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***  6DG7 CHOLESTEROL BOX 3  ***

LOGs for ID: 21032916130086327

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21032916130086327.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21032916130086327.atom to be opened. Openam> File opened: 21032916130086327.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1956 First residue number = 8 Last residue number = 1 Number of atoms found = 16204 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 159.632872 +/- 17.374370 From: 114.491000 To: 200.459000 = 159.613645 +/- 17.361445 From: 114.398000 To: 200.645000 = 167.307666 +/- 38.037435 From: 73.189000 To: 233.877000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.5890 % Filled. Pdbmat> 5688897 non-zero elements. Pdbmat> 621387 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.70 +/- 17.73 Maximum number = 120 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 1.242774E+07 Pdbmat> Larger element = 495.993 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1956 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21032916130086327.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21032916130086327.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21032916130086327.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 16204 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1956 residues. Blocpdb> 75 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 80 atoms in block 2 Block first atom: 76 Blocpdb> 92 atoms in block 3 Block first atom: 156 Blocpdb> 76 atoms in block 4 Block first atom: 248 Blocpdb> 81 atoms in block 5 Block first atom: 324 Blocpdb> 100 atoms in block 6 Block first atom: 405 Blocpdb> 94 atoms in block 7 Block first atom: 505 Blocpdb> 81 atoms in block 8 Block first atom: 599 Blocpdb> 80 atoms in block 9 Block first atom: 680 Blocpdb> 78 atoms in block 10 Block first atom: 760 Blocpdb> 83 atoms in block 11 Block first atom: 838 Blocpdb> 89 atoms in block 12 Block first atom: 921 Blocpdb> 71 atoms in block 13 Block first atom: 1010 Blocpdb> 89 atoms in block 14 Block first atom: 1081 Blocpdb> 81 atoms in block 15 Block first atom: 1170 Blocpdb> 81 atoms in block 16 Block first atom: 1251 Blocpdb> 88 atoms in block 17 Block first atom: 1332 Blocpdb> 86 atoms in block 18 Block first atom: 1420 Blocpdb> 88 atoms in block 19 Block first atom: 1506 Blocpdb> 82 atoms in block 20 Block first atom: 1594 Blocpdb> 88 atoms in block 21 Block first atom: 1676 Blocpdb> 86 atoms in block 22 Block first atom: 1764 Blocpdb> 78 atoms in block 23 Block first atom: 1850 Blocpdb> 74 atoms in block 24 Block first atom: 1928 Blocpdb> 78 atoms in block 25 Block first atom: 2002 Blocpdb> 80 atoms in block 26 Block first atom: 2080 Blocpdb> 68 atoms in block 27 Block first atom: 2160 Blocpdb> 76 atoms in block 28 Block first atom: 2228 Blocpdb> 70 atoms in block 29 Block first atom: 2304 Blocpdb> 82 atoms in block 30 Block first atom: 2374 Blocpdb> 83 atoms in block 31 Block first atom: 2456 Blocpdb> 89 atoms in block 32 Block first atom: 2539 Blocpdb> 46 atoms in block 33 Block first atom: 2628 Blocpdb> 75 atoms in block 34 Block first atom: 2674 Blocpdb> 89 atoms in block 35 Block first atom: 2749 Blocpdb> 90 atoms in block 36 Block first atom: 2838 Blocpdb> 84 atoms in block 37 Block first atom: 2928 Blocpdb> 86 atoms in block 38 Block first atom: 3012 Blocpdb> 82 atoms in block 39 Block first atom: 3098 Blocpdb> 56 atoms in block 40 Block first atom: 3180 Blocpdb> 75 atoms in block 41 Block first atom: 3236 Blocpdb> 80 atoms in block 42 Block first atom: 3311 Blocpdb> 92 atoms in block 43 Block first atom: 3391 Blocpdb> 76 atoms in block 44 Block first atom: 3483 Blocpdb> 81 atoms in block 45 Block first atom: 3559 Blocpdb> 100 atoms in block 46 Block first atom: 3640 