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LOGs for ID: 21062107565910413

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21062107565910413.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21062107565910413.atom to be opened. Openam> File opened: 21062107565910413.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1180 First residue number = 1 Last residue number = 378 Number of atoms found = 11550 Mean number per residue = 9.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 16.111656 +/- 13.652055 From: -20.387000 To: 51.583000 = 65.661971 +/- 17.910004 From: 20.076000 To: 116.464000 = 58.330741 +/- 27.928647 From: 2.306000 To: 120.200000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9049 % Filled. Pdbmat> 5432395 non-zero elements. Pdbmat> 595989 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 103.20 +/- 27.09 Maximum number = 175 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.191978E+07 Pdbmat> Larger element = 633.779 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1180 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21062107565910413.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21062107565910413.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21062107565910413.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11550 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1180 residues. Blocpdb> 62 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 53 atoms in block 2 Block first atom: 63 Blocpdb> 50 atoms in block 3 Block first atom: 116 Blocpdb> 62 atoms in block 4 Block first atom: 166 Blocpdb> 53 atoms in block 5 Block first atom: 228 Blocpdb> 54 atoms in block 6 Block first atom: 281 Blocpdb> 54 atoms in block 7 Block first atom: 335 Blocpdb> 41 atoms in block 8 Block first atom: 389 Blocpdb> 68 atoms in block 9 Block first atom: 430 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 498 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 546 Blocpdb> 58 atoms in block 12 Block first atom: 608 Blocpdb> 53 atoms in block 13 Block first atom: 666 Blocpdb> 75 atoms in block 14 Block first atom: 719 Blocpdb> 63 atoms in block 15 Block first atom: 794 Blocpdb> 57 atoms in block 16 Block first atom: 857 Blocpdb> 53 atoms in block 17 Block first atom: 914 Blocpdb> 69 atoms in block 18 Block first atom: 967 Blocpdb> 55 atoms in block 19 Block first atom: 1036 Blocpdb> 53 atoms in block 20 Block first atom: 1091 Blocpdb> 71 atoms in block 21 Block first atom: 1144 Blocpdb> 51 atoms in block 22 Block first atom: 1215 Blocpdb> 62 atoms in block 23 Block first atom: 1266 Blocpdb> 48 atoms in block 24 Block first atom: 1328 Blocpdb> 48 atoms in block 25 Block first atom: 1376 Blocpdb> 62 atoms in block 26 Block first atom: 1424 Blocpdb> 53 atoms in block 27 Block first atom: 1486 Blocpdb> 66 atoms in block 28 Block first atom: 1539 Blocpdb> 56 atoms in block 29 Block first atom: 1605 Blocpdb> 50 atoms in block 30 Block first atom: 1661 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1711 Blocpdb> 57 atoms in block 32 Block first atom: 1769 Blocpdb> 58 atoms in block 33 Block first atom: 1826 Blocpdb> 51 atoms in block 34 Block first atom: 1884 Blocpdb> 63 atoms in block 35 Block first atom: 1935 Blocpdb> 70 atoms in block 36 Block first atom: 1998 Blocpdb> 61 atoms in block 37 Block first atom: 2068 Blocpdb> 63 atoms in block 38 Block first atom: 2129 Blocpdb> 64 atoms in block 39 Block first atom: 2192 Blocpdb> 48 atoms in block 40 Block first atom: 2256 Blocpdb> 60 atoms in block 41 Block first atom: 2304 Blocpdb> 55 atoms in block 42 Block first atom: 2364 Blocpdb> 63 atoms in block 43 Block first atom: 2419 Blocpdb> 62 atoms in block 44 Block first atom: 2482 Blocpdb> 