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LOGs for ID: EXAMPLE2

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 14051916424419054.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 14051916424419054.atom to be opened. Openam> File opened: 14051916424419054.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 1 Last residue number = 370 Number of atoms found = 2860 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 10.139298 +/- 14.421229 From: -23.250000 To: 36.712000 = 11.216960 +/- 9.507194 From: -12.979000 To: 35.617000 = 40.122757 +/- 11.476958 From: 10.058000 To: 67.707000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9681 % Filled. Pdbmat> 1092615 non-zero elements. Pdbmat> 119515 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.58 +/- 20.84 Maximum number = 131 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 2.390300E+06 Pdbmat> Larger element = 483.566 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 370 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 14051916424419054.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 14051916424419054.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 14051916424419054.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2860 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 370 residues. Blocpdb> 10 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 11 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 21 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 34 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 49 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 71 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 87 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 99 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 112 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 132 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 144 Blocpdb> 11 atoms in block 12 Block first atom: 158 Blocpdb> 18 atoms in block 13 Block first atom: 169 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 187 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 207 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 224 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 235 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 252 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 266 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 282 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 299 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 316 Blocpdb> 18 atoms in block 23 Block first atom: 333 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 351 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 369 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 385 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 395 Blocpdb> 12 atoms in block 28 Block first atom: 406 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 418 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 433 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 449 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 474 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 489 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 508 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 523 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 539 Blocpdb> 10 atoms in block 37 Block first atom: 553 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 563 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 579 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 593 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 608 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 623 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 637 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 657 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 674 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 694 Blocpdb> 21 atoms in block 47 Block first atom: 712 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 733 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 746 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 764 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 784 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 797 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 813 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 830 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 845 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 857 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 871 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 885 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 901 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 921 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 938 Blocpdb> 15 atoms in block 62 Block first atom: 954 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 969 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 983 Blocpdb> 23 atoms in block 65 Block first atom: 999 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 1022 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1039 