*** 3p53_B7X3_Comparison ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2407171249544031456.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2407171249544031456.atom to be opened.
Openam> File opened: 2407171249544031456.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 970
First residue number = 8
Last residue number = 493
Number of atoms found = 7664
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 44.930960 +/- 22.203927 From: -0.375000 To: 88.321000
= -41.529693 +/- 19.452724 From: -91.314000 To: 5.610000
= 21.177971 +/- 13.646016 From: -17.265000 To: 53.529000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.1362 % Filled.
Pdbmat> 3003274 non-zero elements.
Pdbmat> 328645 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.76 +/- 23.13
Maximum number = 135
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 6.572900E+06
Pdbmat> Larger element = 503.269
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
970 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2407171249544031456.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2407171249544031456.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2407171249544031456.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7664 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 970 residues.
Blocpdb> 38 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 40 atoms in block 2
Block first atom: 39
Blocpdb> 35 atoms in block 3
Block first atom: 79
Blocpdb> 41 atoms in block 4
Block first atom: 114
Blocpdb> 40 atoms in block 5
Block first atom: 155
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 195
Blocpdb> 38 atoms in block 7
Block first atom: 226
Blocpdb> 47 atoms in block 8
Block first atom: 264
Blocpdb> 40 atoms in block 9
Block first atom: 311
Blocpdb> 32 atoms in block 10
Block first atom: 351
Blocpdb> 31 atoms in block 11
Block first atom: 383
Blocpdb> 47 atoms in block 12
Block first atom: 414
Blocpdb> 41 atoms in block 13
Block first atom: 461
Blocpdb> 37 atoms in block 14
Block first atom: 502
Blocpdb> 40 atoms in block 15
Block first atom: 539
Blocpdb> 34 atoms in block 16
Block first atom: 579
Blocpdb> 44 atoms in block 17
Block first atom: 613
Blocpdb> 38 atoms in block 18
Block first atom: 657
Blocpdb> 43 atoms in block 19
Block first atom: 695
Blocpdb> 37 atoms in block 20
Block first atom: 738
Blocpdb> 55 atoms in block 21
Block first atom: 775
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 830
Blocpdb> 42 atoms in block 23
Block first atom: 862
Blocpdb> 34 atoms in block 24
Block first atom: 904
Blocpdb> 44 atoms in block 25
Block first atom: 938
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 982
Blocpdb> 41 atoms in block 27
Block first atom: 1018
Blocpdb> 41 atoms in block 28
Block first atom: 1059
Blocpdb> 50 atoms in block 29
Block first atom: 1100
Blocpdb> 34 atoms in block 30
Block first atom: 1150
Blocpdb> 40 atoms in block 31
Block first atom: 1184
Blocpdb> 39 atoms in block 32
Block first atom: 1224
Blocpdb> 40 atoms in block 33
Block first atom: 1263
Blocpdb> 37 atoms in block 34
Block first atom: 1303
Blocpdb> 40 atoms in block 35
Block first atom: 1340
Blocpdb> 46 atoms in block 36
Block first atom: 1380
Blocpdb> 36 atoms in block 37
Block first atom: 1426
Blocpdb> 51 atoms in block 38
Block first atom: 1462
Blocpdb> 41 atoms in block 39
Block first atom: 1513
Blocpdb> 39 atoms in block 40
Block first atom: 1554
Blocpdb> 35 atoms in block 41
Block first atom: 1593
Blocpdb> 46 atoms in block 42
Block first atom: 1628
Blocpdb> 31 atoms in block 43
Block first atom: 1674
Blocpdb> 45 atoms in block 44
Block first atom: 1705
Blocpdb> 40 atoms in block 45
Block first atom: 1750
Blocpdb> 30 atoms in block 46
Block first atom: 1790
Blocpdb> 33 atoms in block 47
Block first atom: 1820
Blocpdb> 34 atoms in block 48
Block first atom: 1853
Blocpdb> 37 atoms in block 49
Block first atom: 1887
Blocpdb> 41 atoms in block 50
Block first atom: 1924
Blocpdb> 35 atoms in block 51
Block first atom: 1965
Blocpdb> 36 atoms in block 52
Block first atom: 2000
Blocpdb> 41 atoms in block 53
Block first atom: 2036
Blocpdb> 43 atoms in block 54
Block first atom: 2077
Blocpdb> 34 atoms in block 55
Block first atom: 2120
Blocpdb> 39 atoms in block 56
Block first atom: 2154
Blocpdb> 42 atoms in block 57