56 atoms in block 45 Block first atom: 2544 Blocpdb> 53 atoms in block 46 Block first atom: 2600 Blocpdb> 57 atoms in block 47 Block first atom: 2653 Blocpdb> 60 atoms in block 48 Block first atom: 2710 Blocpdb> 51 atoms in block 49 Block first atom: 2770 Blocpdb> 53 atoms in block 50 Block first atom: 2821 Blocpdb> 62 atoms in block 51 Block first atom: 2874 Blocpdb> 69 atoms in block 52 Block first atom: 2936 Blocpdb> 51 atoms in block 53 Block first atom: 3005 Blocpdb> 61 atoms in block 54 Block first atom: 3056 Blocpdb> 54 atoms in block 55 Block first atom: 3117 Blocpdb> 52 atoms in block 56 Block first atom: 3171 Blocpdb> 68 atoms in block 57 Block first atom: 3223 Blocpdb> 59 atoms in block 58 Block first atom: 3291 Blocpdb> 52 atoms in block 59 Block first atom: 3350 Blocpdb> 66 atoms in block 60 Block first atom: 3402 Blocpdb> 42 atoms in block 61 Block first atom: 3468 Blocpdb> 64 atoms in block 62 Block first atom: 3510 Blocpdb> 56 atoms in block 63 Block first atom: 3574 Blocpdb> 52 atoms in block 64 Block first atom: 3630 Blocpdb> 61 atoms in block 65 Block first atom: 3682 Blocpdb> 65 atoms in block 66 Block first atom: 3743 Blocpdb> 68 atoms in block 67 Block first atom: 3808 Blocpdb> 69 atoms in block 68 Block first atom: 3876 Blocpdb> 47 atoms in block 69 Block first atom: 3945 Blocpdb> 60 atoms in block 70 Block first atom: 3992 Blocpdb> 57 atoms in block 71 Block first atom: 4052 Blocpdb> 61 atoms in block 72 Block first atom: 4109 Blocpdb> 50 atoms in block 73 Block first atom: 4170 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 4220 Blocpdb> 68 atoms in block 75 Block first atom: 4228 Blocpdb> 51 atoms in block 76 Block first atom: 4296 Blocpdb> 52 atoms in block 77 Block first atom: 4347 Blocpdb> 73 atoms in block 78 Block first atom: 4399 Blocpdb> 54 atoms in block 79 Block first atom: 4472 Blocpdb> 52 atoms in block 80 Block first atom: 4526 Blocpdb> 53 atoms in block 81 Block first atom: 4578 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 4631 Blocpdb> 63 atoms in block 83 Block first atom: 4705 Blocpdb> 60 atoms in block 84 Block first atom: 4768 Blocpdb> 56 atoms in block 85 Block first atom: 4828 Blocpdb> 49 atoms in block 86 Block first atom: 4884 Blocpdb> 59 atoms in block 87 Block first atom: 4933 Blocpdb> 50 atoms in block 88 Block first atom: 4992 Blocpdb> 68 atoms in block 89 Block first atom: 5042 Blocpdb> 50 atoms in block 90 Block first atom: 5110 Blocpdb> 55 atoms in block 91 Block first atom: 5160 Blocpdb> 72 atoms in block 92 Block first atom: 5215 Blocpdb> 47 atoms in block 93 Block first atom: 5287 Blocpdb> 50 atoms in block 94 Block first atom: 5334 Blocpdb> 66 atoms in block 95 Block first atom: 5384 Blocpdb> 49 atoms in block 96 Block first atom: 5450 Blocpdb> 67 atoms in block 97 Block first atom: 5499 Blocpdb> 38 atoms in block 98 Block first atom: 5566 Blocpdb> 48 atoms in block 99 Block first atom: 5604 Blocpdb> 68 atoms in block 100 Block first atom: 5652 Blocpdb> 67 atoms in block 101 Block first atom: 5720 Blocpdb> 58 atoms in block 102 Block first atom: 5787 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 5845 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 5897 Blocpdb> 57 atoms in block 105 Block first atom: 5947 Blocpdb> 59 atoms in block 106 Block first atom: 6004 Blocpdb> 57 atoms in block 107 Block first atom: 6063 Blocpdb> 59 atoms in block 108 Block first atom: 6120 Blocpdb> 57 atoms in block 109 Block first atom: 6179 Blocpdb> 67 atoms in block 110 Block first atom: 6236 Blocpdb> 57 atoms in block 111 Block first atom: 6303 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 6360 Blocpdb> 48 atoms in block 113 Block first atom: 6416 Blocpdb> 47 atoms