***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 14051617044813611.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 14051617044813611.atom to be opened.
Openam> File opened: 14051617044813611.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 403
First residue number = 7
Last residue number = 409
Number of atoms found = 3030
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 7.635969 +/- 15.196757 From: -27.177000 To: 38.712000
= 1.539181 +/- 11.839588 From: -25.984000 To: 27.540000
= 17.066341 +/- 11.217977 From: -8.409000 To: 45.092000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 6 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8788 % Filled.
Pdbmat> 1189471 non-zero elements.
Pdbmat> 130164 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.92 +/- 24.75
Maximum number = 134
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 2.603280E+06
Pdbmat> Larger element = 493.331
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
403 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 14051617044813611.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 14051617044813611.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
14051617044813611.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3030 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 403 residues.
Blocpdb> 18 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 21 atoms in block 2
Block first atom: 19
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 40
Blocpdb> 19 atoms in block 4
Block first atom: 62
Blocpdb> 25 atoms in block 5
Block first atom: 81
Blocpdb> 28 atoms in block 6
Block first atom: 106
Blocpdb> 15 atoms in block 7
Block first atom: 134
Blocpdb> 17 atoms in block 8
Block first atom: 149
Blocpdb> 25 atoms in block 9
Block first atom: 166
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 191
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 207
Blocpdb> 27 atoms in block 12
Block first atom: 224
Blocpdb> 18 atoms in block 13
Block first atom: 251
Blocpdb> 28 atoms in block 14
Block first atom: 269
Blocpdb> 23 atoms in block 15
Block first atom: 297
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 320
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 347
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 371
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 391
Blocpdb> 25 atoms in block 20
Block first atom: 411
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 436
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 453
Blocpdb> 20 atoms in block 23
Block first atom: 478
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 498
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 518
Blocpdb> 23 atoms in block 26
Block first atom: 536
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 559
Blocpdb> 18 atoms in block 28
Block first atom: 581
Blocpdb> 27 atoms in block 29
Block first atom: 599
Blocpdb> 26 atoms in block 30
Block first atom: 626
Blocpdb> 23 atoms in block 31
Block first atom: 652
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 675
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 690
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 706
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 728
Blocpdb> 27 atoms in block 36
Block first atom: 750
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 777
Blocpdb> 31 atoms in block 38
Block first atom: 801
Blocpdb> 28 atoms in block 39
Block first atom: 832
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 860
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 881
Blocpdb> 27 atoms in block 42
Block first atom: 900
Blocpdb> 26 atoms in block 43
Block first atom: 927
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 953
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 972
Blocpdb> 29 atoms in block 46
Block first atom: 990
Blocpdb> 24 atoms in block 47
Block first atom: 1019
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1043
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 1069
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 1093
Blocpdb> 30 atoms in block 51
Block first atom: 1110
Blocpdb> 28 atoms in block 52
Block first atom: 1140
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1168
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 1189
Blocpdb> 29 atoms in block 55
Block first atom: 1213
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1242
Blocpdb> 27 atoms in block 57
Block first atom: 1267
Blocpdb> 23 atoms in block 58
Block first atom: 1294
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1317
Blocpdb> 26 atoms in block 60
Block first atom: 1339
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 1365
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 1386
Blocpdb> 25 atoms in block 63
Block first atom: 1405
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1430
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1455
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1474
Blocpdb> 23 atoms in block 67
Block first atom: 1496
Blocpdb> 24 atoms in block 68
Block first atom: 1519
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1543
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1560
Blocpdb> 21 atoms in block 71
Block first atom: 1583
Blocpdb> 24 atoms in block 72
Block first atom: 1604
Blocpdb> 29 atoms in block 73
Block first atom: 1628
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1657
Blocpdb> 22 atoms in block 75
Block first atom: 1673
Blocpdb> 19 atoms in block 76
Block first atom: 1695
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 1714
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 1737
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 1758
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1781
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1798
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 1822
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1849
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1870
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 1889
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1917
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 1939
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 1960
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 1983
Blocpdb> 32 atoms in block 90
Block first atom: 2006
Blocpdb> 23 atoms in block 91
Block first atom: 2038
Blocpdb> 21 atoms in block 92
Block first atom: 2061
Blocpdb> 24 atoms in block 93
Block first atom: 2082
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2106
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2128
Blocpdb> 28 atoms in block 96
Block first atom: 2150
Blocpdb> 24 atoms in block 97
Block first atom: 2178
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2202
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 2222
Blocpdb> 28 atoms in block 100
Block first atom: 2238
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 2266
Blocpdb> 19 atoms in block 102
Block first atom: 2296
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2315
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2340
Blocpdb> 20 atoms in block 105
Block first atom: 2360
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 2380
Blocpdb> 23 atoms in block 107
Block first atom: 2404
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 2427
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 2446
Blocpdb> 28 atoms in block 110
Block first atom: 2462
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2490
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 2512
Blocpdb> 16 atoms in block 113
Block first atom: 2537
Blocpdb> 20 atoms in block 114
Block first atom: 2553
Blocpdb> 21 atoms in block 115
Block first atom: 2573
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 2594
Blocpdb> 25 atoms in block 117
Block first atom: 2618
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 2643
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 2663
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 2683
Blocpdb> 23 atoms in block 121
Block first atom: 2702
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 2725
Blocpdb> 19 atoms in block 123
Block first atom: 2749
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 2768
Blocpdb> 23 atoms in block 125
Block first atom: 2786
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 2809
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 2830
Blocpdb> 31 atoms in block 128
Block first atom: 2849
Blocpdb> 24 atoms in block 129
Block first atom: 2880
Blocpdb> 19 atoms in block 130
Block first atom: 2904
Blocpdb> 21 atoms in block 131
Block first atom: 2923
Blocpdb> 27 atoms in block 132
Block first atom: 2944
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 2971
Blocpdb> 25 atoms in block 134
Block first atom: 2997
Blocpdb> 9 atoms in block 135
Block first atom: 3021
Blocpdb> 135 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1189606 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9090
Prepmat> Matrix trace = 2603280.0000
Prepmat> Last element read: 9090 9090 125.8298
Prepmat> 9181 lines saved.
