CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  6DG7 SUBUNIT C ONLY - NO OESTRODIOL  ***

LOGs for ID: 21032914212721515

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21032914212721515.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21032914212721515.atom to be opened. Openam> File opened: 21032914212721515.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 181 First residue number = 1 Last residue number = 181 Number of atoms found = 3040 Mean number per residue = 16.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 169.424610 +/- 9.362577 From: 146.698000 To: 193.946000 = 175.499139 +/- 7.239923 From: 159.874000 To: 194.355000 = 131.517112 +/- 22.798576 From: 72.364000 To: 173.408000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.2314 % Filled. Pdbmat> 1759911 non-zero elements. Pdbmat> 193554 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 127.34 +/- 38.58 Maximum number = 229 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 3.871080E+06 Pdbmat> Larger element = 867.807 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 181 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21032914212721515.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21032914212721515.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21032914212721515.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3040 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 181 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 24 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 49 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 63 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 82 Blocpdb> 21 atoms in block 6 Block first atom: 102 Blocpdb> 10 atoms in block 7 Block first atom: 123 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 133 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 149 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 160 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 179 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 198 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 217 Blocpdb> 11 atoms in block 14 Block first atom: 231 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 242 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 261 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 281 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 300 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 317 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 333 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 349 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 361 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 380 Blocpdb> 7 atoms in block 24 Block first atom: 396 Blocpdb> 20 atoms in block 25 Block first atom: 403 Blocpdb> 11 atoms in block 26 Block first atom: 423 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 434 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 453 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 467 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 481 Blocpdb> 11 atoms in block 31 Block first atom: 493 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 504 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 511 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 526 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 550 Blocpdb> 11 atoms in block 36 Block first atom: 566 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 577 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 597 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 619 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 638 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 652 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 671 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 690 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 709 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 716 Blocpdb> 11 atoms in block 46 Block first atom: 737 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 748 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 764 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 784 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 803 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 822 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 841 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 857 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 868 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 880 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 894 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 913 Blocpdb> 10 atoms in block 58 Block first atom: 927 Blocpdb> 14 atoms in block 59 Block first atom: 937 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 951 Blocpdb> 19 atoms in block 61 Block first atom: 961 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 980 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 987 Blocpdb> 14 atoms in block 64 Block first atom: 1001 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1015 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1034 Blocpdb> 7 atoms in block 67 Block first atom: 1053 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1060 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1076 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1097 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1117 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1133 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 1149 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1160 Blocpdb> 10 atoms in block 75 Block first atom: 1177 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1187 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1206 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1225 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1241 Blocpdb> 11 atoms in block 80 Block first atom: 1260 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1271 Blocpdb> 10 atoms in block 82 Block first atom: 1290 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1300 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 1315 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1329 Blocpdb> 20 atoms in block 86 Block first atom: 1348 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 1368 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1387 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 1403 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1427 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1446 