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LOGs for ID: EXAMPLE4

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 14051617044813611.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 14051617044813611.atom to be opened. Openam> File opened: 14051617044813611.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 403 First residue number = 7 Last residue number = 409 Number of atoms found = 3030 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 7.635969 +/- 15.196757 From: -27.177000 To: 38.712000 = 1.539181 +/- 11.839588 From: -25.984000 To: 27.540000 = 17.066341 +/- 11.217977 From: -8.409000 To: 45.092000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'MSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 6 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8788 % Filled. Pdbmat> 1189471 non-zero elements. Pdbmat> 130164 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.92 +/- 24.75 Maximum number = 134 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.603280E+06 Pdbmat> Larger element = 493.331 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 403 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 14051617044813611.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 14051617044813611.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 14051617044813611.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3030 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 403 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 21 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 40 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 62 Blocpdb> 25 atoms in block 5 Block first atom: 81 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 106 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 134 Blocpdb> 17 atoms in block 8 Block first atom: 149 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 166 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 191 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 207 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 224 Blocpdb> 18 atoms in block 13 Block first atom: 251 Blocpdb> 28 atoms in block 14 Block first atom: 269 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 297 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 320 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 347 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 371 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 391 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 411 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 436 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 453 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 478 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 498 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 518 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 536 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 559 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 581 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 599 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 626 Blocpdb> 23 atoms in block 31 Block first atom: 652 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 675 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 690 Blocpdb> 22 atoms in block 34 Block first atom: 706 Blocpdb> 22 atoms in block 35 Block first atom: 728 Blocpdb> 27 atoms in block 36 Block first atom: 750 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 777 Blocpdb> 31 atoms in block 38 Block first atom: 801 Blocpdb> 28 atoms in block 39 Block first atom: 832 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 860 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 881 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 900 Blocpdb> 26 atoms in block 43 Block first atom: 927 Blocpdb> 19 atoms in block 44 Block first atom: 953 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 972 Blocpdb> 29 atoms in block 46 Block first atom: 990 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 1019 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1043 Blocpdb> 24 atoms in block 49 Block first atom: 1069 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 1093 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1110 Blocpdb> 28 atoms in block 52 Block first atom: 1140 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1168 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1189 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1213 Blocpdb> 25 atoms in block 56 Block first atom: 1242 Blocpdb> 27 atoms in block 57 Block first atom: 1267 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 1294 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1317 Blocpdb> 26 atoms in block 60 Block first atom: 1339 Blocpdb> 21 atoms in block 61 Block first atom: 1365 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 1386 Blocpdb> 25 atoms in block 63 Block first atom: 1405 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1430 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1455 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1474 Blocpdb> 23 atoms in block 67 Block first atom: 1496 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1519 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1543 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1560 Blocpdb> 21 atoms in block 71 Block first atom: 1583 Blocpdb> 24 atoms in block 72 Block first atom: 1604 Blocpdb> 29 