Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* vp2-c4 *

CA distance fluctuations for 2408010529592259715

--- normal mode 7 ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase ref largest decrease
PHE 17 0.12 THR 1 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.16 ASN 2 -0.07 ALA 20

PHE 17 0.24 TYR 3 -0.03 ALA 20

PHE 17 0.24 GLU 4 -0.02 PRO 32

PHE 17 0.14 ASP 5 -0.08 ALA 20

PHE 17 0.17 VAL 6 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.28 ILE 7 -0.03 PRO 32

PHE 17 0.20 ASP 8 -0.04 ALA 20

PHE 17 0.12 LYS 9 -0.12 ALA 20

PHE 17 0.24 TYR 10 -0.04 ALA 20

PHE 17 0.35 LYS 11 -0.05 VAL 30

PHE 17 0.32 PRO 12 -0.05 LYS 9

THR 193 0.19 LYS 13 -0.09 ASP 241

THR 193 0.24 ASP 14 -0.08 ASP 241

THR 193 0.30 ALA 15 -0.04 GLU 120

THR 193 0.52 THR 16 -0.07 GLU 120

LYS 196 0.74 PHE 17 -0.05 SER 21

THR 193 0.65 ASP 18 -0.15 GLU 120

THR 193 0.46 HSP 19 -0.17 ASP 241

THR 193 0.38 ALA 20 -0.24 LYS 59

THR 193 0.34 SER 21 -0.14 GLN 121

THR 193 0.25 TYR 22 -0.06 GLN 121

THR 193 0.25 ASP 23 -0.06 GLU 120

THR 193 0.20 TRP 24 -0.07 GLN 121

THR 193 0.18 ARG 25 -0.06 GLU 120

THR 193 0.13 LEU 26 -0.04 GLU 120

THR 193 0.11 HSP 27 -0.04 ALA 20

MET 194 0.14 LYS 28 -0.04 LYS 13

PHE 17 0.21 GLY 29 -0.04 ASN 60

PHE 17 0.24 VAL 30 -0.07 ASN 60

PHE 17 0.21 THR 31 -0.06 ILE 57

PHE 17 0.21 PRO 32 -0.05 ILE 57

PHE 17 0.24 VAL 33 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.22 LYS 34 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.21 ASP 35 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.23 GLN 36 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.21 ALA 37 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.20 ASN 38 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.19 CYS 39 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.21 GLY 40 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.20 SER 41 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.23 CYM 42 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.21 TRP 43 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.19 ALA 44 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.22 PHE 45 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.25 SER 46 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.21 THR 47 -0.07 PHE 189

PHE 17 0.18 VAL 48 -0.07 ALA 20

PHE 17 0.23 GLY 49 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.24 VAL 50 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.17 VAL 51 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.16 GLU 52 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.22 SER 53 -0.05 ALA 20

PHE 17 0.17 GLN 54 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.11 TYR 55 -0.16 ALA 20

PHE 17 0.15 ALA 56 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.20 ILE 57 -0.06 ALA 20

PHE 17 0.12 ARG 58 -0.16 ALA 20

THR 193 0.07 LYS 59 -0.24 ALA 20

THR 193 0.08 ASN 60 -0.18 ALA 20

THR 193 0.06 GLN 61 -0.18 ALA 20

PHE 17 0.08 LEU 62 -0.12 ALA 20

PHE 17 0.08 VAL 63 -0.14 ALA 20

PHE 17 0.12 SER 64 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.12 ILE 65 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.12 SER 66 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.15 GLU 67 -0.07 ALA 20

PHE 17 0.13 GLN 68 -0.08 ALA 20

PHE 17 0.10 GLN 69 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.12 MET 70 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.14 VAL 71 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.11 ASP 72 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.09 CYS 73 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.11 SER 74 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.11 THR 75 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.13 GLN 76 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.15 ASN 77 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.15 THR 78 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.15 GLY 79 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.18 CYS 80 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.19 TYR 81 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.21 GLY 82 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.20 GLY 83 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.21 PHE 84 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.21 ILE 85 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.19 PRO 86 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.16 LEU 87 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.16 ALA 88 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.15 PHE 89 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.12 GLU 90 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.11 ASP 91 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.10 MET 92 -0.12 ALA 20

