CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  HYDROLASE 16-OCT-20 7AP7  ***

LOGs for ID: 2407290648321926925

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2407290648321926925.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2407290648321926925.atom to be opened. Openam> File opened: 2407290648321926925.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 130 First residue number = 1 Last residue number = 130 Number of atoms found = 2151 Mean number per residue = 16.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 4.356284 +/- 7.816240 From: -14.231000 To: 23.315000 = -13.380762 +/- 8.074169 From: -31.146000 To: 5.397000 = -15.340462 +/- 8.412499 From: -38.348000 To: 3.165000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 7.8023 % Filled. Pdbmat> 1624740 non-zero elements. Pdbmat> 179126 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 166.55 +/- 54.19 Maximum number = 276 Minimum number = 30 Pdbmat> Matrix trace = 3.582520E+06 Pdbmat> Larger element = 1019.65 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 130 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2407290648321926925.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2407290648321926925.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2407290648321926925.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2151 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 130 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 20 atoms in block 3 Block first atom: 41 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 61 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 76 Blocpdb> 10 atoms in block 6 Block first atom: 100 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 110 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 125 Blocpdb> 10 atoms in block 9 Block first atom: 144 Blocpdb> 43 atoms in block 10 Block first atom: 154 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 197 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 211 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 230 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 252 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 276 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 295 Blocpdb> 29 atoms in block 17 Block first atom: 302 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 331 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 343 Blocpdb> 21 atoms in block 20 Block first atom: 350 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 371 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 414 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 421 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 440 Blocpdb> 32 atoms in block 25 Block first atom: 451 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 483 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 493 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 507 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 531 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 548 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 568 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 587 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 597 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 619 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 643 Blocpdb> 11 atoms in block 36 Block first atom: 658 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 669 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 676 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 697 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 711 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 725 Blocpdb> 10 atoms in block 42 Block first atom: 749 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 759 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 773 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 787 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 808 Blocpdb> 10 atoms in block 47 Block first atom: 822 Blocpdb> 7 atoms in block 48 Block first atom: 832 Blocpdb> 12 atoms in block 49 Block first atom: 839 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 851 Blocpdb> 11 atoms in block 51 Block first atom: 875 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 886 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 900 Blocpdb> 21 atoms in block 54 Block first atom: 912 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 933 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 940 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 959 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 979 Blocpdb> 33 atoms in block 59 Block first atom: 996 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 1029 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 1043 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 1054 Blocpdb> 21 atoms in block 63 Block first atom: 1078 Blocpdb> 24 atoms in block 64 Block first atom: 1099 Blocpdb> 10 atoms in block 65 Block first atom: 1123 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1133 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1147 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 1159 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1166 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1188 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1202 Blocpdb> 7 atoms in block 72 Block first atom: 1216 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1223 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1233 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1249 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1263 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1273 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 1283 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1314 Blocpdb> 11 atoms in block 80 Block first atom: 1333 Blocpdb> 10 atoms in block 81 Block first atom: 1344 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1354 Blocpdb> 10 atoms in block 83 Block first atom: 1370 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1380 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1399 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1418 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1435 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1447 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1461 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1480 Blocpdb> 12 atoms in block 91 Block first atom: 1490 Blocpdb> 10 atoms in block 92 Block first atom: 1502 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1512 Blocpdb> 10 atoms in block 94 Block first atom: 1528 Blocpdb> 10 atoms in block 95 Block first atom: 1538 Blocpdb> 10 atoms in block 96 Block first atom: 1548 Blocpdb> 22 atoms in block 97 Block first atom: 1558 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 1580 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1604 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1620 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 1636 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1660 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1672 