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***  METAL TRANSPORT 03-MAR-11 3QYT  ***

LOGs for ID: 2106161252132815

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2106161252132815.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2106161252132815.atom to be opened. Openam> File opened: 2106161252132815.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 679 First residue number = 1 Last residue number = 679 Number of atoms found = 5265 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 28.645450 +/- 18.755439 From: -14.716000 To: 69.359000 = 0.867886 +/- 14.725132 From: -36.662000 To: 33.975000 = 2.403361 +/- 15.138938 From: -31.452000 To: 36.539000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6105 % Filled. Pdbmat> 2009032 non-zero elements. Pdbmat> 219753 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.48 +/- 23.04 Maximum number = 133 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 4.395060E+06 Pdbmat> Larger element = 501.841 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 679 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2106161252132815.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2106161252132815.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2106161252132815.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5265 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 679 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 39 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 71 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 95 Blocpdb> 31 atoms in block 5 Block first atom: 128 Blocpdb> 36 atoms in block 6 Block first atom: 159 Blocpdb> 33 atoms in block 7 Block first atom: 195 Blocpdb> 28 atoms in block 8 Block first atom: 228 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 256 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 281 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 306 Blocpdb> 34 atoms in block 12 Block first atom: 335 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 369 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 401 Blocpdb> 25 atoms in block 15 Block first atom: 428 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 453 Blocpdb> 31 atoms in block 17 Block first atom: 481 Blocpdb> 33 atoms in block 18 Block first atom: 512 Blocpdb> 28 atoms in block 19 Block first atom: 545 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 573 Blocpdb> 32 atoms in block 21 Block first atom: 604 Blocpdb> 31 atoms in block 22 Block first atom: 636 Blocpdb> 33 atoms in block 23 Block first atom: 667 Blocpdb> 42 atoms in block 24 Block first atom: 700 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 742 Blocpdb> 33 atoms in block 26 Block first atom: 766 Blocpdb> 30 atoms in block 27 Block first atom: 799 Blocpdb> 33 atoms in block 28 Block first atom: 829 Blocpdb> 33 atoms in block 29 Block first atom: 862 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 895 Blocpdb> 27 atoms in block 31 Block first atom: 924 Blocpdb> 29 atoms in block 32 Block first atom: 951 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 980 Blocpdb> 32 atoms in block 34 Block first atom: 1011 Blocpdb> 29 atoms in block 35 Block first atom: 1043 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1072 Blocpdb> 33 atoms in block 37 Block first atom: 1108 Blocpdb> 25 atoms in block 38 Block first atom: 1141 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1166 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 1198 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 1222 Blocpdb> 33 atoms in block 42 Block first atom: 1245 Blocpdb> 32 atoms in block 43 Block first atom: 1278 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 1310 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 1335 Blocpdb> 32 atoms in block 46 Block first atom: 1357 Blocpdb> 39 atoms in block 47 Block first atom: 1389 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1428 Blocpdb> 32 atoms in block 49 Block first atom: 1454 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1486 Blocpdb> 31 atoms in block 51 Block first atom: 1507 Blocpdb> 32 atoms in block 52 Block first atom: 1538 Blocpdb> 35 atoms in block 53 Block first atom: 1570 Blocpdb> 29 atoms in block 54 Block first atom: 1605 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 1634 Blocpdb> 38 atoms in block 56 Block first atom: 1667 Blocpdb> 30 atoms in block 57 Block first atom: 1705 Blocpdb> 34 atoms in block 58 Block first atom: 1735 Blocpdb> 31 atoms in block 59 Block first atom: 1769 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 1800 Blocpdb> 29 atoms in block 61 Block first atom: 1838 Blocpdb> 29 atoms in block 62 Block first atom: 1867 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1896 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 1927 Blocpdb> 26 atoms in block 65 Block first atom: 1957 Blocpdb> 38 atoms in block 66 Block first atom: 1983 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 2021 Blocpdb> 32 atoms in block 68 Block first atom: 2054 Blocpdb> 34 atoms in block 69 Block first atom: 2086 Blocpdb> 32 atoms in block 70 Block first atom: 2120 Blocpdb> 37 atoms in block 71 Block first atom: 2152 Blocpdb> 30 atoms in block 72 Block first atom: 2189 Blocpdb> 31 atoms in block 73 Block first atom: 2219 Blocpdb> 36 atoms