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1051 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1067 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1085 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1102 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1116 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 1129 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1140 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1156 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1175 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1192 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 1208 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1231 Blocpdb> 15 atoms in block 80 Block first atom: 1252 Blocpdb> 13 atoms in block 81 Block first atom: 1267 Blocpdb> 13 atoms in block 82 Block first atom: 1280 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 1293 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1301 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1318 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 1338 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1359 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1371 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1392 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1408 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 1425 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1436 Blocpdb> 13 atoms in block 93 Block first atom: 1451 Blocpdb> 9 atoms in block 94 Block first atom: 1464 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1473 Blocpdb> 12 atoms in block 96 Block first atom: 1487 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 1499 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 1517 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1532 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1548 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1565 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1582 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1600 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1613 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1628 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1648 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1662 Blocpdb> 10 atoms in block 108 Block first atom: 1676 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1686 Blocpdb> 13 atoms in block 110 Block first atom: 1705 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1718 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1734 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1747 Blocpdb> 12 atoms in block 114 Block first atom: 1762 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 1774 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1795 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1814 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1828 Blocpdb> 13 atoms in block 119 Block first atom: 1844 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1857 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1873 Blocpdb> 11 atoms in block 122 Block first atom: 1893 Blocpdb> 14 atoms in block 123 Block first atom: 1904 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1918 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1933 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 1951 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1964 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 1980 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 1995 Blocpdb> 11 atoms in block 130 Block first atom: 2013 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2024 Blocpdb> 11 atoms in block 132 Block first atom: 2039 Blocpdb> 12 atoms in block 133 Block first atom: 2050 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2062 Blocpdb> 10 atoms in block 135 Block first atom: 2075 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2085 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 2100 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2118 Blocpdb> 18 atoms in block 139 Block first atom: 2131 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 2149 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2168 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 2185 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2205 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 2220 Blocpdb> 12 atoms in block 145 Block first atom: 2237 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2249 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2263 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2278 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2295 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 2311 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2323 Blocpdb> 13 atoms in block 152 Block first atom: 2335 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2348 Blocpdb> 21 atoms in block 154 Block first atom: 2363 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 2384 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2402 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2415 