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1686 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 1703 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 1710 Blocpdb> 43 atoms in block 107 Block first atom: 1729 Blocpdb> 10 atoms in block 108 Block first atom: 1772 Blocpdb> 24 atoms in block 109 Block first atom: 1782 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1806 Blocpdb> 10 atoms in block 111 Block first atom: 1822 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 1832 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 1856 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1880 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 1894 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1918 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1933 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1950 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 1964 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1988 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 2000 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2016 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 2040 Blocpdb> 21 atoms in block 124 Block first atom: 2057 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 2078 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 2094 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 2111 Blocpdb> 10 atoms in block 128 Block first atom: 2118 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 2128 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2134 Blocpdb> 130 blocks. Blocpdb> At most, 43 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1624870 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6453 Prepmat> Matrix trace = 3582520.0000 Prepmat> Last element read: 6453 6453 578.3414 Prepmat> 8516 lines saved. Prepmat> 6632 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2151 RTB> Total mass = 2151.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2151 RTB> Number of blocks = 130 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 393784.5178 RTB> 65838 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 780 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65838 Diagstd> Projected matrix trace = 393784.5178 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 780 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 393784.5178 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.4712230 10.8716776 18.8736131 26.1562319 28.0241298 34.3905565 36.8056070 44.2961359 45.7726790 48.0056278 51.4636608 55.5107280 60.3972890 62.7769572 64.1605298 65.6224668 69.6053865 72.5465962 75.1623166 77.5631291 80.5376563 86.2012486 86.7463817 90.2838517 92.0361907 93.2290499 95.2979027 99.0663149 99.9384092 101.0410826 103.7831530 108.3730713 110.2450869 113.2476434 114.7932018 116.7234012 118.3044229 121.4025109 124.8671925 125.1840210 126.7207981 130.1786687 130.7800269 133.0868009 137.3418880 138.7221817 139.6253220 142.2874320 144.1448418 146.2018791 147.7213599 151.1744618 151.7478640 153.5647783 155.7338057 159.6876111 160.8987613 162.5640287 164.7525038 165.8354571 167.3139179 169.8090780 171.8989995 172.7731725 174.4007449 175.5367960 177.7282261 181.4294168 182.6081365 184.9942372 186.5714082 188.0757479 188.7902784 190.2373856 192.0607527 192.2532528 197.1643748 198.4257048 200.3829512 202.0759336 202.8269239 204.5508609 205.1075733 207.8424783 208.5878026 209.5154908 210.2105886 211.8511912 212.4913343 215.5327907 215.6869588 218.8306353 220.3877441 221.8604704 222.6154886 224.7919943 226.3280220 226.9586705 228.8908568 230.0680326 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034329 0.0034336 0.0034338 0.0034352 0.0034354 296.8186127 358.0499047 471.7618358 555.3705799 574.8590172 636.8173423 658.7980007 722.7335270 734.6803874 752.3871281 779.0146381 809.0656103 843.9252926 860.3901128 869.8197230 879.6735953 905.9760250 924.9192123 941.4458792 956.3633860 974.5290146 1008.2124560 1011.3953783 1031.8113947 1041.7765993 1048.5059742 1060.0758764 1080.8322242 1085.5791569 1091.5516130 1106.2638237 1130.4620071 1140.1838951 1155.6062101 1163.4651120 1173.2059242 1181.1247524 1196.4901145 1213.4432043 1214.9816785 1222.4165751 1238.9825597 1241.8409921 1252.7452744 1272.6142645 1278.9932001 1283.1498399 1295.3244133 1303.7515363 1313.0212584 1319.8267574 1335.1636371 1337.6933669 1345.6778031 1355.1480003 1372.2425834 1377.4366386 1384.5463753 1393.8347634 1398.4082464 1404.6279782 1415.0628591 1423.7441571 1427.3597115 1434.0670196 1438.7302130 1447.6830293 1462.6793581 1467.4230699 1476.9792029 1483.2618444 1489.2296663 1492.0558978 1497.7634032 1504.9240877 1505.6780820 1524.7881326 1529.6576606 1537.1833245 1543.6632935 1546.5290504 1553.0875421 1555.1995733 1565.5337563 1568.3382510 1571.8219512 1574.4271649 1580.5590848 1582.9452432 1594.2335936 1594.8036600 1606.3838931 1612.0889458 1617.4663155 1620.2161953 1628.1173351 1633.6704150 1635.9448904 1642.8938454 1647.1130937 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2151 Rtb_to_modes> Number of blocs = 130 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9889E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.471 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 167.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 171.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 181.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 190.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 197.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 200.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 202.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 202.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 204.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 205.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 207.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 209.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 210.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 211.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 212.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 215.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 215.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 218.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 220.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 221.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 222.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 224.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 226.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 227.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 228.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 230.1 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 780 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00005 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 38718 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00005 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407290648321926925.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407290648321926925.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2407290648321926925.atom Openam> file on opening on unit 11: 2407290648321926925.