Block first atom: 2193
Blocpdb> 44 atoms in block 58
Block first atom: 2235
Blocpdb> 42 atoms in block 59
Block first atom: 2279
Blocpdb> 43 atoms in block 60
Block first atom: 2321
Blocpdb> 39 atoms in block 61
Block first atom: 2364
Blocpdb> 56 atoms in block 62
Block first atom: 2403
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 2459
Blocpdb> 34 atoms in block 64
Block first atom: 2486
Blocpdb> 34 atoms in block 65
Block first atom: 2520
Blocpdb> 43 atoms in block 66
Block first atom: 2554
Blocpdb> 56 atoms in block 67
Block first atom: 2597
Blocpdb> 45 atoms in block 68
Block first atom: 2653
Blocpdb> 34 atoms in block 69
Block first atom: 2698
Blocpdb> 40 atoms in block 70
Block first atom: 2732
Blocpdb> 39 atoms in block 71
Block first atom: 2772
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 2811
Blocpdb> 37 atoms in block 73
Block first atom: 2842
Blocpdb> 42 atoms in block 74
Block first atom: 2879
Blocpdb> 41 atoms in block 75
Block first atom: 2921
Blocpdb> 41 atoms in block 76
Block first atom: 2962
Blocpdb> 45 atoms in block 77
Block first atom: 3003
Blocpdb> 33 atoms in block 78
Block first atom: 3048
Blocpdb> 38 atoms in block 79
Block first atom: 3081
Blocpdb> 36 atoms in block 80
Block first atom: 3119
Blocpdb> 49 atoms in block 81
Block first atom: 3155
Blocpdb> 44 atoms in block 82
Block first atom: 3204
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 3248
Blocpdb> 45 atoms in block 84
Block first atom: 3284
Blocpdb> 38 atoms in block 85
Block first atom: 3329
Blocpdb> 38 atoms in block 86
Block first atom: 3367
Blocpdb> 33 atoms in block 87
Block first atom: 3405
Blocpdb> 31 atoms in block 88
Block first atom: 3438
Blocpdb> 44 atoms in block 89
Block first atom: 3469
Blocpdb> 45 atoms in block 90
Block first atom: 3513
Blocpdb> 41 atoms in block 91
Block first atom: 3558
Blocpdb> 32 atoms in block 92
Block first atom: 3599
Blocpdb> 44 atoms in block 93
Block first atom: 3631
Blocpdb> 34 atoms in block 94
Block first atom: 3675
Blocpdb> 33 atoms in block 95
Block first atom: 3709
Blocpdb> 38 atoms in block 96
Block first atom: 3742
Blocpdb> 42 atoms in block 97
Block first atom: 3780
Blocpdb> 13 atoms in block 98
Block first atom: 3822
Blocpdb> 33 atoms in block 99
Block first atom: 3835
Blocpdb> 41 atoms in block 100
Block first atom: 3868
Blocpdb> 34 atoms in block 101
Block first atom: 3909
Blocpdb> 44 atoms in block 102
Block first atom: 3943
Blocpdb> 34 atoms in block 103
Block first atom: 3987
Blocpdb> 44 atoms in block 104
Block first atom: 4021
Blocpdb> 31 atoms in block 105
Block first atom: 4065
Blocpdb> 44 atoms in block 106
Block first atom: 4096
Blocpdb> 47 atoms in block 107
Block first atom: 4140
Blocpdb> 7 atoms in block 108
Block first atom: 4187
Blocpdb> 27 atoms in block 109
Block first atom: 4194
Blocpdb> 41 atoms in block 110
Block first atom: 4221
Blocpdb> 43 atoms in block 111
Block first atom: 4262
Blocpdb> 35 atoms in block 112
Block first atom: 4305
Blocpdb> 32 atoms in block 113
Block first atom: 4340
Blocpdb> 43 atoms in block 114
Block first atom: 4372
Blocpdb> 36 atoms in block 115
Block first atom: 4415
Blocpdb> 39 atoms in block 116
Block first atom: 4451
Blocpdb> 41 atoms in block 117
Block first atom: 4490
Blocpdb> 46 atoms in block 118
Block first atom: 4531
Blocpdb> 46 atoms in block 119
Block first atom: 4577
Blocpdb> 38 atoms in block 120
Block first atom: 4623
Blocpdb> 42 atoms in block 121
Block first atom: 4661
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 4703
Blocpdb> 34 atoms in block 123
Block first atom: 4741
Blocpdb> 46 atoms in block 124
Block first atom: 4775
Blocpdb> 38 atoms in block 125
Block first atom: 4821
Blocpdb> 44 atoms in block 126
Block first atom: 4859
Blocpdb> 40 atoms in block 127
Block first atom: 4903
Blocpdb> 46 atoms in block 128
Block first atom: 4943
Blocpdb> 34 atoms in block 129
Block first atom: 4989
Blocpdb> 37 atoms in block 130
Block first atom: 5023
Blocpdb> 46 atoms in block 131
Block first atom: 5060
Blocpdb> 39 atoms in block 132
Block first atom: 5106
Blocpdb> 36 atoms in block 133
Block first atom: 5145
Blocpdb> 56 atoms in block 134
Block first atom: 5181
Blocpdb> 41 atoms in block 135
Block first atom: 5237
Blocpdb> 45 atoms in block 136
Block first atom: 5278