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 2432 Blocpdb> 13 atoms in block 159 Block first atom: 2450 Blocpdb> 12 atoms in block 160 Block first atom: 2463 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 2475 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2492 Blocpdb> 18 atoms in block 163 Block first atom: 2505 Blocpdb> 13 atoms in block 164 Block first atom: 2523 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2536 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2552 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2567 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 2582 Blocpdb> 11 atoms in block 169 Block first atom: 2599 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 2610 Blocpdb> 17 atoms in block 171 Block first atom: 2635 Blocpdb> 18 atoms in block 172 Block first atom: 2652 Blocpdb> 12 atoms in block 173 Block first atom: 2670 Blocpdb> 15 atoms in block 174 Block first atom: 2682 Blocpdb> 13 atoms in block 175 Block first atom: 2697 Blocpdb> 11 atoms in block 176 Block first atom: 2710 Blocpdb> 15 atoms in block 177 Block first atom: 2721 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2736 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2752 Blocpdb> 14 atoms in block 180 Block first atom: 2767 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 2781 Blocpdb> 13 atoms in block 182 Block first atom: 2798 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 2811 Blocpdb> 19 atoms in block 184 Block first atom: 2827 Blocpdb> 15 atoms in block 185 Block first atom: 2845 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1092800 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8580 Prepmat> Matrix trace = 2390300.0000 Prepmat> Last element read: 8580 8580 15.7362 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15139 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2860 RTB> Total mass = 2860.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2860 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 263427.8209 RTB> 71601 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71601 Diagstd> Projected matrix trace = 263427.8209 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 263427.8209 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000 2.0365970 2.0980778 4.0452183 5.1151785 6.5782927 7.8731034 8.1106123 9.2869026 10.4157948 11.7794428 12.6227426 14.4984314 15.3132237 15.8481744 17.5306887 17.9636000 18.3171333 19.0892773 20.4244489 21.2784370 21.9977963 22.3228092 23.0033215 23.8803870 24.2005551 24.5511766 25.1338004 26.1097592 26.2641728 27.0566472 27.1654179 28.4531957 28.4907772 29.9090754 30.6795070 31.8693629 32.3322760 33.0416856 33.7031612 33.8668933 34.3692422 34.9510501 35.9816958 36.3000678 37.0070953 37.8581067 38.7006856 39.4038281 40.0321468 40.5478871 40.6572441 41.3730109 42.1744000 43.4889823 44.1446250 44.4163985 45.1902587 45.8782790 46.8848255 47.5436490 48.0275331 48.2040519 49.0260448 49.6769169 49.8625896 50.6490756 51.8713186 51.9220788 52.0164304 53.2492303 53.7835888 54.4527599 55.3511074 56.0520797 56.3055516 56.7039539 58.2770782 58.9105533 59.3591360 59.4609844 60.2033724 61.0184748 61.7241192 62.4258627 63.7222546 63.8411285 64.5470876 64.9777386 65.8770043 66.3861340 66.5523149 67.7736946 68.0565361 68.1527924 68.9355258 69.9750616 70.6413913 71.5032218 71.8928533 72.0998113 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): .0034319 .0034334 .0034336 .0034347 .0034352 .0034369 154.9700700 157.2917963 218.4068520 245.5984805 278.5171085 304.6970563 309.2588244 330.9258756 350.4624461 372.6985083 385.8088124 413.4812208 424.9409589 432.2996674 454.6683979 460.2480621 464.7549593 474.4495328 490.7614641 500.9162747 509.3131252 513.0618273 520.8234801 530.6595205 534.2049946 538.0609024 544.4078278 554.8769871 556.5153450 564.8488765 565.9831160 579.2430156 579.6254266 593.8773663 601.4776145 613.0303425 617.4665262 624.2037555 630.4208948 631.9503515 636.6199712 641.9857589 651.3825113 654.2579349 660.5987988 668.1511587 675.5455066 681.6547860 687.0679982 691.4796358 692.4114625 698.4797894 705.2120697 716.1185153 721.4964459 723.7139614 729.9913168 735.5273724 743.5521473 748.7581040 752.5587687 753.9404649 760.3415244 765.3720478 766.8010436 772.8247857 782.0939463 782.4765235 783.1871499 792.4136489 796.3796784 801.3186095 807.9015428 813.0011232 814.8372771 817.7149757 828.9802141 833.4735671 836.6408499 837.3582969 842.5694147 848.2540739 853.1447661 857.9807752 866.8437995 867.6519712 872.4360565 875.3416163 881.3779902 884.7772949 885.8840113 893.9760025 895.8394854 896.4727803 901.6060693 908.3786641 912.6933838 918.2439709 920.7423947 922.0667132 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2860 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.037 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.10 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): .99998 .99999 .99999 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 .99998 1.00001 1.00002 .99996 1.00001 1.00003 1.00003 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 .99998 