CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  HYDROLASE 05-JAN-98 1JSF  ***

LOGs for ID: 2407240812061042059

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2407240812061042059.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2407240812061042059.atom to be opened. Openam> File opened: 2407240812061042059.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 130 First residue number = 1 Last residue number = 130 Number of atoms found = 2019 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 13.309573 +/- 8.096700 From: -5.072000 To: 31.633000 = 14.921665 +/- 8.443386 From: -8.511000 To: 33.683000 = 28.141569 +/- 7.926634 From: 9.483000 To: 46.698000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 7.7036 % Filled. Pdbmat> 1413349 non-zero elements. Pdbmat> 155715 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.25 +/- 47.87 Maximum number = 244 Minimum number = 30 Pdbmat> Matrix trace = 3.114300E+06 Pdbmat> Larger element = 872.982 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 130 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2407240812061042059.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2407240812061042059.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2407240812061042059.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2019 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 130 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 20 atoms in block 3 Block first atom: 41 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 61 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 76 Blocpdb> 10 atoms in block 6 Block first atom: 100 Blocpdb> 15 atoms in block 7 Block first atom: 110 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 125 Blocpdb> 10 atoms in block 9 Block first atom: 144 Blocpdb> 24 atoms in block 10 Block first atom: 154 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 178 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 192 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 211 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 233 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 257 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 276 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 283 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 300 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 312 Blocpdb> 21 atoms in block 20 Block first atom: 319 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 340 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 364 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 371 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 390 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 401 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 420 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 430 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 444 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 468 Blocpdb> 10 atoms in block 30 Block first atom: 485 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 495 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 514 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 524 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 546 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 570 Blocpdb> 11 atoms in block 36 Block first atom: 585 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 596 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 603 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 624 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 638 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 652 Blocpdb> 10 atoms in block 42 Block first atom: 676 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 686 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 700 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 714 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 735 Blocpdb> 10 atoms in block 47 Block first atom: 749 Blocpdb> 7 atoms in block 48 Block first atom: 759 Blocpdb> 12 atoms in block 49 Block first atom: 766 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 778 Blocpdb> 11 atoms in block 51 Block first atom: 802 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 813 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 827 Blocpdb> 21 atoms in block 54 Block first atom: 839 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 860 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 867 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 886 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 906 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 923 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 942 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 956 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 967 Blocpdb> 21 atoms in block 63 Block first atom: 991 Blocpdb> 24 atoms in block 64 Block first atom: 1012 Blocpdb> 10 atoms in block 65 Block first atom: 1036 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1046 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1060 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 1072 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1079 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1101 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1115 Blocpdb> 7 atoms in block 72 Block first atom: 1129 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1136 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1146 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1162 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1176 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1186 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1196 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1213 Blocpdb> 11 atoms in block 80 Block first atom: 1232 Blocpdb> 10 atoms in block 81 Block first atom: 1243 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1253 Blocpdb> 10 atoms in block 83 Block first atom: 1264 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1274 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1293 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1310 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1327 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1339 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1353 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1372 Blocpdb> 12 atoms in block 91 Block first atom: 1382 Blocpdb> 10 atoms in block 92 Block first atom: 1394 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1404 Blocpdb> 10 atoms in block 94 Block first atom: 1420 Blocpdb> 10 atoms in block 95 Block first atom: 1430 Blocpdb> 10 atoms in block 96 Block first atom: 1440 Blocpdb> 22 atoms in block 97 Block first atom: 1450 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 1472 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1496 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1512 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 1528 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1552 