Blocpdb> 41 atoms in block 137
Block first atom: 5323
Blocpdb> 42 atoms in block 138
Block first atom: 5364
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 5406
Blocpdb> 40 atoms in block 140
Block first atom: 5441
Blocpdb> 41 atoms in block 141
Block first atom: 5481
Blocpdb> 42 atoms in block 142
Block first atom: 5522
Blocpdb> 42 atoms in block 143
Block first atom: 5564
Blocpdb> 30 atoms in block 144
Block first atom: 5606
Blocpdb> 32 atoms in block 145
Block first atom: 5636
Blocpdb> 32 atoms in block 146
Block first atom: 5668
Blocpdb> 36 atoms in block 147
Block first atom: 5700
Blocpdb> 41 atoms in block 148
Block first atom: 5736
Blocpdb> 38 atoms in block 149
Block first atom: 5777
Blocpdb> 36 atoms in block 150
Block first atom: 5815
Blocpdb> 36 atoms in block 151
Block first atom: 5851
Blocpdb> 39 atoms in block 152
Block first atom: 5887
Blocpdb> 40 atoms in block 153
Block first atom: 5926
Blocpdb> 36 atoms in block 154
Block first atom: 5966
Blocpdb> 41 atoms in block 155
Block first atom: 6002
Blocpdb> 51 atoms in block 156
Block first atom: 6043
Blocpdb> 44 atoms in block 157
Block first atom: 6094
Blocpdb> 39 atoms in block 158
Block first atom: 6138
Blocpdb> 44 atoms in block 159
Block first atom: 6177
Blocpdb> 50 atoms in block 160
Block first atom: 6221
Blocpdb> 34 atoms in block 161
Block first atom: 6271
Blocpdb> 30 atoms in block 162
Block first atom: 6305
Blocpdb> 33 atoms in block 163
Block first atom: 6335
Blocpdb> 37 atoms in block 164
Block first atom: 6368
Blocpdb> 50 atoms in block 165
Block first atom: 6405
Blocpdb> 49 atoms in block 166
Block first atom: 6455
Blocpdb> 37 atoms in block 167
Block first atom: 6504
Blocpdb> 39 atoms in block 168
Block first atom: 6541
Blocpdb> 39 atoms in block 169
Block first atom: 6580
Blocpdb> 31 atoms in block 170
Block first atom: 6619
Blocpdb> 34 atoms in block 171
Block first atom: 6650
Blocpdb> 35 atoms in block 172
Block first atom: 6684
Blocpdb> 44 atoms in block 173
Block first atom: 6719
Blocpdb> 42 atoms in block 174
Block first atom: 6763
Blocpdb> 49 atoms in block 175
Block first atom: 6805
Blocpdb> 42 atoms in block 176
Block first atom: 6854
Blocpdb> 40 atoms in block 177
Block first atom: 6896
Blocpdb> 34 atoms in block 178
Block first atom: 6936
Blocpdb> 36 atoms in block 179
Block first atom: 6970
Blocpdb> 47 atoms in block 180
Block first atom: 7006
Blocpdb> 44 atoms in block 181
Block first atom: 7053
Blocpdb> 37 atoms in block 182
Block first atom: 7097
Blocpdb> 34 atoms in block 183
Block first atom: 7134
Blocpdb> 53 atoms in block 184
Block first atom: 7168
Blocpdb> 29 atoms in block 185
Block first atom: 7221
Blocpdb> 30 atoms in block 186
Block first atom: 7250
Blocpdb> 37 atoms in block 187
Block first atom: 7280
Blocpdb> 53 atoms in block 188
Block first atom: 7317
Blocpdb> 43 atoms in block 189
Block first atom: 7370
Blocpdb> 40 atoms in block 190
Block first atom: 7413
Blocpdb> 39 atoms in block 191
Block first atom: 7453
Blocpdb> 36 atoms in block 192
Block first atom: 7492
Blocpdb> 33 atoms in block 193
Block first atom: 7528
Blocpdb> 34 atoms in block 194
Block first atom: 7561
Blocpdb> 34 atoms in block 195
Block first atom: 7595
Blocpdb> 36 atoms in block 196
Block first atom: 7628
Blocpdb> 196 blocks.
Blocpdb> At most, 56 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3003470 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 22992
Prepmat> Matrix trace = 6572900.0000
Prepmat> Last element read: 22992 22992 370.9149
Prepmat> 19307 lines saved.
Prepmat> 17462 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7664
RTB> Total mass = 7664.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7664
RTB> Number of blocks = 196
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 243356.6347
RTB> 63444 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1176
Diagstd> Nb of non-zero elements: 63444
Diagstd> Projected matrix trace = 243356.6347
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1176 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 243356.6347
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2417098 0.3735344 0.7386642 1.0805308
1.3560163 1.6528529 2.0870816 2.3950432 2.7417461
3.4213384 3.5927160 4.1294730 5.7293889 5.8977141
6.0951094 6.5378774 6.9469792 7.8258555 8.1996926
