*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2407171737054148529.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2407171737054148529.atom to be opened.
Openam> File opened: 2407171737054148529.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 767
First residue number = 1
Last residue number = 767
Number of atoms found = 6134
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -3.105356 +/- 21.035609 From: -75.260000 To: 58.351000
= -0.113664 +/- 18.596315 From: -46.414000 To: 42.654000
= 3.044567 +/- 13.573196 From: -35.297000 To: 35.414000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2756 % Filled.
Pdbmat> 2159968 non-zero elements.
Pdbmat> 235956 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.93 +/- 24.08
Maximum number = 130
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 4.719120E+06
Pdbmat> Larger element = 506.815
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
767 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2407171737054148529.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2407171737054148529.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2407171737054148529.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6134 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 767 residues.
Blocpdb> 40 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 37 atoms in block 2
Block first atom: 41
Blocpdb> 35 atoms in block 3
Block first atom: 78
Blocpdb> 21 atoms in block 4
Block first atom: 113
Blocpdb> 26 atoms in block 5
Block first atom: 134
Blocpdb> 32 atoms in block 6
Block first atom: 160
Blocpdb> 38 atoms in block 7
Block first atom: 192
Blocpdb> 34 atoms in block 8
Block first atom: 230
Blocpdb> 38 atoms in block 9
Block first atom: 264
Blocpdb> 26 atoms in block 10
Block first atom: 302
Blocpdb> 37 atoms in block 11
Block first atom: 328
Blocpdb> 32 atoms in block 12
Block first atom: 365
Blocpdb> 39 atoms in block 13
Block first atom: 397
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 436
Blocpdb> 34 atoms in block 15
Block first atom: 466
Blocpdb> 31 atoms in block 16
Block first atom: 500
Blocpdb> 27 atoms in block 17
Block first atom: 531
Blocpdb> 27 atoms in block 18
Block first atom: 558
Blocpdb> 31 atoms in block 19
Block first atom: 585
Blocpdb> 41 atoms in block 20
Block first atom: 616
Blocpdb> 33 atoms in block 21
Block first atom: 657
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 690
Blocpdb> 33 atoms in block 23
Block first atom: 722
Blocpdb> 37 atoms in block 24
Block first atom: 755
Blocpdb> 32 atoms in block 25
Block first atom: 792
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 824
Blocpdb> 29 atoms in block 27
Block first atom: 860
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 889
Blocpdb> 33 atoms in block 29
Block first atom: 915
Blocpdb> 34 atoms in block 30
Block first atom: 948
Blocpdb> 31 atoms in block 31
Block first atom: 982
Blocpdb> 34 atoms in block 32
Block first atom: 1013
Blocpdb> 35 atoms in block 33
Block first atom: 1047
Blocpdb> 34 atoms in block 34
Block first atom: 1082
Blocpdb> 31 atoms in block 35
Block first atom: 1116
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 1147
Blocpdb> 30 atoms in block 37
Block first atom: 1176
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 1206
Blocpdb> 32 atoms in block 39
Block first atom: 1230
Blocpdb> 36 atoms in block 40
Block first atom: 1262
Blocpdb> 36 atoms in block 41
Block first atom: 1298
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1334
Blocpdb> 29 atoms in block 43
Block first atom: 1364
Blocpdb> 30 atoms in block 44
Block first atom: 1393
Blocpdb> 39 atoms in block 45
Block first atom: 1423
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 1462
Blocpdb> 32 atoms in block 47
Block first atom: 1487
Blocpdb> 33 atoms in block 48
Block first atom: 1519
Blocpdb> 33 atoms in block 49
Block first atom: 1552
