*** HYDROLASE 05-JAN-98 1JSF ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2407241007361079528.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2407241007361079528.atom to be opened.
Openam> File opened: 2407241007361079528.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 130
First residue number = 1
Last residue number = 130
Number of atoms found = 2016
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 13.304554 +/- 8.113872 From: -5.072000 To: 31.633000
= 14.913311 +/- 8.446747 From: -8.511000 To: 33.683000
= 28.151463 +/- 7.929165 From: 9.483000 To: 46.698000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 7.6822 % Filled.
Pdbmat> 1405234 non-zero elements.
Pdbmat> 154817 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 153.59 +/- 47.27
Maximum number = 241
Minimum number = 34
Pdbmat> Matrix trace = 3.096340E+06
Pdbmat> Larger element = 862.798
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
130 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2407241007361079528.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2407241007361079528.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2407241007361079528.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2016 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 130 residues.
Blocpdb> 24 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 25
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 41
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 61
Blocpdb> 24 atoms in block 5
Block first atom: 76
Blocpdb> 10 atoms in block 6
Block first atom: 100
Blocpdb> 15 atoms in block 7
Block first atom: 110
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 125
Blocpdb> 10 atoms in block 9
Block first atom: 144
Blocpdb> 24 atoms in block 10
Block first atom: 154
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 178
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 192
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 211
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 233
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 257
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 276
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 283
Blocpdb> 12 atoms in block 18
Block first atom: 300
Blocpdb> 7 atoms in block 19
Block first atom: 312
Blocpdb> 21 atoms in block 20
Block first atom: 319
Blocpdb> 24 atoms in block 21
Block first atom: 340
Blocpdb> 7 atoms in block 22
Block first atom: 364
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 371
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 390
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 401
Blocpdb> 10 atoms in block 26
Block first atom: 420
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 444
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 468
Blocpdb> 10 atoms in block 30
Block first atom: 485
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 495
Blocpdb> 10 atoms in block 32
Block first atom: 514
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 524
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 546
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 570
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 585
Blocpdb> 7 atoms in block 37
Block first atom: 596
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 603
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 624
Blocpdb> 14 atoms in block 40
Block first atom: 638
Blocpdb> 24 atoms in block 41
Block first atom: 652
Blocpdb> 10 atoms in block 42
Block first atom: 676
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 686
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 700
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 714
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 735
Blocpdb> 10 atoms in block 47
Block first atom: 749
Blocpdb> 7 atoms in block 48
Block first atom: 759
Blocpdb> 12 atoms in block 49
Block first atom: 766
Blocpdb> 24 atoms in block 50
Block first atom: 778
Blocpdb> 11 atoms in block 51
Block first atom: 802
Blocpdb> 14 atoms in block 52
Block first atom: 813
Blocpdb> 12 atoms in block 53
Block first atom: 827
Blocpdb> 21 atoms in block 54
Block first atom: 839
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 860
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 867
Blocpdb> 20 atoms in block 57
Block first atom: 881
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 901
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 918
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 937
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 951
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 962
Blocpdb> 21 atoms in block 63
Block first atom: 986
Blocpdb> 24 atoms in block 64
Block first atom: 1007
Blocpdb> 10 atoms in block 65
Block first atom: 1031
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1041
Blocpdb> 12 atoms in block 67
Block first atom: 1055
Blocpdb> 7 atoms in block 68
Block first atom: 1067
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1074
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1096
Blocpdb> 14 atoms in block 71
Block first atom: 1110
Blocpdb> 7 atoms in block 72
Block first atom: 1124
Blocpdb> 10 atoms in block 73
Block first atom: 1131
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1141
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1157
Blocpdb> 10 atoms in block 76
Block first atom: 1171
Blocpdb> 10 atoms in block 77
Block first atom: 1181
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1191
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1208
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1227
Blocpdb> 10 atoms in block 81
Block first atom: 1238
Blocpdb> 11 atoms in block 82
Block first atom: 1248
Blocpdb> 10 atoms in block 83
Block first atom: 1259
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1269
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1288
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1307
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1324
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1336
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1350
Blocpdb> 10 atoms in block 90
Block first atom: 1369
Blocpdb> 12 atoms in block 91
Block first atom: 1379
Blocpdb> 10 atoms in block 92
Block first atom: 1391
Blocpdb> 16 atoms in block 93
Block first atom: 1401
Blocpdb> 10 atoms in block 94
Block first atom: 1417
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 1427
Blocpdb> 10 atoms in block 96
Block first atom: 1437
Blocpdb> 22 atoms in block 97
Block first atom: 1447
Blocpdb> 24 atoms in block 98
Block first atom: 1469
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1493
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1509
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 1525
Blocpdb> 12 atoms in block 102
Block first atom: 1549
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 1561
Blocpdb> 17 atoms in block 104
Block first atom: 1575
Blocpdb> 7 atoms in block 105
Block first atom: 1592
Blocpdb> 19 atoms in block 106
Block first atom: 1599
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 1618
Blocpdb> 10 atoms in block 108
Block first atom: 1642
Blocpdb> 24 atoms in block 109
Block first atom: 1652
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1676
Blocpdb> 10 atoms in block 111
Block first atom: 1692
Blocpdb> 24 atoms in block 112
Block first atom: 1702
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 1726
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1750
Blocpdb> 24 atoms in block 115
Block first atom: 1764
Blocpdb> 10 atoms in block 116
Block first atom: 1788
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1798
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1815
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 1829
Blocpdb> 12 atoms in block 120
Block first atom: 1853
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1865
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 1881
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1905
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 1922
Blocpdb> 16 atoms in block 125
Block first atom: 1943
Blocpdb> 17 atoms in block 126
Block first atom: 1959
Blocpdb> 7 atoms in block 127
Block first atom: 1976
Blocpdb> 10 atoms in block 128
Block first atom: 1983
Blocpdb> 7 atoms in block 129
Block first atom: 1993
Blocpdb> 17 atoms in block 130
Block first atom: 1999
Blocpdb> 130 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1405364 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6048
Prepmat> Matrix trace = 3096340.0000
Prepmat> Last element read: 6048 6048 557.5019
Prepmat> 8516 lines saved.