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1462 Blocpdb> 22 atoms in block 93 Block first atom: 1479 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1501 Blocpdb> 12 atoms in block 95 Block first atom: 1518 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1530 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1549 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 1566 Blocpdb> 14 atoms in block 99 Block first atom: 1590 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1604 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1620 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1634 Blocpdb> 24 atoms in block 103 Block first atom: 1646 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1670 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 1689 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1713 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 1730 Blocpdb> 16 atoms in block 108 Block first atom: 1749 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1765 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1784 Blocpdb> 24 atoms in block 111 Block first atom: 1796 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1820 Blocpdb> 10 atoms in block 113 Block first atom: 1839 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 1849 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 1873 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1892 Blocpdb> 10 atoms in block 117 Block first atom: 1911 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1921 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 1937 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 1961 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1968 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1987 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 2006 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 2023 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 2038 Blocpdb> 11 atoms in block 126 Block first atom: 2057 Blocpdb> 11 atoms in block 127 Block first atom: 2068 Blocpdb> 19 atoms in block 128 Block first atom: 2079 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2098 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2122 Blocpdb> 20 atoms in block 131 Block first atom: 2139 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 2159 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2178 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 2193 Blocpdb> 24 atoms in block 135 Block first atom: 2215 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2239 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2251 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2266 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 2283 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2307 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2322 Blocpdb> 10 atoms in block 142 Block first atom: 2338 Blocpdb> 24 atoms in block 143 Block first atom: 2348 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2372 Blocpdb> 24 atoms in block 145 Block first atom: 2384 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2408 Blocpdb> 24 atoms in block 147 Block first atom: 2427 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2451 Blocpdb> 7 atoms in block 149 Block first atom: 2467 Blocpdb> 21 atoms in block 150 Block first atom: 2474 Blocpdb> 16 atoms in block 151 Block first atom: 2495 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 2511 Blocpdb> 12 atoms in block 153 Block first atom: 2530 Blocpdb> 24 atoms in block 154 Block first atom: 2542 Blocpdb> 19 atoms in block 155 Block first atom: 2566 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 2585 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 2604 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 2624 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 2648 Blocpdb> 21 atoms in block 160 Block first atom: 2667 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 2688 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2707 Blocpdb> 10 atoms in block 163 Block first atom: 2726 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2736 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2752 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 2771 Blocpdb> 21 atoms in block 167 Block first atom: 2781 Blocpdb> 11 atoms in block 168 Block first atom: 2802 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2813 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 2832 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 2846 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2865 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2881 Blocpdb> 19 atoms in block 174 Block first atom: 2895 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 2914 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 2938 Blocpdb> 19 atoms in block 177 Block first atom: 2949 Blocpdb> 24 atoms in block 178 Block first atom: 2968 Blocpdb> 17 atoms in block 179 Block first atom: 2992 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 3009 Blocpdb> 11 atoms in block 181 Block first atom: 3029 Blocpdb> 181 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1760092 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9120 Prepmat> Matrix trace = 3871080.0000 Prepmat> Last element read: 9120 9120 394.3723 Prepmat> 16472 lines saved. Prepmat> 14468 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3040 RTB> Total mass = 3040.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3040 RTB> Number of blocks = 181 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 407473.4230 RTB> 69382 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1086 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69382 Diagstd> Projected matrix trace = 407473.4230 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1086 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 407473.4230 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2094666 0.2569634 1.2666786 1.6849395 1.9892111 2.4686895 2.6372911 2.9905933 3.1906388 4.9113437 5.5520293 5.5956417 5.9852587 6.7321346 7.0502230 8.6894927 9.0484613 11.4505205 12.3488636 13.7025549 14.4734765 14.8622157 15.9646395 17.6865751 18.0970994 19.6291554 20.5545898 22.0931762 23.8165121 25.2052759 26.4350918 27.2955816 27.4870257 29.1312706 31.8188498 32.3730534 33.5911943 34.0253604 35.4999024 36.6796529 37.9389493 38.6096494 41.5534980 42.3645830 44.4045212 45.5008634 46.4341021 46.5994081 48.2081975 48.7410524 51.9919018 53.8589162 54.3713763 55.0863833 55.5186156 55.8882965 57.5333128 