***  VirJD22  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2407151516463796982.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2407151516463796982.atom to be opened.
Openam> File opened: 2407151516463796982.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 448
First residue number = 1
Last residue number = 448
Number of atoms found = 3382
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.217532 +/- 14.352692 From: -33.715000 To: 34.149000
= 0.663023 +/- 13.738636 From: -32.883000 To: 36.252000
= 1.989860 +/- 12.256918 From: -30.082000 To: 38.116000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.4557 % Filled.
Pdbmat> 1264108 non-zero elements.
Pdbmat> 138224 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.74 +/- 23.18
Maximum number = 133
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 2.764480E+06
Pdbmat> Larger element = 494.835
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
448 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2407151516463796982.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2407151516463796982.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2407151516463796982.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3382 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 448 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 40
Blocpdb> 36 atoms in block 4
Block first atom: 62
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 98
Blocpdb> 25 atoms in block 6
Block first atom: 120
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 145
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 169
Blocpdb> 16 atoms in block 9
Block first atom: 194
Blocpdb> 28 atoms in block 10
Block first atom: 210
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 238
Blocpdb> 26 atoms in block 12
Block first atom: 260
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 286
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 310
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 329
Blocpdb> 21 atoms in block 16
Block first atom: 348
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 369
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 391
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 413
Blocpdb> 29 atoms in block 20
Block first atom: 433
Blocpdb> 26 atoms in block 21
Block first atom: 462
Blocpdb> 21 atoms in block 22
Block first atom: 488
Blocpdb> 24 atoms in block 23
Block first atom: 509
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 533
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 557
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 579
Blocpdb> 25 atoms in block 27
Block first atom: 603
Blocpdb> 21 atoms in block 28
Block first atom: 628
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 649
Blocpdb> 21 atoms in block 30
Block first atom: 674
Blocpdb> 23 atoms in block 31
Block first atom: 695
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 718
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 746
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 771
Blocpdb> 23 atoms in block 35
Block first atom: 793
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 816
Blocpdb> 20 atoms in block 37
Block first atom: 840
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 860
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 879
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 912
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 934
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 953
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 970
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 990
Blocpdb> 16 atoms in block 45
Block first atom: 1012
Blocpdb> 21 atoms in block 46
Block first atom: 1028
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 1049
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 1069
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 1086
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1104
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 1127
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 1146
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1175
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1196
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 1218
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1241
Blocpdb> 19 atoms in block 57
Block first atom: 1263
Blocpdb> 19 atoms in block 58
Block first atom: 1282
Blocpdb> 25 atoms in block 59
Block first atom: 1301
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1326
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1346
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 1366
Blocpdb> 24 atoms in block 63
Block first atom: 1383
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 1407
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1427
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1444
Blocpdb> 23 atoms in block 67
Block first atom: 1467
Blocpdb> 27 atoms in block 68
Block first atom: 1490
Blocpdb> 25 atoms in block 69
Block first atom: 1517
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1542
Blocpdb> 21 atoms in block 71
Block first atom: 1562
Blocpdb> 26 atoms in block 72
Block first atom: 1583
Blocpdb> 22 atoms in block 73
Block first atom: 1609
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 1631
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1656
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1676
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1698
Blocpdb> 25 atoms in block 78
Block first atom: 1716
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1741
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1763
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1785
Blocpdb> 23 atoms in block 82
Block first atom: 1808
Blocpdb> 18 atoms in block 83
Block first atom: 1831
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1849
Blocpdb> 23 atoms in block 85
Block first atom: 1866
Blocpdb> 23 atoms in block 86
Block first atom: 1889
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 1912
Blocpdb> 16 atoms in block 88
Block first atom: 1934
Blocpdb> 33 atoms in block 89
Block first atom: 1950
Blocpdb> 25 atoms in block 90
Block first atom: 1983
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 2008