8.3606348 9.2579389 10.0087913 10.6079211 11.1663386
11.9802703 12.5165846 13.0365927 14.4049114 14.8015297
15.6918680 16.3733501 17.0837783 17.6604142 18.2980962
19.5478290 20.1585510 20.6821314 21.3536539 21.7522718
22.4352194 23.6850871 23.9829137 24.1926460 24.7295759
25.4708391 26.7066659 27.3909350 27.4569732 27.9602073
28.5305002 28.9068998 29.1310397 29.4483830 30.7501279
31.2391288 32.0247949 32.3947571 32.9266907 33.6377545
33.7467422 34.6640287 35.5773786 36.0280506 36.3261793
37.3454095 37.7979826 38.0293527 38.4359356 39.0354688
39.2743770 39.5587535 39.9590825 40.0394731 40.3031726
40.6965501 41.2116160 41.3244875 41.4106725 41.8272361
42.2182581 42.7028523 42.8007797 43.2030499 43.3721832
43.6802804 43.8890012 44.6192248 45.0086757 45.5091902
45.6385082 45.9637196 45.9886734 46.3534393 46.6895402
47.2156897 47.3312549 47.7630385 48.1186888 48.1320258
48.5099525
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034307 0.0034321 0.0034323 0.0034338 0.0034341
0.0034347 53.3878460 66.3682795 93.3294706 112.8791813
126.4525917 139.6086678 156.8790659 168.0552013 179.8079545
200.8599238 205.8290767 220.6696446 259.9258248 263.7163988
268.0933445 277.6602221 286.2155861 303.7814090 310.9525101
313.9893430 330.4094313 343.5469500 353.6799342 362.8696761
375.8621456 384.1830496 392.0823833 412.1455133 417.7808998
430.1625559 439.4040495 448.8355460 456.3475499 464.5133858
480.1141941 487.5564841 493.8475760 501.8008356 506.4628458
514.3520092 528.4851312 531.7974524 534.1176946 540.0122534
548.0458669 561.1837893 568.3275496 569.0122423 574.2030222
580.0293548 583.8429484 586.1020939 589.2858414 602.1694848
606.9385699 614.5234486 618.0628556 623.1166014 629.8088788
630.8283561 639.3443009 647.7124619 651.8019607 654.4932038
663.6114841 667.6203876 669.6605992 673.2308498 678.4611437
680.5341642 682.9935142 686.4407138 687.1308649 689.3898699
692.7460816 697.1160836 698.0700705 698.7976280 702.3035504
705.5786575 709.6165281 710.4297188 713.7604563 715.1562228
717.6918078 719.4044653 725.3644892 728.5232184 732.5627546
733.6028335 736.2119515 736.4117699 739.3264805 742.0020052
746.1711432 747.0837496 750.4836821 753.2726036 753.3769887
756.3289168
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7664
Rtb_to_modes> Number of blocs = 196
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9808E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7387
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.081
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.356
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.087
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.395
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.421
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.593
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.729
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.898
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.095
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.538
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.361
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.51
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00003 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 1.00005 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99996 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 137952 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00003 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 1.00005 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99996 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407171249544031456.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407171249544031456.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2407171249544031456.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407171249544031456.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 970
First residue number = 8
Last residue number = 493
Number of atoms found = 7664
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9808E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2417
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7387
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.081
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.421
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.729