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1564 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1578 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 1595 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 1602 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1621 Blocpdb> 10 atoms in block 108 Block first atom: 1645 Blocpdb> 24 atoms in block 109 Block first atom: 1655 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1679 Blocpdb> 10 atoms in block 111 Block first atom: 1695 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 1705 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 1729 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1753 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 1767 Blocpdb> 10 atoms in block 116 Block first atom: 1791 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1801 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1818 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 1832 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1856 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1868 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 1884 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 1908 Blocpdb> 21 atoms in block 124 Block first atom: 1925 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1946 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1962 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 1979 Blocpdb> 10 atoms in block 128 Block first atom: 1986 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 1996 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2002 Blocpdb> 130 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1413479 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6057 Prepmat> Matrix trace = 3114300.0000 Prepmat> Last element read: 6057 6057 557.5019 Prepmat> 8516 lines saved. Prepmat> 6620 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2019 RTB> Total mass = 2019.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2019 RTB> Number of blocks = 130 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 366317.0998 RTB> 66270 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 780 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66270 Diagstd> Projected matrix trace = 366317.0998 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 780 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 366317.0998 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.4974854 11.1280803 18.7596642 24.8346935 28.0421574 34.7967184 37.2401484 41.1301464 44.7297171 48.0999071 50.1994804 51.8481963 54.8022745 61.1493189 62.3940652 65.1611053 65.4776037 69.2764691 75.8300317 77.3528412 79.4144967 80.3138467 85.2172711 86.7642146 88.4808000 91.8937686 94.1976775 98.8090571 99.8647210 101.7145446 105.1471940 106.5330002 109.3634307 110.8396488 111.7101090 114.7149825 116.2744449 118.5598170 120.4840779 121.5159523 123.9187174 126.1667648 128.8032836 131.0580484 133.3790685 137.0145676 139.4732905 139.7316598 143.4926859 145.4356661 145.9418361 148.0494831 150.8960053 151.4202982 153.8609833 154.5545789 156.5045956 157.5523624 158.1590317 159.0383942 162.4302720 163.3868857 166.3723372 167.8335789 169.1520821 170.4145371 172.7428079 173.3647351 175.1077036 177.5104166 178.2955853 180.8563928 182.2391327 183.8418767 186.8431327 188.1362816 188.7443652 190.6529893 192.3573258 193.6496420 194.9576618 196.4551284 198.5851981 198.9156628 201.1294037 202.2856663 203.7202314 205.5286386 206.3658027 208.0591007 208.7478551 210.4389673 211.9087953 212.7687751 214.1706934 214.5905149 217.0429250 217.5021628 220.6850726 220.8530645 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034321 0.0034326 0.0034333 0.0034346 0.0034361 297.3398335 362.2475065 470.3355549 541.1587473 575.0438875 640.5667978 662.6756029 696.4266918 726.2620577 753.1255806 769.3870835 781.9196125 803.8861978 849.1630583 857.7622351 876.5758501 878.7021088 903.8329134 945.6183670 955.0660678 967.7098782 973.1739919 1002.4416245 1011.4993319 1021.4563219 1040.9702349 1053.9387632 1079.4279463 1085.1788649 1095.1832924 1113.5100059 1120.8238385 1135.6155822 1143.2543189 1147.7347160 1163.0686557 1170.9474838 1182.3989635 1191.9556850 1197.0489984 1208.8258402 1219.7413972 1232.4200287 1243.1602884 1254.1200768 1271.0968792 1282.4510688 1283.6383667 1300.7989052 1309.5761058 1311.8530313 1321.2917643 1333.9334147 1336.2488018 1346.9749902 1350.0076152 1358.4974503 1363.0372981 1365.6590246 1369.4502868 1383.9766601 1388.0460598 1400.6700391 1406.8076071 1412.3227479 1417.5833378 1427.2342780 1429.8012107 1436.9706793 1446.7956751 1449.9918970 1460.3676791 1465.9396790 1472.3718399 1484.3415704 1489.4693075 1491.8744553 1499.3985614 1506.0855637 1511.1362696 1516.2312175 1522.0431519 1530.2723016 1531.5450321 1540.0437669 1544.4641626 1549.9309857 1556.7950893 1559.9624545 1566.3493774 1568.9398399 1575.2821839 1580.7739540 1583.9782978 1589.1880900 1590.7449060 1599.8088580 1601.5004690 1613.1760265 1613.7899079 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2019 Rtb_to_modes> Number of blocs = 130 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9851E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9920E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.497 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 167.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 173.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 190.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 193.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 195.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 196.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 201.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 202.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 203.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 205.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 206.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 210.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 211.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 212.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 214.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 214.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 217.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 217.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 220.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 220.9 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 780 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00006 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99996 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 36342 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00006 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99996 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407240812061042059.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407240812061042059.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2407240812061042059.atom Openam> file on opening on unit 11: 2407240812061042059.