***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 14051616002320826.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 14051616002320826.atom to be opened.
Openam> File opened: 14051616002320826.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 758
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 44.333530 +/- 6.596488 From: 29.854000 To: 58.353000
= 44.227468 +/- 8.664383 From: 25.358000 To: 61.272000
= -11.527855 +/- 8.244856 From: -28.556000 To: 9.685000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 9.0834 % Filled.
Pdbmat> 234959 non-zero elements.
Pdbmat> 25604 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 67.56 +/- 24.09
Maximum number = 117
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 512080.
Pdbmat> Larger element = 444.551
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
99 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 14051616002320826.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 14051616002320826.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
14051616002320826.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 758 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 99 residues.
Blocpdb> 7 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 9 atoms in block 2
Block first atom: 8
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 7 atoms in block 4
Block first atom: 25
Blocpdb> 8 atoms in block 5
Block first atom: 32
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 40
Blocpdb> 9 atoms in block 7
Block first atom: 54
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 63
Blocpdb> 7 atoms in block 9
Block first atom: 74
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 81
Blocpdb> 7 atoms in block 11
Block first atom: 89
Blocpdb> 7 atoms in block 12
Block first atom: 96
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 103
Blocpdb> 9 atoms in block 14
Block first atom: 111
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 120
Blocpdb> 4 atoms in block 16
Block first atom: 128
Blocpdb> 4 atoms in block 17
Block first atom: 132
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 136
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 145
Blocpdb> 9 atoms in block 20
Block first atom: 153
Blocpdb> 9 atoms in block 21
Block first atom: 162
Blocpdb> 5 atoms in block 22
Block first atom: 171
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 176
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 184
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 192
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 200
Blocpdb> 4 atoms in block 27
Block first atom: 207
Blocpdb> 5 atoms in block 28
Block first atom: 211
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 216
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 224
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 232
Blocpdb> 7 atoms in block 32
Block first atom: 239
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 246
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 254
Blocpdb> 9 atoms in block 35
Block first atom: 263
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 272
Blocpdb> 6 atoms in block 37
Block first atom: 280
Blocpdb> 8 atoms in block 38
Block first atom: 286
Blocpdb> 7 atoms in block 39
Block first atom: 294
Blocpdb> 4 atoms in block 40
Block first atom: 301
Blocpdb> 11 atoms in block 41
Block first atom: 305
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 316
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 330
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 339
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 346
Blocpdb> 8 atoms in block 46
Block first atom: 355
Blocpdb> 8 atoms in block 47
Block first atom: 363
Blocpdb> 4 atoms in block 48
Block first atom: 371
Blocpdb> 4 atoms in block 49
Block first atom: 375
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 379
Blocpdb> 4 atoms in block 51
Block first atom: 387
Blocpdb> 4 atoms in block 52
Block first atom: 391
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 395
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 406
Blocpdb> 9 atoms in block 55
Block first atom: 414
Blocpdb> 7 atoms in block 56
Block first atom: 423
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 430
Blocpdb> 9 atoms in block 58
Block first atom: 441
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 450
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 462
Blocpdb> 9 atoms in block 61
Block first atom: 470
Blocpdb> 8 atoms in block 62
Block first atom: 479
Blocpdb> 8 atoms in block 63
Block first atom: 487
Blocpdb> 8 atoms in block 64
Block first atom: 495
Blocpdb> 9 atoms in block 65
Block first atom: 503
Blocpdb> 8 atoms in block 66