1.00001 1.00000 1.00002 .99998 .99998 .99996 1.00000 1.00001 .99997 .99999 1.00003 1.00002 .99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 .99999 1.00002 1.00001 .99998 1.00002 .99999 1.00000 1.00000 .99998 1.00002 .99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 .99998 .99998 1.00000 .99999 .99999 1.00001 .99998 1.00002 .99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 .99999 .99999 .99999 .99999 .99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 1.00001 .99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000 .99998 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51480 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): .99998 .99999 .99999 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 .99998 1.00001 1.00002 .99996 1.00001 1.00003 1.00003 .99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 .99998 1.00001 1.00000 1.00002 .99998 .99998 .99996 1.00000 1.00001 .99997 .99999 1.00003 1.00002 .99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 .99999 1.00002 1.00001 .99998 1.00002 .99999 1.00000 1.00000 .99998 1.00002 .99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 .99998 .99998 1.00000 .99999 .99999 1.00001 .99998 1.00002 .99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 .99999 .99999 .99999 .99999 .99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 .99999 1.00001 .99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 .99999 1.00000 1.00000 .99998 .99999 .99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 .99999 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: .000 Vector 3: .000 .000 Vector 4: .000 .000 .000 Vector 5: .000 .000 .000 .000 Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000 Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051916424419054.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051916424419054.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 14051916424419054.atom Openam> file on opening on unit 11: 14051916424419054.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 1 Last residue number = 370 Number of atoms found = 2860 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.037 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.10 Bfactors> 106 vectors, 8580 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.037000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= .609 for 370 C-alpha atoms. Bfactors> = .022 +/- .02 Bfactors> = 28.788 +/- 10.94 Bfactors> Shiftng-fct= 28.766 Bfactors> Scaling-fct= 539.622 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 14051916424419054.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051916424419054.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.0 Chkmod> 106 vectors, 8580 coordinates in file. Chkmod> That is: 2860 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. .0034 .7424 .0034 .7156 .0034 .8148 .0034 .8108 .0034 .7778 .0034 .9465 154.9787 .7131 157.2821 .6660 218.3916 .6057 245.5837 .1951 278.4990 .2517 304.6820 .7070 309.2529 .6891 330.9134 .4948 350.5181 .3981 372.6913 .5484 385.7503 .4083 413.4858 .3188 424.8780 .3120 432.3060 .1495 454.6399 .3756 460.1822 .4747 464.7714 .4770 474.4381 .4948 490.6869 .3514 500.9132 .3024 509.3168 .3804 513.0075 .3497 520.7635 .4713 530.6324 .3786 534.1759 .4747 538.0249 .4435 544.3433 .3311 554.8557 .4442 556.4472 .3022 564.8596 .6417 566.0065 .5081 579.1856 .2509 579.5926 .3716 593.8611 .2914 601.4566 .2702 613.0102 .5322 617.4183 .4089 624.1610 .3975 630.3643 .4967 631.9522 .4676 636.5997 .6349 641.9486 .4804 651.3392 .4857 654.2292 .3450 660.5964 .3631 668.1392 .4447 675.5105 .5026 681.5924 .3961 687.0201 .5167 691.4680 .4090 692.4052 .2484 698.4244 .6140 705.1450 .4414 716.0962 .4878 721.4277 .4333 723.7122 .4322 729.9579 .4132 735.5096 .3088 743.4820 .5363 748.6972 .4382 752.5458 .5394 753.8764 .4389 760.3396 .4744 765.3629 .4961 766.7482 .5919 772.7987 .4250 782.0504 .5273 782.4273 .4377 783.1804 .3422 792.3854 .3566 796.3189 .4347 801.2639 .5090 807.8588 .4952 812.9511 .5052 814.8345 .2783 817.6514 .4287 828.9654 .4339 833.4339 .4035 836.6110 .2860 837.3154 .4340 842.5096 .3883 848.2283 .5104 853.0797 .4218 857.9724 .5664 866.7913 .2186 867.6071 .4524 872.4183 .5247 875.3193 .2667 881.3602 .4860 884.7651 .5115 885.8306 .4472 893.9133 .5793 895.8238 .5366 896.4159 .3854 901.5966 .5178 908.3717 .5208 912.6452 .5334 918.1839 .5231 920.6846 .4945 922.0283 .4662 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 14051916424419054.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 14051916424419054.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 14051916424419054.atom Openam> file on opening on unit 11: 14051916424419054.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 14051916424419054.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 14051916424419054.