PHE 17 0.07 ILE 93 -0.15 ALA 20

PHE 17 0.06 GLU 94 -0.14 ALA 20

PHE 17 0.05 MET 95 -0.15 ALA 20

PHE 17 0.04 GLY 96 -0.18 ALA 20

PHE 17 0.06 GLY 97 -0.16 ALA 20

PHE 17 0.07 LEU 98 -0.15 ALA 20

PHE 17 0.05 CYS 99 -0.16 ALA 20

PHE 17 0.06 SER 100 -0.15 ALA 20

PHE 17 0.10 SER 101 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.07 GLU 102 -0.12 ALA 20

PHE 17 0.04 ASP 103 -0.15 ALA 20

PHE 17 0.06 TYR 104 -0.13 ALA 20

PHE 17 0.07 PRO 105 -0.11 ALA 20

PHE 17 0.09 TYR 106 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.11 VAL 107 -0.07 PHE 189

PHE 17 0.11 ALA 108 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.12 ASP 109 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.11 ILE 110 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.11 PRO 111 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.09 GLU 112 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.08 MET 113 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.07 CYS 114 -0.12 ALA 20

PHE 17 0.04 LYS 115 -0.14 ALA 20

LYS 196 0.02 PHE 116 -0.16 ALA 20

LYS 196 0.02 ASP 117 -0.18 ALA 20

ASP 185 0.02 ILE 118 -0.17 ALA 20

ASP 185 0.03 CYS 119 -0.19 ALA 20

MET 194 0.03 GLU 120 -0.23 ALA 20

MET 194 0.04 GLN 121 -0.23 ALA 20

MET 194 0.03 LYS 122 -0.21 ALA 20

PHE 17 0.04 TYR 123 -0.19 ALA 20

PHE 17 0.05 LYS 124 -0.19 ALA 20

PHE 17 0.08 ILE 125 -0.17 ALA 20

PHE 17 0.05 ASN 126 -0.19 ALA 20

PHE 17 0.10 ASN 127 -0.14 ALA 20

PHE 17 0.16 PHE 128 -0.10 ALA 20

PHE 17 0.21 LEU 129 -0.06 ALA 20

PHE 17 0.25 GLU 130 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.32 ILE 131 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.34 PRO 132 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.39 GLU 133 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.44 ASP 134 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.45 LYS 135 -0.03 PHE 189

PHE 17 0.46 PHE 136 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.55 LYS 137 -0.03 VAL 33

PHE 17 0.56 GLU 138 -0.03 PRO 32

PHE 17 0.45 ALA 139 -0.03 VAL 33

PHE 17 0.48 ILE 140 -0.03 VAL 33

PHE 17 0.57 ARG 141 -0.04 PRO 32

PHE 17 0.45 PHE 142 -0.04 PRO 32

PHE 17 0.35 LEU 143 -0.04 VAL 33

PHE 17 0.38 GLY 144 -0.04 VAL 33

PHE 17 0.35 PRO 145 -0.04 PHE 189

PHE 17 0.33 LEU 146 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.29 SER 147 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.31 VAL 148 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.30 SER 149 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.32 ILE 150 -0.15 PHE 189

PHE 17 0.31 ALA 151 -0.17 PHE 189

PHE 17 0.29 VAL 152 -0.18 PHE 189

PHE 17 0.31 SER 153 -0.20 PHE 189

PHE 17 0.29 ASP 154 -0.20 PHE 189

PHE 17 0.32 ASP 155 -0.22 PHE 189

PHE 17 0.32 PHE 156 -0.19 PHE 189

PHE 17 0.29 ALA 157 -0.17 PHE 189

PHE 17 0.29 PHE 158 -0.18 PHE 189

PHE 17 0.33 TYR 159 -0.19 PHE 189

PHE 17 0.33 ARG 160 -0.17 PHE 189

PHE 17 0.37 GLY 161 -0.18 PHE 189

PHE 17 0.41 GLY 162 -0.20 PHE 189

PHE 17 0.44 ILE 163 -0.23 PHE 189

PHE 17 0.41 PHE 164 -0.24 PHE 189

PHE 17 0.40 ASP 165 -0.31 PHE 189

PHE 17 0.36 GLY 166 -0.27 PHE 189

PHE 17 0.34 GLU 167 -0.26 PHE 189

PHE 17 0.33 CYS 168 -0.22 PHE 189

PHE 17 0.31 GLY 169 -0.20 PHE 189

PHE 17 0.31 GLU 170 -0.19 ASP 190

PHE 17 0.28 ALA 171 -0.16 PHE 189

PHE 17 0.28 PRO 172 -0.15 PHE 189

PHE 17 0.26 ASN 173 -0.15 PHE 189

PHE 17 0.27 HSP 174 -0.14 PHE 189

PHE 17 0.27 ALA 175 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.31 VAL 176 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.32 ILE 177 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.39 LEU 178 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.42 VAL 179 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.51 GLY 180 -0.04 PHE 189