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.095
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.361
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.51
Bfactors> 106 vectors, 22992 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.241700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.491 for 988 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.033 +/- 0.02
Bfactors> = 40.618 +/- 14.53
Bfactors> Shiftng-fct= 40.585
Bfactors> Scaling-fct= 756.080
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407171249544031456.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407171249544031456.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.3
Chkmod> 106 vectors, 22992 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7664 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7214
0.0034 0.9699
0.0034 0.9044
0.0034 0.7720
0.0034 0.6802
0.0034 0.6701
53.3845 0.6905
66.3624 0.7065
93.3277 0.6914
112.8988 0.6871
126.4464 0.6255
139.6089 0.5645
156.8693 0.8270
168.0465 0.6870
179.8086 0.6563
200.8414 0.4612
205.8284 0.6170
220.6475 0.5295
259.9058 0.5802
263.7115 0.6030
268.0794 0.6629
277.6509 0.4941
286.2037 0.5381
303.7712 0.3490
310.9450 0.5060
313.9827 0.6043
330.3963 0.5221
343.5529 0.4789
353.6994 0.5644
362.9136 0.3672
375.8418 0.6148
384.2190 0.4865
392.1168 0.5478
412.0576 0.3173
417.7414 0.5242
430.1185 0.5374
439.3402 0.4779
448.7666 0.2439
456.3226 0.4142
464.5176 0.4537
480.1202 0.4717
487.5531 0.4197
493.8009 0.4983
501.7364 0.5028
506.4147 0.3731
514.3847 0.2993
528.5173 0.3265
531.7423 0.1318
534.0656 0.1524
539.9937 0.2607
548.0133 0.3912
561.1947 0.4583
568.2935 0.0924
569.0192 0.1239
574.1762 0.1556
579.9994 0.1606
583.8492 0.1491
586.0665 0.0924
589.2767 0.1671
602.1424 0.1372
606.9210 0.1383
614.4511 0.3501
617.9909 0.1143
623.1212 0.3905
629.8029 0.2747
630.8317 0.2587
639.2797 0.2558
647.7085 0.2662
651.7916 0.2205
654.4995 0.3119
663.6238 0.3560
667.6095 0.4118
669.6376 0.3487
673.2375 0.3332
678.4714 0.2896
680.4670 0.3203
682.9750 0.2146
686.4191 0.4456
687.1059 0.2743
689.3331 0.3050
692.7457 0.3171
697.0725 0.4249
698.0022 0.2530
698.7620 0.3530
702.2966 0.3212
705.5629 0.4626
709.5624 0.4759
710.3928 0.5477
713.7046 0.5318
715.1075 0.4773
717.6587 0.4377
719.3818 0.4492
725.3397 0.4894
728.5027 0.4570
732.5378 0.4748
733.5833 0.5137
736.1506 0.4759
736.3908 0.4393
739.2673 0.3995
741.9738 0.2813
746.1732 0.4739
747.0418 0.4390
750.4276 0.4216
753.2505 0.3882
753.3288 0.2234
756.2968 0.3678
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2407171249544031456.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407171249544031456.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2407171249544031456.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407171249544031456.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2407171249544031456.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2407171249544031456.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.3
Projmod> 106 vectors, 22992 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 970
First residue number = 8
Last residue number = 493
Number of atoms found = 7664
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 486
First residue number = 8
Last residue number = 493
Number of atoms found = 3798
Mean number per residue = 7.8
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171249544031456 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171249544031456.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 486 0.935 478 0.630
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 486 0.925 478 0.624
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 486 0.919 478 0.623
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 486 0.917 478 0.627
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 486 0.918 478 0.637
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 486 0.924 478 0.652
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 486 0.933 478 0.672
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 486 0.946 478 0.696
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 486 0.963 478 0.725
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 486 0.983 478 0.758
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 486 1.007 477 0.781