Prepmat> 6625 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2016
RTB> Total mass = 2016.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2016
RTB> Number of blocks = 130
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 365040.6519
RTB> 66090 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 780
Diagstd> Nb of non-zero elements: 66090
Diagstd> Projected matrix trace = 365040.6519
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 780 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 365040.6519
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 7.4743082 11.0792386 18.7819832 24.7454516
27.8816036 34.7769789 37.2517931 41.0101318 45.1058927
48.2224846 51.4112909 52.6084401 54.7819650 61.0881917
63.3366824 64.9052818 65.1311525 69.1488396 75.7000356
77.4323730 79.8146198 80.5802692 85.1066121 86.5681130
88.1630430 92.2927795 93.6030872 99.0733573 99.9956309
101.8885733 105.6631415 106.0453142 109.1215742 110.6296901
111.9801610 114.7274023 116.0605089 118.6139062 120.3261080
120.9988004 123.8508371 126.0412370 128.7032504 130.8454728
132.9960237 136.9541305 138.9881386 139.3027909 143.1034685
144.6184452 146.2747281 147.5803891 150.4907759 151.3414722
153.6042579 154.2421424 156.1292450 157.1571874 157.8602810
158.6639481 162.2789882 163.3849144 165.7487235 168.1415106
168.9030356 172.0826697 173.1147980 174.9415702 175.4499075
177.6957590 178.2106874 180.7994417 182.2922604 183.7527689
187.0048579 188.0547669 189.2693022 190.7038676 192.0770992
193.0413061 195.4686144 195.9082194 197.7988715 198.4339514
200.5589009 201.5445411 202.9888405 204.9266691 206.1963740
207.4348091 208.4780332 209.5631135 211.7252505 212.4275254
213.5464213 214.2716127 216.7971124 217.3765646 219.8648634
220.7453146
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034289 0.0034315 0.0034323 0.0034337 0.0034344
0.0034347 296.8798896 361.4516715 470.6152583 540.1855620
573.3953342 640.3850821 662.7792011 695.4098897 729.3095853
754.0846004 778.6181705 787.6313475 803.7372254 848.7385242
864.2172603 874.8534323 876.3743577 902.9999549 944.8074783
955.5569264 970.1446767 974.7867947 1001.7905519 1010.3556066
1019.6205175 1043.2277794 1050.6071853 1080.8706406 1085.8898972
1096.1197947 1116.2386081 1118.2554461 1134.3591841 1142.1709977
1149.1211659 1163.1316149 1169.8697615 1182.6686491 1191.1740261
1194.4990607 1208.4947093 1219.1344639 1231.9413652 1242.1516789
1252.3179587 1270.8165081 1280.2186499 1281.6669607 1299.0335280
1305.8915879 1313.3483416 1319.1968507 1332.1410795 1335.9009463
1345.8507706 1348.6423858 1356.8674058 1361.3268305 1364.3686007
1367.8371935 1383.3320081 1388.0376864 1398.0425080 1408.0975817
1411.2826672 1424.5045730 1428.7701783 1436.2888546 1438.3740925
1447.5507931 1449.6466389 1460.1377285 1466.1533441 1472.0149687
1484.9838295 1489.1465975 1493.9476199 1499.5986153 1504.9881294
1508.7608417 1518.2168162 1519.9230770 1527.2396303 1529.6894467
1537.8580514 1541.6322969 1547.1462241 1554.5135816 1559.3219497
1563.9976577 1567.9255274 1572.0005780 1580.0892121 1582.7075544
1586.8702897 1589.5624664 1598.9026670 1601.0380032 1610.1754301
1613.3961913
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2016
Rtb_to_modes> Number of blocs = 130
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9707E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 173.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 187.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 190.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 193.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 195.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 195.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 197.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 200.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 201.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 203.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 204.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 206.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 207.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 209.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 211.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 212.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 213.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 214.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 216.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 217.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 219.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 220.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 780 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00006
1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004
1.00003 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999
0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00003
0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99999 0.99996 1.00001
1.00004 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00003 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999
0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99996 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 36288 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00006
1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004
1.00003 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999
0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00003
0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99999 0.99996 1.00001
1.00004 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00003 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999
0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99996 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407241007361079528.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407241007361079528.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2407241007361079528.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407241007361079528.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 130
First residue number = 1
Last residue number = 130
Number of atoms found = 2016
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9707E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 187.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 213.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 219.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.7
Bfactors> 106 vectors, 6048 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.474000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.636 for 130 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.007 +/- 0.01
Bfactors> = 15.959 +/- 5.01
Bfactors> Shiftng-fct= 15.952
Bfactors> Scaling-fct= 620.140
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407241007361079528.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407241007361079528.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4288E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1134.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1280.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1299.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1306.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1313.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1319.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1332.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1346.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1348.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1357.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1368.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1388.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1398.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1411.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1429.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1436.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1448.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1460.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1472.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1485.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1489.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1494.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1500.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1509.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1518.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1520.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1527.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1529.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1538.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1541.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1547.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1554.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1559.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1564.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1568.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1572.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1580.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1583.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1587.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1590.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1599.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1601.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1610.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1613.