in block 114 Block first atom: 6464 Blocpdb> 62 atoms in block 115 Block first atom: 6511 Blocpdb> 65 atoms in block 116 Block first atom: 6573 Blocpdb> 51 atoms in block 117 Block first atom: 6638 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 6689 Blocpdb> 57 atoms in block 119 Block first atom: 6754 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 6811 Blocpdb> 58 atoms in block 121 Block first atom: 6833 Blocpdb> 55 atoms in block 122 Block first atom: 6891 Blocpdb> 63 atoms in block 123 Block first atom: 6946 Blocpdb> 48 atoms in block 124 Block first atom: 7009 Blocpdb> 68 atoms in block 125 Block first atom: 7057 Blocpdb> 52 atoms in block 126 Block first atom: 7125 Blocpdb> 69 atoms in block 127 Block first atom: 7177 Blocpdb> 57 atoms in block 128 Block first atom: 7246 Blocpdb> 59 atoms in block 129 Block first atom: 7303 Blocpdb> 63 atoms in block 130 Block first atom: 7362 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 7425 Blocpdb> 59 atoms in block 132 Block first atom: 7494 Blocpdb> 46 atoms in block 133 Block first atom: 7553 Blocpdb> 7 atoms in block 134 Block first atom: 7599 Blocpdb> 61 atoms in block 135 Block first atom: 7606 Blocpdb> 52 atoms in block 136 Block first atom: 7667 Blocpdb> 54 atoms in block 137 Block first atom: 7719 Blocpdb> 68 atoms in block 138 Block first atom: 7773 Blocpdb> 58 atoms in block 139 Block first atom: 7841 Blocpdb> 77 atoms in block 140 Block first atom: 7899 Blocpdb> 66 atoms in block 141 Block first atom: 7976 Blocpdb> 56 atoms in block 142 Block first atom: 8042 Blocpdb> 57 atoms in block 143 Block first atom: 8098 Blocpdb> 66 atoms in block 144 Block first atom: 8155 Blocpdb> 73 atoms in block 145 Block first atom: 8221 Blocpdb> 41 atoms in block 146 Block first atom: 8294 Blocpdb> 62 atoms in block 147 Block first atom: 8335 Blocpdb> 63 atoms in block 148 Block first atom: 8397 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 8460 Blocpdb> 59 atoms in block 150 Block first atom: 8514 Blocpdb> 72 atoms in block 151 Block first atom: 8573 Blocpdb> 74 atoms in block 152 Block first atom: 8645 Blocpdb> 55 atoms in block 153 Block first atom: 8719 Blocpdb> 71 atoms in block 154 Block first atom: 8774 Blocpdb> 61 atoms in block 155 Block first atom: 8845 Blocpdb> 51 atoms in block 156 Block first atom: 8906 Blocpdb> 73 atoms in block 157 Block first atom: 8957 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 9030 Blocpdb> 64 atoms in block 159 Block first atom: 9079 Blocpdb> 61 atoms in block 160 Block first atom: 9143 Blocpdb> 52 atoms in block 161 Block first atom: 9204 Blocpdb> 61 atoms in block 162 Block first atom: 9256 Blocpdb> 60 atoms in block 163 Block first atom: 9317 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 9377 Blocpdb> 58 atoms in block 165 Block first atom: 9442 Blocpdb> 57 atoms in block 166 Block first atom: 9500 Blocpdb> 21 atoms in block 167 Block first atom: 9557 Blocpdb> 51 atoms in block 168 Block first atom: 9578 Blocpdb> 58 atoms in block 169 Block first atom: 9629 Blocpdb> 71 atoms in block 170 Block first atom: 9687 Blocpdb> 57 atoms in block 171 Block first atom: 9758 Blocpdb> 61 atoms in block 172 Block first atom: 9815 Blocpdb> 68 atoms in block 173 Block first atom: 9876 Blocpdb> 63 atoms in block 174 Block first atom: 9944 Blocpdb> 66 atoms in block 175 Block first atom: 10007 Blocpdb> 63 atoms in block 176 Block first atom: 10073 Blocpdb> 59 atoms in block 177 Block first atom: 10136 Blocpdb> 39 atoms in block 178 Block first atom: 10195 Blocpdb> 62 atoms in block 179 Block first atom: 10234 Blocpdb> 61 atoms in block 180 Block first atom: 10296 Blocpdb> 45 atoms in block 181 Block first atom: 10357 Blocpdb> 73 atoms in