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LOGs for ID: 210302033615115124

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210302033615115124.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210302033615115124.atom to be opened. Openam> File opened: 210302033615115124.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 40 First residue number = 1 Last residue number = 40 Number of atoms found = 598 Mean number per residue = 14.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.892100 +/- 4.900143 From: 12.657000 To: 36.017000 = 24.957084 +/- 6.450135 From: 10.227000 To: 38.447000 = 26.021766 +/- 7.002511 From: 10.207000 To: 38.467000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 17.8457 % Filled. Pdbmat> 287336 non-zero elements. Pdbmat> 31592 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 105.66 +/- 35.44 Maximum number = 186 Minimum number = 33 Pdbmat> Matrix trace = 631840. Pdbmat> Larger element = 697.730 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 40 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210302033615115124.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210302033615115124.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210302033615115124.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 598 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 40 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 40 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 84 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 101 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 113 Blocpdb> 7 atoms in block 9 Block first atom: 124 Blocpdb> 21 atoms in block 10 Block first atom: 131 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 152 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 167 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 183 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 200 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 217 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 234 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 256 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 275 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 291 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 311 Blocpdb> 10 atoms in block 21 Block first atom: 331 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 341 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 356 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 368 Blocpdb> 7 atoms in block 25 Block first atom: 384 Blocpdb> 11 atoms in block 26 Block first atom: 391 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 402 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 416 Blocpdb> 7 atoms in block 29 Block first atom: 438 Blocpdb> 10 atoms in block 30 Block first atom: 445 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 455 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 474 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 493 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 500 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 519 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 536 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 552 Blocpdb> 7 atoms in block 38 Block first atom: 559 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 566 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 581 Blocpdb> 40 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 287376 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 1794 Prepmat> Matrix trace = 631840.0000 Prepmat> Last element read: 1794 1794 261.0538 Prepmat> 821 lines saved. Prepmat> 474 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 598 RTB> Total mass = 598.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 598 RTB> Number of blocks = 40 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 73565.5034 RTB> 11856 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 240 Diagstd> Nb of non-zero elements: 11856 Diagstd> Projected matrix trace = 73565.5034 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 240 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 73565.5034 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 6.5322146 8.7838542 14.3546258 15.9043664 16.4838679 23.1317230 28.4651224 29.6026683 34.0158358 38.1436799 45.8298064 49.5721034 55.0749579 59.6046368 61.5628405 66.3219516 67.4252145 71.8620356 74.7144854 76.5835410 82.8992702 86.0515170 88.3598733 90.3307444 92.7066259 96.9701432 99.7930602 105.8007934 111.2837504 112.5273336 113.6500198 117.5291309 120.2655373 121.6387852 124.9700833 130.8062854 131.1179718 134.0588339 138.8066706 139.4942981 142.1302460 142.4764446 146.5970333 147.2955054 148.1537630 153.8038700 155.5740919 159.6983398 162.8087347 164.0879521 166.2895767 169.9465367 173.3154970 175.4451528 176.5819736 179.7867075 180.7254125 182.9530689 185.3038223 189.0091123 189.4928220 193.3421511 198.1272856 199.0375546 200.0676992 201.3049562 204.5313458 206.2690588 207.3834705 209.1469259 209.8149826 213.6123209 216.6594154 217.4860816 220.8994662 221.5498599 224.2037325 225.6628379 228.6777759 230.9137495 231.9934835 235.4920923 237.6045398 238.7386029 240.6348652 245.2116318 246.3708392 247.9691702 250.4612165 252.2232500 254.8963862 255.8111468 259.7238634 260.7326275 262.0545982 263.1486123 