58.1519231 59.3165815 59.7357713 62.0225570 62.3063686 64.6061833 65.6648503 67.0709975 67.9676961 68.5087658 71.1786529 72.4500466 72.9816525 74.5141430 75.6862796 78.3393325 78.7359492 79.7769593 80.9017607 81.9742224 82.7664417 84.6721405 85.3949526 86.0430583 87.5462673 88.1400899 89.7941938 90.0551192 92.0443939 93.4575307 93.7696150 96.2189980 96.4920428 97.9130757 98.4239414 98.8558008 99.9838682 101.0050541 101.2752365 103.3040168 103.5620398 105.1839923 106.1903558 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034307 0.0034308 0.0034323 0.0034335 0.0034339 0.0034343 49.6995700 55.0466559 122.2161191 140.9572554 153.1566001 170.6194420 176.3495329 187.7906457 193.9697930 240.6553079 255.8710521 256.8740468 265.6664692 281.7550292 288.3345650 320.1050255 326.6499886 367.4581586 381.6003608 401.9722339 413.1252217 418.6364707 433.8852024 456.6854254 461.9551002 481.1118863 492.3225032 510.4160926 529.9493455 545.1813715 558.3232227 567.3374550 569.3235575 586.1044165 612.5443224 617.8557778 629.3728482 633.4271103 647.0068220 657.6697835 668.8641667 674.7504909 700.0016678 706.8003380 723.6171914 732.4957333 739.9694776 741.2854579 753.9728841 758.1283394 783.0024704 796.9371739 800.7195705 805.9672781 809.1230889 811.8124668 823.6732675 828.0895825 836.3409029 839.2909075 855.2047682 857.1592186 872.8353417 879.9576265 889.3294268 895.2545867 898.8109447 916.1575451 924.3035366 927.6884010 937.3777390 944.7216306 961.1368174 963.5667693 969.9157682 976.7294148 983.1820321 987.9214668 999.2301962 1003.4861463 1007.2869316 1016.0477000 1019.4877810 1029.0095564 1030.5035278 1041.8230250 1049.7899996 1051.5413296 1065.1866018 1066.6968942 1074.5227796 1077.3223171 1079.6832392 1085.8260280 1091.3569866 1092.8156687 1103.7072225 1105.0847308 1113.7048362 1119.0199218 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3040 Rtb_to_modes> Number of blocs = 181 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9809E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1086 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54720 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21032914212721515.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21032914212721515.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21032914212721515.atom Openam> file on opening on unit 11: 21032914212721515.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 181 First residue number = 1 Last residue number = 181 Number of atoms found = 3040 Mean number per residue = 16.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9809E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2095 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Bfactors> 106 vectors, 9120 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.209500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.371 for 181 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.066 +/- 0.11 Bfactors> = 197.836 +/- 17.01 Bfactors> Shiftng-fct= 197.771 Bfactors> Scaling-fct= 148.904 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21032914212721515.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21032914212721515.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1093. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119. Chkmod> 106 vectors, 9120 coordinates in file. Chkmod> That is: 3040 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7191 0.0034 0.6914 0.0034 0.9973 0.0034 0.6891 0.0034 0.9165 0.0034 0.9567 49.7014 0.3215 55.0482 0.3112 122.2264 0.4109 140.9537 0.4699 153.1419 0.2705 170.6228 0.2629 176.3322 0.1765 187.7954 0.2607 193.9724 0.4744 240.6366 0.2080 255.8594 0.4184 256.8712 0.5298 265.6493 0.0627 281.7401 0.2285 288.3176 0.3931 320.0822 0.4756 326.6276 0.5131 367.4340 0.2458 381.6015 0.2649 401.9175 0.1993 413.0579 0.5790 418.5873 0.4535 433.8035 0.4407 456.7100 0.4018 461.9723 0.5805 481.1016 0.3491 492.2464 0.5746 510.3575 0.3006 529.9654 0.3003 545.2091 0.4124 558.3511 0.3451 567.3590 0.5607 569.3299 0.5335 586.0665 0.3576 612.5291 0.3155 617.8001 0.3111 629.3346 0.2854 633.4431 0.2832 646.9799 0.3029 657.6447 0.3709 668.8447 0.5576 674.7246 0.4145 699.9422 0.4669 706.7318 0.4200 723.5493 0.4292 732.4573 0.3448 739.9050 0.3354 741.2583 0.4088 753.9546 0.4118 758.0876 0.4395 782.9545 0.5000 796.9110 0.3688 800.6751 0.2806 805.9591 0.2857 809.0984 0.4240 811.7900 0.4400 823.6142 0.4088 828.0403 0.3607 836.3291 0.2763 839.2846 0.3732 855.1504 0.4123 857.1474 0.3780 872.8237 0.2881 879.8874 0.3802 889.2846 0.3206 895.2313 0.3805 898.7805 0.3018 916.1269 0.3403 924.2636 0.2845 927.6381 0.4543 937.3114 0.4480 944.7043 0.3876 961.0997 0.3275 963.5502 0.6013 969.8926 0.4775 976.6769 0.0825 983.1145 0.5196 987.9003 0.2540 999.1747 0.5102 1003.4140 0.5893 1007.2258 0.3480 1016.0257 0.3731 1019.4435 0.4449 1028.9414 0.4962 1030.4872 0.5227 1041.7534 0.4198 1049.7588 0.2639 1051.4983 0.2902 1065.1464 0.4182 1066.6398 0.4794 1074.4598 0.4149 1077.2545 0.4667 1079.6598 0.2890 1085.7584 0.3676 1091.2828 0.3468 1092.9023 0.2646 1103.6384 0.3888 1105.2398 0.1100 1113.7418 0.4424 1119.0227 0.4100 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21032914212721515 7 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom making animated gifs 6 models are in 21032914212721515.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21032914212721515 8 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom making animated gifs 6 models are in 21032914212721515.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21032914212721515 9 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom making animated gifs 6 models are in 21032914212721515.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21032914212721515 10 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom making animated gifs 6 models are in 21032914212721515.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21032914212721515 11 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=10 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=30 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom calculating perturbed structure for DQ=50 21032914212721515.eigenfacs 21032914212721515.atom making animated gifs 6 models are in 21032914212721515.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 21032914212721515.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21032914212721515.10.pdb 21032914212721515.11.pdb 21032914212721515.7.pdb 21032914212721515.8.pdb 21032914212721515.9.pdb STDERR: real 0m18.506s user 0m18.224s sys 0m0.272s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.