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***  AlexCx43  ***

LOGs for ID: 210715114033143249

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210715114033143249.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210715114033143249.atom to be opened. Openam> File opened: 210715114033143249.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1194 First residue number = 3 Last residue number = 234 Number of atoms found = 11760 Mean number per residue = 9.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 107.666896 +/- 18.356506 From: 67.691000 To: 147.580000 = 107.667000 +/- 18.342345 From: 62.487000 To: 152.902000 = 113.009757 +/- 19.572854 From: 73.028000 To: 153.786000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8339 % Filled. Pdbmat> 5190084 non-zero elements. Pdbmat> 568936 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 96.76 +/- 26.10 Maximum number = 156 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 1.137872E+07 Pdbmat> Larger element = 618.481 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1194 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210715114033143249.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210715114033143249.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210715114033143249.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11760 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1194 residues. Blocpdb> 55 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 61 atoms in block 2 Block first atom: 56 Blocpdb> 55 atoms in block 3 Block first atom: 117 Blocpdb> 56 atoms in block 4 Block first atom: 172 Blocpdb> 58 atoms in block 5 Block first atom: 228 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 286 Blocpdb> 47 atoms in block 7 Block first atom: 344 Blocpdb> 60 atoms in block 8 Block first atom: 391 Blocpdb> 62 atoms in block 9 Block first atom: 451 Blocpdb> 53 atoms in block 10 Block first atom: 513 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 566 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 628 Blocpdb> 70 atoms in block 13 Block first atom: 683 Blocpdb> 58 atoms in block 14 Block first atom: 753 Blocpdb> 56 atoms in block 15 Block first atom: 811 Blocpdb> 60 atoms in block 16 Block first atom: 867 Blocpdb> 67 atoms in block 17 Block first atom: 927 Blocpdb> 59 atoms in block 18 Block first atom: 994 Blocpdb> 65 atoms in block 19 Block first atom: 1053 Blocpdb> 54 atoms in block 20 Block first atom: 1118 Blocpdb> 58 atoms in block 21 Block first atom: 1172 Blocpdb> 64 atoms in block 22 Block first atom: 1230 Blocpdb> 53 atoms in block 23 Block first atom: 1294 Blocpdb> 70 atoms in block 24 Block first atom: 1347 Blocpdb> 51 atoms in block 25 Block first atom: 1417 Blocpdb> 69 atoms in block 26 Block first atom: 1468 Blocpdb> 52 atoms in block 27 Block first atom: 1537 Blocpdb> 62 atoms in block 28 Block first atom: 1589 Blocpdb> 57 atoms in block 29 Block first atom: 1651 Blocpdb> 60 atoms in block 30 Block first atom: 1708 Blocpdb> 49 atoms in block 31 Block first atom: 1768 Blocpdb> 53 atoms in block 32 Block first atom: 1817 Blocpdb> 65 atoms in block 33 Block first atom: 1870 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 1935 Blocpdb> 55 atoms in block 35 Block first atom: 1961 Blocpdb> 61 atoms in block 36 Block first atom: 2016 Blocpdb> 55 atoms in block 37 Block first atom: 2077 Blocpdb> 56 atoms in block 38 Block first atom: 2132 Blocpdb> 58 atoms in block 39 Block first atom: 2188 Blocpdb> 58 atoms in block 40 Block first atom: 2246 Blocpdb> 47 atoms in block 41 Block first atom: 2304 Blocpdb> 60 atoms in block 42 Block first atom: 2351 Blocpdb> 62 atoms in block 43 Block first atom: 2411 Blocpdb> 53 atoms in block 44 Block first atom: 2473 Blocpdb> 62 atoms in block 45 Block first atom: 2526 Blocpdb> 55 atoms in block 46 Block first atom: 2588 Blocpdb> 70 atoms in block 47 Block first atom: 2643 Blocpdb> 58 atoms in block 48 Block first atom: 2713 Blocpdb> 56 atoms in block 49 Block first atom: 2771 Blocpdb> 60 atoms in block 50 Block first atom: 2827 Blocpdb> 67 atoms in block 51 Block first atom: 2887 Blocpdb> 59 atoms in block 52 Block first atom: 2954 Blocpdb> 65 atoms in block 53 Block first atom: 3013 Blocpdb> 54 atoms in block 54 Block first atom: 3078 Blocpdb> 58 atoms in block 55 Block first atom: 3132 Blocpdb> 64 atoms in block 56 Block first atom: 3190 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 3254 Blocpdb> 70 atoms in