264.6764063 266.9357187 270.1049277 273.0493802 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034336 0.0034337 0.0034346 0.0034358 277.5399474 321.8383840 411.4255123 433.0653798 440.8845119 522.2750413 579.3644033 590.8275116 633.3384483 670.6664402 735.1387098 764.5641908 805.8836914 838.3691778 852.0294482 884.3494888 891.6747089 920.5450304 938.6370333 950.3049725 988.7138863 1007.3364427 1020.7580711 1032.0793174 1045.5641113 1069.3362727 1084.7894441 1116.9654573 1145.5423703 1151.9252403 1157.6573623 1177.2482202 1190.8741771 1197.6538568 1213.9430411 1241.9656565 1243.4444595 1257.3118217 1279.3826268 1282.5476468 1294.6087383 1296.1844733 1314.7944769 1317.9229710 1321.7570138 1346.7249678 1354.4529319 1372.2886802 1385.5880553 1391.0208116 1400.3216202 1415.6354824 1429.5981542 1438.3546021 1443.0070852 1456.0425610 1459.8387676 1468.8083395 1478.2145377 1492.9203964 1494.8295071 1509.9360474 1528.5069755 1532.0142113 1535.9736634 1540.7157211 1553.0134544 1559.5967578 1563.8041066 1570.4388233 1572.9449698 1587.1151221 1598.3948212 1601.4412638 1613.9594293 1616.3336710 1625.9856162 1631.2679480 1642.1289596 1650.1376633 1653.9911190 1666.4160677 1673.8735521 1677.8634139 1684.5137341 1700.4576252 1704.4722368 1709.9921812 1718.5632600 1724.5978448 1733.7126557 1736.8208041 1750.0530244 1753.4483224 1757.8878829 1761.5534378 1766.6596700 1774.1838662 1784.6848375 1794.3860233 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 598 Rtb_to_modes> Number of blocs = 40 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 173.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 193.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 199.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 200.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 201.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 204.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 206.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 207.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 209.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 209.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 213.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 216.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 217.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 220.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 221.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 224.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 225.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 228.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 230.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 232.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 235.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 237.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 238.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 240.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 245.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 246.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 248.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 250.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 252.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 254.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 255.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 259.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 260.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 262.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 263.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 264.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 266.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 270.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 273.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 240 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99996 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99996 0.99997 1.00006 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99998 0.99998 1.00004 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 1.00003 0.99996 0.99994 1.00004 1.00003 0.99995 1.00002 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99996 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00005 1.00001 0.99996 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 10764 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99996 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99996 0.99997 1.00006 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99998 0.99998 1.00004 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 1.00003 0.99996 0.99994 1.00004 1.00003 0.99995 1.00002 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99996 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00005 1.00001 0.99996 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210302033615115124.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210302033615115124.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210302033615115124.atom Openam> file on opening on unit 11: 210302033615115124.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 40 First residue number = 1 Last residue number = 40 Number of atoms found = 598 Mean number per residue = 14.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 213.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 225.