atoms in block 73 Block first atom: 1628 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1657 Blocpdb> 22 atoms in block 75 Block first atom: 1673 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1695 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1714 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1737 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 1758 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 81 Block first atom: 1798 Blocpdb> 27 atoms in block 82 Block first atom: 1822 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1849 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1870 Blocpdb> 28 atoms in block 85 Block first atom: 1889 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1917 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 1939 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 1960 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 1983 Blocpdb> 32 atoms in block 90 Block first atom: 2006 Blocpdb> 23 atoms in block 91 Block first atom: 2038 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2061 Blocpdb> 24 atoms in block 93 Block first atom: 2082 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2106 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 2128 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 2150 Blocpdb> 24 atoms in block 97 Block first atom: 2178 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 2202 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 2222 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2238 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 2266 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 2296 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2315 Blocpdb> 20 atoms in block 104 Block first atom: 2340 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 2360 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 2380 Blocpdb> 23 atoms in block 107 Block first atom: 2404 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 2427 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 2446 Blocpdb> 28 atoms in block 110 Block first atom: 2462 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2490 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2512 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 2537 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 2553 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 2573 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2594 Blocpdb> 25 atoms in block 117 Block first atom: 2618 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 2643 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2663 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 2683 Blocpdb> 23 atoms in block 121 Block first atom: 2702 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2725 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2749 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 2768 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 2786 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2809 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 2830 Blocpdb> 31 atoms in block 128 Block first atom: 2849 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2880 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2904 Blocpdb> 21 atoms in block 131 Block first atom: 2923 Blocpdb> 27 atoms in block 132 Block first atom: 2944 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 2971 Blocpdb> 25 atoms in block 134 Block first atom: 2997 Blocpdb> 9 atoms in block 135 Block first atom: 3021 Blocpdb> 135 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1189606 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9090 Prepmat> Matrix trace = 2603280.0000 Prepmat> Last element read: 9090 9090 125.8298 Prepmat> 9181 lines saved. Prepmat> 7837 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3030 RTB> Total mass = 3030.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3030 RTB> Number of blocks = 135 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 184719.9900 RTB> 46323 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 810 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46323 Diagstd> Projected matrix trace = 184719.9900 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 810 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 184719.9900 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 1.4638912 1.5214313 2.2993278 5.4387700 6.1584587 7.2074046 8.5142889 9.7618232 10.7392426 12.4308032 12.8979193 14.4250167 14.8577823 15.1695118 15.7909010 16.4256509 17.3209224 18.3858663 18.8289166 19.0116658 20.5346369 22.6441523 22.9239062 23.1575351 23.6441505 24.3907501 24.6824232 25.4187944 26.6223162 26.8654514 27.0234409 28.6099611 30.0891074 30.6222165 30.9949433 32.0394677 32.7942585 33.3270910 34.0330404 34.7103669 35.8494283 36.8310965 37.8307157 38.3553883 39.2771624 40.2316608 42.1169735 42.6138242 42.9319945 43.4555452 44.0219657 45.1554387 45.8448206 46.9091875 47.1456180 47.4567979 47.8446254 48.8361356 49.1097471 49.7941494 50.6992253 50.9147313 51.7895691 52.3995923 52.9898587 53.9364271 54.5532384 55.0887596 55.3711018 56.4853596 56.8647172 57.2565730 58.1753618 58.6270972 59.1030111 59.6758028 59.9735334 60.8633014 61.1245484 61.6163739 61.8617968 62.5416346 63.6556888 64.3552471 64.7214859 65.5335212 66.1966567 66.5792727 67.8811134 68.1359824 69.2343334 69.7890081 70.8062858 71.3095720 71.6489834 72.2108855 