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 130 First residue number = 1 Last residue number = 130 Number of atoms found = 2151 Mean number per residue = 16.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9889E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.471 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 210.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 222.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 226.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 228.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 230.1 Bfactors> 106 vectors, 6453 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.471000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.319 for 138 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 13.044 +/- 3.53 Bfactors> Shiftng-fct= 13.037 Bfactors> Scaling-fct= 438.677 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407290648321926925.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407290648321926925.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1239. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1272. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1313. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1320. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1335. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1337. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1346. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1372. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1377. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1385. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1398. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1405. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1415. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1424. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1439. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1448. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1462. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1467. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1477. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1483. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1489. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1492. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1498. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1506. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1525. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1529. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1537. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1544. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1546. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1553. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1555. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1565. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1568. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1572. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1574. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1581. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1583. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1594. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1595. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1606. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1612. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1618. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1620. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1628. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1633. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1636. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1643. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1647. Chkmod> 106 vectors, 6453 coordinates in file. Chkmod> That is: 2151 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8351 0.0034 0.9747 0.0034 0.8744 0.0034 0.7772 0.0034 0.7991 0.0034 0.7378 296.8014 0.3704 358.0069 0.4611 471.6964 0.3214 555.3867 0.3499 574.7920 0.4647 636.7849 0.4191 658.8090 0.5879 722.7340 0.1598 734.6273 0.3632 752.3891 0.3665 778.9535 0.2293 809.0256 0.4045 843.9080 0.4057 860.3740 0.3386 869.7788 0.3563 879.6193 0.3336 905.9672 0.4542 924.9012 0.4587 941.3910 0.4477 956.3030 0.3933 974.5014 0.3136 1008.1619 0.3486 1011.3731 0.6217 1031.7451 0.5244 1041.7534 0.3973 1048.4663 0.4161 1060.0420 0.3278 1080.8059 0.3972 1085.5412 0.3165 1091.2828 0.4096 1106.3061 0.2737 1130.5539 0.2890 1139.9018 0.3125 1155.3135 0.2148 1163.4496 0.3355 1173.0380 0.2814 1181.0520 0.2910 1196.4264 0.1457 1213.5505 0.2855 1215.0071 0.3239 1222.2638 0.2307 1239.0309 0.1899 1241.8825 0.3148 1252.7536 0.3679 1272.3656 0.2165 1278.8360 0.2750 1282.9784 0.3055 1295.3260 0.3266 1303.4928 0.2481 1312.9565 0.2902 1319.6747 0.2866 1335.2191 0.3251 1337.4250 0.3223 1345.7743 0.4022 1354.9427 0.4130 1372.2369 0.3298 1377.3828 0.4538 1384.6401 0.3663 1393.9758 0.4194 1398.1987 0.5599 1404.5093 0.4770 1414.9643 0.4096 1423.6872 0.0820 1427.4092 0.1363 1434.0024 0.4573 1438.5177 0.2992 1447.5059 0.3631 1462.4980 0.3307 1467.3274 0.3136 1476.9388 0.2661 1483.3118 0.2571 1489.2617 0.2877 1492.0303 0.3623 1497.5519 0.2945 1505.0132 0.3121 1505.7965 0.1724 1524.8604 0.3919 1529.4929 0.3781 1537.1827 0.3447 1543.6889 0.3682 1546.3600 0.2889 1553.2074 0.1266 1555.1041 0.3351 1565.3066 0.1691 1568.3168 0.1378 1571.6964 0.3741 1574.3199 0.3828 1580.6733 0.2965 1582.9096 0.2325 1594.0439 0.4288 1594.7834 0.3142 1606.2025 0.4310 1612.0646 0.3762 1617.5410 0.2704 1620.0903 0.3824 1628.0764 0.3145 1633.4992 0.2789 1636.0236 0.3342 1642.8561 0.3351 1647.1568 0.2857 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2407290648321926925 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom making animated gifs 11 models are in 2407290648321926925.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2407290648321926925 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom making animated gifs 11 models are in 2407290648321926925.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2407290648321926925 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom making animated gifs 11 models are in 2407290648321926925.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2407290648321926925 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom making animated gifs 11 models are in 2407290648321926925.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2407290648321926925 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407290648321926925.eigenfacs 2407290648321926925.atom making animated gifs 11 models are in 2407290648321926925.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407290648321926925.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2407290648321926925.10.pdb 2407290648321926925.11.pdb 2407290648321926925.7.pdb 2407290648321926925.8.pdb 2407290648321926925.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m8.821s user 0m8.788s sys 0m0.032s rm: cannot remove '2407290648321926925.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.