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 228.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 232.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 235.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 237.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 246.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 248.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 252.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 254.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 255.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 259.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 260.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 262.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 263.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 264.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 266.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 270.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 273.0 Bfactors> 106 vectors, 1794 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 6.532000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.024 +/- 0.02 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.024 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210302033615115124.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210302033615115124.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1257. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1322. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1347. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1372. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1385. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1400. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1415. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1429. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1443. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1460. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1469. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1478. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1493. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1495. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1510. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1528. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1532. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1536. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1541. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1553. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1560. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1564. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1570. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1573. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1587. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1598. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1601. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1614. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1616. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1626. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1631. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1642. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1650. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1654. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1666. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1674. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1678. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1684. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1700. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1704. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1710. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1719. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1724. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1734. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1737. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1750. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1753. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1758. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1761. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1767. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1774. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1785. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1794. Chkmod> 106 vectors, 1794 coordinates in file. Chkmod> That is: 598 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 36 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 74 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8732 0.0034 0.7471 0.0034 0.7757 0.0034 0.9224 0.0034 0.6895 0.0034 0.6854 277.5235 0.3738 321.8272 0.4850 411.3416 0.5949 432.9873 0.4419 440.8139 0.4558 522.2332 0.2331 579.3892 0.3758 590.7755 0.3292 633.3500 0.3421 670.6053 0.5960 735.1087 0.3103 764.5152 0.5270 805.8128 0.6818 838.3006 0.5272 851.9732 0.5483 884.2985 0.3237 891.6681 0.5077 920.4925 0.3095 938.5686 0.1509 950.2422 0.4643 988.6758 0.2960 1007.2843 0.3471 1020.7150 0.4717 1032.0308 0.5334 1045.5383 0.1748 1069.2896 0.4820 1084.7262 0.4048 1116.9133 0.4420 1145.5768 0.5636 1151.7359 0.2310 1157.8622 0.3533 1177.0518 0.4735 1190.9937 0.1889 1197.4115 0.2728 1214.0362 0.4708 