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***  CELL CYCLE 19-FEB-15 4YC6  ***

LOGs for ID: 21041915160580634

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21041915160580634.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21041915160580634.atom to be opened. Openam> File opened: 21041915160580634.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1420 First residue number = 1 Last residue number = 74 Number of atoms found = 11700 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = -14.318632 +/- 16.039413 From: -57.845000 To: 28.548000 = 12.339916 +/- 21.723208 From: -33.294000 To: 54.978000 = -22.276263 +/- 21.605121 From: -69.342000 To: 24.838000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7182 % Filled. Pdbmat> 4424329 non-zero elements. Pdbmat> 483866 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.71 +/- 21.58 Maximum number = 130 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 9.677320E+06 Pdbmat> Larger element = 507.068 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1420 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21041915160580634.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21041915160580634.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21041915160580634.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11700 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1420 residues. Blocpdb> 70 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 57 atoms in block 2 Block first atom: 71 Blocpdb> 69 atoms in block 3 Block first atom: 128 Blocpdb> 54 atoms in block 4 Block first atom: 197 Blocpdb> 69 atoms in block 5 Block first atom: 251 Blocpdb> 54 atoms in block 6 Block first atom: 320 Blocpdb> 67 atoms in block 7 Block first atom: 374 Blocpdb> 68 atoms in block 8 Block first atom: 441 Blocpdb> 63 atoms in block 9 Block first atom: 509 Blocpdb> 72 atoms in block 10 Block first atom: 572 Blocpdb> 67 atoms in block 11 Block first atom: 644 Blocpdb> 65 atoms in block 12 Block first atom: 711 Blocpdb> 61 atoms in block 13 Block first atom: 776 Blocpdb> 71 atoms in block 14 Block first atom: 837 Blocpdb> 63 atoms in block 15 Block first atom: 908 Blocpdb> 72 atoms in block 16 Block first atom: 971 Blocpdb> 74 atoms in block 17 Block first atom: 1043 Blocpdb> 61 atoms in block 18 Block first atom: 1117 Blocpdb> 57 atoms in block 19 Block first atom: 1178 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 1235 Blocpdb> 66 atoms in block 21 Block first atom: 1250 Blocpdb> 74 atoms in block 22 Block first atom: 1316 Blocpdb> 60 atoms in block 23 Block first atom: 1390 Blocpdb> 65 atoms in block 24 Block first atom: 1450 Blocpdb> 57 atoms in block 25 Block first atom: 1515 Blocpdb> 65 atoms in block 26 Block first atom: 1572 Blocpdb> 67 atoms in block 27 Block first atom: 1637 Blocpdb> 65 atoms in block 28 Block first atom: 1704 Blocpdb> 69 atoms in block 29 Block first atom: 1769 Blocpdb> 68 atoms in block 30 Block first atom: 1838 Blocpdb> 72 atoms in block 31 Block first atom: 1906 Blocpdb> 55 atoms in block 32 Block first atom: 1978 Blocpdb> 61 atoms in block 33 Block first atom: 2033 Blocpdb> 67 atoms in block 34 Block first atom: 2094 Blocpdb> 58 atoms in block 35 Block first atom: 2161 Blocpdb> 67 atoms in block 36 Block first atom: 2219 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 2286 Blocpdb> 76 atoms in block 38 Block first atom: 2313 Blocpdb> 77 atoms in block 39 Block first atom: 2389 Blocpdb> 73 atoms in block 40 Block first atom: 2466 Blocpdb> 62 atoms in block 41 Block first atom: 2539 Blocpdb> 71 atoms in block 42 Block first atom: 2601 Blocpdb> 60 atoms in block 43 Block first atom: 2672 Blocpdb> 73 atoms in block 44 Block first atom: 2732 Blocpdb> 66 atoms in block 45 Block first atom: 2805 Blocpdb> 55 atoms in block 46 Block first atom: 2871 Blocpdb> 70 atoms in block 47 Block first atom: 2926 Blocpdb> 57 atoms in block 48 Block first atom: 2996 Blocpdb> 69 atoms in block 49 Block first atom: 3053 Blocpdb> 54 atoms in block 50 Block first atom: 3122 Blocpdb> 69 atoms in block 51 Block first atom: 3176 Blocpdb> 54 atoms in block 52 Block first atom: 3245 Blocpdb> 67 atoms in block 53 Block first atom: 3299 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 