Block first atom: 512
Blocpdb> 6 atoms in block 67
Block first atom: 520
Blocpdb> 4 atoms in block 68
Block first atom: 526
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 530
Blocpdb> 9 atoms in block 70
Block first atom: 540
Blocpdb> 5 atoms in block 71
Block first atom: 549
Blocpdb> 8 atoms in block 72
Block first atom: 554
Blocpdb> 4 atoms in block 73
Block first atom: 562
Blocpdb> 7 atoms in block 74
Block first atom: 566
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 573
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 580
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 588
Blocpdb> 4 atoms in block 78
Block first atom: 595
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 599
Blocpdb> 7 atoms in block 80
Block first atom: 606
Blocpdb> 7 atoms in block 81
Block first atom: 613
Blocpdb> 7 atoms in block 82
Block first atom: 620
Blocpdb> 8 atoms in block 83
Block first atom: 627
Blocpdb> 8 atoms in block 84
Block first atom: 635
Blocpdb> 8 atoms in block 85
Block first atom: 643
Blocpdb> 4 atoms in block 86
Block first atom: 651
Blocpdb> 11 atoms in block 87
Block first atom: 655
Blocpdb> 8 atoms in block 88
Block first atom: 666
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 674
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 682
Blocpdb> 7 atoms in block 91
Block first atom: 690
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 697
Blocpdb> 8 atoms in block 93
Block first atom: 706
Blocpdb> 4 atoms in block 94
Block first atom: 714
Blocpdb> 6 atoms in block 95
Block first atom: 718
Blocpdb> 7 atoms in block 96
Block first atom: 724
Blocpdb> 8 atoms in block 97
Block first atom: 731
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 739
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 746
Blocpdb> 99 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 235058 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2274
Prepmat> Matrix trace = 512080.0000
Prepmat> Last element read: 2274 2274 108.9375
Prepmat> 4951 lines saved.
Prepmat> 3897 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 758
RTB> Total mass = 758.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 758
RTB> Number of blocks = 99
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 121624.5885
RTB> 36423 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 594
Diagstd> Nb of non-zero elements: 36423
Diagstd> Projected matrix trace = 121624.5885
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 594 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 121624.5885
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : .000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: .0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
.0000000 .0000000 .0000000 .0000000 .0000000
.0000000 1.2904106 1.9193667 2.1457177 2.5601082
4.0829085 4.2974169 4.9753768 5.7602965 6.5446142
7.5494880 9.5961151 10.4467839 11.5943873 12.1011225
12.7220170 13.0473278 14.5857135 16.2559568 16.8834589
17.8358751 18.2440581 19.6976669 20.3962336 22.6128977
23.1067178 23.8364499 24.3067406 24.8462690 25.8653789
26.5555353 27.5118904 28.4332600 29.0418372 29.7979744
30.9142365 33.2004862 34.2236244 34.5141713 36.8936897
36.9696959 37.4429380 37.8419906 38.8967066 39.6236478
40.1374719 41.1093109 42.6479481 43.1378737 43.8311181
44.3091456 45.4210266 46.0304949 46.5918464 47.5311332
48.5466460 48.6873479 49.4351847 50.5658457 51.1785989
51.8717524 52.9912493 53.9347059 54.6427725 56.9893937
57.6762089 58.7083328 59.4905665 60.3357361 61.2788724
62.3280289 64.1432366 65.1503780 65.9519502 66.5008605
67.6037419 67.8338420 68.4339883 68.8269501 70.7651103
72.5395907 73.6126408 73.8426006 74.3537716 75.0952780
76.4092943 76.6927120 77.6868228 78.4164493 78.7118449
79.8829152 80.9799285 81.6367394 82.3975448 83.2699349
83.5649686 84.4917140 85.6675511 85.9823472 86.9082187
87.4720061
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
.0034324 .0034326 .0034329 .0034338 .0034340
.0034340 123.3557038 150.4437891 159.0675423 173.7498521
219.4219665 225.1121960 242.2190337 260.6259774 277.8032387
298.3692266 336.3899432 350.9834069 369.7593643 377.7531631
387.3229820 392.2437810 414.7239532 437.8260001 446.1963283
458.6089138 463.8269758 481.9507665 490.4223671 516.3847275
521.9926766 530.1711211 535.3756851 541.2848498 552.2741336
559.5936917 569.5810036 579.0400569 585.2040511 592.7733242
603.7741880 625.7019412 635.2699034 637.9608171 659.5858433
660.2649138 664.4774383 668.0089286 677.2541823 683.5534942
687.9712468 696.2502733 709.1601952 713.2218631 718.9299149
722.8396523 731.8528245 736.7465356 741.2253109 748.6595424
756.6149101 757.7105587 763.5075940 772.1895462 776.8541253
782.0972168 790.4917821 797.4976973 802.7154898 819.7705243