PHE 17 0.59 PHE 181 -0.03 PHE 189

PHE 17 0.63 GLY 182 -0.03 PHE 189

PHE 17 0.67 ALA 183 -0.03 PHE 189

PHE 17 0.67 GLU 184 -0.02 ASP 165

PHE 17 0.71 ASP 185 -0.07 ASP 165

PHE 17 0.64 ALA 186 -0.14 ILE 163

PHE 17 0.64 TYR 187 -0.21 ASP 165

PHE 17 0.63 ASP 188 -0.24 ASP 165

PHE 17 0.57 PHE 189 -0.31 ASP 165

PHE 17 0.59 ASP 190 -0.27 ASP 165

PHE 17 0.65 THR 191 -0.20 ASP 165

PHE 17 0.66 LYS 192 -0.21 ASP 165

PHE 17 0.72 THR 193 -0.16 ASP 165

PHE 17 0.74 MET 194 -0.14 ASP 165

PHE 17 0.73 LYS 195 -0.11 ASP 165

PHE 17 0.74 LYS 196 -0.07 ARG 197

PHE 17 0.63 ARG 197 -0.07 LYS 196

PHE 17 0.61 TYR 198 -0.06 PHE 189

PHE 17 0.56 TYR 199 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.50 TYR 200 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.47 ILE 201 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.40 VAL 202 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.35 LYS 203 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.31 ASN 204 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.27 SER 205 -0.10 PHE 189

PHE 17 0.25 TRP 206 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.25 GLY 207 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.25 VAL 208 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.27 SER 209 -0.13 PHE 189

PHE 17 0.30 TRP 210 -0.14 PHE 189

PHE 17 0.34 GLY 211 -0.14 PHE 189

PHE 17 0.36 GLU 212 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.33 LYS 213 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.32 GLY 214 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.37 PHE 215 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.40 ILE 216 -0.14 PHE 189

PHE 17 0.46 ARG 217 -0.15 PHE 189

PHE 17 0.46 LEU 218 -0.17 PHE 189

PHE 17 0.50 GLU 219 -0.17 PHE 189

PHE 17 0.52 THR 220 -0.13 PHE 189

PHE 17 0.54 ASP 221 -0.11 ASP 190

PHE 17 0.56 ILE 222 -0.04 PHE 189

PHE 17 0.51 ASN 223 -0.04 ASP 190

PHE 17 0.45 GLY 224 -0.08 ASP 190

PHE 17 0.45 TYR 225 -0.14 ASP 190

PHE 17 0.41 ARG 226 -0.20 ASP 190

PHE 17 0.42 LYS 227 -0.20 ASP 190

PHE 17 0.41 PRO 228 -0.25 PHE 189

PHE 17 0.38 CYS 229 -0.22 PHE 189

PHE 17 0.37 SER 230 -0.18 PHE 189

PHE 17 0.35 LEU 231 -0.14 PHE 189

PHE 17 0.31 GLY 232 -0.12 PHE 189

PHE 17 0.31 THR 233 -0.11 PHE 189

PHE 17 0.31 GLU 234 -0.09 PHE 189

PHE 17 0.32 ALA 235 -0.08 PHE 189

PHE 17 0.26 LEU 236 -0.07 PHE 189

PHE 17 0.25 VAL 237 -0.05 PHE 189

PHE 17 0.18 ALA 238 -0.09 ALA 20

PHE 17 0.14 LEU 239 -0.14 ALA 20

PHE 17 0.08 VAL 240 -0.19 ALA 20

THR 193 0.06 ASP 241 -0.24 ALA 20

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.

Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know.

*** vp2-c4 ***

CA distance fluctuations for 2408010529592259715

--- normal mode 7 ---

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.

* vp2-c4 *