*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2411141154122814629.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2411141154122814629.atom to be opened.
Openam> File opened: 2411141154122814629.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 388
First residue number = 23
Last residue number = 119
Number of atoms found = 2820
Mean number per residue = 7.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 72.189935 +/- 11.216919 From: 43.568000 To: 96.625000
= 26.599682 +/- 10.748912 From: 0.976000 To: 52.231000
= 19.898374 +/- 13.557813 From: -6.410000 To: 55.766000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.9667 % Filled.
Pdbmat> 1061789 non-zero elements.
Pdbmat> 116121 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.36 +/- 22.63
Maximum number = 127
Minimum number = 18
Pdbmat> Matrix trace = 2.322420E+06
Pdbmat> Larger element = 498.000
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
388 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2411141154122814629.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2411141154122814629.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2411141154122814629.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2820 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 388 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 10 atoms in block 3
Block first atom: 38
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 10 atoms in block 5
Block first atom: 57
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 67
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 81
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 97
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 112
Blocpdb> 13 atoms in block 10
Block first atom: 127
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 140
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 150
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 170
Blocpdb> 13 atoms in block 14
Block first atom: 182
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 195
Blocpdb> 9 atoms in block 16
Block first atom: 215
Blocpdb> 11 atoms in block 17
Block first atom: 224
Blocpdb> 14 atoms in block 18
Block first atom: 235
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 249
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 264
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 283
Blocpdb> 13 atoms in block 22
Block first atom: 295
Blocpdb> 28 atoms in block 23
Block first atom: 308
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 336
Blocpdb> 12 atoms in block 25
Block first atom: 349
Blocpdb> 12 atoms in block 26
Block first atom: 361
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 373
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 387
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 403
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 415
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 435
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 449
Blocpdb> 18 atoms in block 33
Block first atom: 464
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 482
Blocpdb> 12 atoms in block 35
Block first atom: 499
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 511
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 525
Blocpdb> 12 atoms in block 38
Block first atom: 540
Blocpdb> 12 atoms in block 39
Block first atom: 552
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 564
Blocpdb> 15 atoms in block 41
Block first atom: 577
Blocpdb> 15 atoms in block 42
Block first atom: 592
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 607
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 619
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 632
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 644
Blocpdb> 11 atoms in block 47
Block first atom: 669
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 680
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 697
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 706
Blocpdb> 24 atoms in block 51
Block first atom: 719
Blocpdb> 10 atoms in block 52
Block first atom: 743
Blocpdb> 9 atoms in block 53
Block first atom: 753
Blocpdb> 10 atoms in block 54
Block first atom: 762
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 772
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 786
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 802
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 817
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 832
Blocpdb> 10 atoms in block 60
Block first atom: 845
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 855
Blocpdb> 12 atoms in block 62
Block first atom: 875
Blocpdb> 13 atoms in block 63
Block first atom: 887
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 900
Blocpdb> 9 atoms in block 65
Block first atom: 920
Blocpdb> 11 atoms in block 66
Block first atom: 929
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 940
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 954
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 969
Blocpdb> 12 atoms in block 70
Block first atom: 988
Blocpdb> 13 atoms in block 71
Block first atom: 1000
Blocpdb> 28 atoms in block 72
Block first atom: 1013
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1041
Blocpdb> 12 atoms in block 74
Block first atom: 1054
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1066
Blocpdb> 14 atoms in block 76
Block first atom: 1078
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1092
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1108
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1120
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1140
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1154
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 1169
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1187
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1204
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1216
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1230
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1245
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1257
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1269