824.6955162 832.0418173 837.5665654 843.4951462 850.0621183
857.3081979 869.7024938 876.5036929 881.8792040 885.5414880
892.8544097 894.3726047 898.3202835 900.8957600 913.4922646
924.8745534 931.6900969 933.1442232 936.3684709 941.0259397
949.2232662 950.9820686 957.1256620 961.6097700 963.4192642
970.5596524 977.2011619 981.1560937 985.7173839 990.9218229
992.6757382 998.1650066 1005.0865388 1006.9315032 1012.3383853
1015.6166774
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 758
Rtb_to_modes> Number of blocs = 99
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.290
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.919
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.146
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.560
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.083
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.760
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.545
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.549
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.596
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.47
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 594 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
.99999 .99997 .99996 1.00003 1.00000
1.00001 1.00000 .99997 .99999 1.00004
.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 .99997 .99996 1.00001
1.00000 .99994 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
.99997 1.00000 .99999 .99997 1.00004
.99999 1.00001 .99999 1.00003 1.00001
.99999 1.00001 .99998 1.00000 1.00002
1.00001 .99999 1.00001 1.00001 .99998
1.00000 1.00000 1.00000 .99999 .99999
.99997 .99999 .99997 1.00000 1.00000
1.00006 .99999 1.00000 .99999 1.00000
1.00002 1.00003 .99999 1.00001 .99997
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 .99999
1.00000 .99998 1.00002 1.00000 .99999
1.00002 1.00003 1.00001 .99999 1.00001
.99995 .99998 .99998 1.00003 1.00001
1.00001 .99999 .99994 .99997 .99997
.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
.99996 .99999 1.00000 .99998 1.00004
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 13644 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
.99999 .99997 .99996 1.00003 1.00000
1.00001 1.00000 .99997 .99999 1.00004
.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 .99997 .99996 1.00001
1.00000 .99994 1.00002 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
.99997 1.00000 .99999 .99997 1.00004
.99999 1.00001 .99999 1.00003 1.00001
.99999 1.00001 .99998 1.00000 1.00002
1.00001 .99999 1.00001 1.00001 .99998
1.00000 1.00000 1.00000 .99999 .99999
.99997 .99999 .99997 1.00000 1.00000
1.00006 .99999 1.00000 .99999 1.00000
1.00002 1.00003 .99999 1.00001 .99997
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 .99999
1.00000 .99998 1.00002 1.00000 .99999
1.00002 1.00003 1.00001 .99999 1.00001
.99995 .99998 .99998 1.00003 1.00001
1.00001 .99999 .99994 .99997 .99997
.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
.99996 .99999 1.00000 .99998 1.00004
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: .000
Vector 3: .000 .000
Vector 4: .000 .000 .000
Vector 5: .000 .000 .000 .000
Vector 6: .000 .000 .000 .000 .000
Vector 7: .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 8: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 9: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Vector 10: .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000 .000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051616002320826.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051616002320826.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 14051616002320826.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051616002320826.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 758
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.146
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.083
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.760
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.549
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.47
Bfactors> 106 vectors, 2274 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : .000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : .000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.290000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= .280 for 99 C-alpha atoms.
Bfactors> = .090 +/- .18
Bfactors> = 31.076 +/- 10.13
Bfactors> Shiftng-fct= 30.986
Bfactors> Scaling-fct= 56.676
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 14051616002320826.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051616002320826.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Chkmod> 106 vectors, 2274 coordinates in file.