1241.8825 0.4512 1243.3059 0.2510 1257.4509 0.3823 1279.2970 0.4085 1282.5188 0.4476 1294.4154 0.5043 1296.2360 0.4971 1314.7513 0.1442 1317.8865 0.2201 1321.9065 0.3615 1346.6502 0.3129 1354.5076 0.2007 1372.2369 0.4847 1385.4914 0.4420 1391.0122 0.4985 1400.3054 0.4068 1415.3809 0.5159 1429.4729 0.5581 1438.1078 0.3600 1443.0188 0.3459 1456.0339 0.1302 1459.6735 0.2942 1468.9337 0.3703 1478.1358 0.1680 1492.8203 0.4618 1494.7936 0.4172 1509.7066 0.4857 1528.3361 0.5506 1531.8039 0.4621 1536.0317 0.4765 1540.6306 0.3906 1552.8278 0.3588 1559.6468 0.1292 1563.7993 0.3208 1570.1952 0.0765 1572.8213 0.4320 1587.0012 0.4691 1598.4759 0.5115 1601.4238 0.2780 1613.8921 0.5386 1616.0824 0.1289 1625.9023 0.2963 1631.3322 0.4146 1642.1383 0.5035 1650.0177 0.4284 1653.9433 0.4248 1666.3725 0.3309 1673.7857 0.4199 1677.6557 0.2751 1684.3194 0.5832 1700.3443 0.2954 1704.4999 0.4525 1710.0251 0.4379 1718.6225 0.3843 1724.4443 0.3816 1733.6505 0.3353 1736.7084 0.1921 1749.8975 0.3156 1753.2633 0.4435 1757.9647 0.2646 1761.3151 0.2842 1766.6626 0.2742 1773.9890 0.4547 1784.5919 0.4383 1794.1467 0.4788 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 210302033615115124.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210302033615115124.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 210302033615115124.atom Openam> file on opening on unit 11: 210302033615115124.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 210302033615115124.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 210302033615115124.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1257. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1700. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1704. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1710. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1719. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1724. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1734. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1737. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1750. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1753. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1758. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1761. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1767. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1774. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1785. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1794. Projmod> 106 vectors, 1794 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 40 First residue number = 1 Last residue number = 40 Number of atoms found = 598 Mean number per residue = 14.9 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 40 First residue number = 1 Last residue number = 40 Number of atoms found = 598 Mean number per residue = 14.9 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 598 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 16.67 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.250 Sum= 0.062 q= -101.8362 Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.082 Sum= 0.069 q= 33.3597 Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.035 Sum= 0.070 q= -14.3029 Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.016 Sum= 0.071 q= 6.3847 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.100 Sum= 0.081 q= 40.8746 Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.148 Sum= 0.103 q= -60.4736 Vector: 7 F= 277.52 Cos= 0.034 Sum= 0.104 q= 13.7089 Vector: 8 F= 321.83 Cos= -0.058 Sum= 0.107 q= -23.7035 Vector: 9 F= 411.34 Cos= -0.060 Sum= 0.111 q= -24.5731 Vector: 10 F= 432.99 Cos= -0.038 Sum= 0.112 q= -15.5497 Vector: 11 F= 440.81 Cos= -0.101 Sum= 0.122 q= -41.1929 Vector: 12 F= 522.23 Cos= -0.007 Sum= 0.122 q= -2.7694 Vector: 13 F= 579.39 Cos= -0.034 Sum= 0.124 q= -13.8733 Vector: 14 F= 590.78 Cos= -0.081 Sum= 0.130 q= -33.0749 Vector: 15 F= 633.35 Cos= -0.053 Sum= 0.133 q= -21.7756 Vector: 16 F= 670.61 Cos= -0.204 Sum= 0.175 q= -83.1185 Vector: 17 F= 735.11 Cos= 0.195 Sum= 0.213 q= 79.5018 Vector: 18 F= 764.52 Cos= -0.001 Sum= 0.213 q= -0.5703 Vector: 19 F= 805.81 Cos= 0.141 Sum= 0.233 q= 57.6823 Vector: 20 F= 838.30 Cos= -0.063 Sum= 0.237 q= -25.7096 Vector: 21 F= 851.97 Cos= -0.047 Sum= 0.239 q= -19.2732 Vector: 22 F= 884.30 Cos= -0.140 Sum= 0.258 q= -56.9884 Vector: 23 F= 891.67 Cos= -0.044 Sum= 0.260 q= -17.8745 Vector: 24 F= 920.49 Cos= -0.051 Sum= 0.263 q= -20.9369 Vector: 25 F= 938.57 Cos= 0.200 Sum= 0.303 q= 81.4127 Vector: 26 F= 950.24 Cos= 0.092 Sum= 0.311 q= 37.4320 Vector: 27 F= 988.68 Cos= -0.280 Sum= 0.390 q= -114.2098 Vector: 28 F= 1007.28 Cos= -0.150 Sum= 0.412 q= -61.2288 Vector: 29 F= 1020.71 Cos= 0.132 Sum= 0.430 q= 53.9606 Vector: 30 F= 1032.03 Cos= -0.207 Sum= 0.473 q= -84.2734 Vector: 31 F= 1045.54 Cos= -0.006 Sum= 0.473 q= -2.3437 Vector: 32 F= 1069.29 Cos= 0.106 Sum= 0.484 q= 43.1886 Vector: 33 F= 1084.73 Cos= 0.031 Sum= 0.485 q= 12.8221 Vector: 34 F= 1116.91 Cos= -0.002 Sum= 0.485 q= -0.9458 Vector: 35 F= 1145.58 Cos= 0.134 Sum= 0.503 q= 54.6775 %Projmod-Wn> Eigenvector 36 Norm= 1.0002 Vector: 36 F= 1151.74 Cos= 0.148 Sum= 0.525 q= 60.3472 Vector: 37 F= 1157.86 Cos= 0.007 Sum= 0.525 q= 2.7813 Vector: 38 F= 1177.05 Cos= -0.109 Sum= 0.537 q= -44.4977 Vector: 39 F= 1190.99 Cos= -0.093 Sum= 0.545 q= -37.9843 Vector: 40 F= 1197.41 Cos= -0.007 