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LOGs for ID: 241118155317566920

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 241118155317566920.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 241118155317566920.atom to be opened. Openam> File opened: 241118155317566920.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 542 First residue number = 1 Last residue number = 271 Number of atoms found = 4306 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.454068 +/- 24.653907 From: -61.188000 To: 63.993000 = -0.313484 +/- 22.428236 From: -57.367000 To: 45.520000 = -0.210467 +/- 20.044804 From: -70.017000 To: 57.775000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6084 % Filled. Pdbmat> 1342142 non-zero elements. Pdbmat> 146279 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 67.94 +/- 26.69 Maximum number = 126 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 2.925580E+06 Pdbmat> Larger element = 496.198 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 542 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 241118155317566920.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 241118155317566920.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 241118155317566920.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4306 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 542 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 21 atoms in block 3 Block first atom: 43 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 64 Blocpdb> 27 atoms in block 5 Block first atom: 88 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 115 Blocpdb> 28 atoms in block 7 Block first atom: 138 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 166 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 191 Blocpdb> 30 atoms in block 10 Block first atom: 211 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 241 Blocpdb> 23 atoms in block 12 Block first atom: 261 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 284 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 305 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 327 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 346 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 374 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 398 Blocpdb> 32 atoms in block 19 Block first atom: 418 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 450 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 478 Blocpdb> 26 atoms in block 22 Block first atom: 502 Blocpdb> 30 atoms in block 23 Block first atom: 528 Blocpdb> 21 atoms in block 24 Block first atom: 558 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 579 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 604 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 628 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 645 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 668 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 687 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 709 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 734 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 757 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 779 Blocpdb> 27 atoms in block 35 Block first atom: 799 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 826 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 846 Blocpdb> 29 atoms in block 38 Block first atom: 871 Blocpdb> 25 atoms in block 39 Block first atom: 900 Blocpdb> 19 atoms in block 40 Block first atom: 925 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 944 Blocpdb> 25 atoms in block 42 Block first atom: 968 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 993 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 1017 Blocpdb> 27 atoms in block 45 Block first atom: 1041 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1068 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 1090 Blocpdb> 24 atoms in block 48 Block first atom: 1113 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1137 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1158 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1183 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1209 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 1232 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 1254 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1276 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1296 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 1314 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1333 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1358 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1387 Blocpdb> 28 atoms in block 61 Block first atom: 1410 Blocpdb> 27 atoms in block 62 Block first atom: 1438 Blocpdb> 18 atoms in block 63 Block first atom: 1465 Blocpdb> 29 atoms in block 64 Block first atom: 1483 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1512 Blocpdb> 27 atoms in block 66 Block first atom: 1531 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1558 Blocpdb> 23 atoms in block 68 Block first atom: 1580 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1603 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 1626 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1657 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 1683 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1708 Blocpdb> 21 atoms in block 74 Block first atom: 1730 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1751 Blocpdb> 26 atoms in block 76 Block first atom: 1775 Blocpdb> 24 atoms in block 77 Block first atom: 1801 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1825 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 1850 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1868 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 1891 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1923 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1943 Blocpdb> 26 atoms in block 84 Block first atom: 1970 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 1996 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 2023 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2051 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2078 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2101 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 2125 Blocpdb> 9 atoms in block 91 Block first atom: 2145 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 2154 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2176 Blocpdb> 21 atoms in block 94 Block first atom: 2196 Blocpdb> 24 atoms in block 95 Block first atom: 2217 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2241 Blocpdb> 