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LOGs for ID: EXAMPLE5

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 14051617144916654.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 14051617144916654.atom to be opened. Openam> File opened: 14051617144916654.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1284 First residue number = 1 Last residue number = 428 Number of atoms found = 9918 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -3.934002 +/- 28.382313 From: -71.707000 To: 56.700000 = 57.119643 +/- 23.369838 From: 3.019000 To: 105.030000 = 46.549210 +/- 18.184960 From: 5.390000 To: 86.496000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 15 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is .8426 % Filled. Pdbmat> 3729818 non-zero elements. Pdbmat> 407875 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.25 +/- 17.67 Maximum number = 125 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 8.157500E+06 Pdbmat> Larger element = 515.087 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1284 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 14051617144916654.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 14051617144916654.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 14051617144916654.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9918 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1284 residues. Blocpdb> 61 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 56 atoms in block 2 Block first atom: 62 Blocpdb> 55 atoms in block 3 Block first atom: 118 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 173 Blocpdb> 59 atoms in block 5 Block first atom: 226 Blocpdb> 53 atoms in block 6 Block first atom: 285 Blocpdb> 48 atoms in block 7 Block first atom: 338 Blocpdb> 61 atoms in block 8 Block first atom: 386 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 447 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 494 Blocpdb> 57 atoms in block 11 Block first atom: 540 Blocpdb> 61 atoms in block 12 Block first atom: 597 Blocpdb> 52 atoms in block 13 Block first atom: 658 Blocpdb> 55 atoms in block 14 Block first atom: 710 Blocpdb> 57 atoms in block 15 Block first atom: 765 Blocpdb> 48 atoms in block 16 Block first atom: 822 Blocpdb> 59 atoms in block 17 Block first atom: 870 Blocpdb> 56 atoms in block 18 Block first atom: 929 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 985 Blocpdb> 64 atoms in block 20 Block first atom: 1039 Blocpdb> 57 atoms in block 21 Block first atom: 1103 Blocpdb> 50 atoms in block 22 Block first atom: 1160 Blocpdb> 59 atoms in block 23 Block first atom: 1210 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1269 Blocpdb> 55 atoms in block 25 Block first atom: 1321 Blocpdb> 54 atoms in block 26 Block first atom: 1376 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1430 Blocpdb> 54 atoms in block 28 Block first atom: 1489 Blocpdb> 59 atoms in block 29 Block first atom: 1543 Blocpdb> 55 atoms in block 30 Block first atom: 1602 Blocpdb> 53 atoms in block 31 Block first atom: 1657 Blocpdb> 58 atoms in block 32 Block first atom: 1710 Blocpdb> 56 atoms in block 33 Block first atom: 1768 Blocpdb> 61 atoms in block 34 Block first atom: 1824 Blocpdb> 53 atoms in block 35 Block first atom: 1885 Blocpdb> 50 atoms in block 36 Block first atom: 1938 Blocpdb> 46 atoms in block 37 Block first atom: 1988 Blocpdb> 50 atoms in block 38 Block first atom: 2034 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 2084 Blocpdb> 54 atoms in block 40 Block first atom: 2129 Blocpdb> 51 atoms in block 41 Block first atom: 2183 Blocpdb> 61 atoms in block 42 Block first atom: 2234 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 2295 Blocpdb> 59 atoms in block 44 Block first atom: 2341 Blocpdb> 51 atoms in block 45 Block first atom: 2400 Blocpdb> 55 atoms in block 46 Block first atom: 2451 Blocpdb> 54 atoms in block 47 Block first atom: 2506 Blocpdb> 54 atoms in block 48 Block first atom: 2560 Blocpdb> 47 atoms in block 49 Block first atom: 2614 Blocpdb> 55 atoms in block 50 Block first atom: 2661 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2716 Blocpdb> 51 atoms in block 52 Block