Blocpdb> 31 atoms in block 50
Block first atom: 1585
Blocpdb> 32 atoms in block 51
Block first atom: 1616
Blocpdb> 28 atoms in block 52
Block first atom: 1648
Blocpdb> 28 atoms in block 53
Block first atom: 1676
Blocpdb> 28 atoms in block 54
Block first atom: 1704
Blocpdb> 37 atoms in block 55
Block first atom: 1732
Blocpdb> 31 atoms in block 56
Block first atom: 1769
Blocpdb> 29 atoms in block 57
Block first atom: 1800
Blocpdb> 26 atoms in block 58
Block first atom: 1829
Blocpdb> 28 atoms in block 59
Block first atom: 1855
Blocpdb> 30 atoms in block 60
Block first atom: 1883
Blocpdb> 26 atoms in block 61
Block first atom: 1913
Blocpdb> 28 atoms in block 62
Block first atom: 1939
Blocpdb> 38 atoms in block 63
Block first atom: 1967
Blocpdb> 35 atoms in block 64
Block first atom: 2005
Blocpdb> 33 atoms in block 65
Block first atom: 2040
Blocpdb> 36 atoms in block 66
Block first atom: 2073
Blocpdb> 29 atoms in block 67
Block first atom: 2109
Blocpdb> 37 atoms in block 68
Block first atom: 2138
Blocpdb> 29 atoms in block 69
Block first atom: 2175
Blocpdb> 27 atoms in block 70
Block first atom: 2204
Blocpdb> 34 atoms in block 71
Block first atom: 2231
Blocpdb> 34 atoms in block 72
Block first atom: 2265
Blocpdb> 30 atoms in block 73
Block first atom: 2299
Blocpdb> 29 atoms in block 74
Block first atom: 2329
Blocpdb> 35 atoms in block 75
Block first atom: 2358
Blocpdb> 28 atoms in block 76
Block first atom: 2393
Blocpdb> 30 atoms in block 77
Block first atom: 2421
Blocpdb> 28 atoms in block 78
Block first atom: 2451
Blocpdb> 37 atoms in block 79
Block first atom: 2479
Blocpdb> 34 atoms in block 80
Block first atom: 2516
Blocpdb> 26 atoms in block 81
Block first atom: 2550
Blocpdb> 42 atoms in block 82
Block first atom: 2576
Blocpdb> 28 atoms in block 83
Block first atom: 2618
Blocpdb> 33 atoms in block 84
Block first atom: 2646
Blocpdb> 33 atoms in block 85
Block first atom: 2679
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 2712
Blocpdb> 36 atoms in block 87
Block first atom: 2736
Blocpdb> 30 atoms in block 88
Block first atom: 2772
Blocpdb> 32 atoms in block 89
Block first atom: 2802
Blocpdb> 29 atoms in block 90
Block first atom: 2834
Blocpdb> 23 atoms in block 91
Block first atom: 2863
Blocpdb> 32 atoms in block 92
Block first atom: 2886
Blocpdb> 34 atoms in block 93
Block first atom: 2918
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2952
Blocpdb> 32 atoms in block 95
Block first atom: 2979
Blocpdb> 24 atoms in block 96
Block first atom: 3011
Blocpdb> 27 atoms in block 97
Block first atom: 3035
Blocpdb> 46 atoms in block 98
Block first atom: 3062
Blocpdb> 30 atoms in block 99
Block first atom: 3108
Blocpdb> 27 atoms in block 100
Block first atom: 3138
Blocpdb> 38 atoms in block 101
Block first atom: 3165
Blocpdb> 37 atoms in block 102
Block first atom: 3203
Blocpdb> 34 atoms in block 103
Block first atom: 3240
Blocpdb> 30 atoms in block 104
Block first atom: 3274
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 3304
Blocpdb> 32 atoms in block 106
Block first atom: 3342
Blocpdb> 34 atoms in block 107
Block first atom: 3374
Blocpdb> 36 atoms in block 108
Block first atom: 3408
Blocpdb> 38 atoms in block 109
Block first atom: 3444
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 3482
Blocpdb> 33 atoms in block 111
Block first atom: 3509
Blocpdb> 28 atoms in block 112
Block first atom: 3542
Blocpdb> 31 atoms in block 113
Block first atom: 3570
Blocpdb> 32 atoms in block 114
Block first atom: 3601
Blocpdb> 38 atoms in block 115
Block first atom: 3633
Blocpdb> 34 atoms in block 116
Block first atom: 3671
Blocpdb> 36 atoms in block 117
Block first atom: 3705
Blocpdb> 31 atoms in block 118
Block first atom: 3741
Blocpdb> 32 atoms in block 119
Block first atom: 3772
Blocpdb> 35 atoms in block 120
Block first atom: 3804
Blocpdb> 32 atoms in block 121
Block first atom: 3839
