718.07 Cos= .055 Sum= .889 q= 12.6420
Vector: 49 F= 722.73 Cos= .030 Sum= .890 q= 6.8403
Vector: 50 F= 732.78 Cos= .028 Sum= .891 q= 6.4006
Vector: 51 F= 742.05 Cos= .001 Sum= .891 q= .2465
Vector: 52 F= 745.94 Cos= .012 Sum= .891 q= 2.7165
Vector: 53 F= 755.59 Cos= .008 Sum= .891 q= 1.8717
Vector: 54 F= 765.13 Cos= .014 Sum= .891 q= 3.1692
Vector: 55 F= 767.90 Cos= -.022 Sum= .892 q= -5.1973
Vector: 56 F= 773.64 Cos= .032 Sum= .893 q= 7.3019
Vector: 57 F= 782.88 Cos= .007 Sum= .893 q= 1.6243
Vector: 58 F= 789.85 Cos= .044 Sum= .895 q= 10.1702
Vector: 59 F= 793.80 Cos= -.015 Sum= .895 q= -3.3855
Vector: 60 F= 798.32 Cos= -.011 Sum= .895 q= -2.5074
Vector: 61 F= 801.34 Cos= .000 Sum= .895 q= .1092
Vector: 62 F= 804.42 Cos= .040 Sum= .897 q= 9.3185
Vector: 63 F= 809.97 Cos= .018 Sum= .897 q= 4.2204
Vector: 64 F= 818.80 Cos= .024 Sum= .898 q= 5.5046
Vector: 65 F= 840.06 Cos= -.025 Sum= .898 q= -5.6796
Vector: 66 F= 845.72 Cos= -.037 Sum= .900 q= -8.5972
Vector: 67 F= 849.34 Cos= .003 Sum= .900 q= .6720
Vector: 68 F= 855.08 Cos= -.001 Sum= .900 q= -.1534
Vector: 69 F= 861.54 Cos= .016 Sum= .900 q= 3.7417
Vector: 70 F= 861.74 Cos= .027 Sum= .901 q= 6.1706
Vector: 71 F= 869.51 Cos= -.007 Sum= .901 q= -1.7221
Vector: 72 F= 869.78 Cos= -.019 Sum= .901 q= -4.5026
Vector: 73 F= 873.63 Cos= .011 Sum= .901 q= 2.4755
Vector: 74 F= 879.42 Cos= .021 Sum= .902 q= 4.9646
Vector: 75 F= 887.63 Cos= -.002 Sum= .902 q= -.5173
Vector: 76 F= 892.92 Cos= .003 Sum= .902 q= .7444
Vector: 77 F= 893.45 Cos= -.020 Sum= .902 q= -4.6702
Vector: 78 F= 903.30 Cos= .024 Sum= .903 q= 5.5040
Vector: 79 F= 906.10 Cos= .011 Sum= .903 q= 2.6029
Vector: 80 F= 910.58 Cos= .007 Sum= .903 q= 1.6265
Vector: 81 F= 912.45 Cos= -.028 Sum= .904 q= -6.4885
Vector: 82 F= 917.93 Cos= .031 Sum= .904 q= 7.2308
Vector: 83 F= 927.07 Cos= .002 Sum= .904 q= .5376
Vector: 84 F= 934.29 Cos= -.018 Sum= .905 q= -4.1493
Vector: 85 F= 936.56 Cos= .021 Sum= .905 q= 4.8417
Vector: 86 F= 941.27 Cos= -.002 Sum= .905 q= -.4707
Vector: 87 F= 944.83 Cos= -.023 Sum= .906 q= -5.2207
Vector: 88 F= 950.06 Cos= -.034 Sum= .907 q= -7.8653
Vector: 89 F= 956.98 Cos= .047 Sum= .909 q= 10.8614
Vector: 90 F= 960.06 Cos= -.013 Sum= .909 q= -2.8956
Vector: 91 F= 964.71 Cos= -.033 Sum= .910 q= -7.7577
Vector: 92 F= 967.21 Cos= .018 Sum= .911 q= 4.2311
Vector: 93 F= 972.20 Cos= .003 Sum= .911 q= .7441
Vector: 94 F= 984.49 Cos= -.021 Sum= .911 q= -4.8027
Vector: 95 F= 984.79 Cos= -.023 Sum= .912 q= -5.3191
Vector: 96 F= 987.36 Cos= -.001 Sum= .912 q= -.1601
Vector: 97 F= 993.61 Cos= -.031 Sum= .913 q= -7.1878
Vector: 98 F= 995.81 Cos= .024 Sum= .913 q= 5.4513
Vector: 99 F= 997.23 Cos= .001 Sum= .913 q= .1289
Vector: 100 F= 1001.06 Cos= .011 Sum= .913 q= 2.4976
Vector: 101 F= 1006.11 Cos= .027 Sum= .914 q= 6.2664
Vector: 102 F= 1007.40 Cos= -.018 Sum= .914 q= -4.0790
Vector: 103 F= 1015.62 Cos= -.008 Sum= .914 q= -1.8985
Vector: 104 F= 1018.17 Cos= -.050 Sum= .917 q= -11.5424
Vector: 105 F= 1027.05 Cos= .003 Sum= .917 q= .5939
Vector: 106 F= 1033.34 Cos= .007 Sum= .917 q= 1.5722
Projmod> Best zero-frequency found : .003433
Projmod> 6 frequencies less than: .003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 102.899865
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -.90 for mode 7 with F= 102.90 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = .802 .843 .859 .868 .876 .917
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 14051917195825065 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051917195825065.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 14051917195825065.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 220 3.306 142 1.418
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 220 3.680 139 1.238
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 220 4.076 138 1.237
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 220 4.486 136 1.154
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 220 4.908 131 1.362
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 220 5.775 39 2.139
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 220 6.218 33 2.151
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 220 6.664 27 2.196
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 220 7.114 27 2.140
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 220 7.567 25 2.122
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 14051917195825065 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 220 5.605 131 1.102
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 220 5.471 134 1.231
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 220 5.376 133 1.338
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 220 5.322 131 0.931
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 220 5.309 131 0.902
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 220 5.409 131 0.840
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 220 5.519 133 0.984
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 220 5.667 134 1.036
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 220 5.850 133 1.026
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 220 6.064 131 0.810
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 14051917195825065 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=80
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 220 5.557 42 2.163
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 220 5.437 44 2.197
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 220 5.354 43 2.157
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 220 5.309 43 2.138
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 220 5.304 132 1.000
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 220 5.411 131 0.866
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 220 5.521 133 1.059
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 220 5.666 43 2.136
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 220 5.844 130 0.864
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 220 6.051 41 2.016
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 14051917195825065 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 220 5.721 100 1.256
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 220 5.565 100 1.341
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 220 5.447 57 2.075
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 220 5.369 43 2.200
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 220 5.332 130 1.051
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 220 5.387 132 1.194
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 220 5.477 129 1.063
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 220 5.606 129 1.161
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 220 5.772 128 1.254
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 220 5.972 124 1.335
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 14051917195825065 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051917195825065.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051917195825065.eigenfacs
14051917195825065.atom
making animated gifs
11 models are in 14051917195825065.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051917195825065.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 220 5.373 136 1.229
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 220 5.280 136 1.152
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 220 5.229 136 1.109
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 220 5.222 138 1.165
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 220 5.259 136 1.178
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 220 5.338 131 0.832
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 220 5.458 130 0.869
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 220 5.616 40 2.084
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 220 5.810 43 2.025
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 220 6.035 43 2.090
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 220 6.289 123 1.390
14051917195825065.10.pdb
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