Blocpdb> 31 atoms in block 92
Block first atom: 2026
Blocpdb> 24 atoms in block 93
Block first atom: 2057
Blocpdb> 21 atoms in block 94
Block first atom: 2081
Blocpdb> 19 atoms in block 95
Block first atom: 2102
Blocpdb> 21 atoms in block 96
Block first atom: 2121
Blocpdb> 31 atoms in block 97
Block first atom: 2142
Blocpdb> 31 atoms in block 98
Block first atom: 2173
Blocpdb> 27 atoms in block 99
Block first atom: 2204
Blocpdb> 25 atoms in block 100
Block first atom: 2231
Blocpdb> 21 atoms in block 101
Block first atom: 2256
Blocpdb> 22 atoms in block 102
Block first atom: 2277
Blocpdb> 21 atoms in block 103
Block first atom: 2299
Blocpdb> 23 atoms in block 104
Block first atom: 2320
Blocpdb> 22 atoms in block 105
Block first atom: 2343
Blocpdb> 21 atoms in block 106
Block first atom: 2365
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 2386
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 2405
Blocpdb> 29 atoms in block 109
Block first atom: 2424
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 2453
Blocpdb> 25 atoms in block 111
Block first atom: 2470
Blocpdb> 30 atoms in block 112
Block first atom: 2495
Blocpdb> 29 atoms in block 113
Block first atom: 2525
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 2554
Blocpdb> 25 atoms in block 115
Block first atom: 2575
Blocpdb> 29 atoms in block 116
Block first atom: 2600
Blocpdb> 19 atoms in block 117
Block first atom: 2629
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 2648
Blocpdb> 23 atoms in block 119
Block first atom: 2668
Blocpdb> 21 atoms in block 120
Block first atom: 2691
Blocpdb> 27 atoms in block 121
Block first atom: 2712
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2739
Blocpdb> 26 atoms in block 123
Block first atom: 2762
Blocpdb> 20 atoms in block 124
Block first atom: 2788
Blocpdb> 21 atoms in block 125
Block first atom: 2808
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2829
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 2851
Blocpdb> 19 atoms in block 128
Block first atom: 2871
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 2890
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 2913
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 2938
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 2963
Blocpdb> 25 atoms in block 133
Block first atom: 2985
Blocpdb> 18 atoms in block 134
Block first atom: 3010
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 3028
Blocpdb> 26 atoms in block 136
Block first atom: 3048
Blocpdb> 20 atoms in block 137
Block first atom: 3074
Blocpdb> 24 atoms in block 138
Block first atom: 3094
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 3118
Blocpdb> 24 atoms in block 140
Block first atom: 3137
Blocpdb> 28 atoms in block 141
Block first atom: 3161
Blocpdb> 29 atoms in block 142
Block first atom: 3189
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 3218
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 3238
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 3256
Blocpdb> 25 atoms in block 146
Block first atom: 3281
Blocpdb> 20 atoms in block 147
Block first atom: 3306
Blocpdb> 22 atoms in block 148
Block first atom: 3326
Blocpdb> 23 atoms in block 149
Block first atom: 3348
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 3370
Blocpdb> 150 blocks.
Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1264258 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10146
Prepmat> Matrix trace = 2764480.0000
Prepmat> Last element read: 10146 10146 63.6625
Prepmat> 11326 lines saved.
Prepmat> 9797 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3382
RTB> Total mass = 3382.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3382
RTB> Number of blocks = 150
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 194788.1731
RTB> 52758 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 900
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52758
Diagstd> Projected matrix trace = 194788.1731
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 900 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 194788.1731
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6723712 1.0846286 1.1912918 2.3614723
3.8494613 4.1454622 4.6111619 5.9352327 6.6259364
7.9041986 9.5800851 9.7585196 10.3211510 10.5159617
11.2804975 11.9120788 12.8231405 14.4527336 15.8209128
16.3005081 16.6071009 17.5772120 17.9421726 18.3582893
19.8916669 19.9536544 20.5426721 21.1685275 21.7938165
22.3186525 22.8098397 23.0986741 23.7855076 24.5538092
24.8671948 25.2015483 25.6787898 26.8919675 27.2905894
27.3107368 27.8727289 28.2193966 29.0122747 29.4288536
29.9340368 30.3310562 31.7440404 32.1642427 32.3951509
32.6573894 33.7771345 34.6213392 35.3339797 35.5552741
35.9162376 36.7194203 37.5111655 38.5038153 39.1613363
39.4190791 39.7525501 40.6865856 41.5472463 41.8344701
42.2326488 43.0667620 43.8576607 44.1004391 45.0536964
46.1413637 46.4969255 47.1023019 47.3703743 48.0129103
48.6718031 49.3294146 50.0520471 50.5391189 50.7465760
51.2974069 52.2403639 52.5852247 53.0893028 53.6531293
54.3066086 55.3292132 55.6675702 56.0575697 57.0253671
57.6991686 58.2013840 58.9517681 59.4273083 59.6791847
60.2822380 61.1224602 61.4184760 62.1039506 62.3808078
62.9067404
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034332 0.0034337 0.0034345 0.0034352
0.0034353 89.0430073 113.0930187 118.5234687 166.8732450
213.0567319 221.0964465 233.1849233 264.5538933 279.5238776
305.2981698 336.1088628 339.2245310 348.8665619 352.1435829
364.7198557 374.7909179 388.8592917 412.8290781 431.9276922
438.4255452 442.5294648 455.2713029 459.9734823 465.2767866
484.3182885 485.0723313 492.1797567 499.6209089 506.9462620
513.0140573 518.6285221 521.9018132 529.6042874 538.0897489
541.5127402 545.1410573 550.2785143 563.1272830 567.2855720
567.4949339 573.3040710 576.8582950 584.9061274 589.0904094
594.1251331 598.0521379 611.8238206 615.8599258 618.0666124
620.5631923 631.1123548 638.9504965 645.4930312 647.5112165
650.7897412 658.0262042 665.0825598 673.8250668 679.5540919
681.7866877 684.6644481 692.6612669 699.9490080 702.3642794
705.6989001 712.6337566 719.1475610 721.1352705 728.8874866
737.6332640 740.4698826 745.2746444 747.3924187 752.4441953
757.5895895 762.6903672 768.2564279 771.9854468 773.5682784
