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LOGs for ID: 21020814424797903

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21020814424797903.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21020814424797903.atom to be opened. Openam> File opened: 21020814424797903.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 3227 First residue number = 3 Last residue number = 667 Number of atoms found = 25362 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 27.259235 +/- 24.688917 From: -31.564000 To: 85.593000 = 26.636066 +/- 28.067872 From: -35.806000 To: 91.248000 = 42.318841 +/- 27.908389 From: -21.872000 To: 106.062000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3886 % Filled. Pdbmat> 10373789 non-zero elements. Pdbmat> 1135918 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 89.58 +/- 21.91 Maximum number = 132 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 2.271836E+07 Pdbmat> Larger element = 521.372 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21020814424797903.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21020814424797903.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21020814424797903.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 25362 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 3227 residues. Blocpdb> 92 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 80 atoms in block 2 Block first atom: 93 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 173 Blocpdb> 61 atoms in block 4 Block first atom: 256 Blocpdb> 76 atoms in block 5 Block first atom: 317 Blocpdb> 85 atoms in block 6 Block first atom: 393 Blocpdb> 79 atoms in block 7 Block first atom: 478 Blocpdb> 76 atoms in block 8 Block first atom: 557 Blocpdb> 86 atoms in block 9 Block first atom: 633 Blocpdb> 94 atoms in block 10 Block first atom: 719 Blocpdb> 75 atoms in block 11 Block first atom: 813 Blocpdb> 79 atoms in block 12 Block first atom: 888 Blocpdb> 87 atoms in block 13 Block first atom: 967 Blocpdb> 84 atoms in block 14 Block first atom: 1054 Blocpdb> 60 atoms in block 15 Block first atom: 1138 Blocpdb> 75 atoms in block 16 Block first atom: 1198 Blocpdb> 87 atoms in block 17 Block first atom: 1273 Blocpdb> 64 atoms in block 18 Block first atom: 1360 Blocpdb> 56 atoms in block 19 Block first atom: 1424 Blocpdb> 68 atoms 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75 atoms in block 314 Block first atom: 24319 Blocpdb> 75 atoms in block 315 Block first atom: 24394 Blocpdb> 76 atoms in block 316 Block first atom: 24469 Blocpdb> 86 atoms in block 317 Block first atom: 24545 Blocpdb> 84 atoms in block 318 Block first atom: 24631 Blocpdb> 72 atoms in block 319 Block first atom: 24715 Blocpdb> 46 atoms in block 320 Block first atom: 24787 Blocpdb> 76 atoms in block 321 Block first atom: 24833 Blocpdb> 74 atoms in block 322 Block first atom: 24909 Blocpdb> 86 atoms in block 323 Block first atom: 24983 Blocpdb> 85 atoms in block 324 Block first atom: 25069 Blocpdb> 83 atoms in block 325 Block first atom: 25154 Blocpdb> 73 atoms in block 326 Block first atom: 25237 Blocpdb> 53 atoms in block 327 Block first atom: 25309 Blocpdb> 327 blocks. Blocpdb> At most, 100 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10374116 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 76086 Prepmat> Matrix trace = 22718360.0001 Prepmat> Last element read: 76086 76086 38.5591 Prepmat> 53629 lines saved. Prepmat> 50645 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 25362 RTB> Total mass = 25362.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 25362 RTB> Number of blocks = 327 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 370241.5234 RTB> 102483 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1962 Diagstd> Nb of non-zero elements: 102483 Diagstd> Projected matrix trace = 370241.5234 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1962 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 370241.5234 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1967662 0.2100871 0.3169474 0.3380433 0.4078213 0.4211414 0.5878757 0.6787822 0.6931434 0.7276312 0.8252464 0.8752918 1.1557981 1.1813724 1.2560962 1.5669665 1.5833062 2.0216838 2.9333850 2.9693583 3.1042618 3.1749804 3.1986081 3.9959914 4.6092819 4.7000754 5.1039136 5.2091803 5.2779099 5.3609117 7.2108632 7.5244212 7.9233593 8.4635485 8.7806864 8.9691672 9.7476460 9.7694656 10.3277351 10.7176064 11.2067820 11.7858724 12.1926869 12.9588694 13.3121649 13.5684822 13.6487401 13.7881541 13.9038264 14.5801499 14.8274693 15.2761166 15.5445317 15.5824986 15.8205875 16.1037830 16.2562451 16.6236716 16.9041840 17.3369311 17.4676776 17.8294626 18.1099932 18.1631301 18.3019394 18.6788531 18.7244334 18.8987332 19.5363459 19.7988072 19.9371254 20.3413080 20.6451967 20.7941579 21.0096088 21.1245140 21.3730884 21.6342029 21.7032557 21.8660329 21.9562862 