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171249544031456 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171249544031456.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 486 0.914 478 0.632
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 486 0.914 478 0.634
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 486 0.915 478 0.637
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 486 0.917 478 0.641
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 486 0.920 478 0.646
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 486 0.924 478 0.652
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 486 0.928 478 0.659
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 486 0.934 478 0.666
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 486 0.940 478 0.675
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 486 0.947 478 0.684
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 486 0.955 478 0.695
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171249544031456 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171249544031456.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 486 0.947 478 0.674
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 486 0.935 478 0.659
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 486 0.926 478 0.649
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 486 0.922 478 0.645
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 486 0.921 478 0.645
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 486 0.924 478 0.652
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 486 0.931 478 0.664
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 486 0.942 478 0.682
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 486 0.956 478 0.705
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 486 0.975 478 0.732
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 486 0.997 478 0.764
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171249544031456 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171249544031456.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 486 1.303 476 1.059
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 486 1.189 476 0.932
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 486 1.090 477 0.829
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 486 1.010 477 0.735
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 486 0.953 478 0.682
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 486 0.924 478 0.652
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 486 0.925 478 0.665
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 486 0.957 478 0.717
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 486 1.018 478 0.803
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 486 1.102 478 0.911
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 486 1.205 480 1.052
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2407171249544031456 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407171249544031456.eigenfacs
2407171249544031456.atom
making animated gifs
11 models are in 2407171249544031456.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407171249544031456.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 486 1.298 477 1.120
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 486 1.159 479 0.977
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 486 1.044 479 0.836
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 486 0.961 478 0.714
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 486 0.919 478 0.651
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 486 0.924 478 0.652
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 486 0.974 478 0.716
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 486 1.065 477 0.817
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 486 1.185 477 0.963
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 486 1.328 476 1.121
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 486 1.487 474 1.285
2407171249544031456.10.pdb
2407171249544031456.11.pdb
2407171249544031456.7.pdb
2407171249544031456.8.pdb
2407171249544031456.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m41.393s
user 0m41.241s
sys 0m0.152s
rm: cannot remove '2407171249544031456.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|