777.7553128 784.8711702 787.4575428 791.2227956 795.4132272
800.2425166 807.7417433 810.2077872 813.0409367 820.0292152
824.8596466 828.4416718 833.7650719 837.1211412 838.8932904
843.1211114 848.9765476 851.0298594 855.7657364 857.6711024
861.2790262
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3382
Rtb_to_modes> Number of blocs = 150
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6724
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.085
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.361
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.849
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.145
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.611
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.935
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.626
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.904
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.580
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.759
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.91
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 900 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00004
1.00002 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99995 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 60876 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99998 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00004
1.00002 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99995 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000
1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407151516463796982.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407151516463796982.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2407151516463796982.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2407151516463796982.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 448
First residue number = 1
Last residue number = 448
Number of atoms found = 3382
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6724
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.085
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.361
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.849
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.935
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.626
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.580
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.759
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.91
Bfactors> 106 vectors, 10146 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.672400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.474 for 448 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.034 +/- 0.06
Bfactors> = 91.016 +/- 8.99
Bfactors> Shiftng-fct= 90.981
Bfactors> Scaling-fct= 159.632
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2407151516463796982.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2407151516463796982.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.3
Chkmod> 106 vectors, 10146 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3382 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7231
0.0034 0.8194
0.0034 0.8689
0.0034 0.7191
0.0034 0.7662
0.0034 0.8731
89.0411 0.6693
113.1075 0.6871
118.5039 0.6842
166.8494 0.0205
213.0348 0.3299
221.0746 0.4174
233.1708 0.4413
264.5373 0.4579
279.5132 0.5078
305.2812 0.2771
336.0929 0.3056
339.2183 0.0912
348.8321 0.2006
352.1961 0.1072
364.6962 0.2130
374.7421 0.3812
388.7950 0.1952
412.7723 0.2821
431.8967 0.3570
438.3999 0.3018
442.5491 0.3905
455.2879 0.3785
459.9259 0.3651
465.2785 0.0896
484.2772 0.1361
485.0071 0.1803
492.1266 0.2875
499.6168 0.4784
506.8801 0.3714
513.0075 0.3012
518.6081 0.2704
521.8944 0.3675
529.6316 0.4128
538.0249 0.2077
541.5200 0.3959
545.1009 0.3370
550.2679 0.3329
563.0825 0.4505
567.2551 0.1816
567.4629 0.3361
573.2514 0.5508
576.8397 0.5407
584.8581 0.4037
589.0766 0.4399
594.0596 0.3917
598.0161 0.3130
611.7586 0.4365
615.7929 0.4057
618.0863 0.4395
620.5614 0.5057
631.1120 0.5224
638.9107 0.4199
645.4290 0.5313
647.5264 0.3883
650.7959 0.2252
658.0032 0.2961
665.0437 0.4805
673.7628 0.3446
679.5133 0.3230
681.7654 0.4099
684.6131 0.4131
692.6606 0.4357
699.9422 0.3977
702.2966 0.3623
705.6465 0.4013
712.6300 0.3813
719.1359 0.3935
721.1007 0.2106
728.8263 0.3739
737.5907 0.2897
740.4626 0.2470
745.2244 0.3899
747.3574 0.4571
752.3891 0.3835
757.5430 0.3410
762.6622 0.4158
768.2077 0.3591
771.9590 0.4038
773.5612 0.3014
777.7416 0.4085
784.8347 0.4555
787.4595 0.3592
791.1940 0.4029
795.3559 0.3454
800.2331 0.3955
807.7128 0.5154
810.1907 0.3822
813.0237 0.4000
820.0273 0.4409
824.8302 0.4585
828.3963 0.4577
833.7168 0.3077
837.1042 0.4045
838.8630 0.4290
843.0693 0.2962
848.9230 0.4902
851.0039 0.4650
855.7018 0.5474
857.6287 0.4842
861.2644 0.5313
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2407151516463796982 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
making animated gifs
11 models are in 2407151516463796982.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2407151516463796982 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
making animated gifs
11 models are in 2407151516463796982.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2407151516463796982 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
making animated gifs
11 models are in 2407151516463796982.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2407151516463796982 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
making animated gifs
11 models are in 2407151516463796982.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2407151516463796982 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2407151516463796982.eigenfacs
2407151516463796982.atom
making animated gifs
11 models are in 2407151516463796982.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2407151516463796982.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2407151516463796982.10.pdb
2407151516463796982.11.pdb
2407151516463796982.7.pdb
2407151516463796982.8.pdb
2407151516463796982.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m14.127s
user 0m14.067s
sys 0m0.060s
rm: cannot remove '2407151516463796982.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: April 25th, 2023.
|