*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 240723075111832138.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 240723075111832138.atom to be opened.
Openam> File opened: 240723075111832138.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 548
First residue number = 1
Last residue number = 137
Number of atoms found = 4344
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.000000 +/- 27.941209 From: -63.478000 To: 63.478000
= -0.000000 +/- 56.237688 From: -103.757000 To: 103.757000
= -0.745883 +/- 24.602485 From: -42.752000 To: 57.756000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.4745 % Filled.
Pdbmat> 1252182 non-zero elements.
Pdbmat> 136262 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 62.74 +/- 19.16
Maximum number = 127
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 2.725240E+06
Pdbmat> Larger element = 488.096
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
548 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 240723075111832138.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 240723075111832138.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
240723075111832138.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4344 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 548 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 24 atoms in block 3
Block first atom: 46
Blocpdb> 27 atoms in block 4
Block first atom: 70
Blocpdb> 26 atoms in block 5
Block first atom: 97
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 123
Blocpdb> 26 atoms in block 7
Block first atom: 142
Blocpdb> 24 atoms in block 8
Block first atom: 168
Blocpdb> 24 atoms in block 9
Block first atom: 192
Blocpdb> 25 atoms in block 10
Block first atom: 216
Blocpdb> 26 atoms in block 11
Block first atom: 241
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 267
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 290
Blocpdb> 31 atoms in block 14
Block first atom: 314
Blocpdb> 24 atoms in block 15
Block first atom: 345
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 369
Blocpdb> 21 atoms in block 17
Block first atom: 384
Blocpdb> 29 atoms in block 18
Block first atom: 405
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 434
Blocpdb> 26 atoms in block 20
Block first atom: 461
Blocpdb> 32 atoms in block 21
Block first atom: 487
Blocpdb> 24 atoms in block 22
Block first atom: 519
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 543
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 560
Blocpdb> 25 atoms in block 25
Block first atom: 583
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 608
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 630
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 648
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 670
Blocpdb> 25 atoms in block 30
Block first atom: 690
Blocpdb> 25 atoms in block 31
Block first atom: 715
Blocpdb> 21 atoms in block 32
Block first atom: 740
Blocpdb> 30 atoms in block 33
Block first atom: 761
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 791
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 815
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 836
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 859
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 884
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 908
Blocpdb> 24 atoms in block 40
Block first atom: 927
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 951
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 973
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 999
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1018
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1042
Blocpdb> 18 atoms in block 46
Block first atom: 1069
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1087
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 1110
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 1132
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1156
Blocpdb> 26 atoms in block 51
Block first atom: 1183
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 1209
Blocpdb> 26 atoms in block 53
Block first atom: 1228
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 1254
Blocpdb> 24 atoms in block 55
Block first atom: 1278
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1302
Blocpdb> 26 atoms in block 57
Block first atom: 1327
Blocpdb> 23 atoms in block 58
Block first atom: 1353
Blocpdb> 24 atoms in block 59
Block first atom: 1376
Blocpdb> 31 atoms in block 60
Block first atom: 1400
Blocpdb> 24 atoms in block 61
Block first atom: 1431
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 1455
Blocpdb> 21 atoms in block 63
Block first atom: 1470
Blocpdb> 29 atoms in block 64
Block first atom: 1491
Blocpdb> 27 atoms in block 65
Block first atom: 1520
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1547
Blocpdb> 32 atoms in block 67
Block first atom: 1573
Blocpdb> 24 atoms in block 68
Block first atom: 1605
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1629
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1646
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 1669
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1694
Blocpdb> 18 atoms in block 73
Block first atom: 1716
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1734
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1756
Blocpdb> 25 atoms in block 76
Block first atom: 1776
Blocpdb> 25 atoms in block 77
Block first atom: 1801
Blocpdb> 21 atoms in block 78
Block first atom: 1826
Blocpdb> 30 atoms in block 79
Block first atom: 1847
Blocpdb> 24 atoms in block 80
Block first atom: 1877
Blocpdb> 21 atoms in block 81
Block first atom: 1901
Blocpdb> 23 atoms in block 82
Block first atom: 1922
Blocpdb> 25 atoms in block 83
Block first atom: 1945
Blocpdb> 24 atoms in block 84
Block first atom: 1970
Blocpdb> 19 atoms in block 85
Block first atom: 1994
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 2013
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 2037
Blocpdb> 26 atoms in block 88
Block first atom: 2059