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 3871
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 3900
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 3922
Blocpdb> 34 atoms in block 125
Block first atom: 3960
Blocpdb> 32 atoms in block 126
Block first atom: 3994
Blocpdb> 36 atoms in block 127
Block first atom: 4026
Blocpdb> 36 atoms in block 128
Block first atom: 4062
Blocpdb> 29 atoms in block 129
Block first atom: 4098
Blocpdb> 34 atoms in block 130
Block first atom: 4127
Blocpdb> 35 atoms in block 131
Block first atom: 4161
Blocpdb> 27 atoms in block 132
Block first atom: 4196
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 4223
Blocpdb> 31 atoms in block 134
Block first atom: 4246
Blocpdb> 36 atoms in block 135
Block first atom: 4277
Blocpdb> 31 atoms in block 136
Block first atom: 4313
Blocpdb> 29 atoms in block 137
Block first atom: 4344
Blocpdb> 35 atoms in block 138
Block first atom: 4373
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 4408
Blocpdb> 32 atoms in block 140
Block first atom: 4443
Blocpdb> 33 atoms in block 141
Block first atom: 4475
Blocpdb> 31 atoms in block 142
Block first atom: 4508
Blocpdb> 35 atoms in block 143
Block first atom: 4539
Blocpdb> 33 atoms in block 144
Block first atom: 4574
Blocpdb> 28 atoms in block 145
Block first atom: 4607
Blocpdb> 32 atoms in block 146
Block first atom: 4635
Blocpdb> 33 atoms in block 147
Block first atom: 4667
Blocpdb> 32 atoms in block 148
Block first atom: 4700
Blocpdb> 38 atoms in block 149
Block first atom: 4732
Blocpdb> 32 atoms in block 150
Block first atom: 4770
Blocpdb> 33 atoms in block 151
Block first atom: 4802
Blocpdb> 33 atoms in block 152
Block first atom: 4835
Blocpdb> 33 atoms in block 153
Block first atom: 4868
Blocpdb> 28 atoms in block 154
Block first atom: 4901
Blocpdb> 25 atoms in block 155
Block first atom: 4929
Blocpdb> 44 atoms in block 156
Block first atom: 4954
Blocpdb> 31 atoms in block 157
Block first atom: 4998
Blocpdb> 29 atoms in block 158
Block first atom: 5029
Blocpdb> 32 atoms in block 159
Block first atom: 5058
Blocpdb> 35 atoms in block 160
Block first atom: 5090
Blocpdb> 33 atoms in block 161
Block first atom: 5125
Blocpdb> 31 atoms in block 162
Block first atom: 5158
Blocpdb> 34 atoms in block 163
Block first atom: 5189
Blocpdb> 31 atoms in block 164
Block first atom: 5223
Blocpdb> 36 atoms in block 165
Block first atom: 5254
Blocpdb> 28 atoms in block 166
Block first atom: 5290
Blocpdb> 29 atoms in block 167
Block first atom: 5318
Blocpdb> 29 atoms in block 168
Block first atom: 5347
Blocpdb> 29 atoms in block 169
Block first atom: 5376
Blocpdb> 33 atoms in block 170
Block first atom: 5405
Blocpdb> 35 atoms in block 171
Block first atom: 5438
Blocpdb> 35 atoms in block 172
Block first atom: 5473
Blocpdb> 29 atoms in block 173
Block first atom: 5508
Blocpdb> 28 atoms in block 174
Block first atom: 5537
Blocpdb> 36 atoms in block 175
Block first atom: 5565
Blocpdb> 43 atoms in block 176
Block first atom: 5601
Blocpdb> 28 atoms in block 177
Block first atom: 5644
Blocpdb> 31 atoms in block 178
Block first atom: 5672
Blocpdb> 27 atoms in block 179
Block first atom: 5703
Blocpdb> 38 atoms in block 180
Block first atom: 5730
Blocpdb> 29 atoms in block 181
Block first atom: 5768
Blocpdb> 35 atoms in block 182
Block first atom: 5797
Blocpdb> 28 atoms in block 183
Block first atom: 5832
Blocpdb> 35 atoms in block 184
Block first atom: 5860
Blocpdb> 34 atoms in block 185
Block first atom: 5895
Blocpdb> 32 atoms in block 186
Block first atom: 5929
Blocpdb> 31 atoms in block 187
Block first atom: 5961
Blocpdb> 35 atoms in block 188
Block first atom: 5992
Blocpdb> 29 atoms in block 189
Block first atom: 6027
Blocpdb> 34 atoms in block 190
Block first atom: 6056
Blocpdb> 23 atoms in block 191
Block first atom: 6090
Blocpdb> 22 atoms in block 192
Block first atom: 6112
Blocpdb> 192 blocks.
Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2160160 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 18402
Prepmat> Matrix trace = 4719120.0000
Prepmat> Last element read: 18402 18402 35.1270
Prepmat> 18529 lines saved.
Prepmat> 16909 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6134
RTB> Total mass = 6134.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6134
RTB> Number of blocks = 192
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212411.8769
RTB> 55404 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1152
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55404
Diagstd> Projected matrix trace = 212411.8769
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1152 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212411.8769
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0003691 0.0009053 0.0092838 0.0166912
0.0534336 0.0598455 0.1968620 0.2432835 0.2880028
0.3828350 0.5205375 0.6596478 0.7443738 0.8141790
0.8917875 1.0830081 1.1392771 1.3821607 1.4891026
1.6770658 1.8832648 1.9234401 2.0659787 2.3645635
2.5857356 2.8922101 3.2811873 3.3602878 3.6506315
3.9219721 4.5512891 4.8270498 5.0267586 5.1848204
5.8002474 6.4060264 6.7655152 7.0640154 7.1574132
7.4854233 7.6394369 7.9643352 8.4644214 8.7050611
8.8241140 9.1700235 9.5137419 9.7106422 10.0347472
10.1346670 10.5796994 10.7239893 11.5035247 11.6579183
11.8081862 11.9889465 12.3748819 12.4366399 12.5102753
12.6611180 12.8986684 13.2320433 13.6694226 14.0738258
14.4298098 14.9785605 15.1977367 15.5231321 15.7655635
16.0876318 16.4052156 16.6673639 17.0659617 17.1758535
17.3816541 17.7559511 17.8695524 18.3527347 18.4532589
18.8391288 19.5914927 20.1984970 20.6020380 20.9078976
21.3462611 21.6025651 21.9106886 22.1232098 22.4093978
22.8163093 23.4088806 23.7361365 24.0400729 24.2933319
25.0290104 25.7408613 25.9511090 27.0963665 27.3649328
27.4763728
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034334 0.0034337 0.0034344 0.0034352
0.0034353 2.0863167 3.2674082 10.4630219 14.0293902
25.1016571 26.5650803 48.1810403 53.5613585 58.2765264
67.1894553 78.3468016 88.1965006 93.6894776 97.9840123
102.5477108 113.0085050 115.9070781 127.6657929 132.5127264
140.6275259 149.0222029 150.6033429 156.0839322 166.9824271
174.6173290 184.6758880 196.7029132 199.0597801 207.4814516
215.0540036 231.6661034 238.5811731 243.4665464 247.2647111
261.5282092 274.8461397 282.4526921 288.6164620 290.5181869
297.1005540 300.1414356 306.4573517 315.9322203 320.3916520
322.5750957 328.8368698 334.9430435 338.3913520 343.9921237
345.7005116 353.2091487 355.6095909 368.3076539 370.7710218
373.1529483 375.9982218 382.0021537 382.9541765 384.0862092
386.3948311 390.0027950 395.0105883 401.4859623 407.3815588
412.5015492 420.2718675 423.3355481 427.8435181 431.1714821
435.5533310 439.8314212 443.3316523 448.6014401 450.0434484
452.7316235 457.5802283 459.0416771 465.2063919 466.4786991
471.3306562 480.6501077 488.0393139 492.8904140 496.5356809
501.7139642 504.7170105 508.3037266 510.7629062 514.0559293
518.7020666 525.3945990 529.0543579 532.4307994 535.2279967
543.2717470 550.9431875 553.1886243 565.2633254 568.0577290
569.2132229
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6134
Rtb_to_modes> Number of blocs = 192
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6912E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0535E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2838E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6691E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3434E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9846E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1969
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2880
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6596
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7444
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8142
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.083
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.139
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.382
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.489
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.677
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.365
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.586
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.892
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.281
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.651
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.922
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.551
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.827
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.027
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.185
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.800
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.406
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.064
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.157
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.485
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.639
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.705
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.824
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.170
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.514
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.711
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
0.99996 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999
0.99997 1.00000 0.99999 1.00005 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 0.99995 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 110412 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000
0.99996 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999
0.99997 1.00000 0.99999 1.00005 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 0.99995 1.00001 1.00001 0.99999
1.00000 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407171737054148529.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407171737054148529.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2407171737054148529.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407171737054148529.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 767
First residue number = 1
Last residue number = 767
Number of atoms found = 6134
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6912E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0535E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2838E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6691E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3434E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9846E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1969
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2880
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8142
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.083
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.139
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.489
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.677
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.365
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.586
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.892
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.281
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.651
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.922
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.551
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.827
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.027
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.185
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.064
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.157
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.639
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.705
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.824
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.170
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.514
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.711
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48
Bfactors> 106 vectors, 18402 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000369
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.524 for 767 C-alpha atoms.
