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LOGs for ID: 21060913023720863

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21060913023720863.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21060913023720863.atom to be opened. Openam> File opened: 21060913023720863.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 702 First residue number = 212 Last residue number = 913 Number of atoms found = 11671 Mean number per residue = 16.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 148.664164 +/- 17.421100 From: 105.409000 To: 198.235000 = 166.726178 +/- 14.694478 From: 126.207000 To: 207.216000 = 173.190753 +/- 41.520969 From: 103.070000 To: 254.966000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2812 % Filled. Pdbmat> 7853687 non-zero elements. Pdbmat> 864989 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 148.23 +/- 47.27 Maximum number = 252 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.729978E+07 Pdbmat> Larger element = 903.935 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 702 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21060913023720863.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21060913023720863.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21060913023720863.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11671 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 702 residues. Blocpdb> 64 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 77 atoms in block 2 Block first atom: 65 Blocpdb> 66 atoms in block 3 Block first atom: 142 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 208 Blocpdb> 56 atoms in block 5 Block first atom: 268 Blocpdb> 73 atoms in block 6 Block first atom: 324 Blocpdb> 63 atoms in block 7 Block first atom: 397 Blocpdb> 67 atoms in block 8 Block first atom: 460 Blocpdb> 64 atoms in block 9 Block first atom: 527 Blocpdb> 65 atoms in block 10 Block first atom: 591 Blocpdb> 54 atoms in block 11 Block first atom: 656 Blocpdb> 79 atoms in block 12 Block first atom: 710 Blocpdb> 79 atoms in block 13 Block first atom: 789 Blocpdb> 55 atoms in block 14 Block first atom: 868 Blocpdb> 68 atoms in block 15 Block first atom: 923 Blocpdb> 73 atoms in block 16 Block first atom: 991 Blocpdb> 62 atoms in block 17 Block first atom: 1064 Blocpdb> 58 atoms in block 18 Block first atom: 1126 Blocpdb> 80 atoms in block 19 Block first atom: 1184 Blocpdb> 78 atoms in block 20 Block first atom: 1264 Blocpdb> 66 atoms in block 21 Block first atom: 1342 Blocpdb> 69 atoms in block 22 Block first atom: 1408 Blocpdb> 72 atoms in block 23 Block first atom: 1477 Blocpdb> 74 atoms in block 24 Block first atom: 1549 Blocpdb> 70 atoms in block 25 Block first atom: 1623 Blocpdb> 75 atoms in block 26 Block first atom: 1693 Blocpdb> 61 atoms in block 27 Block first atom: 1768 Blocpdb> 61 atoms in block 28 Block first atom: 1829 Blocpdb> 72 atoms in block 29 Block first atom: 1890 Blocpdb> 60 atoms in block 30 Block first atom: 1962 Blocpdb> 71 atoms in block 31 Block first atom: 2022 Blocpdb> 61 atoms in block 32 Block first atom: 2093 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2154 Blocpdb> 69 atoms in block 34 Block first atom: 2226 Blocpdb> 57 atoms in block 35 Block first atom: 2295 Blocpdb> 72 atoms in block 36 Block first atom: 2352 Blocpdb> 77 atoms in block 37 Block first atom: 2424 Blocpdb> 51 atoms in block 38 Block first atom: 2501 Blocpdb> 66 atoms in block 39 Block first atom: 2552 Blocpdb> 73 atoms in block 40 Block first atom: 2618 Blocpdb> 66 atoms in block 41 Block first atom: 2691 Blocpdb> 59 atoms in block 42 Block first atom: 2757 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 2816 Blocpdb> 63 atoms in block 44 Block first atom: 2885 Blocpdb> 78 atoms in block 45 Block first atom: 2948 Blocpdb> 67 atoms in block 46 Block first atom: 3026 Blocpdb> 60 atoms in block 47 Block first atom: 3093 Blocpdb> 61 atoms in block 48 Block first atom: 3153 Blocpdb> 68 atoms in block 49 Block first atom: 3214 Blocpdb> 69 atoms in block 50 Block first atom: 3282 Blocpdb> 73 atoms in block 51 Block first atom: 3351 Blocpdb> 69 atoms in block 52 Block first atom: 3424 Blocpdb> 73 atoms in block 53 Block first atom: 3493 Blocpdb> 61 atoms in block 54 Block first atom: 3566 