Chkmod> That is: 758 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: .9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 61 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 86 is: .9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
.0034 .8768
.0034 .9218
.0034 .7403
.0034 .7358
.0034 .9609
.0034 .7846
123.3308 .0652
150.4230 .1124
159.0712 .1132
173.7387 .1859
219.4150 .0253
225.0916 .3070
242.1995 .2905
260.6081 .2191
277.7995 .1796
298.3468 .2148
336.3735 .2094
351.0224 .1485
369.6735 .3014
377.7194 .0805
387.2757 .2623
392.2671 .1212
414.7671 .3514
437.8616 .2608
446.1315 .3727
458.6423 .2156
463.7555 .4263
481.9586 .1572
490.4466 .2123
516.3295 .2233
522.0073 .3769
530.1878 .2763
535.3886 .3329
541.3023 .3827
552.2998 .2396
559.6167 .3438
569.5370 .2949
578.9820 .1247
585.1604 .3736
592.7680 .3356
603.7069 .2947
625.6705 .3481
635.2090 .1447
637.8949 .3780
659.5245 .4072
660.2393 .4286
664.4228 .2321
667.9627 .2867
677.2538 .4843
683.4927 .3512
687.9634 .3818
696.2262 .3525
709.1468 .1916
713.2088 .3993
718.8899 .3992
722.8156 .1488
731.8131 .1671
736.7109 .2535
741.1788 .2806
748.6185 .3227
756.6086 .0269
757.6987 .4007
763.5120 .3061
772.1881 .2796
776.8314 .2239
782.0504 .3239
790.4485 .3267
797.4287 .3467
802.6607 .3943
819.7397 .3963
824.6872 .2863
832.0179 .2863
837.5266 .3526
843.4887 .3611
850.0334 .2730
857.2850 .2304
869.6432 .0910
876.4635 .4803
881.8283 .4201
885.4977 .1359
892.7914 .2312
894.3089 .1947
898.2555 .3593
900.8770 .4600
913.4846 .4518
924.8375 .2203
931.6334 .2415
933.0877 .3510
936.3045 .3599
941.0151 .0841
949.1869 .3570
950.9244 .1867
957.1041 .1629
961.5903 .0985
963.3666 .3097
970.5003 .4126
977.1596 .0338
981.1336 .2418
985.6898 .4343
990.8797 .3319
992.6036 .1118
998.1120 .3260
1005.0578 .4037
1006.8745 .2740
1012.3053 .2929
1015.5614 .1008
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 14051616002320826.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
14051616002320826.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 14051616002320826.atom
Openam> file on opening on unit 11:
14051616002320826.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 14051616002320826.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
14051616002320826.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Projmod> 106 vectors, 2274 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 758
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 758
Mean number per residue = 7.7
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 758 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.37
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- .00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= .00 Cos= -.066 Sum= .004 q= -2.4922
Vector: 2 F= .00 Cos= -.016 Sum= .005 q= -.6100
Vector: 3 F= .00 Cos= -.051 Sum= .007 q= -1.9146
Vector: 4 F= .00 Cos= .033 Sum= .008 q= 1.2595
Vector: 5 F= .00 Cos= -.081 Sum= .015 q= -3.0487
Vector: 6 F= .00 Cos= .089 Sum= .023 q= 3.3529
Vector: 7 F= 123.33 Cos= -.074 Sum= .028 q= -2.7823
Vector: 8 F= 150.42 Cos= .629 Sum= .424 q= 23.6904
Vector: 9 F= 159.07 Cos= -.080 Sum= .431 q= -3.0079
Vector: 10 F= 173.74 Cos= -.118 Sum= .444 q= -4.4538
Vector: 11 F= 219.42 Cos= -.031 Sum= .445 q= -1.1549
Vector: 12 F= 225.09 Cos= -.027 Sum= .446 q= -1.0060
Vector: 13 F= 242.20 Cos= -.054 Sum= .449 q= -2.0342
Vector: 14 F= 260.61 Cos= -.041 Sum= .451 q= -1.5298
Vector: 15 F= 277.80 Cos= -.005 Sum= .451 q= -.1837
Vector: 16 F= 298.35 Cos= -.028 Sum= .452 q= -1.0709