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 2085
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 2104
Blocpdb> 27 atoms in block 91
Block first atom: 2128
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 2155
Blocpdb> 23 atoms in block 93
Block first atom: 2173
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2196
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2218
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2242
Blocpdb> 26 atoms in block 97
Block first atom: 2269
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 2295
Blocpdb> 26 atoms in block 99
Block first atom: 2314
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 2340
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 2364
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2388
Blocpdb> 26 atoms in block 103
Block first atom: 2413
Blocpdb> 23 atoms in block 104
Block first atom: 2439
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2462
Blocpdb> 31 atoms in block 106
Block first atom: 2486
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 2517
Blocpdb> 15 atoms in block 108
Block first atom: 2541
Blocpdb> 21 atoms in block 109
Block first atom: 2556
Blocpdb> 29 atoms in block 110
Block first atom: 2577
Blocpdb> 27 atoms in block 111
Block first atom: 2606
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 2633
Blocpdb> 32 atoms in block 113
Block first atom: 2659
Blocpdb> 24 atoms in block 114
Block first atom: 2691
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 2715
Blocpdb> 23 atoms in block 116
Block first atom: 2732
Blocpdb> 25 atoms in block 117
Block first atom: 2755
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2780
Blocpdb> 18 atoms in block 119
Block first atom: 2802
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2820
Blocpdb> 20 atoms in block 121
Block first atom: 2842
Blocpdb> 25 atoms in block 122
Block first atom: 2862
Blocpdb> 25 atoms in block 123
Block first atom: 2887
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 2912
Blocpdb> 30 atoms in block 125
Block first atom: 2933
Blocpdb> 24 atoms in block 126
Block first atom: 2963
Blocpdb> 21 atoms in block 127
Block first atom: 2987
Blocpdb> 23 atoms in block 128
Block first atom: 3008
Blocpdb> 25 atoms in block 129
Block first atom: 3031
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 3056
Blocpdb> 19 atoms in block 131
Block first atom: 3080
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3099
Blocpdb> 22 atoms in block 133
Block first atom: 3123
Blocpdb> 26 atoms in block 134
Block first atom: 3145
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 3171
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 3190
Blocpdb> 27 atoms in block 137
Block first atom: 3214
Blocpdb> 18 atoms in block 138
Block first atom: 3241
Blocpdb> 23 atoms in block 139
Block first atom: 3259
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 3282
Blocpdb> 24 atoms in block 141
Block first atom: 3304
Blocpdb> 27 atoms in block 142
Block first atom: 3328
Blocpdb> 26 atoms in block 143
Block first atom: 3355
Blocpdb> 19 atoms in block 144
Block first atom: 3381
Blocpdb> 26 atoms in block 145
Block first atom: 3400
Blocpdb> 24 atoms in block 146
Block first atom: 3426
Blocpdb> 24 atoms in block 147
Block first atom: 3450
Blocpdb> 25 atoms in block 148
Block first atom: 3474
Blocpdb> 26 atoms in block 149
Block first atom: 3499
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 3525
Blocpdb> 24 atoms in block 151
Block first atom: 3548
Blocpdb> 31 atoms in block 152
Block first atom: 3572
Blocpdb> 24 atoms in block 153
Block first atom: 3603
Blocpdb> 15 atoms in block 154
Block first atom: 3627
Blocpdb> 21 atoms in block 155
Block first atom: 3642
Blocpdb> 29 atoms in block 156
Block first atom: 3663
Blocpdb> 27 atoms in block 157
Block first atom: 3692
Blocpdb> 26 atoms in block 158
Block first atom: 3719
Blocpdb> 32 atoms in block 159
Block first atom: 3745
Blocpdb> 24 atoms in block 160
Block first atom: 3777
Blocpdb> 17 atoms in block 161
Block first atom: 3801
Blocpdb> 23 atoms in block 162
Block first atom: 3818
Blocpdb> 25 atoms in block 163
Block first atom: 3841
Blocpdb> 22 atoms in block 164
Block first atom: 3866
Blocpdb> 18 atoms in block 165
Block first atom: 3888
Blocpdb> 22 atoms in block 166
Block first atom: 3906
Blocpdb> 20 atoms in block 167
Block first atom: 3928
Blocpdb> 25 atoms in block 168
Block first atom: 3948
Blocpdb> 25 atoms in block 169
Block first atom: 3973
Blocpdb> 21 atoms in block 170
Block first atom: 3998
Blocpdb> 30 atoms in block 171
Block first atom: 4019
Blocpdb> 24 atoms in block 172
Block first atom: 4049
Blocpdb> 21 atoms in block 173
Block first atom: 4073
Blocpdb> 23 atoms in block 174
Block first atom: 4094
Blocpdb> 25 atoms in block 175
Block first atom: 4117
Blocpdb> 24 atoms in block 176
Block first atom: 4142
Blocpdb> 19 atoms in block 177
Block first atom: 4166
Blocpdb> 24 atoms in block 178
Block first atom: 4185
Blocpdb> 22 atoms in block 179
Block first atom: 4209
Blocpdb> 26 atoms in block 180
Block first atom: 4231
Blocpdb> 19 atoms in block 181
Block first atom: 4257
Blocpdb> 24 atoms in block 182
Block first atom: 4276
Blocpdb> 27 atoms in block 183
Block first atom: 4300
Blocpdb> 18 atoms in block 184
Block first atom: 4326
Blocpdb> 184 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1252366 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13032
Prepmat> Matrix trace = 2725240.0000
Prepmat> Last element read: 13032 13032 30.8849
Prepmat> 17021 lines saved.
Prepmat> 16022 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4344
RTB> Total mass = 4344.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4344
RTB> Number of blocks = 184
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 158058.0112
RTB> 33166 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1104
Diagstd> Nb of non-zero elements: 33166
Diagstd> Projected matrix trace = 158058.0112
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1104 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 158058.0112