Blocpdb> 94 atoms in block 47 Block first atom: 3740 Blocpdb> 81 atoms in block 48 Block first atom: 3834 Blocpdb> 80 atoms in block 49 Block first atom: 3915 Blocpdb> 78 atoms in block 50 Block first atom: 3995 Blocpdb> 83 atoms in block 51 Block first atom: 4073 Blocpdb> 89 atoms in block 52 Block first atom: 4156 Blocpdb> 71 atoms in block 53 Block first atom: 4245 Blocpdb> 89 atoms in block 54 Block first atom: 4316 Blocpdb> 81 atoms in block 55 Block first atom: 4405 Blocpdb> 81 atoms in block 56 Block first atom: 4486 Blocpdb> 88 atoms in block 57 Block first atom: 4567 Blocpdb> 86 atoms in block 58 Block first atom: 4655 Blocpdb> 88 atoms in block 59 Block first atom: 4741 Blocpdb> 82 atoms in block 60 Block first atom: 4829 Blocpdb> 88 atoms in block 61 Block first atom: 4911 Blocpdb> 86 atoms in block 62 Block first atom: 4999 Blocpdb> 78 atoms in block 63 Block first atom: 5085 Blocpdb> 74 atoms in block 64 Block first atom: 5163 Blocpdb> 78 atoms in block 65 Block first atom: 5237 Blocpdb> 80 atoms in block 66 Block first atom: 5315 Blocpdb> 68 atoms in block 67 Block first atom: 5395 Blocpdb> 76 atoms in block 68 Block first atom: 5463 Blocpdb> 70 atoms in block 69 Block first atom: 5539 Blocpdb> 82 atoms in block 70 Block first atom: 5609 Blocpdb> 83 atoms in block 71 Block first atom: 5691 Blocpdb> 89 atoms in block 72 Block first atom: 5774 Blocpdb> 46 atoms in block 73 Block first atom: 5863 Blocpdb> 75 atoms in block 74 Block first atom: 5909 Blocpdb> 89 atoms in block 75 Block first atom: 5984 Blocpdb> 90 atoms in block 76 Block first atom: 6073 Blocpdb> 84 atoms in block 77 Block first atom: 6163 Blocpdb> 86 atoms in block 78 Block first atom: 6247 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 6333 Blocpdb> 56 atoms in block 80 Block first atom: 6415 Blocpdb> 75 atoms in block 81 Block first atom: 6471 Blocpdb> 80 atoms in block 82 Block first atom: 6546 Blocpdb> 92 atoms in block 83 Block first atom: 6626 Blocpdb> 76 atoms in block 84 Block first atom: 6718 Blocpdb> 81 atoms in block 85 Block first atom: 6794 Blocpdb> 100 atoms in block 86 Block first atom: 6875 Blocpdb> 94 atoms in block 87 Block first atom: 6975 Blocpdb> 81 atoms in block 88 Block first atom: 7069 Blocpdb> 80 atoms in block 89 Block first atom: 7150 Blocpdb> 78 atoms in block 90 Block first atom: 7230 Blocpdb> 83 atoms in block 91 Block first atom: 7308 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 7391 Blocpdb> 71 atoms in block 93 Block first atom: 7480 Blocpdb> 89 atoms in block 94 Block first atom: 7551 Blocpdb> 81 atoms in block 95 Block first atom: 7640 Blocpdb> 81 atoms in block 96 Block first atom: 7721 Blocpdb> 88 atoms in block 97 Block first atom: 7802 Blocpdb> 86 atoms in block 98 Block first atom: 7890 Blocpdb> 88 atoms in block 99 Block first atom: 7976 Blocpdb> 82 atoms in block 100 Block first atom: 8064 Blocpdb> 88 atoms in block 101 Block first atom: 8146 Blocpdb> 86 atoms in block 102 Block first atom: 8234 Blocpdb> 78 atoms in block 103 Block first atom: 8320 Blocpdb> 74 atoms in block 104 Block first atom: 8398 Blocpdb> 78 atoms in block 105 Block first atom: 8472 Blocpdb> 80 atoms in block 106 Block first atom: 8550 Blocpdb> 68 atoms in block 107 Block first atom: 8630 Blocpdb> 76 atoms in block 108 Block first atom: 8698 Blocpdb> 70 atoms in block 109 Block first atom: 8774 Blocpdb> 82 atoms in block 110 Block first atom: 8844 Blocpdb> 83 atoms in block 111 Block first atom: 8926 Blocpdb> 89 atoms in block 112 Block first atom: 9009 Blocpdb> 46 atoms in block 113 Block first atom: 9098 Blocpdb> 75 atoms in block 114 Block first atom: 9144 Blocpdb> 89 atoms in block 115 Block first atom: 9219 Blocpdb> 90 atoms in block 116 Block first atom: 9308 Blocpdb> 84 atoms in block 117 Block first atom: 9398 Blocpdb> 86 atoms