Vector: 17 F= 336.37 Cos= .051 Sum= .454 q= 1.9155
Vector: 18 F= 351.02 Cos= -.068 Sum= .459 q= -2.5641
Vector: 19 F= 369.67 Cos= .043 Sum= .461 q= 1.6157
Vector: 20 F= 377.72 Cos= .026 Sum= .461 q= .9744
Vector: 21 F= 387.28 Cos= -.027 Sum= .462 q= -1.0261
%Projmod-Wn> Eigenvector 22 Norm= .9999
Vector: 22 F= 392.27 Cos= -.049 Sum= .464 q= -1.8432
Vector: 23 F= 414.77 Cos= .106 Sum= .476 q= 3.9870
Vector: 24 F= 437.86 Cos= -.044 Sum= .478 q= -1.6504
Vector: 25 F= 446.13 Cos= -.104 Sum= .488 q= -3.9238
Vector: 26 F= 458.64 Cos= .044 Sum= .490 q= 1.6607
Vector: 27 F= 463.76 Cos= -.029 Sum= .491 q= -1.0918
Vector: 28 F= 481.96 Cos= -.073 Sum= .496 q= -2.7310
Vector: 29 F= 490.45 Cos= -.008 Sum= .497 q= -.2934
Vector: 30 F= 516.33 Cos= .017 Sum= .497 q= .6584
Vector: 31 F= 522.01 Cos= -.025 Sum= .497 q= -.9540
Vector: 32 F= 530.19 Cos= -.037 Sum= .499 q= -1.4098
Vector: 33 F= 535.39 Cos= .003 Sum= .499 q= .1161
Vector: 34 F= 541.30 Cos= .030 Sum= .500 q= 1.1358
Vector: 35 F= 552.30 Cos= .038 Sum= .501 q= 1.4379
Vector: 36 F= 559.62 Cos= -.031 Sum= .502 q= -1.1809
Vector: 37 F= 569.54 Cos= .029 Sum= .503 q= 1.0962
Vector: 38 F= 578.98 Cos= .054 Sum= .506 q= 2.0191
Vector: 39 F= 585.16 Cos= .027 Sum= .507 q= 1.0211
Vector: 40 F= 592.77 Cos= -.014 Sum= .507 q= -.5175
Vector: 41 F= 603.71 Cos= -.052 Sum= .510 q= -1.9405
Vector: 42 F= 625.67 Cos= .052 Sum= .512 q= 1.9680
Vector: 43 F= 635.21 Cos= .022 Sum= .513 q= .8464
Vector: 44 F= 637.89 Cos= .020 Sum= .513 q= .7629
Vector: 45 F= 659.52 Cos= -.018 Sum= .514 q= -.6950
Vector: 46 F= 660.24 Cos= .033 Sum= .515 q= 1.2380
Vector: 47 F= 664.42 Cos= .039 Sum= .516 q= 1.4539
Vector: 48 F= 667.96 Cos= .069 Sum= .521 q= 2.5984
Vector: 49 F= 677.25 Cos= -.004 Sum= .521 q= -.1629
Vector: 50 F= 683.49 Cos= -.065 Sum= .525 q= -2.4353
Vector: 51 F= 687.96 Cos= .008 Sum= .525 q= .2867
Vector: 52 F= 696.23 Cos= .020 Sum= .526 q= .7391
Vector: 53 F= 709.15 Cos= -.006 Sum= .526 q= -.2086
Vector: 54 F= 713.21 Cos= -.015 Sum= .526 q= -.5625
Vector: 55 F= 718.89 Cos= -.003 Sum= .526 q= -.1303
Vector: 56 F= 722.82 Cos= .027 Sum= .527 q= 1.0315
Vector: 57 F= 731.81 Cos= .036 Sum= .528 q= 1.3526
Vector: 58 F= 736.71 Cos= .026 Sum= .528 q= .9718
Vector: 59 F= 741.18 Cos= -.065 Sum= .533 q= -2.4461
Vector: 60 F= 748.62 Cos= -.004 Sum= .533 q= -.1387
%Projmod-Wn> Eigenvector 61 Norm= 1.0002
Vector: 61 F= 756.61 Cos= .006 Sum= .533 q= .2422
Vector: 62 F= 757.70 Cos= .029 Sum= .534 q= 1.0841
Vector: 63 F= 763.51 Cos= -.007 Sum= .534 q= -.2692
Vector: 64 F= 772.19 Cos= .039 Sum= .535 q= 1.4559
Vector: 65 F= 776.83 Cos= .016 Sum= .535 q= .5858
Vector: 66 F= 782.05 Cos= -.087 Sum= .543 q= -3.2701
Vector: 67 F= 790.45 Cos= -.040 Sum= .545 q= -1.5067
Vector: 68 F= 797.43 Cos= -.013 Sum= .545 q= -.4818
Vector: 69 F= 802.66 Cos= -.038 Sum= .546 q= -1.4358
Vector: 70 F= 819.74 Cos= .006 Sum= .546 q= .2199
Vector: 71 F= 824.69 Cos= -.027 Sum= .547 q= -1.0224
Vector: 72 F= 832.02 Cos= .014 Sum= .547 q= .5411
Vector: 73 F= 837.53 Cos= .010 Sum= .547 q= .3658
Vector: 74 F= 843.49 Cos= -.009 Sum= .547 q= -.3350
Vector: 75 F= 850.03 Cos= -.026 Sum= .548 q= -.9677
Vector: 76 F= 857.28 Cos= .030 Sum= .549 q= 1.1325
Vector: 77 F= 869.64 Cos= -.014 Sum= .549 q= -.5153
Vector: 78 F= 876.46 Cos= -.023 Sum= .550 q= -.8789
Vector: 79 F= 881.83 Cos= .001 Sum= .550 q= .0271
Vector: 80 F= 885.50 Cos= -.001 Sum= .550 q= -.0446
Vector: 81 F= 892.79 Cos= -.066 Sum= .554 q= -2.4839
Vector: 82 F= 894.31 Cos= .013 Sum= .554 q= .4878