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1282
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1297
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1312
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1324
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1337
Blocpdb> 25 atoms in block 95
Block first atom: 1349
Blocpdb> 11 atoms in block 96
Block first atom: 1374
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1385
Blocpdb> 9 atoms in block 98
Block first atom: 1402
Blocpdb> 13 atoms in block 99
Block first atom: 1411
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 1424
Blocpdb> 10 atoms in block 101
Block first atom: 1448
Blocpdb> 9 atoms in block 102
Block first atom: 1458
Blocpdb> 10 atoms in block 103
Block first atom: 1467
Blocpdb> 14 atoms in block 104
Block first atom: 1477
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1491
Blocpdb> 15 atoms in block 106
Block first atom: 1507
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1522
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1537
Blocpdb> 10 atoms in block 109
Block first atom: 1550
Blocpdb> 20 atoms in block 110
Block first atom: 1560
Blocpdb> 12 atoms in block 111
Block first atom: 1580
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1592
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 1605
Blocpdb> 9 atoms in block 114
Block first atom: 1625
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 1634
Blocpdb> 14 atoms in block 116
Block first atom: 1645
Blocpdb> 15 atoms in block 117
Block first atom: 1659
Blocpdb> 19 atoms in block 118
Block first atom: 1674
Blocpdb> 12 atoms in block 119
Block first atom: 1693
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1705
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 1718
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1746
Blocpdb> 12 atoms in block 123
Block first atom: 1759
Blocpdb> 12 atoms in block 124
Block first atom: 1771
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 1783
Blocpdb> 16 atoms in block 126
Block first atom: 1797
Blocpdb> 12 atoms in block 127
Block first atom: 1813
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 1825
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 1845
Blocpdb> 15 atoms in block 130
Block first atom: 1859
Blocpdb> 18 atoms in block 131
Block first atom: 1874
Blocpdb> 17 atoms in block 132
Block first atom: 1892
Blocpdb> 12 atoms in block 133
Block first atom: 1909
Blocpdb> 14 atoms in block 134
Block first atom: 1921
Blocpdb> 15 atoms in block 135
Block first atom: 1935
Blocpdb> 12 atoms in block 136
Block first atom: 1950
Blocpdb> 12 atoms in block 137
Block first atom: 1962
Blocpdb> 13 atoms in block 138
Block first atom: 1974
Blocpdb> 15 atoms in block 139
Block first atom: 1987
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2002
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2017
Blocpdb> 13 atoms in block 142
Block first atom: 2029
Blocpdb> 12 atoms in block 143
Block first atom: 2042
Blocpdb> 25 atoms in block 144
Block first atom: 2054
Blocpdb> 11 atoms in block 145
Block first atom: 2079
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2090
Blocpdb> 9 atoms in block 147
Block first atom: 2107
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2116
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 2129
Blocpdb> 10 atoms in block 150
Block first atom: 2153
Blocpdb> 9 atoms in block 151
Block first atom: 2163
Blocpdb> 10 atoms in block 152
Block first atom: 2172
Blocpdb> 14 atoms in block 153
Block first atom: 2182
Blocpdb> 16 atoms in block 154
Block first atom: 2196
Blocpdb> 15 atoms in block 155
Block first atom: 2212
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2227
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2242
Blocpdb> 10 atoms in block 158
Block first atom: 2255
Blocpdb> 20 atoms in block 159
Block first atom: 2265
Blocpdb> 12 atoms in block 160
Block first atom: 2285
Blocpdb> 13 atoms in block 161
Block first atom: 2297
Blocpdb> 20 atoms in block 162
Block first atom: 2310
Blocpdb> 9 atoms in block 163
Block first atom: 2330
Blocpdb> 11 atoms in block 164
Block first atom: 2339
Blocpdb> 14 atoms in block 165
Block first atom: 2350
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 2364
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 2379
Blocpdb> 12 atoms in block 168
Block first atom: 2398
Blocpdb> 13 atoms in block 169
Block first atom: 2410
Blocpdb> 28 atoms in block 170
Block first atom: 2423
Blocpdb> 13 atoms in block 171
Block first atom: 2451
Blocpdb> 12 atoms in block 172
Block first atom: 2464
Blocpdb> 12 atoms in block 173
Block first atom: 2476
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2488
Blocpdb> 16 atoms in block 175
Block first atom: 2502
Blocpdb> 12 atoms in block 176
Block first atom: 2518
Blocpdb> 20 atoms in block 177
Block first atom: 2530
Blocpdb> 14 atoms in block 178
Block first atom: 2550
Blocpdb> 15 atoms in block 179
Block first atom: 2564
Blocpdb> 18 atoms in block 180
Block first atom: 2579
Blocpdb> 17 atoms in block 181
Block first atom: 2597
Blocpdb> 12 atoms in block 182
Block first atom: 2614
Blocpdb> 14 atoms in block 183
Block first atom: 2626
Blocpdb> 15 atoms in block 184
Block first atom: 2640
Blocpdb> 12 atoms in block 185
Block first atom: 2655
Blocpdb> 12 atoms in block 186
Block first atom: 2667
Blocpdb> 13 atoms in block 187
Block first atom: 2679
Blocpdb> 15 atoms in block 188
Block first atom: 2692
Blocpdb> 15 atoms in block 189
Block first atom: 2707
Blocpdb> 12 atoms in block 190
Block first atom: 2722
Blocpdb> 13 atoms in block 191
Block first atom: 2734
Blocpdb> 12 atoms in block 192
Block first atom: 2747
Blocpdb> 25 atoms in block 193
Block first atom: 2759
Blocpdb> 11 atoms in block 194
Block first atom: 2784
Blocpdb> 17 atoms in block 195
Block first atom: 2795
Blocpdb> 9 atoms in block 196
Block first atom: 2811
Blocpdb> 196 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1061985 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8460
Prepmat> Matrix trace = 2322420.0000
Prepmat> Last element read: 8460 8460 134.7210
Prepmat> 19307 lines saved.