Sum= 0.545 q= -3.0434 Vector: 41 F= 1214.04 Cos= 0.033 Sum= 0.546 q= 13.3691 Vector: 42 F= 1241.88 Cos= -0.057 Sum= 0.550 q= -23.2605 Vector: 43 F= 1243.31 Cos= 0.032 Sum= 0.551 q= 12.8479 Vector: 44 F= 1257.45 Cos= -0.048 Sum= 0.553 q= -19.4281 Vector: 45 F= 1279.30 Cos= 0.038 Sum= 0.554 q= 15.4894 Vector: 46 F= 1282.52 Cos= -0.019 Sum= 0.555 q= -7.7848 Vector: 47 F= 1294.42 Cos= 0.024 Sum= 0.555 q= 9.8751 Vector: 48 F= 1296.24 Cos= 0.181 Sum= 0.588 q= 73.8342 Vector: 49 F= 1314.75 Cos= -0.020 Sum= 0.589 q= -8.1048 Vector: 50 F= 1317.89 Cos= -0.072 Sum= 0.594 q= -29.3565 Vector: 51 F= 1321.91 Cos= -0.091 Sum= 0.602 q= -36.9590 Vector: 52 F= 1346.65 Cos= 0.007 Sum= 0.602 q= 3.0180 Vector: 53 F= 1354.51 Cos= -0.006 Sum= 0.602 q= -2.4642 Vector: 54 F= 1372.24 Cos= -0.003 Sum= 0.602 q= -1.2748 Vector: 55 F= 1385.49 Cos= -0.103 Sum= 0.613 q= -42.0579 Vector: 56 F= 1391.01 Cos= 0.098 Sum= 0.622 q= 39.8186 Vector: 57 F= 1400.31 Cos= -0.049 Sum= 0.625 q= -20.1522 Vector: 58 F= 1415.38 Cos= -0.070 Sum= 0.630 q= -28.5267 Vector: 59 F= 1429.47 Cos= -0.179 Sum= 0.662 q= -73.0545 Vector: 60 F= 1438.11 Cos= 0.042 Sum= 0.664 q= 17.2912 Vector: 61 F= 1443.02 Cos= -0.045 Sum= 0.666 q= -18.4126 Vector: 62 F= 1456.03 Cos= 0.036 Sum= 0.667 q= 14.8217 Vector: 63 F= 1459.67 Cos= 0.003 Sum= 0.667 q= 1.0675 Vector: 64 F= 1468.93 Cos= -0.029 Sum= 0.668 q= -11.7087 Vector: 65 F= 1478.14 Cos= -0.017 Sum= 0.668 q= -6.9078 Vector: 66 F= 1492.82 Cos= -0.037 Sum= 0.669 q= -14.9957 Vector: 67 F= 1494.79 Cos= 0.075 Sum= 0.675 q= 30.4285 Vector: 68 F= 1509.71 Cos= -0.005 Sum= 0.675 q= -1.9478 Vector: 69 F= 1528.34 Cos= -0.012 Sum= 0.675 q= -4.7904 Vector: 70 F= 1531.80 Cos= -0.048 Sum= 0.677 q= -19.4517 Vector: 71 F= 1536.03 Cos= 0.064 Sum= 0.681 q= 25.9001 Vector: 72 F= 1540.63 Cos= 0.029 Sum= 0.682 q= 11.9455 Vector: 73 F= 1552.83 Cos= 0.109 Sum= 0.694 q= 44.6022 %Projmod-Wn> Eigenvector 74 Norm= 1.0001 Vector: 74 F= 1559.65 Cos= -0.082 Sum= 0.701 q= -33.5644 Vector: 75 F= 1563.80 Cos= 0.027 Sum= 0.702 q= 11.2114 Vector: 76 F= 1570.20 Cos= -0.038 Sum= 0.703 q= -15.4154 Vector: 77 F= 1572.82 Cos= 0.101 Sum= 0.713 q= 41.1684 Vector: 78 F= 1587.00 Cos= 0.094 Sum= 0.722 q= 38.3009 Vector: 79 F= 1598.48 Cos= -0.130 Sum= 0.739 q= -52.8481 Vector: 80 F= 1601.42 Cos= -0.019 Sum= 0.739 q= -7.7679 Vector: 81 F= 1613.89 Cos= -0.090 Sum= 0.748 q= -36.8727 Vector: 82 F= 1616.08 Cos= 0.056 Sum= 0.751 q= 22.9215 Vector: 83 F= 1625.90 Cos= 0.081 Sum= 0.757 q= 33.1906 Vector: 84 F= 1631.33 Cos= 0.050 Sum= 0.760 q= 20.2051 Vector: 85 F= 1642.14 Cos= 0.141 Sum= 0.780 q= 57.2920 Vector: 86 F= 1650.02 Cos= -0.048 Sum= 0.782 q= -19.5356 Vector: 87 F= 1653.94 Cos= -0.014 Sum= 0.782 q= -5.8843 Vector: 88 F= 1666.37 Cos= 0.012 Sum= 0.782 q= 4.9172 Vector: 89 F= 1673.79 Cos= -0.017 Sum= 0.782 q= -6.8697 Vector: 90 F= 1677.66 Cos= -0.031 Sum= 0.783 q= -12.4435 Vector: 91 F= 1684.32 Cos= 0.043 Sum= 0.785 q= 17.6015 Vector: 92 F= 1700.34 Cos= 0.027 Sum= 0.786 q= 11.0662 Vector: 93 F= 1704.50 Cos= 0.016 Sum= 0.786 q= 6.6327 Vector: 94 F= 1710.03 Cos= 0.034 Sum= 0.787 q= 13.7053 Vector: 95 F= 1718.62 Cos= -0.025 Sum= 0.788 q= -10.2369 Vector: 96 F= 1724.44 Cos= 0.014 Sum= 0.788 q= 5.6924 Vector: 97 F= 1733.65 Cos= 0.006 Sum= 0.788 q= 2.3369 Vector: 98 F= 1736.71 Cos= 0.025 Sum= 0.789 q= 10.3538 %Projmod-Wn> Eigenvector 99 Norm= 1.0001 Vector: 99 F= 1749.90 Cos= 0.040 Sum= 0.790 q= 16.1291 Vector: 100 F= 1753.26 Cos= 0.066 Sum= 0.795 q= 27.0159 Vector: 101 F= 1757.96 Cos= -0.033 Sum= 0.796 q= -13.4066 Vector: 102 F= 1761.32 Cos= -0.025 Sum= 0.797 q= -10.1247 Vector: 103 F= 1766.66 Cos= 0.099 Sum= 0.806 q= 40.4493 Vector: 104 F= 1773.99 Cos= -0.015 Sum= 0.807 q= -6.1146 Vector: 105 F= 1784.59 Cos= 0.027 Sum= 0.807 q= 10.9190 Vector: 106 F= 1794.15 Cos= 0.046 Sum= 0.809 q= 18.9236 Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433 Projmod> 6 frequencies less than: 0.003436 Projmod> Lowest non-zero frequency : 277.523475 Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.28 for mode 27 with F= 988.68 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.078 0.184 0.303 0.391 0.454 0.809 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 210302033615115124 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210302033615115124.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 40 4.847 20 1.579 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 40 4.504 22 1.626 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 40 4.236 23 1.537 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 40 4.057 23 1.510 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 40 3.979 23 1.642 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 40 4.007 21 1.734 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 40 4.139 19 1.909 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 40 4.367 16 2.084 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 40 4.676 15 2.351 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 40 5.051 15 1.242 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 40 5.479 14 1.166 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210302033615115124 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210302033615115124.eigenfacs 210302033615115124.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 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