in block 74 Block first atom: 2250 Blocpdb> 29 atoms in block 75 Block first atom: 2286 Blocpdb> 32 atoms in block 76 Block first atom: 2315 Blocpdb> 32 atoms in block 77 Block first atom: 2347 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 2379 Blocpdb> 32 atoms in block 79 Block first atom: 2409 Blocpdb> 40 atoms in block 80 Block first atom: 2441 Blocpdb> 31 atoms in block 81 Block first atom: 2481 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 2512 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 2548 Blocpdb> 28 atoms in block 84 Block first atom: 2572 Blocpdb> 32 atoms in block 85 Block first atom: 2600 Blocpdb> 37 atoms in block 86 Block first atom: 2632 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 2669 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2694 Blocpdb> 31 atoms in block 89 Block first atom: 2734 Blocpdb> 36 atoms in block 90 Block first atom: 2765 Blocpdb> 25 atoms in block 91 Block first atom: 2801 Blocpdb> 32 atoms in block 92 Block first atom: 2826 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2858 Blocpdb> 31 atoms in block 94 Block first atom: 2885 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2916 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 2944 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2972 Blocpdb> 30 atoms in block 98 Block first atom: 2999 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 3029 Blocpdb> 29 atoms in block 100 Block first atom: 3055 Blocpdb> 27 atoms in block 101 Block first atom: 3084 Blocpdb> 29 atoms in block 102 Block first atom: 3111 Blocpdb> 34 atoms in block 103 Block first atom: 3140 Blocpdb> 31 atoms in block 104 Block first atom: 3174 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 3205 Blocpdb> 28 atoms in block 106 Block first atom: 3236 Blocpdb> 32 atoms in block 107 Block first atom: 3264 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 3296 Blocpdb> 29 atoms in block 109 Block first atom: 3322 Blocpdb> 29 atoms in block 110 Block first atom: 3351 Blocpdb> 38 atoms in block 111 Block first atom: 3380 Blocpdb> 31 atoms in block 112 Block first atom: 3418 Blocpdb> 29 atoms in block 113 Block first atom: 3449 Blocpdb> 27 atoms in block 114 Block first atom: 3478 Blocpdb> 30 atoms in block 115 Block first atom: 3505 Blocpdb> 31 atoms in block 116 Block first atom: 3535 Blocpdb> 32 atoms in block 117 Block first atom: 3566 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 3598 Blocpdb> 38 atoms in block 119 Block first atom: 3631 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 121 Block first atom: 3708 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 3733 Blocpdb> 32 atoms in block 123 Block first atom: 3755 Blocpdb> 29 atoms in block 124 Block first atom: 3787 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 3816 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 3842 Blocpdb> 30 atoms in block 127 Block first atom: 3868 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 3898 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 3932 Blocpdb> 28 atoms in block 130 Block first atom: 3964 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 3992 Blocpdb> 29 atoms in block 132 Block first atom: 4028 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 4057 Blocpdb> 35 atoms in block 134 Block first atom: 4088 Blocpdb> 30 atoms in block 135 Block first atom: 4123 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 4153 Blocpdb> 32 atoms in block 137 Block first atom: 4176 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 4208 Blocpdb> 33 atoms in block 139 Block first atom: 4243 Blocpdb> 38 atoms in block 140 Block first atom: 4276 Blocpdb> 30 atoms in block 141 Block first atom: 4314 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 4344 Blocpdb> 32 atoms in block 143 Block first atom: 4374 Blocpdb> 34 atoms in block 144 Block first atom: 4406 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 4440 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 4469 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 4500 Blocpdb> 35 atoms in block 148 Block first atom: 4529 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4564 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4593 Blocpdb> 37 atoms in block 151 Block first atom: 4627 Blocpdb> 38 atoms in block 152 Block first atom: 4664 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 4702 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 4727 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 4754 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 4783 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 4819 Blocpdb> 38 atoms in block 158 Block first atom: 4852 Blocpdb> 30 atoms in block 159 Block first atom: 4890 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 4920 Blocpdb> 37 atoms in block 161 Block first atom: 4948 Blocpdb> 36 atoms in block 162 Block first atom: 4985 Blocpdb> 33 atoms in block 163 Block first atom: 5021 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 5054 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 5091 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 5116 Blocpdb> 25 atoms in block 167 Block first atom: 5152 Blocpdb> 31 atoms in block 168 Block first atom: 5177 Blocpdb> 29 atoms in block 169 Block first atom: 5208 Blocpdb> 29 atoms in block 170 Block first atom: 5236 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 42 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2009202 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 15795 Prepmat> Matrix trace = 4395060.0000 Prepmat> Last element read: 15795 15795 115.3637 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 12941 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5265 RTB> Total mass = 5265.