in block 118 Block first atom: 9482 Blocpdb> 82 atoms in block 119 Block first atom: 9568 Blocpdb> 56 atoms in block 120 Block first atom: 9650 Blocpdb> 75 atoms in block 121 Block first atom: 9706 Blocpdb> 80 atoms in block 122 Block first atom: 9781 Blocpdb> 92 atoms in block 123 Block first atom: 9861 Blocpdb> 76 atoms in block 124 Block first atom: 9953 Blocpdb> 81 atoms in block 125 Block first atom: 10029 Blocpdb> 100 atoms in block 126 Block first atom: 10110 Blocpdb> 94 atoms in block 127 Block first atom: 10210 Blocpdb> 81 atoms in block 128 Block first atom: 10304 Blocpdb> 80 atoms in block 129 Block first atom: 10385 Blocpdb> 78 atoms in block 130 Block first atom: 10465 Blocpdb> 83 atoms in block 131 Block first atom: 10543 Blocpdb> 89 atoms in block 132 Block first atom: 10626 Blocpdb> 71 atoms in block 133 Block first atom: 10715 Blocpdb> 89 atoms in block 134 Block first atom: 10786 Blocpdb> 81 atoms in block 135 Block first atom: 10875 Blocpdb> 81 atoms in block 136 Block first atom: 10956 Blocpdb> 88 atoms in block 137 Block first atom: 11037 Blocpdb> 86 atoms in block 138 Block first atom: 11125 Blocpdb> 88 atoms in block 139 Block first atom: 11211 Blocpdb> 82 atoms in block 140 Block first atom: 11299 Blocpdb> 88 atoms in block 141 Block first atom: 11381 Blocpdb> 86 atoms in block 142 Block first atom: 11469 Blocpdb> 78 atoms in block 143 Block first atom: 11555 Blocpdb> 74 atoms in block 144 Block first atom: 11633 Blocpdb> 78 atoms in block 145 Block first atom: 11707 Blocpdb> 80 atoms in block 146 Block first atom: 11785 Blocpdb> 68 atoms in block 147 Block first atom: 11865 Blocpdb> 76 atoms in block 148 Block first atom: 11933 Blocpdb> 70 atoms in block 149 Block first atom: 12009 Blocpdb> 82 atoms in block 150 Block first atom: 12079 Blocpdb> 83 atoms in block 151 Block first atom: 12161 Blocpdb> 89 atoms in block 152 Block first atom: 12244 Blocpdb> 46 atoms in block 153 Block first atom: 12333 Blocpdb> 75 atoms in block 154 Block first atom: 12379 Blocpdb> 89 atoms in block 155 Block first atom: 12454 Blocpdb> 90 atoms in block 156 Block first atom: 12543 Blocpdb> 84 atoms in block 157 Block first atom: 12633 Blocpdb> 86 atoms in block 158 Block first atom: 12717 Blocpdb> 82 atoms in block 159 Block first atom: 12803 Blocpdb> 56 atoms in block 160 Block first atom: 12885 Blocpdb> 75 atoms in block 161 Block first atom: 12941 Blocpdb> 80 atoms in block 162 Block first atom: 13016 Blocpdb> 92 atoms in block 163 Block first atom: 13096 Blocpdb> 76 atoms in block 164 Block first atom: 13188 Blocpdb> 81 atoms in block 165 Block first atom: 13264 Blocpdb> 100 atoms in block 166 Block first atom: 13345 Blocpdb> 94 atoms in block 167 Block first atom: 13445 Blocpdb> 81 atoms in block 168 Block first atom: 13539 Blocpdb> 80 atoms in block 169 Block first atom: 13620 Blocpdb> 78 atoms in block 170 Block first atom: 13700 Blocpdb> 83 atoms in block 171 Block first atom: 13778 Blocpdb> 89 atoms in block 172 Block first atom: 13861 Blocpdb> 71 atoms in block 173 Block first atom: 13950 Blocpdb> 89 atoms in block 174 Block first atom: 14021 Blocpdb> 81 atoms in block 175 Block first atom: 14110 Blocpdb> 81 atoms in block 176 Block first atom: 14191 Blocpdb> 88 atoms in block 177 Block first atom: 14272 Blocpdb> 86 atoms in block 178 Block first atom: 14360 Blocpdb> 88 atoms in block 179 Block first atom: 14446 Blocpdb> 82 atoms in block 180 Block first atom: 14534 Blocpdb> 88 atoms in block 181 Block first atom: 14616 Blocpdb> 86 atoms in block 182 Block first atom: 14704 Blocpdb> 78 atoms in block 183 Block first atom: 14790 Blocpdb> 74 atoms in block 184 Block first atom: 14868 Blocpdb> 78 atoms in block 185 Block first atom: 14942 Blocpdb> 80 atoms in block 186 Block first atom: 15020 Blocpdb> 68 atoms in block 187 Block first