first atom: 2763 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2814 Blocpdb> 49 atoms in block 54 Block first atom: 2866 Blocpdb> 60 atoms in block 55 Block first atom: 2915 Blocpdb> 57 atoms in block 56 Block first atom: 2975 Blocpdb> 61 atoms in block 57 Block first atom: 3032 Blocpdb> 47 atoms in block 58 Block first atom: 3093 Blocpdb> 58 atoms in block 59 Block first atom: 3140 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 3198 Blocpdb> 51 atoms in block 61 Block first atom: 3246 Blocpdb> 10 atoms in block 62 Block first atom: 3297 Blocpdb> 61 atoms in block 63 Block first atom: 3307 Blocpdb> 56 atoms in block 64 Block first atom: 3368 Blocpdb> 55 atoms in block 65 Block first atom: 3424 Blocpdb> 53 atoms in block 66 Block first atom: 3479 Blocpdb> 59 atoms in block 67 Block first atom: 3532 Blocpdb> 53 atoms in block 68 Block first atom: 3591 Blocpdb> 48 atoms in block 69 Block first atom: 3644 Blocpdb> 61 atoms in block 70 Block first atom: 3692 Blocpdb> 47 atoms in block 71 Block first atom: 3753 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 3800 Blocpdb> 57 atoms in block 73 Block first atom: 3846 Blocpdb> 61 atoms in block 74 Block first atom: 3903 Blocpdb> 52 atoms in block 75 Block first atom: 3964 Blocpdb> 55 atoms in block 76 Block first atom: 4016 Blocpdb> 57 atoms in block 77 Block first atom: 4071 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 4128 Blocpdb> 59 atoms in block 79 Block first atom: 4176 Blocpdb> 56 atoms in block 80 Block first atom: 4235 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 4291 Blocpdb> 64 atoms in block 82 Block first atom: 4345 Blocpdb> 57 atoms in block 83 Block first atom: 4409 Blocpdb> 50 atoms in block 84 Block first atom: 4466 Blocpdb> 59 atoms in block 85 Block first atom: 4516 Blocpdb> 52 atoms in block 86 Block first atom: 4575 Blocpdb> 55 atoms in block 87 Block first atom: 4627 Blocpdb> 54 atoms in block 88 Block first atom: 4682 Blocpdb> 59 atoms in block 89 Block first atom: 4736 Blocpdb> 54 atoms in block 90 Block first atom: 4795 Blocpdb> 59 atoms in block 91 Block first atom: 4849 Blocpdb> 55 atoms in block 92 Block first atom: 4908 Blocpdb> 53 atoms in block 93 Block first atom: 4963 Blocpdb> 58 atoms in block 94 Block first atom: 5016 Blocpdb> 56 atoms in block 95 Block first atom: 5074 Blocpdb> 61 atoms in block 96 Block first atom: 5130 Blocpdb> 53 atoms in block 97 Block first atom: 5191 Blocpdb> 50 atoms in block 98 Block first atom: 5244 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 5294 Blocpdb> 50 atoms in block 100 Block first atom: 5340 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 5390 Blocpdb> 54 atoms in block 102 Block first atom: 5435 Blocpdb> 51 atoms in block 103 Block first atom: 5489 Blocpdb> 61 atoms in block 104 Block first atom: 5540 Blocpdb> 46 atoms in block 105 Block first atom: 5601 Blocpdb> 59 atoms in block 106 Block first atom: 5647 Blocpdb> 51 atoms in block 107 Block first atom: 5706 Blocpdb> 55 atoms in block 108 Block first atom: 5757 Blocpdb> 54 atoms in block 109 Block first atom: 5812 Blocpdb> 54 atoms in block 110 Block first atom: 5866 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 5920 Blocpdb> 55 atoms in block 112 Block first atom: 5967 Blocpdb> 47 atoms in block 113 Block first atom: 6022 Blocpdb> 51 atoms in block 114 Block first atom: 6069 Blocpdb> 52 atoms in block 115 Block first atom: 6120 Blocpdb> 49 atoms in block 116 Block first atom: 6172 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 6221 Blocpdb> 57 atoms in block 118 Block first atom: 6281 Blocpdb> 61 atoms in block 119 Block first atom: 6338 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 6399 Blocpdb> 58 atoms in block 121 Block first atom: 6446 Blocpdb> 48 atoms in block 122 Block first atom: 6504 Blocpdb> 51 atoms in block 123 Block first atom: 6552 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 6603 Blocpdb> 61 atoms in block 125 Block first atom: 6613 Blocpdb> 56 atoms in block 126 Block first atom: 6674 Blocpdb> 55 atoms in block 127 Block first atom: 6730 Blocpdb> 53 atoms in block 128 Block first atom: 6785 Blocpdb> 59 atoms in block 129 Block