Prepmat> 17175 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2820
RTB> Total mass = 2820.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2820
RTB> Number of blocks = 196
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 275111.5577
RTB> 73776 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1176
Diagstd> Nb of non-zero elements: 73776
Diagstd> Projected matrix trace = 275111.5577
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1176 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 275111.5577
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.0031056 3.6974040 3.7097540 3.7452431
5.6948047 6.3624113 6.3948010 6.5410495 7.5901301
7.6765727 7.6898528 8.0049001 8.1449440 8.5593272
8.5809540 9.2595814 9.8686836 9.8961032 10.0184032
10.0716266 11.8801879 12.5713447 12.5915770 13.3342851
13.7341530 15.3491252 15.5154811 16.1047755 18.3780344
18.4844075 20.0362506 20.3219137 21.3883782 21.7652713
22.7983782 23.4767087 23.5928295 23.6306835 23.7684269
25.4809683 25.5633728 25.6120472 26.3012629 26.4683364
26.4998752 27.5397129 29.6278671 30.2505152 30.3176618
30.3880620 31.5585441 33.2022029 33.4340685 33.9200059
34.6970015 35.2780483 35.8024277 35.8808913 36.6994830
36.8420839 37.7548020 38.4263899 38.5959737 39.6793233
39.7176552 41.1037043 41.3810354 41.7009396 41.8494452
43.3807251 43.4956955 43.7485131 44.2308468 44.8078488
44.8895642 45.7468439 46.0127704 46.7068220 48.6685300
48.9885827 49.0634454 49.2696576 51.8267453 52.2927095
52.6985664 52.7545565 53.9159566 54.0290208 54.8000329
55.0730904 56.6408350 56.7004998 57.3367358 57.6150576
58.7432067 58.8231820 59.8288565 59.9206052 60.9540572
61.0361308
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034328 0.0034338 0.0034342 0.0034350
0.0034355 153.6905637 208.8063655 209.1548005 210.1528503
259.1401455 273.9089041 274.6052258 277.7275732 299.1712745
300.8700544 301.1301875 307.2368036 309.9126695 317.6984482
318.0995587 330.4387399 341.1339114 341.6074929 343.7118729
344.6236589 374.2888888 385.0225332 385.3322372 396.5337415
402.4354418 425.4387993 427.7380674 435.7853419 465.5269312
466.8722355 486.0752494 489.5280496 502.2086718 506.6141581
518.4982050 526.1552233 527.4548558 527.8778292 529.4140952
548.1548289 549.0404695 549.5629259 556.9081601 558.6741841
559.0069335 569.8689373 591.0789242 597.2575770 597.9200712
598.6138798 610.0336054 625.7181175 627.8991486 632.4456936
639.6483040 644.9819416 649.7578255 650.4694308 657.8475377
659.1243774 667.2389325 673.1472451 674.6309810 684.0335589
684.3638817 696.2027937 698.5475229 701.2424537 702.4899781
715.2266425 716.1737855 718.2521405 722.2007038 726.8960810
727.5585934 734.4730231 736.6046763 742.1393156 757.5641157
760.0509706 760.6314908 762.2282700 781.7578457 785.2642980
788.3057249 788.7243857 797.3590680 798.1946796 803.8697567
805.8700284 817.2597373 817.6900698 822.2649206 824.2582079
832.2889050 832.8552681 839.9445787 840.5883674 847.8062022
848.3767882
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2820
Rtb_to_modes> Number of blocs = 196
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.003
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.697
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.710
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.745
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.695
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.362
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.395
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.590
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.677
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.005
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.145
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.581
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.869
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.896
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.04
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996
0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 50760 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996
0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2411141154122814629.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2411141154122814629.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2411141154122814629.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2411141154122814629.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 388