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 130 First residue number = 1 Last residue number = 130 Number of atoms found = 2019 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9851E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9920E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.497 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 196.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 201.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 210.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 212.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.9 Bfactors> 106 vectors, 6057 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.497000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.637 for 130 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 15.959 +/- 5.01 Bfactors> Shiftng-fct= 15.952 Bfactors> Scaling-fct= 620.120 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2407240812061042059.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2407240812061042059.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1143. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1220. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1301. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1312. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1347. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1350. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1358. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1363. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1366. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1369. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1384. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1388. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1401. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1407. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1412. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1417. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1430. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1437. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1447. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1460. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1472. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1484. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1489. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1492. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1500. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1506. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1511. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1516. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1522. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1530. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1531. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1540. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1544. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1550. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1557. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1560. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1566. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1569. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1575. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1581. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1584. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1589. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1591. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1600. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1601. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1613. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1614. Chkmod> 106 vectors, 6057 coordinates in file. Chkmod> That is: 2019 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8754 0.0034 0.7322 0.0034 0.8550 0.0034 0.8100 0.0034 0.9454 0.0034 0.7569 297.3174 0.3907 362.2632 0.4706 470.3196 0.3859 541.0844 0.4301 574.9971 0.3417 640.5695 0.5513 662.6458 0.4662 696.3956 0.5069 726.2332 0.2763 753.0940 0.3242 769.3580 0.2011 781.8996 0.5256 803.8350 0.3321 849.1313 0.4222 857.6975 0.4120 876.5308 0.3564 878.6805 0.4503 903.8171 0.4617 945.5776 0.5257 955.0075 0.4435 967.6409 0.3610 973.1089 0.5153 1002.4146 0.3334 1011.4313 0.5448 1021.4079 0.4212 1040.9042 0.4298 1053.9065 0.6253 1079.3868 0.4110 1085.1066 0.3446 1095.0580 0.2727 1113.2123 0.2604 1120.6021 0.4674 1135.7567 0.1577 1143.0008 0.3058 1147.6335 0.2501 1162.9428 0.4029 1171.0259 0.3737 1182.5486 0.0496 1191.9833 0.3515 1196.9190 0.3225 1208.6827 0.1984 1219.8497 0.3183 1232.3514 0.3975 1243.3059 0.3582 1254.1646 0.2005 1270.9747 0.3048 1282.5188 0.3465 1283.4378 0.4201 1300.7762 0.3800 1309.3593 0.4480 1311.6087 0.2067 1321.0142 0.3047 1333.8938 0.3395 1336.1019 0.3915 1347.0879 0.2655 1350.1480 0.3503 1358.4192 0.4277 1363.1848 0.2948 1365.7773 0.3842 1369.2262 0.2218 1383.7883 0.4003 1388.0422 0.2272 1400.7263 0.4590 1406.6065 0.3447 1412.4621 0.2984 1417.4620 0.2336 1426.9962 0.5193 1429.8852 0.3371 1436.8774 0.3858 1446.6911 0.3779 1449.9476 0.3293 1460.4810 0.4293 1465.7194 0.1707 1472.1409 0.3024 1484.1065 0.3847 1489.2617 0.4498 1491.6351 0.3137 1499.5190 0.3432 1506.1880 0.1215 1510.8777 0.3258 1516.3308 0.2647 1522.1516 0.3257 1530.2636 0.1532 1531.4190 0.2126 1539.8651 0.3850 1544.4526 0.4172 1549.7875 0.3776 1556.6198 0.2864 1560.0247 0.1651 1566.4361 0.3914 1568.6926 0.1899 1575.0687 0.2952 1580.6733 0.4026 1584.0265 0.4562 1589.2286 0.1966 1590.7118 0.2330 1599.5820 0.1132 1601.4238 0.4254 1613.1613 0.3393 1613.8921 0.3418 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2407240812061042059 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom making animated gifs 11 models are in 2407240812061042059.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2407240812061042059 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom making animated gifs 11 models are in 2407240812061042059.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2407240812061042059 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom making animated gifs 11 models are in 2407240812061042059.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2407240812061042059 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom making animated gifs 11 models are in 2407240812061042059.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2407240812061042059 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2407240812061042059.eigenfacs 2407240812061042059.atom making animated gifs 11 models are in 2407240812061042059.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2407240812061042059.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2407240812061042059.10.pdb 2407240812061042059.11.pdb 2407240812061042059.7.pdb 2407240812061042059.8.pdb 2407240812061042059.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m8.540s user 0m8.480s sys 0m0.060s rm: cannot remove '2407240812061042059.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.