3366 Blocpdb> 63 atoms in block 55 Block first atom: 3434 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 3497 Blocpdb> 67 atoms in block 57 Block first atom: 3569 Blocpdb> 65 atoms in block 58 Block first atom: 3636 Blocpdb> 61 atoms in block 59 Block first atom: 3701 Blocpdb> 71 atoms in block 60 Block first atom: 3762 Blocpdb> 63 atoms in block 61 Block first atom: 3833 Blocpdb> 72 atoms in block 62 Block first atom: 3896 Blocpdb> 74 atoms in block 63 Block first atom: 3968 Blocpdb> 61 atoms in block 64 Block first atom: 4042 Blocpdb> 57 atoms in block 65 Block first atom: 4103 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 4160 Blocpdb> 66 atoms in block 67 Block first atom: 4175 Blocpdb> 74 atoms in block 68 Block first atom: 4241 Blocpdb> 60 atoms in block 69 Block first atom: 4315 Blocpdb> 65 atoms in block 70 Block first atom: 4375 Blocpdb> 57 atoms in block 71 Block first atom: 4440 Blocpdb> 65 atoms in block 72 Block first atom: 4497 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 4562 Blocpdb> 65 atoms in block 74 Block first atom: 4629 Blocpdb> 69 atoms in block 75 Block first atom: 4694 Blocpdb> 68 atoms in block 76 Block first atom: 4763 Blocpdb> 72 atoms in block 77 Block first atom: 4831 Blocpdb> 55 atoms in block 78 Block first atom: 4903 Blocpdb> 61 atoms in block 79 Block first atom: 4958 Blocpdb> 67 atoms in block 80 Block first atom: 5019 Blocpdb> 58 atoms in block 81 Block first atom: 5086 Blocpdb> 67 atoms in block 82 Block first atom: 5144 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 5211 Blocpdb> 76 atoms in block 84 Block first atom: 5238 Blocpdb> 77 atoms in block 85 Block first atom: 5314 Blocpdb> 73 atoms in block 86 Block first atom: 5391 Blocpdb> 62 atoms in block 87 Block first atom: 5464 Blocpdb> 71 atoms in block 88 Block first atom: 5526 Blocpdb> 60 atoms in block 89 Block first atom: 5597 Blocpdb> 73 atoms in block 90 Block first atom: 5657 Blocpdb> 66 atoms in block 91 Block first atom: 5730 Blocpdb> 55 atoms in block 92 Block first atom: 5796 Blocpdb> 70 atoms in block 93 Block first atom: 5851 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 5921 Blocpdb> 69 atoms in block 95 Block first atom: 5978 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 6047 Blocpdb> 69 atoms in block 97 Block first atom: 6101 Blocpdb> 54 atoms in block 98 Block first atom: 6170 Blocpdb> 67 atoms in block 99 Block first atom: 6224 Blocpdb> 68 atoms in block 100 Block first atom: 6291 Blocpdb> 63 atoms in block 101 Block first atom: 6359 Blocpdb> 72 atoms in block 102 Block first atom: 6422 Blocpdb> 67 atoms in block 103 Block first atom: 6494 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 6561 Blocpdb> 61 atoms in block 105 Block first atom: 6626 Blocpdb> 71 atoms in block 106 Block first atom: 6687 Blocpdb> 63 atoms in block 107 Block first atom: 6758 Blocpdb> 72 atoms in block 108 Block first atom: 6821 Blocpdb> 74 atoms in block 109 Block first atom: 6893 Blocpdb> 61 atoms in block 110 Block first atom: 6967 Blocpdb> 57 atoms in block 111 Block first atom: 7028 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 7085 Blocpdb> 66 atoms in block 113 Block first atom: 7100 Blocpdb> 74 atoms in block 114 Block first atom: 7166 Blocpdb> 60 atoms in block 115 Block first atom: 7240 Blocpdb> 65 atoms in block 116 Block first atom: 7300 Blocpdb> 57 atoms in block 117 Block first atom: 7365 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 7422 Blocpdb> 67 atoms in block 119 Block first atom: 7487 Blocpdb> 65 atoms in block 120 Block first atom: 7554 Blocpdb> 69 atoms in block 121 Block first atom: 7619 Blocpdb> 68 atoms in block 122 Block first atom: 7688 Blocpdb> 72 atoms in block 123 Block first atom: 7756 Blocpdb> 55 atoms in block 124 Block first atom: 7828 Blocpdb> 61 atoms in block 125 Block first atom: 7883 Blocpdb> 67 atoms in block 126 Block first atom: 7944 Blocpdb> 58 atoms in block 127 Block first atom: 8011 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 8069 Blocpdb> 27 atoms in block 129 Block first atom: 8136 Blocpdb> 76 atoms in block 130 Block first atom: 8163 Blocpdb> 77 atoms in block 131 Block first atom: 8239 Blocpdb> 73 atoms in block 132 Block first atom: 8316 Blocpdb> 62 