block 182 Block first atom: 10402 Blocpdb> 57 atoms in block 183 Block first atom: 10475 Blocpdb> 67 atoms in block 184 Block first atom: 10532 Blocpdb> 60 atoms in block 185 Block first atom: 10599 Blocpdb> 59 atoms in block 186 Block first atom: 10659 Blocpdb> 60 atoms in block 187 Block first atom: 10718 Blocpdb> 69 atoms in block 188 Block first atom: 10778 Blocpdb> 51 atoms in block 189 Block first atom: 10847 Blocpdb> 52 atoms in block 190 Block first atom: 10898 Blocpdb> 69 atoms in block 191 Block first atom: 10950 Blocpdb> 62 atoms in block 192 Block first atom: 11019 Blocpdb> 57 atoms in block 193 Block first atom: 11081 Blocpdb> 65 atoms in block 194 Block first atom: 11138 Blocpdb> 49 atoms in block 195 Block first atom: 11203 Blocpdb> 51 atoms in block 196 Block first atom: 11252 Blocpdb> 55 atoms in block 197 Block first atom: 11303 Blocpdb> 54 atoms in block 198 Block first atom: 11358 Blocpdb> 51 atoms in block 199 Block first atom: 11412 Blocpdb> 22 atoms in block 200 Block first atom: 11463 Blocpdb> 66 atoms in block 201 Block first atom: 11484 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 77 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5432596 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 34650 Prepmat> Matrix trace = 11919780.0000 Prepmat> Last element read: 34650 34650 408.3941 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18359 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11550 RTB> Total mass = 11550.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11550 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 280135.2897 RTB> 66897 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66897 Diagstd> Projected matrix trace = 280135.2897 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 280135.2897 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4191889 0.6282288 0.9845401 1.6053551 1.8628455 2.3199898 2.8844843 4.0514465 4.9138457 5.7747942 6.5678652 7.0648315 7.8696672 7.9713441 8.5872359 9.5960045 10.3987333 10.8798501 11.1680318 11.7919588 12.7259092 12.7958986 12.9044039 13.6681088 14.0311412 14.9010517 15.5868096 16.4384180 17.2555789 17.5057893 18.2256768 18.4674802 18.7634431 19.3462286 19.7791420 20.4275793 20.8934557 21.3277981 21.6036873 22.0284063 22.4060954 23.2686599 23.5931598 24.2640578 25.4684863 26.1449076 26.7459297 27.4878431 27.8774945 28.2330567 28.7124555 29.0718626 29.6427009 30.1564927 30.7970188 31.3676119 32.1745612 32.2406557 32.4499186 33.0549329 33.1769706 34.2794245 34.6908137 35.0089579 35.6165910 36.2982843 36.4757837 36.9808797 37.3278784 38.0165141 38.3602429 39.1486704 39.5463180 39.9477099 40.2824318 40.6270500 41.7808045 42.4913613 42.8194671 43.2623250 44.2096061 44.7109797 44.9803152 45.2517108 46.1060077 46.5006503 47.4579628 47.6790667 48.4271130 48.4420451 48.8929792 49.0955332 49.5527644 50.2557448 50.4571519 50.7733671 51.0433579 51.6963453 52.0030405 52.2987167 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034326 0.0034332 0.0034332 0.0034354 0.0034360 70.3072549 86.0704735 107.7486875 137.5880878 148.2121140 165.4010708 184.4290676 218.5749241 240.7165996 260.9537470 278.2962767 288.6331332 304.6305573 306.5921688 318.2159742 336.3880047 350.1752918 358.1844576 362.8971858 372.8964564 387.3822266 388.4460196 390.0894942 401.4666684 406.7633143 419.1830774 428.7201499 440.2762822 451.0867257 454.3453932 463.5932595 466.6584152 470.3829243 477.6320242 482.9464790 490.7990722 496.3641629 501.4969434 504.7301193 509.6673570 514.0180506 523.8186612 527.4585481 534.9054175 548.0205541 555.2503438 561.5961600 569.3320227 573.3530802 576.9978970 581.8760042 585.5064841 591.2268732 596.3286778 602.6284338 608.1854251 615.9587041 