block 58 Block first atom: 3307 Blocpdb> 51 atoms in block 59 Block first atom: 3377 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 3428 Blocpdb> 52 atoms in block 61 Block first atom: 3497 Blocpdb> 62 atoms in block 62 Block first atom: 3549 Blocpdb> 57 atoms in block 63 Block first atom: 3611 Blocpdb> 60 atoms in block 64 Block first atom: 3668 Blocpdb> 49 atoms in block 65 Block first atom: 3728 Blocpdb> 53 atoms in block 66 Block first atom: 3777 Blocpdb> 65 atoms in block 67 Block first atom: 3830 Blocpdb> 26 atoms in block 68 Block first atom: 3895 Blocpdb> 55 atoms in block 69 Block first atom: 3921 Blocpdb> 61 atoms in block 70 Block first atom: 3976 Blocpdb> 55 atoms in block 71 Block first atom: 4037 Blocpdb> 56 atoms in block 72 Block first atom: 4092 Blocpdb> 58 atoms in block 73 Block first atom: 4148 Blocpdb> 58 atoms in block 74 Block first atom: 4206 Blocpdb> 47 atoms in block 75 Block first atom: 4264 Blocpdb> 60 atoms in block 76 Block first atom: 4311 Blocpdb> 62 atoms in block 77 Block first atom: 4371 Blocpdb> 53 atoms in block 78 Block first atom: 4433 Blocpdb> 62 atoms in block 79 Block first atom: 4486 Blocpdb> 55 atoms in block 80 Block first atom: 4548 Blocpdb> 70 atoms in block 81 Block first atom: 4603 Blocpdb> 58 atoms in block 82 Block first atom: 4673 Blocpdb> 56 atoms in block 83 Block first atom: 4731 Blocpdb> 60 atoms in block 84 Block first atom: 4787 Blocpdb> 67 atoms in block 85 Block first atom: 4847 Blocpdb> 59 atoms in block 86 Block first atom: 4914 Blocpdb> 65 atoms in block 87 Block first atom: 4973 Blocpdb> 54 atoms in block 88 Block first atom: 5038 Blocpdb> 58 atoms in block 89 Block first atom: 5092 Blocpdb> 64 atoms in block 90 Block first atom: 5150 Blocpdb> 53 atoms in block 91 Block first atom: 5214 Blocpdb> 70 atoms in block 92 Block first atom: 5267 Blocpdb> 51 atoms in block 93 Block first atom: 5337 Blocpdb> 69 atoms in block 94 Block first atom: 5388 Blocpdb> 52 atoms in block 95 Block first atom: 5457 Blocpdb> 62 atoms in block 96 Block first atom: 5509 Blocpdb> 57 atoms in block 97 Block first atom: 5571 Blocpdb> 60 atoms in block 98 Block first atom: 5628 Blocpdb> 49 atoms in block 99 Block first atom: 5688 Blocpdb> 53 atoms in block 100 Block first atom: 5737 Blocpdb> 65 atoms in block 101 Block first atom: 5790 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 5855 Blocpdb> 55 atoms in block 103 Block first atom: 5881 Blocpdb> 61 atoms in block 104 Block first atom: 5936 Blocpdb> 55 atoms in block 105 Block first atom: 5997 Blocpdb> 56 atoms in block 106 Block first atom: 6052 Blocpdb> 58 atoms in block 107 Block first atom: 6108 Blocpdb> 58 atoms in block 108 Block first atom: 6166 Blocpdb> 47 atoms in block 109 Block first atom: 6224 Blocpdb> 60 atoms in block 110 Block first atom: 6271 Blocpdb> 62 atoms in block 111 Block first atom: 6331 Blocpdb> 53 atoms in block 112 Block first atom: 6393 Blocpdb> 62 atoms in block 113 Block first atom: 6446 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 6508 Blocpdb> 70 atoms in block 115 Block first atom: 6563 Blocpdb> 58 atoms in block 116 Block first atom: 6633 Blocpdb> 56 atoms in block 117 Block first atom: 6691 Blocpdb> 60 atoms in block 118 Block first atom: 6747 Blocpdb> 67 atoms in block 119 Block first atom: 6807 Blocpdb> 59 atoms in block 120 Block first atom: 6874 Blocpdb> 65 atoms in block 121 Block first atom: 6933 Blocpdb> 54 atoms in block 122 Block first atom: 6998 Blocpdb> 58 atoms in block 123 Block first atom: 7052 Blocpdb> 64 atoms in block 124 Block first atom: 7110 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 7174 Blocpdb> 70 atoms in block 126 Block first atom: 7227 Blocpdb> 51 atoms in block 127 Block first atom: 7297 Blocpdb> 69 atoms in block 128 Block first atom: 7348 Blocpdb> 52 atoms in block 129 Block first atom: 7417 Blocpdb> 62 atoms in block 130 Block first atom: 7469 Blocpdb> 57 atoms in block 131 Block first atom: 7531 Blocpdb> 60 atoms in block 132 Block first atom: 7588 Blocpdb> 49 atoms in block 133 Block first atom: 7648 Blocpdb> 53 atoms in block 134 Block first atom: 7697 Blocpdb> 65 atoms in block 135 Block first atom: 7750 Blocpdb> 26 atoms in block 136 Block first atom: 7815 Blocpdb> 55 atoms in block 137 Block first atom: 7841 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 7896 Blocpdb> 55 atoms in block 139 Block first atom: 7957 Blocpdb> 56 atoms in block 140 Block first atom: 8012 Blocpdb> 58 atoms