Bfactors> = 8.088 +/- 67.94
Bfactors> = 91.081 +/- 13.70
Bfactors> Shiftng-fct= 82.993
Bfactors> Scaling-fct= 0.202
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407171737054148529.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407171737054148529.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.086
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.2
Chkmod> 106 vectors, 18402 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6134 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 67 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9777
0.0034 0.7981
0.0034 0.6659
0.0034 0.7575
0.0034 0.6976
0.0034 0.7189
2.0862 0.0305
3.2673 0.0165
10.4626 0.0323
14.0287 0.0318
25.1007 0.0366
26.5640 0.0383
48.1836 0.1648
53.5609 0.0440
58.2737 0.1272
67.1835 0.0836
78.3406 0.4378
88.1895 0.3860
93.6871 0.0630
97.9811 0.1505
102.5440 0.0954
113.0032 0.4767
115.8880 0.0514
127.6529 0.3899
132.5025 0.4936
140.6187 0.6166
149.0053 0.0239
150.5796 0.1024
156.0780 0.0971
166.9907 0.6470
174.6188 0.5694
184.6613 0.3747
196.6889 0.0152
199.0427 0.3418
207.4830 0.4292
215.0455 0.4764
231.6488 0.1359
238.5697 0.3228
243.4619 0.2594
247.2584 0.1164
261.5114 0.4546
274.8338 0.5306
282.4507 0.2759
288.6038 0.1957
290.4973 0.4238
297.0794 0.3447
300.1200 0.0248
306.4377 0.3147
315.9108 0.0767
320.3768 0.3180
322.5592 0.2327
328.8223 0.4181
334.9332 0.2546
338.3831 0.0509
343.8960 0.3399
345.6061 0.2264
353.1990 0.3133
355.5282 0.2523
368.2354 0.0854
370.7882 0.2855
373.1656 0.2174
375.9986 0.4494
381.9104 0.1879
382.9895 0.0790
384.0655 0.3270
386.3612 0.1905
390.0062 0.0634
394.9631 0.3499
401.4772 0.3035
407.3087 0.2967
412.4866 0.4519
420.2740 0.0413
423.3489 0.2941
427.7820 0.2347
431.2136 0.1312
435.5667 0.0266
439.8767 0.3289
443.3477 0.3368
448.6353 0.3048
450.0784 0.1056
452.6906 0.3191
457.6128 0.0614
459.0277 0.2314
465.1518 0.2818
466.4175 0.1451
471.3213 0.4123
480.6112 0.3303
488.0365 0.4536
492.8449 0.4525
496.5393 0.4131
501.7364 0.3239
504.6654 0.4292
508.2739 0.4478
510.7039 0.3575
514.0408 0.2726
518.7217 0.3660
525.3846 0.4124
529.0747 0.2927
532.4071 0.1599
535.1683 0.2402
543.2592 0.2593
550.9103 0.2766
553.1531 0.1153
565.2770 0.4361
567.9821 0.3585
569.2264 0.1598
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171737054148529 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171737054148529.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171737054148529 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171737054148529.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171737054148529 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171737054148529.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171737054148529 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171737054148529.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171737054148529 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171737054148529.eigenfacs
2407171737054148529.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171737054148529.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171737054148529.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2407171737054148529.10.pdb
2407171737054148529.11.pdb
2407171737054148529.7.pdb
2407171737054148529.8.pdb
2407171737054148529.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m34.299s
user 0m34.187s
sys 0m0.112s
rm: cannot remove '2407171737054148529.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