Blocpdb> 73 atoms in block 55 Block first atom: 3627 Blocpdb> 62 atoms in block 56 Block first atom: 3700 Blocpdb> 64 atoms in block 57 Block first atom: 3762 Blocpdb> 62 atoms in block 58 Block first atom: 3826 Blocpdb> 70 atoms in block 59 Block first atom: 3888 Blocpdb> 60 atoms in block 60 Block first atom: 3958 Blocpdb> 60 atoms in block 61 Block first atom: 4018 Blocpdb> 77 atoms in block 62 Block first atom: 4078 Blocpdb> 54 atoms in block 63 Block first atom: 4155 Blocpdb> 65 atoms in block 64 Block first atom: 4209 Blocpdb> 74 atoms in block 65 Block first atom: 4274 Blocpdb> 61 atoms in block 66 Block first atom: 4348 Blocpdb> 76 atoms in block 67 Block first atom: 4409 Blocpdb> 71 atoms in block 68 Block first atom: 4485 Blocpdb> 54 atoms in block 69 Block first atom: 4556 Blocpdb> 71 atoms in block 70 Block first atom: 4610 Blocpdb> 77 atoms in block 71 Block first atom: 4681 Blocpdb> 77 atoms in block 72 Block first atom: 4758 Blocpdb> 48 atoms in block 73 Block first atom: 4835 Blocpdb> 68 atoms in block 74 Block first atom: 4883 Blocpdb> 65 atoms in block 75 Block first atom: 4951 Blocpdb> 65 atoms in block 76 Block first atom: 5016 Blocpdb> 67 atoms in block 77 Block first atom: 5081 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5148 Blocpdb> 62 atoms in block 79 Block first atom: 5220 Blocpdb> 67 atoms in block 80 Block first atom: 5282 Blocpdb> 69 atoms in block 81 Block first atom: 5349 Blocpdb> 73 atoms in block 82 Block first atom: 5418 Blocpdb> 63 atoms in block 83 Block first atom: 5491 Blocpdb> 64 atoms in block 84 Block first atom: 5554 Blocpdb> 69 atoms in block 85 Block first atom: 5618 Blocpdb> 79 atoms in block 86 Block first atom: 5687 Blocpdb> 64 atoms in block 87 Block first atom: 5766 Blocpdb> 63 atoms in block 88 Block first atom: 5830 Blocpdb> 69 atoms in block 89 Block first atom: 5893 Blocpdb> 64 atoms in block 90 Block first atom: 5962 Blocpdb> 55 atoms in block 91 Block first atom: 6026 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 6081 Blocpdb> 61 atoms in block 93 Block first atom: 6142 Blocpdb> 73 atoms in block 94 Block first atom: 6203 Blocpdb> 70 atoms in block 95 Block first atom: 6276 Blocpdb> 82 atoms in block 96 Block first atom: 6346 Blocpdb> 67 atoms in block 97 Block first atom: 6428 Blocpdb> 70 atoms in block 98 Block first atom: 6495 Blocpdb> 66 atoms in block 99 Block first atom: 6565 Blocpdb> 75 atoms in block 100 Block first atom: 6631 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 6706 Blocpdb> 64 atoms in block 102 Block first atom: 6781 Blocpdb> 48 atoms in block 103 Block first atom: 6845 Blocpdb> 59 atoms in block 104 Block first atom: 6893 Blocpdb> 58 atoms in block 105 Block first atom: 6952 Blocpdb> 80 atoms in block 106 Block first atom: 7010 Blocpdb> 43 atoms in block 107 Block first atom: 7090 Blocpdb> 55 atoms in block 108 Block first atom: 7133 Blocpdb> 63 atoms in block 109 Block first atom: 7188 Blocpdb> 71 atoms in block 110 Block first atom: 7251 Blocpdb> 62 atoms in block 111 Block first atom: 7322 Blocpdb> 70 atoms in block 112 Block first atom: 7384 Blocpdb> 78 atoms in block 113 Block first atom: 7454 Blocpdb> 72 atoms in block 114 Block first atom: 7532 Blocpdb> 61 atoms in block 115 Block first atom: 7604 Blocpdb> 54 atoms in block 116 Block first atom: 7665 Blocpdb> 64 atoms in block 117 Block first atom: 7719 Blocpdb> 66 atoms in block 118 Block first atom: 7783 Blocpdb> 69 atoms in block 119 Block first atom: 7849 Blocpdb> 65 atoms in block 120 Block first atom: 7918 Blocpdb> 62 atoms in block 121 Block first atom: 7983 Blocpdb> 64 atoms in block 122 Block first atom: 8045 Blocpdb> 70 atoms in block 123 Block first atom: 8109 Blocpdb> 70 atoms in block 124 Block first atom: 8179 Blocpdb> 76 atoms in block 125 Block first atom: 8249 Blocpdb> 69 atoms in block 126 Block first atom: 8325 Blocpdb> 59 atoms in block 127 Block first atom: 8394 Blocpdb> 82 atoms in block 128 Block first atom: 8453 Blocpdb> 61 atoms in block 129 Block first atom: 8535 Blocpdb> 51 atoms in block 130 Block first atom: 8596 Blocpdb> 66 atoms in block 131 Block first atom: 8647 Blocpdb> 64 atoms in block 132 Block first atom: 8713 Blocpdb> 78 atoms in block 133 Block first atom: 8777 Blocpdb> 