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LOGs for ID: 240719111817156970

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 240719111817156970.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 240719111817156970.atom to be opened. Openam> File opened: 240719111817156970.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 584 First residue number = 176 Last residue number = 759 Number of atoms found = 4633 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 3.725325 +/- 16.525701 From: -35.528000 To: 47.499000 = 2.385522 +/- 12.341708 From: -39.244000 To: 32.771000 = -0.458872 +/- 16.015123 From: -41.258000 To: 34.555000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8202 % Filled. Pdbmat> 1758260 non-zero elements. Pdbmat> 192308 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.02 +/- 23.46 Maximum number = 133 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 3.846160E+06 Pdbmat> Larger element = 502.119 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 584 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 240719111817156970.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 240719111817156970.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 240719111817156970.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4633 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 584 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 45 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 71 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 92 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 114 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 137 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 163 Blocpdb> 27 atoms in block 9 Block first atom: 188 Blocpdb> 21 atoms in block 10 Block first atom: 215 Blocpdb> 21 atoms in block 11 Block first atom: 236 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 257 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 276 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 295 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 331 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 358 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 383 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 399 Blocpdb> 23 atoms in block 19 Block first atom: 419 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 442 Blocpdb> 21 atoms in block 21 Block first atom: 470 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 491 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 508 Blocpdb> 30 atoms in block 24 Block first atom: 531 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 561 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 583 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 604 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 626 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 28 atoms in block 30 Block first atom: 666 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 694 Blocpdb> 21 atoms in block 32 Block first atom: 714 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 735 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 753 Blocpdb> 22 atoms in block 35 Block first atom: 774 Blocpdb> 23 atoms in block 36 Block first atom: 796 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 819 Blocpdb> 27 atoms in block 38 Block first atom: 844 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 871 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 893 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 920 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 973 Blocpdb> 22 atoms in block 44 Block first atom: 997 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 1019 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1043 Blocpdb> 29 atoms in block 47 Block first atom: 1065 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1094 Blocpdb> 23 atoms in block 49 Block first atom: 1117 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1140 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 1165 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1189 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1209 Blocpdb> 25 atoms in block 54 Block first atom: 1230 Blocpdb> 26 atoms in block 55 Block first atom: 1255 Blocpdb> 25 atoms in block 56 Block first atom: 1281 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1306 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 1330 Blocpdb> 24 atoms in block 59 Block first atom: 1351 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 1375 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1397 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 1420 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1444 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1466 Blocpdb> 17 atoms in block 65 Block first atom: 1493 Blocpdb> 24 atoms in block 66 Block first atom: 1510 Blocpdb> 32 atoms in block 67 Block first atom: 1534 Blocpdb> 30 atoms in block 68 Block first atom: 1566 Blocpdb> 25 atoms in block 69 Block first atom: 1596 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1621 Blocpdb> 29 atoms in block 71 Block first atom: 1636 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1665 Blocpdb> 33 atoms in block 73 Block first atom: 1685 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1718 Blocpdb> 22 atoms in block 75 Block first atom: 1738 Blocpdb> 24 atoms in block 76 Block first atom: 1760 Blocpdb> 29 atoms in block 77 Block first atom: 1784 Blocpdb> 24 atoms in block 78 Block first atom: 1813 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1837 Blocpdb> 21 atoms in block 80 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1877 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1899 Blocpdb> 30 atoms in block 83 Block first atom: 1919 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1949 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 1968 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1998 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 2020 Blocpdb> 27 atoms in block 88 Block first atom: 2043 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 2070 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 2088 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 2107 Blocpdb> 26 atoms in block 92 Block first atom: 2121 