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0003170 0.0005285 0.0005603 0.0010795
0.0013079 0.0017765 0.0020433 0.0037683 0.0037938
0.0054504 0.0061688 0.0068819 0.0075662 0.0103771
0.0133677 0.0133757 0.0187830 0.0288877 0.0337758
0.0379468 0.0651740 0.0717112 0.1318577 0.1704487
0.1814241 0.2006429 0.2444351 0.2518765 0.2566549
0.2965678 0.3087581 0.3965229 0.4205090 0.5863661
0.7075810 0.7297165 0.7919778 0.8799300 0.9025974
1.0672042 1.1468740 1.2640982 1.3309443 1.4328665
1.4627747 1.5020314 1.5859738 1.6406996 1.8027083
1.9003224 1.9368202 1.9908589 2.0411334 2.0706376
2.1748227 2.4355052 2.4713544 2.5244685 2.8015337
2.8605999 2.9456959 3.2063646 3.2623948 3.4928823
3.7020109 3.7605452 3.9212277 4.0589230 4.1249800
4.4605258 4.5869016 4.6284203 4.7116400 4.9467401
4.9668743 5.2627063 5.3278463 5.3631885 5.5210034
5.5227597 5.7455918 6.4744410 6.7227843 6.7652929
6.8720194 6.8806074 6.9506963 7.0787622 7.4802038
7.6519624 7.7183469 8.0531106 8.2763754 8.3677748
8.4334278 8.5139309 8.5283398 8.5687466 8.6003272
8.6058783
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034331 0.0034335 0.0034340 0.0034346
0.0034353 1.9332796 2.4965235 2.5704228 3.5678486
3.9272693 4.5770036 4.9086774 6.6660120 6.6885757
8.0169893 8.5289440 9.0084069 9.4456697 11.0619767
12.5551802 12.5589559 14.8825804 18.4565966 19.9571256
21.1535264 27.7224968 29.0796301 39.4319307 44.8324174
46.2533053 48.6415270 53.6879846 54.4990718 55.0136023
59.1367305 60.3398785 68.3800491 70.4178766 83.1533422
91.3447039 92.7624827 96.6388598 101.8636782 103.1673599
112.1809331 116.2928821 122.0915744 125.2781198 129.9864681
131.3360640 133.0867388 136.7550203 139.0944543 145.8001617
149.6955610 151.1262593 153.2200219 155.1425695 156.2598225
160.1427246 169.4688229 170.7115079 172.5362129 181.7578636
183.6639154 186.3756786 194.4472188 196.1388096 202.9491599
208.9364095 210.5817286 215.0335923 218.7765082 220.5495653
229.3444877 232.5706952 233.6208914 235.7118029 241.5209603
242.0119800 249.1149818 250.6519701 251.4819450 255.1551211
255.1957019 260.2931057 276.3098836 281.5592950 282.4480515
284.6672266 284.8450457 286.2921472 288.9175625 296.9969536
300.3873870 301.6875769 308.1606000 312.4031257 314.1233866
315.3532743 316.8548369 317.1228453 317.8732113 318.4584426
318.5612020
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4344
Rtb_to_modes> Number of blocs = 184
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1696E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2854E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6030E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0795E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3079E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7765E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0433E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7683E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7938E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4504E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1688E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8819E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5662E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0377E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3368E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3376E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8783E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8888E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3776E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7947E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5174E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1711E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1319
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1704
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1814
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2444
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2519
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2567
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2966
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3088
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3965
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7076
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8799
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9026
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.463
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.502
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.586
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.641
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.900
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.937
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.991
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.041
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.071
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.436
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.471
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.524
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.802
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.861
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.946
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.206
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.262
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.921
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.059
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.125
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.461
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.628
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.712
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.967
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.263
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.328
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.363
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.723
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.765
