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***  TEST  ***

LOGs for ID: 2502031613291658206

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2502031613291658206.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2502031613291658206.atom to be opened. Openam> File opened: 2502031613291658206.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 201 First residue number = 513 Last residue number = 13 Number of atoms found = 1564 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 30.005969 +/- 7.579049 From: 10.914000 To: 49.942000 = -9.881854 +/- 10.746578 From: -33.967000 To: 13.813000 = 5.946882 +/- 12.348570 From: -20.544000 To: 29.476000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.0455 % Filled. Pdbmat> 555503 non-zero elements. Pdbmat> 60696 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 77.62 +/- 22.82 Maximum number = 123 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 1.213920E+06 Pdbmat> Larger element = 495.810 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 201 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2502031613291658206.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2502031613291658206.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2502031613291658206.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1564 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 201 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 48 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 67 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 83 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 100 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 112 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 134 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 149 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 164 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 177 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 193 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 210 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 232 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 246 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 261 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 278 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 290 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 301 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 315 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 328 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 342 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 356 Blocpdb> 17 atoms in block 25 Block first atom: 375 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 392 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 404 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 420 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 435 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 451 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 466 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 482 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 496 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 513 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 531 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 547 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 562 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 595 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 607 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 627 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 638 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 651 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 667 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 683 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 701 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 716 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 734 Blocpdb> 15 atoms in block 49 Block first atom: 750 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 765 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 784 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 801 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 816 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 833 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 848 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 863 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 882 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 898 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 906 Blocpdb> 18 atoms in block 60 Block first atom: 919 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 937 Blocpdb> 15 atoms in block 62 Block first atom: 952 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 967 Blocpdb> 18 atoms in block 64 Block first atom: 980 Blocpdb> 12 atoms in block 65 Block first atom: 998 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 1010 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1021 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1033 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1049 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 1062 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1088 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1117 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1134 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1148 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1164 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1176 Blocpdb> 13 atoms in block 78 Block first atom: 1195 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1208 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1227 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1244 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1261 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1275 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1294 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 1311 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1322 Blocpdb> 10 atoms in block 87 Block first atom: 1337 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1347 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1364 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1377 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1392 Blocpdb> 8 atoms in block 92 Block first atom: 1410 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1418 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 1438 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1456 Blocpdb> 10 atoms in block 96 Block first atom: 1475 Blocpdb> 13 atoms in block 97 Block first atom: 1485 Blocpdb> 18 atoms in block 98 Block first atom: 1498 Blocpdb> 9 atoms in block 99 Block first atom: 1516 Blocpdb> 13 atoms in block 100 Block first atom: 1525 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1538 Blocpdb> 9 atoms in block 102 Block first atom: 1555 Blocpdb> 102 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 555605 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4692 Prepmat> Matrix trace = 1213920.0000 Prepmat> Last element read: 4692 4692 270.5755 Prepmat> 5254 lines saved. Prepmat> 4211 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1564 RTB> Total mass = 1564.