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.0 Projmod> 106 vectors, 8580 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 1 Last residue number = 370 Number of atoms found = 2860 Mean number per residue = 7.7 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 1 Last residue number = 370 Number of atoms found = 2860 Mean number per residue = 7.7 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 2860 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 3.96 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- .00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= -.0017 Vector: 2 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0000 Vector: 3 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0015 Vector: 4 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0009 Vector: 5 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= -.0002 Vector: 6 F= .00 Cos= .000 Sum= .000 q= .0005 Vector: 7 F= 154.98 Cos= .897 Sum= .804 q= 189.9586 Vector: 8 F= 157.28 Cos= .076 Sum= .810 q= 16.0909 Vector: 9 F= 218.39 Cos= .189 Sum= .846 q= 39.9778 Vector: 10 F= 245.58 Cos= .135 Sum= .864 q= 28.5394 Vector: 11 F= 278.50 Cos= -.013 Sum= .864 q= -2.8173 Vector: 12 F= 304.68 Cos= -.011 Sum= .864 q= -2.2813 Vector: 13 F= 309.25 Cos= -.143 Sum= .884 q= -30.2923 Vector: 14 F= 330.91 Cos= .004 Sum= .885 q= .9511 Vector: 15 F= 350.52 Cos= -.034 Sum= .886 q= -7.1980 Vector: 16 F= 372.69 Cos= -.033 Sum= .887 q= -6.9885 Vector: 17 F= 385.75 Cos= -.017 Sum= .887 q= -3.7060 Vector: 18 F= 413.49 Cos= .000 Sum= .887 q= -.0151 Vector: 19 F= 424.88 Cos= -.020 Sum= .887 q= -4.2783 Vector: 20 F= 432.31 Cos= .029 Sum= .888 q= 6.1544 Vector: 21 F= 454.64 Cos= .004 Sum= .888 q= .8667 Vector: 22 F= 460.18 Cos= -.036 Sum= .890 q= -7.5978 Vector: 23 F= 464.77 Cos= .049 Sum= .892 q= 10.4040 Vector: 24 F= 474.44 Cos= .005 Sum= .892 q= 1.0810 Vector: 25 F= 490.69 Cos= .016 Sum= .892 q= 3.4289 Vector: 26 F= 500.91 Cos= .032 Sum= .893 q= 6.8754 Vector: 27 F= 509.32 Cos= -.028 Sum= .894 q= -5.8932 Vector: 28 F= 513.01 Cos= -.054 Sum= .897 q= -11.4764 Vector: 29 F= 520.76 Cos= -.021 Sum= .898 q= -4.4276 Vector: 30 F= 530.63 Cos= -.035 Sum= .899 q= -7.4666 Vector: 31 F= 534.18 Cos= -.002 Sum= .899 q= -.4599 Vector: 32 F= 538.02 Cos= .021 Sum= .899 q= 4.3787 Vector: 33 F= 544.34 Cos= -.032 Sum= .900 q= -6.6947 Vector: 34 F= 554.86 Cos= .019 Sum= .901 q= 4.0043 Vector: 35 F= 556.45 Cos= -.017 Sum= .901 q= -3.6324 Vector: 36 F= 564.86 Cos= -.014 Sum= .901 q= -2.9639 Vector: 37 F= 566.01 Cos= .000 Sum= .901 q= -.0485 Vector: 38 F= 579.19 Cos= -.010 Sum= .901 q= -2.0834 Vector: 39 F= 579.59 Cos= .028 Sum= .902 q= 5.9895 Vector: 40 F= 593.86 Cos= .006 Sum= .902 q= 1.2573 Vector: 41 F= 601.46 Cos= -.025 Sum= .903 q= -5.2138 Vector: 42 F= 613.01 Cos= .005 Sum= .903 q= 1.0341 Vector: 43 F= 617.42 Cos= .006 Sum= .903 q= 1.3091 Vector: 44 F= 624.16 Cos= .023 Sum= .903 q= 4.9523 Vector: 45 F= 630.36 Cos= .033 Sum= .904 q= 7.0197 Vector: 46 F= 631.95 Cos= -.003 Sum= .904 q= -.5976 Vector: 47 F= 636.60 Cos= -.010 Sum= .904 q= -2.1909 Vector: 48 F= 641.95 Cos= -.006 Sum= .904 q= -1.3173 Vector: 49 F= 651.34 Cos= .018 Sum= .905 q= 3.8954 Vector: 50 F= 654.23 Cos= .015 Sum= .905 q= 3.1099 Vector: 51 F= 660.60 Cos= .026 Sum= .906 q= 5.5384 Vector: 52 F= 668.14 Cos= .002 Sum= .906 q= .3308 Vector: 53 F= 675.51 Cos= .017 Sum= .906 q= 3.6667 Vector: 54 F= 681.59 Cos= .002 Sum= .906 q= .3410 Vector: 55 F= 687.02 Cos= .018 Sum= .906 q= 3.8921 Vector: 56 F= 691.47 Cos= -.015 Sum= .907 q= -3.1900 Vector: 57 F= 692.41 Cos= .007 Sum= .907 q= 1.5129 Vector: 58 F= 698.42 Cos= -.040 Sum= .908 q= -8.4729 Vector: 59 F= 705.15 Cos= .002 Sum= .908 q= .4405 Vector: 60 F= 716.10 Cos= .007 Sum= .908 q= 1.4460 Vector: 61 F= 721.43 Cos= .014 Sum= .908 q= 2.9011 Vector: 62 F= 723.71 Cos= -.036 Sum= .910 q= -7.5929 Vector: 63 F= 729.96 Cos= .020 Sum= .910 q= 4.3357 Vector: 64 F= 735.51 Cos= -.014 Sum= .910 q= -2.9793 Vector: 65 F= 743.48 Cos= -.013 Sum= .911 q= -2.7687 Vector: 66 F= 748.70 Cos= .020 Sum= .911 q= 4.1625 Vector: 67 F= 752.55 Cos= -.001 Sum= .911 q= -.2747 Vector: 68 F= 753.88 Cos= -.016 Sum= .911 q= -3.3601 Vector: 69 F= 760.34 Cos= -.001 Sum= .911 q= -.1684 Vector: 70 F= 765.36 Cos= -.029 Sum= .912 q= -6.0477 Vector: 71 F= 766.75 Cos= -.017 Sum= .912 q= -3.6621 Vector: 72 F= 772.80 Cos= -.012 Sum= .912 q= -2.4470 Vector: 73 F= 782.05 Cos= -.005 Sum= .912 q= -1.1144 Vector: 74 F= 782.43 Cos= -.001 Sum= .912 q= -.2922 Vector: 75 F= 783.18 Cos= .010 Sum= .913 q= 2.1901 Vector: 76 F= 792.39 Cos= .008 Sum= .913 q= 1.7137 Vector: 77 F= 796.32 Cos= .007 Sum= .913 q= 1.4495 Vector: 78 F= 801.26 Cos= -.025 Sum= .913 q= -5.2695 Vector: 79 F= 807.86 Cos= -.015 Sum= .913 q= -3.2386 Vector: 80 F= 812.95 Cos= .015 Sum= .914 q= 3.0850 Vector: 81 F= 814.83 Cos= -.002 Sum= .914 q= -.3758 Vector: 82 F= 817.65 Cos= -.010 Sum= .914 q= -2.1528 Vector: 83 F= 828.97 Cos= .014 Sum= .914 q= 3.0276 Vector: 84 F= 833.43 Cos= .015 Sum= .914 q= 3.2403 Vector: 85 F= 836.61 Cos= .017 Sum= .915 q= 3.5196 Vector: 86 F= 837.32 Cos= .009 Sum= .915 q= 1.9723 Vector: 87 F= 842.51 Cos= -.008 Sum= .915 q= -1.6899 Vector: 88 F= 848.23 Cos= -.015 Sum= .915 q= -3.2217 Vector: 89 F= 853.08 Cos= -.020 Sum= .915 q= -4.3341 Vector: 90 F= 857.97 Cos= -.003 Sum= .915 q= -.5425 Vector: 91 F= 866.79 Cos= -.016 Sum= .916 q= -3.3491 Vector: 92 F= 867.61 Cos= -.015 Sum= .916 q= -3.2780 Vector: 93 F= 872.42 Cos= -.008 Sum= .916 