first atom: 6838 Blocpdb> 53 atoms in block 130 Block first atom: 6897 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6950 Blocpdb> 61 atoms in block 132 Block first atom: 6998 Blocpdb> 47 atoms in block 133 Block first atom: 7059 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 7106 Blocpdb> 57 atoms in block 135 Block first atom: 7152 Blocpdb> 61 atoms in block 136 Block first atom: 7209 Blocpdb> 52 atoms in block 137 Block first atom: 7270 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 7322 Blocpdb> 57 atoms in block 139 Block first atom: 7377 Blocpdb> 48 atoms in block 140 Block first atom: 7434 Blocpdb> 59 atoms in block 141 Block first atom: 7482 Blocpdb> 56 atoms in block 142 Block first atom: 7541 Blocpdb> 54 atoms in block 143 Block first atom: 7597 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 7651 Blocpdb> 57 atoms in block 145 Block first atom: 7715 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 7772 Blocpdb> 59 atoms in block 147 Block first atom: 7822 Blocpdb> 52 atoms in block 148 Block first atom: 7881 Blocpdb> 55 atoms in block 149 Block first atom: 7933 Blocpdb> 54 atoms in block 150 Block first atom: 7988 Blocpdb> 59 atoms in block 151 Block first atom: 8042 Blocpdb> 54 atoms in block 152 Block first atom: 8101 Blocpdb> 59 atoms in block 153 Block first atom: 8155 Blocpdb> 55 atoms in block 154 Block first atom: 8214 Blocpdb> 53 atoms in block 155 Block first atom: 8269 Blocpdb> 58 atoms in block 156 Block first atom: 8322 Blocpdb> 56 atoms in block 157 Block first atom: 8380 Blocpdb> 61 atoms in block 158 Block first atom: 8436 Blocpdb> 53 atoms in block 159 Block first atom: 8497 Blocpdb> 50 atoms in block 160 Block first atom: 8550 Blocpdb> 46 atoms in block 161 Block first atom: 8600 Blocpdb> 50 atoms in block 162 Block first atom: 8646 Blocpdb> 45 atoms in block 163 Block first atom: 8696 Blocpdb> 54 atoms in block 164 Block first atom: 8741 Blocpdb> 51 atoms in block 165 Block first atom: 8795 Blocpdb> 61 atoms in block 166 Block first atom: 8846 Blocpdb> 46 atoms in block 167 Block first atom: 8907 Blocpdb> 59 atoms in block 168 Block first atom: 8953 Blocpdb> 51 atoms in block 169 Block first atom: 9012 Blocpdb> 55 atoms in block 170 Block first atom: 9063 Blocpdb> 54 atoms in block 171 Block first atom: 9118 Blocpdb> 54 atoms in block 172 Block first atom: 9172 Blocpdb> 47 atoms in block 173 Block first atom: 9226 Blocpdb> 55 atoms in block 174 Block first atom: 9273 Blocpdb> 47 atoms in block 175 Block first atom: 9328 Blocpdb> 51 atoms in block 176 Block first atom: 9375 Blocpdb> 52 atoms in block 177 Block first atom: 9426 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 9478 Blocpdb> 60 atoms in block 179 Block first atom: 9527 Blocpdb> 57 atoms in block 180 Block first atom: 9587 Blocpdb> 61 atoms in block 181 Block first atom: 9644 Blocpdb> 47 atoms in block 182 Block first atom: 9705 Blocpdb> 58 atoms in block 183 Block first atom: 9752 Blocpdb> 48 atoms in block 184 Block first atom: 9810 Blocpdb> 51 atoms in block 185 Block first atom: 9858 Blocpdb> 10 atoms in block 186 Block first atom: 9908 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3730004 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 29754 Prepmat> Matrix trace = 8157500.0000 Prepmat> Last element read: 29754 29754 129.6641 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 16172 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9918 RTB> Total mass = 9918.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9918 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 187040.5079 RTB> 41094 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 41094 Diagstd> Projected matrix trace = 187040.5079 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 187040.5079 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .8319557 .8406434 1.6099371 1.9942953 2.0014588 2.7051015 2.7332159 2.8123203 3.2356598 3.3206021 3.8967276 3.9374415 4.0247683 4.9752268 5.0074435 5.4361277 5.4799156 5.6364980 6.4119584 6.4295538 7.0072415 7.5204815 8.4278885 8.4989956 8.8332518 9.0028429 9.0304624 9.2053276 9.3667437 9.3796255 10.0839993 10.1488919 10.2513127 10.9706528 