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.872
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.951
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.652
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.718
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.276
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.368
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.514
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.528
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.569
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.606
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996
1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99999
0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998
1.00004 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
0.99997 0.99997 0.99996 0.99998 0.99996
0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002
0.99998 0.99999 0.99997 1.00007 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00004 0.99999 1.00001 1.00004 0.99996
1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
1.00002 0.99997 1.00004 1.00003 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999
0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99995
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 0.99995 1.00002 1.00007
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 78192 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996
1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99999
0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998
1.00004 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
0.99997 0.99997 0.99996 0.99998 0.99996
0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 1.00002
0.99998 0.99999 0.99997 1.00007 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00004 0.99999 1.00001 1.00004 0.99996
1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
1.00002 0.99997 1.00004 1.00003 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999
0.99999 1.00004 1.00000 0.99999 0.99995
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 0.99995 1.00002 1.00007
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240723075111832138.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240723075111832138.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 240723075111832138.atom
Openam> file on opening on unit 11:
240723075111832138.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 548
First residue number = 1
Last residue number = 137
Number of atoms found = 4344
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1696E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2854E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6030E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0795E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3079E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7765E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0433E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7683E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7938E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4504E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1688E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8819E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5662E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0377E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3368E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3376E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8783E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8888E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3776E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7947E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5174E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1711E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2519
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2567
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2966
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3965
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7076
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8799
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9026
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.463
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.502
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.586
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.641
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.937
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.991
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.041
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.071
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.436
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.471
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.802
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.861
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.262
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.921
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.125
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.461
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.628
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.263
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.328
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.363
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.523
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.765
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.652
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.718
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.053
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.276
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.514
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.528
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.606
Bfactors> 106 vectors, 13032 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000317
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.079 for 548 C-alpha atoms.