First residue number = 23
Last residue number = 119
Number of atoms found = 2820
Mean number per residue = 7.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.697
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.745
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.695
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.362
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.677
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.005
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.896
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.04
Bfactors> 106 vectors, 8460 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.003000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.466 for 388 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.029 +/- 0.04
Bfactors> = 89.810 +/- 37.87
Bfactors> Shiftng-fct= 89.781
Bfactors> Scaling-fct= 999.655
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2411141154122814629.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2411141154122814629.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.4
Chkmod> 106 vectors, 8460 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2820 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8637
0.0034 0.9294
0.0034 0.6827
0.0034 0.7872
0.0034 0.7363
0.0034 0.7668
153.6799 0.4766
208.7860 0.4937
209.1528 0.5169
210.1370 0.4894
259.1335 0.4777
273.8883 0.5268
274.5977 0.5392
277.7146 0.1468
299.1559 0.4653
300.8655 0.3452
301.1201 0.3480
307.2255 0.3763
309.9004 0.0394
317.6787 0.4802
318.0868 0.4680
330.4320 0.5591
341.1247 0.2739
341.5910 0.2058
343.7245 0.7072
344.5810 0.2272
374.2699 0.4713
384.9854 0.3317
385.2916 0.3345
396.4530 0.5685
402.3573 0.3844
425.4327 0.3718
427.7820 0.3919
435.7020 0.6068
465.5318 0.4241
466.7965 0.3912
486.0999 0.0511
489.4840 0.1641
502.2062 0.4807
506.6474 0.4149
518.4944 0.0634
526.1695 0.0284
527.4006 0.2870
527.8475 0.1703
529.4089 0.3082
548.1209 0.4344
548.9807 0.3673
549.5174 0.4176
556.8709 0.2179
558.6678 0.4530
558.9843 0.4255
569.8474 0.5694
591.0748 0.5068
597.2269 0.3753
597.9175 0.3755
598.6073 0.4086
610.0215 0.2678
625.6705 0.2813
627.8340 0.2848
632.4185 0.3293
639.6485 0.3364
644.9721 0.3732
649.7079 0.3955
650.4334 0.3960
657.8239 0.4270
659.0774 0.4305
667.1679 0.3521
673.1500 0.2850
674.6372 0.3916
684.0100 0.4345
684.3547 0.4553
696.1415 0.4929
698.5088 0.3504
701.2045 0.3212
702.4645 0.3159
715.1900 0.3313
716.1785 0.4087
718.2335 0.3171
722.1628 0.4617
726.8823 0.2740
727.5309 0.3351
734.4668 0.3936
736.5509 0.3719
742.1327 0.4970
757.5430 0.3766
760.0293 0.6293
760.5721 0.3843
762.1982 0.3654
781.7488 0.3054
785.2102 0.4267
788.2826 0.4362
788.6565 0.4256
797.3547 0.4712
798.1676 0.4755
803.8350 0.3044
805.8128 0.1772
817.2186 0.4867
817.6514 0.3697
822.2530 0.2673
824.2582 0.2865
832.2305 0.3828
832.7970 0.4336
839.9165 0.4766
840.5480 0.4774
847.7416 0.4976
848.3673 0.4707
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2411141154122814629 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
making animated gifs
11 models are in 2411141154122814629.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2411141154122814629 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
making animated gifs
11 models are in 2411141154122814629.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2411141154122814629 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
making animated gifs
11 models are in 2411141154122814629.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2411141154122814629 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
making animated gifs
11 models are in 2411141154122814629.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2411141154122814629 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2411141154122814629.eigenfacs
2411141154122814629.atom
making animated gifs
11 models are in 2411141154122814629.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2411141154122814629.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2411141154122814629.10.pdb
2411141154122814629.11.pdb
2411141154122814629.7.pdb
2411141154122814629.8.pdb
2411141154122814629.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m23.663s
user 0m23.594s
sys 0m0.036s
rm: cannot remove '2411141154122814629.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