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1564 RTB> Number of blocks = 102 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 133199.2518 RTB> 35982 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 612 Diagstd> Nb of non-zero elements: 35982 Diagstd> Projected matrix trace = 133199.2518 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 612 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 133199.2518 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2861357 1.6273718 2.9123925 7.0836729 8.0455945 8.7953887 12.2585032 13.2246800 13.4316359 14.8376354 15.3380730 15.8846721 16.8620146 19.2268374 20.1350570 21.9347725 22.9988327 23.2457843 23.9581990 24.9865668 26.1391462 26.4533289 28.1978148 29.0151576 29.1811256 30.4859547 31.4209634 31.5803940 32.0015796 32.0942765 32.4954902 33.2610279 34.0030949 34.4374746 35.9497812 36.3881291 38.0446567 38.3245318 38.4643743 39.0068577 40.4147004 41.5706377 41.8649728 42.7159296 42.8766176 45.2363138 46.2888018 47.9514493 49.4236222 49.9973241 51.3628053 52.4814855 53.2991845 54.1809400 54.4451472 55.8702186 57.9486681 59.3086000 60.0749916 61.3380405 62.0010148 62.9795669 63.6352658 65.0369434 65.3772361 66.2413156 66.9079528 68.0042402 68.7107577 69.4307653 70.1579355 70.5697304 70.8349466 71.5196002 72.0820555 72.7385156 73.4534612 74.5804776 75.4558543 75.9123010 77.1736721 77.6360992 78.1942221 78.8305185 79.3772982 79.7641003 80.9356168 81.4781735 82.5533853 84.5039243 84.6749204 85.4382151 85.4944219 86.3857162 87.3203824 88.7910255 88.9739904 89.6892764 91.0224207 91.1826978 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034332 0.0034333 0.0034336 0.0034337 0.0034340 123.1512075 138.5283534 185.3191209 289.0177597 308.0167622 322.0496260 380.2016554 394.9006664 397.9786149 418.2901408 425.2856024 432.7971650 445.9128730 476.1559409 487.2722867 508.5830099 520.7726614 523.5611126 531.5233694 542.8109179 555.1891615 558.5157771 576.6376659 584.9351868 586.6057296 599.5772975 608.7024203 610.2447510 614.3006685 615.1897279 619.0230585 626.2721707 633.2198258 637.2515908 651.0935693 655.0510445 669.7953296 672.2544861 673.4798653 678.2124587 690.3430579 700.1460192 702.6202895 709.7251761 711.0588384 730.3632026 738.8108243 751.9624417 763.4182991 767.8363370 778.2509295 786.6804178 792.7852520 799.3160765 801.2625934 811.6811599 826.6411288 836.2846327 841.6705659 850.4724096 855.0562367 861.7774288 866.2519223 875.7403113 878.0283896 883.8117172 888.2478218 895.4952294 900.1350006 904.8388859 909.5648748 912.2303340 913.9429050 918.3491307 921.9531695 926.1418241 930.6822107 937.7948866 943.2824418 946.1311867 953.9593368 956.8131458 960.2462328 964.1452629 967.4832095 969.8375964 976.9337663 980.2027638 986.6490996 998.2371288 999.2465991 1003.7403055 1004.0704137 1009.2906487 1014.7360618 1023.2454359 1024.2991555 1028.4082228 1036.0231762 1036.9349172 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1564 Rtb_to_modes> Number of blocs = 102 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.795 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> 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Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502031613291658206.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502031613291658206.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2502031613291658206.atom Openam> file on opening on unit 11: 2502031613291658206.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 201 First residue number = 513 Last residue number = 13 Number of atoms found = 1564 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.912 Rdmodfacs> Numero du 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vecteur en lecture: 40.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.18 Bfactors> 106 vectors, 4692 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.286000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.526 for 204 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.037 +/- 0.03 Bfactors> = 15.089 +/- 6.39 Bfactors> Shiftng-fct= 15.052 Bfactors> Scaling-fct= 231.999 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2502031613291658206.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2502031613291658206.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Chkmod> 106 vectors, 4692 coordinates in file. Chkmod> That is: 1564 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9945 0.0034 0.7544 0.0034 0.8033 0.0034 0.9055 0.0034 0.7471 0.0034 0.9884 123.1394 0.7316 138.5066 0.7136 185.2987 0.7448 289.0120 0.7264 308.0113 0.6394 322.0287 0.6910 380.2085 0.1556 394.8138 0.1764 397.9373 0.0990 418.3055 0.2400 425.2941 0.3481 432.7149 0.2119 445.8671 0.2698 476.1747 0.1639 487.3112 0.1753 508.5058 0.3971 520.7635 0.4221 523.5861 0.2512 531.5205 0.2344 542.8249 0.1782 555.1744 0.2176 558.4567 0.3445 576.6353 0.3694 584.9589 0.1880 586.5692 0.2785 599.5913 0.1946 608.6670 0.1258 610.2147 0.3469 614.2591 0.2531 615.1223 0.2717 619.0394 0.5095 626.2356 0.6638 633.1638 0.4083 637.2476 0.2148 651.0676 0.5596 655.0398 0.5749 669.7256 0.4033 672.1859 0.4575 673.4127 0.6757 678.2107 0.5288 690.2733 0.5941 700.1106 0.4565 702.5484 0.5589 709.7285 0.4898 711.0564 0.3222 730.3616 0.4465 738.7887 0.4810 751.9188 0.4321 763.3576 0.2546 767.8239 0.3262 778.1963 0.5802 786.6355 0.3636 792.7573 0.3654 799.2748 0.2624 801.2639 0.2884 811.6447 0.2924 826.6151 0.3124 836.2586 0.4102 841.5995 0.3523 850.4495 0.3178 855.0125 0.3430 861.7434 0.2688 866.2470 0.3630 875.7233 0.4541 878.0093 0.4635 883.7650 0.3481 888.2233 0.3621 895.4289 0.5271 900.0914 0.3560 904.7951 0.3397 909.5392 0.4209 912.1929 0.4533 913.8718 0.3449 918.3123 0.5430 921.9004 0.4783 926.1115 0.5297 930.6203 0.4005 937.7516 0.3585 943.2679 0.4269 946.0762 0.3457 953.8957 0.4434 956.7961 0.4474 960.1791 0.5073 964.1007 0.4740 967.4581 0.4971 969.7710 0.3632 976.9183 0.3239 980.1717 0.3596 986.5865 0.5102 998.1711 0.3225 999.1747 0.3732 1003.7077 0.4062 1004.0013 0.4384 1009.2723 0.3826 1014.6903 0.4042 1023.1956 0.3364 1024.2322 0.4828 1028.3682 0.5013 1035.9649 0.3717 1036.8751 0.4343 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2502031613291658206 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2502031613291658206.eigenfacs 2502031613291658206.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2502031613291658206.eigenfacs 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