Bfactors> = 39.884 +/- 44.97
Bfactors> = 94.092 +/- 3.74
Bfactors> Shiftng-fct= 54.207
Bfactors> Scaling-fct= 0.083
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 240723075111832138.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
240723075111832138.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.496
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.570
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.568
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.577
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.908
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.666
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.688
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.017
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.529
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.008
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.445
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.5
Chkmod> 106 vectors, 13032 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4344 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 54 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 103 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6352
0.0034 0.6279
0.0034 0.9997
0.0034 0.7838
0.0034 0.7967
0.0034 0.8541
1.9332 0.3696
2.4964 0.5243
2.5703 0.4633
3.5677 0.3131
3.9270 0.6595
4.5768 0.3716
4.9084 0.4653
6.6658 0.5288
6.6883 0.5655
8.0166 0.6454
8.5286 0.5406
9.0081 0.5636
9.4453 0.2339
11.0615 0.5975
12.5548 0.6511
12.5586 0.7997
14.8819 0.7417
18.4559 0.5792
19.9563 0.3008
21.1527 0.6861
27.7213 0.3305
29.0783 0.3421
39.4366 0.4651
44.8241 0.4543
46.2482 0.5965
48.6342 0.4886
53.6818 0.4205
54.4993 0.4572
55.0161 0.4177
59.1374 0.3629
60.3414 0.6882
68.3751 0.3786
70.4141 0.4450
83.1522 0.7009
91.3420 0.3466
92.7575 0.4313
96.6361 0.3871
101.8576 0.5277
103.1631 0.4385
112.1654 0.3040
116.2943 0.3304
122.0816 0.3954
125.2754 0.3394
129.9869 0.2493
131.3405 0.2195
133.0796 0.2843
136.7503 0.4011
139.1012 0.2880
145.8057 0.4836
149.6764 0.2722
151.1268 0.1847
153.2189 0.3441
155.1308 0.1838
156.2668 0.1780
160.1424 0.2767
169.4788 0.2867
170.6919 0.2157
172.5128 0.2392
181.7652 0.3502
183.6689 0.2688
186.3773 0.3676
194.4278 0.3755
196.1185 0.3339
202.9439 0.3133
208.9271 0.4515
210.5854 0.4809
215.0181 0.2940
218.7692 0.2361
220.5406 0.3351
229.3468 0.4077
232.5632 0.3186
233.6003 0.3162
235.7107 0.2475
241.5169 0.3963
242.0047 0.2921
249.1112 0.2044
250.6448 0.1884
251.4667 0.3734
255.1441 0.1669
255.1903 0.1831
260.2912 0.3116
276.2886 0.3746
281.5517 0.1876
282.4298 0.1492
284.6546 0.3882
284.8409 0.3924
286.2861 0.4775
288.9100 0.3979
296.9802 0.5407
300.3752 0.3937
301.6678 0.4015
308.1453 0.4106
312.3826 0.5174
314.1141 0.4448
315.3317 0.5123
316.8425 0.1855
317.1029 0.1312
317.8643 0.2263
318.4387 0.1589
318.5498 0.4955
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 240723075111832138 7 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
making animated gifs
21 models are in 240723075111832138.7.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.7.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.7.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 240723075111832138 8 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
making animated gifs
21 models are in 240723075111832138.8.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.8.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.8.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 240723075111832138 9 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
making animated gifs
21 models are in 240723075111832138.9.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.9.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.9.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 240723075111832138 10 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
making animated gifs
21 models are in 240723075111832138.10.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.10.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.10.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 240723075111832138 11 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
240723075111832138.eigenfacs
240723075111832138.atom
making animated gifs
21 models are in 240723075111832138.11.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.11.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
21 models are in 240723075111832138.11.pdb, 3 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
240723075111832138.10.pdb
240723075111832138.11.pdb
240723075111832138.7.pdb
240723075111832138.8.pdb
240723075111832138.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m23.760s
user 0m23.715s
sys 0m0.044s
rm: cannot remove '240723075111832138.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