11.5138355 11.5901050 11.9312299 12.2735293 12.4841477 12.6463714 12.7013050 12.8601922 13.0962922 13.8684399 13.9839732 14.1294311 14.1772144 14.3836072 15.8355297 15.9587217 16.1199115 16.8503679 16.9188115 16.9751114 17.6807537 17.7181952 17.7314140 18.3036462 18.4755357 18.5160201 18.8656289 20.1619468 20.2699109 20.3436571 20.9178856 21.0477430 21.5533352 23.2267788 23.2412093 23.4854620 23.5249443 23.6525464 23.7779211 24.6467608 25.0428662 25.3111149 25.4074109 26.2429403 26.2915408 26.8541705 27.2071427 27.4740874 27.6148342 27.8697931 28.0022905 28.2344428 29.0544364 29.0833826 29.4224525 29.7664252 29.9357341 30.3394269 30.4800068 30.7240049 31.2207593 31.2674985 31.3092644 32.5843954 33.1617690 33.2660272 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): .0034333 .0034334 .0034334 .0034336 .0034339 .0034343 99.0479248 99.5637372 137.7843014 153.3521998 153.6273741 178.6023075 179.5280243 182.1074325 195.3334899 197.8808183 214.3607678 215.4777037 217.8540927 242.2153842 242.9983404 253.1862426 254.2039027 257.8101184 274.9733647 275.3503911 287.4543086 297.7954818 315.2496926 316.5767980 322.7420740 325.8255339 326.3249465 329.4692641 332.3453444 332.5737974 344.8352728 345.9430371 347.6842521 359.6760463 368.4726775 369.6910747 375.0920743 380.4346038 383.6849184 386.1697453 387.0075634 389.4206787 392.9791047 404.3980796 406.0790388 408.1855424 408.8751661 411.8406277 432.1271743 433.8047780 435.9900788 445.7588498 446.6632348 447.4057868 456.6102614 457.0934746 457.2639520 464.5838262 466.7601813 467.2712947 471.6620387 487.5975469 488.9013093 489.7898642 496.6542685 498.1934873 504.1415846 523.3470405 523.5095894 526.2533027 526.6954690 528.1219661 529.5198210 539.1072907 543.4221001 546.3248028 547.3630611 556.2903503 556.8052215 562.7314025 566.4176100 569.1895503 570.6456359 573.2738772 574.6349790 577.0120608 585.3309763 585.6224788 589.0263391 592.4594360 594.1419765 598.1346566 599.5188053 601.9136515 606.7600947 607.2141016 607.6195135 619.8692803 625.3369991 626.3192349 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9918 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: .8320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: .8406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.610 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.705 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.733 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.030 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00000 .99999 .99998 1.00001 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99998 1.00001 .99997 .99999 .99997 1.00000 .99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 1.00001 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 .99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 .99999 .99999 1.00001 1.00000 .99999 .99998 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00002 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 .99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 .99998 1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00001 1.00000 .99999 .99999 .99999 1.00000 .99997 1.00000 1.00000 1.00000 .99999 1.00001 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 178524 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00000 .99999 .99998 1.00001 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99998 1.00001 .99997 .99999 .99997 1.00000 .99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 1.00001 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 .99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 .99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 .99999 .99999 1.00001 1.00000 .99999 .99998 1.00001 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00002 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00001 .99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 .99998 1.00000 .99999 1.00001 .99999 1.00001 1.00000 .99999 .99999 .99999 1.00000 .99997 1.00000 1.00000 1.00000 .99999 1.00001 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: .000 Vector 3: .000 .000 Vector 4: .000 .000 .000 Vector 5: .000 .000 .000 .000 Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000 Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051617144916654.