atoms in block 133 Block first atom: 8389 Blocpdb> 71 atoms in block 134 Block first atom: 8451 Blocpdb> 60 atoms in block 135 Block first atom: 8522 Blocpdb> 73 atoms in block 136 Block first atom: 8582 Blocpdb> 66 atoms in block 137 Block first atom: 8655 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 8721 Blocpdb> 70 atoms in block 139 Block first atom: 8776 Blocpdb> 57 atoms in block 140 Block first atom: 8846 Blocpdb> 69 atoms in block 141 Block first atom: 8903 Blocpdb> 54 atoms in block 142 Block first atom: 8972 Blocpdb> 69 atoms in block 143 Block first atom: 9026 Blocpdb> 54 atoms in block 144 Block first atom: 9095 Blocpdb> 67 atoms in block 145 Block first atom: 9149 Blocpdb> 68 atoms in block 146 Block first atom: 9216 Blocpdb> 63 atoms in block 147 Block first atom: 9284 Blocpdb> 72 atoms in block 148 Block first atom: 9347 Blocpdb> 67 atoms in block 149 Block first atom: 9419 Blocpdb> 65 atoms in block 150 Block first atom: 9486 Blocpdb> 61 atoms in block 151 Block first atom: 9551 Blocpdb> 71 atoms in block 152 Block first atom: 9612 Blocpdb> 63 atoms in block 153 Block first atom: 9683 Blocpdb> 72 atoms in block 154 Block first atom: 9746 Blocpdb> 74 atoms in block 155 Block first atom: 9818 Blocpdb> 61 atoms in block 156 Block first atom: 9892 Blocpdb> 57 atoms in block 157 Block first atom: 9953 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 10010 Blocpdb> 66 atoms in block 159 Block first atom: 10025 Blocpdb> 74 atoms in block 160 Block first atom: 10091 Blocpdb> 60 atoms in block 161 Block first atom: 10165 Blocpdb> 65 atoms in block 162 Block first atom: 10225 Blocpdb> 57 atoms in block 163 Block first atom: 10290 Blocpdb> 65 atoms in block 164 Block first atom: 10347 Blocpdb> 67 atoms in block 165 Block first atom: 10412 Blocpdb> 65 atoms in block 166 Block first atom: 10479 Blocpdb> 69 atoms in block 167 Block first atom: 10544 Blocpdb> 68 atoms in block 168 Block first atom: 10613 Blocpdb> 72 atoms in block 169 Block first atom: 10681 Blocpdb> 55 atoms in block 170 Block first atom: 10753 Blocpdb> 61 atoms in block 171 Block first atom: 10808 Blocpdb> 67 atoms in block 172 Block first atom: 10869 Blocpdb> 58 atoms in block 173 Block first atom: 10936 Blocpdb> 67 atoms in block 174 Block first atom: 10994 Blocpdb> 27 atoms in block 175 Block first atom: 11061 Blocpdb> 76 atoms in block 176 Block first atom: 11088 Blocpdb> 77 atoms in block 177 Block first atom: 11164 Blocpdb> 73 atoms in block 178 Block first atom: 11241 Blocpdb> 62 atoms in block 179 Block first atom: 11314 Blocpdb> 71 atoms in block 180 Block first atom: 11376 Blocpdb> 60 atoms in block 181 Block first atom: 11447 Blocpdb> 73 atoms in block 182 Block first atom: 11507 Blocpdb> 66 atoms in block 183 Block first atom: 11580 Blocpdb> 55 atoms in block 184 Block first atom: 11645 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 77 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4424513 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 35100 Prepmat> Matrix trace = 9677320.0000 Prepmat> Last element read: 35100 35100 120.9859 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15494 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11700 RTB> Total mass = 11700.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11700 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188141.2276 RTB> 52176 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52176 Diagstd> Projected matrix trace = 188141.2276 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188141.2276 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3067782 2.3107558 2.5056039 2.5810238 2.9382755 3.1080454 3.3354059 3.5193545 3.7645181 3.8201777 4.2515406 4.6650710 5.0477580 6.1067786 6.1903552 6.8493835 7.0426787 7.2650246 7.5496570 7.7626785 7.9484458 8.7909851 9.2104115 9.2663053 9.6939599 10.2099508 10.7001088 10.9795555 11.4075959 11.5559231 12.5433870 12.8001208 13.3232115 13.4909659 13.6363122 14.1874802 14.2753504 14.4348299 14.6044228 15.1303155 16.3180701 17.0712213 17.2608072 17.4427554 17.6990707 18.4571139 18.8107697 19.0567145 19.8803531 20.0612576 20.2731971 20.6187183 21.1315951 22.0151865 22.3748597 22.4835333 23.0129230 23.1753309 23.5351061 24.1716270 24.5871738 