22.2147036 22.4880921 22.6046521 22.9440222 23.1123290 23.4362892 23.6886567 24.1307867 24.5214372 24.5558998 24.7639745 24.8732847 25.4577964 25.6566683 25.8979757 26.1766899 26.4478130 26.6122595 27.1342840 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034322 0.0034324 0.0034341 0.0034347 0.0034349 48.1693195 49.7731291 61.1348567 63.1366391 69.3474090 70.4708062 83.2603119 89.4665140 90.4079948 92.6298479 98.6477292 101.5948563 116.7444575 118.0289892 121.7045277 135.9330728 136.6399634 154.4016366 185.9858112 187.1227463 191.3262017 193.4932437 194.2118818 217.0738711 233.1373808 235.4223509 245.3278982 247.8448932 249.4745599 251.4285590 291.6009315 297.8734726 305.6679854 315.9159282 321.7803450 325.2155777 339.0354844 339.4147289 348.9778193 355.5037458 363.5262207 372.8002089 379.1796229 390.9118506 396.2047017 400.0008509 401.1821132 403.2258307 404.9136787 414.6448498 418.1468186 424.4257866 428.1383215 428.6608580 431.9232508 435.7719126 437.8298831 442.7501894 446.4701067 452.1488092 453.8505479 458.5264642 462.1196374 462.7970980 464.5621650 469.3214276 469.8937001 472.0756801 479.9731558 483.1865020 484.8713802 489.7615853 493.4064166 495.1832532 497.7419706 499.1012340 502.0291339 505.0864637 505.8918973 507.7854802 508.8323585 511.8179843 514.9577352 516.2905711 520.1517425 522.0560538 525.7020911 528.5249548 533.4344021 537.7349203 538.1126565 540.3876991 541.5790430 547.9055311 550.0414398 552.6220243 555.5877277 558.4575454 560.1910361 565.6586895 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 25362 Rtb_to_modes> Number of blocs = 327 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9890E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8252 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.156 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1962 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 456516 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21020814424797903.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21020814424797903.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21020814424797903.atom Openam> file on opening on unit 11: 21020814424797903.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 3227 First residue number = 3 Last residue number = 667 Number of atoms found = 25362 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9890E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8252 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Bfactors> 106 vectors, 76086 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.196800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.796 for 3230 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.025 +/- 0.02 Bfactors> = 58.661 +/- 21.14 Bfactors> Shiftng-fct= 58.637 Bfactors> Scaling-fct= 1091.881 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21020814424797903.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21020814424797903.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5 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Chkmod> That is: 25362 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7172 0.0034 0.8571 0.0034 0.7521 0.0034 0.7742 0.0034 0.8935 0.0034 0.9968 48.1714 0.6396 49.7725 0.6492 61.1277 0.6553 63.1299 0.6069 69.3426 0.6131 70.4643 0.5897 83.2585 0.5257 89.4638 0.3543 90.4013 0.3895 92.6239 0.4853 98.6407 0.6205 101.5910 0.6439 116.7496 0.4950 118.0053 0.4605 121.6946 0.3985 135.9287 0.6865 136.6209 0.6704 154.4071 0.7847 185.9656 0.6884 187.1034 0.5024 191.3099 0.7384 193.4855 0.6522 194.2154 0.4552 217.0648 0.7193 233.1202 0.5925 235.4104 0.5590 245.3194 0.4117 247.8300 0.5256 249.4660 0.5374 251.4198 0.5695 291.5912 0.5700 297.8523 0.4163 305.6479 0.4926 315.9108 0.2443 321.7723 0.5164 325.1986 0.3507 339.0271 0.2938 339.3921 0.2999 349.0011 0.3012 355.5282 0.3847 363.5628 0.3686 372.8495 0.4004 379.1216 0.3737 390.9121 0.2563 396.1555 0.3938 400.0061 0.3239 401.1834 0.5210 403.2355 0.2494 404.8406 0.3659 414.6249 0.2691 418.1645 0.0847 424.4615 0.0792 428.0575 0.2634 428.6081 0.3060 431.8967 0.3095 435.7020 0.4255 437.8616 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21020814424797903.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21020814424797903.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21020814424797903 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom making animated gifs 11 models are in 21020814424797903.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21020814424797903.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21020814424797903.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21020814424797903 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21020814424797903.eigenfacs 21020814424797903.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21020814424797903.eigenfacs 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