Blocpdb> 31 atoms in block 93 Block first atom: 2147 Blocpdb> 23 atoms in block 94 Block first atom: 2178 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2201 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2233 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2256 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 2275 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 2306 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2323 Blocpdb> 25 atoms in block 101 Block first atom: 2351 Blocpdb> 16 atoms in block 102 Block first atom: 2376 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2392 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 2414 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 2437 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2457 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 2486 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 2515 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2541 Blocpdb> 23 atoms in block 110 Block first atom: 2567 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 2590 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 2610 Blocpdb> 21 atoms in block 113 Block first atom: 2629 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 2650 Blocpdb> 26 atoms in block 115 Block first atom: 2670 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2696 Blocpdb> 23 atoms in block 117 Block first atom: 2720 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2743 Blocpdb> 29 atoms in block 119 Block first atom: 2764 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 2793 Blocpdb> 24 atoms in block 121 Block first atom: 2816 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2840 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 2862 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2877 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 2901 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2927 Blocpdb> 26 atoms in block 127 Block first atom: 2948 Blocpdb> 23 atoms in block 128 Block first atom: 2974 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 2997 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 3021 Blocpdb> 30 atoms in block 131 Block first atom: 3048 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3078 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3102 Blocpdb> 20 atoms in block 134 Block first atom: 3125 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 3145 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 3171 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3191 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3215 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 3235 Blocpdb> 27 atoms in block 140 Block first atom: 3257 Blocpdb> 29 atoms in block 141 Block first atom: 3284 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 3313 Blocpdb> 23 atoms in block 143 Block first atom: 3341 Blocpdb> 26 atoms in block 144 Block first atom: 3364 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 3390 Blocpdb> 25 atoms in block 146 Block first atom: 3406 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3431 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3458 Blocpdb> 23 atoms in block 149 Block first atom: 3480 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 3503 Blocpdb> 28 atoms in block 151 Block first atom: 3520 Blocpdb> 28 atoms in block 152 Block first atom: 3548 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3576 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 3598 Blocpdb> 23 atoms in block 155 Block first atom: 3620 Blocpdb> 23 atoms in block 156 Block first atom: 3643 Blocpdb> 21 atoms in block 157 Block first atom: 3666 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 3687 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 3715 Blocpdb> 25 atoms in block 160 Block first atom: 3734 Blocpdb> 24 atoms in block 161 Block first atom: 3759 Blocpdb> 31 atoms in block 162 Block first atom: 3783 Blocpdb> 23 atoms in block 163 Block first atom: 3814 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3837 Blocpdb> 20 atoms in block 165 Block first atom: 3862 Blocpdb> 27 atoms in block 166 Block first atom: 3882 Blocpdb> 27 atoms in block 167 Block first atom: 3909 Blocpdb> 30 atoms in block 168 Block first atom: 3936 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3966 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 3991 Blocpdb> 22 atoms in block 171 Block first atom: 4016 Blocpdb> 26 atoms in block 172 Block first atom: 4038 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 4064 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 4086 Blocpdb> 35 atoms in block 175 Block first atom: 4114 Blocpdb> 24 atoms in block 176 Block first atom: 4149 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4173 Blocpdb> 29 atoms in block 178 Block first atom: 4196 Blocpdb> 27 atoms in block 179 Block first atom: 4225 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 4252 Blocpdb> 19 atoms in block 181 Block first atom: 4280 Blocpdb> 30 atoms in block 182 Block first atom: 4299 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 4329 Blocpdb> 21 atoms in block 184 Block first atom: 4348 Blocpdb> 29 atoms in block 185 Block first atom: 4369 Blocpdb> 27 atoms in block 186 Block first atom: 4398 Blocpdb> 24 atoms in block 187 Block first atom: 4425 Blocpdb> 26 atoms in block 188 Block first atom: 4449 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 4475 Blocpdb> 30 atoms in block 190 Block first atom: 4491 Blocpdb> 28 atoms in block 191 Block first atom: 4521 Blocpdb> 24 atoms in block 192 Block first atom: 4549 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4573 Blocpdb> 24 atoms in block 194 Block first atom: 4592 Blocpdb> 18 atoms in block 195 Block first atom: 4615 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1758455 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13899 Prepmat> Matrix trace = 3846160.0000 Prepmat> Last element read: 13899 13899 190.8194 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 17054 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4633 RTB> Total mass = 4633.