q= -1.7628 Vector: 94 F= 875.32 Cos= -.015 Sum= .916 q= -3.1535 Vector: 95 F= 881.36 Cos= .008 Sum= .916 q= 1.6348 Vector: 96 F= 884.77 Cos= -.030 Sum= .917 q= -6.3897 Vector: 97 F= 885.83 Cos= .040 Sum= .919 q= 8.5498 Vector: 98 F= 893.91 Cos= .008 Sum= .919 q= 1.6608 Vector: 99 F= 895.82 Cos= .030 Sum= .920 q= 6.3670 Vector: 100 F= 896.42 Cos= -.008 Sum= .920 q= -1.6401 Vector: 101 F= 901.60 Cos= .007 Sum= .920 q= 1.5634 Vector: 102 F= 908.37 Cos= .017 Sum= .920 q= 3.6477 Vector: 103 F= 912.65 Cos= -.007 Sum= .920 q= -1.4060 Vector: 104 F= 918.18 Cos= .001 Sum= .920 q= .1803 Vector: 105 F= 920.68 Cos= -.042 Sum= .922 q= -8.8284 Vector: 106 F= 922.03 Cos= .011 Sum= .922 q= 2.3349 Projmod> Best zero-frequency found : .003432 Projmod> 6 frequencies less than: .003437 Projmod> Lowest non-zero frequency : 154.978749 Projmod> Best overlap with diff.vect. = .90 for mode 7 with F= 154.98 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = .804 .860 .887 .893 .897 .922 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 14051916424419054 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=80 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=100 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom making animated gifs 11 models are in 14051916424419054.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to reference MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 370 5.513 81 2.122 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 370 5.159 92 2.092 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 370 4.808 216 1.267 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 370 4.460 222 1.136 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 370 4.115 229 1.303 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 370 3.775 231 1.513 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 370 3.440 240 1.367 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 370 3.112 256 1.590 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 370 2.795 271 1.789 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 370 2.492 299 1.727 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 370 2.208 318 1.713 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 14051916424419054 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=20 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=40 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=60 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=80 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=100 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom making animated gifs 11 models are in 14051916424419054.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to reference MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 370 4.282 217 1.156 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 370 4.120 221 1.098 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 370 3.986 223 1.263 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 370 3.882 224 1.272 MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 370 3.811 229 1.303 MODEL 6 MODE=8 DQ=0 370 3.775 231 1.513 MODEL 7 MODE=8 DQ=20 370 3.774 232 1.275 MODEL 8 MODE=8 DQ=40 370 3.809 231 1.371 MODEL 9 MODE=8 DQ=60 370 3.879 223 1.233 MODEL 10 MODE=8 DQ=80 370 3.982 222 1.143 MODEL 11 MODE=8 DQ=100 370 4.115 216 1.085 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 14051916424419054 9 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 14051916424419054.eigenfacs 14051916424419054.atom calculating perturbed structure for DQ=0 14051916424419054.eigenfacs 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to reference MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 370 4.499 222 1.310 MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 370 4.302 226 1.257 MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 370 4.128 228 1.494 MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 370 3.980 232 1.462 MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 370 3.861 232 1.501 MODEL 6 MODE=9 DQ=0 370 3.775 231 1.513 MODEL 7 MODE=9 DQ=20 370 3.722 230 1.212 MODEL 8 MODE=9 DQ=40 370 3.705 234 1.374 MODEL 9 MODE=9 DQ=60 370 3.724 227 1.219 MODEL 10 MODE=9 DQ=80 370 3.778 226 1.278 MODEL 11 MODE=9 DQ=100 370 3.867 161 2.077 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 14051916424419054 10 -100 100 20 on on normal mode 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making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 14051916424419054.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to reference MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 370 4.162 216 1.490 MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 370 4.024 219 1.307 MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 370 3.913 221 1.214 MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 370 3.834 223 1.299 MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 370 3.787 231 1.445 MODEL 6 MODE=11 DQ=0 370 3.775 231 1.513 MODEL 7 MODE=11 DQ=20 370 3.796 231 1.245 MODEL 8 MODE=11 DQ=40 370 3.851 227 1.233 MODEL 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