63 atoms in block 134 Block first atom: 8855 Blocpdb> 70 atoms in block 135 Block first atom: 8918 Blocpdb> 71 atoms in block 136 Block first atom: 8988 Blocpdb> 56 atoms in block 137 Block first atom: 9059 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 9115 Blocpdb> 68 atoms in block 139 Block first atom: 9176 Blocpdb> 63 atoms in block 140 Block first atom: 9244 Blocpdb> 53 atoms in block 141 Block first atom: 9307 Blocpdb> 65 atoms in block 142 Block first atom: 9360 Blocpdb> 74 atoms in block 143 Block first atom: 9425 Blocpdb> 51 atoms in block 144 Block first atom: 9499 Blocpdb> 63 atoms in block 145 Block first atom: 9550 Blocpdb> 67 atoms in block 146 Block first atom: 9613 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 9680 Blocpdb> 68 atoms in block 148 Block first atom: 9737 Blocpdb> 53 atoms in block 149 Block first atom: 9805 Blocpdb> 64 atoms in block 150 Block first atom: 9858 Blocpdb> 66 atoms in block 151 Block first atom: 9922 Blocpdb> 78 atoms in block 152 Block first atom: 9988 Blocpdb> 84 atoms in block 153 Block first atom: 10066 Blocpdb> 67 atoms in block 154 Block first atom: 10150 Blocpdb> 68 atoms in block 155 Block first atom: 10217 Blocpdb> 63 atoms in block 156 Block first atom: 10285 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 10348 Blocpdb> 75 atoms in block 158 Block first atom: 10397 Blocpdb> 70 atoms in block 159 Block first atom: 10472 Blocpdb> 69 atoms in block 160 Block first atom: 10542 Blocpdb> 55 atoms in block 161 Block first atom: 10611 Blocpdb> 82 atoms in block 162 Block first atom: 10666 Blocpdb> 77 atoms in block 163 Block first atom: 10748 Blocpdb> 61 atoms in block 164 Block first atom: 10825 Blocpdb> 65 atoms in block 165 Block first atom: 10886 Blocpdb> 66 atoms in block 166 Block first atom: 10951 Blocpdb> 78 atoms in block 167 Block first atom: 11017 Blocpdb> 66 atoms in block 168 Block first atom: 11095 Blocpdb> 63 atoms in block 169 Block first atom: 11161 Blocpdb> 80 atoms in block 170 Block first atom: 11224 Blocpdb> 61 atoms in block 171 Block first atom: 11304 Blocpdb> 74 atoms in block 172 Block first atom: 11365 Blocpdb> 73 atoms in block 173 Block first atom: 11439 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 11512 Blocpdb> 73 atoms in block 175 Block first atom: 11569 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 11641 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 84 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7853863 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 35013 Prepmat> Matrix trace = 17299780.0000 Prepmat> Last element read: 35013 35013 81.1679 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 14040 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11671 RTB> Total mass = 11671.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11671 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 366060.7051 RTB> 52656 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52656 Diagstd> Projected matrix trace = 366060.7051 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 366060.7051 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0162784 0.0539797 0.0829561 0.1029240 0.1343722 0.3083168 0.4411372 0.7936883 0.9136530 1.0668809 1.5122996 1.7365452 2.5850821 2.7172647 3.4363041 3.7406479 4.2781792 5.0855319 6.3346743 7.5878049 7.9913581 8.4601257 9.4608097 10.8113764 11.5811429 13.7311955 14.7904047 15.8180839 16.9182604 17.7588569 18.7531540 19.2776994 19.8803091 22.1289906 22.9958610 23.8128029 24.3955285 25.4967519 25.8787999 27.3183318 28.4985654 29.1096999 29.7529895 31.0091659 31.6560421 32.5228349 33.0154643 33.6733325 34.2135399 37.2675348 37.5303525 38.7891620 40.2491207 40.4784088 40.9423950 41.7471760 43.6339867 43.8340531 45.4918562 46.9744414 47.4352420 47.5608814 48.4846991 49.1526005 49.7485988 50.8038118 52.1990852 52.7791070 53.2376933 54.7378841 55.3715716 57.0771909 57.8431523 60.2473265 60.6404554 62.1694658 62.6527322 62.7904455 64.2202883 64.6588746 66.3746873 66.7550471 68.2233953 69.9978950 70.4070751 70.8710617 71.7089267 72.4419461 72.5690180 74.2600757 74.2840896 75.5491781 76.0450648 77.3218660 78.0052541 78.2065877 78.6347761 78.8644628 80.4312283 82.5130748 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034309 