23 atoms in block 97 Block first atom: 2268 Blocpdb> 28 atoms in block 98 Block first atom: 2291 Blocpdb> 25 atoms in block 99 Block first atom: 2319 Blocpdb> 20 atoms in block 100 Block first atom: 2344 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 2364 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 2394 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2414 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2437 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 2458 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 2480 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2499 Blocpdb> 24 atoms in block 108 Block first atom: 2527 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 2551 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 2571 Blocpdb> 28 atoms in block 111 Block first atom: 2603 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2631 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 2655 Blocpdb> 30 atoms in block 114 Block first atom: 2681 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 2711 Blocpdb> 25 atoms in block 116 Block first atom: 2732 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 2757 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 2781 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 2798 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 2821 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 2840 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2862 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 2887 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2910 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2932 Blocpdb> 27 atoms in block 126 Block first atom: 2952 Blocpdb> 20 atoms in block 127 Block first atom: 2979 Blocpdb> 25 atoms in block 128 Block first atom: 2999 Blocpdb> 29 atoms in block 129 Block first atom: 3024 Blocpdb> 25 atoms in block 130 Block first atom: 3053 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 3078 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3097 Blocpdb> 25 atoms in block 133 Block first atom: 3121 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3146 Blocpdb> 24 atoms in block 135 Block first atom: 3170 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 3194 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 3221 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3243 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 3266 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 3290 Blocpdb> 25 atoms in block 141 Block first atom: 3311 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3336 Blocpdb> 23 atoms in block 143 Block first atom: 3362 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 3385 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 3407 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3429 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 3449 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3467 Blocpdb> 25 atoms in block 149 Block first atom: 3486 Blocpdb> 29 atoms in block 150 Block first atom: 3511 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3540 Blocpdb> 28 atoms in block 152 Block first atom: 3563 Blocpdb> 27 atoms in block 153 Block first atom: 3591 Blocpdb> 18 atoms in block 154 Block first atom: 3618 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 3636 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 3665 Blocpdb> 27 atoms in block 157 Block first atom: 3684 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 3711 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 3733 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 3756 Blocpdb> 31 atoms in block 161 Block first atom: 3779 Blocpdb> 26 atoms in block 162 Block first atom: 3810 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 3836 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3861 Blocpdb> 21 atoms in block 165 Block first atom: 3883 Blocpdb> 24 atoms in block 166 Block first atom: 3904 Blocpdb> 26 atoms in block 167 Block first atom: 3928 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3954 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3978 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 4003 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 4021 Blocpdb> 32 atoms in block 172 Block first atom: 4044 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 4076 Blocpdb> 27 atoms in block 174 Block first atom: 4096 Blocpdb> 26 atoms in block 175 Block first atom: 4123 Blocpdb> 27 atoms in block 176 Block first atom: 4149 Blocpdb> 28 atoms in block 177 Block first atom: 4176 Blocpdb> 27 atoms in block 178 Block first atom: 4204 Blocpdb> 23 atoms in block 179 Block first atom: 4231 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4254 Blocpdb> 20 atoms in block 181 Block first atom: 4278 Blocpdb> 9 atoms in block 182 Block first atom: 4297 Blocpdb> 182 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1342324 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12918 Prepmat> Matrix trace = 2925580.0000 Prepmat> Last element read: 12918 12918 200.3568 Prepmat> 16654 lines saved. Prepmat> 15317 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4306 RTB> Total mass = 4306.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4306 RTB> Number of blocks = 182 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 178404.3283 RTB> 45366 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1092 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45366 Diagstd> Projected matrix trace = 178404.3283 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1092 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 178404.3283 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0036094 0.0043729 0.0044894 0.0049256 0.0051382 0.0089522 0.0112186 0.0173256 0.0182468 0.0214142 0.0348822 0.0372105 0.0593347 0.0677269 0.0833666 0.0972602 0.1242184 0.1262680 0.1305448 0.1339154 0.1600080 0.1867280 0.2508075 0.2654499 0.2862585 0.3050519 0.3260561 0.3375865 0.3526422 0.3968355 0.4198807 0.4312955 0.5114984 0.5450916 0.6291716 0.6359574 0.7072256 0.7679396 0.8004074 0.8344406 0.8471896 0.8643175 0.8954794 0.9755047 1.0032615 1.0967251 1.1183537 1.1591061 1.1769109 1.1810643 1.2824283 1.2957939 1.4630939 1.5983456 1.6132911 1.6340248 1.6628890 1.7843851 1.8232166 1.8740977 1.9095681 2.0112923 2.0938802 2.2380734 2.2746990 2.4005607 2.5542642 2.7095562 2.7570388 2.8569970 2.9405787 3.0697502 3.1498018 3.2113038 3.3155935 3.5765876 3.7229701 3.7661554 3.8312041 4.0052091 4.0767104 4.1794454 4.4055961 4.7101690 4.7728204 4.8821598 4.9455733 5.1224522 5.2115650 5.7196706 5.8086728 5.8864101 5.9601907 6.1596016 6.2919038 6.4574505 6.5433727 6.6464138 6.8953763 6.9980330 