24.6992345 24.9016332 25.2355462 26.1166224 26.3894116 26.9181912 27.0685594 27.4277071 27.6594291 28.0207102 28.3123780 28.6011741 28.7444346 29.2025300 29.6898591 29.8394088 30.3093922 31.0408425 31.1913247 31.8703169 31.9020133 32.3139085 33.0873093 33.4909809 33.6077060 33.8328663 34.3377588 34.3916490 34.9537551 35.2652705 35.5323686 35.8836651 36.2955127 36.3589408 36.7408831 37.0699835 37.3595216 37.4957642 37.8054482 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034334 0.0034337 0.0034342 0.0034345 0.0034351 124.1355615 165.0715797 171.8903462 174.4581587 186.1407846 191.4427661 198.3214225 203.7167714 210.6929360 212.2448024 223.9073998 234.5440454 243.9745610 268.3498563 270.1799185 284.1980020 288.1802522 292.6940034 298.3725667 302.5527329 306.1514985 321.9689960 329.5602294 330.5586937 338.1005591 346.9821271 355.2134300 359.8219551 366.7687665 369.1455204 384.5941650 388.5101003 396.3690556 398.8566183 400.9994232 409.0231739 410.2878619 412.5732963 414.9898535 422.3954894 438.6616597 448.6705628 451.1550580 453.5266646 456.8467208 466.5274216 470.9757689 474.0446982 484.1805368 486.3784869 488.9409385 493.0899069 499.1848783 509.5144025 513.6596370 514.9055364 520.9321628 522.7671054 526.8092118 533.8856182 538.4552130 539.6808742 541.8875788 545.5086419 554.9499098 557.8406181 563.4017833 564.9732057 568.7089094 571.1062146 574.8239431 577.8078719 580.7473158 582.1999521 586.8208274 591.6969742 593.1853104 597.8385201 605.0092718 606.4740042 613.0395181 613.3442896 617.2911144 624.6345553 628.4333349 629.5275128 631.6328031 636.3283215 636.8274570 642.0106014 644.8651244 647.3026123 650.4945732 654.2168839 654.7882711 658.2184866 661.1598559 663.7368555 664.9460108 667.6863161 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11700 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.252 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 210600 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21041915160580634.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21041915160580634.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21041915160580634.atom Openam> file on opening on unit 11: 21041915160580634.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1420 First residue number = 1 Last residue number = 74 Number of atoms found = 11700 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.252 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.791 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Bfactors> 106 vectors, 35100 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.307000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.458 for 1428 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.012 +/- 0.01 Bfactors> = 95.345 +/- 29.86 Bfactors> Shiftng-fct= 95.332 Bfactors> Scaling-fct= 4174.213 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21041915160580634.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21041915160580634.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.7 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Chkmod> That is: 11700 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21041915160580634.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21041915160580634.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21041915160580634 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom 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0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21041915160580634.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21041915160580634 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21041915160580634 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21041915160580634.eigenfacs 21041915160580634.atom making animated gifs 11 models are in 21041915160580634.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21041915160580634.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21041915160580634.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21041915160580634.10.pdb 21041915160580634.11.pdb 21041915160580634.7.pdb 21041915160580634.8.pdb 21041915160580634.9.pdb STDERR: real 0m55.868s user 0m55.004s sys 0m0.828s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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