Chkmod> 106 vectors, 6048 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2016 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8251
0.0034 0.9665
0.0034 0.7369
0.0034 0.8293
0.0034 0.7369
0.0034 0.9381
296.8610 0.3909
361.4486 0.4741
470.5702 0.3829
540.2120 0.4373
573.3542 0.3474
640.3854 0.5569
662.7348 0.5105
695.3789 0.4973
729.3115 0.3245
754.0328 0.3435
778.5750 0.3886
787.6092 0.2830
803.6883 0.3337
848.7147 0.4383
864.2028 0.3221
874.8477 0.3911
876.3290 0.4338
902.9688 0.4460
944.7667 0.5275
955.5013 0.4377
970.0750 0.5253
974.7433 0.3864
1001.7675 0.3441
1010.3232 0.5540
1019.5592 0.4016
1043.1673 0.4299
1050.5448 0.6277
1080.8059 0.4568
1085.8670 0.3591
1096.1342 0.2887
1116.3854 0.2957
1117.9685 0.4455
1134.1984 0.1407
1141.9687 0.2505
1149.1736 0.2348
1162.9428 0.4186
1170.0185 0.3538
1182.5486 0.0523
1190.9937 0.3602
1194.4537 0.3180
1208.6827 0.1891
1218.8827 0.3396
1231.8729 0.4146
1241.8825 0.3421
1252.2829 0.2039
1270.9747 0.3359
1280.2183 0.3496
1281.5991 0.4070
1298.9620 0.3897
1305.7523 0.4371
1313.4054 0.1915
1319.2279 0.2939
1332.1247 0.3848
1335.6606 0.2999
1345.7743 0.2860
1348.4002 0.3016
1356.6821 0.4192
1361.4538 0.2777
1364.4817 0.3151
1367.9339 0.2646
1383.3622 0.4669
1388.0422 0.1898
1397.7770 0.4280
1407.8633 0.3673
1411.2094 0.2868
1424.5151 0.4655
1428.6478 0.4301
1436.0565 0.3321
1438.1078 0.3912
1447.5059 0.3517
1449.5409 0.4108
1460.0773 0.4593
1466.1215 0.1697
1472.1409 0.3333
1484.9008 0.4888
1489.2617 0.2498
1494.0046 0.2992
1499.5190 0.2455
1505.0132 0.4134
1508.5347 0.1518
1518.2735 0.2840
1519.8259 0.3244
1527.1784 0.3269
1529.4929 0.0808
1537.9496 0.3843
1541.3958 0.4481
1547.1223 0.4303
1554.3457 0.3157
1559.2687 0.1477
1563.7993 0.2653
1567.9408 0.2305
1572.0714 0.3589
1579.9272 0.4239
1582.5371 0.4407
1586.6297 0.1613
1589.5995 0.2351
1598.8447 0.1019
1601.0556 0.4753
1610.2350 0.4226
1613.1613 0.3021
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2407241007361079528 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
making animated gifs
11 models are in 2407241007361079528.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2407241007361079528 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
making animated gifs
11 models are in 2407241007361079528.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2407241007361079528 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
making animated gifs
11 models are in 2407241007361079528.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2407241007361079528 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
making animated gifs
11 models are in 2407241007361079528.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2407241007361079528 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407241007361079528.eigenfacs
2407241007361079528.atom
making animated gifs
11 models are in 2407241007361079528.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407241007361079528.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2407241007361079528.10.pdb
2407241007361079528.11.pdb
2407241007361079528.7.pdb
2407241007361079528.8.pdb
2407241007361079528.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.602s
user 0m8.535s
sys 0m0.044s
rm: cannot remove '2407241007361079528.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