atom: 15100 Blocpdb> 76 atoms in block 188 Block first atom: 15168 Blocpdb> 70 atoms in block 189 Block first atom: 15244 Blocpdb> 82 atoms in block 190 Block first atom: 15314 Blocpdb> 83 atoms in block 191 Block first atom: 15396 Blocpdb> 89 atoms in block 192 Block first atom: 15479 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 15568 Blocpdb> 75 atoms in block 194 Block first atom: 15614 Blocpdb> 89 atoms in block 195 Block first atom: 15689 Blocpdb> 90 atoms in block 196 Block first atom: 15778 Blocpdb> 84 atoms in block 197 Block first atom: 15868 Blocpdb> 86 atoms in block 198 Block first atom: 15952 Blocpdb> 82 atoms in block 199 Block first atom: 16038 Blocpdb> 56 atoms in block 200 Block first atom: 16120 Blocpdb> 29 atoms in block 201 Block first atom: 16175 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 100 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5689098 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 48612 Prepmat> Matrix trace = 12427740.0000 Prepmat> Last element read: 48612 48612 149.9289 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18754 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 16204 RTB> Total mass = 16204.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 16204 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 164453.1144 RTB> 52677 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52677 Diagstd> Projected matrix trace = 164453.1144 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 164453.1144 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6626996 0.8844776 0.8852299 2.0839070 2.0927389 2.2155391 2.3259480 2.3492769 2.4587344 2.4805756 2.6887428 2.7018894 2.8252572 2.8682558 2.8748600 3.2090520 3.2294351 4.1458170 4.1808121 4.2255058 4.2633421 4.3059373 5.3286448 6.0426141 6.1695062 6.5650199 6.5970372 6.6108766 6.8591824 7.0103717 7.2710918 7.6058196 7.6556674 8.0922535 8.8959904 9.1016442 9.1378426 9.2881209 9.3882775 9.4618701 9.5092490 10.1045122 10.2495342 10.4105128 10.6195980 10.7354653 10.7609589 10.8467000 11.0077711 11.3189591 11.3333106 11.4083391 11.4772069 11.6784441 11.7513166 11.9555559 12.8224699 12.8899048 12.9250873 12.9441040 13.0106757 13.1457967 13.5256352 14.3648300 14.4059365 14.7153720 14.7547820 14.8772177 15.1967000 15.2305794 16.1054381 16.1817421 16.3342553 16.6411819 16.6842818 17.2584424 17.2830137 18.0135633 18.2978584 18.3439679 18.4854438 18.5841248 20.0785452 20.1168950 20.1836689 20.4112854 20.4565110 20.4695785 20.5071391 20.7349499 20.8808440 21.4602612 21.8854549 21.9756970 22.0510320 22.1763026 22.2830641 22.6409740 22.6478554 23.1749472 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034331 0.0034335 0.0034339 0.0034341 0.0034346 88.4002810 102.1265573 102.1699846 156.7597080 157.0915421 161.6348439 165.6133261 166.4417929 170.2750771 171.0296936 178.0614525 178.4962361 182.5258051 183.9095257 184.1211286 194.5286866 195.1455076 221.1059057 222.0371290 223.2207840 224.2179478 225.3352484 250.6707533 266.9363456 269.7245540 278.2359886 278.9136355 279.2060375 284.4012202 287.5185062 292.8161957 299.4803217 300.4601011 308.9086145 323.8861912 327.6085343 328.2593597 330.9475800 332.7271486 334.0286908 334.8639450 345.1858279 347.6540908 350.3735729 353.8745411 355.7998131 356.2220236 357.6383594 360.2840000 365.3410940 365.5726326 366.7807143 367.8861052 371.0972822 372.2532888 375.4742582 388.8491234 389.8702851 390.4019895 390.6890841 391.6924556 393.7211416 399.3687830 411.5717192 412.1601781 416.5632018 417.1206390 418.8477040 423.3211097 423.7927206 435.7943062 436.8254347 438.8791507 442.9833106 443.5565930 451.1241520 451.4451764 460.8876765 464.5103679 465.0952688 466.8853222 468.1298531 486.5880084 487.0524753 487.8601408 490.6032922 491.1465092 491.3033559 491.7539062 494.4777736 496.2143332 503.0518870 