Prepmat> 7837 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3030
RTB> Total mass = 3030.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3030
RTB> Number of blocks = 135
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 184719.9900
RTB> 46323 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 810
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46323
Diagstd> Projected matrix trace = 184719.9900
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 810 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 184719.9900
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
.0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000
.0000000 1.4638912 1.5214313 2.2993278 5.4387700
6.1584587 7.2074046 8.5142889 9.7618232 10.7392426
12.4308032 12.8979193 14.4250167 14.8577823 15.1695118
15.7909010 16.4256509 17.3209224 18.3858663 18.8289166
19.0116658 20.5346369 22.6441523 22.9239062 23.1575351
23.6441505 24.3907501 24.6824232 25.4187944 26.6223162
26.8654514 27.0234409 28.6099611 30.0891074 30.6222165
30.9949433 32.0394677 32.7942585 33.3270910 34.0330404
34.7103669 35.8494283 36.8310965 37.8307157 38.3553883
39.2771624 40.2316608 42.1169735 42.6138242 42.9319945
43.4555452 44.0219657 45.1554387 45.8448206 46.9091875
47.1456180 47.4567979 47.8446254 48.8361356 49.1097471
49.7941494 50.6992253 50.9147313 51.7895691 52.3995923
52.9898587 53.9364271 54.5532384 55.0887596 55.3711018
56.4853596 56.8647172 57.2565730 58.1753618 58.6270972
59.1030111 59.6758028 59.9735334 60.8633014 61.1245484
61.6163739 61.8617968 62.5416346 63.6556888 64.3552471
64.7214859 65.5335212 66.1966567 66.5792727 67.8811134
68.1359824 69.2343334 69.7890081 70.8062858 71.3095720
71.6489834 72.2108855 72.5860349 72.8194674 73.8007165
74.3343356
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
.0034325 .0034328 .0034329 .0034334 .0034344
.0034345 131.3861797 133.9434425 164.6628861 253.2477678
269.4829525 291.5309934 316.8614974 339.2819452 355.8624035
382.8643033 389.9914705 412.4330339 418.5740261 422.9422601
431.5178205 440.1052759 451.9400075 465.6261136 471.2028910
473.4840631 492.0834900 516.7414671 519.9236723 522.5663559
528.0282246 536.3000762 539.4971783 547.4856678 560.2968730
562.8495865 564.5021546 580.8365194 595.6620505 600.9157562
604.5618015 614.6642106 621.8622414 626.8938135 633.4985935
639.7714892 650.1841788 659.0260846 667.9094051 672.5250607
680.5582959 688.7779901 704.7317821 708.8764281 711.5178714
715.8431640 720.4933816 729.7100256 735.2591184 743.7453026
745.6172494 748.0738886 751.1243816 758.8674514 760.9903145
766.2746164 773.2072935 774.8488780 781.4774114 786.0664019
790.4814104 797.5104220 802.0575816 805.9846620 808.0474480
816.1373042 818.8733216 821.6899129 828.2564502 831.4659639
834.8339148 838.8695211 840.9595340 847.1748089 848.9910500
852.3998185 854.0957197 858.7759906 866.3909182 871.1386075
873.6138689 879.0772324 883.5137404 886.0634117 894.6841815
896.3622152 903.5580053 907.1702371 913.7579891 916.9997034
919.1794297 922.7766901 925.1705859 926.6570396 932.8795426
936.2460798
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3030
Rtb_to_modes> Number of blocs = 135
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.299
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.439
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.158
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.207
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.514
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.33
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 810 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 .99999 1.00001 .99999 .99999
1.00000 .99996 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00000
1.00001 .99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 .99997 .99997
1.00002 .99997 1.00002 .99999 1.00001
1.00000 .99996 .99999 1.00000 .99999
.99998 1.00001 .99998 1.00000 .99999
.99998 1.00001 1.00001 1.00000 .99999
1.00001 .99998 .99998 .99999 1.00000
1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
.99999 .99999 .99999 .99999 .99999
1.00000 1.00001 .99999 .99999 .99998
.99999 1.00002 1.00001 .99999 .99999
1.00000 1.00002 .99999 1.00002 1.00002
.99999 1.00000 .99999 .99999 1.00001
1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000
.99998 .99999 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 .99997
.99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000
.99998 1.00000 .99999 1.00002 1.00003
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 54540 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 .99999 1.00001 .99999 .99999