Vector: 83 F= 898.26 Cos= -.005 Sum= .554 q= -.2060
Vector: 84 F= 900.88 Cos= .026 Sum= .555 q= .9737
Vector: 85 F= 913.48 Cos= -.030 Sum= .556 q= -1.1256
%Projmod-Wn> Eigenvector 86 Norm= .9999
Vector: 86 F= 924.84 Cos= .002 Sum= .556 q= .0839
Vector: 87 F= 931.63 Cos= -.021 Sum= .556 q= -.7798
Vector: 88 F= 933.09 Cos= -.004 Sum= .556 q= -.1598
Vector: 89 F= 936.30 Cos= -.010 Sum= .556 q= -.3818
Vector: 90 F= 941.02 Cos= -.007 Sum= .556 q= -.2499
Vector: 91 F= 949.19 Cos= -.054 Sum= .559 q= -2.0235
Vector: 92 F= 950.92 Cos= .069 Sum= .564 q= 2.5950
Vector: 93 F= 957.10 Cos= .003 Sum= .564 q= .0965
Vector: 94 F= 961.59 Cos= -.001 Sum= .564 q= -.0431
Vector: 95 F= 963.37 Cos= -.022 Sum= .564 q= -.8297
Vector: 96 F= 970.50 Cos= .030 Sum= .565 q= 1.1147
Vector: 97 F= 977.16 Cos= .011 Sum= .565 q= .4172
Vector: 98 F= 981.13 Cos= .017 Sum= .566 q= .6258
Vector: 99 F= 985.69 Cos= -.071 Sum= .571 q= -2.6857
Vector: 100 F= 990.88 Cos= .068 Sum= .575 q= 2.5534
Vector: 101 F= 992.60 Cos= -.004 Sum= .575 q= -.1560
Vector: 102 F= 998.11 Cos= .015 Sum= .576 q= .5471
Vector: 103 F= 1005.06 Cos= .043 Sum= .577 q= 1.6015
Vector: 104 F= 1006.87 Cos= -.004 Sum= .577 q= -.1359
Vector: 105 F= 1012.31 Cos= .035 Sum= .579 q= 1.3167
Vector: 106 F= 1015.56 Cos= .006 Sum= .579 q= .2323
Projmod> Best zero-frequency found : .003432
Projmod> 6 frequencies less than: .003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 123.330784
Projmod> Best overlap with diff.vect. = .63 for mode 8 with F= 150.42 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = .396 .421 .447 .466 .481 .579
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 14051616002320826 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
making animated gifs
11 models are in 14051616002320826.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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11 models are in 14051616002320826.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 99 2.813 93 1.011
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 99 2.307 94 0.954
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 99 1.828 94 0.821
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 99 1.403 94 0.725
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 99 1.098 95 0.708
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 99 1.227 95 0.838
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 99 1.603 94 0.898
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 99 2.059 92 0.912
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 99 2.554 91 0.962
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 99 3.068 91 1.089
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 14051616002320826 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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14051616002320826.atom
making animated gifs
11 models are in 14051616002320826.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 99 4.597 83 1.034
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 99 3.868 85 1.008
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 99 3.142 87 1.015
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 99 2.419 90 0.973
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 99 1.707 93 0.911
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 99 0.514 99 0.514
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 99 0.744 97 0.585
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 99 1.385 93 0.649
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 99 2.088 91 0.730