508.0109450 509.0572293 509.9290335 511.3754204 512.6048785 516.7052007 516.7837183 522.7627779 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 16204 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.481 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.868 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.329 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.597 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.859 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.656 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99996 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 291672 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99996 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21032916130086327.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21032916130086327.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21032916130086327.atom Openam> file on opening on unit 11: 21032916130086327.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1956 First residue number = 8 Last residue number = 1 Number of atoms found = 16204 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.481 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.868 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.329 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.597 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.859 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.656 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17 Bfactors> 106 vectors, 48612 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.662700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.281 for 1955 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.02 Bfactors> = 155.267 +/- 39.03 Bfactors> Shiftng-fct= 155.252 Bfactors> Scaling-fct= 2009.642 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21032916130086327.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21032916130086327.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 16204 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9608 0.0034 0.8142 0.0034 0.8116 0.0034 0.8191 0.0034 0.8006 0.0034 0.8307 88.3965 0.4731 102.1235 0.4812 102.1639 0.4792 156.7565 0.4821 157.0946 0.4879 161.6447 0.1146 165.6081 0.0413 166.4248 0.0491 170.2770 0.0729 171.0370 0.0590 178.0623 0.4153 178.4922 0.4225 182.5097 0.1277 183.8934 0.5171 184.1177 0.1387 194.5188 0.1727 195.1240 0.1652 221.1013 0.1132 222.0326 0.3760 223.2243 0.3389 224.1993 0.6192 225.3272 0.6078 250.6683 0.4850 266.9334 0.1987 269.7238 0.2108 278.2236 0.6107 278.9009 0.6153 279.1967 0.6006 284.3852 0.4696 287.4985 0.4805 292.8018 0.6691 299.4710 0.6890 300.4537 0.6904 308.8905 0.5993 323.8725 0.4108 327.6009 0.6129 328.2481 0.5935 330.9312 0.4628 332.7079 0.4687 334.0166 0.5912 334.8452 0.5917 345.0939 0.7856 347.6471 0.1001 350.3499 0.2424 353.8660 0.3194 355.8597 0.2434 356.1909 0.1465 357.6774 0.2593 360.3050 0.4279 365.3422 0.3968 365.5035 0.3902 366.7917 0.2791 367.9151 0.2878 371.1061 0.6448 372.2165 0.2513 375.5279 0.1833 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gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032916130086327.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21032916130086327 8 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032916130086327.eigenfacs 21032916130086327.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032916130086327.eigenfacs 21032916130086327.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032916130086327.eigenfacs 21032916130086327.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032916130086327.eigenfacs 21032916130086327.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032916130086327.eigenfacs 21032916130086327.atom calculating perturbed structure for DQ=50 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