in block 141 Block first atom: 8068 Blocpdb> 58 atoms in block 142 Block first atom: 8126 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 8184 Blocpdb> 60 atoms in block 144 Block first atom: 8231 Blocpdb> 62 atoms in block 145 Block first atom: 8291 Blocpdb> 53 atoms in block 146 Block first atom: 8353 Blocpdb> 62 atoms in block 147 Block first atom: 8406 Blocpdb> 55 atoms in block 148 Block first atom: 8468 Blocpdb> 70 atoms in block 149 Block first atom: 8523 Blocpdb> 58 atoms in block 150 Block first atom: 8593 Blocpdb> 56 atoms in block 151 Block first atom: 8651 Blocpdb> 60 atoms in block 152 Block first atom: 8707 Blocpdb> 67 atoms in block 153 Block first atom: 8767 Blocpdb> 59 atoms in block 154 Block first atom: 8834 Blocpdb> 65 atoms in block 155 Block first atom: 8893 Blocpdb> 54 atoms in block 156 Block first atom: 8958 Blocpdb> 58 atoms in block 157 Block first atom: 9012 Blocpdb> 64 atoms in block 158 Block first atom: 9070 Blocpdb> 53 atoms in block 159 Block first atom: 9134 Blocpdb> 70 atoms in block 160 Block first atom: 9187 Blocpdb> 51 atoms in block 161 Block first atom: 9257 Blocpdb> 69 atoms in block 162 Block first atom: 9308 Blocpdb> 52 atoms in block 163 Block first atom: 9377 Blocpdb> 62 atoms in block 164 Block first atom: 9429 Blocpdb> 57 atoms in block 165 Block first atom: 9491 Blocpdb> 60 atoms in block 166 Block first atom: 9548 Blocpdb> 49 atoms in block 167 Block first atom: 9608 Blocpdb> 53 atoms in block 168 Block first atom: 9657 Blocpdb> 65 atoms in block 169 Block first atom: 9710 Blocpdb> 26 atoms in block 170 Block first atom: 9775 Blocpdb> 55 atoms in block 171 Block first atom: 9801 Blocpdb> 61 atoms in block 172 Block first atom: 9856 Blocpdb> 55 atoms in block 173 Block first atom: 9917 Blocpdb> 56 atoms in block 174 Block first atom: 9972 Blocpdb> 58 atoms in block 175 Block first atom: 10028 Blocpdb> 58 atoms in block 176 Block first atom: 10086 Blocpdb> 47 atoms in block 177 Block first atom: 10144 Blocpdb> 60 atoms in block 178 Block first atom: 10191 Blocpdb> 62 atoms in block 179 Block first atom: 10251 Blocpdb> 53 atoms in block 180 Block first atom: 10313 Blocpdb> 62 atoms in block 181 Block first atom: 10366 Blocpdb> 55 atoms in block 182 Block first atom: 10428 Blocpdb> 70 atoms in block 183 Block first atom: 10483 Blocpdb> 58 atoms in block 184 Block first atom: 10553 Blocpdb> 56 atoms in block 185 Block first atom: 10611 Blocpdb> 60 atoms in block 186 Block first atom: 10667 Blocpdb> 67 atoms in block 187 Block first atom: 10727 Blocpdb> 59 atoms in block 188 Block first atom: 10794 Blocpdb> 65 atoms in block 189 Block first atom: 10853 Blocpdb> 54 atoms in block 190 Block first atom: 10918 Blocpdb> 58 atoms in block 191 Block first atom: 10972 Blocpdb> 64 atoms in block 192 Block first atom: 11030 Blocpdb> 53 atoms in block 193 Block first atom: 11094 Blocpdb> 70 atoms in block 194 Block first atom: 11147 Blocpdb> 51 atoms in block 195 Block first atom: 11217 Blocpdb> 69 atoms in block 196 Block first atom: 11268 Blocpdb> 52 atoms in block 197 Block first atom: 11337 Blocpdb> 62 atoms in block 198 Block first atom: 11389 Blocpdb> 57 atoms in block 199 Block first atom: 11451 Blocpdb> 60 atoms in block 200 Block first atom: 11508 Blocpdb> 49 atoms in block 201 Block first atom: 11568 Blocpdb> 53 atoms in block 202 Block first atom: 11617 Blocpdb> 65 atoms in block 203 Block first atom: 11670 Blocpdb> 26 atoms in block 204 Block first atom: 11734 Blocpdb> 204 blocks. Blocpdb> At most, 70 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 26 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5190288 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 35280 Prepmat> Matrix trace = 11378720.0000 Prepmat> Last element read: 35280 35280 209.8954 Prepmat> 20911 lines saved. Prepmat> 19174 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11760 RTB> Total mass = 11760.