72.5860349 72.8194674 73.8007165 74.3343356 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): .0034325 .0034328 .0034329 .0034334 .0034344 .0034345 131.3861797 133.9434425 164.6628861 253.2477678 269.4829525 291.5309934 316.8614974 339.2819452 355.8624035 382.8643033 389.9914705 412.4330339 418.5740261 422.9422601 431.5178205 440.1052759 451.9400075 465.6261136 471.2028910 473.4840631 492.0834900 516.7414671 519.9236723 522.5663559 528.0282246 536.3000762 539.4971783 547.4856678 560.2968730 562.8495865 564.5021546 580.8365194 595.6620505 600.9157562 604.5618015 614.6642106 621.8622414 626.8938135 633.4985935 639.7714892 650.1841788 659.0260846 667.9094051 672.5250607 680.5582959 688.7779901 704.7317821 708.8764281 711.5178714 715.8431640 720.4933816 729.7100256 735.2591184 743.7453026 745.6172494 748.0738886 751.1243816 758.8674514 760.9903145 766.2746164 773.2072935 774.8488780 781.4774114 786.0664019 790.4814104 797.5104220 802.0575816 805.9846620 808.0474480 816.1373042 818.8733216 821.6899129 828.2564502 831.4659639 834.8339148 838.8695211 840.9595340 847.1748089 848.9910500 852.3998185 854.0957197 858.7759906 866.3909182 871.1386075 873.6138689 879.0772324 883.5137404 886.0634117 894.6841815 896.3622152 903.5580053 907.1702371 913.7579891 916.9997034 919.1794297 922.7766901 925.1705859 926.6570396 932.8795426 936.2460798 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3030 Rtb_to_modes> Number of blocs = 135 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.521 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.514 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 .99999 1.00001 .99999 .99999 1.00000 .99996 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00000 1.00001 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 .99997 .99997 1.00002 .99997 1.00002 .99999 1.00001 1.00000 .99996 .99999 1.00000 .99999 .99998 1.00001 .99998 1.00000 .99999 .99998 1.00001 1.00001 1.00000 .99999 1.00001 .99998 .99998 .99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 .99999 .99999 .99999 .99999 .99999 1.00000 1.00001 .99999 .99999 .99998 .99999 1.00002 1.00001 .99999 .99999 1.00000 1.00002 .99999 1.00002 1.00002 .99999 1.00000 .99999 .99999 1.00001 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000 .99998 .99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 .99997 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000 .99998 1.00000 .99999 1.00002 1.00003 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: .000 Vector 3: .000 .000 Vector 4: .000 .000 .000 Vector 5: .000 .000 .000 .000 Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000 Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051617044813611.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051617044813611.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 14051617044813611.atom Openam> file on opening on unit 11: 14051617044813611.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 403 First residue number = 7 Last residue number = 409 Number of atoms found = 3030 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.521 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.299 Rdmodfacs> Numero du 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Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46 Rdmodfacs> Numero du 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Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.33 Bfactors> 106 vectors, 9090 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.464000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= .520 for 403 C-alpha atoms. Bfactors> = .026 +/- .03 Bfactors> = 20.533 +/- 9.91 Bfactors> Shiftng-fct= 20.507 Bfactors> Scaling-fct= 380.358 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051617044813611.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051617044813611.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.2 Chkmod> 106 vectors, 9090 coordinates in file. Chkmod> That is: 3030 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. .0034 .9884 .0034 .8647 .0034 .7386 .0034 .8045 .0034 .7541 .0034 .9560 131.3854 .5841 133.9187 .5680 164.6441 .6704 253.2423 .6532 269.4613 .5646 291.5103 .6055 316.8425 .6696 339.2705 .2739 355.8597 .2989 382.8355 .3010 390.0062 .4268 412.4866 .2551 418.5873 .6371 422.9309 .5042 431.4870 .4060 440.1446 .3497 451.9086 .3737 465.6585 .3213 471.1962 .1331 473.4430 .1241 492.0068 .2625 516.6719 .3701 519.8571 .4354 522.5717 .3048 527.9592 .3391 536.2688 .2792 539.4475 .1723 547.4751 .1792 560.2484 .2253 562.8731 .3030 564.4420 .1683 580.8120 .5033 595.6453 .3349 600.8682 .4219 604.4876 .4542 614.6429 .3698 621.7952 .5281 626.8943 .3714 633.4431 .4600 639.7406 .4594 650.1615 .3540 658.9880 .4368 667.8744 .3765 672.5366 .3481 680.5537 .3422 688.7342 .5142 704.7268 .5215 708.8142 .5778 711.4708 .3567 715.8491 .4145 720.4464 .4307 729.7156 .6276 735.1889 .3704 743.7198 .3831 745.6199 .4217 748.0670 .3265 751.0558 .4907 758.8649 .4211 760.9596 .2770 766.2098 .5101 773.1800 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plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617044813611.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051617044813611.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 14051617044813611 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051617044813611.eigenfacs 14051617044813611.atom calculating perturbed structure 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