0.0034320 0.0034323 0.0034340 0.0034342 0.0034343 13.8548101 25.2296033 31.2765897 34.8380394 39.8061269 60.2967484 72.1243809 96.7431602 103.7972700 112.1639408 133.5408676 143.0995672 174.5952617 179.0033878 201.2987477 210.0238891 224.6077648 244.8857267 273.3111968 299.1254443 306.9768153 315.8520418 334.0099726 357.0555389 369.5481147 402.3921088 417.6238661 431.8890742 446.6559594 457.6176683 470.2539370 476.7853272 484.1800002 510.8296329 520.7390156 529.9080770 536.3526073 548.3245736 552.4173966 567.5738368 579.7046435 585.8873815 592.3257114 604.7004929 610.9752078 619.2834551 623.9560277 630.1418582 635.1763007 662.9192234 665.2526332 676.3172723 688.9274331 690.8869612 694.8353449 701.6311007 717.3113911 718.9539845 732.4232283 744.2624228 747.9039732 748.8937867 756.1320257 761.3222636 765.9240504 774.0044000 784.5610189 788.9078893 792.3278021 803.4137922 808.0508760 820.4017456 825.8881916 842.8769361 845.6224558 856.2170030 859.5384077 860.4825397 870.2246994 873.1912017 884.7010127 887.2322787 896.9370106 908.5268577 911.1784330 914.1758613 919.5638529 924.2518630 925.0621322 935.7783085 935.9296002 943.8655875 946.9581744 954.8748251 959.0852420 960.3221564 962.9474949 964.3528205 973.8848967 986.4081816 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11671 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6278E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3980E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2956E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.585 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.461 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.51 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 210078 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21060913023720863.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21060913023720863.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21060913023720863.atom Openam> file on opening on unit 11: 21060913023720863.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 702 First residue number = 212 Last residue number = 913 Number of atoms found = 11671 Mean number per residue = 16.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6278E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3980E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2956E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.585 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.461 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.51 Bfactors> 106 vectors, 35013 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.016278 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.038 for 702 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.159 +/- 0.27 Bfactors> = 0.687 +/- 0.12 Bfactors> Shiftng-fct= 0.528 Bfactors> Scaling-fct= 0.433 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21060913023720863.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21060913023720863.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9 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Chkmod> That is: 11671 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 21060913023720863.7.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 21060913023720863.7.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21060913023720863 8 -200 200 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-200 21060913023720863.eigenfacs 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for DQ=20 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=120 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=140 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=160 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=180 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom calculating perturbed structure for DQ=200 21060913023720863.eigenfacs 21060913023720863.atom making animated gifs 21 models are in 21060913023720863.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 21060913023720863.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 21060913023720863.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21060913023720863 9 -200 200 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating 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