1.00000 .99996 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00000
1.00001 .99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 .99997 .99997
1.00002 .99997 1.00002 .99999 1.00001
1.00000 .99996 .99999 1.00000 .99999
.99998 1.00001 .99998 1.00000 .99999
.99998 1.00001 1.00001 1.00000 .99999
1.00001 .99998 .99998 .99999 1.00000
1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
.99999 .99999 .99999 .99999 .99999
1.00000 1.00001 .99999 .99999 .99998
.99999 1.00002 1.00001 .99999 .99999
1.00000 1.00002 .99999 1.00002 1.00002
.99999 1.00000 .99999 .99999 1.00001
1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000
.99998 .99999 1.00002 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 .99997
.99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000
.99998 1.00000 .99999 1.00002 1.00003
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: .000
Vector 3: .000 .000
Vector 4: .000 .000 .000
Vector 5: .000 .000 .000 .000
Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000
Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051617044813611.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051617044813611.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 14051617044813611.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051617044813611.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 403
First residue number = 7
Last residue number = 409
Number of atoms found = 3030
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.439
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.514
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.33
Bfactors> 106 vectors, 9090 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.464000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= .520 for 403 C-alpha atoms.
Bfactors> = .026 +/- .03
Bfactors> = 20.533 +/- 9.91
Bfactors> Shiftng-fct= 20.507
Bfactors> Scaling-fct= 380.358
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051617044813611.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051617044813611.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.2
Chkmod> 106 vectors, 9090 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3030 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
.0034 .9884
.0034 .8647
.0034 .7386
.0034 .8045
.0034 .7541
.0034 .9560
131.3854 .5841
133.9187 .5680
164.6441 .6704
253.2423 .6532
269.4613 .5646
291.5103 .6055
316.8425 .6696
339.2705 .2739
355.8597 .2989
382.8355 .3010
390.0062 .4268
412.4866 .2551
418.5873 .6371
422.9309 .5042
431.4870 .4060
440.1446 .3497
451.9086 .3737
465.6585 .3213
471.1962 .1331
473.4430 .1241
492.0068 .2625
516.6719 .3701
519.8571 .4354
522.5717 .3048
527.9592 .3391
536.2688 .2792
539.4475 .1723
547.4751 .1792
560.2484 .2253
562.8731 .3030
564.4420 .1683
580.8120 .5033
595.6453 .3349
600.8682 .4219
604.4876 .4542
614.6429 .3698
621.7952 .5281
626.8943 .3714
633.4431 .4600
639.7406 .4594
650.1615 .3540
658.9880 .4368
667.8744 .3765
672.5366 .3481
680.5537 .3422
688.7342 .5142
704.7268 .5215
708.8142 .5778
711.4708 .3567
715.8491 .4145
720.4464 .4307
729.7156 .6276
735.1889 .3704
743.7198 .3831
745.6199 .4217
748.0670 .3265
751.0558 .4907
758.8649 .4211
760.9596 .2770
766.2098 .5101
773.1800 .2296
774.7796 .4245
781.4471 .3689
786.0357 .4259
790.4485 .4733
797.5026 .3372
801.9993 .3526
805.9591 .4054
808.0047 .4480
816.1358 .3945
818.8042 .4435
821.6792 .3291
828.2539 .2615
831.4509 .2411
834.7768 .4024
838.8630 .4132
840.8987 .4135
847.1155 .5022
848.9230 .4994
852.3883 .4375
854.0467 .5237
858.7279 .4553
866.3831 .4830
871.1334 .5022
873.5663 .3830
879.0159 .3814
883.4981 .4163
886.0302 .4706
894.6384 .4686
896.3502 .4711
903.4909 .4759
907.1377 .4712
913.7427 .4650
916.9631 .4388
919.1465 .5126
922.7314 .4989
925.1561 .5354
926.6206 .3677
932.8350 .4512
936.1786 .4490
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617044813611.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617044813611.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617044813611.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617044813611.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051617044813611.eigenfacs
14051617044813611.atom
making animated gifs
11 models are in 14051617044813611.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051617044813611.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
14051617044813611.10.pdb
14051617044813611.11.pdb
14051617044813611.7.pdb
14051617044813611.8.pdb
14051617044813611.9.pdb
STDERR:
18.05user 0.72system 0:18.77elapsed 100%CPU (0avgtext+0avgdata 40944maxresident)k
0inputs+76704outputs (0major+2626minor)pagefaults 0swaps
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|