616.5910454 618.5888480 624.3288737 625.4803126 635.7875824 639.5912646 642.5173681 648.0693087 654.2418624 655.8395395 660.3647749 663.4557058 669.5475513 672.5676198 679.4441889 682.8861547 686.3430238 689.2124604 692.1543054 701.9136358 707.8571163 710.5847936 714.2499328 722.0272742 726.1099255 728.2936570 730.4874884 737.3506025 740.4995408 748.0830695 749.8236825 755.6828565 755.7993519 759.3089705 760.8801788 764.4150410 769.8181338 771.3591699 773.7724502 775.8270164 780.7737450 783.0863407 785.3094006 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11550 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.870 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.971 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.30 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 207900 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21062107565910413.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21062107565910413.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21062107565910413.atom Openam> file on opening on unit 11: 21062107565910413.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1180 First residue number = 1 Last residue number = 378 Number of atoms found = 11550 Mean number per residue = 9.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.870 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.971 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.30 Bfactors> 106 vectors, 34650 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.419200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.723 for 1209 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.01 Bfactors> = 55.445 +/- 23.72 Bfactors> Shiftng-fct= 55.431 Bfactors> Scaling-fct= 1615.237 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21062107565910413.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21062107565910413.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 11550 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8692 0.0034 0.6924 0.0034 0.9369 0.0034 0.8410 0.0034 0.6875 0.0034 0.7114 70.3052 0.5796 86.0648 0.4775 107.7419 0.4466 137.5670 0.5837 148.2119 0.6173 165.3943 0.6825 184.4057 0.5268 218.5535 0.6665 240.7100 0.5456 260.9472 0.5455 278.2872 0.5788 288.6242 0.1021 304.6239 0.3003 306.5724 0.2346 318.1979 0.5143 336.3735 0.4657 350.1816 0.0028 358.1715 0.4665 362.9136 0.2518 372.8495 0.3130 387.4279 0.2294 388.4916 0.1909 390.0062 0.4188 401.4772 0.2621 406.7293 0.1978 419.1503 0.4122 428.7456 0.3518 440.2786 0.4101 451.1251 0.4007 454.3805 0.3229 463.6283 0.2107 466.6702 0.0319 470.3196 0.2786 477.6581 0.4566 482.9362 0.5492 490.8071 0.3746 496.3018 0.4440 501.5013 0.3985 504.6654 0.5783 509.6639 0.4667 514.0408 0.4181 523.8113 0.5157 527.4006 0.4754 534.8377 0.5066 548.0133 0.5530 555.1744 0.5528 561.6148 0.4941 569.3299 0.3900 573.3542 0.2672 576.9419 0.4288 581.8261 0.3690 585.4626 0.1921 591.1746 0.3988 596.3378 0.4405 602.6317 0.3161 608.1825 0.2977 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062107565910413.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062107565910413.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21062107565910413 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom making animated gifs 11 models are in 21062107565910413.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062107565910413.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21062107565910413.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21062107565910413 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21062107565910413.eigenfacs 21062107565910413.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21062107565910413.eigenfacs 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