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11760 RTB> Number of blocks = 204 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 248576.4088 RTB> 59436 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1224 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59436 Diagstd> Projected matrix trace = 248576.4088 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1224 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 248576.4088 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.4885519 1.4953309 2.3127931 2.3335578 3.2131236 3.7784245 4.1390576 4.1648711 4.3365549 5.0998229 5.1303066 5.1641976 6.1882803 6.2009837 6.5703165 6.5826282 6.9611034 6.9637362 7.6141046 8.2131672 8.6136135 8.6957572 9.0834987 9.1081865 9.1659632 9.1763886 9.9231324 11.0840420 11.6455637 11.6591286 11.7335916 11.7415414 12.0772527 12.2779995 12.3504224 12.4005587 12.6262316 12.6835552 13.0477405 14.3479269 14.6083171 14.6445453 15.9433376 15.9787524 17.1609149 18.1855093 18.7095122 18.7305468 18.7625729 18.8046212 20.5618920 20.5879388 20.9994675 21.0470508 21.0854282 21.1158513 21.6109628 21.7647871 21.9597926 22.1139567 22.4752770 22.7561803 22.8474200 23.6651956 24.0659458 25.5369920 25.5809664 25.6115504 25.6287834 25.6655041 25.6891616 27.0906693 27.1712724 27.2717833 27.2893456 27.7106173 28.1452759 28.2109590 29.0195812 29.3802255 29.4107400 30.0005392 30.2368224 30.2986052 31.6531500 31.7558373 31.8496320 33.8976181 34.0020729 34.0135701 34.6646284 35.1090657 35.3441388 35.3592295 35.4311571 35.6508861 37.8570119 38.0523234 38.1832846 38.2544164 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034330 0.0034333 0.0034334 0.0034338 0.0034345 132.4882208 132.7895586 165.1443324 165.8840232 194.6520557 211.0817356 220.9255854 221.6134227 226.1349567 245.2295644 245.9613906 246.7724692 270.1346342 270.4117599 278.3482060 278.6088729 286.5063969 286.5605731 299.6433887 311.2078993 318.7043356 320.2203898 327.2818039 327.7262567 328.7640596 328.9509756 342.0736900 361.5300169 370.5745059 370.7902673 371.9724408 372.0984300 377.3804148 380.5038769 381.6244446 382.3982586 385.8621284 386.7370509 392.2499844 411.3295003 415.0451792 415.5595109 433.5956350 434.0769383 449.8476950 463.0821223 469.7064377 469.9704023 470.3720164 470.8987906 492.4099469 492.7217283 497.6218265 498.1852960 498.6392865 498.9988876 504.8151013 506.6085230 508.8729870 510.6560812 514.8109867 518.0181339 519.0555789 528.2631654 532.7172351 548.7570977 549.2293713 549.5575956 549.7424528 550.1361446 550.3896335 565.2038968 566.0441007 567.0900782 567.2726446 571.6344319 576.1002126 576.7720478 584.9797738 588.6035030 588.9090875 594.7847298 597.1223883 597.7321265 610.9472979 611.9374951 612.8405443 632.2369463 633.2103096 633.3173553 639.3498311 643.4353493 645.5858191 645.7236258 646.3800567 648.3812464 668.1414974 669.8628149 671.0145274 671.6392544 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11760 Rtb_to_modes> Number of blocs = 204 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.495 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.337 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.961 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.614 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.614 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1224 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 211680 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210715114033143249.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210715114033143249.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210715114033143249.atom Openam> file on opening on unit 11: 210715114033143249.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1194 First residue number = 3 Last residue number = 234 Number of atoms found = 11760 Mean number per residue = 9.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.495 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.337 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.961 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.614 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.614 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25 Bfactors> 106 vectors, 35280 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.489000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.011 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.011 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210715114033143249.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210715114033143249.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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Chkmod> That is: 11760 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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perturbed structure for DQ=-100 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210715114033143249 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210715114033143249.eigenfacs 210715114033143249.atom 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