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 99 2.806 89 0.868
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 14051616002320826 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 99 2.602 86 0.980
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 99 2.147 88 0.929
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 99 1.720 91 0.916
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 99 1.348 92 0.840
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 99 1.086 96 0.834
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 99 1.196 94 0.801
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 99 1.523 91 0.835
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 99 1.928 90 0.938
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 99 2.371 88 0.975
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 99 2.835 86 1.019
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 14051616002320826 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051616002320826.eigenfacs
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14051616002320826.eigenfacs
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14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 99 2.620 88 1.167
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 99 2.115 90 1.114
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 99 1.641 95 1.108
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 99 1.237 97 0.942
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 99 0.991 97 0.825
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 99 1.318 95 0.745
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 99 1.742 95 1.045
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 99 2.226 88 1.043
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 99 2.736 85 1.016
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 99 3.261 82 1.053
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 14051616002320826 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
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14051616002320826.atom
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14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
14051616002320826.eigenfacs
14051616002320826.atom
making animated gifs
11 models are in 14051616002320826.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 14051616002320826.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to reference
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 99 3.085 92 0.839
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 99 2.524 93 0.902
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 99 1.988 94 0.839
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 99 1.503 95 0.820
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 99 1.136 95 0.740
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 99 1.240 95 0.753
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 99 1.660 94 0.702
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 99 2.168 95 0.789
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 99 2.715 95 0.793
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 99 3.282 95 0.812
14051616002320826.10.pdb
14051616002320826.11.pdb
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14051616002320826.9.pdb
STDERR:
5.82user 0.31system 0:06.14elapsed 100%CPU (0avgtext+0avgdata 24112maxresident)k
0inputs+18256outputs (0major+1570minor)pagefaults 0swaps
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