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034333 0.0034338 0.0034338 0.0034340 0.0034342 6.5239981 7.1809026 7.2759556 7.6212333 7.7839429 10.2744764 11.5017461 14.2935136 14.6685954 15.8907999 20.2813761 20.9472952 26.4514540 28.2602355 31.3538851 33.8659256 38.2726292 38.5870810 39.2351202 39.7384167 43.4376353 46.9245439 54.3832941 55.9482573 58.0997806 59.9766390 62.0071061 63.0939610 64.4855556 68.4069964 70.3652518 71.3153016 77.6635841 80.1733480 86.1350342 86.5982855 91.3217593 95.1609571 97.1517955 99.1957336 99.9506435 100.9559504 102.7597570 107.2531244 108.7683027 113.7219168 114.8378037 116.9114056 117.8059095 118.0136002 122.9735809 123.6127432 131.3503957 137.2873838 137.9277476 138.8112303 140.0318764 145.0572964 146.6271564 148.6590643 150.0592794 154.0043096 157.1343733 162.4547597 163.7786371 168.2486664 173.5514276 178.7493034 180.3087153 183.5482188 186.2137246 190.2596950 192.7244855 194.5969263 197.7315284 205.3665539 209.5270289 210.7387504 212.5508897 217.3240932 219.2553553 222.0008346 227.9279694 235.6750044 237.2372201 239.9392372 241.4924740 245.7730376 247.9016162 259.7052851 261.7180863 263.4635492 265.1095411 269.5079566 272.3869631 275.9470929 277.7768892 279.9554763 285.1505844 287.2653689 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4306 Rtb_to_modes> Number of blocs = 182 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6094E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3729E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4894E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9256E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1382E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9522E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1219E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7326E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8247E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1414E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4882E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7210E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9335E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7727E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3367E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7260E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8004 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8955 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.118 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.177 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.296 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.663 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.823 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.179 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.809 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.543 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.646 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.895 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.998 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1092 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 0.99996 1.00001 1.00004 1.00002 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00007 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99995 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 77508 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 0.99996 1.00001 1.00004 1.00002 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00007 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99995 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 241118155317566920.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 241118155317566920.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 241118155317566920.atom Openam> file on opening on unit 11: 241118155317566920.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 542 First residue number = 1 Last residue number = 271 Number of atoms found = 4306 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6094E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3729E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4894E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9256E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1382E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9522E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1219E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7326E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8247E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1414E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4882E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7210E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9335E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7727E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3367E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7260E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3526 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8004 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8955 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.118 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.177 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.823 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.179 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.809 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.543 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.646 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.895 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.998 Bfactors> 106 vectors, 12918 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.003609 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.478 for 542 C-alpha atoms. Bfactors> = 6.468 +/- 18.84 Bfactors> = 72.843 +/- 26.74 Bfactors> Shiftng-fct= 66.375 Bfactors> Scaling-fct= 1.419 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 241118155317566920.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 241118155317566920.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.621 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 4306 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 54 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 241118155317566920.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 241118155317566920.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 241118155317566920 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 241118155317566920 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed structure for DQ=0 241118155317566920.eigenfacs 241118155317566920.atom calculating perturbed 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