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5265 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 212321.7230 RTB> 54834 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54834 Diagstd> Projected matrix trace = 212321.7230 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 212321.7230 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2914379 0.3755033 0.6797890 0.8680901 1.2044182 1.7610264 2.1469905 3.2459240 3.7174628 4.5102773 5.3509813 5.6530652 5.9309281 6.7279384 7.4091685 8.3592452 9.1064031 9.8135163 10.7356507 12.1787485 13.3685534 13.7559740 14.3133352 14.4038701 15.4274340 15.8658879 16.5940113 16.6684685 17.3286833 17.5083856 18.3312925 18.7217040 19.0913539 19.9478569 20.3407295 21.1490648 21.7474973 22.2135880 23.0671849 23.6875484 23.7240106 25.0909414 25.8735702 26.1846535 26.7332882 27.4327349 27.8541830 28.5087980 29.4662360 29.6199800 30.3978990 30.6063279 30.9895124 31.3272200 31.8086130 32.5597679 33.1966556 33.8066205 34.0841481 34.4761480 34.7359531 34.9184569 35.7075117 36.0397939 36.2971384 36.6763444 37.2025593 37.7756602 38.4368675 38.5605480 39.1605505 39.4410283 40.0519551 40.6715766 40.8842213 41.8892008 42.4560602 42.4800143 43.2404039 43.7556676 44.2096727 44.5041237 45.2011828 45.5333684 45.7254945 45.9377818 46.3751404 46.9446776 47.8148673 48.2323414 48.7307421 49.3063926 50.0437699 50.6277437 51.3784335 51.5425271 51.8516682 52.1188787 52.2903482 52.6406456 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034333 0.0034335 0.0034337 0.0034340 0.0034349 58.6230300 66.5429668 89.5328349 101.1760385 119.1746641 144.1047215 159.1147132 195.6430633 209.3719979 230.6199645 251.1955810 258.1887277 264.4579394 281.6672049 295.5833839 313.9632468 327.6941701 340.1790823 355.8028858 378.9628274 397.0429489 402.7550120 410.8333596 412.1306162 426.5226794 432.5411900 442.3550305 443.3463426 452.0412457 454.3790835 464.9345539 469.8594511 474.4753387 485.0018581 489.7546207 499.3911756 506.4072602 511.8051326 521.5459519 528.5125901 528.9192028 543.9434586 552.3615764 555.6722338 561.4634249 568.7610322 573.1133077 579.8087078 589.4644410 591.0002449 598.7107612 600.7598412 604.5088337 607.7937208 612.4457801 619.6349849 625.6658434 631.3877614 633.9740797 637.6093085 640.0072448 641.6863510 648.8959654 651.9081784 654.2315351 657.6401220 662.3410758 667.4232197 673.2390112 674.3213013 679.5472740 681.9764770 687.2379612 692.5334962 694.3415353 702.8235700 707.5630181 707.7625965 714.0689534 718.3108684 722.0278177 724.4282990 730.0795435 732.7573269 734.3016187 736.0041968 739.4995242 744.0265966 750.8907556 754.1616649 758.0481513 762.5123730 768.1929010 772.6620231 778.3693204 779.6113158 781.9457918 783.9580284 785.2465681 787.8723943 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5265 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9879E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6798 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8681 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.246 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.728 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.409 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.64 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 94770 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2106161252132815.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2106161252132815.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2106161252132815.atom Openam> file on opening on unit 11: 2106161252132815.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 679 First residue number = 1 Last residue number = 679 Number of atoms found = 5265 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9879E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6798 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.246 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.728 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.409 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64 Bfactors> 106 vectors, 15795 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.291400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.664 for 679 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.044 +/- 0.03 Bfactors> = 55.628 +/- 21.52 Bfactors> Shiftng-fct= 55.584 Bfactors> Scaling-fct= 655.970 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2106161252132815.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2106161252132815.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2106161252132815.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2106161252132815.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2106161252132815 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2106161252132815.eigenfacs 2106161252132815.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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