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051617144916654.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 14051617144916654.atom Openam> file on opening on unit 11: 14051617144916654.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1284 First residue number = 1 Last residue number = 428 Number of atoms found = 9918 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: .8320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: .8406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.610 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.705 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.733 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.030 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27 Bfactors> 106 vectors, 29754 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : .832000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= .486 for 1284 C-alpha atoms. Bfactors> = .019 +/- .02 Bfactors> = 48.241 +/- 15.73 Bfactors> Shiftng-fct= 48.222 Bfactors> Scaling-fct= 982.094 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051617144916654.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051617144916654.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6 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vecteur en lecture: 528.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3 Chkmod> 106 vectors, 29754 coordinates in file. Chkmod> That is: 9918 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. .0034 .8084 .0034 .8735 .0034 .8667 .0034 .8044 .0034 .7839 .0034 .7443 99.0463 .6363 99.5569 .6361 137.7811 .5609 153.3343 .5989 153.6032 .5952 178.5913 .6407 179.5132 .6530 182.0892 .5665 195.3354 .3420 197.8842 .4337 214.3591 .4017 215.4564 .5488 217.8510 .4661 242.1995 .6052 242.9771 .6026 253.1724 .6432 254.1949 .6975 257.7877 .0893 274.9625 .7282 275.3481 .7435 287.4370 .6304 297.7732 .8289 315.2382 .4041 316.5633 .5192 322.7236 .5490 325.8144 .5700 326.3026 .5387 329.4493 .5111 332.3356 .4298 332.5662 .4237 344.7521 .6045 345.9471 .5191 347.6471 .4794 359.6499 .2358 368.3955 .4149 369.6735 .5779 375.0566 .2553 380.3636 .3972 383.6047 .4526 386.2086 .1102 386.9711 .5692 389.4011 .4427 393.0179 .0284 404.4035 .1001 406.0039 .5907 408.1762 .4662 408.8978 .4516 411.7713 .6786 432.1696 .5781 433.8035 .5978 435.9726 .6826 445.7348 .5575 446.6597 .5003 447.4510 .5236 456.5809 .6785 457.0971 .6577 457.2261 .6559 464.5176 .5546 466.7965 .5232 467.3014 .5314 471.6964 .6066 487.5531 .5973 488.8814 .5999 489.7248 .6155 496.6580 .6619 498.1988 .6595 504.0809 .6341 523.3609 .6744 523.4735 .6632 526.2815 .5671 526.6175 .5772 528.0709 .5664 529.5202 .5703 539.1196 .4802 543.3677 .5398 546.2893 .5203 547.3675 .5266 556.2353 .6394 556.7650 .6404 562.6635 .4231 566.4230 .3162 569.1228 .1455 570.5712 .2958 573.2514 .2691 574.5868 .2977 576.9419 .3352 585.2612 .2914 585.5633 .2616 588.9765 .2762 592.4696 .4829 594.1588 .2984 598.1146 .3903 599.4930 .4057 601.8486 .2108 606.7267 .5210 607.2123 .5024 607.6006 .5409 619.8009 .4177 625.2935 .5188 626.3297 .5288 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom making animated gifs 11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom making animated gifs 11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom making animated gifs 11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617144916654.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=80 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617144916654 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051617144916654.eigenfacs 14051617144916654.atom calculating perturbed 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5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 14051617144916654.10.pdb 14051617144916654.11.pdb 14051617144916654.7.pdb 14051617144916654.8.pdb 14051617144916654.9.pdb STDERR: 96.73user 1.81system 1:38.63elapsed 99%CPU (0avgtext+0avgdata 186160maxresident)k 0inputs+259168outputs (0major+11715minor)pagefaults 0swaps pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file 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