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4633 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 257777.9304 RTB> 71091 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71091 Diagstd> Projected matrix trace = 257777.9304 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 257777.9304 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1726694 0.3601051 0.5165158 0.6249964 0.9353856 1.4781712 1.5748586 1.8967715 2.7544446 2.9802316 3.1610578 3.6169209 3.9636024 4.8202257 5.2041083 5.7528589 6.1929103 7.0022221 7.4927027 7.6978141 8.4427882 9.0098182 9.5115482 10.0145594 10.3417038 10.4740723 10.9660613 11.1696622 11.6076688 12.5415547 13.1154344 13.2072999 13.5303585 13.8150264 14.5898337 14.9937420 15.9543950 16.0829905 16.6714904 17.3209971 17.5670687 18.8480843 19.0325178 19.7131858 20.4260686 21.2299722 21.7743229 22.2844457 22.7464621 22.9565312 23.4445855 23.6804374 23.9195898 24.7289021 24.9113484 25.2581933 25.6474078 26.0318650 26.7697097 27.2384275 27.8894049 28.4473801 28.5784301 29.0809285 29.1987247 29.9443961 30.3746723 31.1405826 31.7056319 32.4530737 32.7644300 33.1864368 33.5494570 34.2205908 34.6652897 35.4989428 35.5893181 36.0620895 36.4782577 36.7567673 37.4457405 37.6068589 38.3620985 39.3312491 39.5673466 39.9793445 40.5389692 40.8547080 41.4241602 41.6771711 42.1172508 42.1933775 42.5110650 43.3690382 44.3223304 44.8206158 45.0451661 45.3655899 46.7419556 46.9728725 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034334 0.0034338 0.0034339 0.0034353 45.1235245 65.1643274 78.0435654 85.8487622 105.0244995 132.0254470 136.2749615 149.5556382 180.2238645 187.4650385 193.0685351 206.5212684 216.1923485 238.4124699 247.7242046 260.4576639 270.2356711 287.3513369 297.2449815 301.2860269 315.5282341 325.9517325 334.9044258 343.6459288 349.2137431 351.4415155 359.6007720 362.9236750 369.9710857 384.5660746 393.2661982 394.6410881 399.4385094 403.6185704 414.7825255 420.4847960 433.7459679 435.4904975 443.3865278 451.9409812 455.1399213 471.4426699 473.7436509 482.1405825 490.7809239 500.3454943 506.7194914 512.6207694 517.9075108 520.2935148 525.7951301 528.4332548 531.0949159 540.0048968 541.9932749 545.7533646 549.9421650 554.0486767 561.8457641 566.7431719 573.4755465 579.1838160 580.5163612 585.5977707 586.7825934 594.2279282 598.4819828 605.9804971 611.4535730 618.6189197 621.5793656 625.5695385 628.9817262 635.2417478 639.3559299 646.9980772 647.8211363 652.1097956 655.8617811 658.3607550 664.5023050 665.9303532 672.5838861 681.0267168 683.0676913 686.6147279 691.4035915 694.0908766 698.9114199 701.0425796 704.7341028 705.3707166 708.0212177 715.1302937 722.9471894 726.9996297 728.8184812 731.4060717 742.4183879 744.2499937 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4633 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3601 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.575 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.980 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.617 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.443 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00007 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 83394 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00007 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240719111817156970.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240719111817156970.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 240719111817156970.atom Openam> file on opening on unit 11: 240719111817156970.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 584 First residue number = 176 Last residue number = 759 Number of atoms found = 4633 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3601 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.575 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.617 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.443 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.97 Bfactors> 106 vectors, 13899 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.172700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.464 for 584 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.069 +/- 0.38 Bfactors> = 88.132 +/- 13.90 Bfactors> Shiftng-fct= 88.062 Bfactors> Scaling-fct= 36.404 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 240719111817156970.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 240719111817156970.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2 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vecteur en lecture: 625.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.2 Chkmod> 106 vectors, 13899 coordinates in file. Chkmod> That is: 4633 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 35 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8852 0.0034 0.7057 0.0034 0.7677 0.0034 0.8978 0.0034 0.8156 0.0034 0.8329 45.1256 0.0101 65.1611 0.1900 78.0390 0.0773 85.8453 0.1066 105.0208 0.0682 132.0121 0.0640 136.2752 0.0793 149.5582 0.0194 180.2016 0.4227 187.4497 0.4077 193.0585 0.0131 206.5147 0.2562 216.1939 0.2012 238.3967 0.2363 247.7110 0.3797 260.4497 0.3626 270.2260 0.4267 287.3344 0.3868 297.2381 0.4220 301.2767 0.1933 315.5186 0.1131 325.9410 0.2726 334.8980 0.3731 343.5529 0.1554 349.1700 0.3492 351.3581 0.5791 359.6499 0.4907 362.9136 0.2646 369.9924 0.0742 384.5257 0.2784 393.3178 0.2422 394.6645 0.4106 399.4161 0.4837 403.6739 0.4704 414.7671 0.5851 420.4143 0.3216 433.6676 0.4651 435.4313 0.3948 443.3477 0.5136 451.9086 0.5512 455.1584 0.2062 471.4464 0.3138 473.6920 0.5934 482.0809 0.4524 490.8071 0.5180 500.3243 0.4513 506.6474 0.3080 512.5476 0.2496 517.9256 0.5317 520.3105 0.2871 525.7211 0.2815 528.4057 0.0856 531.0767 0.2124 539.9937 0.5050 541.9553 0.4558 545.7495 0.5178 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 240719111817156970.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 240719111817156970.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 240719111817156970 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=80 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 240719111817156970 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=0 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=20 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=40 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom calculating perturbed structure for DQ=60 240719111817156970.eigenfacs 240719111817156970.atom 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